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Guía de

l Máster

Máster Universitario en Conocimiento Actual de las Enfermedades Raras

HORARIO DE CLASES El horario puede consultarse a través de Google Calendar en el siguiente enlace: https://www.google.com/calendar/embed?src=jasanalc%40upo.es&ctz=Europe/Madrid

PROGRAMA: Máster Oficial en Conocimiento Actual de las

Enfermedades Raras

Modulo I: Aspectos Generales de las Enfermedades Raras Asignatura: Conceptos Generales y Aspectos Sociales Relacionados

con las Enfermedades Raras

GUÍA DIDÁCTICA DEL ALUMNO

Curso 2012‐2013

FICHA POR ASIGNATURA CURSO ACADÉMICO 2012‐2013

1.‐ DEFINICIÓN DE LA ASIGNATURA

Denominación: CONCEPTOS GENERALES Y ASPECTOS PSICOSOCIALES RELACIONADOS CON LA ENFERMEDADES RARAS (Obligatoria) Código: 2103600

Área de Conocimiento: SOCIALES

Descriptores ENFERMEDADES RARAS (ER), ASPECTOS SOCIOSANITARIOS, ASOCIACIONES DE PACIENTES

Titulación: CONOCIMIENTO ACTUAL DE LAS ENFERMEDADES RARAS

Fechas Profesor responsable del módulo/asignatura Manuel A. Ballesteros/ Salud Jurado Chacón

Actividades Docentes Nº de Horas Nº Créditos1 % Créditos Totales:

Clases teórico‐prácticas 4 0.20 20

Actividad por plataforma virtual 4 0.20 20

Seminarios

Tutorías 5 0.20 20

Horas de estudio 10 0.30 30

Actividades dirigidas

Actividades de evaluación 2 0.10 10

1

TOTAL 25 1 100

2.‐ PROFESORES DE LA ASIGNATURA.

Salud Jurado Chacón. Doctora en Ciencias Biológicas y Licenciada en Farmacia. Federación Española de Enfermedades Raras.

1 Valorar entre 25-30 horas/crédito

3.‐ PROGRAMA DE LA ASIGNATURA.

DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA

1.PRESENTACIÓN. El concepto de Enfermedad Rara (ER) viene definido por un límite en la prevalencia de una patología, siendo en nuestro país el de 5 por cada 10.000 personas. De las aproximadamente 7.000 ER que se conocen, las hay muy raras. El padecer una ER se convierte en un sufrimiento mayor al de una enfermedad prevalente o conocida por distintos motivos que se explicaran en esta asignatura. Como afectada de una enfermedad todavía considerada rara (Síndrome de Tourette), Presidenta de la Asociación Andaluza de Síndrome de Tourette y Trastornos Asociados (ASTTA), Delegada en Andalucía de FEDER y miembro del patronato de la Fundación FEDER he acumulado el conocimiento y la experiencia suficientes para que esta asignatura aporte un conocimiento sicosocial a los profesionales que se encuentren ante la situación de diagnósticar a un paciente con una posible ER, así como de atender a dicho paciente y a sus allegados. Mi perfil profesional me ha ayudado a entender mis problemas como paciente de una ER, y creo que es fundamental que en el “Dialogo Profesional - Paciente” se tengan en cuenta todos los aspectos relacionados con las vivencias del paciente desde que empieza a tener algún síntoma de la enfermedad hasta el final de la misma. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Los estudiantes de este Máster en general van a poder entender los conceptos generales y aspectos sicosociales de las ER. Pero el requisito más importante va a ser la sensibilidad hacia este colectivo y las ganas de trabajar con y para el mismo durante la etapa profesional.

3. COMPETENCIAS 3.1 GENERICAS O TRANSVERSALES 1.- Aceptación del concepto de ER en el contexto de prevalencia y también de dificultades de acceso a resolución de problemas biopsicosociales. 2.- Conocimiento de los grupos de ER. 3.- Entender que hay una base genética en la mayoría de las ER y su relación con la aparición de síntomas en edades tempranas. Esto es muy importante a la hora de hacer pronto los diagnósticos evitando así la alta morbilidad y mortalidad en la infancia y/o adolescencia. 4.- Saber trabajar en equipo con otros especialistas en medicina ya que muchas de las ER afectan a más de un órgano. 5.- Colaborar con las asociaciones de afectados pues son ellas las que a día de hoy tienen el mayor conocimiento de las necesidades del paciente. 3.2 ESPECIFICAS: • Cognitivas (saber): Que cuando se busca un diagnostico hay que pensar en la posibilidad de que se trate de una ER. • Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer): Derivar a especialistas y no alargar el peregrinaje en busca de un diagnostico cierto. • Actitudinales (Saber ser y estar): Disponibilidad para que se cumplan los protocolos y ayudar a las familias a solucionar el desamparo que sufren en muchas ocasiones.

3.3. OBJETIVOS: 1.- Conocimiento de PREVALENCIA en una enfermedad. 2.- Conocimiento de los grupos de ER. 3.- Entender la importancia del diagnostico cierto y temprano. 4.- Entender los problemas biopsicosociales y el concepto de AFECTADO por una ER. 5.- Saber hacer uso de los recursos que existan para una atención adecuada a los afectados. 6.- Saber dar una buena información a los afectados. 7.- Escucha activa a los afectados. 8.- Saber trabajar con y en equipos multidisciplinares e interdisciplinares. 9.- Colaborar con las asociaciones de afectados por ER. 10.- Sensibilización hacia la importancia de dedicarse profesionalmente a ayudar al colectivo de las ER.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Nº de Horas: • Clases teóricas: 4 • Clases a través de la plataforma virtual: 4 • Tutorías: 5 (individuales según necesidades del alumno) • Trabajo personal: 10 horas de estudio • Exámenes:

4.2. TÉCNICAS DOCENTES Sesiones académicas teóricas Exposición y debate Tutorías Controles de lecturas obligatorias. DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN: Durante la sesión académica se explicaran los temas relacionados con los objetivos a alcanzar. Al final se hará un debate, si bien se podrá preguntar durante la sesión si hiciese falta. Además el alumno dispondrá de material de estudio para que pueda superar el examen que consistirá en valorar las competencias que ha adquirido.

5.‐ BLOQUES TEMÁTICOS

− Nociones Generales y clasificación de las ER: • Definición de ER • Grupos de ER

− Aspectos sociosanitarios de las ER: • Peregrinaje en busca de un diagnostico • Falta de tratamientos adecuados. • Costes de la ER • Discapacidades de una ER • Falta de integración social en general y en las distintas etapas de la vida en particular

− Organizaciones y Asociaciones de Enfermos: • Cómo nace una asociación de afectados por una ER • Federación Española de Enfermedades Raras (FEDER). • Servicio de Información y Orientación (SIO) • Fundación FEDER • ER en Europa

6.‐ HORARIO DE CLASE. TEORÍA Y PRÁCTICA https://www.google.com/calendar/embed?src=jasanalc%40upo.es&ctz=Europe/Madrid

7.‐ BIBLIOGRAFÍA Y OTROS RECURSOS DOCENTES.

7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: - Estudio Enserio (Consultora Intersocial). 2009 - Guía de apoyo psicológico para enfermedades raras (FEDER).2009 - Estrategia en Enfermedades Raras del Sistema Nacional de Salud (Ministerio de Sanidad). 2009 - Plan Andaluz para las Enfermedades Raras (Consejería de Salud de la Junta de Andalucía). 2007 7.2. OTROS RECURSOS DOCENTES: ‐ Documentos internos de FEDER no publicados.

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. Se tendrá en cuenta:

- Asistencia a la sesión presencial del 9 de enero de 2012.El 40% de la calificación final.

- Consultas planteadas para mejorar conocimientos. El 25% de la calificación final. - Examen final que consistirá en contestar a preguntas relacionadas con los temas

explicados y el material que se va a suministrar para su lectura. El 35% de la calificación final.


Enfermedades Raras

Modulo I: Aspectos Generales de las Enfermedades Raras Asignatura: Principios Éticos en Biomedicina y Ciencias de la Salud


Curso 2012‐2013



Denominación: Principios éticos en biomedicina y ciencias de la salud (Obligatoria) Código: 2103601

Área de Conocimiento: Ética

Descriptores Enfermedades raras, aspectos éticos, derechos humanos

Titulación: Conocimiento Actual de las Enfermedades Raras.

Fechas Profesor/a responsable del módulo/asignatura Módulo: Manuel A. Ballesteros / Asignatura: María Concepción Martín Arribas




Seminarios

Tutorías 5 0.20 20




1

TOTAL 25 1 100

2.‐ PROFESORADO DE LA ASIGNATURA.

Lydia Feito Grande, Doctora en Filosofía y Letras y profesora en la Universidad Complutense de Madrid

Miembro del Comité de Ética del Instituto de Investigación de Enfermedades Raras.

Instituto de Salud Carlos III ‐



DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La asignatura ofrece un marco de reflexión sobre los problemas éticos que genera la investigación biomédica, especialmente en el campo de las enfermedades raras. Es esencial que el alumno comprenda la importancia de los valores implicados en la biomedicina. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Capacidad de diálogo. Esfuerzo en la comprensión y tolerancia frente a los valores plurales. Capacidad de análisis. Capacidad de argumentación racional. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. 1. Poseer los conocimientos, habilidades y actitudes que posibilitan la comprensión de nuevas teorías, interpretaciones, métodos y técnicas dentro de los diferentes campos disciplinares, conducentes a satisfacer de manera óptima las exigencias profesionales.

‐ El alumnado demuestra una actitud de disposición al aprendizaje continuado de conceptos y métodos, manteniendo al tiempo el rigor crítico exigible a un científico.

2. Ser capaz de identificar, analizar, y definir los elementos significativos que constituyen un problema para resolverlo con rigor.

‐ El alumnado es capaz de analizar problemas complejos, elaborar hipótesis y ponerlas a prueba utilizando el método científico.

3. Saber aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudios.

‐ El alumnado es capaz de resolver problemas que requieren conocimientos multidisciplinares impartidos en distintas materias del Plan de estudios.

4. Capacidad para pensar y actuar según principios de carácter universal que se basan en el valor de la persona y se dirigen a su pleno desarrollo.

‐ El alumnado es capaz de trabajar en equipo con grupos de personas con distinta formación. 5. Respetar los derechos fundamentales y de igualdad entre hombres y mujeres, los Derechos Humanos, los valores de una cultura de paz y democrática, los principios medioambientales y de cooperación al desarrollo que promuevan un compromiso ético en una sociedad global, intercultural, libre y justa.

‐ El alumnado es capaz de tomar decisiones sobre la base de principios éticos, en contra de otros criterios (económicos, sociales, científicos, etc.)

3.2 ESPECÍFICAS: 1. Conocer los conceptos fundamentales de la ética y sus implicaciones en el ámbito de la investigación biomédica. 2. Saber analizar los problemas éticos generados por la investigación biomédica en enfermedades raras, aplicando la metodología y principios desarrollados por la bioética. 3. Desarrollar una actitud de prudencia, respeto a la pluralidad de valores, honestidad intelectual y responsabilidad en la toma de decisiones.

3.3. OBJETIVOS ‐ Identificar problemas éticos en la investigación biomédica ‐ Aplicar la metodología de análisis de problemas a los casos y situaciones conflictivas ‐ Entender qué son los conflictos de valores, cómo se producen y cómo se resuelven ‐ Conocer las principales teorías éticas y sus principios básicos ‐ Entender la necesidad del respeto a la pluralidad de valores ‐ Comprender la responsabilidad como clave de la actuación y análisis de consecuencias ‐ Desarrollar valores de honestidad, veracidad, confidencialidad, y prudencia ‐ Evaluar las decisiones en función de los mínimos de derechos humanos

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNADO: Nº de Horas:

• Clases Teóricas: 4 • Clases a través de la plataforma virtual: 4 • Tutorías Especializadas (virtuales) individuales: 2 (según necesidades del alumnado) • Realización de Actividades Académicas Dirigidas: • Otro Trabajo Personal Autónomo:

A) Horas de estudio: 13 • Realización de Exámenes: 2

4.2. TÉCNICAS DOCENTES Sesiones académicas teóricas Exposición y debate Tutorías especializadas

DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN:


1. Introducción a la ética y la bioética clínica a. Ética y moral b. Fundamentación y aplicación (principios y consecuencias) c. Mínimos y máximos d. Valores. Conflictos de valores y métodos de resolución e. Deliberación

2. Ética de la investigación con seres humanos a. Importancia y necesidad de la investigación b. Orígenes de la ética de la investigación con humanos

i. Código de Nüremberg ii. Declaración de Helskinki iii. Informe Belmont y principios de la bioética

c. Requisitos éticos de la investigación i. Consentimiento ii. Estándar de cuidado iii. Justicia

3. Problemas éticos de la investigación en enfermedades raras 4. Comités de ética y evaluación de protocolos de investigación


7.‐ BIBLIOGRAFÍA Y OTROS RECURSOS DOCENTES. Recogerá sólo las obras más significativas de la materia correspondiente, indicando un máximo de 15 reseñas, y tratando de integrar obras clásicas con las últimas aportaciones. Las citas se unificarán siguiendo el estilo de la APA: Ej: Pérez Gómez, A. (1998). La cultura escolar en la sociedad neoliberal. Madrid: Morata.

7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: ‐ Asociación Médica Mundial (2005). Manual de Ética Médica http://www.wma.net/s/index.htm) ‐ Beauchamp TL, Childress JF. (1999) Principios de ética biomédica. Barcelona: Masson. ‐ Callahan D. (2004) Los fines de la Medicina. El establecimiento de unas prioridades nuevas. Barcelona: Fundació Víctor Grífols i Lucas. ‐ Gracia D. (1989) Fundamentos de Bioética. Madrid. Eudema Universidad. ‐ Gracia D. (1991) Procedimientos de decisión en ética clínica. Madrid: Eudema Universidad. ‐ Gracia D. (2001) La deliberación moral: el método de la ética clínica. Med Clín (Barc) 117: 18‐23 ‐ Gracia D. (2004) Como arqueros al blanco. Estudios de bioética. Madrid, Triacastela. ‐ Gracia D, Júdez J (eds). (2004) Ética en la práctica clínica. Madrid: Fundación de Ciencias de la Salud‐Triacastela. ‐ Couceiro A (ed). (1999) Bioética para clínicos. Madrid: Triacastela. 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA ‐ Informe Belmont. (1978) Principios éticos y recomendaciones para la protección de las personas objeto de la experimentación biomédica y de la conducta. En: Ensayos clínicos en España (1982‐1988). Madrid: Ministerio de Sanidad y Consumo; 1990. p. 121‐31. ‐ Sarabia J, De los Reyes M, eds. (2000) Comités de Ética Asistencial. Madrid. Asociación de Bioética Fundamental y Clínica. ‐ Consejo de Europa. (1997) Convenio para la protección de los Derechos Humanos y la dignidad del ser humano con respecto a las aplicaciones de la Biología y la Medicina (Convenio de Oviedo). Madrid: Ministerio de Asuntos Exteriores. ‐ F. Lolas et al. (eds.) (2006) Investigación en salud. Dimensión ética. CIEB, Universidad de Chile. ‐ CIOMS. (2003) Pautas Éticas Internacionales para la Investigación Biomédica en Seres Humanos (rev. 2002). Santiago de Chile: Programa Regional de Bioética OPS/OMS. ‐ Pellegrini AF, Macklin R, (eds.) (1999) Investigación en Sujetos Humanos: Experiencia Internacional. Santiago de Chile: Programa Regional de Bioética OPS/OMS. ‐ Emanuel EJ, Wendler D, Grady C. (2000) What makes clinical research ethical? JAMA283(20): 2701‐2711. ‐ Beecher HK. (1966) Ethics and clinical research. The New England Journal of Medicine 274: 1354‐1360.

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. Se tendrá en cuenta:

- Asistencia a la sesión presencial: El 40% de la calificación final. - Consultas planteadas para mejorar conocimientos: El 25% de la calificación final. - Examen final que consistirá en contestar a preguntas relacionadas con los temas

explicados y el material que se va a suministrar para su lectura: El 35% de la calificación final.


Enfermedades Raras

Modulo I: Aspectos Generales de las Enfermedades Raras Asignatura: Epidemiología Genética y Métodos de Análisis Estadístico

y Epidemiológico para el estudio de EERR

GUÍA DIDÁCTICA DEL ALUMNO Curso 2012‐2013



Denominación: Epidemiología genética y métodos de análisis estadístico y epidemiológico para el estudio de EERR (Obligatoria) Código: 2103602

Área de Conocimiento: CONCEPTOS GENERALES Y ASPECTOS SOCIALES RELACIONADOS CON LAS ENFERMEDADES RARAS

Descriptores Epidemiología; epidemiología genética; epidemiología ambiental; métodos epidemiológicos; diseños de estudios

Titulación: Máster en Diagnóstico y Terapia de las Enfermedades Raras

Fechas Profesor/a responsable del módulo/asignatura Módulo: Manuel A. Ballesteros/ Asignatura: Manuel Posada de la Paz




Seminarios 3 0.10 5

Tutorías 5 0.20 10




2

TOTAL 50 2 100


Manuel Posada de la Paz. Doctor en Medicina y Cirugía y especialista en Medicina Interna y también especialista en

Medicina Preventiva y Salud Pública

Instituto de Investigación en Enfermedades Raras. Instituto de Salud Carlos III



DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La epidemiología se ha definido como la ciencia encargada de estudiar los

factores de riesgo (determinantes) de las enfermedades, así como la distribución de los mismos. Aunque se confunde a veces con una de las opciones de esta práctica, la versión descriptiva y numérica de los hechos según tiempo, lugar y persona, en realidad esta fase no es nada más que la inicial para dar paso a las versiones de la denominada epidemiología analítica (en todas sus áreas: ambiental, genética, ocupacional, social, farmacológica, clínica, etc). La epidemiología usa métodos muy específicos y complejos para establecer la causalidad de las enfermedades. No es una ciencia que se encargue de los mecanismos, salvo para evaluar marcadores y factores de riesgo o pronósticos. La epidemiología es una ciencia para evaluar y analizar las posibles causas de las enfermedades y las explicaciones que justifican su aparición y sobre su distribución. La epidemiología de las ER no está muy desarrollada, por eso es muy importante que en una maestría como ésta se expliquen los conceptos básicos y la forma de razonar, diseñar, establecer hipótesis y contrastar hipótesis etiológicas.

2. REQUISITOS DE ACCESO. Cualquier licenciatura y también diplomatura es suficiente para acceder a los conocimientos epidemiológicos. Sin embargo, su aplicación al campo de las enfermedades raras, requiere que al menos exista una familiarización con ciertos aspectos de la biología y fiospatología humana. Por ello, licenciaturas del campo de las ciencias de la salud, son considerados como idóneos para optar a entrar en este campo del conocimiento.

3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. 1. Poseer los conocimientos, habilidades y actitudes que posibilitan la comprensión de nuevas teorías, interpretaciones, métodos y técnicas dentro de los diferentes campos disciplinares, conducentes a satisfacer de manera óptima las exigencias profesionales.









3.2 ESPECÍFICAS:

• Cognitivas (Saber): Familiarizarse con los objetivos de la epidemiología y en concreto con la forma de razonar frente a un problema, definir el diseño más apropiado para un estudio concreto, su análisis y razonar sobre los posibles sesgos existentes y sus ventajas , limitaciones y aplicabilidad en la práctica.

• Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer): Conocer el manejo de alguna de las herramientas más habituales en el manejo de la literatura científica, como realizar una revisión sistemática de la literatura, meta‐análisis, etc.

• Actitudinales (Saber ser y estar): Conocer las limitaciones de los diferentes campos científicos que se aplican a las enfermedades raras, al mismo tiempo que se desarrolla una mayor capacidad crítica con criterios establecidos en la evidencia científica del momento

3.3. OBJETIVOS 1.‐ Conocer el ámbito de conocimientos y aplicación de la epidemiología 2.‐ Conocer las diferentes ramas de la epidemiología y la aplicación de cada una de ellas al campo de las Enfermedades Raras 3.‐ Comprender y saber utilizar las medidas de frecuencia más habituales y su utilización 4.‐ Saber elegir el mejor diseño del estudio para cada situación 5.‐ Desarrollar herramientas estratégicas de análisis estadístico asociados a cada diseño 6.‐ Estrategias de la Medicina Basada en la Evidencia y guías prácticas para el desarrollo de estudios científicos 7.‐ Conocer los posibles defectos de los estudios científicos 8.‐ Diferenciar entre validez interna y validez externa. Teoría de la causalidad

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNADO: El número total de horas estimado para este módulo es de 50. El reparto de las horas se hará según la siguiente distribución: Nº de Horas:

• Clases Teóricas*: 8 • Clases Prácticas*: 7 a través del sistema de internet • Exposiciones y Seminarios*: Se impartirá un seminario aparte del módulo, pero que tendrá relación

con el mismo • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales):

A) Colectivas*: B) Individuales: Según necesidades de cada alumno

• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: A) Horas de estudio: 35 B) Preparación de Trabajo Personal: Los alumnos deberán preparar dos trabajos según se indican en

documento aparte • Realización de Exámenes: A) Examen escrito: Los trabajos arribas mencionados servirán de evaluación del alumno para este

módulo B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal):

4.2. TÉCNICAS DOCENTES Sesiones académicas teóricas Exposición y debate Tutorías especializadas Controles de lecturas obligatorias

Otros (especificar): DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN: Básicamente este módulo se desarrollará con un seminario introductorio en colaboración con otros profesores invitados, pero el énfasis principal se pondrá en las clases teóricas, con participación activa de los alumnos y debates centrados en la materia que se esté dando. A este trabajo, los alumnos tendrán que desarrollar una serie de trabajos en casa, consistentes en lecturas de artículos seleccionados sobre los que deberán emitir juicios críticos, contraponer diseños de estudios más apropiados y desarrollar revisiones sistemáticas de la literatura


• Aplicaciones prácticas del análisis estadístico de datos empleado en el estudio de las Enfermedades Raras. • Principios de epidemiología. • Métodos epidemiológicos aplicados al estudio de las Enfermedades Raras. • Epidemiología genética.



7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Comunicación de la Comisión al Parlamento Europeo, Al Consejo, y al Comité económico y social europeo y al Comité de las Regiones. Las Enfermedades raras: Un reto para Europa. Bruselas, 11 de noviembre de 2008. Disponible en:http://ec.europa.eu/health/ph_threats/non_com/docs/rare_com_es.pdf 2 de diciembre de 2009 Arrigo Schieppati, Jan-Inge Henter, Erica Daina, Anita Aperia. Why rare diseases are an important medical and social issue. thelancet.com Vol 371 June 14, 2008 2039-2041 Tracy Hampton, PhD. Rare Disease Research Gets Boost. JAMA, June 28, 2006—Vol 295, No. 24 2836-2838 von EE, Altman DG, Egger M, Pocock SJ, Gotzsche PC, Vandenbroucke JP. [The Strengthening the Reporting of Observational Studies in Epidemiology [STROBE] statement: guidelines for reporting observational studies]. Gac Sanit 2008 Mar;22(2):144-50. Moher D, Schulz KF, Altman D. The CONSORT statement: revised recommendations for improving the quality of reports of parallel-group randomized trials. JAMA 2001 Apr 18;285(15):1987-91. Little J, Higgins JP, Ioannidis JP, Moher D, Gagnon F, von EE, et al. STrengthening the REporting of Genetic Association Studies (STREGA)--an extension of the STROBE statement. Genet Epidemiol 2009 Nov;33(7):581-98. 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA Burton PR, Tobin MD, Hopper JL. Key concepts in genetic epidemiology. Lancet. 2005 366:941-51. M Dawn Teare, Jennifer H Barrett Genetic linkage studies. Lancet 2005; 366 September 17, 2005 1036-1044 Heather J Cordell, David G Clayton Genetic association studies. Lancet 2005; 366: 1121–31 Joel B Greenhouse. Commentary: Cornfield, Epidemiology and. Causalita. International Journal of Epidemiology 2009;38:1199–1201 Beverly Levine, PhDWhat Does the Population Attributable Fraction Mean?. Preventive Chronic Diseases. 2007 VOLUME 4: NO. 1: 1-5 W. Scott Richardson, MD, Mark C. Wilson, MD, MPH, John W. Williams, Jr, MD, MHS, Virginia A. , oyer, MD, MPH, C. David Naylor, MD, Dphil, for the Evidence-Based Medicine, Working GroupUsers’ Guides to the Medical Literature, XXIV. How to Use an Article on the Clinical Manifestations of Disease. JAMA, August 16, 2000—Vol 284, No. 7 869-875 Heiner C. Bucher, MD, MPH, Gordon H. Guyatt, MD, MSc, Deborah J. Cook, MD, MSc, Anne Holbrook, MD, MSc, Finlay A. McAlister, MD, for the Evidence-Based Medicine, Working Group. Users’ Guides to the Medical Literature. XIX. Applying Clinical Trial Results A. How to Use an Article Measuring the Effect of an Intervention on Surrogate End Points. JAMA, August 25, 1999—Vol 282, No. 8 771-778

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. El sistema de evaluación consistirá por una parte en el control de la asistencia a las clases teóricas, su participación e interés a través de la interacción entre profesor y alumnos y por otra la demostración del trabajo realizado en sus horas de estudio a través de dos instrumentos básicos:

1. Interacción con el profesor y/o cuestiones planteadas 2. Desarrollo del trabajo siguiente:

Trabajos específicos a desarrollar: (Se facilitará bibliografía y artículos) 1.- Trabajo sobre la aplicación de STROBE y STREGA guidelines en los trabajos de epidemiología genética de los dos últimos años Cada alumno debe elegir un estudio de epidemiología genética – en especial GWAS aunque no necesariamente, de una enfermedad rara publicado en los dos últimos años y aplicar los criterios STROBE y STREGA de forma crítica El trabajo deberá contener los siguientes puntos:

a) Título del trabajo y nombre del alumno b) Estrategia de la búsqueda bibliográfica c) Decisión a la hora de elegir el artículo (fundamentos de la elección) d) Aplicación de los criterios de las estrategias STROBE y STREGA en formato checklist e) Comentario y juicio final sobre el grado de cumplimiento de estos criterios y la decisión final sobre la validez del

artículo Extensión máxima, 6 folios


Enfermedades Raras

Modulo I: Aspectos Generales de las Enfermedades Raras Asignatura: Fundamentos y tipos de Herencia. Citogenética y

Alteraciones Cromosómicas




Denominación: Fundamentos y tipos de Herencia. Citogenética y Alteraciones Cromosómicas (Obligatoria) Código: 2103603

Área de Conocimiento: Aspectos generales de las enfermedades raras.

Descriptores Base biológica de la herencia. Herencia mendeliana y no mendeliana. Herencia mitocondrial. Penetrancia, expresividad. Heterogeneidad genética

Titulación: Máster en Diagnóstico y Terapia de las Enfermedades Raras

Fechas Profesor/a responsable del módulo/asignatura Módulo: Manuel Angel Ballesteros Simarro/ Asignatura: Carmen Ayuso García


Clases teórico‐prácticas 10 0.40 13.3

Actividad por plataforma virtual 20 0.80 26.6

Seminarios

Tutorías 5 0.20 6.66

Horas de estudio 32.5 1.3 43.3


Actividades de evaluación 7.5 0.30 10

3

TOTAL 75 3 100

2.‐ PROFESORADO DE LA ASIGNATURA. Carmen Ayuso García,

Dra. en Medicina y Cirugía, Universidad Autónoma de Madrid. Profª Titular en ciencias de la salud.

Especialista en Medicina Interna. Acreditada en Genética Humana por la AEGH.

Servicio de Genética Fundación Jiménez Díaz

U 704 CIBERER



DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La Genética Humana es el estudio de la herencia en los seres humanos y engloba diferentes áreas que incluyen la genética clásica, citogenética, genética molecular, biología, genómica, genética de poblaciones, genética del desarrollo, genética médica y el asesoramiento genético. Teniendo en cuenta que más del 80% de las ER lo constituyen las enfermedades genéticas, el conocimiento de las bases moleculares y celulares de la herencia, los patrones hereditarios mendelianos y no mendelianos son de relevancia para el entendimiento de la etiopatogenia de las ER. Esta asignatura está enfocada específicamente a los distintos mecanismos etiopatogénicos que subyacen a las enfermedades mendelianas en la que la patología se origina fundamentalmente como consecuencia de un defecto en un solo gen/locus. Su conocimiento resulta fundamental para comprender las técnicas diagnósticas en ER, su tratamiento y prevención, así como para poder abordar el asesoramiento genético 2. REQUISITOS DE ACCESO. Se requiere conocimiento básico en bioquímica, citología y fisiología humanas. Y por tanto, licenciaturas o diplomaturas del campo de las ciencias de la salud. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. 1. Poseer los conocimientos, habilidades y actitudes que posibilitan la comprensión de nuevas teorías, interpretaciones, métodos y técnicas dentro de los diferentes campos disciplinares, conducentes a satisfacer de manera óptima las exigencias profesionales.









3.2 ESPECÍFICAS:

• Cognitivas (Saber): i) Conocimiento de las bases de la herencia y de los patrones de herencia mendeliana ii) Conocimiento de los modelos no mendelianos de herencia (mitocondrial, ligada al sexo, impronta genética, etc.) iii) Conocimiento de los Polimorfismos genéticos y mutaciones iv) Conocimiento del concepto de Enfermedad hereditaria (penetrancia, expresividad, heterogeneidad genética y fenotípica)

• Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer): i) Construcción de un árbol genealógico ii) Reconocer patrones hereditarios a través del árbol genealógico iii) Lectura crítica de artículos especializados iv) Búsqueda bibliográfica de artículos y recursos en la web sobre ER de base monogénica

• Actitudinales (Saber ser y estar): i) Establecimiento del conocimiento teórico para aprender las técnicas diagnósticas en

genética ii) Establecimiento del conocimiento teórico para aprender las bases del asesoramiento

genético. 3.3. OBJETIVOS 1 Definir los patrones de herencia mendeliana clásico 2 Conocer las características de la herencia y la patología mitocondrial 3 Identificar las bases moleculares de las enfermedades por mutaciones dinámicas 4 Familiarizarse con los distintos tipos de mutación y polimorfismos genéticos 5 Conocer los fundamentos de la heterogeneidad genética, la penetrancia y expresividad en la patología hereditaria humana

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNADO: Se consignarán las horas (número aproximado) de trabajo del alumnado en cada uno de los grandes apartados. Nº de Horas:

• Clases Teóricas*: 10 h presenciales • Clases Prácticas*: 20 h a través de la plataforma virtual de la UNIA • Exposiciones y Seminarios*: • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales): 5 horas • Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: A) Horas de estudio: 32,5horas B) Preparación de Trabajo Personal: 4horas Los alumnos deberán preparar un trabajo de revisión sobre

una enfermedad rara genética (monogénica o de mecanismo no mendeliano) C) ... • Realización de Exámenes: A) Examen escrito: Un examen tipo test al final de las clases y el trabajo presentado servirá de

evaluación (7,5 horas) B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal):

4.2. TÉCNICAS DOCENTES Sesiones académicas teóricas Exposición y debate Tutorías especializadas: Controles de lecturas obligatorias DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN: El énfasis principal se pondrá en las clases teóricas, con participación activa de los alumnos y debates centrados en la materia que se esté dando. Tras un bloque de contenido teórico se procederá a un seminario con aprendizaje de la construcción de árboles genealógicos, identificación de patrones hereditarios, estudio de algunos casos prácticos y búsquedas de recursos bibliográficos y de recursos en la web

5.‐ BLOQUES TEMÁTICOS Día 16 de enero 16:00 - 17:00 Estructura y función de los genes. Herencia monogénica. Autosómica dominante, autosómica recesiva, ligada al X. 17:00 – 18:00 Mutaciones y polimorfismos 18:00 – 18:30 Descanso 18:30 – 19:30 Herencia no mendeliana: herencia mitocondrial, disomia uniparental, impronta genética Mosaicismos 19:30 – 20:30 Construcción de pedigrees y reconocimiento de patrones hereditarios Discusión de Casos prácticos. Día 17 de enero 16:00 - 17:00 Concepto de enfermedad genética. Frecuencia y tipos de enfermedades mendelianas. Heterogeneidad genética 17:00 – 18:00 Enfermedades genéticas: Penetrancia y expresividad. Mutaciones dinámicas, herencia oligogénica (Digenia y Trialelismo ). Genes Modificadores 18:00 – 18:30 Descanso 18:30 – 19:30 Aproximación clínica al estudio de las enfermedades genéticas. 19:30 – 20:30 Discusión de Casos prácticos Búsqueda en la web y búsqueda bibliográfica.



7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Recursos en la Red PubMed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed&cmd=search&term= 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA Genética Humana. Fundamentos y aplicaciones en medicina. A.J. SOLARI. Editorial Médica Panamericana, Argentina (3ª ed, 2004) ISBN 84‐7903‐926‐4 Oxford Desk Reference ‐ Clinical Genetics. HV. Firth & J A. Hurst, (Consulting Editor Judith G. Hall) Oxford University Press (2005) Thompson & Thompson's Genetics in Medicine 7E (2007) (edicion española 2008) Nussbaum et al http://www.egoshare.com/download.php?id=E02A9E8542 EMERY. ELEMENTOS DE GENÉTICA MÉDICA + STUDENT CONSULT Turnpenny, P.D. / Ellard, S. (13ª edicion , esp, 2009)

Recursos en la Red OMIM http://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/ NCBI http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ SNP http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/ HUMAN GENOME PROJECT http://www.ornl.gov/sci/techresources/Human_Genome/home.shtml Web de divulgación de Genética en español http://www.lagenetica.info/

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN.

- Asistencia a las sesiones presenciales: El 40% de la calificación final. - Examen Tipo Test que consistirá en contestar a preguntas relacionadas con los temas

explicados: El 25% de la calificación final. - Trabajo de Revisión Bibliográfica: 35% de la calificación final


Enfermedades Raras

Modulo I: Aspectos Generales de las Enfermedades Raras Asignatura: Enfermedades Raras y su implicación en el Embarazo y el

Desarrollo Fetal




Denominación: Enfermedades Raras y su implicación en el Embarazo y el Desarrollo Fetal (Obligatoria) Código: 2103604

Área de Conocimiento: Pediatría

Descriptores Defectos y Malformaciones congénitas en niños recién nacidos. Causas, Frecuencia y prevención primaria

Titulación: Master en diagnóstico y terapia de las enfermedades raras

Fechas Profesor/a responsable del módulo/asignatura Módulo: Manuel Angel Ballesteros / Asignatura: María Luísa Martínez Frías




Seminarios

Tutorías 9 0.36 18




2

TOTAL 50 2 100


María Luisa Martínez Frías, Profesora Titular de la Facultad de Medicina de la Universidad Complutense de

Madrid.



DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN.

Las alteraciones del desarrollo embrionario y fetal de los seres humanos, sean del tipo que sean (físicos, psíquicos funcionales y sensoriales), se producen en diferentes momentos del desarrollo y por diferentes causas. Por tanto, se describirán los distintos tipos de defectos y su terminología dismorfológica, que hacer referencia a los mecanismos implicados en cada tipo:

A) genéticas -A1- por alteraciones de los cromosomas sean en su número o en su estructura. -A2- Por alteraciones de la estructura del ADN de ciertos genes, y de la función del ADN.

B) Por factores ambientales que llegan al embrión y feto a través de la madre. Sin embargo, no existe especificidad entre las causas y sus efectos.

Por tanto, un mismo agente causal (por ejemplo, una mutación, o un fármaco), pueden producir diferentes cuadros clínicos, y viceversa, un mismo cuadro clínico puede ser producido por diferentes agentes. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Capacidad de diálogo. Esfuerzo en la comprensión y tolerancia frente a los valores plurales. Capacidad de análisis. Capacidad de argumentación racional. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. 1. Poseer los conocimientos, habilidades y actitudes que posibilitan la comprensión de nuevas teorías, interpretaciones, métodos y técnicas dentro de los diferentes campos disciplinares, conducentes a satisfacer de manera óptima las exigencias profesionales.









3.2 ESPECÍFICAS: ‐ Estudio de causas genéticas y ambientales que producen alteraciones del desarrollo embrionario y fetal de los seres humanos - Estudio de defectos congénitos durante el desarrollo embrionario - Medidas preventivas. 3.3. OBJETIVOS

En esta asignatura, vamos a estudiar, las bases biológicas (genéticas y epigenéticas) del proceso del desarrollo humano, sobre todo las que ocurren desde los momentos de formación y maduración de los dos gametos, ovocito y espermatozoide, la fecundación y las primeras fases hasta la implantación. Se analizará también que tipos de defectos congénitos se producen durante TODO el desarrollo embrionario. Se analizarán también los tipos de factores ambientales que alteran el desarrollo embrionario y fetal, así como algunos de sus mecanismos de acción (por ejemplo, epigenéticos). Finalmente, se expondrán los tipos de medidas preventivas que se pueden utilizar, sean de Prevención primaria, secundaria o terciaria.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNADO: Nº de Horas:

• Clases Teóricas: 11 • Clases a través de la plataforma virtual: 11 • Tutorías Especializadas (virtuales) individuales: 10 (según necesidades del alumnado) • Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo:

A) Horas de estudio: 35 • Realización de Exámenes: 8

4.2. TÉCNICAS DOCENTES Sesiones académicas teóricas Exposición y debate Tutorías especializadas

DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN:


A) Aspectos biológicos básicos:

1. Características generales de los defectos congénitos, terminología, tipos, y causas

2. Actualización del conocimiento sobre los procesos de formación de los gametos

3. Estructura y función del ADN y de los genes: Tipos de alteraciones génicas.

4. Introducción al concepto de epigenética y su importancia para el desarrollo desde la fecundación hasta

la implantación

B) Características clínicas de las anomalías genéticas

1. Síndromes clínicos debidos a mutaciones génicas. Tipos y métodos de identificación

2. Síndromes cromosómicos: Técnicas citogenéticas y moleculares:

3. Síndromes cromosómicos detectables por citogenética de alta resolución

4. Síndromes detectables por técnicas moleculares: Luces y sombras

C) Aspectos epidemiológicos y de teratología clínica

1. Frecuencia de defectos congénitos en niños recién nacidos en nuestro país y su comportamiento

temporal y espacial.

2. Teratología clínica: Tipos de factores teratogénicos humanos.

3. Medidas, y pautas de prevención de defectos congénitos, con especial referencia a los niveles primario

y secundario.



Serán proporcionados en el Campus Virtual.

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN.

- Asistencia a las sesiones presenciales: El 40% de la calificación final. - Examen Tipo Test que consistirá en contestar a preguntas relacionadas con los temas

explicados: El 25% de la calificación final. - Trabajo de Revisión Bibliográfica: 35% de la calificación final


Enfermedades Raras

Modulo I: Aspectos Generales de las Enfermedades Raras Asignatura: Regulación de la Expresión Génica durante el Desarrollo,

la Evolución y las Enfermedades Humanas




Denominación: Regulación de la expresión génica durante el desarrollo, la evolución y las enfermedades humanas (Obligatoria) Código: 2103605

Área de Conocimiento:

Descriptores Regulación de la expresión génica durante el desarrollo, la evolución y las enfermedades humanas

Titulación: Diagnóstico y terapia de las enfermedades raras

Fechas Profesor/a responsable del módulo/asignatura Módulo: Manuel Angel Ballesteros Simarro/ Asignatura: José Luis Gómez Skarmeta




Seminarios

Tutorías 2 0.10 10




1

TOTAL 25 1 100


Dr.José Luis Gómez Skarmeta

Científico Titular

Centro Andaluz de Biología Del Desarrollo – Sevilla

Consejo Superior de Investigaciones Científicas


• Introducción: el genoma no‐codificante y su implicación en el desarrollo y la evolución

• El modelo de pez cebra


• Transgénesis en peces

• Los genes iroquois en desarrollo

• Regulación de los genes iroquois

• Arquitectura genómica de los genes iroquois

• Donde empiezan y donde acaban los genes

• Papel de los aisladores en la regulación génica

• Análisis de actividad cis‐reguladora a escala génomica

• Papel de elementos cis‐reguladores en enfermedades humanas

• Papel de elementos cis‐reguladores en la evolución

• Desarrollo de nueva mutagénesis reguladores en peces

DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. Durante el desarrollo de un organismo, las células proliferan, se diferencia y posteriormente forman parte de tejidos y órganos. Las instrucciones para coordinar estos procesos están codificadas en el genoma del organismo. El genoma está básicamente formado por genes, secuencias codificantes que instruyen la síntesis de ARN o proteínas, y secuencias no codificantes. Dentro de estas secuencias no codificantes, se localiza el ADN regulador que tiene una función fundamental en el control preciso de la transcripción de los genes en el espacio, tiempo y cantidad. Así, el ADN regulador, o la regulación en cis, es crítica para el correcto desarrollo de los animales. Además, la secuenciación de los genomas de múltiples organismos ha revelado que la gran mayoría de los genes están conservados entre los metazoos. Así, la mayor parte de los organismos se construyen con el mismo conjunto de genes. ¿Cómo entonces ha surgido la diversidad morfológica durante la evolución? La opinión más extendida actualmente es que, aunque las regiones codificantes han cambiado, la generación de morfologías diferentes durante la evolución ha dependido sobre todo de variaciones en el ADN regulador. De hecho, en gran medida, la evolución es la historia del cambio en la regulación de la expresión de genes durante el desarrollo. Además, durante la vida adulta, la expresión de genes en las células de un organismo controlan su fisiología. De hecho, un número cada vez mayor de enfermedades genéticas humanas se asocian a lesiones en regiones no-codificantes. El mayor problema es que, si bien el código de las regiones codificantes es conocido, el de las regiones reguladoras es en gran medida un misterio. Si tenemos en cuenta que en vertebrados las regiones codificantes representan sólo el 5% del genoma, aún conociendo las secuencias de los genomas, el 95% de la información contenida en ella es aún desconocida. En esta asignatura, pretendemos demostrar el papel esencial de regiones cis-reguladoras en procesos de desarrollo embrionario, durante la aparición de innovaciones evolutivas y en las enfermedades genéticas humanas. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Conocimientos: Bioquímica Biología molecular Genética Procedimientos: Metodología bioquímico‐molecular y genética Actitudes: Participación Pro‐actividad Actitud crítica

3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. 1. Poseer los conocimientos, habilidades y actitudes que posibilitan la comprensión de nuevas teorías, interpretaciones, métodos y técnicas dentro de los diferentes campos disciplinares, conducentes a satisfacer de manera óptima las exigencias profesionales.









3.2 ESPECÍFICAS: Cognitivas (Saber):

i) Conocimiento de la importancia del genoma no codificante ii) Conocimiento de la compartimentalización reguladora del genoma iii) Conocimiento de la arquitectura 3D del genoma iv) Conocimiento del modelo experimental de pez cebra

Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer): i) Técnicas de genómica comparativa ii) Técnicas de transgénesis iii) Técnicas de análisis de conformación de la cromatina

Actitudinales (Saber ser y estar): i) Plantear de forma crítica estrategias de análisis funcionales de regiones cis‐reguladoras ii) Plantear preguntas de investigación con orientación traslacional

3.3. OBJETIVOS

1. Conocer el modelo de pez cebra 2. Conocer la importancia del genoma no codificante 3. Conocer las técnicas de transgénesis en peces 4. Conocer herramientas de genómica comparativa 5. Conocer técnicas de determinación de estructura 3D de cromatina 6. Aproximación al uso de distintos Browsers genómicos 7. Identificar estratégias para determinar la implicación de elementos reguladores en

enfermedades humanas. 8. Conocer la implicación del genoma regulador en la evolución

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNADO: Se consignarán las horas (número aproximado) de trabajo del alumnado en cada uno de los grandes apartados. Nº de Horas: 25 horas.

• Clases Teóricas*: 2 • Clases Prácticas*: 2 • Exposiciones y Seminarios*: • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales): 2 horas

A) Colectivas*: B) Individuales: 2

• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: A) Horas de estudio: 13 horas B) Preparación de Trabajo Personal: 4 horas C) ... • Realización de Exámenes: A) Examen escrito: B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal):

4.2. TÉCNICAS DOCENTES Sesiones académicas teóricas Exposición y debate Tutorías especializadas Sesiones académicas prácticas Visitas y excursiones Controles de lecturas obligatorias DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN:


1. Bloque I: Introducción

• El genoma no‐codificante y su implicación en el desarrollo y la evolución

• El modelo de pez cebra

• Transgénesis en peces

2. Bloque II: Los genes Iroquois

• Los genes iroquois en desarrollo

• Regulación de los genes iroquois

• Arquitectura genómica de los genes iroquois

3. Bloque III: Los límites reguladores de los genes

• Donde empiezan y donde acaban los genes

• Papel de los aisladores en la regulación génica

4. Bloque IV: Cis regulación, evolución y enfermedades

• Análisis de actividad cis‐reguladora a escala génomica

• Papel de elementos cis‐reguladores en enfermedades humanas

• Papel de elementos cis‐reguladores en la evolución

• Desarrollo de nueva mutagénesis reguladores en peces



7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Fredman D, Engström PG, Lenhard B. Web‐based tools and approaches to study long‐range gene regulation in Metazoa. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):231‐42. Narlikar L, Ovcharenko I. Identifying regulatory elements in eukaryotic genomes. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):215‐30. Moltó E, Fernández A, Montoliu L. Boundaries in vertebrate genomes: different solutions to adequately insulate gene expression domains. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):283‐96. 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA Gurudatta BV, Corces VG. Chromatin insulators: lessons from the fly. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):276‐82.

Elgar G. Pan‐vertebrate conserved non‐coding sequences associated with developmental regulation. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):256‐65. Jiménez‐Delgado S, Pascual‐Anaya J, Garcia‐Fernàndez J. Implications of duplicated cis‐regulatory elements in the evolution of metazoans: the DDI model or how simplicity begets novelty. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):266‐75. Chopra VS, Levine M. Combinatorial patterning mechanisms in the Drosophila embryo. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):243‐9. Epstein DJ. Cis‐regulatory mutations in human disease. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):310‐6. Kleinjan DJ, Coutinho P. Cis‐ruption mechanisms: disruption of cis‐regulatory control as a cause of human genetic disease. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):317‐32. Navratilova P, Becker TS. Genomic regulatory blocks in vertebrates and implications in human disease. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):333‐42. Kubo A, Imai KS, Satou Y. Gene‐regulatory networks in the Ciona embryos. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):250‐5. Theo Sijtse Palstra RJ. Close encounters of the 3C kind: long‐range chromatin interactions and transcriptional regulation. Brief Funct Genomic Proteomic. 2009 Jul;8(4):297‐309.

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. La asistencia supone el 70% de la evaluación. El 30% restante supondrá la lectura de 12 trabajos de investigación y el comentario de uno de ellos en 2‐3 paginas. Este trabajo es individual.

Máster Oficial en Conocimiento Actual de las Enfermedades Raras

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FICHAS POR ASIGNATURAS

Diagnóstico Molecular de Enfermedades Raras

Módulo 2



Denominación: Diagnóstico Molecular de Enfermedades Raras (Obligatoria) Código: 2103606


Descriptores Fundamentos bioquímicos, genéticos y moleculares del diagnóstico molecular. Introducción al diagnóstico molecular. Técnicas de diagnóstico molecular.

Titulación: Diagnóstico y Terapia de las Enfermedades Raras

Fechas Profesor responsable del módulo/asignatura Carlos Santos Ocaña




Seminarios ‐ ‐ ‐

Tutorías 2 0.05 4


Actividades dirigidas 6 0.20 12


2

TOTAL 50 2 100



Carlos Santos Ocaña. Profesor Titular de Universidad. Universidad Pablo de Olavide. Sevilla


DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. Se trata de justificar la relevancia de la asignatura y su relación con el programa. Se puede reflejar las aportaciones de la misma en el proceso formativo del alumnado haciendo mención a las competencias profesionales e investigación que otorga. La asignatura es la primera impartida en el 2º módulo del máster que se enfoca de manera general al diagnóstico molecular de las enfermedades raras. Esta asignatura constituye el acceso a las técnicas de diagnóstico y provee de los fundamentos teóricos y metodológicos necesarios para interpretar las técnicas utilizadas y para llevar a cabo un correcto seguimiento, pronóstico y tratamiento de las enfermedades raras. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Conocimientos básicos de Biología Celular, Biología Molecular, Genética y Bioquímica. Es necesario un nivel medio de lectura y comprensión lectora en inglés escrito. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Las detalladas en la memoria del título aunque es necesario señalar:‐ La comprensión de nuevas teorías, métodos, y técnicas. ‐ Uso de las TICs como herramientas de expresión y comunicación. ‐ Capacidad de aplicar los conocimientos a la resolución de problemas ‐ Capacidad de integración de diversas fuentes de datos. ‐ Capacidad de formular hipótesis basadas en la integración de datos. ‐ Habilidad para expresar ideas, hipótesis o conocimientos formulados en distintos entornos e idiomas (inglés). ‐ Adquirir y desarrollar capacidades de aprendizaje. ‐ Autonomía en el desarrollo del aprendizaje ‐ Conocer las enfermedades raras y los recursos de moleculares y bioquímicos para la evaluación, diagnóstico, seguimiento, pronóstico y tratamiento de las mismas. ‐ Conocimiento de los modelos animales y celulares utilizados en la investigación de enfermedades raras. ‐ Conocer la metodología básica de uso común en el estudio de las enfermedades raras. ‐ Diseñar y ejecutar experimentos para aclarar aspectos básicos y aplicados de las enfermedades raras. ‐ Realizar propuestas de nuevas pruebas diagnósticas. 3.2 ESPECÍFICAS:

• Cognitivas (Saber): o 1. Conocer la base de la enfermedad hereditaria o 2. Conocer las estrategias para la identificación de las mutaciones o 3. Conocer las técnicas adecuadas para el diagnóstico de las enfermedades raras.

• Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer): o 4. Conocer y utilizar fuentes de información científico‐técnica o 5. Capacidad valorar y desarrollar nuevas técnicas de diagnóstico

• Actitudinales (Saber ser y estar): o 6. Capacidad de expresión oral y escrita de los resultados obtenidos tras aplicar

pruebas diagnósticas o 7. Capacidad para valorar en grupo la aplicación y valoración de las pruebas

diagnósticas

3.3. OBJETIVOS 1. Conocer los fundamentos celulares, moleculares, genéticos y bioquímicos de las técnicas

utilizadas en el diagnóstico molecular. 2. Diseñar estrategias de diagnóstico molecular adaptadas a casos específicos de pacientes con

enfermedades raras 3. Desarrollar e implementar nuevas técnicas de diagnóstico molecular 4. Analizar resultados de la aplicación de técnicas de diagnóstico molecular 5. Expresar correctamente de forma oral y escrita los resultados de la aplicación de técnicas de

diagnóstico molecular

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Nº de Horas:

• Clases Teóricas*: 9 • Clases Prácticas*: 10 • Exposiciones y Seminarios*: 0 • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales): 2

A) Colectivas*: 1,5 B) Individuales: 0.5

• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: 6 A) Con presencia del profesor*: 2 B) Sin presencia del profesor: 4 • Otro Trabajo Personal Autónomo: 20 A) Horas de estudio: 18.5 B) Preparación de Trabajo Personal: 1,5 C) ... • Realización de Exámenes: 3 A) Pruebas escritas: 1 B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal): C) Exámenes web: 2

4.2. TÉCNICAS DOCENTES: Sesiones académicas teóricas

X Debate mediante foros:

X Tutorías especializadas:

X Sesiones académicas prácticas

X Visitas y excursiones:

Controles de lecturas obligatorias:

X Otros (especificar): Resolución de Problemas DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN:

1. Lectura y análisis de artículos científicos: El alumno recibirá como tarea la lectura de un artículo científico que trate sobre el diagnóstico molecular de enfermedades. Deberá preparar un resumen y una interpretación crítica del mismo. De forma dirigida deberá detallar las pruebas diagnósticas utilizadas y analizar la pertinencia de las mismas incluyendo posibles sugerencias. Esta actividad va ligada a la competencia específica cognitiva 3, las procedimentales 4 y 5 y las actitudinales 6 y 7. Esta actividad facilita el cumplimiento de los objetivos 1, 4 y 5.

2. Resolución de problemas: El alumno aplicar los conocimientos obtenidos sobre las técnicas utilizadas en el diagnóstico molecular para resolver problemas que simulan casos reales de enfermedades genéticas. Esta actividad va ligada a las competencias específicas cognitivas 1, 2 y 3, la procedimental 5 y la actitudinal 6. Esta actividad facilita el cumplimiento de los objetivos 2, 3 y 4.

5.‐ BLOQUES TEMÁTICOS 1. Introducción al Diagnóstico Molecular

1.1. Definición 1.2. Aplicaciones

1.2.1. Forenses 1.2.2. Detección agentes infecciosos 1.2.3. Detección de OMG en alimentos 1.2.4. Detección de enfermedades genéticas

1.3. Fundamentos 1.3.1. Celulares 1.3.2. Moleculares 1.3.3. Genéticos 1.3.4. Bioquímicos

2. Técnicas de Diagnóstico Molecular 2.1. Metodología Básica

2.1.1. Aislamiento de ácidos nucleicos y determinación de la calidad 2.1.2. Electroforesis de ADN y ARN 2.1.3. Técnicas de hibridación de ADN y ARN 2.1.4. Técnicas de amplificación de ADN y ARN 2.1.5. Técnicas de secuenciación de ADN

2.2. Detección de mutaciones genómicas y cromosómicas 2.2.1. Cariotipo 2.2.2. Nomenclatura de las alteraciones cromosómicas 2.2.3. Técnicas de comunes de diagnóstico

2.2.3.1. Cariotipado 2.2.3.2. FISH

2.3. Detección de mutaciones puntuales 2.3.1. Tipos de mutaciones puntuales 2.3.2. Técnicas comunes de diagnóstico

2.3.2.1. Hibridación 2.3.2.2. Electroforesis 2.3.2.3. Secuenciación 2.3.2.4. Amplificación



7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Richard, G. (2007) Biochemistry, New York: McGraw‐Hill. Strachan, T. (2006) Genética humana. México: McGraw‐Hill Interamericana. Jorde, L.B., (2005) Genética médica. Madrid: Elsevier. Pollard, T.D.(2002) Cell biology. Philadelphia: Saunders. Bruce, A. (2008) Molecular biology of the cell. New Cork: Garland Science. Trent, R.J. (2005) Molecular medicin. Amsterdam: Elsevier 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA Buckingham and Maribeth (2007) Molecular diagnostics : fundamentals, methods and clinical applications. Philadelphia: Davis, F.A. Patrinos, G. (2005) Molecular diagnostics. Ámsterdam/Boston: Elsevier Academic Press. G.J., Tsongalis (2002) Molecular diagnostics : a training and study guide. Washington: AACC Press. Rao, J.R., Fleming, C.C. and Moore, J. (2006) Molecular diagnostics: Current technology and applications, Norfolk: Horizon Bioscience.

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. En la evaluación, la asistencia supondrá un 10% de la calificación final repartido de forma proporcional a las horas presenciales impartidas. El resto de la calificación se basará en el uso de diversos instrumentos de evaluación que se basarán en el criterio de adquisición de conocimientos mayoritariamente junto con otros criterios que dependerán del instrumento utilizado. Exámenes online:

1. Examen global. Cubre los aspectos teóricos tratados de forma presencial y aspectos prácticos mediante problemas. Examen escrito. (30%). Adquisición de conocimiento.

2. Exámenes de fundamentos. Cubre los aspectos teóricos tratados de forma online. Examen online de 20 preguntas de distinto tipo. (20%). Adquisición de conocimientos, esfuerzo.

Pruebas individuales: 1. Resolución de un problema de diagnóstico. Tarea (20%). Adquisición de conocimientos.

Tutorías: Valoración de la participación en los foros colectivos (10%). Implicación y adquisición de conocimientos. Análisis de trabajos científicos: (10%)


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ENFERMEDADES MITOCONDRIALES



Denominación: ENFERMEDADES MITOCONDRIALES (Obligatoria) Código: 2103607


Descriptores

Titulación: MASTER DE DIAGNOSTICO Y TERAPIA DE LAS ENFERMEDADES RARAS

Fechas Profesor responsable del módulo/asignatura MIGUEL ANGEL MARTIN CASANUEVA


Clases teórico‐prácticas 15

Actividad por plataforma virtual 15

Seminarios

Tutorías 12

Horas de estudio 31


Actividades de evaluación 2

3

TOTAL 75 3 100


Dr. Miguel Ángel Martín Casanueva

Facultativo adjunto Servicio Bioquímica

Centro de Investigación

Hospital Universitario 12 de Octubre

CIBERER U‐723

Madrid

Dra. Cristina Ugalde Bilbao


Investigadora Miguel Servet, Instituto de Salud Carlos III

Centro de Investigación

Hospital Universitario 12 Octubre

CIBERER U‐723

Madrid

Dr. Eduardo Ruiz Pesini,

Dpto. Bioquímica, Biología Molecular y Celular

Fundación ARAGÓN I+D, Universidad de Zaragoza

CIBERER U‐727

Zaragoza

Dr. Rafael Artuch

Facultativo Adjunto S. Bioquímica Clínica

Hospital Sant Joan de Déu

CIBERER U‐703

Barcelona

Dra. Sandra Jackson

Universidad de Dresden

Alemania


Introducción: Sistema genético mitocondrial. Regulación de la biogénesis mitocondrial. Ensamblaje del sistema OXPHOS . Enfermedades de la cadena respiratoria: aspectos morfo‐histoquímicos Enfermedades de la cadena respiratoria: aspectos bioquímicos Enfermedades pediátricas de la cadena respiratoria: aspectos clínicos. Enfermedades del adulto de la cadena respiratoria: aspectos clínicos Enfermedades mitocondriales debidas a mutaciones en el mtDNA Déficits aislados de complejos de la cadena respiratoria: genes estructurales y de ensamblaje. Alteraciones genéticas que afectan al mantenimiento del mtDNA (comunicación intergenómica). Déficit de coenzima Q. Los haplogrupos mitocondriales en la fisiopatología mitocondrial Fisiopatología de las enfermedades mitocondriales: Estrés oxidativo, dinámica mitocondrial, apoptosis, y autofagia. Mitocondria y su relación con enfermedades prevalentes: diabetes, sordera, enfermedades, neurodegenerativas, cáncer. Protocolos y algoritmos diagnósticos en patología mitocondrial. Metodologías bioquímicas y moleculares aplicables al diagnóstico de enfermedades mitocondriales Desarrollo de nuevas tecnologías para el estudio de las enfermedades mitocondriales


Las enfermedades mitocondriales (enfermedades de la cadena respiratoria mitocondrial, o enfermedades del sistema OXPHOS) son un problema social y sanitario de primera magnitud ya que, aunque son individualmente raras, en su conjunto agrupan una amplia variedad de trastornos genéticos. Hoy en día se considera la implicación de la mitocondria, de forma primaria o secundaria, en más de la mitad de las enfermedades humanas. Aún permanecen sin diagnosticar a nivel bioquímico y molecular una gran proporción de estos pacientes, en gran medida debido a la falta de adecuadas pruebas diagnósticas, al control genético dual (ADN nuclear y ADN mitocondrial) de los factores que regulan el sistema OXPHOS, y a los complejos mecanismos moleculares responsables de los variados fenotipos clínicos; de ahí que a su vez sea una tarea complicada la búsqueda de terapias adecuadas en modelos celulares y animales. Este hecho les hace relevantes y justifica su estudio en el seno de un máster de diagnóstico y tratamiento de enfermedades raras; no en vano, en el contexto del CIBER de ER se estructura uno de sus cinco áreas como Area de Patología mitocondrial, lo que pone de manifiesto su importancia además en las líneas estratégicas de investigación nacionales. Esta asignatura pretende formar al alumno de manera integral al abordar un amplio espectro de temas que van desde una vertiente básica del conocimiento a nivel bioquímico molecular del sistema de fosforilación oxidativa (OXPHOS), pasando por el estudio de las características clínicas y de su clasificación bioquímico molecular de las diferentes patologías, hasta el razonamiento crítico de las metodologías y estrategias clínicas, y bioquímico‐moleculares que puedan elaborarse para mejora del diagnóstico de estas patologías; sin olvidar aspectos de las alteraciones fisiopatocelulares que ocurren en dichas enfermedades, claves para entender la fisiopatología de las mismas y para intentar identificar dianas moleculares de tratamiento. Además se establecerán talleres específicos sobre temas de actualidad preferentemente desde un punto de vista de investigación traslacional. Todo ello hará que el alumno adquiera competencias sobre el conocimiento estructurado y multidisciplinar de las patologías mitocondriales lo que les facultará tanto a nivel de profesionales del diagnóstico molecular en patología humana, como a nivel formativo en investigación pero con un perfil orientado a la enfermedad y al paciente. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Conocimientos: Bioquímica y enzimología Biología molecular Fisiología animal y humana Procedimientos: Metodología bioquímico‐molecular TICs Actitudes: Participación Pro‐actividad Actitud crítica

3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Conjuntamente con otras materias contribuyen a desarrollar en el alumnado el perfil profesional concreto. Se trabajarán en todas las asignaturas que componen el programa de estudio. Están relacionadas con actitudes y valores (saber ser y saber estar) y con los procedimientos (saber hacer). Se han de indicar, como máximo 5 competencias genéricas. Se seleccionarán aquéllas más relacionadas con los objetivos de nuestra materia. 1. Demostrar una buena capacidad de comprender y criticar la literatura científica. El alumno es capaz de obtener con facilidad literatura adecuada sobre temas científico‐técnicos. 2. Poseer los conocimientos, habilidades y actitudes que posibilitan la comprensión de nuevas teorías, interpretaciones, métodos y técnicas dentro de los diferentes campos disciplinares, conducentes a satisfacer de manera óptima las exigencias profesionales. El alumno demuestra una actitud de disposición al aprendizaje continuado de conceptos y métodos, manteniendo al tiempo el rigor crítico exigible a un científico. 3. Ser capaz de utilizar las Técnicas de Información y Comunicación (TICs) como una herramienta para la expresión y la comunicación, para el acceso a fuentes de información, como medio de archivo de datos y documentos, para tareas de presentación, para el aprendizaje, la investigación y el trabajo cooperativo. El alumno demuestra un correcto manejo del ordenador personal a nivel de usuario, incluyendo el uso de herramientas de comunicación y archivo de datos online. 4. Ser capaz de identificar, analizar, y definir los elementos significativos que constituyen un problema para resolverlo con rigor. El alumno es capaz de analizar problemas complejos, elaborar hipótesis y ponerlas a prueba utilizando el método científico. 5. Saber aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudios. El alumno es capaz de resolver problemas que requieren conocimientos multidisciplinares impartidos en distintas materias del Plan de estudios 3.2 ESPECÍFICAS: están relacionadas con los conocimientos, actitudes, y habilidades propios de la asignatura. Se definirán a partir de la formulación de los objetivos que se pretenden conseguir en la materia. Se han de indicar, como máximo 3 competencias específicas en cada uno de los ámbitos. Cognitivas (Saber):

i) conocimiento integral de los aspectos que intervienen en el diagnóstico de patologías mitocondriales

ii) conocimiento de la fisiopatología mitocondrial Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer):

i) formación en metodologías bioquímicas y moleculares de diagnóstico de patologías OXPHOS ii) interpretación de resultados de laboratorio en un contexto de incertidumbre clínica iii) metodologías en investigación traslacional de estas enfermedades

Actitudinales (Saber ser y estar): i) Plantear de forma crítica estrategias de diagnóstico en patología OXPHOS ii) Plantear preguntas de investigación con orientación traslacional

3.3. OBJETIVOS Se incluirán un máximo de diez, enumerándose sin ningún tipo de clasificación. Se deben relacionar con las competencias específicas.

1. Conocer la estructura bioquímica‐molecular del sistema OXPOS 2. Conocer el control genético‐dual de regulación del sistema OXPHOS 3. Integrar las características clínicas, anatómo‐patológicas y bioquímicas de las enfermedades

mitocondriales 4. Diferenciar la patología del ADN mitocondrial y del ADN nuclear 5. Conocer las consecuencias fisiopatocelulares de las alteraciones OXPHOS 6. Plantear estrategias de diagnóstico clínico‐bioquímico‐molecular en patologías OXPHOS 7. Conocimiento crítico de las metodologías bioquímicas y moleculares para el diagnóstico de la

patología mitocondrial 8. Razonamiento crítico sobre factores que modifican el fenotipo de estás enfermedades 9. Razonamiento crítico sobre aspectos no solucionados en patología mitocondrial con

orientación a investigación traslacional.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Se consignarán las horas (número aproximado) de trabajo del alumnado en cada uno de los grandes apartados. Nº de Horas:

• Clases Teóricas*: 11 • Clases Prácticas*: 4 • Exposiciones y Seminarios*: • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales):

A) Colectivas*: B) Individuales: 12

• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: A) Horas de estudio: 31 B) Preparación de Trabajo Personal: C) ... • Realización de Exámenes: A) Examen escrito: 2 B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal):

4.2. TÉCNICAS DOCENTES (señale con una X las técnicas que va a utilizar en el desarrollo de su asignatura. Puede señalar más de una. También puede sustituirlas por otras): Sesiones académicas teóricas X

Exposición y debate: X

Tutorías especializadas: X

Sesiones académicas prácticas X

Visitas y excursiones:

Controles de lecturas obligatorias: X

Otros (especificar): DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN: Se deben detallar las actividades dirigidas, seminarios o cualquier otra que se pretenda realizar y justificar su necesidad en relación con los objetivos y las competencias Se realizarán 4 talleres dirigidas con profesor para profundizar en temas relacionados con los últimos conocimientos de la biología molecular‐celular del sistema OXPHOS, en el diagnóstico de nuevas mutaciones en el ADN mitocondrial, y en relación con actividades clínico‐bioquímicas recientemente adquiridas en la comunidad científica, con el fin de capacitar al alumno en el espíritu crítico, y fomentar su orientación hacia la investigación desde el punto de vista de traslación de los conocimientos para resolver problemas de salud. Talleres Taller I: Cristina Ugalde Bilbao. El respirasoma mitocondrial en la fisiopatología de las enfermedades mitocondriales Taller II. Eduardo Ruiz Pesini. Criterios utilizados para definir la patogenicidad de mutaciones en mtDNA Taller III. Rafael Artuch. Estrategias para el diagnóstico de deficiencias de coenzima Q. /ó Deficiencia de folato cerebral en pacientes con patologías multisistémicas mitocondriales. Taller IV. Sandra Jackson. MELAS


Se presentarán los contenidos temáticos que se trabajarán en la asignatura para lograr las competencias específicas formuladas. Bloque I: Introducción a la biología molecular del sistema OXPHOS Introducción: Sistema genético mitocondrial. Regulación de la biogénesis mitocondrial. Ensamblaje del sistema OXPHOS . Bloque II: Aspectos clínicos, morfohistoquímicos y bioquímicos de las enfermedades mitocondriales. Enfermedades de la cadena respiratoria: aspectos histoquímicos Enfermedades de la cadena respiratoria: aspectos bioquímicos Enfermedades pediátricas de la cadena respiratoria: aspectos clínicos. Enfermedades del adulto de la cadena respiratoria: aspectos clínicos Bloque III. Clasificación bioquímico‐molecular de las patologías de la cadena respiratoria mitocondrial. Enfermedades mitocondriales debidas a mutaciones en el mtDNA Déficits aislados de complejos de la cadena respiratoria: genes estructurales y de ensamblaje. Alteraciones genéticas que afectan al mantenimiento del mtDNA (comunicación intergenómica). Déficit de coenzima Q. Mitocondria y su relación con enfermedades prevalentes: diabetes, sordera, enfermedades, neurodegenerativas, cáncer Bloque IV. Aspectos fisiopatológicos Los haplogrupos mitocondriales en la fisiopatología mitocondrial Papel fisiopatológico del estrés oxidativo, dinámica mitocondrial, apoptosis, y autofagia. Bloque V. Metodologías y estrategias de diagnóstico. Protocolos y algoritmos diagnósticos en patología mitocondrial. Desarrollo de nuevas tecnologías para el estudio de las enfermedades mitocondriales

Talleres Taller I: Cristina Ugalde Bilbao. El respirasoma mitocondrial en la fisiopatología de las enfermedades mitocondriales Taller II. Eduardo Ruiz Pesini. Criterios utilizados para definir la patogenicidad de mutaciones en mtDNA Taller III. Rafael Artuch. Estrategias para el diagnóstico de deficiencias de coenzima Q. /ó Deficiencia de folato cerebral en pacientes con patologías multisistémicas mitocondriales. Taller IV. Sandra Jackson. MELAS 6.- HORARIO DE CLASE. TEORÍA Y PRÁCTICA https://www.google.com/calendar/embed?src=jasanalc%40upo.es&ctz=Europe/Madrid


7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Libro Serie: Mitochondria 2nd Edition. Methods in Cell Biology, vol 80 Ed. Pon LA, Schon EA. 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA 1. Rhaman S and Hanna MG (2009) Diagnosis and therapy in neuromuscular disorders: diagnosis and new

treatments in mitocondrial diseases. J Neurol Neurosurg Psichiatry 80:943‐953 2. Di Donato S (2009) Multisystem manifestations of mitochondrial disorders. J Neurol 256:693‐710 3. Taylor RW, Turnbull DM. (2005) Mitochondrial DNA mutations in human disease. Nat Rev Genet 6:389–

402. 4. Taylor RW, et al. (2004). The diagnosis of mitochondrial muscle disease. Neuromusc Disord 14:237–45 5. Rahman S, Poulton J. (2009) Diagnosis of mitochondrial DNA depletion syndromes. Arch Dis Child 94:3–5 6. Horvath R, et al.(2006) Phenotypic spectrum associated with mutations of the mitochondrial polymerase

gamma gene. Brain 129:1674–84.

7. Fernadez‐Vizarra E, Tiranti V, Zeviani M (2009) Assembly of the oxidative phosphorylation system in humans: What we have learned by studying its defects. Biochim Biophys Acta1793:200–211 Related articles

8. Distelmaier F, et al (2009). Mitochondrial complex I deficiency: from organelle dysfunction to clinical disease. Brain. 2009 ;132:833‐42. Related articles

9. Dimauro S. (2004) Mitochondrial medicine. Biochim Biophys Acta. 2004 ;1659:107‐114.

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. Se deben detallar, incluyendo los criterios (asistencia, esfuerzo, adquisición de conocimientos, implicación…) e instrumentos de evaluación empleados (prácticas de laboratorio, de campo, examen escrito, oral, exposición en grupo, trabajos…). Debe tener una cierta coherencia con el método de trabajo elegido y las actividades propuestas a los alumnos. Asistencia Examen escrito Trabajo


Enfermedades Raras

Modulo II: Diagnóstico Molecular de las Enfermedades Raras Asignatura: Enfermedades Raras Metabólicas


Curso 2012‐2013



Denominación: Enfermedades Raras Metabólicas (Obligatoria) Código: 2103608

Área de Conocimiento: Bioquímica y Metabolómica Clínica

Descriptores Errores innatos del metabolismo, metabolopatías congénitas, transtornos genéticos hereditarios

Titulación: Diagnóstico y Terapia de las Enfermedades raras. Curso de Postgrado.

Fechas Profesor responsable de la asignatura Manuel Angel Ballesteros Simarro


Clases teórico‐prácticas 12 0,48 24% Actividad por plataforma virtual 12 0,48 24% Seminarios 0 0 0% Tutorías 5 0,2 10% Horas de estudio 18 0,72 36% Actividades dirigidas 0 0 0% Actividades de evaluación 3 0,12 6%

2

TOTAL 50 2 100



• D. Luis Jiménez Jiménez, Jefe de Sección de Bioquímica Clínica, Hospital Virgen del Rocio de Sevilla.

Contacto: [email protected]

• Dr. Antonio González Meneses, Director de las unidades de Dismorfología y de Síndrome de Down del Hospital Virgen del Rocio de Sevilla, Director del Plan Andaluz de Atención a Pacientes con Enfermedades Raras 2008‐ 2012.


• Dr. Juan José Infante, Director científico de Bionaturis (I+D+i)


• Dr. Manuel Angel Ballesteros Simarro, Departamento de Anatomía, Fisiología y Biología Celular, Profesor de la Universidad Pablo de Olavide.



DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La Enfermedades raras metabólicas son un grupo numeroso de enfermedades hereditarias producidas por el bloqueo de alguna vía metabólica en el organismo. La asignatura estará centrada en el aprendizaje por parte del alumno de las pruebas moleculares más modernas para la investigación, diagnóstico, pronóstico y seguimientos de las metabolopatías más prevalentes en el territorio nacional, presentando especial atención a la importancia del diagnóstico precoz como un factor clave para enfrentar la progresión de la patología: Consejo genético a las parejas de padres con cierto riesgo, programas de cribado neonatal y los procedimientos selectivos o específicos ante la sospecha diagnóstica. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Se requieren conocimientos previos de Bioquímica y regulación metabólica. Es necesario haber cursado el primer módulo del curso (Aspectos generales de las enfermedades raras) y la asignatura 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Conviene señalar las siguientes: ‐ La comprensión de nuevas teorías, métodos, y técnicas, en especial las aplicadas al diagnóstico molecular de las metabolopatías.

• Uso de las TICs como herramientas de expresión y comunicación. • Capacidad de aplicar los conocimientos a la resolución de problemas • Capacidad de formular hipótesis basadas en la integración de datos. • Habilidad para expresar ideas, hipótesis o conocimientos formulados en distintos entornos e

idiomas (inglés). • Adquirir y desarrollar capacidades de aprendizaje, en especial el aprendizaje autónomo. • Conocer las enfermedades raras y los recursos de moleculares y bioquímicos para la evaluación,

diagnóstico, seguimiento, pronóstico y tratamiento de las mismas. • Conocimiento de los modelos animales y celulares utilizados en la investigación de

enfermedades raras. • Diseñar y ejecutar experimentos para aclarar aspectos básicos y aplicados de las enfermedades

raras. • Realizar propuestas de nuevas pruebas diagnósticas.

3.2 ESPECÍFICAS: están relacionadas con los conocimientos, actitudes, y habilidades propios de la asignatura. Se definirán a partir de la formulación de los objetivos que se pretenden conseguir en la materia.

o Cognitivas (Saber): Referente a las metabolopatías: 1. Conocer las bases de este tipo de transtornos 2. Conocer las estrategias para su identificación. 3. Conocer las técnicas adecuadas para su diagnóstico.

o Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer): 4. Conocer y utilizar de forma adecuada fuentes de información científico‐técnica. 5. Capacidad para valorar y desarrollar nuevas técnicas de diagnóstico.

o Actitudinales (Saber ser y estar): 6. Capacidad de expresión oral y escrita de los resultados obtenidos tras aplicar purebas

diagnósticas 7. Capacidad para valorar en grupo la aplicación de las pruebas diagnósticas.

3.3. OBJETIVOS

1. Conocer los fundamentos celulares, moleculares, genéticos y bioquímicos de las técnicas utilizadas en el diagnóstico molecular de las metabolopatías.

2. Diseñar estrategias de diagnóstico molecular adaptadas a casos específicos de pacientes con enfermedades raras metabólicas, en especial con la generación de medicamentos innovadores y nuevos sistemas diagnósticos.

3. Analizar resultados de aplicaciones de técnicas de diagnostico molecular de metabolopatías. 4. Poner en contacto a los alumnos con grupos de investigación destacados en el campo de las

enfermedades raras metabólicas, proporcionando un marco para establecer futuras relaciones laborales.

5. Proporcionar a los alumnos una formación sólida y multidisciplinar con vistas a su acceso posterior a estudios de doctorado.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Se consignarán las horas (número aproximado) de trabajo del alumnado en cada uno de los grandes apartados. Nº de Horas: 50


A) Colectivas*: 1 B) Individuales: 4

• Otro Trabajo Personal Autónomo: 18 A) Horas de estudio: 9 B) Preparación de Trabajo Personal: 9 C) Exposición y discusión de un trabajo bibliográfico por los alumnos del Máster: 3

4.2. TÉCNICAS DOCENTES Sesiones académicas teóricas Exposición y debate Tutorías especializadas Sesiones académicas prácticas Controles de lecturas obligatorias Otros (especificar): DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN:


A. BLOQUE TEÓRICO i. Introducción a las enfermedades raras metabólicas.

ii. Alteraciones del metabolismo de los carbohidratos. iii. Alteraciones del metabolismo de los aminoácidos. iv. Alteraciones del metabolismo de los ácidos orgánicos. v. Alteraciones de las purinas y pirimidinas.

vi. Alteraciones del metabolismo lipídico. vii. Las porfirias.

viii. Alteraciones peroxisomales. ix. Alteraciones lisosomales. x. Control de calidad en el diagnóstico de enfermedades hereditarias del metabolismo (QAP-ERNDIM, Quality

Assurance Program). Programa de control de calidad, QA externos: SEQC (España) y CDCs (EE.UU) xi. Programa de cribado neonatal de Andalucía.

B. BlOQUE PRÁCTICO

I. Diagnóstico molecular a partir de muestras sanguíneas II. Taller de Enfermedades lisosomales con práctica en el laboratorio I+D+i de Bionaturis, (CABD)



7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL:

1. Ruiz Pons M, Sánchez‐Valverde F, Dalmau Serra J. (2004) Tratamiento nutricional de los errores innatos del metabolismo. Madrid, Ergon. p.6‐31.

2. Galán Gómez , E. (2010) Consejo genético y enfermedades metabólicas hereditarias. En: Sanjurjo P, Baldellou A (eds.). Diagnóstico y tratamiento de las enfermedades metabólicas hereditarias. 3ª ed. Madrid, Ergon; 2010. p. 333‐42.

3. Saudubray, JM; Sedel, F. (2010) Enfermedades metabólicas hereditarias: generalidades, grupos clínicos y algoritmos diagnósticos. En: Sanjurjo P, Baldellou A (eds.).Diagnóstico y tratamiento de las enfermedades metabólicas hereditarias. 3ª ed. Madrid, Ergon. p. 63‐112.

7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA

Disponible en el Campus Virtual

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. El método de evaluación propuesto para esta asignatura es un sistema de evaluación continua, donde se tendrán en cuenta los siguientes criterios de evaluación:

― asistencia a las clases presenciales ― esfuerzo del estudiante ― adquisición de conocimientos ― implicación y participación en las actividades presenciales y virtuales ― estudio y desarrollo de las actividades virtuales

Para cuantificar el grado de participación y determinar la adquisición de las competencias se proponen los siguientes instrumentos de evaluación:

― control de la asistencia a las clases prácticas y seminarios y participación activa en las actividades que se propongan virtualmente.

― prácticas de laboratorio ― realización y desarrollo correcto de las actividades y ejercicios planteadas en las clases prácticas

La nota final obtenida en este curso se calculará de la siguiente manera:

40%: Asistencia y participación a clases teóricas y prácticas, obligatoria para aprobar 25% Realización de un examen tipo test sobre los contenidos de las sesiones asistenciales. 35% Entrega de un trabajo de revisión en el que el alumno ampliará alguna de las patologías citadas en esta asignatura. Deberá incluir una descripción de la enfermedad con la vía metabólica afectada, incidencia a nivel nacional y europeo, detalles de la sintomatología, curso de la enfermedad a lo largo de la vida del paciente, tratamiento especifico y/o paliativo. También se pretende que el alumno investigue sobre la calidad de la vida de estos pacientes, si hay asociaciones en el territorio nacional y que proponga propuestas de mejora a la atención de estas personas.


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OTRAS ENFERMEDADES RARAS: ENFERMEDADES RARAS HEMATOLÓGICAS.



Denominación: OTRAS ENFERMEDADES RARAS: ENFERMEDADES RARAS HEMATOLÓGICAS. (Obligatoria) Código: 2103610


Descriptores

Enfermedades raras hematológicas. Introducción: Sistema hematopoyético y sistema inmune. Regulación del funcionamiento del sistema hematopoyético y sistema inmune. Métodos de estudio morfológicos, inmunofenotípicos, genéticos y moleculares. Enfermedades raras de la línea eritroide: Hemoglobinuria paroxística nocturna, anemia de Fanconi, Síndromes mielodisplásicos. Leucemias agudas raras. Tricoleucemia. Macroglobulinemia de Waldenström Trastornos congénitos de la coagulación. Hemofilias. Enfermedad de von Wilebrand. Trombocitopatías. Hipercoagulabilidad. Trastornos del sistema inmune. Inmunodeficiencias. Amiloidosis. Enfermedad de Castleman y síndrome de POEMS. Granulomatosis linfomatoide. Síndromes linfoproliferativos postrasplante de órganos. Errores congéniros del metabolismo. Histiocitosis. Mastocitosis. Investigación básica e investigación traslacional. Ensayos clínicos en enfermedades raras. Epidemiología de las enfermedades hematológicas raras. Aspectos éticos y sociales.

Titulación: MASTER DE DIAGNOSTICO Y TERAPIA DE LAS ENFERMEDADES RARAS

Fechas

Profesor responsable del módulo/asignatura

Pilar Giraldo Castellano José A Sánchez Alcázar


Clases teórico‐prácticas 6

Actividad por plataforma virtual 6

Seminarios

Tutorías

Horas de estudio 17


Actividades de evaluación 1

1

TOTAL 25‐30 1 100


Dra. Pilar Giraldo Castellano, Profesor Titular. Universidad de Zaragoza


Dr. José A Sánchez Alcázar, Universidad Pablo de Olavide


DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. Los avances en las técnicas de diagnóstico y la incorporación de nuevos tratamientos han producido modificaciones en el conocimiento de entidades poco frecuentes pero que constituyen modelos completos de actuación aplicables a otras entidades hematológicas no tan raras. El conocimiento detallado de la biología y de las alteraciones genéticas y moleculares que acontecen en estos procesos y actualmente son identificables en una gran mayoría. Los procedimientos diagnósticos se han ido incorporando desde el ámbito de la investigación molecular y después trasladando el conocimiento a la actividad clínica asistencial. El estudio de las enfermedades hematológicas raras es un ejercicio importante e interesante para conocer las dimensiones del problema: planteamiento del problema en estudio, procedimientos diagnósticos a aplicar para resolverlo, opciones de tratamiento, comunicación del problema al paciente y familiares estableciendo un pronóstico y su repercusión social, familiar y laboral.

2. REQUISITOS DE ACCESO. Materia: Diagnóstico citológico de las enfermedades hematológicas raras Asignatura: Diagnóstico citológico de las enfermedades hematológicas raras Materia: Marcadores inmunológicos de las enfermedades hematológicas raras Asignatura: Marcadores inmunológicos de las enfermedades hematológicas raras Materia: Diagnóstico genético y molecular de las enfermedades hematológicas raras Asignatura: Diagnóstico genético y molecular de las enfermedades hematológicas raras. Materia: Tratamiento farmacológico de las enfermedades hematológicas raras Asignatura: Tratamiento farmacológico de las enfermedades hematológicas raras Materia: Trasplante en las enfermedades hematológicas raras Asignatura: Trasplante en las enfermedades hematológicas raras

3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. 1. Identificar los recursos citológicos, inmunofenotípicos, genéticos y moleculares para el diagnóstico, seguimiento, pronóstico y tratamiento de los pacientes afectados por enfermedades hematológicas raras. 2. Describir las bases moleculares de las enfermedades hematológicas raras. 3. Diseñar estrategias de investigación en las enfermedades descritas, utilizando las técnicas y los organismos modelos más apropiados 4. Identificar las técnicas moleculares o bioquímicas adecuadas para el diagnóstico y seguimiento de las distintas enfermedades descritas en el módulo 5.- Establecer las estrategias de tratamiento de acuerdo a los parámetros biológicos

3.2 ESPECÍFICAS: 1. Conocer la base de las enfermedades hematológicas 2. Conocer las estrategias para la identificación de las alteraciones biológicas 3. Conocer los fundamentos básicos moleculares y celulares de las diferentes enfermedades estudiadas en el módulo 4. Conocer e identificar las características diagnósticas fundamentales de las diferentes enfermedades estudiadas en el módulo 5. Conocer las más actuales técnicas utilizadas para el diagnóstico de estas enfermedades 6.Conocer las bases racionales de los tratamientos adecuados a cada una de las enfermedades estudiadas 7. Conocer la indicación, las bases y procedimiento del trasplante de precursores hematopoyéticos 8. Como comunicar un diagnóstico de una enfermedad hematológica rara y el planteamiento terapéutico 9. Conocer y utilizar las más actuales fuentes de información científico-técnicas sobre el tema 10. Expresarse de forma escrita y oral adecuadamente utilizando términos científicos relacionados con la asignatura

3.3. OBJETIVOS 1. Conocer la fisiología del sistema hematopoyético y del sistema inmune para entender el origen de las enfermedades hematológicas 2. Conocer los métodos de valoración funcional del sistema hematopoyético y estudio del sistema inmune. 3. Interpretar los resultados básicos moleculares y celulares que permiten identificar las diferentes enfermedades estudiadas en el módulo 4. Conocer e identificar las características clínicas que orientan el diagnóstico de las diferentes enfermedades estudiadas en el módulo 5. Conocer las modalidades de tratamiento de las enfermedades hematológicas abordadas en el módulo 6.Conocer los métodos de evaluación de eficacia de los tratamientos aplicados a cada una de las enfermedades estudiadas 7. Conocer las bases, procedimiento e indicaciones del trasplante de precursores hematopoyéticos 8. Estudiar las habilidades de comunicación del diagnóstico de una enfermedad hematológica rara y el planteamiento terapéutico 9. Buscar en las fuentes de información los conocimientos actuales mas relevantes sobre el tema

10. Plantear un trabajo de investigación relacionado con las enfermedades estudiadas en el módulo.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Se consignarán las horas (número aproximado) de trabajo del alumnado en cada uno de los grandes apartados. Nº de Horas:

• Clases Teóricas*: 6 • Clases Prácticas*: • Exposiciones y Seminarios*: • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales):

A) Colectivas*: B) Individuales:

• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: A) Horas de estudio: 17 B) Preparación de Trabajo Personal: C) ... • Realización de Exámenes: A) Examen escrito: 1 B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal):

4.2. TÉCNICAS DOCENTES (señale con una X las técnicas que va a utilizar en el desarrollo de su asignatura. Puede señalar más de una. También puede sustituirlas por otras): Sesiones académicas teóricas

X Exposición y debate:

Tutorías especializadas:

Sesiones académicas prácticas

Visitas y excursiones:


Otros (especificar): DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN: Se deben detallar las actividades dirigidas, seminarios o cualquier otra que se pretenda realizar y justificar su necesidad en relación con los objetivos y las competencias

5.‐ BLOQUES TEMÁTICOS Se presentarán los contenidos temáticos que se trabajarán en la asignatura para lograr las competencias específicas formuladas.



7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Farreras-Rozmann 16º edición (2009) Medicina Interna, 2 vols. + CD-ROM J Sans Sabrafen, C Besses Raebel, JL Vives Corrons –Hematología Clínica. 6ª edición 2006 Rozmann C Hematologia. Atlas practico para el medico general.2005 Woessner S. La citología óptica en el diagnóstico hematológico. 5ª edición 2006 Mehta A. Haematology at a glance 3ª edición. 2008 García Conde J Hematología 2003 Hoffmann R Hematology: basic principles and practice 2008 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA Hernández- Nieto L Biopsia de la medula ósea. Perspectiva clínico-patológica 2007 Burg G Cutaneous Lymphomas. 2005 Sun T Flow cytometry and Immunohistochemistry for Hematologic Neoplasms. 2008. Leonard JP. Hodgkin`s and non-Hodgkin`s Lymphoma. 2006 Richardson P Multiple Myeloma 2007 Ansell S Rare Hematological Malignancies 2008

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. ASISTENCIA PARTICIPACION EN LAS CLASES EXAMEN ESCRITO TRABAJOS


Módulo 4 Modelos animales y celulares para el estudio de las enfermedades raras

ASIGNATURA GENÓMICA ESTRUCTURAL, FUNCIONAL Y COMPARATIVA,

ANÁLISIS FILOGENÉTICO Y BIOINFORMÁTICA

________________________________________________________________________________________________


FICHA POR ASIGNATURA



Denominación: GENÓMICA ESTRUCTURAL, FUNCIONAL Y COMPARATIVA, ANÁLISIS FILOGENÉTICO Y BIOINFORMÁTICA (Obligatoria) Código: 2103616


Descriptores

― Introducción a los modelos animales y celulares para el estudio de las enfermedades raras. ― Análisis genómico y filogenético de genes homólogos. ― Análisis genético. Análisis bioquímico. Análisis fisiológico e histopatológico. Análisis fenotípico.― Procedimientos experimentales de mayor uso en el estudio de modelos animales y celulares.

Titulación: Master en Diagnóstico y Terapia de las Enfermedades Raras Fechas Profesor responsable del módulo/asignatura

Daniel José Moreno Fernández-Ayala


Clases teórico‐prácticas 4 0,16 16%

Actividad por plataforma virtual 4 0,16 16%

Seminarios 0 0 0%

Tutorías 2 0,08 8%

Horas de estudio 14 0,56 56%

Actividades dirigidas 0 0 0%

Actividades de evaluación 1 0,04 4%

1

TOTAL 25 1 100%



Oswaldo Trelles Salazar

― Profesor Titular de Universidad (Universidad de Málaga)

― [email protected]

― Profesor responsable del curso

Daniel José Moreno Fernández‐Ayala

― Profesor Contratado Doctor (Universidad Pablo de Olavide)


― Profesor responsable del módulo 4


DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La relevancia de esta asignatura… (INDICAR PORQUÉ ES IMPORTANTE) La realización de este curso aportará al alumno las competencias básicas necesarias para… (QUÉ APRENDERÁ EL ALUMNO) 2. REQUISITOS DE ACCESO. En principio no existen requisitos indispensables de acceso a este curso. sin embargo, sí se recomienda tener un conocimiento medio de ingles científico y haber superado con éxito los cursos incluidos en los módulos anteriores. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Las competencias generales a trabajar en este curso son comunes a todos los cursos del módulo 4 “Modelos animales y celulares para el estudio de las enfermedades raras”. Entre ellas: 1. Demostrar una buena capacidad de comprender y criticar la literatura científica. El alumno debe ser

capaz de obtener con facilidad literatura adecuada sobre temas científico‐técnicos. 2. Poseer los conocimientos, habilidades y actitudes que posibilitan la comprensión de nuevas teorías,

interpretaciones, métodos y técnicas dentro de los diferentes campos disciplinares, conducentes a satisfacer de manera óptima las exigencias profesionales. El alumno debe demostrar una actitud de disposición al aprendizaje continuado de conceptos y métodos, manteniendo al tiempo el rigor crítico exigible a un científico.

3. Ser capaz de utilizar las Técnicas de Información y Comunicación (TICs) como una herramienta para la expresión y la comunicación, para el acceso a fuentes de información, como medio de archivo de datos y documentos, para tareas de presentación, para el aprendizaje, la investigación y el trabajo cooperativo. El alumno debe demostrar un correcto manejo del ordenador personal a nivel de usuario, incluyendo el uso de herramientas de comunicación y archivo de datos online.

4. Ser capaz de identificar, analizar, y definir los elementos significativos que constituyen un problema para resolverlo con rigor. El alumno debe ser capaz de analizar problemas complejos, elaborar hipótesis y ponerlas a prueba utilizando el método científico.

5. Ser capaz de cuestionar hipótesis y principios en base a los fundamentos en los que se asientan las ideas, acciones y juicios, tanto propios como ajenos. El alumno debe ser capaz de juzgar críticamente y de forma racional cualquier idea, propia o ajena.

3.2 ESPECÍFICAS Las competencias específicas a trabajar en este curso se centran en describir y conocer Drosophila melanogaster como un organismo modelo en la investigación sobre las enfermedades raras. En este curso trabajaremos las siguientes competencias: 1. Cognitivas (Saber)

― Conocer los principales sistemas modelos genéticos, experimentales y genómicos para la investigación biomédica.

― Saber comparar tanto las principales rutas metabólicas y de señalización como la fisiopatología en los diferentes organismos modelo.

2. Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer) ― Ser capaz de identificar las dianas moleculares y los mecanismos de acción en el estudio de los

modelos animales de enfermedad. ― Saber manejar las herramientas básicas bioinformáticas para el estudio de los diferentes

modelos animales de enfermedad. 3. Actitudinales (Saber ser y estar)

― Saber trabajar en equipo. 3.3. OBJETIVOS

1. Conocimiento del genoma, la estructura genómica y la genética de los organismos modelo. 2. Conocimiento de las herramientas experimentales bioinformáticas propias para el trabajo con

los diferentes modelos biológicos.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Nº de Horas: 25

• Clases Teóricas*: 4 • Clases Prácticas*: 4 • Exposiciones y Seminarios*: • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales): 2


• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: 14 A) Horas de estudio: 4 B) Preparación de Trabajo Personal: 10 • Realización de Exámenes: 1 A) Examen escrito: B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal): 1





Visitas y excursiones: X




7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL ― Por ejemplo, algún libro al que tengan acceso fácil en biblioteca ― También se pueden poner sitios web 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA ― Por ejemplo, artículos específicos de la materia…

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. El método de evaluación propuesto para este curso es un sistema de evaluación continua, donde se tendrán en cuenta los siguientes criterios de evaluación:

― asistencia a las clases presenciales ― esfuerzo del estudiante ― adquisición de conocimientos ― implicación y participación en las actividades presenciales y virtuales ― estudio y desarrollo de las actividades virtuales


― prácticas de laboratorio ― examen escrito / oral ― realización y desarrollo correcto de las actividades y ejercicios planteadas en las clases prácticas ― ejecución y desarrollo correcto de las actividades y ejercicios a realizar virtualmente ― control de la asistencia a las clases prácticas y seminarios y participación activa en las actividades que se

propongan virtualmente. La nota final obtenida en este curso se calculará de la siguiente manera: a) 50% correspondiente a la parte a desarrollar en l aplataforma virtual, donde se tendrá en cuenta

• Realización de las actividades virtuales propuestas obligatorio para aprobar su calidad determinará la nota a obtener en este apartado

b) 50% correspondiente a la parte presencial

• Clases prácticas (25% de la nota final) asistencia obligatoria para aprobar entrega de las actividades propuestas obligatorio para aprobar realización y desarrollo correcto su calidad determinará la nota de este apartado

• Seminarios (25% de la nota final) asistencia obligatoria para aprobar entrega de un resumen (máximo 1 página A4) de los trabajos expuestos su calidad determinará la nota a obtener en este apartado


_____________________________________________________________________________________________ ________________________________________________________________________________________________



Estudio del genoma, la genética y la bioquímica de la levadura Saccharomyces cerevisiae

Módulo 4



Denominación: Genómica, genética y biología funcional de Saccharomyces cerevisiae y su relación con la enfermedad genética (Obligatoria) Código: 2103617


Descriptores

Estudio del genoma, la genética y la bioquímica de la levadura Saccharomyces cerevisiae. Saccharomyces cerevisiae, como modelo eucariota unicelular que aporta herramientas para el análisis genético y bioquímico.

Titulación: Diagnóstico y Terapia de las Enfermedades Raras

Fechas Profesor responsable del módulo/asignatura Daniel José Moreno Fernández‐Ayala / Carlos Santos Ocaña


Clases teórico‐prácticas 15 0.50 33,3


Seminarios 2 0.07 4,4

Tutorías 2 0.07 4,4

Horas de estudio 19 0.63 42,5

Actividades dirigidas 4 0.13 8,8

Actividades de evaluación 3 0.10 6,6

1,5

TOTAL 45 1.5 100



Carlos Santos Ocaña. Profesor Titular de Universidad. Universidad Pablo de Olavide. Sevilla

Eva Trevisson. Investigadora, Universidad de Pagua (Italia)

Pascual Sanz Bigorra. Investigador, Instituto de Biomedicina de Valencia (CSIC)

Daniel José Moreno Fernández‐Ayala. Profesor Contratado Doctor. Universidad Pablo de Olavide. Sevilla



El modelo de levadura ha sido una importantísima herramienta inicial para comprender las causas básicas que subyacen a una enfermedad rara. La levadura como eucariota, comparte la mayor parte de los aspectos genéticos, bioquímicos, celulares y moleculares de las células humanas. Desde este entorno celular es sorprendente la similitud entre ambos modelos, levadura‐humano. La levadura aporta una ventaja inicial para constituirse como organismo modelo, la simplicidad a todos los niveles. Una propiedad fundamental cuando se inicia el desbroce de un camino complejo como son las enfermedades raras. Por supuesto es necesario poseer de un conocimiento exhaustivo del modelo para obtener el mayor rendimiento, incluyendo algunas características diferenciales que son importantes conocer a la hora de interpretar los resultados obtenidos. Y todo ello acompañado de las técnicas experimentales de manipulación y mantenimiento del modelo permitirán obtener un buen rendimiento en la investigación y/o diagnóstico de estas enfermedades.. 2. REQUISITOS DE ACCESO. Conocimientos básicos de Biología Celular, Biología Molecular, Genética y Bioquímica. Es necesario un nivel medio de lectura y comprensión lectora en inglés escrito. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Las detalladas en la memoria del título aunque es necesario señalar:‐ La comprensión de nuevas teorías, métodos, y técnicas. ‐ Uso de las TICs como herramientas de expresión y comunicación. ‐ Capacidad de aplicar los conocimientos a la resolución de problemas ‐ Capacidad de integración de diversas fuentes de datos. ‐ Capacidad de formular hipótesis basadas en la integración de datos. ‐ Habilidad para expresar ideas, hipótesis o conocimientos formulados en distintos entornos e idiomas (inglés). ‐ Adquirir y desarrollar capacidades de aprendizaje. ‐ Autonomía en el desarrollo del aprendizaje ‐ Conocer la metodología básica de uso común en el estudio de las enfermedades raras. 3.2 ESPECÍFICAS:

• Cognitivas (Saber): o 1. Conocer las características fisiológicas del modelo de levadura o 2. Conocer las características metabólicas, celulares y bioquímicas del modelo de

levadura. o 3. Conocer los modelos de enfermedad e identificación de dianas moleculares y

mecanismos de acción en el modelo de levadura. • Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer):

o 4. Conocer y utilizar fuentes de información científico‐técnica o 5. Capacidad para desarrollar protocolos de análisis de enfermedades genéticas

mediante el modelo de levadura. • Actitudinales (Saber ser y estar):

o 6. Capacidad de expresión oral y escrita de los resultados obtenidos tras aplicar pruebas diagnósticas

o 7. Capacidad de trabajo en grupo.

3.3. OBJETIVOS 1. Conocer las herramientas experimentales propias de la levadura de utilidad para el estudio de

enfermedades raras. 2. Comprensión de la biología fundamental de la levadura como base para la modelización y

estudio de los procesos bioquímicos, celulares y fisiopatológicos de las enfermedades humanas. studios

3. Estudio de ejemplos concretos de enfermedades genéticas raras y su análisis en el modelos de levadura.

4. Definición de los mecanismos de acción alterados en el modelo de levadura y determinación de posibles dianas moleculares inferidas a partir de los datos experimentales obtenidos.

5. Aprendizaje de las técnicas empleadas en cultivo de levadura y procesos básicos de mantenimiento.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Nº de Horas: 45



• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: 4 A) Con presencia del profesor*: 0 B) Sin presencia del profesor: 4 • Otro Trabajo Personal Autónomo: 19 A) Horas de estudio: 13 B) Preparación de Trabajo Personal: 6 C) ... • Realización de Exámenes: 3 A) Pruebas escritas: B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal): C) Exámenes web: 3

4.2. TÉCNICAS DOCENTES: Sesiones académicas teóricas

X Debate mediante foros:

X Tutorías especializadas:

X Sesiones académicas prácticas

X Seminarios en grupo:

X Comentarios sobre seminarios:

Otros (especificar): DESARROLLO Y JUSTIFICACIÓN:

1. Seminarios en grupo: Los alumnos recibirán material bibliográfico de partida sobre un tema relacionado con la asignatura. Con este material y otro adicional deberán preparar una exposición conjunta ante el resto de compañeros. Esta actividad va ligada a la competencia específica cognitiva 1, 2 y 3, las procedimentales 4 y las actitudinales 6 y 7. Esta actividad facilita el cumplimiento de los objetivos 1, 2, 3 y 5.




7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Richard, G. (2007) Biochemistry, New York: McGraw‐Hill. Strachan, T. (2006) Genética humana. México: McGraw‐Hill Interamericana. Jorde, L.B., (2005) Genética médica. Madrid: Elsevier. Pollard, T.D.(2002) Cell biology. Philadelphia: Saunders. Bruce, A. (2008) Molecular biology of the cell. New Cork: Garland Science. Trent, R.J. (2005) Molecular medicin. Amsterdam: Elsevier 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA Hohmann, S y Mager W.H. (2003) Yeast stress responses, Berlin‐New York: Springer Dickinson, J. R. y Schweizer, M. (2004) The metabolism and molecular physiology of Saccharomyces cerevisiae Boca Raton, Florida: CRC Press. Graeme, M. (2000) Yeast physiology and biotechnology Chichester: John Wiley and Sons. Pringle, J. R., Broach, J. R. y Jones, E. W. (1997) The molecular and cellular biology of the yeast Saccharomyces Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press. Feldmann, H. (2005) Yeast Molecular Biology, Online, Adolf‐Butenandt‐Institute, Universidad de Munich

8.‐ SISTEMA DE EVALUACIÓN. En la evaluación, la asistencia supondrá un 10% de la calificación final repartido de forma proporcional a las horas presenciales impartidas. El resto de la calificación se basará en el uso de diversos instrumentos de evaluación que se basarán en el criterio de adquisición de conocimientos mayoritariamente junto con otros criterios que dependerán del instrumento utilizado.

Examen global. Cubre los aspectos teóricos tratados de forma presencial. Examen online de 20 preguntas de distinto tipo. (40%). Adquisición de conocimiento.

Tutorías: Valoración de la participación en los foros colectivos (10%). Implicación y adquisición de conocimientos. Memoria de prácticas: (15%) Exposición de seminario en grupo: (25%)



ASIGNATURA GENÓMICA, GENÉTICA Y BIOLOGÍA FUNCIONAL DE CAENORHABDITIS ELEGANS Y SU RELACIÓN CON LA

ENFERMEDAD GENÉTICA

________________________________________________________________________________________________





Denominación: GENÓMICA, GENÉTICA Y BIOLOGÍA FUNCIONAL DE CAENORHABDITIS ELEGANS Y SU RELACIÓN CON LA ENFERMEDAD GENÉTICA (Obligatoria)

Código: 2103618


Descriptores ― Estudio del genoma, la genética, la bioquímica y la fisiología del gusano Caenorhabditis elegans― Caenorhabditis elegans, modelo invertebrado clásico de análisis genético y del desarrollo






Seminarios 3,5 0,14 9%

Tutorías 2,5 0,1 7%



Actividades de evaluación 2,5 0,1 7%

1,5

TOTAL 37,5 1,5 100%



Claudio Asencio Salcedo

― Profesor ayudante doctor. Universidad Pablo de Olavide


― Profesor responsable del curso

Pilar González Cabo

― Investigadora acreditada del CIBER de Enfermedades Raras


― Profesor colaborador en la docencia del curso




― Profesor responsable del módulo 4


DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La relevancia de esta asignatura radica en el aprendizaje de Caenorhabditis elegans y en su utilidad como un organismo modelo muy útil para la investigación de los procesos de desarrollo y de las enfermedades raras. La realización de este curso aportará al alumno las competencias básicas necesarias para poder empezar a trabajar con el gusano Caenorhabditis elegans en un laboratorio. 2. REQUISITOS DE ACCESO. En principio no existen requisitos indispensables de acceso a este curso. Sin embargo, sí se recomienda tener un conocimiento medio de ingles científico y haber superado con éxito los cursos incluidos en los módulos anteriores. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Las competencias generales a trabajar en este curso son comunes a todos los cursos del módulo 4 “Modelos animales y celulares para el estudio de las enfermedades raras”. Entre ellas: 1. Demostrar una buena capacidad de comprender y criticar la literatura científica. El alumno debe ser







― Conocer Caenorhabditis elegans como un sistema modelo relevante en la investigación biomédica.

― Conocer tanto las principales rutas metabólicas y de señalización como la fisiopatología en este organismo modelo.

― Conocer en este sistema modelo. 2. Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer)

― Ser capaz de identificar las dianas moleculares y los mecanismos de acción en el estudio de Caenorhabditis elegans como un modelo de enfermedad.

― Saber trabajar en un laboratorio con Caenorhabditis elegans. ― Saber cultivar y mantener stocks de Caenorhabditis elegans.

3. Actitudinales (Saber ser y estar) ― Ser capaz de trabajar en un laboratorio con Caenorhabditis elegans. ― Saber trabajar en equipo.

3.3. OBJETIVOS

1.‐ Introducción a la biología de Caenorhabditis elegans

2.‐ Técnicas y metodologías utilizadas para la investigación en C. elegans.

3.‐ Caenorhabditis elegans como modelos de enfermedades raras. Ejemplos.

4.‐ Manejo, visualizar e identificar los distintos estadios larvarios del gusano.

5.‐ Diferenciar, caracterizar y evaluar distintos fenotipos mutantes.

6.‐ Obtención de un mutante transitorio por RNAi.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Nº de Horas: 37.5

• Clases Teóricas*: 8 • Clases Prácticas*: 8 • Exposiciones y Seminarios*: 3.5 • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales): 2.5

A) Colectivas*: 0.5 B) Individuales: 2

• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: 13 A) Horas de estudio: 3 B) Preparación de Trabajo Personal: 10 • Realización de Exámenes: 2.5 A) Examen escrito: 1 B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal): 1.5








5.‐ BLOQUES TEMÁTICOS Esta asignatura está dividida en dos bloques temáticos: uno teórico, que servirá de introducción al estudio de Drosophila melanogaster como un modelo de estudio de enfermedad y donde se aprenderán los conceptos básicos necesarios para el abordaje de un problema genético, bioquímico o fisiológico, y un segundo bloque práctico, donde se aprenderá el cultivo de la mosca y el modo de trabajo de un laboratorio con este organismo. El curso terminará con un seminario que mostrara estudios de enfermedades raras usando Caenorhabditis elegans como modelo de estudio. A continuación se especifican los contenidos de cada uno de los bloques: Teórica: 1. Introducción a la biología de Caenorhabditis elegans: El gusano.

1.1 El modelo biológico y su origen. 1.2 Anatomía. 1.3 Organización del genoma. 1.4 Procesamiento del RNA.

2. La investigación en C. elegans.

2.1 Técnica y metodología: 2.2 Genética clásica. 2.3 Genética reversa. 2.4 Transformación y microinyección. 2.5 Expresión de genes.

3. Caenorhabditis elegans como modelo de enfermedades raras. Ejemplos. Práctica: 4. Presentación de Caenorhabditis elegans.

1.1 Observar morfología y comportamiento. 1.2 Diferenciar estadios larvarios y huevos. 1.3 Manipulación del gusano. Preparación de placas y mantenimiento de los gusanos.

5. Práctica de genética reversa: Obtención de un mutante transitorio por RNAi feeding. 6. Práctica de observación de distintos fenotipos. Análisis cuantitativo y cualitativo.

6.‐ HORARIO DE CLASE. TEORÍA Y PRÁCTICA

PLAN DE ORDENACIÓN DOCENTE DE LA ASIGNATURA (POD) – Créditos ECTS

Profesor Créditos

(Enseñanzas Básicas) Créditos (Prácticas)

Total (créditos del profesor)

Responsable de firma de actas


0.60 1.20 1.80 SI

Claudio Asencio Salcedo


7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL ‐ Riddle, D.L., et al. (1997) C. elegans II. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. ‐ Hope, I.A. (1999) C. elegans. A Practical Approach. Oxford University Press, Oxford. ‐ Wood, B. (1988) The Nematode Caenorhabditis elegans. Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York. ‐ Epstein, H.F.; Shakes, D.C. (1995) Caenorhabditis elegans: Modern Biological Analysis of an Organism. (Volume 48). Methods in Cell Biology. Academic Press, San Diego. 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA ‐ Fire, A., Xu, S., Montgomery, M.K., Kostas, S.A., Driver, S.E. and Mello, C.C. (1998) Potent and specific genetic interference by double‐stranded RNA in Caenorhabditis elegans. Nature, 391, 806‐811. ‐ Timmons, L. and Fire, A. (1998) Specific interference by ingested dsRNA. Nature, 395, 854. ‐ Hunter, C.P. (1999) Genetics: a touch of elegance with RNAi. Curr Biol, 9, R440‐442.


― asistencia a las clases presenciales ― esfuerzo del estudiante ― adquisición de conocimientos ― implicación y participación en las actividades presenciales ― estudio y desarrollo de las actividades


― prácticas de laboratorio ― Desarrollo escrito de la memoria de prácticas. ― realización y desarrollo correcto de las actividades y ejercicios planteadas en las clases prácticas ― control de la asistencia a las clases prácticas y seminarios y participación activa en las actividades que se

propongan.. La nota final obtenida en este curso se calculará de la siguiente manera:

a) 75% correspondiente a la parte presencial

• Clases prácticas (50% de la nota final) asistencia obligatoria para aprobar realizar de las actividades propuestas obligatorio para aprobar desarrollo correcto su calidad determinará la nota de este apartado

• Seminarios (25% de la nota final) asistencia obligatoria para aprobar

b) 25% correspondiente a la memoria de prácticas.



ASIGNATURA GENÓMICA, GENÉTICA Y BIOLOGÍA FUNCIONAL DE

DROSOPHILA MELANOGASTER Y SU RELACIÓN CON LA ENFERMEDAD GENÉTICA

________________________________________________________________________________________________





Denominación: GENÓMICA, GENÉTICA Y BIOLOGÍA FUNCIONAL DE DROSOPHILA MELANOGASTER Y SU RELACIÓN CON LA ENFERMEDAD GENÉTICA (Obligatoria)

Código: 2103619


Descriptores ― Estudio del genoma, la genética, la bioquímica y la fisiología de la mosca Drosophila

melanogaster ― Drosophila melanogaster, modelo invertebrado clásico de análisis genético y del desarrollo






Seminarios 3,5 0,14 9%

Tutorías 2,5 0,1 7%



Actividades de evaluación 2,5 0,1 7%

1,5

TOTAL 37,5 1,5 100%






― Profesor responsable del curso y del módulo 4

Máximo Ibo Galindo Orozco

― Investigador Ramón y Cajal (Instituto de Biomedicina de Valencia, CSIC)


― Profesor colaborador en la docencia del curso

Rafael Garesse

―


― Profesor participante en el Workshop

Howy Jacobs

―



Alberto Sanz

―




DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La relevancia de esta asignatura radica en el aprendizaje de Drosophila melanogaster y en su utilidad como un organismo modelo muy útil para la investigación de los procesos de desarrollo y de las enfermedades raras. La realización de este curso aportará al alumno las competencias básicas necesarias para poder empezar a trabajar con la mosca Drosophila melanogaster en un laboratorio. 2. REQUISITOS DE ACCESO. En principio no existen requisitos indispensables de acceso a este curso. sin embargo, sí se recomienda tener un conocimiento medio de ingles científico y haber superado con éxito los cursos incluidos en los módulos anteriores. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Las competencias generales a trabajar en este curso son comunes a todos los cursos del módulo 4 “Modelos animales y celulares para el estudio de las enfermedades raras”. Entre ellas: 1. Demostrar una buena capacidad de comprender y criticar la literatura científica. El alumno debe ser







― Conocer Drosophila melanogaster como un sistema modelo relevante en la investigación biomédica.

― Conocer tanto las principales rutas metabólicas y de señalización como la fisiopatología en este organismo modelo.

― Conocer en este sistema modelo. 2. Procedimentales/Instrumentales (Saber hacer)

― Ser capaz de identificar las dianas moleculares y los mecanismos de acción en el estudio de Drosophila melanogaster como un modelo de enfermedad.

― Saber trabajar en un laboratorio con Drosophila melanogaster. ― Saber cultivar y mantener stocks de Drosophila melanogaster.

3. Actitudinales (Saber ser y estar) ― Ser capaz de trabajar en un laboratorio con Drosophila melanogaster. ― Saber trabajar en equipo.

3.3. OBJETIVOS

1. Conocimiento del genoma, la estructura genómica, la genética, el ciclo vital y complejidad del organismo modelo Drosophila melanogaster.

2. Conocimiento de las herramientas experimentales propias para el trabajo con Drosophila melanogaster.

3. Comprensión de la biología fundamental de Drosophila melanogaster y su utilidad práctica para la modelización y estudio de los procesos bioquímicos y fisiopatológicos de las enfermedades humanas.

4. Aprendizaje de las diferentes rutas biológicas, metabólicas y de señalización fundamentales en Drosophila melanogaster.

5. Estudio de ejemplos concretos de enfermedades genéticas raras y su análisis en el organismo modelo Drosophila melanogaster.

4.‐ METODOLOGÍA

4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Nº de Horas: 37.5

• Clases Teóricas*: 8 • Clases Prácticas*: 8 • Exposiciones y Seminarios*: 3.5 • Tutorías Especializadas (presenciales o virtuales): 2.5

A) Colectivas*: 0.5 B) Individuales: 2

• Realización de Actividades Académicas Dirigidas: A) Con presencia del profesor*: B) Sin presencia del profesor: • Otro Trabajo Personal Autónomo: 13 A) Horas de estudio: 3 B) Preparación de Trabajo Personal: 10 • Realización de Exámenes: 2.5 A) Examen escrito: 1 B) Exámenes orales (control del Trabajo Personal): 1.5








5.‐ BLOQUES TEMÁTICOS Esta asignatura está dividida en dos bloques temáticos: uno teórico, que servirá de introducción al estudio de Drosophila melanogaster como un modelo de estudio de enfermedad y donde se aprenderán los conceptos básicos necesarios para el abordaje de un problema genético, bioquímico o fisiológico, y un segundo bloque práctico, donde se aprenderá el cultivo de la mosca y el modo de trabajo de un laboratorio con este organismo. El curso terminará con una serie de seminarios organizados a modo de workshop, donde participarán investigadores internacionales que mostrarán su trabajo sobre el estudio de enfermedades raras usando Drosophila melanogaster como modelo de estudio. A continuación se especifican los contenidos de cada uno de los bloques, especificando si van a ser trabajados virtualmente (V) y/o de manera presencial en las prácticas (P): BLOQUE TEÓRICO ― Ciclo de vida y fisiología de Drosophila melanogaster V, P ― Genoma y genética de Drosophila melanogaster V, P ― Herramientas experimentales para el trabajo con Drosophila melanogaster V, P ― Fisiopatología y modelización de enfermedades humanas en Drosophila melanogaster V, P ― Principales rutas biológicas, metabólicas y de señalización típicas de Drosophila melanogaster V, P BLOQUE PRÁCTICO ― Estudio de ejemplos concretos de enfermedades raras en Drosophila melanogaster V, P ― Peculiaridades del laboratorio especializado en el trabajo con Drosophila melanogaster P ― Manejo y cultivo de Drosophila melanogaster P



7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL ― Alberts B, Jonson A, Lewis J, Raff M, Roberts K y Walter P. (2008) Biología Molecular de la Célula. GS Ed.

(5ª edición), capítulos 21, 22 y 23 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA ― Julian A.T. Dow (2007). Model organisms and molecular genetics for endocrinology. General and

Comparative Endocrinology, 153: 3–12 ― Rafael Garesse and Laurie S. Kaguni (2005). A Drosophila Model of Mitochondrial DNA Replication:

Proteins, Genes and Regulation. IUBMB Life, 57(8): 555–561 ― Ronald J. Krieser and Kristin White (2009). Inside an enigma: do mitochondria contribute to cell death in

Drosophila? Apoptosis, 14:961–968 ― Geneviève Morrow and Robert M. Tanguay (2008). Mitochondria and ageing in Drosophila. Biotechnology

Journal, 3: 728–739 ― Sánchez‐Martínez y colaboradores (2006). Modeling human mitochondrial diseases in flies. Biochimica et

Biophysica Acta, 1757: 1190–1198


― asistencia a las clases presenciales ― esfuerzo del estudiante

― adquisición de conocimientos ― implicación y participación en las actividades presenciales y virtuales ― estudio y desarrollo de las actividades virtuales


― prácticas de laboratorio ― examen escrito / oral ― realización y desarrollo correcto de las actividades y ejercicios planteadas en las clases prácticas ― ejecución y desarrollo correcto de las actividades y ejercicios a realizar virtualmente ― control de la asistencia a las clases prácticas y seminarios y participación activa en las actividades que se

propongan virtualmente. La nota final obtenida en este curso se calculará de la siguiente manera: a) 50% correspondiente a la parte a desarrollar en l aplataforma virtual, donde se tendrá en cuenta

• Realización de las actividades virtuales propuestas obligatorio para aprobar su calidad determinará la nota a obtener en este apartado

b) 50% correspondiente a la parte presencial

• Clases prácticas (25% de la nota final) asistencia obligatoria para aprobar entrega de las actividades propuestas obligatorio para aprobar realización y desarrollo correcto su calidad determinará la nota de este apartado

• Seminarios (25% de la nota final) asistencia obligatoria para aprobar entrega de un resumen (máximo 1 página A4) de los trabajos expuestos su calidad determinará la nota a obtener en este apartado


Módulo 4 Modelos animales y celulares para el estudio de las enfermedades

raras

ASIGNATURA Estudio de las bases bioquímicas, celulares y

fisiológicas de modelos de enfermedad en líneas celulares establecidas y cultivos primarios

________________________________________________________________________________________________




1.‐ DEFINICIÓN DE LA ASIGNATURA Denominación: Estudio de las bases bioquímicas, celulares y fisiológicas de modelos de enfermedad en líneas celulares establecidas y cultivos primarios (Obligatoria) Código: Área de Conocimiento: Descriptores ― Estudio de las bases bioquímicas, celulares y fisiológicas de modelos de enfermedad en líneas celulares establecidas y cultivos primarios ― Cultivos celulares como complemento a los modelos animales en el estudio de enfermedades humanas. ― Líneas inmortalizadas, cultivos primarios, sistema de interferencia del ARN (RNAi) Titulación: Master en Diagnóstico y Terapia de las Enfermedades Raras Profesor responsable del módulo/asignatura Emilio Siendones Castillo


Clases teórico ‐ prácticas 12 0,45 22,5

Actividad por plataforma virtual

12 0,45 22,5

Seminarios 1 0,05 2

Tutorías 5 0,18 9,5

Horas de estudio 20 0,75 37,5

Actividades dirigidas 2 0,075 4

Actividades de evaluación 1 0,05 2

2

TOTAL 53 2 100



Emilio Siendones Castillo ― Profesor Contratado Doctor (Universidad Pablo de Olavide) ― [email protected] ― Profesor responsable del curso Daniel Moreno Fernández-Ayala ― Profesor Contratado Doctor (Universidad Pablo de Olavide) ― [email protected] ― Profesor responsable del módulo 4 María Victoria Cascajo Almenara ― Investigadora del Ciber de Enfermedades Raras (Centro Andaluz de Biología del Desarrollo) ― Profesora colaboradora del curso ― [email protected]

Ángela Gavilán Naranjo ― Investigadora de Ciber de Enfermedades Raras y Técnico del laboratorio de diagnóstico y cultivos celulares (Centro Andaluz de Biología del Desarrollo) ― Profesora colaboradora del curso ― [email protected] 3.‐ PROGRAMA DE LA ASIGNATURA. DATOS ESPECÍFICOS DE LA ASIGNATURA 1. PRESENTACIÓN. La biología celular trata de comprender de forma integrada como las moléculas interaccionan dentro de la célula para llevar a cabo y regular los procesos necesarios para la vida. Siendo conscientes de sus

limitaciones, el uso de los cultivos celulares para el estudio de aspectos básicos y fisiopatológicos de las enfermedades raras puede proporcionar información clave para un mejor conocimiento de la enfermedad y de cara al diagnóstico de posibles pacientes. La realización de este curso aportará al alumno las competencias básicas necesarias para la obtención y el manejo de cultivos celulares de mamífero, así como una serie de técnicas útiles para la manipulación y análisis de sus funciones en laboratorio. El alumno se familiarizará con el diseño de estrategias para el estudio de aspectos fisiopatológicos en modelos celulares. 2. REQUISITOS DE ACCESO. No existen requisitos indispensables de acceso a este curso. No obstante, tener cierto nivel de inglés científico facilita el óptimo aprovechamiento de este curso. 3. COMPETENCIAS 3.1 GENÉRICAS O TRANSVERSALES. Las competencias generales a trabajar en este curso son comunes a todos los cursos del módulo 4 “Modelos animales y celulares para el estudio de las enfermedades raras”. Por lo tanto, este curso contribuirá a que los estudiantes del módulo sean capaces de:

1. Demostrar una buena capacidad de comprender y criticar la literatura científica. El alumno debe ser capaz de obtener con facilidad literatura adecuada sobre temas científico‐técnicos

2. Utilizar las Técnicas de Información y Comunicación (TICs) como una herramienta para la expresión y la comunicación, para el acceso a fuentes de información, como medio de archivo de datos y documentos, para tareas de presentación, para el aprendizaje, la investigación y el trabajo cooperativo. Demostrar un correcto manejo del ordenador personal a nivel de usuario, incluyendo el uso de herramientas de comunicación y archivo de datos online.

3. Identificar, analizar, y definir los elementos significativos que constituyen un problema para resolverlo con rigor. Analizar problemas complejos, elaborar hipótesis y ponerlas a prueba utilizando el método científico.

4. Cuestionar hipótesis y principios en base a los fundamentos en los que se asientan las ideas, acciones y juicios, tanto propios como ajenos. Juzgar críticamente y de forma racional cualquier idea, propia o ajena.

5. Demostrar habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.

3.2. ESPECÍFICAS Las competencias específicas a trabajar en este curso se centran en conocer los cultivos celulares de

mamífero como modelo en la investigación sobre las enfermedades raras. En este curso trabajaremos las siguientes competencias: 1. Cognitivas ― Conocer los cultivos celulares como un sistema modelo relevante en la investigación biomédica. ― Conocer los requerimientos de las células de mamíferos para crecer en cultivo. ― Conocer técnicas para la manipulación y análisis de células en cultivo. 2. Procedimentales/Instrumentales ― Saber trabajar en un laboratorio con cultivos celulares de mamífero de diverso origen. ― Saber manipular la expresión génica en células en cultivo. 3. Actitudinales ― Ser capaz de trabajar en un laboratorio con cultivos celulares. ― Saber trabajar en equipo. 3.3. OBJETIVOS 1. Conocimiento de los distintos tipos de cultivos celulares, así como de sus características, ventajas y limitaciones. 2. Conocimiento de las herramientas experimentales propias del trabajo con cultivos celulares. 3. Comprensión de la biología fundamental de la célula de mamífero y su utilidad práctica para la modelización y estudio de los procesos bioquímicos y fisiopatológicos de las enfermedades humanas. 4. Estudio de ejemplos concretos de enfermedades genéticas raras y su análisis en modelos celulares.

4.‐ METODOLOGÍA 4.1. NÚMERO DE HORAS DE TRABAJO DEL ALUMNO: Nº de Horas: 50 • Clases Teóricas: 6

• Clases Prácticas: 6 • Exposiciones y Seminarios: 1 • Tutorías Especializadas: 5 • Trabajo Personal Autónomo: 20 A) Horas de estudio: 7 B) Preparación de Trabajo Personal: 10 • Actividades dirigidas: 14 4.2. TÉCNICAS DOCENTES: Sesiones académicas teóricas: X Exposición y debate: X Tutorías especializadas: X Sesiones académicas prácticas: X Visitas y excursiones: Controles de lecturas obligatorias: Otros:

5.‐ BLOQUES TEMÁTICOS Esta asignatura está dividida en dos bloques: el primer bloque es teórico y se desarrollará tanto clase como a través de la de la plataforma virtual. Constará de una introducción al uso de los cultivos celulares en investigación y su aplicación en el estudio de la enfermedad. El segundo bloque será práctico y se desarrollará durante la semana del 9 al 11 de mayo de 2010. En este bloque el alumno aprenderá el manejo básico de los cultivos celulares, así como ciertas técnicas más especializadas. Así mismo podremos asistir al seminario de varios reconocidos expertos en el estudio de la biología básica subyacente a la enfermedad utilizando el modelo de los cultivos celulares. A continuación se especifican los contenidos de cada uno de los bloques: BLOQUE TEÓRICO Introducción. Introducción histórica. Interés de los cultivos celulares en el estudio y diagnóstico de las enfermedades raras. Normativa para el uso de células de pacientes en investigación. Ciberer Biobank. Eurobiobank. El laboratorio de cultivos celulares. Normas básicas de seguridad e higiene en el laboratorio de cultivos celulares.

Requerimientos básicos para el trabajo con cultivos celulares: equipamiento. Condiciones de cultivo. Sustratos, medios de cultivo, asepsia y control de contaminación. Fase gaseosa y control del pH. Subcultivo. Criopreservación. Tipos de Cultivos celulares Origen de las células en cultivo. Iniciación de un cultivo y desarrollo. • Cultivos primarios. Obtención. Importancia de los cultivos primarios de fibroblastos (u otros tipos celulares) provenientes de pacientes ‐biopsias‐. • Líneas celulares. Obtención. Inmortalización. Ventajas del uso de estas células en el estudio de la fisiopatología de las enfermedades raras. • Cíbridos. • Células madre embrionarias y su uso en la generación de ratones transgénicos para la modelización de enfermedades humanas. Técnicas de manipulación genética de células madre embrionarias de ratón. Herramientas y recursos disponibles para la comunidad científica. Condiciones particulares de cultivo. • Cocultivos y cultivos tridimensionales. Diseño de experimentos. Puesta en marcha de experimentos con cultivos celulares. Técnicas de manipulación/monitorización de la expresión en células en cultivo. Genes reporteros. Sistema luciferasa, GFP. Tecnología del ARN de interferencia. Transfecciones e infecciones (adenovirus y lentivirus) Establecimiento de líneas estables. Estudios de parámetros fisiopatológicos en algunos casos de enfermedades raras: Función mitocondrial: actividades, potencial (citometria/in vivo), ROS Función lisosomal Viabilidad celular Marcadores de envejecimiento Inmunofluorescencia Inmunoblot Otras técnicas

BLOQUE PRÁCTICO

• Manejo básico de cultivos celulares en laboratorio. Conteo de células. Subcultivo. • Manipulación de la expresión génica en células en cultivo: sobreexpresión y ARN de interferencia. • Técnicas de inmunofluorescencia y visualización en microscopio confocal. • Citometría. • Marcadores de senescencia y actividad lisosomal.

6.‐ HORARIO DE CLASE. TEORÍA Y PRÁCTICA https://www.google.com/calendar/embed?src=jasanalc%40upo.es&ctz=Europe/Madrid 7.‐ BIBLIOGRAFÍA Y OTROS RECURSOS DOCENTES. 7.1. BIBLIOGRAFÍA GENERAL: Alberts, B. et al. (2008). Molecular Biology of the Cell. 5th ed. Garland Science. New York. Davey, J.I. and Lord, M. (2003). Essential Cell Biology. Volume 1: Cell Structure. Oxford. PAS Davey, J.I. and Lord, M. (2003). Essential Cell Biology. Volume 2: Cell Function. Oxford. PAS Davis, J.M. (1994). Basic Cell Culture. A practical Approach. Oxford. PAS Harris et al. (2006). Cell Biology protocols. John Willey & Sons. Hoboken. Lodish, H. (2008). Molecular Cell Biology. 6th ed. W. H. Fereeman and Company. New York. 7.2. BIBLIOGRAFÍA ESPECÍFICA Artículos científicos disponibles en la red a los que puede accederse a través de la biblioteca virtual de la UNIA y la Universidad Pablo de Olavide.


• asistencia a las clases presenciales • esfuerzo del estudiante • adquisición de conocimientos • implicación y participación en las actividades presenciales y virtuales • estudio y desarrollo de las actividades virtuales


• prácticas de laboratorio • realización y desarrollo correcto de las actividades y ejercicios planteadas • control de la asistencia a las clases prácticas y seminarios y participación activa en las actividades que

se propongan. La nota final obtenida en este curso se calculará de la siguiente manera: a) 50% correspondiente a la parte presencial b) 50% correspondiente a la parte no presencial

máster universitario en conocimiento actual de las ... · guía del máster máster universitario...

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