Las vas serotoninrgicas proceden de los ncleos del rafe en la protuberancia y se proyectan hacia la mdula espinal regulando varias funciones vegetativas como las gastrointestinales) o se proyectan hacia la corteza cerebral y estructuras subcorticales regulando funciones cognoscitivas y afectivas

Las vas dopaminrgicas se han clasificado usualmente en 4 diferentes tipos de vas: A9 (tracto nigroestriatal, responsible de los efectos extrapiramidales de los antipsicticos convencionales), A12 (tuberoinfundibular, responsible del aumento de prolactina con los mismos medicamentos y risperidona) y tractos A10 (masolmbicos y mesocorticales, cuyo antagonismo se asocia a los efectos antipsicticos y a las alteraciones cognoscitivas, motivacionales y afectivas, respectivamente).

Las vas noradrenrgicas proceden del locus ceruleus en la protuberancia y tienen una proyeccin similar descrita para la serotonina.