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INSTITUTO DE BIOTECNOLOGÍA UNIVERSIDAD NACIONAL AUTÓNOMA DE MÉXICO

INFORME 2017-2018

Dr. Adrián Ochoa Leyva Dr. Omar Pantoja Ayala

Dr. Agustín López Munguía Dr. Alfredo Martínez Jiménez

Dr. Arnaud Ronceret Dra. Alejandra Bravo de la Parra

Dra. Claudia Lydia Treviño Santa Cruz Dra. Guadalupe Espín Ocampo

Dr. Enrique Morett Sánchez Dr. Enrique Reynaud Garza Dr. Alejandro Alagón Cano

Dr. Gerardo A. Corzo Burguete Dra. Gloria Saab rincón

Dra. Patricia Joseph Bravo Dr. Guillermo Gosset Lagarda Dr. José Luis Puente García

Dr. José Luis Reyes Taboada Dra. Laura A. Palomares Aguilera

Dra. Leonor Pérez Martínez Dra. Marcela Ayala Aceves

Dra. Gladys Iliana Cassab López M.C Ma. del Carmen M. Quinto Hernández

Dra. Susana López Charretón Dra. YvonneJ. Rosenstein Azoulay

DICIEMBRE 10 – 14, 2018

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Dr. Adrián Ochoa Leyva

Departamento de Microbiología Molecular, IBT-UNAM “Del microbioma al desciframiento de las interacciones del holobioma en un organismo no modelo: el camarón” Resumen En la plática abordaremos desde nuestros primeros estudios donde desciframos por primera vez el microbioma del camarón blanco del pacífico Litopennaeus vannamei en el océano y en cautiverio y desciframos la microbiota asociada a una de las peores epidemias en el cultivo de camarón (Síndrome de Mortalidad Temprana), pasaremos por nuestros trabajos en donde hemos modulado su microbiota con fines del aumento de la producción en granjas camaroneras y finalizaremos con nuestros últimos descubrimientos sobre las interacciones en el holobioma del camarón (genoma-microbioma). Integrantes del Grupo (2017-2018) Biól. Filiberto Sanchez Técnico Académico Dr. Gamaliel López Postdoctoral M.C. Maria Fernanda Cornejo Estudiante de Doctorado en Ciencias Bioquímicas Shirley Bikel Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas Dr. Thapanan Jatuyosporn Estudiante de Doctorado (estancia) M.C. Leonardo Yame Fox Estudiante de Doctorado (estancia) Biol. Melany Josheline Cervantes Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímicas Q. Edgar Axel Donjuan Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímicas Biol. Luigui Michel Gallardo Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímicas Lic. Juan Manuel Hernandez Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímicas Q.F.B. Marco Antonio Jimenez Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímicas Q.F.B. Miriam Leonardo Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímicas Ing. Juan Pablo Ochoa Estudiante de Maestría en Ciencias Bioquímicas Itzel Abigail Hernández de Licenciatura Lic. Edgar Bernardo Equihua Medina estudiante de Licenciatura. Lic. Andrea Casas Reyes estudiante de Licenciatura. Lic. Omar Martínez Hernández estudiante de Licenciatura. Valeria Paula Yescas, Secretaria Publicaciones (2017-2018) **Primer autor o corresponsal 15. F. Astudillo-Melgar, A. Ochoa-Leyva, J. Utrilla, G. Huerta-Beristain. Bacterial diversity and population dynamics during the fermentation of palm wine from Guerrero Mexico 2018. doi: https://doi.org/10.1101/480038 bioRxiv. Preprint. 14. Castro-Torres E, Jimenez-Sandoval P, Fernández-de Gortari E, López-Castillo M, Baruch-Torres N, López-Hidalgo M, Peralta-Castro A, Díaz-Quezada C, Sotelo-Mundo R.R., Benitez-Cardoza C.G., Espinoza-Fonseca L. M, Ochoa-Leyva A,

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Brieba L. G. Structural Basis for the Limited Response to Oxidative and Thiol-Conjugating Agents by Triosephosphate Isomerase From the Photosynthetic Bacteria Synechocystis. Frontiers in Molecular Biosciences 2018. Vol. 5 Pages 103. 13. López-Leal, G., Cornejo-Granados, F., Hurtado-Ramírez, J.M., Mendoza-Vargas, A., Ochoa-Leyva, A**. Functional and taxonomic classification of a greenhouse water drain metagenome. (2018) Standards in Genomic Sciences, 13 (1), art. no. 20, . 12. López-Contreras, B.E., Morán-Ramos, S., Villarruel-Vázquez, R., Macías-Kauffer, L., Villamil-Ramírez, H., León-Mimila, P., Vega-Badillo, J., Sánchez-Muñoz, F., Llanos-Moreno, L.E., Canizalez-Román, A., del Río-Navarro, B., Ibarra-González, I., Vela-Amieva, M., Villarreal-Molina, T., Ochoa-Leyva, A., Aguilar-Salinas, C.A., Canizales-Quinteros, S. Composition of gut microbiota in obese and normal-weight Mexican school-age children and its association with metabolic traits (2018) Pediatric Obesity, 13 (6), pp. 381-388. Cited 3 times. 11. González-Félix, M.L., Gatlin, D.M., III, Urquidez-Bejarano, P., de la Reé-Rodríguez, C., Duarte-Rodríguez, L., Sánchez, F., Casas-Reyes, A., Yamamoto, F.Y., Ochoa-Leyva, A.**, Perez-Velazquez, M. Effects of commercial dietary prebiotic and probiotic supplements on growth, innate immune responses, and intestinal microbiota and histology of Totoaba macdonaldi (2018) Aquaculture, 491, pp. 239-251. Cited 4 times. 10. García, C.F., Pedrini, N., Sánchez-Paz, A., Reyna-Blanco, C.S., Lavarias, S., Muhlia-Almazán, A., Fernández-Giménez, A., Laino, A., de-la-Re-Vega, E., Lukaszewicz, G., López-Zavala, A.A., Brieba, L.G., Criscitello, M.F., Carrasco-Miranda, J.S., García-Orozco, K.D., Ochoa-Leyva, A., Rudiño-Piñera, E., Sanchez-Flores, A., Sotelo-Mundo, R.R. De novo assembly and transcriptome characterization of the freshwater prawn Palaemonetes argentinus: Implications for a detoxification response (2018) Marine Genomics, 37, pp. 74-81. Cited 2 times. 9. Dautt-Castro, M., Ochoa-Leyva, A., Contreras-Vergara, C.A., Muhlia-Almazán, A., Rivera-Domínguez, M., Casas-Flores, S., Martinez-Tellez, M.A., Sañudo-Barajas, A., Osuna-Enciso, T., Baez-Sañudo, M.A., Quiroz-Figueroa, F.R., Kuhn, D.N., Islas-Osuna, M.A. Mesocarp RNA-Seq analysis of mango (Mangifera indica L.) identify quarantine postharvest treatment effects on gene expression (2018) Scientia Horticulturae, 227, pp. 146-153. 8. Cornejo-Granados, F., Hurtado-Ramírez, J.M., Hernández-Pando, R., Ochoa-Leyva, A**. Secret-AAR: a web server to assess the antigenic density of proteins and homology search against bacterial and parasite secretome proteins (2018) Genomics, . Article in Press. 7. Cornejo-Granados, F., Gallardo-Becerra, L., Leonardo-Reza, M., Ochoa-Romo, J.P., Ochoa-Leyva, A**. A meta-analysis reveals the environmental and host factors

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shaping the structure and function of the shrimp microbiota (2018) PeerJ, 2018 (8), art. no. e5382, . Cited 2 times. 6. Lopez-Zavala, A.A., Guevara-Hernandez, E., Vazquez-Lujan, L.H., Sanchez-Paz, A., Garcia-Orozco, K.D., Contreras-Vergara, C.A., Lopez-Leal, G., Arvizu-Flores, A.A., Ochoa-Leyva, A., Sotelo-Mundo, R.R. A novel thymidylate synthase from the Vibrionales, Alteromonadales, Aeromonadales, and Pasteurellales (VAAP) clade with altered nucleotide and folate binding sites (2018) PeerJ, 2018 (6), art. no. e5023, . 5. Cornejo-Granados, F., Lopez-Zavala, A.A., Gallardo-Becerra, L., Mendoza-Vargas, A., Sánchez, F., Vichido, R., Brieba, L.G., Viana, M.T., Sotelo-Mundo, R.R., Ochoa-Leyva, A**. Microbiome of Pacific Whiteleg shrimp reveals differential bacterial community composition between Wild, Aquacultured and AHPND/EMS outbreak conditions (2017) Scientific Reports, 7 (1), art. no. 11783, . Cited 12 times. 4. Romero-Hidalgo, S., Ochoa-Leyva, A.**, Garcíarrubio, A., Acuña-Alonzo, V., Antúnez-Argüelles, E., Balcazar-Quintero, M., Barquera-Lozano, R., Carnevale, A., Cornejo-Granados, F., Fernández-López, J.C., García-Herrera, R., García-Ortíz, H., Granados-Silvestre, Á., Granados, J., Guerrero-Romero, F., Hernández-Lemus, E., León-Mimila, P., Macín-Pérez, G., Martínez-Hernández, A., Menjivar, M., Morett, E., Orozco, L., Ortíz-López, G., Pérez-Villatoro, F., Rivera-Morales, J., Riveros-Mckay, F., Villalobos-Comparán, M., Villamil-Ramírez, H., Villarreal-Molina, T., Canizales-Quinteros, S., Soberón, X. Demographic history and biologically relevant genetic variation of Native Mexicans inferred from whole-genome sequencing (2017) Nature Communications, 8 (1), art. no. 1005, . Cited 5 times. 3. Cornejo-Granados, F., Zatarain-Barrón, Z.L., Cantu-Robles, V.A., Mendoza-Vargas, A., Molina-Romero, C., Sánchez, F., Del Pozo-Yauner, L., Hernández-Pando, R., Ochoa-Leyva, A**. Secretome prediction of two M. tuberculosis clinical isolates reveals their high antigenic density and potential drug targets (2017) Frontiers in Microbiology, 8 (FEB), art. no. 128, . Cited 5 times. 2. Bikel, S., Jacobo-Albavera, L., Sánchez-Muñoz, F., Cornejo-Granados, F., Canizales-Quinteros, S., Soberón, X., Sotelo-Mundo, R.R., del Río-Navarro, B.E., Mendoza-Vargas, A., Sánchez, F., Ochoa-Leyva, A**. A novel approach for human whole transcriptome analysis based on absolute gene expression of microarray data (2017) PeerJ, 2017 (12), art. no. e4133, . Cited 1 time. 1. Bobes, R.J., Navarrete-Perea, J., Ochoa-Leyva, A., Anaya, V.H., Hernández, M., Cervantes-Torres, J., Estrada, K., Sánchez-Lopez, F., Soberón, X., Rosas, G., Nunes, C.M., García-Varela, M., Sotelo-Mundo, R.R., López-Zavala, A.A., Gevorkian, G., Acero, G., Laclette, J.P., Fragoso, G., Sciutto, E. Experimental and theoretical approaches to investigate the immunogenicity of Taenia soliumderived KE7 antigen (2017) Infection and Immunity, 85 (12), art. no. e00395-17, . Cited 2 times.

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Alumnos Graduados (2017-2018) 1. Andrea Casas Reyes. “Caracterización metagenómica asociada a corrosión en un pozo petrolero mediante secuenciación del gen 16S rRNA”. Universidad Autónoma del Estado de México. Licenciatura. 2. Luigui Michel Gallardo Becerra. “Análisis de la microbiota relacionada con el camarón blanco (Litopenaeus vannamei): intestino y sedimento”. Universidad de Guadalajara. Licenciatura. 3. Isabel Rosas Muñoz. “Análisis del microbioma del hepatopáncreas de camarones en cultivo (Penaeus vannamei) sanos y enfermos”. Universidad de Guadalajara. Licenciatura. 4. Omar Martínez Hernández. “Transferencia horizontal entre el camarón y su microbioma: el caso de la triosa fosfato isomerasa TIM21”. Universidad Politécnica del Estado de Morelos. Licenciatura. 5. Melany Josheline Cervantes Echeverria. “Abundancia del bacteriófago crAssphage en muestras fecales de niños mexicanos con obesidad y su relación con bacterias entéricas”. Universidad Autónoma de Occidente, Sinaloa. Licenciatura. 6. Edgar Bernardo Equihua Medina. “Identificación y genómica comparativa de bacteriófagos temperados en el viroma de niños sanos, obesos y niños obesos con complicaciones metabólicas”. Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Licenciatura. 7. Jesús Alfredo López García. “Estructura cristalográfica de una triosa fosfato isomerasa (TIM) obtenida del estructuroma del camarón”. CIAD-Hermosillo. Co-dirección. Maestría. Participación en docencia (2017-2018) 1. Curso de posgrado titulado Microbioma MX: Avances en el estudio del microbioma/microbiota en México 2018. Posgrado en Ciencias Bioquímicas de la UNAM. Instituto de Biotecnología. 2. Impartición de la clase “Homeostasis energética y su relación con la microbiota”, nivel Posgrado en Ciencias Bioquímicas dentro del curso “La regulación de la homeostasis energética”. Impartido en IBt-UNAM. 2017. Divulgación (2017-2018) 1. Estudio para salvar de epidemia al camarón blanco. Gaceta UNAM. 12 de octubre de 2017. 2. ¿Están relacionadas nuestras bacterias intestinales con la obesidad? Agencia Informativa CONACyT. 26 de julio de 2017. 3. La microbiota humana, un mundo microscópico apasionante de explorar. Revista Biotecnología en Movimiento, IBT-UNAM. Número 13, 2018. Donativos (2017-2018) 1. Seguimiento multianual de la dinámica del microbioma del camarón y su entorno en un sistema de producción acuícola. Fondo PAPIIT-UNAM. Proyecto número IA203118. Tiempo de Ejecución 2018-2019.

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2. Estudio de la dinámica del microbioma asociado al cultivo de dos cepas de camarón y su entorno a través del tiempo. Fondo PAPIIT-UNAM. Proyecto número IA203516. Tiempo de Ejecución 2016-2017. 3. Análisis del Metagenoma y Metatranscriptoma Intestinal en Personas Sanas y Obesas de Población Mexicana. Fondo Sectorial SS/IMSS/ISSSTE-CONACYT. Proyecto número 234188. Tiempo de Ejecución 2016-2018. 4. Genómica y Microgenómica de la Tuberculosis Pulmonar Experimental. Ciencia Básica-CONACYT. Proyecto de Grupos con número 223279. Tiempo de ejecución: 2015-2018. Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo.

1. Luigui Michel Gallardo Becerra. “Metatranscriptional characterization of the intestinal microbiota in obese and obese with metabolic syndrome Mexican children”.

2. Melany Josheline Cervantes Echeverria. “Abundancia del bacteriófago crAssphage en muestras fecales de niños mexicanos con obesidad y su relación con bacterias entéricas”.

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Dr. Omar Pantoja Ayala Departamento de Biología Molecular de Plantas “Biología de las proteínas cornichon/Erv14” Resumen Una de las principales características de las células eucariotas es la compartimentación de su citoplasma debido a la presencia de los diversos organelos que permiten una organización más compleja que la presente en células procariotas. Esta compartimentación se debe a la presencia de membranas especializadas que rodean a cada uno de los organelos y que permiten la separación de su interior con el citosol. Esta separación habilita el estableciendo de gradientes, tanto de iones, como de una variedad de solutos, generados por la actividad de proteínas de membrana especializadas. Para mantener la identidad de cada uno de los organelos, es necesario que la composición lipídica y proteica de cada membrana se mantenga, lo cual depende del transporte correcto de estas macromoléculas desde el retículo endoplásmico, su sitio de síntesis, para de ahí, ser transportadas hacia los diferentes organelos a lo largo de la vía secretoria que inicia con el sistema COPII de transporte vesicular entre el retículo endoplásmico y el aparato de Golgi. Se estima que entre 20-30% del proteoma de las células eucariotas emplea el sistema COPII para alcanzar, ya sea el medio extracelular, o el sistema endomebranal. Además de la función que se ha descrito para cada uno de los componentes del sistema COPII como son las proteínas Sar1, Sec-12, -13, -23, -24, -31, existe otro grupo de proteínas denominadas receptoras o adaptadoras que participan en la selección de proteínas cargo, ya sean solubles o de membrana. De particular interés en el grupo, es la familia de proteínas denominadas cornichon (pepinillo), cuyo homólogo en la levadura es la proteína Erv14, la cual hemos identificado como un receptor de proteínas en plantas importante para el transporte específico de proteínas de membrana. Para el estudio de la familia conichon, en el grupo se están empleando varios organismos modelo como son el musgo Physcomitrella patens, Arabidopsis thaliana, Saccharomyces cerevisiae y el pez cebra, Danio rerio. En el musgo se han obtenido las mutantes de los dos homólogos del cornichon donde aparentemente, la mutante Ppacnih1 es letal ya que no se ha podido obtener el desarrollo del protonema. En contraste, la mutante Ppacnih2 sí es viable y muestra varios fenotipos que la diferencian del musgo wt. A nivel de protonema, se observa una mayor ramificación de este, así como una diferenciación más temprana del cloronema en caulonema y un menor contenido de clorofila. A nivel de gametóforo, el desarrollo de éstos es más temprano, existe un mayor número y son de mayor tamaño que los del musgo wt. La localización intracelular de los dos cornichones se observa tanto en el retículo endoplásmico como en el aparato de Golgi, como ha sido reportado para estas proteínas en otros organismos. La sobreexpresión transitoria de estas dos proteínas causa una inhibición del

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desarrollo del musgo ya que sólo se llega a observar el desarrollo de un pequeño protonema, siendo este efecto más pronunciado para PpaCNIH1-GFP. Actualmente se está tratando de identificar cual podría ser la razón de los fenotipos observados para la mutante Ppacnih2. Continuando con la caracterización de la terminal carboxilo de Erv14 de S. cerevisiae, se ha identificado que en esta se encuentra un posible sitio de fosforilación por la cinasa de caseína II (CK2), Ser134, cuya importancia se ha estudiado mediante mutaciones puntuales. Estas se han realizado tanto en este residuo para simular su estado no-fosforilado (S134A) como fosforilado (S134D), así como la influencia de los residuos ácidos cercanos, ya que se sabe influyen sobre la actividad de CK2. Integrantes del Grupo

Dra. Rosario Vera Estrella Dr. Paul Rosas Santiago Dr. Erik Nieto Patlán Dr. Jorge Luis Ruiz Salas M.C. María Fernanda Gomez M.C. Carolina Yáñez M.C. Daniel Lagunas M.C. Adriana Garibay Biol. Jimena Martínez Pedro Iván Rogel

Publicaciones

Jeong, K. Pantoja, O. Baten, A. Waters, D. Kretzschmar, T. Wissuwa, M. Julia, C.C.

Heuer, S. Rose, T.J. 2018. Transcriptional response of rice flag leaves to restricted

external phosphorus supply during grain filling in rice cv. IR64 PLoS ONE, 13,

e0203654.

Wudick, M, Portes, MT, Michard, E, Rosas-Santiago, P, Lizzio, MA, de Oliveira

Nunes,C, Campos, C, Santa Cruz Damineli, D, Gomes Campos de Carvalho, J,

Lima, PT, Pantoja, O, Feijó, JA. 2018. CORNICHON sorting and regulation of

GLUTAMATE RECEPTOR–LIKE channels underlies pollen tube Ca2+ homeostasis.

Science. 360, 533–536. DOI: 10.1126/science.aar6464.

Rosas-Santiago, P, Lagunas-Gomez, D, Yáñez-Domínguez, C, Vera-Estrella, R,

Zimmermannová, O, Sychrová, H, Pantoja, O. 2017 Plant and yeast cornichon

possess conserved acidic motif required for correct targeting of plasma membrane

cargos. BBA- Molecular Cell Research 1864:1809-1818.

doi.org/10.1016/j.bbamcr.2017.07.004

Vera-Estrella, R., Gomez-Méndez, M.F., Amezcua-Romero, J.C., Barkla, B.J.

Rosas-Santiago, P. and Pantoja, O. 2017. Cadmium and zinc activate adaptive

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mechanisms in Nicotiana tabacum similar to those observed in metal tolerant plants.

Planta doi.org/10.1007/s00425-017- 2700-1)

Alumnos Graduados

Alumna: Carolina Yáñez Domínguez

Título de la tesis: Posible participación de Erv14p en la detoxificación deCobre y la

tolerancia a ácidos débiles en la levadura

Nivel: Maestría. Examen 9 de junio 2017

Alumno: Daniel Lagunas Gomez

Título de la tesis: Caracterización de un motivo acídico en el receptor

cargoOsCNIH1 de arroz (Oriza sativa)

Nivel: Maestría. Examen 31 de marzo 2017

Participación en docencia

Dr. Omar Pantoja Ayala

2017-18 (I) Curso curricular Biología vegetal, programa de Maestría y Doctorado en

Ciencias Bioquímicas, sede Instituto de Biotecnología/UNAM. Ocho horas al

semestre.

Dra. Rosario Vera Estrella

2017-18 (I) Coordinadora y profesora del curso curricular de Biología Celular de Maestría y Doctorado del programa de Bioquímica, sede Instituto de Biotecnología/UNAM. Responsabilidad 100%. Coordinación a 16 profesores. Seis horas a la semana. 2017-18 (I) Curso curricular Biología vegetal, programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, sede Instituto de Biotecnología/UNAM. Cuatro horas al semestre.

Divulgación

Rosas-Santiago, P y Pantoja O. “Una buena charla molecular es necesaria para la

reproducción sexual de las plantas” Biotecnología en movimiento. No. 14 Jul-Sep

2018

Distinciones

Reconocimiento al Mérito Estatal de Investigación 2018 del Estado de Morelos.

Portada de la revista Science volumen 360, 4 de mayo de 2018. Pollen tube

Currents. Calcium channels sent to subcellular addresses.

Portada de la revista Biotecnología en Movimiento Numero 14 Julio -Agosto-

Septiembre de 2018.

Seminarios, presentaciones en congresos y pláticas/conferencias

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“CORNICHON localiza y regula a los canales GLR necesarios en la homeostasis

del calcio en el tubo polínico” Simposio de Verano 2018, Instituto de Biotecnología,

UNAM, Cuernavaca, México, agosto 2018.

Erv14 cargo receptor participates in the regulation of potassium homeostasis via

its interaction with K+ specific transporters Trk1 and Tok1. Small Meeting on Yeast

Transport and Energetics. Martina Franca, Italy, 2018. Presentación oral.

Pantoja, O, Yáñez-Domínguez, C, Lagunas-Gomez, D, Rosas-Santiago, P, Ruíz-

Salas, J, Vera-Estrella, R, Bezanilla, M, Wudick, MM, Feijo, J. (2018) Exploring

cornichon homologues in plants. 6th Pan American Plant Membrane Biology

Workshop University of British Columbia, Vancouver, BC, Canada June 24-27.

Pantoja, O. Las proteínas cornichon/Erv14 en el tráfico de proteínas de membrana.

Seminario en el Departamento de Bioquímica del Instituto Nacional de Cardiología

“Ignacio Chávez”. Junio 21 2018.

Rosas Santiago, Paul. Conferencia “Canales Iónicos y membranas biológicas”

impartida en la Universidad Interserrana del Estado de Puebla (2018).

Donativos

Dr. Omar Pantoja Ayala

PAPIIT Enero 2017-Dic 2018 (IN203817)

Título Identificación del papel de los homólogos del cornichon (pepinillo) en

Physcomitrella patens.

Dra. Rosario Vera Estrella

PAPIIT Enero-Diciembre 2017 (IN204917)

Título ¿Es el mecanismo de trafico de acuaporinas del Retículo endoplásmico hacia

la membrana plasmática importante para la tolerancia a la salinidad?

Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo.

1. Caracterización de la proteína cornichon PpaCNIH2 como posible receptor

cargo de los transportadores de salida de auxinas PpaPIN en el musgo

Physcomitrella patens. M. en C. Carolina Yáñez.

2. Análisis de la terminal carboxilo en el receptor de proteínas cargo Erv14p de

Saccharomyces cerevisiae. M.C. Daniel Lagunas Gomez.

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Dr. Agustín López Munguía Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis “Fructanas: síntesis e hidrólisis, origen y destino” Resumen Como he señalado en reuniones pasadas, el elemento central de trabajo en el laboratorio que coordino, son las enzimas con capacidad para sintetizar glucanas y fructanas, con énfasis más reciente en las fructanas y los fructooligosacáridos (FOS), desde hace un par de décadas reconocidos por su papel esencial en la salud humana. En efecto, se trata de compuestos abundantes dentro de lo que en nutrición se clasifica como fibra soluble, uno de los nutrimentos específicos para el desarrollo y mantenimiento de una microbiota intestinal adecuada para la salud. En lo relativo a las enzimas fructosiltransferasas, a lo largo de los años hemos adoptado diversos modelos de estudio, partiendo de la fuente (generalmente bacterias lácticas) de la cual se han caracterizado enzimas, que posteriormente se han estudiado en relación con su capacidad para sintetizar fructanas y FOS, estrechamente relacionados con la salud intestinal de los seres humanos, aunque también de otras especies, tales como camarones (Citlali Chino en colaboración con el grupo del Dr. Adrián Ochoa), y potencialmente conejos (propuesta de proyecto). Es así como nos acercamos a alimentos tradicionales en México como el pozol o el pulque, con muchas similitudes en las poblaciones y mecanísmos empleados para la síntesis de glucanas y fructanas en fermentaciones tradicionales de otras materias primas y de otras culturas. Me refiero a productos como el tepache o el tesguino, la masa agria o los ensilados. El pozol y pulque, que reportamos ya como tema de estudio décadas atrás, vuelven a ser nuevamente tema del reporte de este bienio, dado que hemos encontrado nuevos elementos de interés que han dado lugar a trabajos y resultados que en esta plática se describen. En particular, en una colaboración con el grupo de Bioinformática del Dr. Lorenzo Segovia, y de proteómica de la Dra. Romina Rodríguez (IIB-UNAM) abordamos el estudio del pozol en coordinación con la Dra. Carmen Wacher (FQ-UNAM), para analizar la metagenómica y la proteómica del pozol. En nuestrto caso, analizamos el papel que juega el género Weissiella, frecuente en el pozol y señalado como un posible responsable del uso de la hemicelulosa como fuente de carbono alternativa al almidón. Se caracterizaron diversas cepas de este género, con resultados que permiten señalar posibles roles estas bacterias. En particular, se secuenciaron dos genomas de W. confusa, poniendo de manifiesto el arsenal metabólico que representan en términos de su capacidad para el consumo de carbohidratos (Diana Hernandez Oaxaca). Años atrás describimos una cepa aislada del pozol, perteneciente al género Leuconostoc: L. citreum CW28, por su capacidad para producir inulina, vía una fructosiltransferasa. Reportamos el genoma de esta cepa en este bienio, y Cristina Vallejo realizó un estudio en el cual, mediante una estrategia de realizar simultáneamente una reacción de síntesis/hidrólisis, se pretendía producir

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directamente desde sacarosa una amplia gama de FOS. La síntesis estaría asegurada por la enzima de L. citreum en células completas, y la hidrólisis mediante una endo-inulinasa comercial. Los resultados fueron sorpresivos e interesantes, dando lugar a su tesis de maestría, y un manuscrito propuesto para publicación. Ahora Cristina intenta mediante un trabajo de transcriptómica en colaboración con la Dra. Rosa María Gutiérrez, develar los misterios de la regulación, en cepas de este género, de una batería de genes de glicosiltransferasas, diversas en estructura y función, reguladas por la fuente de carbono. La síntesis de FOS vía una reacción bienzimática no es novedosa en el grupo: en el bienio anterior reporté el diseño de una quimera que permite la síntesis de fructo-oligosacáridos de estructura novedosa (tipo levana), de la cual se depositó una patente, y cuya evaluación sigue en curso, en la búsqueda de un simbiótico con propiedades de interés en el sector alimentario (Jaime Porras Domínguez y Alberto Morales). Reportamos aquí los primeros resultados obtenidos en un simulador de la microbiota intestinal, al mismo tiempo que exploramos una novedosa estrategia de producción de la quimera para asociar a la síntesis e hidrólisis, el consumo de los subproductos (glucosa) que es necesario eliminar del medio de reacción con los FOS sintetizados. Para ello, el microorganismo que produce la quimera y sintetiza la quimera, Pichia pastoris, lo hace creciendo sobre la glucosa que resulta de la reacción de síntesis (Silvia Montiel) A partir de este proyecto, mi grupo continuó trabajando sobre las fructanas de agave (inulinas de estructura compleja que combinan levanas, inulinas y neoseries. Las inulinas de agave son actualmente estudiadas como potenciales probióticos de particular interés dada la complejidad de su estructura. Hemos realizado diversos trabajos aplicados y de divulgación ligados con el impacto de este tipo de fructanas y sus fructo-oligosacáridos en la salud intestinal de los consumidores, y buena parte del impacto de estos trabajos se refleja en el reconocimiento que ahora se da a los productos fermentados tradicionales en la nutrición de los mexicanos. Nos interesa la inulina de agave en tanto que fibra soluble y sustrato de la microbiota intestinal. Una de las preguntas importantes está relacionada con la forma en la que las bacterias benéficas, particularmente las del género de las Bifidobacteria, asimilan de manera preferencial la agavina. Estudiamos en particular la especie B. longum, ampliamente reportada como probiótico de enormes beneficios para la salud, en su capacidad para hidrolizar y asimilar fructanas provenientes de agavina o de estructura tipo levana (Alejandra de los Santos). En este mismo tema, y después de una caracterización de la composición de las agavinas de diversas especies de agave, nos abocamos a la respuesta a una de las preguntas más interesantes que se ha hecho el grupo en relación con las fructanas de agave, el aguamiel y el pulque: ¿Cuál es el destino de las agavinas en el proceso pulquero? Conviene recordar aquí, que el aguamiel que se fermenta para obtener el pulque es el único producto de agave que no se trata térmicamente (caso de mezcal, tequila, y otras bebidas destiladas), sino que se procesa (fermenta) tal como se colecta (aguamiel). Así, siempre se ha señalado la responsabilidad de la fibra del agave dentro de las virtudes funcionales y nutrimentales del pulque. Aunque se trata de un trabajo aun no concluido pero muy avanzado, contamos con suficientes resultados, mismos que por ser de gran interés, permiten elaborar conclusiones y

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establecer hipótesis en relación con este importante proceso asociado a la cultura y tradición alimentaria de nuestro país (Ibeth Peralta). Otro aspecto importante que cubren las líneas de investigación implementadas en nuestro grupo es el de la “Biocatálisis aplicada a la síntesis y transformación de moléculas de interés industrial”, bajo dirección del Dr. Edmundo Castillo. En estos dos últimos años los proyectos se han enfocado a la transformación enzimática de moléculas con alta capacidad antioxidante. Específicamente, se han desarrollado métodos eficientes de glicosilación de moléculas polifenólicas mediante el uso de enzimas de tipo CGTasas (Mayra Escribano). Una de las moléculas elegidas como modelo de estudio fue el ácido caféico, en el cual se estudiaron los efectos de los residuos glicosilos sobre la actividad antioxidante de esta molécula y sobre sus propiedades fisicoquímicas y funcionales (Liliana Garrido). Además de sus propiedades funcionales, esta molécula se seleccionó debido a que existe un proyecto de colaboración con el grupo de vías metabolícas dirigido por el Dr. Guillermo Gosset, en el cual se está desarrollando un proceso de síntesis bienzimática (Raúl A. Calzada) acoplado a un un proceso de purificación (Paola Martínez). Complementariamente, se están desarrollando procesos biocatalíticos de síntesis asimétrica de -aminoácidos (Marina A. Ortega) y la síntesis quimioenzimática de biopolímeros de tipo polivinil- glicósidos (Pedro A. Cid). Cuatro años atrás, dediqué la plática prácticamente a un solo tema: la síntesis enzimática de análogos de capsaicina. Sigo considerando que este trabajo es un ejemplo muy ilustrativo, primero de la posibilidad que se tiene en nuestro ambiente académico de llevar un trabajo desde una idea (modificar la estructura de la capsaicina en oleoresinas de chile para manipular su pungencia), hasta la síntesis en escala piloto de análogos de capsaicina, pasando por aportaciones en el ámbito de la biocatálisis (el primer reporte de una lipasa capaz de llevar a cabo hidrolisis y síntesis de amidas). No puedo dejar de señalar ahora la distinción de la que ha sido objeto un joven emprendedor, formado en nuestro grupo con ese proyecto, por la tarea que se echó a cuestas de lograr llevar este proceso a una realidad industrial: Premio Nacional de Tecnología e Innovación en su XIX Edición, al Dr. Alejandro Torres Gavilán y a su empresa Applied Biotech ASA de CV. “por sus logros sobresalientes en el desarrollo tecnológico y gestión de Tecnología en el país” Integrantes del grupo: Agustín López-Munguía (Investigador Titular C) Edmundo Castillo Rosales (Investigador Titular B) M. en C. María Elena Rodríguez A. (Técnico Académico Titular C) TLC Fernando González Muñoz (Técnico Académico Titular A) TLC. Aurelia Ocampo (Técnico Laboratorista) Sra. Judith Uribe (Auxiliar de laboratorio) Biol. Larisa Campos (Secretaria ejecutiva). Estudiantes: Cristina Vallejo García (Doctorado, ALM) Diana Hernández Oaxaca (Maestría ALM)

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Ibeth Peralta García (Maestría ALM) Luis Alberto Morales Moreno (Maestría, ALM) Alejandra Janet de los Santos Alegría (Maestría, ALM) Silvia Montiel Salgado (Licenciatura ALM, MERA) Citlali Melisa Chino de la Cruz (Licenciatura ALM) Pedro Angel Cid Jímenez (ECR) Paola Martínez Juárez (ECR) Liliana Garrido Ramirez (Licenciatura, ECR) Raul Alejandro Calzada Hernández (Maestría, ECR) Personal por honorarios o en estancia: Alejandro Torres (Proyecto PEI) Jaime Porras Domínguez (Proyecto ALM) Publicaciones en el período (2017-2018). • A novel two-step enzymatic synthesis of blastose, a -D-fructofuranosyl-(2-6)-D-glucopyranose sucrose analogue. Miranda Molina A., Castillo E. & Lopez Munguia A. Food Chemistry 227, 202-210, 2017 • Levan type oligosaccharides synthesis by a levansucrase-endolevanase fusion enzyme (LevB1 SacB). Porras-Dominguez J., Rodriguez-Alegría M.E., Avila-Fernancez A., Montiel-Salgado S & López-Munguía A. Carbohydrate Polymers. 177, 40-48, 2017. • Identification of enzymatic activities involved in agave fructan consumption by Bifidobacterium longum subsp. infantis ATCC 15697. Cuevas-Juárez, E., Ávila-Fernández, Á. and López-Munguía A. Journal of Functional Foods. 35, 267-278. DOI information: 10.1016/j.jff.2017.05.048. 2017 • Draft genome sequence of Leuconostoc citreum CW28 isolated from pozol, a prehispanic fermented beverage. Olvera C., Santamaría R.I., Buspos P., Vallejo C., Montor J., Wacher C & López Munguía A. Genome Annoucements.Vol. 5, Issue 999 e01283-17, 2017. • The First description of a Hormone-Sensitive Lipase from a Basidiomycete: Structural Insights and Biochemical Characterization Revealed Bjerkandera adusta BaEstB as a Novel Esterase. María del Rayo Sánchez-Carbente, Ramón Alberto Batista-García, Ayixón Sánchez-Reyes, Angela Escudero- Garcia, Catalina Morales-Herrera, Laura Inés Cuervo-Soto, Leidys French-Pacheco, Arline Fernández-Silva, Carlos Amero, Edmundo Castillo and Jorge Luis Folch-Mallol. (2017) Microbiology Open 6(4):e00463. 01 March 2017. • E. Sierra, A. Miranda, E.Castillo, Hu,H., Ayala, M* (2017) "Chemoenzymatic synthesis of poly(phenylene disulfides) with insulating properties and resistant to high temperatures". Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 92 No. 2691. 24 March 2017. • Evaluation of xylan as carbón source for Weisella spp., a predominant strain in pozol fermentation. Lopez-Hernandez M., Rodriguez-Alegría M.E., López.Munguía A. & Wacher C. LWT. Food Science & Technology. 89, 192-197, 2018.

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• Understanding the transfer reaction network behind the non-processive synthesis of low molecular weighr levan catalyzed by Bacillus subtilis levansucrase. Raga-Carbajal E., López Munguía A., Álvarez Laura & Olvera Clarita. Scientific Reports. 8: 15035 DOI:10.1038/541598-018-32872-7. 2018. • Engineered thermostable β–fructosidase from Thermotoga maritima with enhanced fructooligosaccharides synthesis. Carmen Menendez, Lazaro Hernandez, Duniesky Martinez, Enrique Perez, Agustin Lopez Munguia, Ricardo Ramirez, Alexis Musacchio. Enzyme and Microbial Technology. Accepted. Estudiantes Graduados. Licenciatura: Evaluación de diversos factores que influyen en la expresión heteróloga de la levansacarasa SacB de B.subtilis 168 expresada en células de E.coli BL21 DE3. Flor Marian Vazquez Bahena. Licenciatura en Ingeniería en Biotecnología. Universidad Politécnica del Edo. de Morelos (UPEMOR). Diciembre 2018. Efecto del etilenglicol en la actividad, especificidad y síntesis de productos de la levansacarasa de B.subtilis. Jose Luis Ayala Sámano. Licenciatura en Biología. Facultad de Ciencias Biologicas, UAEM. 28 de abril de 2017 Producción de FOS tipo levana por vía enzimática. Silvia Montiel Salgado. Licenciatura en Ingenieria Bioquímica. Instituto Tecnológico de Zacatepec. 24 de Noviembre de 2017 Producción de fructooligosacáridos tipo levana por vía enzimática a partir de sacarosa. Juan Manuel García Maya. Licenciatura en Ingeniería en Biotecnologia. Universidad Politécnica del Valle de Toluca. Almoloya Edo de México 2018. (Tutor JRPD) Maestría: Producción de fructooligosacáridos a partir de sacarosa mediante procesos enzimáticos novedosos. Luz Cristina Vallejo García. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Febrero 2017. Síntesis enzimática de poliglicósidos fenólicos de interés industrial. Mayra Rebeca Escribano Gómez. Maestría en Ciencias Bioquímicas, Octubre 2017. (Tutor ECR) Doctorado: Estudio de un sistema bi-enzimático levansacarasa/endolevanasa para la síntesis de fructooligosacáridos. Jaime Ricardo Porras Dominguez. Posgrado en Ciencias Bioquimicas, UNAM. Mayo 2018. Participación en docencia. A nivel de licenciatura cursos regulares de Tecnología enzimática y Biocatálisis (A. López-Mungía) y de Biosíntesis Microbiana: teoría y laboratorio (MaElena Rodriguez) ambos en la Facultad de Química, UNAM. A nivel maestría, participación semestral en el curso básico de Bioquímica Cinética Enzimática (A. López-Munguía) y Carbohidratos (E, Castillo). Ambos Participamos también en el Tópico Selecto: del Gen al Producto.

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PROYECTOS (donativos) • “Biosíntesis de fructooligosacáridos tipo Levana mediante un sistema bi-enzimático.” Modalidad proyectos de Investigación aplicada o de innovación tecnológica PAPIIT. IT200316. Enero del 2016-2018. • "Diseño y síntesis enzimática de polifenoles glicosilados: efectos estructurales sobre su capacidad antioxidante" Modalidad proyectos de Investigación aplicada o de innovación tecnológica PAPIIT-IN209016. Enero 2016-2018. • “Fortalecimiento de la Infraestructura del Grupo de Biocatalisis del IBT-UNAM, a través del Programa “Apoyo al Fortalecimiento y Desarrollo de la Infraestructura Científica y Tecnológica 2016” y CONACyT. Hasta este año logró instalarce el equipo principal instalado con este proyecto, un HPLC acoplado a masas. • “Síntesis enzimática de oligosacáridos modulares híbridos con capacidades prebióticas”. CONACYT-BMBF (2017-2018). Colaboración con el Institut fur Organische Chimie. Julius-Maximilians Universitat Wuezburg, Alemania. Divulgación • Cómo alimentar a la microbiota intestinal. Jaime Porras y Agustín López Munguía. ¿Cómoves? Año 19, No 220, 16-19, marzo 2017. • Biotecnología y color en el mundo prehispánico. A. López Munguía. En: Biotecnología prehispánica en Mesoamérica. Biotecnología en Movimiento. No9, abril-junio, 11-16, 2017. • Transgénicos. Grandes beneficios, ausencia de daños y mitos. Coautor como parte del Comité de Biotecnología de la Academia Mexicana de Ciencias. Coordinador F.Bolivar. ISBN 978-607-8379-28-6. AMC, CONACYT, UNAM y El Colegio Nacional. Pp 500 páginas. 1000 ejemplares, 2017. • ¿Pavo o Guajolote? O ¿Comemos lo que somos? Agustín López Munguía. Academia de Ciencias de Morelos. La Ciencia, de Morelos para el Mundo. La Unión de Morelos (http://www.acmor.org.mx/?q=content/¿pavo-o-guajolote-o-¿comemos-lo-que-somos). 2 de enero de 2017. • Biotecnología y color en el mundo prehispánico. Agustín López Munguía. Academia de Ciencias de Morelos. La Ciencia, de Morelos para el Mundo. La Unión de Morelos. (http://www.acmor.org.mx/?q=content/biotecnolog%C3%ADa-y-color-en-el-mundo-prehisp%C3%A1nico) 4 de septiembre de 2017. • Dime con quién andas y te diré quién eres. http://www.cienciorama.unam.mx/a/pdf/507_cienciorama.pdf Entrevista con A. López Munguia. Marzo de 2017) CIENCIORAMA UNAM. • Favorece pulque microbiota benéfica en el ser humano. http://www.amc.edu.mx/comunicacion/boletin/amc061/mobile/index.php#p=25 Revista de la Academia Mexicana de Ciencias. Febrero de 2017. • La Puputov: un arma biológica y orgánica. Y sin embargo se mueve. La Unión de Morelos. 31 de mayo de 2017. • La Ciencia desde Morelos para el Mundo: X Aniversario de la columna de divulgación científicca de la Academia de Ciencias de Morelos. Agustín López

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Munguía. Academia de Ciencias de Morelos. La Union de Morelos (http://www.acmor.org.mx/?q=content/“la-ciencia-desde-morelos-para-el-mundo”-x-aniversario-de-la-columna-de-divulgación) 31 de julio de 2017. • Los guajolotes no se pavonean. Agustín López Munguía. Academia de Ciencias de Morelos. La Ciencia, de Morelos para el Mundo. La Unión de Morelos (http://www.acmor.org.mx/?q=content/los-guajolotes-no-se-pavonean). 26 de diciembre de 2017. • ¿Qué tanto contaminas cuando comes? 1ª Parte. http://www.acmor.org.mx/?q=content/%C2%BFqu%C3%A9-tanto-contaminas-cuando-comes-1a-parte. Agustín López Munguía. Academia de Ciencias de Morelos. La Ciencia, de Morelos para el Mundo. La Unión de Morelos. 16 de julio de 2018. • ¿Qué tanto contaminas cuando comes? 2ª Parte http://www.acmor.org.mx/?q=content/%C2%BFqu%C3%A9-tanto-contaminas-cuando-comes-2a-parte. Agustín López Munguía. Academia de Ciencias de Morelos. La Ciencia, de Morelos para el Mundo. La Unión de Morelos. 23 de julio de 2018. Congresos Conferencia: SÍNTESIS BI-ENZIMÁTICA DE FRUCTOOLIGOSACÁRIDOS TIPO LEVANA. Porras-Domínguez Jaime R., Rodríguez-Alegría María Elena, Ávila-Fernández Ángela and López-Munguía Agustín. XVII Congreso Nacional de Biotecnología y Bioingeniería. 25-30 Junio 2017. Puerto Vallarta, Jalisco. México. Cartel: EFECTO DEL ETILENGLICOL EN LA ACTIVIDAD, ESPECIFICIDAD Y SINTESIS DE PRODUCTOS DE LA LEVANSACARASA DE B. subtillis. Ma. Elena Rodríguez, José Luis Ayala y Agustín López-Munguía. 25-30 Junio 2017. Puerto Vallarta, Jalisco. México. Conferencia: EFECTO DEL ETILENGLICOL EN LA ACTIVIDAD, ESPECIFICIDAD Y SINTESIS DE PRODUCTOS DE LA LEVANSACARASA DE B. subtillis. Ma. Elena Rodríguez, José Luis Ayala y Agustín López-Munguía. 25-30 Junio 2017. Puerto Vallarta, Jalisco. México. Presentación oral. Cartel: LEVAN-TYPE FRUCTOOLIGOSACCHARIDES PRODUCTION BY ENZYMATIC SYNTHESIS. Jaime R. Porras-Domínguez, María Elena Rodríguez-Alegría, Ángela Ávila-Fernández , Silvia Montiel-Salgado, Agustín López-Munguía. 4°Iberoamerican Congress on Biorrefineries. 24-26 October 2018. Jaen España. Cartel: B-XYLOSIDASE ACTIVITY IN W.confusa L9, PREDOMINANT IN POZOL FERMENTATION. Diaz Ruiz G, Lopez Hernandez M, Rodriguez-Alegria ME, Lopez-Munguia A and Wacher C. FEMS Microbiology 9-13 July 2017. Valencia España

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Cartel: B-XYLOSIDASE ACTIVITY IN W.confusa L9, PREDOMINANT IN POZOL FERMENTATION. Diaz Ruiz G, Lopez Hernandez M, Rodriguez-Alegria ME, Lopez-Munguia A and Wacher C. FEMS Microbiology 9-13 July 2017. Valencia España Conference: NEW INSIGHTS IN B.SUBTILLIS LEVANSUCRASE MECHANISM AND APPLICATIONS. XXIV Enzyme Engineering Toulouse, France. September 24-28, 2017 Conference: “NEW FRUCTOSIDE SYNTHESIS THROUGH BACILLUS SUBTILIS LEVANSUCRASE REACTION MECHANISM CONTROL”. Biotecnología Habana 2017 Varadero, Cuba; 3-6 de diciembre 2017. l Ponencia: TRANSGÉNICOS Y ALIMENTACIÓN Congreso Nacional AMMFEN ¿Somos lo que comemos? Mérida, Yucatán 17 al 20 de abril 2018 Conferencias de Divulgación. Conferencia: Enzimas, bacterias y salud alimentaria Ciclo de Conferencias Premios Nacionales en la Unidad Cuajimalpa Universidad Autónoma Metropolitana-Unidad Cuajimalpa 17 de enero 2017 Conferencia: Ciencia, Industria y Obesidad Asamblea Ordinaria en La Sociedad Mexicana de Inocuidad y Calidad para Consumidores de Alimentos A.C. Ciudad de México 27 de enero 2017 Conferencia: ¿Quién alimenta nuestro mundo interior? 40 Aniversario CESSA Universidad CDMX, México. Abril 5, 2017 Simposio: Impacto de la Biocatálisis en la Química de Alimentos, Farmacéutica y Ambiental. Una historia picante sobre biocatálisis. Instituto Tecnológico de Veracruz Veracruz, Veracruz, 6-7 de abril 2017 Conferencia: “Pulque, Bacterias y Nutrición” Feria de las Pulquerias Tradicionales Secretaria de Cultura del Gobierno de la CDMX 29 y 30 de abril 2017 Conferencia: Alimentos: Somos lo que comemos y lo que comieron nuestros antepasados. 41º Aniversario del CIATEJ

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Guadalajara, Jalisco. 24-25 de agosto, 2017. Conferencia: “Alimentos transgénicos” Ciclo Café con Ciencia Biblioteca Vasconcelos y Dirección General de Divulgación de la Ciencia de la UNAM 29 de agosto 2017 3er Coloquio de Divisiones Profesionales de la SOMEDICYT Tlaxcala, Tlax. 19–21 de Octubre 2017 Conferencia: “La Química que te comes” Curso: Química Recreativa. DGDC-UNAM, CDMX, México. 11 de noviembre de 2017 Conferencia: Enzimas responsables de la degradación de fructanas. Primera Jornada de Biotecnología Industrial Tecnológico de Monterrey Zapopan, Jalisco 25 de enero 2018 Conferencia: Transgénicos y alimentación Congreso nacional AMMFEN ¿Somos lo que comemos? Asociación Mexicana de Miembros de Facultades y Escuelas de Nutrición A.C., Mérida, Yucatán 17 al 20 abril 2018 Conferencia: Alimentos tradicionales, alimentos modernos y microbiota intestinal Tercer Día de Puertas Abiertas Instituto de Biotecnología-UNAM Cuernavaca, Morelos 20 de abril 2018 Conferencia: La importancia de la divulgación científica en el contexto actual de la salud y nutrición en México Festival Internacional del Libro y la Lectura San Lorenzo Tezonco Universidad Autónoma de la Ciudad de México, CDMX Abril 2018 Mesa redonda: Los Alimentos Transgénicos a Debate Centro de Investigaciones Interdisciplinarias en Ciencias y Humanidades –UNAM-CDMX 11-13 de Abril 2018 Conferencia: Comer: ¿natural, orgánico, nutraceútico, simbiótico, transgénico, o qué? XXII Congreso Nacional de Divulgación de la Ciencia y la Técnica La Sociedad Mexicana para la Divulgación de la Ciencia y la Técnica, A.C.

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Guanajuato, Gto. 8 de agosto de 2018 Conferencia: Biotecnología: la mesa de hoy y la mesa de mañana. Quinto Curso regional para el Fortalecimiento de Capacidades en Bioseguridad de Organismos Genéticamente Modificados CiBIOGEM 17-21 de septiembre 2018 Conferencia: ¿Por qué Leonora Menten y Leonor Michaelis son tan importantes para la biocatalisis? Red Estructura Función y Evolución de Proteínas Universidad Autónoma de Coahuila 26 y 27 de septiembre 2018 Conferencia: Biocatálisis de carbohidratos: enfoques biotecnológicos Red Estructura Función y Evolución de Proteínas Universidad Autónoma de Coahuila 26 y 27 de septiembre 2018 Conferencia: Biotecnología en alimentos en nuestra vida cotidiana 2do Simposio Internacional EDN Alimentación y la evolución del hombre: del origen a la epigenética y epigenómica Escuela de Dietética y Nutrición-CDMX 25-26 octubre 2018 Carteles a presentar en la Semana Académica 2018

1. Producción de Fructooligosacáridos tipo levana a partir de sacarosa por vía enzimática mediante una enzima de fusión. Montiel-Salgado Silvia, Rodríguez-Alegría María Elena, Porras-Domínguez Jaime Ricardo & López-Munguía Agustín.

2. Efecto del etilenglicol en la actividad, especificidad y síntesis de productos de la levansacarasa de Bacillus subtilis. Ma. Elena Rodríguez, José Luis Ayala y Agustín López-Munguía.

3. Levan-type fructooligosaccharides production by enzymatic synthesis. Jaime R. Porras-Domínguez, María Elena Rodríguez-Alegría, Ángela Ávila-Fernández, Silvia Montiel-Salgado, Agustín López-Munguía.

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Dr. Alfredo Martínez Jiménez Consorcio de Ingeniería Metabólica Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, IBT-UNAM “Factores que promueven la acumulación de lípidos en la microalga Neochloris oleoabundans en condiciones auto y heterotróficas” Resumen Se presentará el trabajo realizado para favorecer la acumulación de lípidos, así como proteínas y carbohidratos, con la microalga Neochloris oleoabundans, tanto en condiciones fototróficas como heterotróficas usando glucosa como fuente de carbono. Se abordarán aspectos de bioprocesos y metabólicos que favorecen la acumulación de lípidos o carbohidratos con esta microalga clasificada como oleaginosa. Integrantes del Grupo 2017-2018 Investigador asociado Dr. Luis Caspeta Guadarrama (Junio 2018 - ). Técnico Académico M. en C. Ramón de Anda Herrera (2017). Estancia posdoctoral por proyecto Dra. Estefanía Sierra Ibarra (2017 - ). Estudiantes en estancia de investigación Daniela Parra Ramírez (Estancia de investigación, 2017. Universidad Nacional de Colombia). Adrián Rojas Romero (Servicio social, 2018. UAEM). Libni Azael Maas Hernández (Residencia profesional, 2018. Instituto Tecnológico Superior de Calkiní, Campeche. Dirigido por el Dr. Luis Caspeta Guadarrama). Karla Vianey Martínez Conde (UAEM, en proceso). Estudiantes de licenciatura Eliseo Ronay Molina Vázquez (Instituto Tecnológico de Tuxtla Gutiérrez, titulación en marzo de 2017). Eduardo Brito Alarcón (UAEM, titulación en abril de 2017). Karen Patricia Vega Díaz (UAEM, en proceso. Dirigida por la Dra. Estefanía Sierra Ibarra). Estudiantes de maestría Ingrid Alexandra Roncancio Sánchez (UNAM, titulación en enero de 2018). Mariana Martínez Valenzuela (UNAM, titulación en febrero de 2018).

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Jesús Alberto Salgado Delgado (UNAM, titulación en octubre de 2018). Mauricio López-Portillo Masson (UNAM, en proceso). Tlakaelel Akolmiztli Hernández Ríos (UNAM, en proceso). Fidel Oswaldo Ramírez Amador (UNAM, en proceso). María de los Ángeles Martínez García (UNAM, en proceso). León Fernando Arenas (UNAM, en proceso. Dirigido por el Dr. Luis Caspeta Guadarrama). Emiliano Balderas (UNAM, en proceso. Dirigido por el Dr. Luis Caspeta Guadarrama). Estudiantes de doctorado Karina Jasmin Salcedo Vite (UNAM, en proceso). Francisco Vera López-Portillo (UNAM, en proceso). Carlos Alberto Montenegro Herrera (UNAM, en proceso). Personal de apoyo Manuel Saucedo Ramírez. Aurelia González Guzmán. Rubí Margarita Robledo López. Publicaciones 2017-2018 Publicaciones en revistas arbitradas 1. Parra-Ramírez, D. Martinez, A. Cardona, C.A. 2019. Lactic acid production from glucose and xylose using the lactogenic Escherichia coli strain JU15: Experiments and techno-economic results. Bioresource Technology, 273, 86-92. 2. Pérez-Cadena, R., Espinosa-Solares, T. Medina-Moreno, S.A. Martinez, A. Lizardi-JIMENEZ, M.A., Tellez-Jurado, A. 2018. Production of Ethanol by Three Yeasts in Defined Media and Hydrolyzed Cladodes of Opuntia ficus-indica var. Atlixco. International Journal of Agriculture and Forestry, 8, 26-34. 3. Parra-Ramírez, D. Martinez, A. Cardona, C.A. 2018. Technical and economic potential evaluation of the strain Escherichia coli MS04 in the ethanol production from glucose and xylose Biochemical Engineering Journal, 140, 123-129. 4. Pérez-Cadena, R. Medina-Moreno, S.A. Martinez, A. Lizardi-Jiménez, M.A. Espinosa-Solares, T. Téllez-Jurado, A. 2018. Effect of concentration of salts in ethanol production from acid hydrolysis of cladodes of Opuntia ficus indica var. Atlixco [Efecto de la concentración de sales en la producción de etanol a partir de la hidrólsis ácida de cladodios de opuntia ficus indica var. Atlixco] Revista Mexicana de Ingeniería Química, 17, 349-364. 5. Serna-Loaiza, S., Martinez,A. Pisarenko,Y. Cardona-Alzate,C.A. 2018. Integral use of plants and their residues: the case of cocoyam (Xanthosoma sagittifolium) conversion through biorefineries at small scale Environmental Science and Pollution Research, 23 May 2018 Online first. 6. Salas-Navarrete, C. Hernández-Chávez, G. Flores, N. Martínez, L.M., Martinez, A. Bolívar, F. Barona-Gómez, F. Gosset, G. 2018. Increasing pinosylvin production in Escherichia coli by reducing the expression level of the gene fabI-

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encoded enoyl-acyl carrier protein reductase Electronic Journal of Biotechnology, 33, 11-16. 7. Ríos, L.F., Martinez, A. Klein, B.C. Maciel, M.R. Filho, R. 2018. Comparison of Growth and Lipid Accumulation at Three Different Growth Regimes with Desmodesmus sp Waste and Biomass Valorization, 9, 421-427. 8. Sigala, J.C. Suarez, B.P. Lara, A.R. Borgne, S.L. Bustos, P. Santamaria, R.I. González, V. Martinez, A. 2017. Genomic and physiological characterization of a laboratory-isolated Acinetobacter schindleri ACE strain that quickly and efficiently catabolizes acetate Microbiology, 163, 1052-1064. 9. Martinez, A. Rito-Palomares, M., Castro-Montoya, A.J. 2017. In Focus: Biotechnology and chemical technology for biorefineries and biofuel production Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 92, 897-898. 10. Ríos-González, L.J., Morales-Martínez, T.K. Rodríguez-Flores, M.F. Rodríguez-De la Garza J.A., Castillo-Quiroz, D. Castro-Montoya, A.J., Martinez, A. 2017. Autohydrolysis pretreatment assessment in ethanol production from agave bagasse Bioresource Technology, 242, 184-190. 11. Ríos-Franquez, F.J. González-Bautista, E. Ponce-Noyola, T. Ramos-Valdivia, A.C. Poggi-Varaldo, H.M. Garcia-Mena, J. Martinez, A. 2017. Expression of a codon-optimized beta-glucosidase from Cellulomonas flavigena PR-22 in Saccharomyces cerevisiae for bioethanol production from cellobiose Archives of Microbiology, 199, 605-611. 12. Huerta-Beristain, G. Cabrera-Ruiz, R. Hernández-Chávez, G. Bolívar, F. Gosset, G. Martinez, A. 2017. Metabolic engineering and adaptive evolution of Escherichia coli KO11 for ethanol production through the Entner-Doudoroff and the pentose phosphate pathways Journal of Chemical Technology and Biotechnology, 92, 990-996. 13. Pérez-Pimienta, J.A. Vargas-Tah, A. López-Ortega, K.M. Medina-López, Y.N. Mendoza-Pérez, J.A. Avila, S. Singh, S. Simmons, B.A. Loaces, I. Martinez, A. 2017. Sequential enzymatic saccharification and fermentation of ionic liquid and organosolv pretreated agave bagasse for ethanol production Bioresource Technology, 225, 191-198. 14. Garibay-Hernández, A. Barkla, B.J. Vera-Estrella, R. Martinez, A. Pantoja, O. 2017. Membrane proteomic insights into the physiology and taxonomy of an oleaginous green microalga Plant Physiology, 173, 390-416. 15. Morales-Sánchez, D. Martinez-Rodríguez, O.A. Martinez, A. 2017. Heterotrophic cultivation of microalgae: production of metabolites of commercial interest Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 92, 925-936. 16. Fernández-Sandoval, M.T. Galíndez-Mayer, J. Moss-Acosta, C.L. Gosset, G. Martinez, A. 2017. Volumetric oxygen transfer coefficient as a means of improving volumetric ethanol productivity and a criterion for scaling up ethanol production with Escherichia coli Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 92, 981-989. Capítulos en libros internacionales 1. Parra D., A. Martinez, G. Aroca, J. A. Quintero and C.A. Cardona. Biobutanol as a platform for future biorefineries. In: Petroleum Science and Technology “Biorefineries:

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Concepts, Advancements and Research”. Ed. Irene Torres. Nova Science Publishers, Inc. Novinka, New York, 2017: pp. 73-107. ISBN: 978-1-53610-708-1. https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?cPath=23_29&products_id=60651. 2. Martinez A., M.E. Rodríguez-Alegría, M.C. Fernandes, G. Gosset, A. Vargas-Tah. Metabolic engineering of Escherichia coli for lactic acid Production from renewable resources. In: Engineering of microorganisms for the production of chemicals and biofuels from renewable resources. Ed. G. Gosset. Springer International Publishing AG. Gewerbestrasse 11, 6330 Cham, Switzerland. 2017: pp. 125-145 .http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-51729-2_5. Alumnos Graduados 2017-2018 Estudiantes de licenciatura Eliseo Ronay Molina Vázquez (Instituto Tecnológico de Tuxtla Gutiérrez, titulación en marzo de 2017). Eduardo Brito Alarcón (UAEM, titulación en abril de 2017). Estudiantes de maestría Ingrid Alexandra Roncancio Sánchez (UNAM, titulación en enero de 2018) Mariana Martínez Valenzuela (UNAM, titulación en febrero de 2018) Jesús Alberto Salgado Delgado (UNAM, titulación en octubre de 2018). Participación en docencia 2017-2018 1. Seminario de Titulación. – Licenciatura de Ingeniería en Energías Renovables. Instituto de Energías Renovables – UNAM. Temixco, Morelos. 8 de agosto de 2016 – 29 de enero de 2017 (48 horas). 2. Participación en el Tópico Selecto “Ingeniería de vías metabólicas en bacterias: Producción de Bio-Combustibles”. Proyecto académico de especialización maestría y doctorado en Ciencias Bioquímicas. Instituto de Biotecnología/UNAM. 9 de mayo de 2017 (3 horas). 3. Producción de etanol y compuestos químicos a partir de lignocelulosa con cepas de Escherichia coli modificadas por ingeniería metabólica. Curso Ingeniería Celular UAM Cuajimalpa. Ciudad de México, México. 17 de julio de 2017 (3 horas). 4. Impartición de la clase Cultivo heterotrófico y análisis proteómico de las vías metabólicas centrales con la microalga oleaginosa Neochloris oleoabundans. Departamento de Biotecnología y Bioingeniería, CINVESTAV – IPN. 11 de agosto de 2017 (3 horas). 5. Integración del Metabolismo. Curso de Bioquímica (6 horas) 3 - 5 de octubre de 2017. Proyecto académico de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Instituto de Biotecnología/UNAM.

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6. Metabolismo Central. Curso de Bioquímica (8 horas) marzo de 2018. Proyecto académico de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Instituto de Biotecnología/UNAM. 7. Responsable y coordinador del Curso “Bioenergías: estado actual desde un enfoque biotecnológico”. Instituto de Biotecnología - UNAM. Febrero a mayo de 2018 (48 horas). 8. Bioenergía II – Licenciatura de Ingeniería en Energías Renovables. Instituto de Energías Renovables – UNAM. Temixco, Morelos. 6 de agosto de 2018 – 27 de enero de 2019 (48 horas). 9. Ingeniería metabólica de Escherichia coli para la producción de ácidos orgánicos precursores de biopolímeros. Curso en Ingeniería Ambiental, departamento de Biotecnología y Bioingeniería CINVESTAV. Ciudad de México, México. 20 de agosto de 2018 (3 horas). 10. Biochemical transformation of biomass (with microorganisms). SIADEB Advanced Course “The Biorefinery as a multi-platform for Energy and Bioproducts”. Jaén, España. 22 de octubre de 2018 (1 hora). Desarrollo tecnológico 2017-2018 1. Solicitud de patente en México (en trámite), “Cepa de Escherichia coli modificadas por ingeniería de vías metabólicas para la biosíntesis de pinosilvina y su uso”. Prisciluis Caheri Salas Navarrete, Georgina Teresa Hernández Chávez, Noemí Flores Mejía, Luz María Martínez Mejía, Alfredo Martínez Jiménez, Francisco Bolívar Zapata, Guillermo Gosset Lagarda. Número de solicitud: MX/a/2017/007394. Fecha de presentación de solicitud: 07/06/2017. 2. Solicitud de patente en México (en trámite), “Cepas de Escherichia coli modificadas por ingeniería de vías metabólicas para la biosíntesis de resveratrol y su uso en un nuevo proceso de co-cultivo”. José Manuel Camacho Zaragoza, Georgina Teresa Hernández Chávez, Fabián Moreno Avitia, René Ramírez Iñiguez, Alfredo Martínez Jiménez, Francisco Bolívar Zapata, Guillermo Gosset Lagarda. Número de solicitud: MX/a/2017/001478. Fecha de presentación de solicitud: 01/02/2017. Divulgación 2017-2018 Congresos y conferencias presentados por invitación 1. Alfredo Martínez Jiménez. Cultivo heterotrófico y estudio del proteoma de la microalga oleaginosa Neochloris oleoabundans. 27 de febrero, 2017. Seminarios de Doctorado en Ciencias en Desarrollo de Productos Bióticos. Yautepec, Morelos. 2. Alfredo Martínez Jiménez. Estudio proteómico de la microalga Neochloris oleoabundans, cultivada en condiciones heterotróficas. Mayo, 2017. Catedra “Dr Tonatiuh Ramírez Reivich”. Santiago de Querétaro, Querétaro. 3. Alfredo Martínez Jiménez. Heterotrophic cultivation and proteomic analysis of the oleaginous microalgae Neochloris oleoabundans reveals central metabolic pathways that promote lipid or starch accumulation. 25 y 26 de mayo, 2017. International

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Symposium on Functional Genomics and Systems Biology 2017. Cuernavaca, Morelos. 4. Alfredo Martínez Jiménez. Hacía una aplicación de la biomasa económica y sostenible. 31 de mayo al 2 de junio, 2017. Seminario Biorrefinerías. Cartagena de Indias, Colombia. 5. Alfredo Martínez Jiménez. Cultivo heterotrófico de microalgas y su potencial aplicación en biorrefinerías. 5 de junio, 2017. Small-scale Biorefineries for Rural Development in Latin America and Europe. Manizales, Colombia. 6. Alfredo Martínez Jiménez. 2da Reunión Red de Estructura Función y Evolución de Proteínas-Industria. 16 de junio, 2017. CDMX, México. 7. Alfredo Martínez Jiménez. Ethanol and lactic acid production from sugarcane bagasse, corn stover and agave bagasse hydrolysates with metabolic engineered Escherichia coli: from feedstocks to fermentations, and Lonnie´s lessons. 30 de julio al 3 de agosto, 2017. 2017 SIMB Annual Meeting and Exhibition. Denver, USA. 8. Alfredo Martínez Jiménez. Cultivo Heterotrófico y Análisis Proteómico de las Vías Metabólicas Centrales de la Microalga Oleaginosa Neochloris oleoabundans. 10 de agosto, 2017. Curso de Posgrado “Biotecnología Ambiental” del Programa de Posgrado en Biotecnología y Bioingeniería. CDMX, México. 9. Alfredo Martínez Jiménez. Microorganisms as microbial cell factories for the biorefinery concept. 28 y 29 de agosto, 2017. 1er Ciclo de Conferencias sobre Biotecnología para Bioenergía y Bioproductos (CCBBB). Coahuila, México. 10. Alfredo Martínez Jiménez. Cultivo de una microalga oleaginosa y sus aplicaciones potenciales. 19 de septiembre, 2017. Congreso y 3ª Feria Técnico-Científica, Departamento de Producción Agrícola y animal UAM Xochimilco. Ciudad de México, México. 11. Alfredo Martínez Jiménez. Ingeniería metabólica y de bioprocesos con Escherichia coli para la producción de lactato a partir de azúcares provenientes de lignocelulosa. 8 - 13 de octubre, 2017. XXX Semana de Ciencias Químicas, Química Sustentable. San Luis Potosí, México. 12. Alfredo Martínez Jiménez. “La triple B: Bioenergía, Biocombustibles y Biotecnología” + Biorrefinerías. 19 de octubre, 2017. 6° Congreso y 2ª Feria Técnico-Científica, Departamento de Producción Agrícola y animal UAM Xochimilco. Ciudad de México, México. 13. Alfredo Martínez Jiménez. Sexto congreso y Segunda Feria Técnico-Científica del Departamento de Producción Agrícola y Animal 2017. 18 - 20 de octubre, 2017. CDMX, México. 14. Alfredo Martínez Jiménez. ¿Qué hay para el almuerzo? Microorganismos para las biorrefinerías. 13 - 15 de noviembre, 2017. 3er taller SMIBIO: biorrefinerías de pequeña escala para el desarrollo rural en América Latina y Europa. Morelos, México. 15. Alfredo Martínez Jiménez. Prod. de R-3-hidroxibutirato con Escherichia coli. 21 de diciembre, 2017. Universidad de la República de Uruguay. Montevideo, Uruguay. 16. Alfredo Martínez Jiménez. Ingeniería Metabólica y de Bioprocesos para la producción de ácido D-láctico con Escherichia coli y lignocelulosa. 10 de agosto, 2018. Facultad de Química, UNAM. Ciudad de México, México. 17. Alfredo Martínez Jiménez. Ingeniería Metabólica y de Bioprocesos con Escherichia coli para la producción de ácido D-láctico. 30 de septiembre, 2018. Unidad de Microbiología

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Básica y Aplicada Universidad Autónoma de Querétaro. Querétaro, México. 18. Alfredo Martínez Jiménez. D and L-lactic acid production: from biochemistry, metabolic engineering and lignocellulosic feedstocks to fermentation, biorefineries and economic feasibility. 4 - 26 de octubre, 2018. 4th Iberoamerican Congress on Biorefineries, Jaén, España. Congresos y conferencias internacionales 1. Alfredo Martínez Jiménez. Seventh International Conference on Algal Biomass, Biofuels and Bioproducts. June 18 - 21, 2017. Miami, Florida, USA. 2. Alfredo Martínez Jiménez. D-lactic acid production with metabolic engineered Escherichia coli from sugarcane bagasse and corn stover hydrolysates. July 9-13, 2017. FEMS 2017 seventh Congress of European Microbiologists. Valencia, Spain. 3. Alfredo Martínez Jiménez. Metabolic engineering of Escherichia coli for R-3-hydroxybutyrate production with increased availability of NADPH. July 9-13, 2017. FEMS2017 seventh Congress of European Microbiologists. Valencia, Spain. 4. Daniela Morales-Sánchez, John Kyndt and Alfredo Martínez Jiménez. Heterotrophic cultures of Neochloris oleoabundans and proteomic analysis revealed key enzymes for lipid accumulation. 4 al 26 de octubre, 2018. 4th Iberoamerican Congress on Biorefineries, Jaén, España. 5. Estefanía Sierra-Ibarra, Guillermo Gosset and Alfredo Martínez Jiménez. Micro-aeration as an approach to improve lactic acid production and fermentation scale up with metabolic engineered Escherichia coli. 4 al 26 de octubre, 2018. 4th Iberoamerican Congress on Biorefineries, Jaén, España. 6. Mauricio García Benítez and Alfredo Martínez Jiménez. Metabolic Engineering of Escherichia coli for the production of (R)-3-hydroxybutyrate increasing the availability of NADPH. 28 al 31 de octubre, 2018. XXIX Interamerican Congress of Chemical Engineering Incorporating the 68th Canadian Chemical Engineering Conference. Toronto, Canadá. Congresos y conferencias nacionales 1. Juan Carlos Fragoso Jiménez *Ponente, Luz María Martínez Mejía, Georgina Hernández Chaves, Noemi Flores Mejía, Alfredo Martínez Jiménez, Guillermo Gosset Lagarda. Reducción en la capacidad de transporte de glucosa en Escherichia coli como estrategia para incrementar la producción de proteínas recombinantes. XVII Congreso Nacional de Biotecnología y Bioingeniería. 25-30 de junio, 2017. Puerto Vallarta, Jalisco. 2. Mariana Martínez Valenzuela, Alejandra Vargas-Tah, Andrea Sabido Ramos, Georgina Hernández Chávez, Guillermo Gosset, Alfredo Martínez Jiménez. Ingeniería metabólica para la producción de succinato en una cepa de Escherichia coli no fermentativa. XVII Congreso Nacional de Biotecnología y Bioingeniería. 25-30 de junio, 2017. Puerto Vallarta, Jalisco. 3. Alfredo Martínez Jiménez. Reunión anual de redes temáticas CONACyT. 30 de agosto al1de septiembre, 2017. Xochitepec, Morelos. 4. Adriana Margarita Longoria Hernández, Alfredo Martínez Jiménez. Producción

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de etanol a partir de celulosa de rastrojo de maíz. IV Reunión Nacional de La Red Temática de Bioenergía y La Red Mexicana de Bioenergía. 13-15 de noviembre, 2017. Morelos, México. 5. Blanca Angélica García García, Agustín Jaime Castro Montoya, Alfredo Martínez Jiménez, Carlos Ariel Cardona Alzate. Análisis tecno económico de la producción de bioetanol a partir de Zymomonas mobilis y E. coli MS04. IV Reunión Nacional de La Red Temática de Bioenergía y La Red Mexicana de Bioenergía. 13-15 de noviembre, 2017. Morelos, México. 6. Erika Alfayuset Ochoa Chacón, Ana C. Ramos Valdivia, Alfredo Martínez Jiménez, Teresa Ponce Noyola. Estudio de la regulación de la Beta-glucosidasa de Clavispora Lusitaniae. IV Reunión Nacional de La Red Temática de Bioenergía y La Red Mexicana de Bioenergía. 13-15 de noviembre, 2017. Morelos, México. 7. Eliseo Ronay Molina Vázquez, Alejandra Vargas Tah, Mario A. Caro Bermúdez, Alfredo Martínez Jiménez. Producción de polihidroxibutirato por fermentación: Bioplástico Biodegradable. IV Reunión Nacional de La Red Temática de Bioenergía y La Red Mexicana de Bioenergía. 13-15 de noviembre, 2017. Morelos, México. 8. Estefanía Sierra Ibarra, Alfredo Martínez Jiménez. Escalamiento del proceso de fermentación para la producción de precursores de Bioplásticos. IV Reunión Nacional de La Red Temática de Bioenergía y La Red Mexicana de Bioenergía. 13-15 de noviembre, 2017. Morelos, México. 9. Karina Salcedo Vite, Juan Carlos Sigala Alanís, Daniel Segura González, Alfredo Martínez Jiménez. Producción bacteriana de lípidos con Acinetobacter. IV Reunión Nacional de La Red Temática de Bioenergía y La Red Mexicana de Bioenergía. 13-15 de noviembre, 2017. Morelos, México. 10. Mariana Martínez Valenzuela, Alejandra Vargas-Tah, Andrea Sabido Ramos, Georgina Hernández Chávez, Guillermo Gosset, Alfredo Martínez Jiménez. Producción de succinato en biorreactor en condiciones de baja transferencia de oxígeno. IV Reunión Nacional de La Red Temática de Bioenergía y La Red Mexicana de Bioenergía. 13-15 de noviembre, 2017. Morelos, México. 11. Alfredo Martínez Jiménez. Escalamiento de la producción de bioetanol con Escherichia coli. 21 de septiembre, 2018. Facultad de Ingeniería Química UNAM. Ciudad de México, México. 12. Tlakaelel A. Hernández Ríos, Estefanía Sierra Ibarra and Alfredo Martínez Jiménez. Evaluation of ptsG and galR deletions on glucose transport and catabolic repression in a lactogenic strain of Escherichia coli. 4 - 9 de noviembre, 2018. XXXII Congreso Nacional de Bioquímica. Ixtapa, México. 13. Mauricio López-Portillo Masson, Alejandra Vargas Tah, Georgina Hernández Chávez, Estefanía Sierra Ibarra and Alfredo Martínez Jiménez. Efficient pyruvate production from glucose and xylose using metabolically engineered Escherichia coli and limited oxygen conditions. 4 - 9 de noviembre, 2018. XXXII Congreso Nacional de Bioquímica. Ixtapa, México. Financiamiento 2017-2018 Responsable del proyecto “Desarrollo de bio-refinerías integradas a módulos de pequeña escala para producir un rango óptimo de bio-productos a partir de varios

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residuos/desechos agro-rurales y agroindustriales con un mínimo de consumo de energía fósil”. Fecha de inicio: 1 de noviembre de 2015. Fecha de Término: 31 de mayo 2019. CONACyT Convocatoria: C0013-2014-02. Solicitud: 248192. Modalidad B1 ERANet-LAC. Carteles que presentará el grupo 1. Hernández Ríos, T.A., Sierra Ibarra, E., Martínez Jiménez, A. Evaluation of ptsG and galR deletions on glucose transport and catabolic repression in a lactogenic strain of Escherichia coli. 2. Sierra Ibarra, E., Gosset Lagarda, G., Martínez Jiménez, A. Micro-aeration as an approach to improve lactic acid production and fermentation scale-up with metabolic engineered Escherichia coli.

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Dr. Arnaud Ronceret Departamento de Biología Molecular de Plantas, IBT-UNAM. “Citogenómica de la meiosis en plantas” Resumen Nuestra investigación se centra en las bases moleculares de la regulación del comportamiento de los cromosomas meióticos. La meiosis es un paso crucial en la sexualidad que permite nuevas combinaciones genómicas (a través de la recombinación), y reduce a la mitad el tamaño del genoma. Para estudiar la meiosis, utilizamos plantas modelos como Arabidopsis thaliana y el maíz (Zea mays). Esperamos que este conocimiento pueda tener un impacto enorme en programas de mejoramiento genético de este cultivo vital. Hemos finalizado la caracterización del gen SPO11-1 de maíz que es un gen clave para la recombinación meiótica. SPO11-1 introduce las rupturas doble cadena en el ADN de manera aleatoria en varios sitios del genoma que pueden convertirse en sitios de entrecruzamientos. De manera sorprendente en maíz (como en Arabidopsis) la regulación de expresión del gene SPO11-1 es débil a nivel transcripcional. Hemos comprobado por análisis de RT-PCR como de qRT-PCR que el gene ZmSPO11-1 no está solamente expresado durante la meiosis, pero también en órganos somáticos (Maestría de Ana Karen Gómez Angoa y Ronceret et al. sometido). Utilizando anticuerpos específicos contra la proteína SPO11-1 de maíz en experimentos de inmunolocalización en meiocitos masculinos de maíz, hemos demostrado un enlace entre la distribución espacial y temporal de SPO11-1 con la organización del eje del complejo sinaptonémico. Este trabajo está sometido a la revista PLoS Genetics. En colaboración con el grupo de Mathilde Grelon (INRA Versalles, Francia), hemos identificado un nuevo componente del complejo sinaptonemico en plantas llamado ASYNAPTIC4 (ASY4). Este trabajo fue publicado en 2018 en la revista Plant Physiology. Hemos desarrollado una estrategia para dirigir la recombinación en sitios desinados en el genoma. Esta estrategia se basa en la complementación funcional del mutante spo11 que no forma ruptura de doble cadenas y finalmente no genera entrecruzamientos. Buscamos suplir la actividad del gen SPO11-1 mediante la acción de Cas9, la cual genera rupturas de doble cadena en regiones específicas del ADN de acuerdo con un RNA guía diseñado in silico. Santiago Valentín Galván Gordillo ha construido vectores específicos usando promotores meióticos (SWI1 y DMC1) para expresar CRISPR-Cas9 (optimizado para Arabidopsis) en los meiocitos, basado en vectores obtenidos de Holger Puchta (Karlsruhe Institute of Technology, Alemania). La complementación del mutante bi-alelico spo11-1-1 / spo11-1-3 en fondos genéticos distintos (Col y Ws) será evidenciada por una

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recuperación en la formación de bivalentes, una correcta formación de COs y segregación de cromosomas, lo que se puede evaluar con herramientas citológicas que hemos recientemente establecido [Escobar et al. 2015 Nature Protocols; Galvan et al. 2019 Methods in Molecular Biology]. Queremos comprobar que los RDC ocurrieron en los sitios preseleccionados usando marcadores moleculares y secuenciación masiva del genoma híbrido Ws/Col. Integrantes del Grupo Dr. Arnaud Ronceret, Lider Academico SNI: I Dr. Santiago Valentin Galvan Gordillo, postdoctorante desde marzo 2018, SNI: C Lic. Patricia Rueda, Tecnico Academico. Lic. Ana Karen Gomez Angoa, estudiante de maestria Lic. Yared Pinzon Guitierez, estudiante de maestria Dulce Alejandra Franco Castillo – Tesis de Licenciatura - Biología Tecnológico de Celaya Maria Guadalupe Morales Cardoso – Tesis de Licenciatura - Biología Tecnológico de Celaya Tania Guadalupe Alberto Calderon – Tesis de Licenciatura - Biología Tecnológico de Celaya Publicaciones Ronceret A, Golubovskaya I, Ku JC, Lee DH, Timofejeva L, Gomez Angoa AK, Kao

YH, Kremling K, Rosalind William-Carrier R, Meeley R, Barkan A, Cande WZ, Wang CJR. Remodeling of axial element conformation and dynamic SPO11 localization during DSB formation of maize male meiocytes. artículo sometido a PLoS Genetics (y BioRxiv). Galvan Gordillo SV, Escobar-Guzmán R, Rodríguez-Leal D, Vielle-Calzada JP, Ronceret A. Whole-mount immunolocalization procedure for plant female meiocytes. en ´Methods in Molecular Biology (2019) (Capitulo aceptado) - ed. Springer Chambon A, West A, Vezon D, Horlow C, De Muyt A, Chelysheva L, Ronceret A, Darbyshire A, Osman K, Heckmann S, Franklin FCH, Grelon M. Identification of ASYNAPTIC4, a component of the meiotic chromosome axis Plant Physiology (2018) 178 (1), (233-246) (artículo), citado 1 vez. Alumnos Graduados Ana Karen Gómez Angoa (graduación en diciembre 2018 o enero 2019) He formado a 3 estudiantes de licenciatura, 4 estudiantes de estancia corta y 2 de servicios sociales durante 2018. Participación en docencia

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Clase de Meiosis en el curso de Biología celular del postgrado de Ciencias Bioquímica -UNAM. Divulgación He participado a una entrevista de divulgación en la revista agronómica ´2000Agro´ de mayo/junio 2018 intitulado ´Científico desarrolla maíces híbridos capaces de reusarse en siembra´. Donativos 1. UNAP PAPIIT IA201217 (144,500.00 pesos en 2017 y 199,400.00 pesos en 2018) 2. Apoyo extraordinario del Instituto de Biotecnología (110,000.00 pesos para 2018-2019) NB: Mi proyecto de Ciencia Básica 2017-2018 (A1-S-8496) fue evaluado como ´altamente recomendable´, ´importante y de frontera, y merece el apoyo de CONACYT´ pero no tuvo la suerte de tener una ayuda económica. Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo. 1. Santiago Valentín Galván Gordillo, Patricia Rueda-Benítez y Arnaud Ronceret. Diseño de los sitios de recombinación meiótica en Arabidopsis thaliana. 2. Yared Gutiérrez- Pinzón, Dulce Alejandra Franco-Castillo, Patricia Rueda-Benítez y Arnaud Ronceret. Clonación y expresión de los componentes del complejo sinaptonémico en maíz.

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Dra. Alejandra Bravo de la Parra Departamento de Microbiología Molecular, IBT-UNAM “Toxinas Cyt de Bacillus thuringiensis. Mecanismo de acción y estrategias para migrar su toxicidad” Resumen Las toxinas Cyt de Bacillus thuringiensis son proteínas pequeñas de 25-27 kDa que también se acumulan en cristales paraesporales durante la esporulación de la bacteria. Tienen actividad insecticida hacia insectos Dípteros, no son toxicas para otros ordenes de insectos como Lepidópteros. Reciben su nombre porque in vitro tienen capacidad citolítica en eritrocitos. Hasta la fecha no se ha identificado un receptor proteínico para estas toxinas. Se propone que interaccionan directamente con fosfolípidos insaturados como: fosfatidilcolina, fosfatidiletanolamina y esfingomielina. Su estructura 3D muestra que están constituidas por un solo dominio

estructural del tipo -, formado por un ramillete de siete hebras β rodeadas por dos capas de α-hélices anfipáticas. El mecanismo de acción no está claro. El modelo de poro propone que se unen irreversiblemente a la membrana en un arreglo oligomérico de hasta 16 subunidades, para formar un poro en el intestino del mosquito. Este modelo propone que las láminas β son las que se insertan en las membranas formando un barril tipo β y las hélices α permanecen en la superficie. El otro modelo propone que las toxinas Cyt se agregan de forma desestructurada sobre la superficie de la membrana, permitiendo un efecto tipo detergente. En este trabajo analizamos la inserción de Cyt1Aa en diferentes tipos de membrana (microvellosidad del intestino del mosquito, eritrocitos y liposomas). La toxina Cyt fue marcada en residuos únicos de cisteína que fueron introducidos en las diferentes estructuras de la toxina. La colección de mutantes generadas en este proyecto nos permitió evidenciar que la actividad insecticida y la actividad hemolítica se pueden separar por mutaciones puntuales, es decir son actividades independientes. Las mutantes con Cys única fueron marcadas con Alexa-488, el análisis del apagamiento colisional con KI cuando la toxina está en solución o insertada en esta membrana nos permitió concluir que la toxina interactúa con estas membranas de diferente manera, y que en membranas del insecto es más probable que tenga una estructura de poro, mientras que en eritrocitos y en liposomas se agrega en la superficie. Por otro lado, generamos toxinas Cyt1Aa híbridas que lleva las asas de Cry1Ab involucradas en la interacción con receptores en las membranas de insectos Lepidópteros. Previamente habíamos demostrado que las asas 2 y 3 de Cry1Ab interaccionan con aminopeptidasa N (APN), fosfatasa alcalina (ALP) y cadherina (CAD). Nuestra hipótesis es que la construcción de proteínas híbridas Cyt1A proporcionando un sitio de unión que reconoce las proteínas en las larvas de lepidópteros podría dar como resultado una toxina Cyt1Aa activa hacia lepidópteros. De manera sistemática se construyeron estas variantes y se encontró que las

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variantes Cyt1Aa que llevan el asa 2 o el asa 3 de Cry1Ab en regiones específicas Cyt1Aa adquirieron la capacidad de interactuar con estos receptores y de matar larvas de Lepidópteros como Manduca sexta y Plutella xylostella. La segunda hipótesis fue que la inserción del epítope de unión a Cry1Ab presente en receptor CAD que está involucrado unir a esta toxina e inducir su oligomerización podría permitir la interacción de Cyt1Aa con Cry1Ab y potenciar su toxicidad. Insertamos el epítope de receptor CAD en diferentes regiones de Cyt1Aa y las toxinas hibridas resultantes mostraron capacidad para unir a Cry1Ab e indujeron toxicidad a larvas de P. xylostella de una población resistente a esta toxina. Es decir, una mezcla de las variantes hibridas de Cyt1Aa junto con Cry1Ab fueron capaces de matar a insectos resistentes a Cry1Ab. Nuestros datos muestran que la especificidad de Cyt1Aa puede ser modificada introduciendo regiones de otras toxinas no relacionadas con diferente especificidad. Así mismo, que pueden ser modificadas para sinergizar actividad de otras toxinas y así contender con problemas de resistencia. Integrantes del Grupo 2017-2018 Estudiantes Mary Carmen Torres Quintero (Doctorado, 28 Noviembre 2018) A. Bravo Zeyu Wang (Doctorado, otro posgrado China, 21 Mayo 2018) J. Zhang, M. Soberón, A. Bravo Nathália Alves dos Santos (Doctorado, otro posgrado Brasil, 6 Junio 2018) R. Polanczyk, A. Bravo Nathaly Alexander de Nascimento (Doctorado, otro posgrado Brasil) Ma.Elena Neves, M. Soberón, A. Bravo Francine Otsuka (Doctorado, otro posgrado Brasil) R. Polanczyk, A. Bravo Luisa Fernanda Velázquez (Doctorado, otro posgrado Colombia) J. Cerón, A. Bravo Analyely Rosales Juárez (Maestría, otro posgrado, 25 Junio 2018) S. Aguilar, A. Bravo Igor H. Sena Da Silva (Maestría, otro posgrado Brasil, 4 Junio 2018) R. Polanczyk, M. Soberón, A. Bravo Yangchao Yang (Maestría, otro posgrado China) KY. Liu, M. Soberón, A. Bravo Daniela Martínez Reynoso (Licenciatura, 6 Junio 2018) A. Bravo Jean Piere Quiliche Duran (Perú, Licenciatura en Biología) S. Pacheco José Luis Chavelas Reyes (Licenciatura en Biología, 19 Abril 2018) S. Pacheco Diego Peinado Rangel (Licenciatura en Biología, 26 Enero 2018) S. Pacheco Emanuel Christian Macario García (Licenciatura en Biología, 8 Diciembre 2017) S. Pacheco Vianca Alicia López Vázquez (Licenciatura en Biología) S. Pacheco Carlos Espindola Garduño (Licenciatura en Biología) S. Pacheco Aurora Massiel Díaz Arce. (Prácticas profesionales) A. Bravo Samira López Molina (Prácticas profesionales) A. Bravo Anayetzi Susano del Rosal (Prácticas profesionales) A. Bravo Postdoctorado

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Marco Aurelio Díaz Salinas (Septiembre 2017-Marzo 2018) M. Soberón, A. Bravo María Luisa Zardo (Septiembre- Diciembre 2017) M. Soberón, A. Bravo Investigadores Sabino Pacheco Guillén Técnicos Jorge Sánchez Quintana Lizbeth Cabrera Zavaleta Laboratorista Sergio Blancas Naranjo Alejandro Uribe Soriano Secretaria Graciela Domínguez Pineda Publicaciones 2017-2018 Artículos 1. Rubio VP, Bravo A, and Olmos J. 2017. Identification of a Bacillus thuringiensis surface-layer-protein with cytotoxic activity against MDA-MB-231 breast cancer cells. J Microbiol Biotechnol. 27: 36-42 2. Portugal L, Muñoz-Garay C, Martinez de Castro DL, Soberón M, Bravo A. 2017. Toxicity of Cry1A toxins from Bacillus thuringiensis to CF1 cells does not involve activation of adenylate cyclase/PKA signaling pathway. Insect Biochem Mol Biol. 80: 21-31 3. Xiao Y, Dai Q, Hu R, Pacheco S, Yang Y, Liang G, Soberón M, Bravo A, Liu K, Wu K. 2017. A single point mutation resulting in cadherin mis-localization underpins resistance against Bacillus thuringiensis toxin in cotton bollworm. J Biol Chem. 292: 2933-2943 4. Onofre J, Gaytan M, Peña AI, García-Gomez BI, Gómez I, Bravo A and Soberón M. 2017. Identification of Aminopeptidase-N2 as a Cry2Ab binding protein in Manduca sexta. Peptides 98: 93-98 5. Zhou Z, Liu Y, Liang G, Huang Y, Bravo A, Soberón M, Song F, Zhou X, Zhang J. 2017. Insecticidal specificity of Cry1Ah to Helicoverpa armigera is determined by binding APN1 through domain II loops 2 and 3. Appl Environm Microbiol. 83: e02864-16 6. Jiang J, Huang Y, Shu Ch, Soberón M, Bravo A, Liu Ch, Song F, Lai J, and Zhang J. 2017. Identification of midgut proteins from Holotrichia oblita bound with Cry8-like toxin. Appl Environm Microbiol. 83: e00541-17 7. Ocelotl J, Sánchez J, García-Gómez BI, Gómez I, Tabashnik BE, Bravo A and Soberón M. 2017. ABCC2 is associated with Bacillus thuringiensis Cry1Ac toxin oligomerization and membrane insertion in diamondback moth. Scientific Rep. 7: 2386 8. Li J, Ma Y, Yuan W, Xiao Y, Liu Ch, Wang J, Peng J, Peng R, Soberón M, Bravo A, Yang Y, Liu K. 2017. FOXA transcriptional factor modulates insect

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susceptibility to Bacillus thuringiensis Cry1Ac toxin by regulating the expression of toxin-receptor ABCC2 and ABCC3 genes. Insect Bioch Mol Biol. 88: 1-11 9. Pacheco S, Gómez I, Sanchez J, García-Gómez B-I, Soberón M, Bravo A. 2017. An intramolecular salt bridge in Bacillus thuringiensis Cry4Ba toxin is involved in the stability of Helix -3, which is needed for oligomerization and insecticidal activity. Appl Environm Microbiol. 83: e01515-17 10. Martínez de Castro DL, Gómez I, Bravo A and Soberón M. 2017. Identification of Bacillus thuringiensis Cry1AbMod binding-proteins from Spodoptera frugiperda. Peptides 98: 99-105 11. Chen WB, Lu GQ, Cheng HM, Liu CX, Xiao YT, Xu C, Shen ZC, Soberón M, Bravo A, Wu K. 2017. Transgenic cotton co-expressing chimeric Vip3AcAa and Cry1Ac confers effective protection against Cry1Ac-resistant cotton bollworm. Transgenic Res. 26: 763-774 12. Liu Y, Wang Y, Shu Ch, Lin K, Song F, Bravo A, Soberón M, Zhang J. 2018. Cry64Ba and Cry64Ca, two ETX/MTX2 Bacillus thuringiensis insecticidal proteins against hemipteran pests. Appl Environm Microbiol. 84: e01996-17 13. Shabbir MZ, Quan Y, Wang Z, Bravo A, Soberón M, He K. 2018. Characterization of the Cry1Ah resistance in Asian corn Borer and its cross-resistance to other Bacillus thuringiensis toxins. Scientific Rep. 8: 234 14. Soberón M, Portugal L, Garcia-Gómez BI, Sánchez J, Onofre J, Gómez I, Pacheco S, Bravo A. 2018. Cell lines as models for the study of Cry toxins from Bacillus thuringiensis. Insect Biochem Mol Biol. 93: 66-78 15. Torres-Quintero MC, Gómez I, Pacheco S, Sánchez J, Flores H, Osuna J, Mendoza G, Soberón M, Bravo A. 2018. Engineering Bacillus thuringiensis Cyt1Aa toxin specificity from dipteran to lepidopteran toxicity. Scientific Rep. 8: 4989 16. Wang Z, Fang L, Zhou Z, Pacheco S, Gómez I, Song F, Soberón M, Zhang J, and Bravo A. 2018. Specific binding between Bacillus thuringiensis Cry9Aa and Vip3Aa toxins synergizes their toxicity against Asiatic rice borer (Chilo suppressalis). J Biol Chem. 293:11447-11458 17. Rocha-Munive MG, Eguiarte LE, Soberón M, Castañeda S, Niaves E, Scheinvar E, Mota-Sanchez D, Rosales-Robles E, Nava-Camberos U, Martínez-Carrillo JL, Blanco CA, Bravo A and Souza V. 2018. Evaluation of the impact of genetically modified cotton after 20 years of cultivation in Mexico. Frontiers Bioeng Biotechnol. 6:82 18. Wang K, Shu Ch, Soberón M, Bravo A, Zhang J. 2018. A systematic characterization procedure for Bacillus thuringiensis strains through multi-locus sequence typing. J Invertebr Pathol. 155: 5-13 19. Liu L, Chen Z, Yang Y, Xiao Y, Liu Ch, Ma Y, Soberón M, Bravo A, Yang Y, Liu K. 2018. A single amino acid polymorphism in ABCC2 loop 1 is responsible of differential toxicity of Bacillus thuringiensis Cry1Ac toxin in different Spodoptera (Noctuidae) species. Insect Biochem Mol Biol. 100: 59-65 20. Gómez I, Rodríguez-Chamorro D, Flores-Ramirez G, Grande R, Portugal F, Sanchez J, Pacheco S, Bravo A, and Soberón M. 2018. Spodoptera frugiperda (J. E. Smith) aminopeptidase N1 is functional receptor of Bacillus thuringiensis Cry1Ca toxin. Appl Environm Microbiol. 84: e01089-18 21. Pacheco S, Gómez I, Sanchez J, García-Gómez BI, Czajkowsky D, Zhang J,

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Soberón M, and Bravo A. 2018. Helix -3 inter-molecular salt bridges and conformational changes are essential for toxicity of Bacillus thuringiensis 3D-Cry toxin family. Scientific Rep. 8: 10331 22. Gómez I, Ocelotl J, Sanchez J, Garcia-Gomez BI, Lima Ch, Martins E, Rosales-Juarez A, Aguilar-Medel S, Monnerat R, Peña G, Bravo A and Soberón M. 2018. Enhancement of Bacillus thuringiensis Cry1Ab and Cry1Fa toxicity to Spodoptera frugiperda by domain III mutations indicates two distinct limiting steps for toxicity. Appl Environm Microbiol. 84: e01393-18 23. Peña-Cardeña A, Grande R, Sanchez J, Tabashnik B, Bravo A, Soberón M, and Gomez I. 2018. The C-terminal protoxin domain of Bacillus thuringiensis Cry1Ab toxin has a functional role in binding to GPI-anchored receptors in the insect midgut. J Biol Chem. In the Press 24. Sena de Silva, I, Gómez I, Sánchez J, Martínez de Castro DL, Valicente FH, Soberón M, Polanczyk RA, Bravo A. 2018. Identification of midgut membrane proteins from different instars of Helicoverpa armigera (Lepidoptera: Noctuidae) that bind to Cry1Ac toxin. PlosONE. In the Press 25. Bravo A, López-Diaz JA, Yamamoto T, Harding K, Zhao JJ, Mendoza G, Onofre J, Torres MC, Nelson ME, Wu G, Sethi A, and Soberon M. 2018. Susceptible and mCry3A resistant corn rootworm larvae killed by a non-hemolytic Bacillus thuringiensis Cyt1Aa mutant. Scientific Rep. In the Press Capítulos en libros 1. Bravo A, Pacheco S, Gomez I, García B, Onofre J, Soberón M. 2017. Insecticidal proteins from Bacillus thuringiensis and their mechanism of action, In: Bacillus thuringiensis and Lysinibacillus sphaericus: Characterization and use in the field of biocontrol. (LM Fiuza, RA Polanczyk, N Crickmore, Ed) Editorial Springer, USA, Pp 53-66 2. Soberón M, Monnerat R, Bravo A. 2018. Mode of action of Cry toxins from Bacillus thuringiensis and resistance mechanism. In: Microbial Toxins (Mandal M Ed.) Springer, Netherlands. Pp 15-27 3. Bravo A, Soberón M. 2018. Desarrollos biotecnológicos en algodón. En: Algodón en México 20 años. (A. Bravo, V. Souza, Ed) UNAM. Pp 37-46 Libros editados 1. Algodón en México. 20 años. (A. Bravo, V. Souza, Ed.) Desarrollos biotecnológicos en algodón. UNAM, México. Primera edición Octubre 2018. 136 págs. Alumnos Graduados 1. Mary Carmen Torres Quintero (Doctorado en Ciencias Bioquímicas, 28 Noviembre 2018) A. Bravo 2. Zeyu Wang (Doctorado, otro posgrado China, 21 Mayo 2018) J Zhang, M. Soberón, A. Bravo 3. Nathália Alves dos Santos (Doctorado, otro posgrado Brasil, 6 Junio 2018) R. Polanczyk, A. Bravo 4. Analyely Rosales Juárez (Maestría, otro posgrado, 25 Junio 2018) S. Aguilar-

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Medel, A. Bravo 5. Igor H. Sena Da Silva (Maestría, otro posgrado Brasil, 4 Junio 2018) R. Polanczyk, M. Soberón, A. Bravo 6. Daniela Martínez Reynoso (Licenciatura, 6 Junio 2018) A. Bravo 7. José Luis Chavelas (Licenciatura, 19 Abril 2018) S. Pacheco 8. Diego Peinado (Licenciatura, 26 Enero 2018) S. Pacheco 9. Emanuel Christian Macario (Licenciatura, 8 Diciembre 2017) S. Pacheco Participación en docencia 1. Participación de A. Bravo en el curso: Biología Celular, Posgrado de Ciencias UAEM, BCyM. Enero 2017 2. Participación de A. Bravo y S. Pacheco como profesores responsables del Curso: Viejas y nuevas tendencias en el uso de la fluorescencia para el análisis estructural de las proteínas y sus procesos biológicos. Instituto de Biotecnología, UNAM. Enero a Junio 2017. 3. Participación de A. Bravo en el curso: Viejas y nuevas tendencias en el uso de la fluorescencia para el análisis estructural de las proteínas y sus procesos biológicos. Instituto de Biotecnología, UNAM Febrero 2018. 4. Participación de A. Bravo en el curso: Evaluación de eficacia biológica, susceptibilidad y resistencia de los adulticidas utilizados en el programa de enfermedades transmitidas por vectores, 4 al 8 de Junio de 2018. CENAPRECE 5. Participación de S. Pacheco como profesor responsable en el curso: Fundamentos y metodologías de las interacciones proteína-proteína. Instituto de Biotecnología, UNAM. Agosto 2017 a Enero 2018 Donativos 1. SEP - CONACYT convocatoria CB-2013-01. No. de Proyecto: 221200. Responsable: A. Bravo. Título: Ingeniería de la toxina Cyt1Aa para inhibir su actividad hemolítica y optimizar su sinergismo con toxinas Cry de Bacillus thuringiensis 2014-2017. Monto aprobado 1,997,500 pesos 2. Collaboration agreement between UNAM and Pioneer Hi-Bred International TRAC 15713. 2014-2019. Responsable: M. Soberón, A. Bravo. Monto aprobado 750,000 US 3. CONACyT Fronteras de la Ciencia Proyecto 008. Responsable: A. Bravo. Título: Desarrollo de nuevas toxinas insecticidas de Bacillus thuringiensis contra las plagas invasivas de cultivos primordiales para México como maíz y algodón. 2016-2018. Monto aprobado 2,858,000 pesos 4. DGAPA, Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación y de Innovación tecnológica. No de proyecto IN201016. Responsable: A. Bravo. Título: Desarrollo de nuevas toxinas insecticidas de Bacillus thuringiensis contra gusano cogollero-Spodoptera frugífera. 2015-2018. Monto aprobado 613,100 pesos 5. DGAPA, Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación y de Innovación tecnológica. No de proyecto: RA-202616. Responsable: Dr. Sabino Pacheco. Título: Evolución dirigida de toxinas Cry de Bacillus thuringiensis como estrategia para rediseñar el reconocimiento toxina-receptor y contender con la resistencia de plagas agrícolas. Monto: 355,000 pesos

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6. NIH National Institutes of Health. National Institute of allergies and infections diseases. Proyecto No: 2R01A/066014-11A1. Responsable: Dr. Sarjeet Gill. Titulo: Mosquitocidal action of Bacillus thuringiensis toxins. 2016-2021 Monto aprobado para IBT-UNAM 432,498 US 7. FAPESP Brazil. Proyecto No: 2017/21004-5 Responsable: Dr. Ricardo Polanczyk. Titulo: Agriculture, Micro/Nanotechnology and Environment. Evaluation of the mechanisms of action to study transport and toxicity. 2018-2020 Monto aprobado para IBT-UNAM 10,000 US 8. DGAPA, Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación y de Innovación tecnológica. No de proyecto: IA201218. Responsable: Dr. Sabino Pacheco. Título: Estudio de la arquitectura de poros inducidos por las toxinas Cry1A de Bacillus thuringiensis en membranas utilizando fluorescencia. Monto: 400,000 pesos 9. DGAPA, Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación y de Innovación tecnológica. No de proyecto: IN203619. Responsable: Dr. A. Bravo. Título: Análisis de la respuesta en larvas de insectos ante el ataque de toxinas Cry de Bacillus thuringiensis 2019-2022. Monto aprobado para el primer año: 240,000 pesos Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo.

1. Puentes salinos intermoleculares necesarios para el ensamblaje del oligómero de las toxinas Cry. Dr. Sabino Pacheco

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Dra. Claudia Lydia Treviño Santa Cruz Consorcio de la Fisiología del Espermatozoide Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular “Oscilaciones de calcio: un mecanismo dependiente de pH que previene la reacción acrosomal en el espermatozoide humano” Resumen La fertilización es un proceso biológico fundamental que produce un individuo nuevo y único, permitiendo la preservación de las especies y la evolución mediante la reproducción sexual. La interacción y el diálogo molecular establecidos entre los gametos masculinos y femeninos son materia bajo intenso estudio. La transducción de señales y el transporte de iones son procesos estrechamente relacionados en diversos procesos celulares. La señalización mediada por iones y segundos mensajeros es particularmente importante en los espermatozoides, dado que éstos carecen de las capacidades de síntesis de proteínas requeridas para los eventos de señalización generalmente disponibles en otros tipos celulares. Nuestro laboratorio está interesado en comprender las vías de señalización en operación en espermatozoides; específicamente, estamos investigando el papel de los flujos de iones y cascadas de señalización como parte de los mecanismos moleculares mediante los que distintas señales ambientales que perciben los espermatozoides se traducen en respuestas fisiológicas específicas. La importancia de la señalización mediante Ca2+ en la fisiología del espermatozoide se ha reconocido desde hace tiempo, y continúa siendo un tema de estudio intensivo en varios laboratorios. Sin embargo, los mecanismos mediante los cuales se regulan los cambios en pH intracelular (pHi) y cómo estos a su vez intervienen en varias funciones del espermatozoide aún no se comprenden completamente. La importancia del pHi se destaca por el hecho de que dos canales (Catsper y Slo3) de expresión específica en el espermatozoide, cuya ausencia causa infertilidad son regulados por pHi. Los espermatozoides no tienen motilidad dentro del epidídimo, debido en parte a las condiciones acidas del fluido extracelular. La regulación de la actividad del espermatozoide está fuertemente relacionada a los niveles de HCO3

- y los valores de pH extracelular (pHe) y pHi. Tras la eyaculación, los espermatozoides se mezclan con el fluido seminal que tiene un pHe alcalino (7.2 – 8.4) y una mayor [HCO3

-]e. Los iones HCO3- no sólo activan la motilidad de los

espermatozoides, sino que también los protegen en el ambiente acido de la vagina. Estos cambios constituyen el primer estímulo a la motilidad, y van seguidos de un segundo aumento de la [HCO3

-]e presente en el tracto femenino, el cual además de activar aún más la motilidad, contribuye al proceso de capacitación. No se sabe en espermatozoide de humano cual es el canal/transportador que permite el ingreso de HCO3

- ni que entidades moleculares regulan el pHi. En este semanario presentaré nuestros resultados del estudio de los cambios de pHi que ocurren durante capacitación en espermatozoide de humano, dado que este fenómeno, está solo bien caracterizado en espermatozoides de ratón. Para esto utilizamos la

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microscopía de flujo (AMNIS), es un citometro que nos permite el análisis de un número grande de células (miles) pero que además nos proporciona resolución espacial de donde ocurren los cambios. Finalmente presentaré resultados de la influencia que tiene el pHe en la generación de oscilaciones de Ca2+ en el espermatozoide de humano, que además parecen ser un mecanismo que previene la ocurrencia de la reacción acrosomal. Integrantes del Grupo 2017-2018 Investigador Asociado Dr. Julio César Chávez Zamora Técnico Académico M. en C. Paulina Torres Rodríguez Francisco Fabio Herrero Rodríguez (2017) Estudiantes en estancia de Investigación, Servicio Social, etc. Catalina Berrios Amaro (estancia de investigación, 2018 Universidad Católica de Chile, Valparaíso). Claudio Adrián Flores López (Servicio social UAEM, 2018 dirigido por Paulina Torres) Mariana Organiz Oregón (verano Delfín 2017, Universidad Autónoma de Guerrero, dirigida por Paulina Torres) Cinthia Estefanía Guevara Canales (verano Delfín 2017, Universidad Autónoma de Ciudad Juárez, dirigida por Julio César Chávez) Estudiantes de Licenciatura Gabriela Álvarez García (UNAM, terminada en junio 2018) Mariana Beatriz Olivares Urbano (UAEM, en proceso) César Rodrigo Coria Gómez (UNAM, en proceso) Julisa Solís Salgado (UPEMOR, en proceso, dirigida por Julio César Chávez) José Emiliano Velázquez Martínez (UAEM, en proceso, dirigida por Julio César Chávez) Estudiantes de Maestría Arturo Matamoros Volante (UNAM, terminada en noviembre 2017) Marco Antonio Chávez Tinoco (IPN; Unidad Michoacán Co-tutoría, en proceso) Karla Lissete Andrade López (UAEM, terminada, dirgida por Dr. Julio Chávez Estudiantes de Doctorado Esperanza Mata Martínez (UNAM, terminada en abril 2018) Linda Valeria Castillo Viveros (UNAM, en proceso) Arturo Matamoros Volante (UNAM, en proceso) Personal de Apoyo: Miguel Ángel Trujillo González Leonel Linares Labastida/Cinthya Olvera Servín Jorge Antonio Blancas Naranjo

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Publicaciones 2017-2018

1. Lis del C. Puga Molina, Nicolás A. Pinto, Paulina Torres Rodríguez, Ana Romarowski, Alberto Vicens Sanchez, Pablo E. Visconti, Alberto Darszon, Claudia L. Treviño and Mariano G. Buffone. (2017). Essential role of CFTR in PKA-dependent phosphorylation, alkalinization and hyperpolarization during human sperm capacitation. Journal of Cellular Physiology, 232(6), 1404-1414.

2. Aidee S Lopez-Torres, Maria E Gonzalez-Gonzalez, Esperanza Mata-Martínez, Claudia L Treviño and Mayel Chirinos. (2017). Luteinizing hormone modulation of human sperm function: potential role in capacitation. BBRC 483(2), 834-839.

3. Joaquín Paillamanque, Ana Sanchez-Tusie, Emerson M. Carmona, Claudia L. Treviño, Carolina Sandoval, Nelson Osses, Juan G. Reyes. (2017) Arachidonic acid triggers [Ca2+]i increases in rat round spermatids by GPR120 activation, ERK signaling and ER/acidic compartments Ca2+ release. PLOS One 12(2):e0172128.

4. Alberto Vicens, Karla Andrade, Diego Cortez, Rosa María Gutiérrez and Claudia Treviño. (2017). Comparative genomics reveals that the sperm specific Slo3 channel originated prior to mammal radiation. FEBS Open Bio, 7(3), 382-390.

5. Corkidi, Gabriel; Montoya, Fernando; Hernández-Herrera, Paul; Ríos-Herrera, Wady; Müller, Markus; Trevino, Claudia and Darszon, Alberto (2017) Are there intracellular Ca2+ oscillations correlated with flagellar beating in human sperm? 3D vs. 2D analysis. Molecular Human Reproduction, 23(9),583-593.

6. Julio C. Chávez, José L. De la Vega, Omar José, Paulina Torres, Takuya Nishigaki, Claudia L. Treviño and Alberto Darszon (2018) Acrosomal alkalinization triggers Ca2+ release and acrosome reaction in mammalian spermatozoa. Journal of Cellular Physiology, 233, 4735-4747.

7. Arturo Matamoros-Volante, Ayelen Moreno-Irusta, Paulina Torres-Rodriguez, LauraGiojalas, Maria G. Gervasi, Pablo E. Visconti and Claudia L. Trevino (2018). Semi-automatized segmentation method using image-based flow cytometry to study sperm physiology: the case of capacitation-induced tyrosine phosphorylation. Molecular Human Reproduction, 24, 64-73.

8. Mata-Martínez Esperanza., Darszon, Alberto. and Treviño Claudia. L. (2018). pH-dependent Ca+2 oscillations prevent untimely acrosome reaction in human sperm. BBRC, 497, 146-152.

9. Lis C. Puga Molina, Nicolás A. Pinto, Nicolas Torres, Ana L. Gonzalez-Cota, Guillermina M Luque, Ana Romarowski, Dario Krapf, Celia M. Santi, Claudia L. Treviño, Alberto Darszon, Mariano G. Buffone.(2018) NBC cotransporter and ENaC channels are essential in the CFTR-dependent activation of cAMP/PKA signaling pathway and hyperpolarization during human sperm capacitation. JBC 293(25), 9924-9936.

10. Alberto Vicens and Claudia L. Treviño (2018). Positive selection in the evolution of mammalian CRISPs. Journal of Molecular Evolution, First Online 28 October 2018.

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11. Moreno-Irusta A, Kembro JM, Domínguez EM, Matamoros-Volante A, Gallea MN, Molina RI, Guidobaldi HA, Treviño C, Figueras J, Babini A, Paina NA, Mercado CAN, Giojalas LC (2018). Sperm physiology variations according to an ultradian and circannual rhythm. Enviado a Scientific Reports.

12. Alberto Vicens, Pablo Vinuesa, Miguel Arenas and Claudia L. Treviño (2018). Analyzing the functional divergence of Slo1 and Slo3 channel subfamilies. Enviado a Molecular Phylogenetics and Evolution.

Alumnos Graduados Licenciatura: Gabriela Álvarez García (UNAM, terminada en junio 2018) Maestría: Arturo Matamoros Volante (UNAM, terminada en noviembre 2017) Karla Lissete Andrade López (UAEM, terminada en agosto 2018 tutor Dr. Julio César Chávez) Doctorado: Esperanza Mata Martínez (UNAM, terminada en abril 2018) Participación en docencia 2017-2018

• Coordinadora de docencia del programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas sede IBt, desde mayo 2013 a agosto de 2017.

• Coordinadora General de Docencia del IBt a partir de agosto del 2017 a la fecha.

• Curso de Bioquímica (Sede Cuernavaca), Maestría en Ciencias Bioquímicas UNAM, (Semestre 2017-II).

• Curso de Biología Celular (Sede CU), Maestría en Ciencias Bioquímicas UNAM, (Semestre 2017-II y 2018-I).

• Taller de titulación de la Facultad de Ciencias, UNAM (2018-I y 2018-II).

• Organización de la primera Escuela de Verano IBt (junio 2018).

Divulgación 2017-2018 Congresos y Conferencias

1.J.Matamoros ,Torres-Rodriguez, P. , A. Moreno, L. Giojalas, M. Gervasi, P. Visconti,Trevino, C. L (2017). Image-Flow Cytometry: Una Metodología Novedosa para medir la Fosforilación de Proteínas en Tirosinas. 8vas Jornadas Estatales de Reproducción de la Universidad Autónoma "Benito Juárez", Oaxaca, México.

2.G.Álvarez,Torres-Rodriguez, P. ,J.Matamoros , I. Maldonado, L.Villar, A. Agarwal,Trevino, C. L. (2017) Estudio de los niveles de potencial redox, movilidad y supervivencia en espermatozoides de humano: comparación entre diferentes medios de incubación. 8vas Jornadas Estatales de Reproducción de la Universidad Autónoma "Benito Juárez", Oaxaca, México.

3. Julio C. Chávez, José L. De la Vega-Beltrán, Omar José, Enrique I. Oliver-Santiago, Paulina Torres, Takuya Nishigaki, Claudia L. Treviño and Alberto Darszon (2017). Acrosomal alkalinization increases intracellular Ca2+ partially through IP3Rs and triggers acrosome reaction in mammalian

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spermatozoa. Gordon Research Conferences: Fertilization & Activation of Development, GRC. Holderness NH, United States.

4. LC. Puga, NA Pinto,Torres-Rodriguez, P., GM Luque, A Romarowski, N Gilio,Trevino, C. L. ,A.Darszon , MG Buffone (2017). Role of NBC cotransporter in the PKA-dependent regulation of membrane potential during human sperm capacitation. Gordon Research Conferences: Fertilization & Activation of Development, GRC. Holderness NH, United States.

5. Carlos Escalera Gallardo, Claudia Lydia Treviño Santa Cruz (2017). Efecto de niveles crecientes de sustitución de harina de chaya (Cnidoscolus chayamansa) en la estabilidad de alimentos isoproteicos de uso acuícola. 12º Congreso Estatal de Ciencia, Tecnología e Innovación y el Sexto Encuentro de Jóvenes Investigadores del Estado de Michoacán. Morelia, Michoacán México.

6.Karla Lisette Andrade López, Julio César Chávez Zamora, Paulina Torres Rodríguez, Claudia Lydia Treviño Santa Cruz e Ignacio López-González (2017). Subcellular localization of Zip3 and ZnT3 Zinc transporters in mouse spermatogenic cells. Emerging Concepts in Ion Channels Biophysics, Biophysical Society, México City.

7.Berrios CI, Torres-Rodríguez P, Jorquera RA, Cortez C, Díaz PR, García MA, Nualart 2, Treviño CL and Reyes JG (2018 July 29-August 3). Fluorescent glucose analog uptake and GLUT1-MCT1 distribution in rat seminiferous tubules. Gordon Research Conferences: Mammalian Reproduction. Tuscany, Italia.

8. Treviño CL, Matamoros-Volante A and Mata-Martínez E. (2018). Calcium Oscillations: A Mechanism to prevent the Acrosome Reaction. XXIX Reunión de la Sociedad Chilena de Reproducción y Desarrollo,Concon Chile (septiembre 5 -9).

9.Berrios CI, Torres-Rodríguez P, Cortez C, Garcia MA, Nualart F, Treviño CL and Reyes JG (2018). Fluorescent glucose analog uptake and GLUT1/MCT1 distribution in rat. XXIX Reunión de la Sociedad Chilena de Reproducción y Desarrollo, Concon Chile (septiembre 5 -9).

10.Chávez-Tinoco Marco Antonio, Carlos Escalera-Gallardo, Treviño-Santa Cruz Claudia Lydia, Moncayo-Estrada Rodrigo, Gudiño-sosa Luis Fernando (2018). Efectos sobre la calidad del agua en sistemas de acuicultura derivados de alimentos acuícolas sostenibles con inclusión de una planta nativa Cnidoscolus chayamansa y una especie invasora H. plecostomus. IV Congreso Nacional de Fauna Nativa en Ambientes Antropizados. Juriquilla, Querétaro (septiembre 2018).

11.Castillo-Viveros, V., Torres-Rodríguez, P., Darszon, A., Buffone, M. G., & Treviño, C.L (Noviembre, 2018). Actin cytoskeleton dynamics during human sperm capacitation. Sesión de carteles en el XXXII Congreso Nacional de Bioquímica, Ixtapa, Zihuatanejo.

12.Arturo Matamoros-Volante & Claudia L. Treviño (noviembre 2018). Multi-protein regulation of intracellular pH during human sperm capacitation. Sesión oral en el XXXII Congreso Nacional de Bioquímica, Ixtapa, Zihuatanejo.

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13.Mariana Beatriz Olivares Urbano, Arturo Matamoros Volante, Paulina Torres Rodríguez, Alberto Darszon and Claudia L. Treviño Santa Cruz. Image-based flow cytometry as a tool to study rheotaxis in human spermatozoa. Sesión de carteles en el XXXII Congreso Nacional de Bioquímica, Ixtapa, Zihuatanejo.

Público en General

1. Arturo Matamoros y Claudia Treviño (2018). Divide y vencerás, como analizar

miles de imágenes de espermatozoides.

Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de

Biotecnología de la UNAM, 13, 3-5.

2. Diciembre 1o, 2017. Feria de la Ciencias y Humanidades. Museo Universum

Ciudad Universitaria ¿Cuál es tu sabor favorito?

3. Programa de Radio IMRyT “El ojo de la mosca” Cuernavaca Morelos. Entrevista sobre el posgrado en Ciencias Bioquímicas. (Una entrevista por mes en 2017 y 2018).

4. Octubre 26, 2018. Feria de la Ciencias y Humanidades. Museo Universum Ciudad Universitaria. El increíble viaje del espermatozoide.

Donativos 2016-2017 *Donativo CONACyT Fronteras de la Ciencia No. 71, Co responsable 2016-2018 *PAPIIT/DGAPA IN203116, Responsable 2019-2020 *PAPIIT/DGAPA IN202519, Responsable Título de los carteles:

1. Castillo-Viveros, V., Torres-Rodríguez, P., Darszon, A., Buffone, M. G., & Treviño, C.L. Dinámica del citoesqueleto de actina durante la capacitación del espermatozoide de humano.

2. Mariana Beatriz Olivares Urbano, Arturo Matamoros Volante, Paulina Torres Rodríguez, Alberto Darszon and Claudia L. Treviño Santa Cruz. Microscopía de flujo como una herramienta para estudiar la reotaxis en el espermatozoide de humano.

3. Julissa Solís Salgado, Julio César Chávez Zamora y Claudia L. Treviño Santa Cruz. Uso del aclarado óptico de tejidos para la visualización de la estructura subcelular del sistema reproductor en ratón.

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Dra. Guadalupe Espín Ocampo Departamento de Microbiología Molecular, IBT-UNAM. “Producción de polímeros y diferenciación en Azotobacter vinelandii” Resumen Azotobacter vinelandii es una bacteria que sufre un proceso de diferenciación para formar quistes resistentes a la desecación y produce los polímeros: alginatos, polihídroxibutirato (PHB), y 5-n-alquilresorcinoles (AR). Estos tres polímeros están presentes en los quistes maduros. En mi grupo estudiamos los mecanismos que regulan la expresión de genes implicados en la formación de quistes (Chowdhury-Paul et al 2018, Rordiguez-Salazar et al 2017) y la síntesis modificación y degradación de estos polímeros, con el objetivo de generar conocimiento que pueda ser útil en el diseño y construcción de cepas para la producción industrial de alginatos y de PHB. Estudiamos sistemas de regulación que controlan la expresión de los genes implicados en estos procesos que incluyen a) sistemas globales como el sistema de regulación post-transcripcional GacS-GacA-Rsm (Bedoya-Pérez et al 2018); el sistema PTS-Ntr y el factor sigma alternativo RpoS (Trejo et al 2017, Muriel-Millán et al 2017, Moreno et al 2018); y el sistema de regulación CbrB-CbrA-Crc que controla la represión catabólica por carbono a nivel post-transcripcional (Quiroz-Rocha et al 2017, 2017a, Martínez-Valenzuela et al 2018). Dos de los reguladores de estos procesos: RsmA y PtsN (EIIANtr) son efectores negativos. Este conocimiento nos permitió construir las mutantes ptsN (OPN) y rsmA-ptsN (OPNA), que han sido evaluadas para la producción de PHB en diferentes medios y condiciones de cultivo en colaboración con Carlos Peña (Castillo et al 2017, Millán et al 2017, García et al 2018, Castillo et al 2018). Respecto al PHB, estamos construyendo cepas de A. vinelandii capaces de sintetizar copolímeros PHAs. Además, estudiamos la biogénesis y composición de los gránulos de PHB así como su degradación. Respecto a la degradación del PHB A. vinelandii posee 7 genes que codifican para posibles PHB depolimerasas: PhbZ1-7. PhbZ1 se encuentra asociada a los gránulos, y una mutante phbZ1- está afectada en degradación por lo que produce un polímero con un peso molecular alto e uniforme (Adaya et al 2018). OprI una lipoproteína de la membrana externa que también se encuentra asociada a gránulos, se requiere para una óptima producción de PHB y afecta el fenotipo de los gránulos (Muriel-Millán et al Sometido) Recientemente hemos encontrado que el enquistamiento, y la síntesis de polímeros también son regulados por molécula reguladoras globales como c-di-GMP) y el (p)ppGpp. En l c-di-GMP sintetizado/degradado por diguanilato ciclasas. A. vinelandii. tiene 23 Una de ellas MucG, está implicada en la síntesis y peso molecular del alginato

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(Ahumada-Manuel et al 2017) y otra denominada MucR es necesaria para el enquistamiento. El (p)ppGpp es sintetizado por las proteínas RelA y sintetizado/degradado por SpoT. El fenotipo de mutantes en relA y/o spoT indica (p)ppGpp inhibe degradación de PHB. SsrA es un RNA no codificante que participa en rescate de ribosomas atascados. En A. vinelandii una mutante en ssrA está afectada en la degradación del PHB y posiblemente en la síntesis de (p)ppGpp. Integrantes del Grupo Investigadores: Cinthia Nuñez y Daniel Segura Tecnicos Academicos: Josefina Guzman y Soledad Moreno Posdoctorado: Alma Reyes González, Holjes Salgado Lugo (D. Segura) Estudiantes Licenciatura: Karen Ameyally Rodriguez Martínez* (G. Espin) Andrea Sánchez Arroyo, Andrea Viridiana Moyao Mejía, Fernando Loyola Martínez, Frida Shiadani López Aragón (D. Segura) Miriam Citlalli Gonzaga Perez, Victor Vicente Barrios Rafael (C. Nuñez) Maestría: Ricardo Javier Farrera Muro, Cristian Camilo Ortíz Vasco, Mariana López Valdez (G. Espin) Jessica Ruiz Escobedo, Gabriela Morales Flores, Thalía Barrientos Millán (D. Segura) Doctorado: Selma Julieta Rodriguez*, Leidy Bedoya Perez (G. Espin) Libertad Adaya García*, Claudia Velázquez Sánchez* (D. Segura )- Elva Yadira Quiroz Rocha*, Marcela Martinez Valenzuela; Leonel Ahumada Manuel; Iliana Chantal Martínez Ortiz; C. Nuñez Publicaciones 1. Trejo A., Moreno S., Cocotl M., Espin G. GacA regulates the PTSNtr–dependent control of cyst formation in Azotobacter vinelandii. FEMS Microbiology Letters 2017. Jan;364(2). pii: fnw278. doi: 10.1093/femsle/fnw278. 2. Ahumada-Manuel CL, Guzmán, J., Peña, C., Quiroz-Rocha, E., Espín G., Núñez C. The signaling protein MucG negatively affects the production and the molecular mass of the alginate in Azotobacter vinelandii. Appl Microbiol Biotechnol. 2017 Feb;101(4):1521-1534. doi: 10.1007/s00253-016-7931-8. 3. Castillo,T. Flores C, Segura,D. Espin,G. Sanguino,J. Cabrera,E. Barreto,J. Diaz-Barrera,A. Pena,C. 2017. Production of polyhydroxybutyrate (PHB) of high and ultra high molecular weight by Azotobacter vinelandii in batch and fed-batch cultures. Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 92, 1809-1816. 4. Muriel-Millan L. F., Moreno S., Gallegos R., Espín, G. Unphosphorylated EIIANtr induces ClpAP-mediated degradation of RpoS in Azotobacter vinelandii

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Molecular Microbiology, 2017. Apr;104(2):197-211. doi: 10.1111/mmi.13621 5. Rodriguez-Salazar J, Moreno S, Espín G. LEA Proteins are involved in cyst desiccation resistance and other abiotic stresses in Azotobacter vinelandii Cell Stress and Chaperones 2017 May;22(3):397-408. doi: 10.1007/s12192-017-0781-1 6. Quiróz-Rocha E, Moreno R, Hernández-Ortíz A, Fragoso-Jimenez JC, Guzmán J, Espín G, Rojo F, and Núñez C. Glucose uptake in Azotobacter vinelandii occurs through a GluP transporter that is under the control of the CbrA/CbrB and Hfq-Crc systems Scientific Reports 2017a Apr 12;7(1):858. doi: 10.1038/s41598-017-00980-5. 7. Quiróz-Rocha E, Bonilla-Badia F, García-Aguilar V, Lopez-Pliego L, Serrano-Roman J, Cocotl-Yañez M, Guzmán J, Ahumada-Manuel CL, Muriel-Millan LF, Castañeda M, Espín G and Núñez C. The two-component system CbrA/CbrB controls the production of alginate in Azotobacter vinelandii. Microbiology, 2017b Jul;163(7):1105-1115. doi: 10.1099/mic.0.000457 8. Romero-Ramírez, Y., Hernández-Flores, G., Rodríguez-Barrera, M. A., Segura, D., Martinez-Galero, N. X., Toribio-Jimenez, J., Castellanos Escamilla, M., Hernandez-Eligio, J. A. 2017. Evaluation of polyhydroxyalkanoates producing bacteria isolated from soils with wastes of Cocos nucifera. Revista Internacional de Contaminacion Ambiental, 33, 115-123 9. Cruz-Rabadan JS, Miranda-Rios J., Espin-Ocampo G., Mendez-Tovar LJ., Maya-Pineda H., Hernandez-Hernandez F Non-Coding RNAs are Differentially Expressed by Nocardia brasiliensis in Vitro and in Experimental Actinomycetoma. The Open Microbiology Journal, 2017 11, 112-125 DOI: 10.2174/1874285801711010112 10. Millan M, Salazar M, Segura D, Castillo T, Diaz-Barrera A, Peña C. Molecular mass of Poly-3-hydroxybutyrate (P3HB) produced by Azotobacter vinelandii is influenced by the polymer content in the inoculum Journal of Biotechnology, 2017, 259, 50-55. 11. Adaya L, Millán M, Peña C, Jendrossek D, Espín G, Tinoco R, Guzmán J, Pfeiffer

D, and Segura D. Inactivation of an intracellular poly-3-hydroxybutyrate depolymerase of Azotobacter vinelandii allows to obtain a polymer of uniform high molecular Appl Microbiol Biotechnol. 2018 Mar;102(6):2693-2707. doi: 10.1007/s00253-018-8806-y. 12. Chowdhury-Paul S, Pando-Robles V, Jiménez-Jacinto V, Segura S, Espín G, and Nuñez C. Proteomic Analysis Revealed Proteins Induced upon Azotobacter vinelandii Encystment. J Proteomics. 2018 Mar 29. pii: S1874-3919(18)30132-5. doi: 10.1016/j.jprot.2018.03.031. 13. Bedoya-Pérez LP, Muriel-Millán LF, Moreno S, Quiroz-Rocha E, Rivera-Gómez N, Espín G.

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The pyrophosphohydrolase RppH is involved in the control of RsmA/CsrA expression in Azotobacter vinelandii and Escherichia coli Microbiological Research 2018. 214: 91-100 14. Moreno S, Ertesvåg H, Valla S, Núñez C, Espin G, Cocotl-Yañez M. RpoS controls the expression and the transport of the AlgE1-7 epimerases in Azotobacter vinelandii. FEMS Microbiology Letters. August 30, 2018 15. López-Pliego L, García-Ramírez L, Cruz-Gómez EA, Domínguez-Ojeda P, López-Pastrana A, Fuentes-Ramírez LE, Núñez C, Castañeda M. 2018. Transcriptional Study of the RsmZ-sRNAs and Their Relationship to the Biosynthesis of Alginate and Alkylresorcinols in Azotobacter vinelandii. Mol Biotechnol. doi: 10.1007/s12033-018-0102-7. 6) 16. Díaz-Pérez AL, Núñez C, Meza Carmen V, Campos-García J. The expression of the genes involved in leucine catabolism of Pseudomonas aeruginosa is controlled by the transcriptional regulator LiuR and by the CbrAB/Crc system. 2018. Res Microbiol. 169(6):324-334. 17. Garcia,A. Ferrer,P. Albiol,J. Castillo,T. Segura,D. Pena,C. 2018. Metabolic flux analysis and the NAD(P)H/NAD(P)(+) ratios in chemostat cultures of Azotobacter vinelandii Microbial Cell Factories, 17, 10. 18. Castillo,T. Lopez,I. Flores,C. Segura,D. Garcia,A. Galindo,E. Pena,C. 2018. Oxygen uptake rate in alginate producer (algU+) and non-producer (algU-) strains of Azotobacter vinelandii under nitrogen-fixation conditions Journal of Applied Microbiology, 125, 181-1 19. Martínez-Valenzuela M, Guzmán J, Moreno S, Ahumada-Manuel L, Espín G and Núñez C. Expression of the sRNAs CrcZ and CrcY modulate the Strength of Carbon Catabolite Repression under diazotrophic or non-diazotrophic growing conditions in Azotobacter vinelandii. PlosOne aceptado noviembre 2018. Sometidos Moreno S, Castellanos M, Bedoya-Pérez L P, Canales P, Espín G, and Muriel-Millán LF. Outer membrane protein I is associated to polyhydroxybutyrate granules and is necessary for the polymer accumulation in Azotobacter vinelandii Microbiology Alumnos Graduados - LICENCIATURA En Biología, Facultad de Ciencias UNAM. Junio 22, 2018 Caracterización del gen Avin08930 y su papel en la sintesis de polihidrodibutirato y alquilresorcinoles en Azotobacter vinelandii Karen Ameyally Rodriguez Martínez. número de cuenta 310211158. G. Espin En Ingeniería en Nanotecnología, Universidad Tecnológica Emiliano Zapata del Estado de Morelos 15 de Junio del 2018

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Análisis mecánico del polihidroxibutirato (PHB) biosintetizado a partir de una cepa mutante de Azotobacter vinelandii, para su utilización en impresión 3D. D. Segura Andrea Sánchez Arroyo. En Ingeniería en Biotecnología, Universidad Politécnica del Estado de Morelos, 2 de Julio del 2018 Análisis del gen Avin33500 y su implicación en la degradación de Polihidoxibutirato. Andrea Viridiana Moyao Mejía. DOCTORADO Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Agosto 2017. Titulo: Estudio de la Función del Sistema de Dos Componentes CbrA/CbrB en la Síntesis de Alginato y en la Represión Catabólica por Carbono en Azotobacter vinelandii. Elva Y. Quiroz Rocha C. Nuñez Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM Diciembre 7, 2017 Genes lea1 y lea2 de A. vinelandii y su papel en la toleranciaa la desecación y otros tipos de estrés Selma Julieta Rodriguez Salazar. G. Espin Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Junio 12, 2018 Regulación postranscripcional de la expresión de rsmA/csrA por la RNA pirofosfohidrolasa RppH en Azotobacter vinelandii y en Escherichia coli Leidy Patricia Bedoya Perez. G. Espin Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Agosto del 2017 Estudio de la Función del Sistema de Dos Componentes CbrA/CbrB en la Síntesis de Alginato y en la Represión Catabólica por Carbono en Azotobacter vinelandii Elva Yadira Quiroz Rocha Participación en docencia Taller: LA BIOLOGÍA A PARTIR DE LAS BIOMOLÉCULAS; NUEVOS PARADIGMAS Y APLICACIONES. Licenciatura en Biologia Facultad de Ciencias Responsable: Dr. José Luis Puente. Semestre 2016-2. 6 horas (noviembre 18 y diciembre 1, 2017), Semestre 2016-2. 6 horas (marzo 6 y 9, 2018), Semestre 2016-2. 6 horas (septiembre 25 y 28, 2018) Tema: Genética molecular de la diferenciación y la biosíntesis de polímeros en A. vinelandii G.Espin Profesor invitado en el curso de posgrado: Fisiología Bacteriana (Traducción), coordinado por el Dr. Michael F. Dunn, con sede en el Centro de Ciencias Genómicas. 3 horas marzo, 2018. G. Espin Participación en el curso de Bioquímica. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Semestres: 2017-2 (Marzo 2017); 2018-1 (Septiembre 2017); 2018-2 (Marzo 2018); 2019-1 (Septiembre 2018). 12h/semestre. D. Segura

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Participación en el tópico EMPRENDIMIENTO EN EL CAMPO DE LA BIOTECNOLOGÍA. Maestría en Ciencias Bioquímicas.Semestres: 2018-1 (Septiembre 2017); 2019-1 (Septiembre 2018). 3h/semestre. D. Segura Tópico selecto titulado: “Mecanismos de Regulación de la expresión Génica en Bacterias. Responsable. Posgrado en Ciencias Bioquímicas. IBT, UNAM. De Febrero a Junio del 2017. 80 h. De Febrero a Junio del 2018. 80 h C. Nuñez Curso de Biología Molecular. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Institución: Instituto de Biotecnología. Número de horas impartidas: 9. Abril del 2018. C. Nuñez 2) Curso de Biología Molecular. Maestría en Ciencias Bioquímicas. Institución: Instituto de Biotecnología. Numero de horas impartidas: 9. Abril del 2017. C. Nuñez Divulgación Conferencia “Contaminación ambiental y Bacterias que producen Plasticos Biodegradables ”Colegio de Ciencias y Humanidades Plantel Sur 17 abril 2017. G. Espin Conferencia “Bacterias que producen Plasticos Biodegradables” 3o día de Puertas Abiertas del Instituto de Biotecnología 20 abril 2018. G. Espin Entrevista Dr. Gerardo Abreu Pederzini, Universidad de Kent, UK. 20 marzo, 2018. G. Espin Participación Evento de Puertas Abiertas. Comité Organizador. Instituto de Biotecnología, UNAM. Marzo 2018. C. Nuñez Artículo de Divulgación: Entendiendo como una bacteria del suelo selecciona su alimento para producir biopolímeros. Revista Biotecnología en Movimiento. Abril 2018. pg., 14-16. C. Nuñez Conferencia: El Potencial Biotecnológico de Azotobacter vinelandii. Dirigida a comunidad estudiantil en Visitas Guiadas. Instituto de Biotecnología. Enero 24 del 2018; Septiembre 2018. C. Nuñez DONATIVOS CONACyT 255212 Solicitud 2015. 2019Control de la síntesis de polímeros por la proteína Nudix en Azotobacter vinelandii. 1496000.00 G. Espin PAPIIT-207017 Control de la síntesis de polímeros por vías de regulación encabezadas por elactivador transcripcional GacA en Azotobacter vinelandii. Enero 2017-Dic2019 $777114.00. G. Espin

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Proyecto PAPIIT, UNAM, IT200415: Establecimiento de condiciones de cultivo en bio-reactores de cepas de Azotobacter vinelandii modificadas genéticamente para la producción de plásticos biodegradables. D. Segura Proyecto CONACyT 255158, Fondo Ciencia Básica: Estudio de la degradación (movilización) del polímero polihidroxibutirato en Azotobacter vinelandii y su regulación genética. D. Segura. Proyecto PAPIIT (IN204818). Efecto de la proteína señalizadora MucG sobre las pozas de c-di-GMP y su relación con la producción de alginato en Azotobacter vinelandii. Duración 3 años: Enero del 2018- Diciembre del 2020. Monto: $720,000. C. Nuñez. Proyecto CONACyT CB-2014 (240095). Estudio del Mecanismo de Regulación de la Represión Catabólica por Carbono y de la Producción de los Polímeros Alginato y PHB por el Sistema CbrA/CbrB-Crc en Azotobacter vinelandii. Duración 3 años: Mayo 2015- Mayo 2018. Monto: $1,550,000. C. Nuñez Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo. Título: Estudio del sistema de degradación (movilización) del bioplástico polihidroxibutirato (PHB) en la bacteria Azotobacter vinelandii. Autores: Holjes Salgado, Josefina Guzmán, Soledad Moreno, Libertad Adaya, Jessica Ruiz, Thalía Barrientos, Alma Reyes, Andrea Moyao, Guadalupe Espín, Carlos Peña y Daniel Segura. Titulo: The c-di-GMP protein MucR is necessary for cyst formation but not for alginate synthesis in Azotobacter vinelandii. Autores: Iliana Chantal Martínez, Josefina Guzmán, Soledad Moreno, Miguel Cocotl, Guadalupe Espín y Cinthia Nuñez.

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Dr. Enrique Morett Sánchez Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, IBT-UNAM

“Genómica de poblaciones indígenas mexicanas” Resumen Nuestro trabajo reciente se ha enfocado en el estudio y caracterización funcional de la variación genómica de diversas poblaciones indígenas del país, que incluyen representantes de todas las zonas geográficas del territorio nacional. Hemos secuenciado el genoma completo de más de 100 individuos seleccionados por pertenecer a sus respectivas comunidades por más de tres generaciones y hablar la lengua nativa. Con los datos de genoma completo llevamos a cabo estudios de ancestría global y local y encontramos que más del 15% tenían menos de 85% ancestría indígena, a pesar de haber cumplido con los criterios anteriores, incluido un individuo con menos de 50% de ancestría amerindia. Estos individuos ya no fueron considerados para el resto de los análisis de frecuencias alélicas. Interesantemente, dos individuos presentaron cromosoma Y de origen europeo, a pesar de tener más de 92% del genoma amerindio. Respecto a la mitocondria, todos, excepto cuatro individuos presentaron haplotipos amerindios, el resto europeos y coincidieron con los que presentaron ancestría amerindia menor al 85%. Una característica relevante observada en todas las poblaciones es que presentaron haplotipos conservados más largos que el promedio de poblaciones de otros continentes, coincidente con el hecho de que nuestros estudios demográficos indican que las poblaciones tuvieron un número muy limitado de individuos hasta antes del desarrollo de la agricultura. Respecto a las relaciones entre las diferentes poblaciones, confirmamos el claro agrupamiento por región, siendo el norte del país donde se encuentran los grupos más relacionados, siguiendo el sur y finalmente el centro, donde los diferentes grupos presentan clara mezcla genética que precede a la conquista española. La diversidad observada en este conjunto de individuos fue de aproximadamente 3.8 millones de variantes individuales respecto al genoma de referencia, representando en conjunto cerca de 11 millones de variantes, incluidas variantes de un nucleótido, indeles cortos, deleciones y duplicaciones génicas. De estas variantes, seleccionamos aquellas altamente frecuentes en estas poblaciones y poco frecuentes en otras poblaciones con el fin de obtener marcadores de ancestría y con relevancia funcional o fenotípica. Se presentarán algunas variantes en regiones codificantes y regulatorias (regiones promotoras y enhancers) que consideramos de relevancia. De particular interés fue el estudio de la variación en los microRNAs: encontramos más de 400 variantes en los microRNAs maduros y, coincidiendo con su gran funcionalidad, la región “seed” presentó el menor grado de variación.

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Este trabajo en su conjunto nos ha permitido una muy detallada descripción de la variación amerindia en nuestro país y la identificación de variantes con alta frecuencia que pueden tener impacto funcional con interés biomédico. Integrantes del grupo: Enrique Morett. Investigador Líder. Israel Aguilar. Estudiante de Doctorado. Ram Aguilar. Estudiante de Licenciatura. Judith Ballesteros. Estudiante de Licenciatura. Publicaciones: Artículos sometidos: Cadmium pre-exposition triggers the polyphosphate metabolism in acetate-grown Methanosarcina acetivorans. Elizabeth Lira-Silva1, Kasia González-Sánchez1, Violeta Larios Serrato,3, Diana Lucía Mendoza-Monzoy 3, Fernando Pérez-Villatoro2,3, Enrique Morett2, Rafael Moreno-Sánchez1 and Ricardo Jasso-Chávez1, *. Characterization and genomic analysis of Klebsiella pneumoniae AqsCr, a Cr(VI)-reducing and heavy metal resistant strain isolated from a chromium polluted site. Paloma Lara1, Fernando Riveros-Mckay1,3,4, Leticia Vega1, Enrique Morett1,2, Katy Juárez1* Participación en docencia: Genómica Humana Licenciatura en Ciencias Genómicas. Enero-Mayo 2017. Genómica Humana Licenciatura en Ciencias Genómicas. Enero-Mayo 2018. Biología Molecular Maestría en Ciencias Bioquímicas Módulo de evolución molecular. Cuersos 2017 y 2018. Curso Introducción a la Medicina Genómica INMEGEN Tema: Diversidad Genética en las Poblaciones Humanas Curso en línea. 2018. Divulgación:

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En Entrevista/ El genoma del mexicano. Tele con Ciencia. Agencia Informativa Conacyt. 31 may. 2016 https://www.youtube.com/watch?v=aBMZmrjuDSQ. En Entrevista/ La Medicina Genómica del Futuro. Tele con Ciencia. Agencia Informativa Conacyt. https://www.youtube.com/watch?v=S5FcOIPyp-E. En Entrevista/ Genómica de Poblaciones. Tele con Ciencia. Agencia Informativa Conacyt. 25 nov. 2016 https://www.youtube.com/watch?v=iObUxRvuXjM. Programa 1. La Medicina Genómica. "¿De qué estamos hechos?", una producción del Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN) en conjunto con la Dirección General de Televisión Educativa de la SEP (DGTVE). 2016. https://www.youtube.com/watch?v=8Bw4RGiVR0k Programa 14. La Medicina Genómica a futuro. "¿De qué estamos hechos?", una producción del Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN) en conjunto con la Dirección General de Televisión Educativa de la SEP (DGTVE). https://www.youtube.com/watch?v=Tvqd693oDx4. 2016. Programa de TV Los observadores. TV Azteca 18 febrero de 2017. http://www.aztecatrece.com/observadores/capitulos/capitulos/dr-juan-enrique-morett-dir-de-investigacion-instituto-nacional-de-medicina-genomica/370486. Serie de televisión “El Show del Dr. Gecko”. Asesor Científico de la serie, 10 Capítulos. Coordinador del Capítulo 10. https://www.youtube.com/watch?v=SGTOJ_PvZgQ 2017-2018. Conferencia “Gernómica Humana: Ciencia, Cultura y Diversión”. Museo Laberinto de Ciencias y Artes. San Luis Potosí, SLP. 13 de Enero de 2018. Entrevista revista Contenido Medicina Genómica y Bioética. Dic. 2018.

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Dr. Enrique Reynaud Garza Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, IBT-UNAM “Neurodesarrollo y Parkinson en Drosophila melanogaster” Resumen: De las grandes preguntas científicas, una de las más importantes y complejas es: ¿Cuáles son los mecanismos genéticos y moleculares que controlan el desarrollo, funcionamiento y degeneración del sistema nervioso de los animales superiores? Nosotros atacamos esta pregunta aprovechando el altísimo grado de conservación a nivel genético y molecular que existe entre el modelo clásico para el estudio del desarrollo, Drosophila melanogaster y el resto de los animales, incluidos los humanos. Mi grupo se enfoca principalmente en dos líneas de investigación. Una de ellas consiste en el estudio de las bases genéticas y moleculares del mal de Parkinson. Para esto, expresamos a las proteínas involucradas en la aparición de Parkinson familiar α-sinucleína y sinfilina en el circuito dopaminérgico de moscas adultas lo que nos permite estudiar el efecto neurotóxico de la expresión de estas proteínas y evaluar el efecto de factores genéticos y ambientales que modifican esta neurotoxocidad. En esta ocasión aprovecharé para presentarles el efecto modulador que tiene en éste modelo de neurodegeneración la nicotina, la droga de uso recreativo más peligrosa y común. La otra línea de investigación de mi grupo es la búsqueda e identificación de factores genéticos que determinan el desarrollo y la arquitectura del sistema nervioso y por lo tanto afectan el comportamiento. El factor transcripcional “Escargot” pertenece a la familia de “Snail”, que son factores trasncripcionales con “zinc-fingers” involucrados en muchos procesos del desarrollo en todos los animales. Escargot contribuye al mantenimiento de la pluripontecialidad de las células madre, está involucrado en la morfogénesis embrionaria y tisular y es importantemente en el control de la diferenciación de los neuroblastos. Nosotros hemos descubierto que Escargot es un gen que tiene un papel central en el desarrollo de los órganos quimiosensoriales tanto los olfativos (antenas y palpos olfativos) como los gustativos (labelos y sencilas gustativas). Alteraciones de la dosis génica de Escargot lleva al desarrollo aberrante de los órganos sensoriales y cambia la identidad de las neuronas sensoriales, alterando la percepción olfativa y gustativa, así como al comportamiento. Por último, cabe mencionar que los estudios genéticos que desarrollamos en Drosophila nos ha permitido identificar genes de interés en la biología reproductiva de la garrapata Rhipicephalus microplus que tienen potencial de ser blancos para el control de este exoparásito que causa pérdidas de miles de millones de dólares al año a la industria ganadera.

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Integrantes del Grupo M.C. Rene Hernadez (Técnico Académico) Dr. Iván Sánchez (Técnico Académico) María del Carmen Muñoz (Laboratorista) Lourdes Cazadero (Auxiliar de laboratorio) Martin Alejandro Blancas (Auxiliar de laboratorio) M.C. Luis Angel Carvajal (Estudiante Doctorado) M.C. Ivan Fernandez (Estudiante Doctorado) Lic. Diego Alexander Zambrano (Estudiante Doctorado) Lic. Fernando Rosales (Estudiante Doctorado) Biol. Estefanía De Allende (Estudiante Maestría) Carmen Dominguez (Estudiante Licenciatura) Alba Yetlanezi Castillo (Estudiante Licenciatura) Luz Virginia Durán (Estudiante Licenciatura) Sayuri Hernández (Estudiante Licenciatura) Lic. José Andrés Niño (Estudiante Licenciatura) Aldo Emmanuel Pérez (Estudiante Licenctura) Alexa Karime Rojo (Estudiante Licenciatura) Publicaciones Raquel Cossío-Bayúgar, Estefan Miranda-Miranda, Manuel Fernández-Rubalcaba, Verónica Narváez Padilla and Enrique Reynaud* ADRENERGIC LIGANDS THAT BLOCK OVIPOSITION IN THE CATTLE TICK RHIPICEPHALUS MICROPLUS AFFECT OVARY CONTRACTION. Scientific Reports 5, Article number: 15109 (2015) doi:10.1038/srep15109 Iván Sanchez-Díaz, Fernando Rosales-Bravo, José Luis Reyes-Taboada, A Covarrubias, Verónica Narvaez-Padilla, Enrique Reynaud* THE ESG GENE IS INVOLVED IN NICOTINE SENSITIVITY IN DROSOPHILA MELANOGASTER. Plos One 2015 July DOI:10.1371/journal.pone.0133956 Bernardo Sachman-Ruiz, Verónica Narváez-Padilla and Enrique Reynaud* COMMERCIAL BOMBUS IMPATIENS AS RESERVOIRS OF EMERGING INFECTIOUS DISEASES IN CENTRAL MÉXICO. Biol. Inv. 2015 July 17(7);2043-2053 Alumnos Graduados Licenciatura: “Caracterización de alteraciones quimiosensoriales en un modelo para la enfermedade de Parkinson en Drosophila melanogaster” Estefanía de Allende Becerra. Tésis de licenciatura, Universidad Nacional Autónoma de México. Marzo 2018. Maestría

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“Efecto de la nicotina en un modelo de la enfermedad de Parkinson inducida por la expresión de α-Sinucleína y Sinfilina humanas en Drosophila melanogaster” Luis Angel Carvajal Oliveros. Maestría en ciencias Bioquímicas. Febrero 2017. “Registro electrofisiológico de la respuesta de neuronas gustativas de la probboscis de Drosophla melanogaster.” Miguel Ángel Cruz Urioso. Maestría en ciencia Bioquímicas. Noviembre 2018. Participación en docencia Participo activamente en los cursos de Bioquímica y Biología Molecular que se imparten en el Instituto de Biotecnología como parte del proyecto de posgrado en ciencias Bioquímicas. Así mismo participo en el Taller de IBT en la Facultad de ciencias de la UNAM. Divulgación Hormigas, terremotos y anarquía; la belleza de los sistemas auto-organizados. Enrique Reynaud. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM. 2018, 11, 29 El niño de la piel transgénica. Enrique Reynaud, Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM. 2018, 13, 27 Donativos Proyecto CONACyT (CB­2015­01) Efecto de la pérdida de función de las distintas subunidades del proteasoma en un modelo de mal de Parkinson. Proyecto DGAPA (PAPIIT) 2017 “Análisis transcriptómico de la diferenciación de los órganos sensoriales de Drosophila melanogaster” Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo. 1) Título: "Olfactory alterations in a Drosophila Parkinson´s disease model expressing α-synuclein".Autores: Estefanía De Allende Becerra y Enrique A. Reynaud Garza 2) Título: “Identification of genes relevant for the reproductive biology of the cattle tick R. microplus, thru differential transcriptome analysis” Autores: Aldo Emmanuel Pérez-Rivera, Raquel Cossio, Iván Sánchez, Verónica Narváez y Enrique Reynaud. 3) Título: "Role of the proteasome subunit Rpt2 in a Parkinson's disease” model" Autores: Iván Fernández-Cruz y Enrique Reynaud Garza 4) Título: “Alteration of the chemosensory system in Drosophila melanogaster due to the deficiency of the transcription factor Escargot”. Autores: Iván Sánchez, Fernando Rosales, Alba Castillo, René Hernández, Verónica Narváez y Enrique Reynaud.

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Dr. Alejandro Alagón Cano

Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, IBT-UNAM. “La Némesis de los Venenos de las Serpientes Mexicanas” Resumen Los venenos de las serpientes tienen tres funciones principales: defensa ante posibles predadores –reales o supuestos-, captura de presas y digestión de las mismas. La historia evolutiva de las serpientes modernas data desde la extinción de los dinosaurios, tiempo suficiente para que las serpientes verdaderamente venenosas hayan generado una pléyade de moléculas, mayormente de naturaleza peptídicas y protéicas, con múltiples funciones bioquímicas, biológicas y fisiopatológicas. En los venenos de los vipéridos (cascabeles, nauyacas y cantiles), la diversificación de funciones ha ocurrido principalmente en las familias de proteínas más abundantes: las fosfolipasas A2, las metaloproteasas dependientes de Zn2+, las serinoproteasas y, en algunos venenos, las crotaminas. En los venenos de los elápidos (coralillos), las fosfolipasas A2 y las toxinas de tres dedos (3FTx) son los componentes dominantes. Llevamos algunos años tratando de entender algunos de los venenos de serpientes mexicanas, incluyendo algunas al norte del Río Bravo, tanto desde un punto de vista puramente biológico como médico y aplicado a la cobertura de los antivenenos que se producen en nuestro país. Todas las especies de vipéridos que hemos estudiado, Bothrops asper, Agkistrodon bilineatus, Crotalus simus, C. culminatus, C. tzabcan, C. scutulatus, C. lepidus, C. aquilus, tres especies de Ophryacus, muestran grandes variaciones en sus componentes dependiendo de la localidad geográfica en que se colectan los especímenes y, en las especies que hemos podido estudiarlo, la edad de los mismos (cambios ontogénicos). Las diferencias más importantes en los venenos de coralillos, radican en la proporción de fosfolipasas neurotóxicas y las verdaderas 3FTx tóxicas, a mamíferos y a otros reptiles, culebras y lagartijas. Este conocimiento empieza a aplicarse en la preparación de las mezclas de inmunógenos utilizadas para inmunizar a los caballos que producen los plasmas hiperinmunes, la materia prima de los antivenenos actuales. Integrantes del Grupo actuales (2018). I. Personal Administrativo: Angélica Linares Labastida

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Ricardo Mondragón Cortes Manuela Ávila II. Técnicos Académicos: Alejandro Olvera Rodríguez Felipe Olvera Rodríguez Irving Giovanni Archundia Jiménez (por contrato) III. Investigadoras por contrato: Hilda Vázquez López Dayanira Paniagua Meza (hasta septiembre 2018) IV. Estudiantes de Doctorado: Edgar Enrique Neri Castro Melisa Benard Valle V. Estudiantes de Maestría: Sergio Bárcenas Arriaga Nicolás Elizalde Morales Oscar Aguayo Avalos Irene María Castillo Pérez José Roberto Ponce López Andrea Colis Torres Luis Fernando Losoya Uribe VI. Estudiantes de Licenciatura: Luis Ángel García Herrera Mitzi Guadalupe Amaro Ruiz VII: Servicio Social: Abril Areadna Lomeli Zavala VIII. Estancias Temporales (más de un mes): Juliana Choza Boyer (Lewis & Clark College, Portland, Oregon) Osiris Lizbeth García Maldonado (Universidad del Papaloapan, Tuxtepec, Oax) Eric Rivas Mercado (Universidad Autónoma de Aguascalientes) Gibrán Rodríguez Barrera (Benemérita Universidad Autónoma de Puebla) Miguel Borja (Universidad Juárez del Estado de Durango) Esau Flores Martínez (Universidad Juárez del Estado de Durango) Fernando Maurith Guerra Olvera (Centro de Investigación Científica y de Educación Superior de Ensenada, Baja California) Tania Corkidi Zajur (Facultad de Ciencias, UAEM) Publicaciones 2017-2018.

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Ontogenetic Change in the Venom of Mexican Black-Tailed Rattlesnakes (Crotalus molossus nigrescens) Miguel Borja, Edgar Neri-Castro, Rebeca Pérez-Morales, Jason L. Strickland, Roberto Ponce-López, Christopher L. Parkinson, Jorge Espinosa-Fematt, Jorge Sáenz-Mata, Esau Flores-Martínez, Alejandro Alagón and Gamaliel Castañeda-Gaytán. Toxins (Basel), 2018, 10, 501; doi:10.3390/toxins10120501. Neri-Castro E, Lomonte B, Valdés M, Ponce-López R, Bénard-Valle M, Borja M, Strickland JL, Jones JM, Grünwald C, Zamudio F, Alagón A. Venom characterization of the three species of Ophryacus and proteomic profiling of O. sphenophrys unveils Sphenotoxin, a novel Crotoxin-like heterodimeric β-neurotoxin. J Proteomics. 2018 Sep 8. pii: S1874-3919(18)30343-9. doi: 10.1016/j.jprot.2018.09.002. Guerrero-Garzón JF, Bénard-Valle M, Restano-Cassulini R, Zamudio F, Corzo G, Alagón A, Olvera-Rodríguez A. Cloning and sequencing of three-finger toxins from the venom glands of four Micrurus species from Mexico and heterologous expression of an alpha-neurotoxin from Micrurus diastema. Biochimie. 2018 Apr;147:114-121. doi: 10.1016/j.biochi.2018.01.006 Borja M, Neri-Castro E, Castañeda-Gaytán G, Strickland JL, Parkinson CL, Castañeda-Gaytán J, Ponce-López R, Lomonte B, Olvera-Rodríguez A, Alagón A, Pérez-Morales R. Biological and Proteolytic Variation in the Venom of Crotalus scutulatus scutulatus from Mexico. Toxins (Basel). 2018 Jan 8;10(1). pii: E35. doi: 10.3390/toxins10010035 Neri-Castro,E. Ponce-Lopez,R. 2018. Variación ontogénica en el veneno de Crotalus simus en México. Arido-Ciencia, 3, 42-47. Calcines-Cruz C, Olvera A, Castro-Acosta RM, Zavala G, Alagón A, Trujillo-Roldán MA, Valdez-Cruz NA. Recombinant-phospholipase A2 production and architecture of inclusion bodies are affected by pH in Escherichia coli. Int J Biol Macromol. 2018 Mar;108:826-836. doi: 10.1016/j.ijbiomac.2017.10.178. Dobson J, Yang DC, Op den Brouw B, Cochran C, Huynh T, Kurrupu S, Sánchez EE, Massey DJ, Baumann K, Jackson TNW, Nouwens A, Josh P, Neri-Castro E, Alagón A, Hodgson WC, Fry BG. Rattling the border wall: Pathophysiological implications of functional and proteomic venom variation between Mexican and US subspecies of the desert rattlesnake Crotalus scutulatus. Comp Biochem Physiol C Toxicol Pharmacol. 2018 Feb;205:62-69. doi: 10.1016/j.cbpc.2017.10.008. Epub 2017 Oct 24. Rivas E, Neri-Castro E, Bénard-Valle M, Hernánez-Dávila AI, Zamudio F, Alagón A. General characterization of the venoms from two species of rattlesnakes and an intergrade population (C. lepidus x aquilus) from Aguascalientes and Zacatecas, Mexico. Toxicon. 2017 Nov;138:191-195. doi: 10.1016/j.toxicon.2017.09.002. Valdez-Cruz NA, Reynoso-Cereceda GI, Pérez-Rodriguez S, Restrepo-Pineda S, González-Santana J, Olvera A, Zavala G, Alagón A, Trujillo-Roldán MA. Production of a recombinant phospholipase A2 in Escherichia coli using resonant acoustic mixing that improves oxygen transfer in shake flasks. Microb Cell Fact. 2017 Jul 25;16(1):129. doi: 10.1186/s12934-017-0746-1. Yang DC, Dobson J, Cochran C, Dashevsky D, Arbuckle K, Benard M, Boyer L, Alagón A, Hendrikx I, Hodgson WC, Fry BG. The Bold and the Beautiful: a Neurotoxicity Comparison of New World Coral Snakes in the Micruroides and

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Micrurus Genera and Relative Neutralization by Antivenom. Neurotox Res. 2017 Oct;32(3):487-495. doi: 10.1007/s12640-017-9771-4. Durban J, Sanz L, Trevisan-Silva D, Neri-Castro E, Alagón A, Calvete JJ. Integrated Venomics and Venom Gland Transcriptome Analysis of Juvenile and Adult Mexican Rattlesnakes Crotalus simus, C. tzabcan, and C. culminatus Revealed miRNA-modulated Ontogenetic Shifts. J Proteome Res. 2017 Sep 1;16(9):3370-3390. doi: 10.1021/acs.jproteome.7b00414. Hernández-Vargas MJ, Gil J, Lozano L, Pedraza-Escalona M, Ortiz E, Encarnación-Guevara S, Alagón A, Corzo G. Proteomic and transcriptomic analysis of saliva components from the hematophagous reduviid Triatoma pallidipennis. J Proteomics. 2017 Jun 6;162:30-39. doi: 10.1016/j.jprot.2017.04.022. Jáuregui-Zúñiga D, Pedraza-Escalona M, Espino-Solís GP, Quintero-Hernández V, Olvera-Rodríguez A, Díaz-Salinas MA, López S, Possani LD. Targeting antigens to Dec-205 on dendritic cells induces a higher immune response in chickens: Hemagglutinin of avian influenza virus example. Res Vet Sci. 2017 Apr;111:55-62. doi: 10.1016/j.rvsc.2016.12.002. de la Rosa G, Pastor N, Alagón A, Corzo G. Synthetic peptide antigens derived from long-chain alpha-neurotoxins: Immunogenicity effect against elapid venoms. Peptides. 2017 Feb;88:80-86. doi: 10.1016/j.peptides.2016.12.006. Alumnos Graduados. Licenciatura: José Roberto Ponce López. “Evaluación del nivel de reconocimiento y potencia neutralizante del suero de conejos hiperinmunizados con el veneno de Crotalus simus” Licenciatura en Biología FES-Iztacala, UNAM. 22 de febrero de 2018. Tutor: M. en C. Edgar Enrique Neri Castro. María Fernanda Hernández Aguas. “Cuantificación de veno completo y crotoxina de la Cascabel Neotropical (C. simus) en sangre de borregos envenenados experimentalmente”. Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 2 de Marzo de 2018. Tutor: Edgar Neri Castro.

Oscar Jesús Pérez Torres. “Clonación, Expresión y Caracterización de una - Neutotoxina presente en la Serpiente de Coral Micrurus browni”. Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 27 de Abril de 2018. Tutor: M. en C. Alejandro Olvera Rodríguez. Oscar Germán Jiménez Román. “Comparación de sueros hiperinmunes de equino y bovino contra el veneno de Agkistrodon bilineatus” Médico Veterinario Zootecnista. Universidad Autónoma del Estado de México. 6 de Marzo de 2018. Tutor: Dr. Alejandro Alagón Cano. Maestría: Mariel Teodora Valdés Arellanes. “Caracterización Bioquímica y actividades Biológicas del veneno de serpientes del género Ophyriacus” Maestría en Ciencias IPN. 22 de Enero de 2018. Tutores: M. en C. Edgar Enrique Neri Castro y Alejandro Alagón Cano.

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Luis Román Domínguez. “Aislamiento y caracterización de componentes con actividad edematizante presentes en el veneno de Agkistrodon bilineatus” Maestría en Medicina Molecular, UAEM 9 de Julio de 2018. Tutores: Drs. Vera Lucía Petricevich y Alejandro Alagón Cano. Barcenas Arriaga. “Caracterización bioquímica y biológica del veneno de Bothrops asper (Garman, 1884) de México”. Facultad de Ciencias, Maestría en Ciencias Biológicas, UNAM. 26 de Junio de 2018. Tutor: Alejandro Alagón Cano. Participación en Docencia: Instructor del 2º Curso de manejo y conservación de cocodrilos y reptiles venenosos Tonalá Chiapas, México. 10 al 14 de Abril de 2017. Edgar Enrique Neri Castro. Curso Interno de Bioseguridad “Bioseguridad para el manejo de animales venenosos, serpientes, arañas y alacranes”. 4 de Agosto de 2017. Edgar Enrique Neri Castro. Curso Interno de Bioseguridad “Bioseguridad para el manejo de animales venenosos, serpientes, arañas y alacranes”. 27 de Enero de 2017. Edgar Enrique Neri Castro. “2° Curso de Animales venenosos en México: Biología, clínica e investigación”. Coordinadores: Edgar Neri, Melisa Benard, Hilda Vázquez, Alejandro Alagón. IBt-UNAM. Cuernavaca, Morelos. 8 a 10 de agosto de 2018. Divulgación (incluyendo Congresos). El Aracnario del IBt, a cargo de la M. en C. Herlinda Clement Carretero, tuvo 648 visitantes y atendió, en ferias de ciencias y escuelas (aparte de las que se mencionan a continuación) alrededor de 600 personas. El Vivario del IBt junto con el Herpetario “Cantil”, fueron inaugurados el 29 de junio de 2018 por el Rector de la UNAM, Enrique Graue. Como verán abajo, al igual que el Aracnario, comienza a impactar a la sociedad. Caracterización inmunoquímica de los venenos de serpientes del género de Agkistrodon. Hilda Vázquez López, Luis Román Domínguez, Edgar Neri Castro, Melisa Benard Valle y Alejandro Alagón Cano. XVII Congreso Nacional de Biotecnología y Bioingeniería, Puerto Vallarta; Jalisco, México. 25 al 30 de junio de 2017. Antivenom Archeology. Irving Archundia, Dayanira Paniagua, Felipe Olvera, Anne Wertheimer, Alejandro Alagón, Leslie Boyer. XXXII Congreso Nacional de Bioquímica, 4-9 noviembre de 2018, Ixtapa, Guerrero. “Antivenenos para el mundo”. Ciclo de conferencias Premios Nacionales en la Unidad Cuajimalpa. Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Cuajimalpa. 22 de marzo de 2017, CDMX. Alejandro Alagón Cano. “Biotecnología de anticuerpos con énfasis de antivenenos”. Sociedad Estudiantil de Biotecnología y Bioingeniería. Universidad Anáhuac de Xalapa. 23 de marzo de 2017, Xalapa, Veracruz. Alejandro Alagón Cano. Conferencia Magistral: Venenos de Alacranes, arañas y Serpientes y antivenenos. Conferencias para Universitarios Impartidas por Premios Nacionales de Ciencias y Artes. 4 de abril de 2017. Emiliano Zapata, Morelos. Alejandro Alagón Cano.

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Exposición y muestra de Serpientes. Colegio Montesori de Tepoztlán. 22 de febrero de 2017. Tepoztlán, Morelos, México. Luis Román Domínguez. Visita guiada: Reptiles y su Importancia médica en México. Instituto de Biotecnología. 10 de marzo de 2017. Cuernavaca Morelos México. Melisa Benard Valle. Visita guiada: Reptiles y su Importancia médica en México. Instituto de Biotecnología. 17 de marzo de 2017. Cuernavaca, Morelos, México. Luis Román Domínguez. Taller: Serpientes, arañas y Alacranes. Escuela primaria de tiempo completo Ignacio Zaragoza. 4 de mayo de 2017. El Huixmi, Hidalgo México. Melisa Benard Valle. “Biotecnología de Antivenenos”. Semana Académica de la Universidad Tecnológica de Izúcar de Matamoros, 24 de mayo de 2017, Izúcar de Matamoros, Puebla. Alejandro Alagón Cano. “Arañas, serpientes y alacranes venenosos”. “Sábados en la Ciencia”. 27 de mayo de 2017. Centro Universitario UTEG, Guadalajara, Jal. Alejandro Alagón Cano. Exposición de animales ponzoñosos en el área de Jardín de niños- primaria- secundaria. Centro Educativo Americano. 3 de abril de 2017. Cuernavaca, Morelos. Edgar Enrique Neri Castro. Efectos del pH de cultivo en la produccióny agregaciónde una fosfolipasa A2 recombinante en Escherichia coli. Carlos Calcines-Cruz, M.Trujillo, R. Castro, A. Olvera, A. Alagon, A. N.Valdez. XVII Congreso Nacional Biotecnología y Bioingeniería, 25 a 30 de junio de 2017, Puerto Vallarta, Jalisco. Increased Osteolytic Bone Metastases from Breast Cancer in Mice. Arellano-Rodríguez, A, F. Olvera, P. Juárez, P. Fournier. EFF 2017 Forum on Metabolic Bone Diseases. 6 de septiembre de 2017, Denver, Colorado, USA. CD8+ T Cells Increase Osteolytic Bone Metastases from Breast Cancer in Mice. Arellano-Rodríguez, A, F. Olvera , P. Juárez, P. Fournier. American Society for Bone and Mineral Research Annual Meeting 2017. 8 a 11 de agosto de 2017. Denver, Colorado. “Venenos de Origen Animal y Antivenenos”. Alejandro Alagón. 5to. Encuentro de Jóvenes Investigadores del Estado de Morelos Secretaría de Innovación, Ciencia y Tecnología de Morelos, 10 de octubre de 2017, Cuernavaca, Morelos. CD8+ T Cells Increase Osteolytic Bone Metastases from Breast Cancer in Mice. Arellano-Rodríguez,A., F. Olvera,P. Juárez, P. Fournier. 4th International Meredith Gould Conference. 20 a 22 de Octubre de 2017, Ensenada, Baja California, México. “Venenos y antivenenos de serpiente. Secretaría de Innovación Ciencia y Tecnología. 26 de octubre de 2017. Cuernavaca, Morelos, México. Luis Román Domínguez. Los linfocitos T CD8+ incrementan la metástasis ósea de cáncer de mama en ráton. Arellano-Rodríguez, A, F. Olvera, P. Juárez , P. Fournier. 5to. Foro Estatal de Investigaciónen Salud. 27 de octubre de 2017. Mexicali, Baja California, México. Conferencia: 6to. Coloquio de divulgación sobre riqueza natural y sociedad “Colecciones vivas y ética para la conservación”. 15-16 de noviembre de 2017. Enrique Neri Castro. “Antivenenos”. Personal de PROFEPA. 4 de diciembre de 2017, Instituto de Biotecnología – UNAM, Cuernavaca, Morelos. Alejandro Alagón Cano.

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“La importancia médica en venenos de serpientes y arañas”. IX congreso de la ciencia del Colegio Diamantes Bilingüe. 23 de enero de 2018, Cuernavaca, Morelos, Melisa Benard Valle. “Antivenenos”. Estudiantes de 1er. semestre de Medicina, Facultad de Medicina-UAEM, Cuernavaca, Mor. 23 de marzo de 2018. Alejandro Alagón Cano. “Venenos de alacranes, arañas y serpientes”. Ciclo de Conferencias del Posgrado en Biodiversidad y Ecología, Facultad de Ciencias Biológicas de la Universidad Juárez del Estado de Durango. Alejandro Alagón Cano. “Desarrollo de antivenenos”. IV Simposio internacional de Ingeniería Biouímica. 31 de mayo de 2018, Centro Universitario de los Lagos, Universidad de Guadalajara, Jalisco, Melisa Benard Valle. “Antivenenos de Alacrán”. Primer Congreso de Bioprospección y Biotecnología. 1 de junio de 2018. UAEM, Cuernavaca, Mor. “Snakebites in Sub-Saharan Africa”. Emergency Medicine 2018. June 6-9, Centro Citibanamex, CDMX. Alejandro Alagón y J.-P. Chippaux. "Coral snake toxins: Implications of their mode of action on lethality" Congreso: "Snakebite: From Science to society", Leiden, Países Bajos en Junio de 2018. Melisa Bénard-Valle, Edgar Neri, Manuel Yañez and Alejandro Alagón. Stand en Convención “LatinZoo”. 18 y 19 de julio, 2018. WTC, CDMX, Edgar Neri, Melisa Benard Valle. “Papel del Sistema Linfático en la Absorción y Distribución de Venenos y Antivenenos”. 36o Congreso Nacional de Pediatría. 26 de julio de 2018, WTC-CDMX. Alejandro Alagón Cano. Antivenenos. Uso de modelos animales para su caracterización. 2do. Curso de Animales Venenosos en México. 9 de agosto de 2018, Instituto de Biotecnología – UNAM, Cuernavaca, Morelos. Alejandro Alagón Cano. Biotecnología de Antivenenos. XX Aniversario del Centro Multidisciplinario de Estudios en Biotecnología (CMEB). Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia. Universidad Michoacana de San Nicolás de Hidalgo. 23 de agosto de 2018. Morelia, Michocán. Alejandro Alagón Cano. “Biotecnología de anticuerpos terapéuticos y diagnósticos, y toxicología aplicada”. Curso de Biotecnología a alumnos licenciatura y posgrado de la UDLA-Quito, Ecuador. 3 de septiembre de 2018. IBt-UNAM. Hilda Vázquez, Felipe Olvera y Alejandro Alagón. Conferencia “Herpetofauna venenosa de México” y visita guiada. Alumnos de la Facultad de Medicina de la UAEM. 14 de septiembre de 2018, IBt-UNAM. Cuernavaca, Morelos, Edgar Neri, Melisa Benard. “Herpetofauna venenosa de México”, VI edición de la Feria de la Investigación Ocachi, 14 de septiembre de 2018, Escuela Ocachicualli, Cuernavaca, Morelos, Melisa Benard, Luis García. “Visita al Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos”. Plática y visita guiada al Herpetario a alumnos de la comunidad Montessori Hormé, 12 de septiembre de 2018. IBt-UNAM. Cuernavaca, Morelos, Melisa Benard. “Development of an Antivenom for Vipera and Macrovipera Bites of Western and Eastern Europe”. 19 EU-IST Congress, 22 a 26 de septiembre de 2018, Yerevan, Armenia. Alejandro Alagón, Irving Archundia, Raúl Soria y Leslie Boyer.

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“Combined animal and human data in support of effectiveness of antivenom against Micrurus fulvius neurotoxicity”. 19 EU-IST Congress, 22 a 26 de septiembre de 2018, Yerevan, Armenia. Leslie Boyer, Dayanira Paniagua y Alejandro Alagón. “Arañas, serpientes y alacranes venenosos”. 40° Ciclo de conferencias: Palabra de Ciencia, 5 de octubre de 2018, UAEMex, Toluca, Edo de México. Melisa Benard. “Arañas, serpientes y alacranes venenosos”. 40° Ciclo de conferencias: Palabra de Ciencia, 5 de octubre de 2018, Preparatoria oficial # 169, Toluca, Edo de México. Melisa Benard. Demostración de animales venenosos y elaboración de antivenenos de tercera generación. Fiesta de las ciencias y las humanidades. DGDC-UNAM. 27 de octubre de 2018, Universum, Ciudad Universitaria. Alejandro Olvera, Nicolás Elizalde, Roberto Ponce, Mitzi Amaro y Fernando Losoya. “Manejo de herpetofauna venenosa” a profesores. 30 de octubre de 2018. Universidad Mesoamericana, Cuernavaca, Morelos. Melisa Benard y Edgar Neri. "Evaluación de una alfa-neurotoxina como inmunógeno en la producción de sueros experimentales para el tratamiento de envenenamiento por coralillos." García Herrera Luis Angel, Benard Valle Melisa y Alagón Alejandro. XV Reunión Nacional de Herpetología. 5 a 8 de noviembre de 2018. Xalapa, Veracruz, "Variación en la letalidad de venenos de coralillos (Micrurus) al inhibir sus fosfolipasas A2 con pBPB." XV Reunión Nacional de Herpetología. Xalapa, Veracruz. Rodríguez Barrera Omar Gibran, García-Herrera Luis, Bénard Valle Melisa y Alagón Alejandro. Reunión Nacional de Herpetología. Xalapa, Veracruz, 5 a 8 de noviembre de 2018. Ganador del certamen de presentaciones orales. “Arañas, serpientes y alacranes venenosos”. Ciclo de conferencias, 33 años de Sábados en la Ciencia, 10 de noviembre de 2018, Museo de Antropología, Xalapa, Veracruz. Melisa Benard. Panel: “Biotecnología y su impacto en el sector salud” en el Foro: ¿Cómo alcanzar el desarrollo sostenible ante el cambio tecnológico acelerado?”. Secretaría de Relaciones Exteriores. 21 de noviembre de 2018. SER, CDMX. Alejandro Alagón Cano. “Antivenenos para el Mundo”. Ciclo de conferencias “Navegando con las Estrellas”, 23 de Noviembre de 2018, Planetario “Cha’an Ka’an”, Cozumel, Q. Roo. Melisa Benard. Donativos: $1,952,000.00 2015-2017. Otorgado por CONACyT. Proyecto: Caracterización funcionald de venenos de Agkistrodon, asi como la respuesta inmune en caballos a los mismos. $ 720,000.00 2018-2020. Otorgado por DGAPA-UNAM. Proyecto: Investigación de venenos de serpientes para el mejoramiento de antivenenos. $150,000.00 2018. Otorgado por CONACYT. Proyecto: Apoyo al 2do. Curso de Animales Venenosos. $ 580, 000.00 2018. Otorgado por Veteria SA de CV. Proyecto: Apoyo para la infraestructura del Herpetario “Cantil” del IBt. $ 61,600 USD. 2018. Contrato otorgado por licitación por el Center for Biologics Evaluation and Research (CBER) de la FDA. Equine Ebola Antibody Production.

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Carteles que presentará el grupo: "Neutralizing capacity of a hyperimmune sera from Crotalus durissus terrificus snake venom conjugates". Irene María Castillo Pérez, Alejandro Olvera Rodríguez, Irving Giovanni Archundia Jiménez, Melisa Benard Valle, Edgar Enrique Neri Castro, Hilda Vazquez Lopez, Felipe Olvera Rodriguez y Alejandro Alagón Cano. "Coral snake toxins: Implications of their mode of action on lethality". Melisa Bénard-Valle, Edgar Neri, Manuel Yañez and Alejandro Alagón. “Antivenom Archeology”. Irving Archundia, Dayanira Paniagua, Felipe Olvera, Anne Wertheimer, Alejandro Alagón, Leslie Boyer.

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Dr. Gerardo A. Corzo Burguete Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, IBT-UNAM “Neurotoxinas de animales ricas en puentes disulfuro: su aleatorio plegamiento y aplicaciones” Resumen

-neurotoxinas de venenos de elápidos. Son moléculas de naturaleza catiónica con masas moleculares de 6 a 7 kDa y un patrón de ocho o diez cisteínas muy conservado, los cuales forman cuatro o cinco puentes disulfuro, respectivamente

(de la Rosa et al., 2017). Las -neurotoxinas son las moléculas responsables de los síntomas neurotóxicos provocados por la mordedura de elápidos, pero por su tamaño, y a veces, por su poca concentración, estas no provocan una reacción humoral eficiente en animales resultando en baja generación de anticuerpos neutralizantes. Ligia Luz Corrales (investigadora en estancia) y Guillermo de la Rosa

(posdoc) expresaron una -neurotoxina, denominada neurotoxina consenso

(ScNtx), la cual representa a varias -neurotoxinas reportadas con actividades biológicas probadas, y que están presentes en venenos de elápidos provenientes de América, Asia y África (de la Rosa et al., 2017). La ScNtx recombinante se obtuvo de forma activa, plegada y generó anticuerpos en conejos y caballos. Interesantemente, los anticuerpos obtenidos con la ScNtx fueron neutralizantes de

-neurotoxinas simples, y de venenos completos de elápidos. Estos resultados dan

base a la elaboración de -neurotoxinas recombinantes a usarse como antígenos en la elaboración de anticuerpos neutralizantes contra el veneno de elápidos. β-neurotoxinas de venenos de alacranes americanos. Estas moléculas son también de naturaleza catiónica con masas moleculares de 7-8 kDa aproximadamente, y un patrón de ocho cisteínas muy conservado, los cuales forman cuatro puentes disulfuro (Obed, 2018). Las β-neurotoxinas de alacrán son una de las familias de moléculas responsables de los síntomas neurotóxicos provocados por la picadura de este arácnido en América. Un ejemplo es la β-neurotoxina CssII del veneno del alacrán mexicano Centruroides suffusus suffusus, la cual tiene como blanco principal el Nav1.6, y se ha logrado expresar y plegar correctamente. Otro ejemplo es la β-neurotoxina Ts1 del veneno del alacrán brasileño Tityus serrulatus, el cual es un poco mas promiscuo que la CssII, y tiene como blancos los Nav1.4, Nav1.5 y Nav1.6, pero desafortunadamente no hemos logrado plegarla correctamente. El trabajo que realizamos con estas neurotoxinas tiene dos objetivos; 1) determinar si algún dominio de la CssII puede favorecer el plegamiento de la Ts1; y 2) cual dominio de la β-neurotoxina CssII es responsable del reconocimiento al Nav1.6, o bien responsable de reconocer a otros subtipos de Nav. Por ahora varios dominios de la β-neurotoxina CssII fueron permutados a la Ts1, y las quimeras expresadas como variantes de la Ts1 con el fin de conocer el efecto de dichos dominios (Obed, 2018).

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Otros trabajos realizados en el periodo 2017-2018 involucran la expresión de neurotoxinas y proteínas de venenos que desde nuestro punto de vista pueden tener aplicaciones clínicas. Integrantes del Grupo Administrativos/académicos compartidos Compartido con los miembros del consorcio Drs. A. Alagón, B. Becerril y L.D. Possani; Carmen Segura, Angélica Linares, Manuela Avila, Ricardo Mondragón, Cipriano Balderas, Fernando Zamudio, Herlinda Clement, Timoteo Olamendi, Fredy Coronas, Ernesto Ortiz, Linda Espinosa, Rosalba Sánchez, Leopoldo Guereca, Alejandro Olvera, Felipe Olvera. Investigadores/posdoctorales Dra. Ligia Luz Corrales García, 2016-2018 “Expresión de proteínas recombinantes ricas en puentes disulfuro”. Dr. Iván Arenas Sosa, 2015-2018 “Péptidos antimicrobianos: síntesis y actividad biológica in vitro e in vivo”. Técnico Académico M. en Biotec. Herlinda Catalina Clement Carretero (Cursa Programa de Doctorado en Biotecnología, CeIB-UAEM), 2016-2018. Tesis: Identificación y expresión heteróloga de la serinoproteasa y fosfolipasa A2 del veneno de Bothrops ammodytoides y sus posibles usos biotecnológicos. Estudiantes Licenciatura Damaris I. Bolaños Guadarrama (Facultad Biología-UAEM, tutor: H. Clement) Alondra G. Callejas Yañez (Graduada, Universidad Politécnica Morelos, tutor: I. Arenas) Samuel Cardoso Arenas (Facultad Biología-UAEM, tutor: I. Arenas) Maestría Quim. Germán Obed Aguilar Carlos (Sinaloa, Maestría) Biol. David Antonio Villaseñor (Morelos, Maestría) Biol. Raúl Sánchez González (Puebla, Maestría) LAQB Diana Alvarado (Aguascalientes, Maestría) Ing. José Jesús Hernández Pérez (Tlaxcala, Maestría, CeIB-UAEM) Doctorado Biol. María José Vargas Hernández (Morelos, Doctorado, graduada 2017) M. en C. Guillermo de la Rosa (Morelos, Doctorado, graduado 2018) M. en C. Francia García García (CdMex, Doctorado, graduada 2018) M. en C. Jesús Ángel Borrego Terrazas (Cohauila, Doctorado) M. en C. Félix Santana Morera (Cuba, Doctorado) Biol. Marcos Salazar (Panamá, Doctorado)

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QFB Marco Antonio Ibarra Valencia (Puebla, Doctorado) Estancias Biol. Ángel Ananda Pérez Bravo (Colombia, 2017) Quim. Marcos Salazar (Panamá, 2017) Biol. Francisco Guillén Chable (Yucatán, 2017) Biol. CynthiaMartinez-Liu (Yucatán, 2017) Biol. Carolina Guevara (Panamá, 2018) Ing. Maria Lourdes Pérez Madrid (Chihuahua, 2018) Dra. Georgina Estrada (Yucatán, 2018) Dr. Pavel Espino (Chihuahua, 2018) M. en C. Lorena Mendoza Tobar (Colombia, 2018) Pasante Ing. Maria Jose Durán (Costa Rica, 2018) Servicio Social Marcela Galeana (Facultad Biología-UAEM) Erika Corzo (Facultad Ciencias-UAEM) Publicaciones (en negritas miembros del consorcio y año de publicación) 1. Montero-Alejo, V., Corzo, G., Porro-Suardíaz, J., Pardo-Ruiz, Z., Perera, E., Rodríguez-Viera, L., Sánchez-Díaz, G., Hernández-Rodríguez, E.W., Álvarez, C., Peigneur, S., Tytgat, J., Perdomo-Morales, R. 2017. Panusin: new family of <beta>-defensin-like peptide from invertebrates. Developmental & Comparative Immunology, 67, 310-321. 2. de la Rosa, G., Pastor, N., Alagon, A., Corzo, G. 2017. Synthetic peptide antigens derived from long-chain alpha-neurotoxins: Immunogenicity effect against elapid venoms. Peptides, 88, 80-86. 3. Corzo, G., Espino-Solis, G.P. 2017. Selected scorpion toxin exposures induce cytokine release in human peripheral blood mononuclear cells. Toxicon, 127, 56-62. 4. Hernández-Vargas, M.J., Gil, J., Lozano, L., Pedraza-Escalona, M., Ortiz, E., Encarnacion-Guevara, S., Alagon, A., Corzo, G. 2017. Proteomic and transcriptomic analysis of saliva components from the hematophagous reduviid Triatoma pallidipennis. Journal of Proteomics, 162, 30-39. 5. Velasco-Bolom, J.L., Corzo, G., Garduño-Juárez, R. 2017. Molecular dynamics dimulation of the membrane binding and disruption mechanisms by antimicrobial scorpion venom-derived peptides. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, 36:2070-2084. doi: 10.1080/07391102.2017.1341340. 6. Guillen-Chable, F., Arenas-Sosa, I., Islas-Flores, I., Corzo, G., Martinez-Liu, C., Estrada, G. 2017. Antibacterial activity and phospholipid recognition of the recombinant defensin J1-1 from Capsicum genus. Protein Expression and Purification, 136:45-51. doi:10.1016/j.pep.2017.06.007. 7. Garcia-Garcia, F., Corrales-Garcia, L.L., Olamendi-Portugal, T., Restano-Cassulini, R., Vega, R., Vega, M., Ortiz, E., Sandoval-Lopez, G., Soto, E., Corzo, G. 2017. Identification, chemical synthesis and heterologous expression of an antinociceptive peptide from the veined tree frog Trachycephalus typhonius. Process Biochemistry, 62:205-214. doi.org/10.1016/j.procbio.2017.07.029.

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8. Salazar, M.H., Arenas, I., Corrales-García, L.L., Miranda, R., Vélez, S., Sánchez, J., Mendoza, K., Cleghorn, J., Zamudio, F., Castillo, A., Possani, L.D., Corzo, G., Acosta, H. 2018. Venoms of Centruroides and Tityus species from Panama and their main toxic fractions. Toxicon, 141:79-87. doi.org/10.1016/j.toxicon.2017.11.013. 9. Titaux-Delgado, G., Carrillo, E., Mendoza, A., Mayorga-Flores, M., Escobedo-González, F. C., Cano-Sánchez, P., López-Vera, E., Corzo, G., del Rio-Portilla, F. 2018. Successful refolding and NMR structure of rMagi3: A disulfide-rich insecticidal spider toxin. Protein Science, 27:692-701. doi:10.1002/pro.3363 10. Guerrero-Garzón, J.F., Bénard-Valle, M., Restano-Cassulini, R., Zamudio, F., Corzo, G., Alagón, A., Olvera-Rodríguez, A. 2018. Cloning and sequencing of three-finger toxins from the venom glands of four Micrurus species from Mexico and heterologous expression of an alpha-neurotoxin from Micrurus diastema, Biochimie, 147:114-121. https://doi.org/10.1016/j.biochi.2018.01.006. 11. Walker, A.A., Hernandez-Vargas, M.J., Corzo, G., Fry, B.G., King, G.F. 2018. Giant fish-killing water bug reveals ancient and dynamic venom evolution in Heteroptera Cellular and Molecular Life Sciences, 75:3215-3229. https://doi.org/10.1007/s00018-018-2768-1. 12. de la Rosa, G., Corrales-García, L.L., Rodriguez-Ruiz, X., López-Vera, E., Corzo, G. 2018. Short-chain consensus alpha-neurotoxin: a synthetic 60-mer peptide with generic traits and enhanced immunogenic properties. Amino Acids, 50:885-895. 13. Luna-Bulbarela, A., Tinoco-Valencia, R., Corzo, G., Kazuma, K., Konno, K., Galindo, E., Serrano-Carreón, L. 2018. Effects of bacillomycin D homologues produced by Bacillus amyloliquefaciens 83 on growth and viability of Colletotrichum gloeosporioides at different physiological stages. Biological Control, 127:145-154 https://doi.org/10.1016/j.biocontrol.2018.08.004 14. Clement, H., Corzo, G., Neri-Castro, E., Arenas, I., Hajos, S., de Roodt, A.R., Villegas, E. 2018. cDNA cloning, heterologous expression, protein folding and immunogenic properties of a phospholipase A2 from Bothrops ammodytoides venom. Protein Expression and Purification. 154:33-34 https://doi.org/10.1016/j.pep.2018.09.00. 15. de la Rosa, G., Olvera, F., Cruz, E., Paniagua, D., Corzo, G. 2018. Use of irradiated elapid and viperid venoms for antivenom production in small and large animals Toxicon, 155, 32-37. Estudiantes Graduados Doctorado en Ciencias Bioquímicas Francia García, 2018, IBt Doctorado en Ciencias Bioquímicas Guillermo de la Rosa, 2018, IBt Ing. en Biotecnología Alondra Callejas (I. Arenas), 2018, UPMor Doctorado en Ciencias Biomédicas María José Hernández, 2017, CCG Maestría en Ciencias Bioquímicas Marco A. Ibarra, 2017, IBt Estudiantes en trámite de graduación Maestría en Ciencias Bioquímicas David Villaseñor, 2018, IBt Maestría en Ciencias Biológicas Raúl Sánchez, 2018, IBt

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Maestría en Ciencias Bioquímicas Omar Piña, 2018, IBt Maestría en Biotecnología Ing. José Jesús Hernández Pérez, CeIB, 2018, UAEM Lic. en Biología Damaris Bolaños (H. Clement), Facultad Biología, 2018, UAEM Participación en docencia Sección de Química de Proteínas (8 horas) del Curso de Bioquímica del Posgrado en Ciencias Bioquímicas 2017 y 2018. Sección de Emprendimiendo (3 horas) del Curso de Emprendimiendo del Posgrado en Ciencias Bioquímicas 2017 y 2018. Responsable y participación en el tópico Expresión de proteínas en sistemas heterólogos (45 horas), 2017, 2018. Curso Teórico Práctico “Búsqueda de proteínas neurotóxicas, insecticidas y antimicrobianas en venenos de arácnidos” en el curso introducción a la biotecnología: toxinología, venenos, antivenenos, cultivos celulares y sobre estructura de proteínas”. Septiembre 3-7, Instituto de Biotecnología UNAM, con un total de 38 horas. Desarrollo tecnológico Patentes solicitadas 1. de la Rosa, G., García-Corrales, L.L., Alagón, A., Corzo, G. 2017. Inmunógenos recombinantes para la producción de antivenenos contra el veneno de elápidos del género Micrurus. Expediente MX/a/2016/015750. Fecha 30 noviembre 2017. 2. Estrada, G., Guillén, F., Arenas, I., Corzo, G. 2018. Defensina recombinante J1-1 de chile y su uso como antibiótico. Expediente MX/a/2018/003988. Folio MX/E/2018/022339. Fecha 28 marzo 2018. Patentes concedidas 1. Barraza, G., Clement, H., Corzo, G. 2017. Concedida el 1 de junio 2017 con No. 348455. Un nuevo péptido analgésico proveniente del veneno de la araña Brachypelma verdezi. Oficina de Patentes Mexico. Expediente MX/a/2011/010576, solicitada el 7 octubre 2011. 2. García-Corrales, L.L., Rodríguez, A., Corzo, G. 2017. Concedida el 1 de diciembre 2017 con No. 352715. Uso de péptidos recombinantes y sintéticos como antibióticos contra Mycobacterium tuberculosis y otras bacterias patógenas. Oficina de Patentes Mexico. Expediente MX/E/2013/077792, solicitada el 25 octubre 2013. Donativos • DGAPA-UNAM, IN204415-IN203118. Expresión heteróloga de péptidos ricos en puentes disulfuro mediante la técnica del ADN recombinante: beta-defensinas humanas y neurotoxinas de arácnidos, duración 3 años. • CONACyT-SEP, CB-2014-01, No. 240616. Péptidos ricos en puentes disulfuro provenientes de venenos y secreciones de animales: síntesis, plegamiento y función molecular, duración hasta marzo 2018. • PEI-INDUSTRIAS LAVÍN, No. 235946. Paquete tecnológico de antimicrobiano

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humano recombinante para aplicación tópica en infecciones dermatológicas, 2018. Divulgación 1. Contra bacterias resistentes a fármacos. 2017. El Universal, sección CIENCIA Y SALUD. 10/6/17. 2. Propiedades bactericidas del veneno de alacrán. 2017. Gaceta UNAM. 4/5/2017 3. La ciencia le da “alas” a los alacranes. 2017. El Universal, sección CIENCIA Y SALUD. 3/13/17 4. ¿Sabías que... el veneno de alacrán tiene propiedades bactericidas? 2017. Agencia informativa CONACyT. 6/24/17 5. Antiveneno contra mordeduras de serpiente. 2018. Agencia informativa CONACyT. 21/08/18 6. Inmunógenos recombinantes ysu aplicación en antivenenos. 2018. Hypatia. Ene-Abr, 58:3-5. Varias cápsulas informativas por TV; http://www.premiorosenkranz.com; Título de los carteles (en negritas miembros del consorcio y año de publicación) 1. Cardoso, S., Arenas, I., Corzo, G. 2018. Characterization of proteins with toxic activity from venoms of Oculicosa supermirabilis, Heriaeus melloteei and Dolomedes gertschi. 2. Aguilar, G., Villaseñor, D., Clement, H., Estrada, G., Corzo, G. 2018. Permutations of the loops of Ts1 by those of the neurotoxin CssII: in vitro folding and specificity on voltage-dependent sodium channels. 3. Ibarra, M.A., Corzo, G. 2018. Efecto antimicrobiano de péptidos derivados de veneno de alacrán en heridas infectadas por Staphylococcus aureus y Pseudomonas aeruginosa. 4. Bolaños, D., Clement, H., Corrales-García, L., de Roodt, A., G. Corzo. 2018. Cloning, expression and purification of a metalloprotease from the venom of a pit viper endemic of Argentina. 5. Callejas, A., Corzo, G., Arenas, I. 2017. Production and purification of a recombinant human beta defensin with antimicrobial activity against selected microorganisms.

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Dra. Gloria Saab rincón Departamento Ingeniería Celular y Biocatálisis, IBT-UNAM. “Estrategias de Mutagénesis combinatoria en la ingeniería de CytP450 y del dominio de unión del receptor de estrógeno α” Resumen El objetivo central de nuestro laboratorio es entender la relación entre la secuencia de aminoácidos, su estructura y su función. Existen proyectos que tratan de abordar estos temas desde una perspectiva de ciencia básica y otros en los que intentamos aplicar los principios aprendidos para generar variantes que tengan un potencial de aplicación. Dentro de los primeros mencionados y de los que sólo hablaré brevemente, se encuentran: El estudio de subunidades de plegamiento a través de permutación circular y el estudio de la contribución de la capacidad calorífica de las enzimas en la estabilización del estado de transición de las reacciones catalizadas. En esta ocasión, mi plática se enfocará principalmente a el uso de herramientas de ingeniería de proteínas para el desarrollo de biocatalizadores y de moléculas de reconocimiento molecular. Una de las proteínas modelos en el laboratorio es el citocromo P450 de B. megaterium (CitP450 BM3). Los citocromos P450 son una familia de enzimas muy interesantes por su capacidad para llevar a cabo la inserción de un solo átomo de oxígeno a partir de oxígeno molecular, en átomos de carbono alifáticos, una reacción que requiere de una energía muy alta para llevarse a cabo. Estas enzimas son las encargadas de iniciar el metabolismo de gran parte de sustancias xenobióticas y su promiscuidad las ha convertido en un blanco importante para realizar ingeniería de proteínas con el fin de desarrollar biocatalizadores. Aunque la mayoría de Citocromos P450 se encuentran anclados a membrana y requieren de la acción de una proteína reductasa que regenere el estado de oxidación del grupo hemo en el sitio catalítico, CitP450 BM3, es una proteína soluble y autosuficiente, ya que la reductasa forma parte de la misma cadena polipeptídica. Sin embargo, la baja estabilidad de este dominio limita su uso. En el laboratorio hemos desarrollado estrategias de ingeniería de proteínas basadas en consensos, logrando un importante incremento en la Tm del dominio reductasa. Nuestro siguiente objetivo es poder modificar la especificidad de la enzima para la producción de ácido cafeico a partir de ácido cumárico. Esta reacción es catalizada por citocromos P450 de plantas, sin embargo, CitP450 BM3, tiene preferencia por hidroxilar largas cadenas alifáticas. En el laboratorio se han utilizado herramientas computacionales para el rediseño del sitio catalítco para que hidroxile preferencialmente al anillo aromático del ácido p-cumárico. Se presentarán algunos avances de este proyecto. El otro proyecto del que se presentarán avances se relaciona con el desarrollo de una molécula de reconocimiento específico a endoxifeno, con el fin de desarrollar un biosensor que monitoree sus niveles en sangre en el tratamiento de cáncer de

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mama de tipo estrogénico. El endoxifeno es un metabolito del tamoxifeno, la droga empleada en este tipo de cáncer y tiene un rango terapéutico muy estrecho, de manera que su concentración en el torrente sanguíneo debe ser finamente regulada para asegurar eficacia terapéutica, por un lado, pero a la vez evitar efectos adversos secundarios entre los que figuran cáncer de endometrio. Mediante el uso de herramientas de diseño como ROSETTA, se está tratando de ingenierear una proteína capaz de unir selectivamente a endoxifeno en muestras de sangre que contengan estradiol, tamoxifeno y otros esteroides. INTEGRANTES DEL GRUPO: Personal Académico I.Q. Leticia Olvera Rodríguez (Técnico Académico) Dr. Alfonso Miranda Molina (Investigador por Honorarios) Dra. Wendy Xolalpa Villanueva (Investigador Asociado “C”) Apoyo Administrativo Delia Caro/Rubí Robledo Personal de Apoyo Antonio Dorantes López (Laboratorista) Corina Mondragón (Auxiliar de Laboratorio) Estudiantes M.C. Rodrigo A. Arreola Barroso (Estudiante de doctorado) M.C. Emma Arévalo Salina (Estudiante de doctorado) Q.F.B. Jorge Luis Jiménez Niebla (Estudiante de maestría) Q.F.B. Ekaterina Jalomo Khayrova (Estudiante de maestría) Miguel Ángel Dávila Uribe (Estudiante de maestría) Pasante Maira Anzures Jacinto (Tesista de licenciatura) Pasante Yeimi Guadalupe Román Moctezuma (Tesista de licenciatura bajo la dirección de los Dres. Wendy Xolalpa y Alfonso Miranda) Pasante Manuel Alejandro Arévalo Salina (Tesista de licenciatura bajo la dirección de I.Q. Leticia Olvera) Roxana Flores Romero (Tesista de licenciatura bajo la dirección de la Dra. Wendy Xolalpa) PUBLICACIONES Trabajos en Revistas Científicas Internacionales Saab-Rincon, G., Alwaseem, H., Guzmán-Luna, V., Olvera, L. and Fasan, R., “Stabilization of the Reductase Domain in the Catalytically Self-Sufficient Cytochrome P450BM3 via Consensus-Guided Mutagenesis” ChemBioChem (2018), 19(6);622-632. doi: 0.1002/cbic.201700546 Cárcamo, E., Roldán-Salgado,A., Osuna, J., Bello-Sanmartin, I., Yáñez, J.A., Saab-Rincón, G., Viadiu, H., and Gaytán, P., “Spiked Genes: A Method to Introduce Random Point Nucleotide Mutations Evenly throughout an Entire Gene Using a Complete Set of Spiked Oligonucleotides for the Assembly” ACS Omega (2017), 2: 3183−3191. doi: 10.1021/acsomega.7b00508 Fox-Uribe, L.F., Soberanes, Y., Guzman-Luna, V., Saab-Rincon, G., Hernández-Paredes, J. and Sotelo-Mundo, R.R., “Absolute Configuration, Optical Activity and

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Raman Microscopy of L and DGlutamic Acid”, Microsc. Microanal. (2017), 23(Suppl 1):1382-1383. doi:10.1017/S1431927617007577. Guzmán-Luna, V., Olvera-Rodríguez, L., Bustamante-Villalobos, P. and Saab-Rincón, G., “Characterization of a New Allelic Variant of Triosephosphate Isomerase from the LNCaP Human Prostate Cancer Cell Line: Enzyme Inhibition and Spectroscopic Studies”, Current Enzyme Inhibition (2017), 13, 1-7. DOI: 10.2174/1573408012666160906110330. ALUMNOS GRADUADOS David Yetlanezi Salgado Rinquey, “Mutagénesis de la alfa-amilasa de Thermotoga marítima para reacciones de alcohólisis”. Tesis de licenciatura de la Facultad de Ciencias de la Universidad Autónoma del Estado de México. 15 de junio de 2017 Javier Burgos Montiel, “Análisis de α-amilasa de Thermotoga maritima con capacidad productora de alquil-glucosidos”. Proyecto de Terminación de Carrera en Ingeniería en Biotecnología de la Universidad Politécnica de Puebla. 2 de mayo de 2017. Axel Arana Gonzaga, “Identificación de blancos de mutagénesis de la enzima Citocromo P450 BM-3 para incrementar su estabilidad, basado en consensos”. Tesis de Licenciatura de la Universidad Politécnica del Valle de Toluca, abril de 2017. Peniel Bustamante Villalobos, “Caracterización biofísica y bioquímica de la mutante G233D de triosa fosfato isomerasa de humano”. Tesis de Licenciatura de la Facultad de Ciencias Químicas de la Universidad Juárez del Estado de Durango. 5 de abril de 2017. Bajo la dirección de Dra. Valeria Guzmán. Sarahi Morales Morales, “Clonación Y Expresión De La Enzima 4- α-Glucanotransferasa de Thermotoga maritima en un sistema heterólogo en Escherichia Coli” Tesina para obtener el grado de T.S.U en Química Área Biotecnología de la Universidad Tecnológica de Xicotepec de Juárez, Pue. Bajo la Dirección de I.Q: Leticia Olvera. PARTICIPACIÓN EN DOCENCIA Responsable de la 13ª Escuela de Proteínas organizada por la Rama de Estructura Función y Evolución de Proteínas en la Universidad Autónoma de Chihuahua 20 - 21 de agosto de 2018. Responsable del curso “Estructura y Función de Proteínas”. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas de la U.N.A.M. (Otoño 2018) Responsable del curso “Estructura y Función de Proteínas”. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas de la U.N.A.M. (Otoño 2017) Miembro de 11 comités tutorales. Miembro de 7 jurados para obtención de grado. Miembro de 7 comisiones de admisión a doctorado DESARROLLO TECNOLÓGICO Saab Rincón, G, V. Guzmán Luna y L. Olvera Rodríguez. Solicitud de Patente Ante el Instituto Mexicano de la Propiedad Industrial “Nuevas variantes del dominio reductasa del citocromo P450 obtenidas por mutagénesis guiada por consenso”

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DIVULGACIÓN “Evolución de proteínas para producción biocatalizadores” impartida el 20 de agosto de 2018 en el Marco de la 13ª Escuela de Proteínas de la Rama de Estructura Función y Evolución de Proteínas en la Universidad Autónoma Juárez de Chihuahua. "Mejorando a las enzimas a través de ingeniería genética para biocatálisis" impartido en el marco de la XXVII Semana de Biología Experimental de la Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa (6 de febrero de 2018) “Exploring Sequence-Space in TIM Barrel Proteins” impartido en el marco del 6° Congreso de la Rama de Fisicoquímica, Estructura Y Diseño de Proteínas” en la Universidad Juárez del Edo de Durango. (6-10 Noviembre, 2017) “Evolucionando proteínas” Impartido el 10 de Marzo de 2017 en el Marco de las Jornadas del Instituto de Biotecnología, UNAM en la Universidad de Guadalajara. DONATIVOS Responsable del Proyecto “Estabilización del dominio reductasa de CytP450 de B. megaterium a través de consenso” ante el Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT IT200617). Vigencia enero 2017-diciembre 2019. PARTICIPACIÓN INSTITUCIONAL Comités técnicos: Unidad de Síntesis de oligonucleótidos y Secuenciación-IBt-UNAM Laboratorio Nacional para la Producción y el Análisis de Moléculas y Medicamentos Biotecnológicos Jefe del Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis y miembro del Consejo Interno del IBt-UNAM. (16 de marzo de 2014- a la fecha) Otros: Parte del Comité Técnico Académico de la Red Temática de “Función Estructura y Evolución de Proteínas” Miembro del Comité de Premios de la Academia Mexicana de Ciencias (2016-2017) TÍTULOS DE CARTELES Rodrigo Arreola Barroso Wendy Xolalpa-Villanueva, Leticia Olvera-Rodríguez, Alfonso Miranda-Molina and Gloria Saab Rincón, “Modulating hydrolysis/transfer function through the analysis of inter-residue protein contacts in the alpha-amylase enzyme family” Alfonso Miranda Molina, Wendy Xolalpa, Leticia Olvera, Simon Strompen, Yeimi Guadalupe Román Moctezuma y Gloria Saab Rincón, “Efecto de disolventes eutécticos sobre la actividad catalítica, estabilidad y estructura de la α-amilasa de Thermotoga maritima en reacciones de alcohólisis” Ekaterina Jaloma Khayrova and Gloria Saab Rincón "Evaluation of the effect of heat capacity on the catalysis of a dimeric enzyme" Wendy Xolalpa Villanueva and Gloria Saab Rincón “A fluorescent assay for the detection of alkyl glucosides and other non-ionic surfactants”

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Dra. Patricia Joseph Bravo Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, IBT-UNAM. “Las neuronas TRHérgicas hipofisiotrópicas son transductores neuroendócrinos del estrés y el metabolismo” Las neuronas hipofisiotrópicas del núcleo paraventricular hipotalámico (PVN) que sintetizan a la hormona liberadora de tirotropina (TRH), o bien las de la hormona liberadora de corticotropina (CRH), decodifican señales metabólicas, neurales y ambientales y regulan dos ejes neuroendócrinos: el eje hipotálamo- hipófisis-tiroideo (HPT) y el HP-adrenal (HPA). Las hormonas tiroideas (T3 y T4) y los glucocorticoides (Gc) son participantes cruciales en la homeostasis energética. La expresión de Trh y el eje HPT se activan por el frío y por el ejercicio; son inhibidos por balance energético negativo como la restricción alimentaria, ayuno o enfermedad. Al nivel de la eminencia media (EM), el TRH liberado puede ser inactivado antes de hacer contacto con los tirótropos de la pituitaria por medio de la ectoenzima degradadora piroglutamil- peptidasa II que se expresa en los tanicitos y es modulada por T3 y por el estado nutricional. Las neuronas de CRH son activadas por estrés (crónico o agudo); el receptor a Gc (GR) media los efectos de los Gc durante el estrés. La exposición al frío activa rápidamente la expresión de Trh en el PVN a través de la fosforilación de la proteína de unión al elemento de respuesta a AMPc (CREB) y los Gc o la exposición aguda a estrés atenúan la activación del eje HPT inducida por frío (4). Hemos dilucidado el mecanismo de la interferencia de los Gc sobre la activación inducida por frío sobre la expresión de Trh. In vivo, una inyección previa de corticosterona evita la estimulación por frío de la fosforilación de CREB en neuronas TRHérgicas del PVN así como la síntesis y liberación de Trh en el PVN/EM y de tirotropina (TSH) en la pituitaria. In vitro, la dexametasona interfiere con la señalización del AMPc inhibiendo la translocación de GR a núcleo y la de PKAc así como fosforilación inducida por AMPc de CREB, la unión de pCREB y GR a los elementos de respuesta del promotor del gen de Trh y disminuye los niveles de RNAm de Trh.El mecanismo involucra la interacción proteína:proteína de PKAc y GR (4). Recientemente hemos evaluado la respuesta del eje HPT en diversos paradigmas de estrés crónico en ratas adultas y en periodos críticos del desarrollo como la lactancia (Jaimes-Hoy) y la pubertad/adolescencia (Parra M). Distintos tipos de estrés crónico en ratas macho adultas restringe también la estimulación el eje HPT provocado por la exposición aguda al frío (Castillo A, Gutiérrez-Mata A) como también por el ejercicio voluntario (Salmerón F, Gutiérrez-Mariscal M, Parra M). Los efectos perjudiciales de la exposición al estrés se extienden al estrés post-natal: la separación materna (SM) causa efectos a largo plazo en la actividad el eje HPT de una manera género-dependiente (Jaimes-Hoy). Las respuestas del HPT al ayuno o

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al frío están parcialmente mitigadas en los machos adultos (no así en hembras) que sufrieron SM, una condición que podría afectar su adaptación a condiciones de balance energético negativo. La respuesta del eje HPT a una dieta “apetitosa” también varía de acuerdo al paradigma de estrés previo y al género. El estrés durante la pubertad/adolescencia causa problemas conductuales y endócrinos incluyendo cambios en la respuesta del eje HPT al ejercicio diferencialmente de acuerdo al sexo. Estos resultados confirman que las neuronas TRHérgicas del PVN actúan como sensores de energía y demuestran que son vulnerables al estrés. La perturbación causada por el estrés en el funcionamiento óptimo del eje HPT en condiciones de demanda energética puede contribuir al desarrollo de obesidad y síndrome metabólico. Integrantes del grupo: Dra. Lorraine E. Jaimes Hoy, investigador asociado; Dra. Mariana Gutiérrez Mariscal, Técnico Académico Titular B, QI Fidelia Romero, Técnico Académico Titular A Estudiantes: Marco Parra (doctorado), Andrea Castillo (Maestría), Angélica Gutiérrez Mata (Maestría) Publicaciones 1. Joseph-Bravo P *., Gutiérrez-Mariscal M., Jaimes-Hoy L., Charli JL. (electronic: 2017; printed: 2019) Thyroid Axis and Energy Balance: Focus on Animals and Implications for Humankind. In: Preedy V., Patel V. (eds) Handbook of Famine, Starvation, and Nutrient Deprivation. Springer, doi:10.1007/978-3-319-40007-5_76- eReference ISBN 978-3-319- 55387-0 Por invitación 2. Cote-Vélez A, Martínez Báez A, Lezama L, Uribe RM, Joseph-Bravo P, Charli JL. A screen for modulators reveals that orexin-A rapidly stimulates thyrotropin releasing hormone expression and release in hypothalamic cell culture. Neuropeptides. 62:11-20, 2017 3. Sotelo-Rivera 1, Cote-Vélez A, Uribe RM, Charli J-L, y Joseph-Bravo P *. Glucocorticoids curtail stimuli-induced CREB phosphorylation in TRH neurons through interaction of the glucocorticoid receptor with the catalytic subunit of protein kinase A. Endocrine 55:861-871,2017 4. González-Franco DA, Ramírez-Amaya V, Joseph-Bravo P, Prado-Alcalá RA, Quirarte GL. Differential Arc protein expression in dorsal and ventral striatum after moderate and intense inhibitory avoidance training. Neurobiol Learn Mem. 140:17-26 2017 5. Jaimes-Hoy L, Gurrola GB, Cisneros M, Joseph-Bravo P, Possani LD, Charli JL. The Kv1.3 channel blocker Vm24 enhances muscle glucose transporter 4 mobilization but does not reduce body-weight gain in diet-induced obese male rats. Life Sci. 15:181:23-30, 2017 Alumnos Graduados 1. Israim Sotelo Rivera. Doctorado en C. Bioquímicas, UNAM. 2017. “Regulación dinámica de la señalización de glucocorticoides en la expresión del TRH y el eje tiroideo.” [Asesora: P. Joseph]

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2. Angélica Gutiérrez Mata. Efectos del estrés crónico por restricción del movimiento sobre la respuesta del eje Tiroideo al frío. Instituto de Investigación en Ciencias Básicas y Aplicadas, Centro de Investigación en Dinámica Celular. UAEM- Asesora: Dra. Patricia I. Joseph Bravo. 2017. 3. Elian Itzel Narváez Bahena. Regulación del tejido adiposo pardo en respuesta al ejercicio en ratas hembra con estrés neonatal. Facultad de Ciencias Biológicas de la UAEM Asesora: Dra. Lorraine Jaimes Hoy. 2017 4. Ma. Félix Salmerón Jiménez. EFECTO DEL ESTRÉS CRÓNICO EN LA REGULACIÓN DEL EJE TIROIDEO ANTE UN MODELO DE EJERCICIO VOLUNTARIO. Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias Biológicas de la UAEM. Asesora: Mariana Gutiérrez Mariscal. Fecha de titulación: 8 Junio 2018. 5. Diana Elisa Velázquez Vázquez. Estudio de la interacción entre el receptor de glucocorticoides y la subunidad catalítica de PKA en la regulación de la expresión del gen proTRH. Licenciatura en Biología, UNAM-Fac. Ciencias. Asesora: Dra Patricia Joseph-Bravo. 2018. 6. Diego Rodríguez Sarmiento 2018 Efectos del aislamiento social a partir de la adolescencia en la actividad del eje hipotálamo-pituiataria-tiroides en respuesta a la exposición al frío. Maestría en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Asesora: Dra. Lorraine Jaimes Hoy. Nov 2018. Participación en Docencia Neurobiología de la homeostasis energética. Maestría CBQ 2017, 2018 Taller de Macromoléculas, Fac. Ciencias, UNAM. Divulgación 1. Patricia Joseph. TRH neurons integrate signals of stress and energy status to modulate metabolism. Symposium Neuroendocrinology, Neuerobiology Meeting 2017. SMB Queretaro, Qro 2. Patricia Joseph-Bravo. Hypophysiotropic TRH neurons integrate stress and metabolic signals. Symposium 2. What’s new with POMC, TRH, PRL and GH neuroendocrine Actions. Co-Chairs: Patricia Joseph-Bravo (Cuernavaca, México) and Dave Grattan (Dunedin, New Zealand. RegPep2018: 22nd International Symposium on Regulatory Peptides Donativos: 1. 2016-2018. CONACYT 284883, 2. PAPIIT DGAPA IN2204316 (2016-2018); 3. PAPIIT DGAPA (2019-2021) IN213419

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Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo.

1. Andrea Castillo. Ratas adultas macho sometidas a estrés crónico variable presentan una respuesta del eje HPT al frío.

2. Marco Parra. Diferencias de género en la respuesta del eje tiroideo a ejercicio y aislamiento.

3. Angélica Gutiérrez: La activación inducida por frío del eje Tiroideo es inhibida por estrés crónico.

4. Mariana Gutiérrez: La activación del eje tiroideo y la reducción de depósitos de grasa inducidas por ejercicio voluntario son atenuadas por el estrés crónico de manera género dependiente en ratas adultas.

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Dr. Guillermo Gosset Lagarda Departamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, IBT-UNAM “Fisiología Microbiana e Ingeniería de Vías Metabólicas” Resumen Durante este periodo se desarrollaron líneas relacionadas con la aplicación de ingeniería genética para la generación de cepas de Escherichia coli con la capacidad de producción de compuestos aromáticos y proteínas no nativas. Cuando E. coli crece en presencia de glucosa en las concentraciones frecuentemente utilizadas en fermentadores, se produce un efecto de desbalance metabólico que ocasiona la síntesis de acetato. La producción de este ácido orgánico representa una pérdida de carbono y su acumulación tiene un efecto negativo sobre la productividad. Una solución a este problema se basa en la limitación de este substrato mediante alimentación controlada. En este proyecto se decidió emplear un conjunto de cepas de E. coli previamente generadas en nuestro grupo, en las que el control de la velocidad de consumo de glucosa ocurre a nivel de su transporte en la membrana interna. El grupo de 6 derivadas isogénicas de la cepa W3110 de E. coli con inactivaciones sencillas o múltiples de genes que codifican para transportadores de glucosa fueron transformadas con el plásmido pV21 que contiene un gene codifica para GFP expresada a partir del promotor lac. Estas cepas se caracterizaron en cultivos en matraz en medio mínimo con 10 g/L de glucosa. En estos experimentos se observó un rango en la velocidad específica de consumo de glucosa de 1.75 a 0.45 g/g h y velocidades específicas de crecimiento de 0.54 a 0.16 h-1. Así mismo, se observó la eliminación o reducción en la producción de acetato en las cepas mutantes. En cultivos en biorreactor, la cepa W3110/pV21 produjo 50.5 mg/L de GFP. En las mismas condiciones, cepas con la eliminación de los componentes PTS IICBGlc y IICBGlc, IIABMan, produjeron títulos de GFP de 342 y 438 mg/L, respectivamente. Con el propósito de establecer si existía heterogeneidad poblacional con respecto a la producción de GFP en estos cultivos, se efectuaron experimentos para cuantificar fluorescencia a nivel de célula individual mediante citometría de flujo. Estos análisis permitieron establecer que existe heterogeneidad poblacional y que esta puede ser alterada dependiendo de cuál transportador fue eliminado en cada cepa. Estos resultados demuestran que es posible mejorar el desempeño de E. coli como productora de una proteína recombinante al reducir la capacidad de transporte de glucosa. Así mismo, este tipo de modificaciones pueden tener un impacto en la heterogeidad poblacional. Integrantes del Grupo: Personal académico y administrativo Guillermo Gosset Lagarda Georgina Hernández-Chávez Luz María Martínez Manuel Saucedo

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Aurelia González Rubí Robledo Alumnos Juan Carlos Fragoso (D) Daniel Abner Rosas Rivera (M) José Ignacio Rodríguez Ochoa (M) Raúl Alejandro Calzada Hernández (L) Jimena Barrientos Parás (L) Benjamín Ángel Galindo (estancia) (D) Joel Alcalá Guerrero (estancia) (L) Publicaciones Artículos en revistas indexadas Volumetric oxygen transfer coefficient as a means of improving volumetric ethanol productivity and a criterion for scaling up ethanol production with Escherichia coli. Fernández-Sandoval M. T., Galíndez-Mayer J., Moss-Acosta C., Gosset, G. y Martinez, A. Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 92:981-989 (2017). Metabolic engineering and adaptive evolution of E. coli KO11 for ethanol production through the Entner-Doudoroff and the Pentose Phosphate pathways. Huerta-Beristain G., Cabrera-Ruiz R., Hernandez-Chavez G., Bolivar F., Gosset G. y Martinez A. Journal of Chemical Technology & Biotechnology, 92:990-996 (2017). The role of the ydiB gene, which encodes quinate/shikimate dehydrogenase, in the production of quinic, dehydroshikimic and shikimic acids in a PTS- strain of Escherichia coli. García S., Flores N., de Anda R., Hernández G., Gosset G., Bolívar F. y Escalante A. Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology, 27:11-21 (2017). Plasmid-encoded biosynthetic genes alleviate metabolic disadvantages while increasing glucose conversion to shikimate in an engineered Escherichia coli strain. Rodriguez A., Martínez J. A., Millard P., Gosset G., Portais J-C., Létisse F. y Bolívar F. Biotechnology and Bioengineering, 114:1319-1330 (2017). Increasing pinosylvin production in Escherichia coli by reducing the expression level of the gene fabI-encoded enoyl-acyl carrier protein reductase. Salas-Navarrete C., Hernández-Chávez G., Flores N., Martínez L. M., Martinez A., Bolívar F., Barona-Gomez F. y Gosset G, Electronic Journal of Biotechnology, 33:11-16 (2018). Metabolic engineering strategies for caffeic acid production in Escherichia coli. Hernández-Chávez G., Martinez A. y Gosset G. Electronic Journal of Biotechnology. Aceptado para publicación (2018). Metabolic modeling and response surface analysis of an Escherichia coli strain engineered for shikimic acid production. Martínez-Álvarez J. A., Rodríguez A.,

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Moreno F., Flores N., Lara A. R., Ramírez O. T., Gosset G. and Bolívar F. BMC Systems Biology. Aceptado para publicación (2018). Libro Engineering of Microorganisms for the Production of Chemicals and Biofuels from Renewable Resources. Gosset G. (Ed.), (2017). Springer International Publishing. 200 páginas. Capítulos en libros de circulación internacional Metabolic Engineering of Escherichia coli for Lactic Acid Production from Renewable Resources. Martinez, A., Rodríguez-Alegría, M. E., Fernandes, M. C., Gosset, G., y Vargas-Tah, A. En: Engineering of Microorganisms for the Production of Chemicals and Biofuels from Renewable Resources. Editor: Gosset G. Springer International Publishing. pp.125–145 (2017). Biotechnological production of melanins with microorganisms. Gosset, G. En: Bio-pigmentation and Biotechnological Implementations. Editor: Om V. Singh. John Wiley & Sons, Inc. pp.161–172 (2017). Publicaciones de divulgación Los microbios como biofábricas. Gosset G. Ciencia, revista de la Academia Mexicana de Ciencias. Vol. 68, num. 2, p. 44-49, abril-junio 2017. Los microbios como biofábricas. Gosset G. Selecciones. p. 78-86, marzo 2018. Alumnos graduados: Licenciatura Jorge Sánchez Andrade. Maestría Prisciluis Caheri Salas Navarrete. Participación en docencia Participación como coordinador y profesor en el Tópico Selecto “Ingeniería de vías metabólicas en bacterias”. Proyecto académico de especialización, maestría y doctorado en Ciencias Bioquímicas. Instituto de Biotecnología/U.N.A.M. 24 de enero 2017 a 23 de mayo de 2017. Participación como profesor en el taller "La biología a partir de las biomoléculas: nuevos paradigmas y aplicaciones". Facultad de Ciencias, U.N.A.M. 29 agosto y 1 de septiembre de 2017. Participación como profesor en el taller "La biología a partir de las biomoléculas: nuevos paradigmas y aplicaciones". Facultad de Ciencias, U.N.A.M. 18 y 21 de septiembre de 2018.

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Desarrollo tecnológico: Patentes en trámite Cepas de Escherichia coli modificadas por ingeniería metabólica para la biosíntesis de resveratrol y su uso en un nuevo proceso en co-cultivo. José Manuel Camacho Zaragoza, Georgina Teresa Hernández Chávez, Fabián Moreno Avitia, René Ramírez Iñiguez, Alfredo Martinez Jiménez, Francisco Gonzalo Bolivar Zapata y Guillermo Gosset Lagarda. Reivindicaciones 5. Presentación 01/Feb/2017 en México. Solicitud MX/E/2017/008887. Cepa de Escherichia coli modificadas por ingeniería de vías metabólicas para la biosíntesis de pinosilvina y su uso. Prisciluis Caheri Salas Navarrete, Georgina Teresa Hernández Chávez, Noemí Flores Mejía, Luz María Martínez Mejía, Alfredo Martinez Jiménez, Francisco Gonzalo Bolivar Zapata y Guillermo Gosset Lagarda. Reivindicaciones 9. Presentación 07/Jun/2017 en México. Solicitud expediente: MX/a/2017/007394. Folio: MX/E2017/041099. Cepas de Escherichia coli modificadas por ingeniería metabólica para la producción de ácido succínico a partir de glucosa, xilosa o una mezcla glucosa-xilosa, como fuente de carbono. Alfredo Martinez Jiménez, Guillermo Gosset Lagarda, Alejandra Vargas Tah, Andrea Sabido Ramos, Mariana Martínez Valenzuela. Reivindicaciones 7. Fecha divulgación previa: 25/06/2017. Fecha: 20/junio/2018 en México. Expediente MX/a/2018/007555. Folio: MX/E/2018/045485. Donativos: Responsable de donativo de PAPIIT/UNAM por tres años. Proyecto “Biosíntesis de ácido cafeico mediante ingeniería metabólica de Escherichia coli” (IT200217). A partir de enero, 2017 Monto: $231,406.00. Carteles HETEROLOGOUS PRODUCTION OF CAFFEIC ACID IN RECOMBINANT Escherichia coli. Luz María Martínez Mejía, Jorge Sánchez Andrade, Georgina Hernández Chávez and Guillermo Gosset Lagarda. CAFFEIC ACID PRODUCTION FROM COUMARIC ACID IN A RECOMBINANT Escherichia coli STRAIN. Georgina Hernández Chávez, Ana Gabriela Hernández López, Ramón de Anda Herrera, Luz María Martínez Mejía, Francisco Bolívar Zapata and Guillermo Gosset Lagarda.

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Dr. José Luis Puente García Departamento de Microbiología Molecular, IBT-UNAM. “Regulación y función de factores de virulencia en bacterias enteropatógenas” Resumen En el laboratorio estamos interesados en el estudio de patógenos bacterianos entéricos causantes de enfermedades gastrointestinales y sistémicas. Salmonella enterica es el agente causal de la salmonelosis o de infecciones sistémicas como la fiebre tifoidea. Escherichia coli enteropatógena (EPEC) es uno de los principales agentes causales de diarrea en niños menores de 6 meses, mientras que E. coli enterohemorrágica (EHEC) puede causar colitis hemorrágica que con frecuencia deriva en el síndrome urémico hemolítico, el cual puede ser fatal. Estas bacterias inducen una lesión denominada de adherencia y destrucción (Attaching and Effacing Lesions, A/E), caracterizada por la unión íntima de las bacterias a las membranas de los enterocitos. En las bacterias A/E la expresión de los principales factores de virulencia codificados por la isla de patogenicidad LEE es regulada por una compleja cascada que involucra diversos reguladores transcripcionales positivos y negativos, tanto específicos de estos patógenos (Ler, GrlA, GrlR y PerC), como globales (H-NS e IHF, entre otros). Citrobacter rodentium es un patógeno A/E de ratones de laboratorio que usamos como modelo para entender diferentes aspectos de la virulencia de esta familia de patógenos. Hemos explorado la virulencia de estos organismos desde diferentes ángulos, con un particular enfoque en el estudio de los mecanismos que regulan la expresión de genes contenidos en islas de patogenicidad, en la descripción de las redes reguladoras que se integraron para regular genes que fueron adquiridos por transferencia genética horizontal (HGT) y en la caracterización de regulones controlados por reguladores adquiridos por HGT que integran genes de virulencia, localizados en regiones del genoma distintas, que codifican para factores antes no estudiados y cuyos productos participan en diferentes etapas de la infección. Estamos también explorando si los paradigmas establecidos para estos mecanismos en cepas prototipo son confirmados estudiando los mismos procesos en aislados clínicos, o si podemos establecer mecanismos alternos. Así mismo, estamos determinando la relevancia que tiene para un patógeno intestinal contar con un amplio repertorio de operones fimbriales y estudiando la diversidad de mecanismos que controlan su expresión en los patógenos A/E. Es también de interés evaluar el efecto de cambios en los niveles de segundos mensajeros (di-GMP cíclico, diadenosina tetrafosfato y AMP cíclico) en la formación de biopelícula y en la expresión de genes de virulencia en E. coli y EPEC.

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Integrantes del grupo 2017-2018 Personal Académico Dr. Ricardo Oropeza Navarro Investigador Titular A. Dra. Lucía Perezgasga Ciscomani Técnico Académico Titular C. Biol. Francisco J. Santana Estrada. Técnico Académico Titular A. Estancia Posdoctoral Dra. Claudia V. Silva Romero Dra. Haydee Martínez Plascencia* Dr. Zeus Saldaña Ahuactzi Estudiantes Carmen A. Contreras García Doctorado Emma Aurora Cruz Gómez Doctorado Isela Serrano Fujarte Doctorado María Inés Isidro Coxca Doctorado Álvaro Damián Morales Ibarra Maestría Fabiola González Lara Maestría Jordan Bernaldo Agüero Maestría Stephanie Ortiz Jiménez Maestría Daniel Ramsses Carlos Carrillo Licenciatura (RON) Karla Fernanda Ramírez González Licenciatura Paola Guadalupe Vázquez Bueno Licenciatura (RON) Fátima Castillo Silva Servicio Social (RON) Personal Administrativo Amapola Blanco Zavala Proyectos. Rosalva González Arenas Secretaria. Rebeca Herrera Trujillo Laboratorista Mariana Ortiz Ramirez Laboratorista Mario Roberto Cruz Jarillo Laboratorista* *Terminaron su estancia en el laboratorio en el periodo. Publicaciones -Soto, E., Espinosa, N., Diaz-Guerrero, M., Gaytan, M.O., Puente, J.L. and Gonzalez-Pedrajo, B. (2017). Functional Characterization of EscK (Orf4), a Sorting Platform Component of the Enteropathogenic Escherichia coli Injectisome. Journal of Bacteriology. 199(1). e00538-16. doi:10.1128/JB.00538-16.

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-Sakamoto, K., Kim, Y.G., Hara, H., Kamada, N., Caballero-Flores, G., Tolosano, E., Soares, M.P., Puente, J.L., Inohara, N. and Núñez, G. 2017. IL-22 Controls Heme/Iron-Dependent Nutritional Immunity Against Systemic Bacterial Infections. Science Immunology. 2(8), eaai8371. doi: 10.1126/sciimmunol.aai8371. -Silva, C., Puente, J.L. and Calva, E. 2017. Salmonella virulence plasmid: pathogenesis and ecology. Pathogens and Disease. doi: 10.1093/femspd/ftx070. -Puente, J.L. and Calva, E. 2017. Perspective: The One Health Concept - the Aztec empire and beyond. Pathogens and Disease. doi: 10.1093/femspd/ftx062. -Iriarte, A., Giner-Lamia, J., Silva, C., Betancor, L., Astocondor, L., Cestero, J.J., Ochoa, T., García, C., Puente, J.L., Chabalgoity, J.A., The SalmoIber CYTED Network, and García-del Portillo, F. 2017. Draft Genome Sequence of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Infantis Strain SPE101, Isolated from a Chronic Human Infection. Genome Announcements. 5:e00679-17. doi.org/10.1128/genomeA.00679-17. -Montero, D.A., Velasco, J., del Canto, F., Puente, J.L., Padola, N., Rasko, D.A., Farfán, M., Salazar, J.C. and Vidal, R. 2017. Locus of Adhesion and Autoaggregation, a pathogenicity island present in emerging Shiga Toxin–producing Escherichia coli strains. Scientific Reports. 7:7011. doi:10.1038/s41598-017-06999-y -Quiñones-Peña, M.A., Tavizon, G. Puente, J.L., Martinez-Anaya, C., Hernandez-Chinas, U. and Eslava, C.A. 2017. Effects of static magnetic fields on the enteropathogenic Escherichia coli. Bioelectromagnetics, 38: 570-578. -Silva, C., Zavala-Alvarado, C. and Puente, J.L. 2017. Self-conjugation of the enteropathogenic Escherichia coli adherence factor plasmid of four typical EPEC isolates. BioMed Research International. 2017: 6325736. doi:10.1155/2017/6325736. -Silva, C., Betancor, L., García, C., Astocondor, L., Hinostroza, N., Bisio, J., Rivera, J., Perezgasga, L., Pérez-Escanda, V., Yim, L., Jacobs, J., García-del Portillo, F, the SalmoIber CYTED Network, Chabalgoity, J.A. and Puente, J.L. 2017. Characterization of Salmonella enterica isolates causing bacteremia in Lima, Peru, using multiple typing methods. PLoS ONE, 12, e0189946. -Sanchez-Reyez, A., Batista-Garcia, R.A., Valdes-Garcia, G., Ortiz, E., Perezgasga, L., Zarate-Romero, A., Pastor, N. and Folch-Mallol, J.L. 2017. A Family 13 thioesterase isolated from an activated sludge metagenome: Insights into aromatic compounds metabolism. Proteins, 85, 1222-1237. doi.org/10.1002/prot.25282. -Verdiguel-Fernandez, L., Oropeza-Navarro, R., Basurto-Alcantara, F.J., Castaneda-Ramirez, A. and Verdugo-Rodriguez, A. 2017. Omp31 plays an

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important role on outer membrane properties and intracellular survival of Brucella melitensis in murine macrophages and HeLa cells. Archives of Microbiology, 199, 971-978. -Velazquez-Guadarrama, N., Olivares-Cervantes, A.L., Salinas, E., Martinez, L., Escorcia, M., Oropeza, R., Rosas, I. 2017. Presence of environmental coagulase-positive staphylococci, their clonal relationship, resistance factors and ability to form biofilm. Revista Argentina de Microbiologia, 49, 15-23. -Ramirez-Castillo, F.Y., Loera-Muro, A., Vargas-Padilla, N.D., Moreno-Flores, A.C., Avelar-Gonzalez, F.J., Harel, J., Jacques, M., Oropeza, R., Barajas-Garcia, C.C. and Guerrero-Barrera, A.L. 2018. Incorporation of Actinobacillus pleuropneumoniae in Preformed Biofilms by Escherichia coli Isolated From Drinking Water of Swine Farms Frontiers in Veterinary Science, 5, 184. -Giner-Lamia, J., Vinuesa, P., Betancor, L., Silva, C., Bisio, J., Sotelo, L., Chabalgoity, J.A., Puente, J.L., The SalmoIber CYTED Network, and García-del Portillo, F. 2018. Genome analysis of Salmonella enterica subsp. diarizonae isolates from invasive human infections reveals enrichment of virulence-related functions in lineage ST1256. BMC Genomics. En prensa. -Montero, D.A., Del Canto, F., Velasco, J., Collelo, R., Padola, NL., Salazar, J.C., San Martin, C., Oñate, A., Blanco, J., Rasko, D.A., Contreras, C., Puente, J.L., Scheutz, F., Franz, E. and Vidal, R. Cumulative acquisition of pathogenicity islands has shaped virulence potential and contributed to the emergence of LEE-negative Shiga toxin-producing Escherichia coli strains. Emerging Microbes & Infections. Sometido. -Cornejo-Granados, F., Calderon de la Barca, A.M., Torres, N., Martinez-Romero, E., Torres, T., Lopez-Vidal, Y., Soberon, X., Partida-Martinez, L., Pinto-Cardoso, S., Alcaraz, L.D., Pardo-Lopez, L., Canizales-Quinteros, S., Puente, J.L. and Ochoa-Leyva, A. Microbiome-MX 2018: Microbiota and Microbiome opportunities in Mexico, a megadiverse country. Research in Microbiology. Sometido. Tesis concluidas -Alumnos Graduados Licenciatura -Álvaro Damián Morales Ibarra (RON) Tesis: Análisis de la regulación del gen dgcT por factores involucrados en la síntesis de biopelícula. Facultad de Ciencias Biológicas de la UA de Coahuila. 2017. -Gerardo Mejía Vázquez (RON) Tesis: Efecto de algunas diguanilato ciclasas y fosfodiesterasas sobre la formación de biopelícula en Escherichia coli. Facultad de Ciencias, UNAM. 2017. -Julio Manuel Méndez Alemán (RON).

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Tesis: Análisis de la regulación transcripcional del gen stdA de Salmonella Enteritidis 49214. Facultad de Veterinaria, UNAM. 2017. -Stephanie Ortiz Jiménez (JLP). Tesis: Análisis de la regulación de operones fimbriales de la familia C/U (chaperona/usher) de Citrobacter rodentium. Facultad de Ciencias, UNAM. 2018. Maestría -María Inés Isidro Coxca (JLP). Tesis: Estudio sobre la regulación del operón fimbrial ecp de Citrobacter rodentium. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Fecha de examen: 12 de junio de 2018. Doctorado -David Arturo Montero Forero (JLP). Tesis: Locus de adhesión y autoagregación (LAA), una nueva isla de patogenicidad presente en cepas emergentes de Escherichia coli productor de shiga toxina. Programa de Doctorado en Ciencias Biomédicas. Facultad de Medicina, Universidad de Chile. Co-dirección con el Dr. Roberto Mauricio Vidal. Fecha de examen: 6 de noviembre de 2018. Docencia R. Oropeza -Fisiología Microbiana, Licenciatura en Biología. Facultad de Ciencias, UNAM. (Docente). Impartido en Instituto de Biotecnología de 30/01/2017 a 02/06/2017. -"Fisiología microbiana: Transcripción, regulación y sistemas modelo para el estudio de la patogénesis y la ecología bacteriana". Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Coahuila. 28 de agosto al 1 de septiembre de 2017. Duración 40 hrs. -"Microbiología molecular: Regulación, virulencia y ecología". Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Coahuila. 29 al 30 de mayo de 2018. Duración 20 hrs. -"Aspectos selectos de regulación, virulencia y formación de biopelículas en bacterias". Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Coahuila. 15 al 19 de octubre de 2018. Duración 20 hrs. Supervisión de estancias de investigación: -Asesor de la alumna María José Castro Alonso, de la carrera de Ingeniero en Bioquímica, de la Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Coahuila durante su estancia en el XXVII Verano de la Investigación Científica, con el proyecto "Efecto de la diguanilato ciclasa YeaJ en la síntesis de biopelícula en Escherichia coli Enteropatógena". Julio a Agosto de 2017.

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-Asesor de la alumna Nancy Belem Beltrán Maldonado, de la Maestría de Ciencias de la Salud y la producción Animal, de la Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, UNAM durante una estancia de verano, con el proyecto "Clonación del gen groEL de Brucella canis". Julio a Agosto de 2017. -Asesor de la Dra. Miriam Paulina Luévanos Escareño, Catedrático Investigador, de la Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma de Coahuila durante su estancia de Investigación, con el proyecto "Expresión del gen LmPH en microorganismos degradadores de fenol". Junio de 2017. J.L. Puente

• Responsable y profesor del taller "La Biología a partir de las biomoléculas; nuevos paradigmas y aplicaciones", niveles I, II, III y IV. Licenciatura en Biología. Facultad de Ciencias, UNAM. Semestres 2017-2 a 2019-1.

• Profesor y responsable de la asignatura optativa Fisiología Microbiana. Facultad de Ciencias, UNAM. Semestre 2017-2 (junto con el Dr. Ricardo Oropeza).

• Coordinador del Programa de Servicio Social “Apoyo a la investigación en el Instituto de Biotecnología de la UNAM”. Semestre 2017-2-2019-1.

• Responsable y coordinador del Tópico Selecto del Programa de maestría y doctorado en Ciencias Bioquímicas. “Avances en el estudio del microbioma / microbiota en México” Semestre 2018-2 (junto con el Dr. Adrián Ochoa Leyva y M. En C. Fernanda Cornejo). Divulgación -Puente, J.L. y Calva, E. 2017. El cocoliztli: armas biológicas involuntarias durante la conquista de México. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 10, 29-32. Organización de eventos académicos -40º Congreso de la Asociación Mexicana de Microbiología. Comité organizador junto con el Dr. Alfredo Herrera. Hotel Fiesta Americana, Guadalajara, Jal. 2 al 5 de abril del 2017. -Cuarta Reunión de la Red Temática CYTED: ‘Control de Salmonelosis en Iberoamérica’ (SALMOIBER)– México 2017. Comité organizador junto con la Dra. Claudia Silva. Club de Banqueros. Ciudad de México (CDMX). 2 al 6 de mayo de 2017. Distinciones -Presidente de la Asociación Mexicana de Microbiología 2017-2019. -Editor Journal of Medical Microbiology 2018-2021.

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Donativos J.L. Puente

• Ciencia Básica-CONACyT. Clave 239659. Febrero 2015- enero 2018.

• PAPIIT-DGAPA-UNAM. Clave IN213516. Enero 2016-diciembre 2018.

• PRODECYT-DADC. Clave 279417-C-64/2017

• Fronteras de la Ciencia. CONACyT. Clave: 2015-02-950. Enero 2017- diciembre 2018. R. Oropeza • PAPIIT-DGAPA-UNAM. “Proteínas involucradas en el balance de di-GMP cíclico (dGc) intracelular y su papel en la síntesis de biopelícula y en la expresión de factores de virulencia en Escherichia coli. Clave del Proyecto IN209216. Inicio Enero 2017. • Ciencia Básica-CONACyT. Formación de biopelículas y virulencia en Escherichia coli: papel de nuevos reguladores que modulan los niveles de segundos mensajeros intracelulares. Clave del Proyecto 252895. Inicio Junio 2017. Título de los carteles María Inés Isidro-Coxca, Verónica I. Martínez-Santos, Andrés Escalera, Abraham Medrano-López, Gustavo Caballero-Flores, Alejandra Vázquez and José Luis Puente. The Citrobacter rodentium ecp fimbrial operon is positively regulated by the putative phosphodiesterase CreR. Stephanie Ortiz Jiménez, Gustavo G. Caballero-Flores and José Luis Puente. Analysis of the regulation and function of chaperone-usher fimbrial operons in Citrobacter rodentium.

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Dr. José Luis Reyes Taboada Departamento de Biología Molecular de Plantas, IBT-UNAM. “Una historia de dos caras: Los RNA mensajeros en plantas se regulan por microRNAs y metilación” Resumen Las plantas son organismos sésiles que se encuentran expuestos a los cambios que ocurren en su medio ambiente. Por ello, han desarrollado diversos y eficientes mecanismos para contender con distintos factores externos, dentro de los cuales se encuentran factores abióticos como las temperaturas extremas, la intensidad y calidad luminosa, la calidad del aire y el suelo, o la disponibilidad de agua para su crecimiento. Nuestro grupo se ha enfocado en el estudio de las respuestas ante deficiencias en la disponibilidad del agua, o déficit hídrico, considerándolo un factor importante para el crecimiento y desarrollo vegetal y, por tanto, para la productividad agrícola. Uno de las etapas de la expresión génica que se regula finamente en plantas ocurre a nivel post-transcripcional, mediante la regulación de la vida media, destino, o traducibilidad de los RNAs mensajeros. En este contexto, en el grupo hemos decidido estudiar dos vías que recientemente han surgido como relevantes en diferentes sistemas biológicos para regular el metabolismo de los RNAs mensajeros: la vía mediada por microRNAs y aquella mediada por la metilación post-transcripcional de adeninas. microRNAs involucrados en la respuesta a déficit hídrico en leguminosas El descubrimiento de los RNAs pequeños como reguladores de la expresión génica motivó la pregunta de cuál es la participación de los microRNAs y otros RNAs pequeños en la regulación de la respuesta de frijol y, en general de las leguminosas, ante condiciones de limitación de agua. Nuestro trabajo ha revelado la relevancia de varios microRNAs y recientemente hemos concluido estudios sobre miR1514a y miR2119 y su participación durante condiciones de déficit hídrico. Estos estudios revelaron propiedades novedosas de estos microRNAs durante su biogénesis y mecanismos de acción. Actualmente seguimos trabajando en este aspecto, analizando las funciones de miR396 y miR2199 en condiciones de limitación de agua, además de otros microRNAs involucrados en la interacción frijol:Rhizobium. Papel de la metilación de RNA en la respuesta a estímulos ambientales y en el desarrollo de plantas terrestres La metilación de residuos de adenosina (m6A) es la modificación post-transcripcional más abundante en RNAs mensajeros tanto en plantas como animales (sólo después de la modificación del cap). Sin embargo, se desconoce cuál es su importancia en la regulación de la expresión de los mRNAs aunque algunos indicios han surgido recientemente. La modificación m6A en ciertos

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residuos puede modificar la estructura secundaria del RNA o puede afectar su localización, traducción, u otros procesos. En plantas se conoce poco sobre los mecanismos que regulan y las consecuencias de esta modificación, por lo que estamos estudiando los diferentes factores que participan en esta vía empleando varios modelos vegetales, que incluyen la planta modelo Arabidopsis thaliana, y dos plantas basales Physcomitrella patens y Marchantia polymorpha. Integrantes del Grupo Investigador Dra. Claudia Díaz Camino Postdoctorado Dr. José Ángel Martín Rodríguez Doctorado M.C. Beatriz Pérez Morales M.C. Carlos Alfonso Sierra Sarabia M.C. Carlos De la Rosa Ureña Maestría Biol. David Garcias Morales I.Q. Luis Reyes Aguilar Alma Jenny García Mejía Q.F.B. Omar Guillermo Rosas Bringas Licenciatura Elisa Pacheco Orduña Edgar Omar Limón Cruz Publicaciones De la Rosa C., Reyes,J.L. Northern Blot Analysis of microRNAs and Other Small RNAs in Plants. Plant MicroRNAs: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, vol. 1932, en Prensa. De la Rosa C. Covarrubias,A.A. Reyes,J.L. 2018. A dicistronic precursor encoding miR398 and the legume-specific miR2119 co-regulates CSD1 and ADH1 mRNAs in response to water deficit. Plant Cell And Environment, Apr 6 [Epub ahead of print]. Alejandri-Ramirez,N.D. Chavez-Hernandez,E.C. Contreras-Guerra,J.L. Reyes,J.L. Dinkova,T.D. 2018. Small RNA differential expression and regulation in Tuxpeno maize embryogenic callus induction and establishment. Plant Physiology And Biochemistry, 122, 78-89.

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Perez-Morales,M.B. Covarrubias,A.A. Reyes,J.L. 2017. The key role of small RNAs in the making of a leaf. Indian Journal of Plant Physiology, 22, 393-400. Reyero-Saavedra,M.D.R. Qiao,Z. Sanchez-Correa,M.D.S. Diaz-Pineda,M.E. Reyes,J.L. Covarrubias,A.A. Libault,M. Valdes-Lopez,O. 2017. Gene Silencing of Argonaute5 Negatively Affects the Establishment of the Legume-Rhizobia Symbiosis. Genes, 8 (12), 352. Cuevas-Velazquez,C.L. Reyes,J.L. Covarrubias,A.A. 2017. Group 4 Late Embryogenesis Abundant Proteins as a Model to Study Intrinsically Disordered Proteins in Plants. Plant Signaling and Behavior, 12 (7) 10893-10903. Sosa-Valencia,G. Romero-Perez,P.S. Palomar,M. Covarrubias,A.A. Reyes,J.L. 2017. Insights into the function of the phasiRNA-triggering miR1514 in response to stress in legumes. Plant Signaling and Behavior, 12 (3), e1284724. Sosa-Valencia,G. Palomar,M. Covarrubias,A.A. Reyes,J.L. 2017. The Legume miR1514a modulates a NAC transcription factor transcript to trigger phasiRNA formation in response to drought. Journal of Experimental Botany, 68 (8), 2013-2026. Alumnos Graduados Guadalupe Sosa Valencia (Doctorado). Carlos Alfonso Sierra (Maestría). David Garcias (Licenciatura). Participación en docencia Biología Vegetal: 3 h al semestre (Otoño) Biología Molecular: 9 h al semestre (Primavera) RNAs pequeños: Responsable, 45 h al semestre (Otoño) Divulgación Miembro del Comité Editorial de Biotecnología en Movimiento, Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM (2015-2018). Reyes-Taboada J.L. 2017. Entendiendo a aquellos que silencian información genética: los ARN pequeños. Biotecnología en Movimiento. Revista de divulgación del Instituto de Biotecnología de la UNAM, 8, 20-21. Donativos Fronteras de la Ciencia, CONACYT 2015-186 (2016-2018) DGAPA-PAPIIT IN-205015 (2015-2017).

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DGAPA-PAPIIT IN-202918 (2018-2020). Títulos y autores de los carteles que presentará el grupo. Carlos De la Rosa Ureña A dicistronic precursor encoding miR398 and the legume-specific miR2119 co-regulates CSD1 and ADH1 mRNAs in response to water deficit. Alfonso Sierra Sarabia Fabaceae miR2199 regulates a bHLH transcription factor mRNA in response to water deficit. David Garcias Morales m6A in mRNA regulates key developmental transitions in Physcomitrella patens Jose Ángel Martín Rodríguez Papel de ECT8, un posible lector de metilación de mRNA en la respuesta a estrés abiótico en Arabidopsis

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Dra. Laura A. Palomares Aguilera Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, IBT-UNAM. “Entendiendo el efecto de la fisiología celular en la productividad y calidad de anticuerpos monoclonales” Juan Carlos Rivera, Alfonso Gómez, Vanessa Hernández, Arturo Pimentel, Frania J. Zúñiga-Bañuelos, Octavio Tonatiuh Ramírez, Laura A. Palomares Resumen Los anticuerpos monoclonales recombinantes son medicamentos para el tratamiento de una amplia variedad de enfermedades, como el cáncer, artritis reumatoide, hemofilia, psoriasis, asma, infecciones virales, y otras. Los anticuerpos monoclonales son glicoproteínas con modos de acción dependientes tanto de su unión al antígeno como a su función efectora. La función efectora es dependiente del patrón de N-glicosilación de la fracción cristalizable del anticuerpo y la unión al antígeno puede ser afectada por modificaciones químicas de los aminoácidos que los conforman. Por lo tanto, es necesario obtener anticuerpos con calidad reproducible. El efecto de las condiciones extracelulares en el patrón de glicosilación de anticuerpos ha sido extensamente evaluado, pero el efecto de las condiciones intracelulares requiere ser estudiado. En esta presentación se discutirá la interacción entre las condiciones extracelulares con el ambiente intracelular, y el efecto de estas interacciones en un anticuerpo producido en células de ovario de hámster chino. Integrantes del consorcio Consorcio “Ingeniería de Bioprocesos para la Producción de Proteínas Recombinantes Complejas” Líderes Académicos Laura A. Palomares (LAP) Octavio Tonatiuh Ramírez (OTR) Técnicos Académicos Martha Alicia Contreras (OTR) Vanessa Hernández Rodríguez (OTR) Ana Ruth Pastor Flores (LAP) Investigadores Ana Carolina Alcalá Aristiguieta (LAP) Norberto Cruz García (LAP) Lilí Esmeralda Gallo Ramírez (LAP) Michelle Gutiérrez Mayret (LAP) Karim Enrique Jaen Chávez (OTR)

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Juan Andrés Martínez Álvarez (OTR) Mabel Rodríguez González (LAP) Estudiantes Doctorado Dubhe Beatriz Bulte Ocaña (OTR) Esmeralda Cuevas Juárez (LAP) Violeta Guadarrama Pérez (LAP) Enrique Paz Cortés (LAP) Juan Carlos Rivera Castro (LAP) Francisca Villanueva Flores (LAP) Maestría Ricardo Antonio González Lizardi (LAP) Arturo Liñán Torres (LAP) Yahel Francisco López Reyes (LAP) Itandehui Alhelí López Martínez (OTR) Víctor Manuel López Saldaña (OTR) Wendy Stfanny Meza Soto (LAP) Yaice Berenice Sandoval Ramírez (OTR) Laura Sevilla Tapia (LAP) Selene Jocelyn Uribe Romero (LAP) Licenciatura Daniel Barreto Cabrera (tutor Mabel Rodríguez) Andrés Castro Lugo (tutor Francisca Villanueva) Elías Rafael Ruiz Morales (LAP) Karla Solís Quintero (tutor Ana Alcalá) Zianya Natalia Tonajero Bazán (tutor Ana Alcalá) Técnicos por proyecto Juan Carlos Arizmendi Arizmendi Ramón Carrasco Macías Luís Alberto Díaz Díaz Julio César Fabián Macedo Edgar Armando García Ortega Alfonso Gómez Aguirre Karin Levy Popp Miguel Ángel Mendoza Vera Lidia Beatriz Piñones Martínez Alberto Porras Sanjuanico Administración y Laboratorista Larisa Campos Íñiguez María Xóchitl González Candelario.

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Productividad del Grupo de LA Palomares (2017-2018) Publicaciones Revistas internacionales arbitradas Hidalgo D, Paz E, Palomares LA*, Ramírez OT* (2017) Real-time imaging reveals unique heterogeneous population features of insect cells. Journal of Biotechnology. 259: 56-62. Palomares LA*, Mukhopadhyay TK, Genzel Y, Lua LHL, Cox MMJ (2018) Vaccine Technology VI: Innovative and integrated approaches in vaccine development. Vaccine. 36: 3061-3063. Gómez IA, Hernández V, Palomares LA, Ramírez OT* (2018) Flocculation of CHO cells for primary separation of recombinant glycoproteins: Effect on glycosylation profiles. Biochemical Engineering Journal. 132: 244-254. Alcalá AC*, Palomares LA, Ludert JE* (2018) Secretion of the non-structural protein 1 of dengue virus from infected mosquito cells: facts and speculations. Journal of Virology. 92: e00275-18. Espíritu-Ramírez P, Ortega-Balderas NY, Sevilla-Tapia L, Montiel-Martínez AG, Pastor-Flores AR, Palomares LA, Torres-Vega MA* (2018) Gene therapy for treatment of chronic hyperammonemia in a rat model of hepatic encephalopatly. Annals of Hepatology. 17: 1026-1034. Villanueva-Flores F, Miranda-Hernández M, Flores-Flores JO, Porras-Sanjuanico A, Hu H, Pérez-Martínez L, Ramírez OT, Palomares LA*. Poly(vinyl alcohol co-vinyl acetate) as a novel scaffold for mammalian cell culture and controlled drug release. Sometido. Edición de publicaciones Palomares LA (editora en jefe), Mukhopadhyay TK, Genzel Y, Lua LHL, Cox MMJ (2018) Special issue for Vaccine Technology VI. Vaccine 36(22). Edición conformada por 18 artículos de investigación original. Capítulos en libros internacionales Lara AR, Palomares LA, Ramírez OT. “Scale Down: Simulating Large-Scale Cultures in the Laboratory” En: Industrial Biotechnology; Liao J, Wittmann C (eds.) Wiley Biotechnology Series. 55-79. DOI: 10.1002/9783527807833.ch2. Palomares LA, Srivastava IK, Ramírez OT, Cox MMJ (2018) Glycobiotechnology of the insect cell-baculovirus expression system technology. En: Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology. Rapp E, Rhiel U (eds.) Springer, Berlin. En prensa. DOI: 10.1007/10_2018_61. Publicaciones nacionales y otras Castro Peralta F, Cuevas Juárez E, Palomares LA* (2017) La Virología en la Industria Farmacéutica. En: Arias, C (ed) La Virología en México: Situación Actual, Retos y Oportunidades. pp. 146-157.

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Alumnos Graduados Maestría María Carolina Gómez Parra Frania Jaqueline Zúñiga Bañuelos David Silverio Moreno Gutiérrez Juan Carlos Rivera Castro Licenciatura Gonzalo González Domínguez (Tutor Ana Ruth Pastor) Norma Mendoza González (Tutor Francisca Villanueva) Elizabeth López Sánchez (Tutor Ana Alcalá) Alberto Porras Sanjuanico Diana Marisol Vázquez Enciso Participación en docencia Palomares LA. Docente en cursos de posgrado Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Doctorado en Ciencias Biomédicas, Licenciatura en Ciencias Genómicas. 57 h frente a grupo. Pastor AR. “Bioseguridad en el manejo de cultivos celulares”, “Hojas de seguridad (HDS) de reactivos químicos” y s capacitación práctica sobre la atención a derrames químicos y biológicos, en el curso interno de Bioseguridad. Dos veces al año. Palomares LA. Producción de glicoproteínas. Glicobiología humana. Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 2017, 2018. 4 h impartidas. Palomares LA y grupo. Curso para la iniciativa privada, responsable y docente. Análisis de flujos metabólicos en cultivos de células animales. 15 a 17 de enero 2108. Palomares LA. Seminario “Nuevas tecnologías en el mundo de los medicamentos” Tema: Nuevas Tecnologías en Vacunas. Impartido a dictaminadores de la COFEPRIS. 2 de febrero 2018. 1 h impartida. Palomares LA. Capacitación para la COFEPRIS. Vacunas: Desarrollo, formulación, fabricación, tendencias en el control sanitario y comparativos de proceso de registro. Temas: Fabricación, parámetros de calidad, especificaciones y controles de proceso. 19 a 21 de febrero, 2018. 3 h impartidas. Palomares LA y grupo. Curso para la iniciativa privada, responsable y docente. Principios teóricos y prácticos del cultivo de células animales. 20-23 agosto 2018. Pastor AR. Bioingeniería del cultivo de células eucariotes superiores. Ingeniería de Bioprocesos para la producción de proteínas recombinantes de uso terapéutico. Curso Introducción a la Toxinología, Producción de antivenenos, cultivos celulares y a la cristalografía de proteínas para la Universidad de las Américas, Ecuador. 3-7 septiembre 2018. Palomares LA. “Cell culture strategies for enhanced glycoprotein production” y “Recombinant vaccines”. Therapeutic mammalian cell-derived glycoproteins: design, expression and glycosylation analysis. Universidad Nacional del Litoral-ICGEB. Santa Fe, Argentina. 3-9 de septiembre 2018. 3 h impartidas.

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Pastor AR. Medios de cultivo y líneas celulares de interés industrial. Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 2018. 1.5 h impartidas. Desarrollo tecnológico Gutierrez-Mayret M y LA Palomares. Desarrollo de líneas celulares en colaboración con OzBio. 2017-2018. Equipo LT01. Desarrollo de tecnología y una transferencia tecnológica a Laboratorios Liomont. Responsable de la transferencia. Desarrollo de un proceso de producción de un anticuerpo monoclonal. 2017 y 2018. Jaen K, Fabián J, Contreras MA, Palomares LA, Ramírez OT. Desarrollo tecnológico con BioSen. 2018. Asesoría científica y técnica para el registro de Flublok tetravalente (primera vacuna recombinante contra influenza) y transferencia de tecnología a México, con Laboratorios Liomont. 2017 y 2018. Colaboración con Laboratorio AVIMEX S.A. de C.V. para el desarrollo de procesos para la producción de vacunas vectorizadas. 2017. Miembro del Subcomité de Evaluación de Productos Biotecnológicos del Comité de Moléculas Nuevas. COFEPRIS. Secretaría de Salud. 2013 a la fecha Asesora científica. Protein Sciences Corporation. 2012 a 2017. Experta del Comité de Productos Biotecnológicos de la Farmacopea de los Estados Unidos Mexicanos. 2009 a la fecha. Divulgación Entrevista en programa televisión “Techo de Cristal”. Instituto Morelense de la Radio y la Televisión. Mayo 2017. Entrevista a revista “Contenido”. Mayo 2017. Pastor AR y alumnos. Talleres y presentación en la Feria de la Ciencia. Secretaría de Innovación, Ciencia y Tecnología del Estado de Morelos. 2017. Beneficios y oportunidades de los medicamentos biocomparables en México. Senado de la República. Noviembre 2017. Entrevista Creadores universitarios. Diciembre 2017. Pastor AR. Taller “Cazando bichos y armando tu propio virus” para niños con capacidades sobresalientes, normales, deficiencia auditiva, deficiencia visual, deficiencia en el desarrollo, deficiencia intelectual, deficiencia motora, déficit de atención o autismo. Cuernavaca, Mor., 21 de marzo de 2018 Pastor AR “Tercer día de Puertas Abiertas del IBt”. Participante como Coordinador de Monitores y Edecanes. Cuernavaca, Mor. 20 de abril de 2018. Tercer día de puertas abiertas. Participación del grupo con obras de teatro, talleres, conferencias y apoyo en la organización. Entrevista en programa de radio “La araña patona”. Radio UNAM. Abril. 2018. Donativos Estudio del papel del metabolismo central de carbono y el potencial redox celular sobre la N-glicosilación de proteínas. CONACyT Ciencia Básica. 2016-2019 Desarrollo de procesos para la producción de vacunas. Programa de Estímulos a la Innovación. 2015-2017.

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Desarrollo y optimización de un clon productor de un anticuerpo monoclonal y comparabilidad con producto de referencia. Laboratorios Liomont. 2014 - a la fecha. Monitoreo e ingeniería celular para la producción de anticuerpos monoclonales y proteínas recombinantes. PAPIIT, UNAM IT200315. 2015-2017. Desarrollo de una vacuna contra virus Zika y Dengue sin efecto amplificador de la infección. PAPIIT-UNAM IT200418. 2018-2020. Títulos y autores de los cárteles que presentará el grupo. Ana C. Alcalá, Laura A. Palomares. Participación del Scavenger Receptor B1 en la entrada de la proteína NS1 de los virus dengue y Zika en células humanas y de insecto. Ana Ruth Pastor, Gonzalo González-Domínguez, Octavio Tonatiuh Ramírez y Laura A. Palomares. Defining the multiplicity and type of infection for the production of Zaire Ebola virus-like particles in the insect cell baculovirus expression system. Mabel Rodríguez, Ricardo M. Castro-Acosta, Elías R. Ruiz-Morales, Francisca Villanueva-Flores, Octavio Tonatiuh Ramírez y Laura A. Palomares. Ensamblaje in vitro de nanotubos formados por la proteína VP6 de rotavirus utilizando un método novedoso, sencillo y fácilmente escalable. Francisca Villanueva-Flores, Andrés Castro-Lugo, Mathieu Hautefeuille, Félix E. Cerón-Vera, Octavio Tonatiuh Ramírez and Laura A. Palomares. Implantable BioChipVP6 for neural tissue engineering.

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Dra. Leonor Pérez Martínez Consorcio de Neuroinmunobiología Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, IBT – UNAM. “Inflamación y disfunción neuronal” Resumen En nuestro grupo de investigación se combinan las áreas de neurociencias e inmunología para determinar cómo la inflamación altera el funcionamiento del sistema nervioso en regiones específicas del cerebro, resultando así, en alteraciones en el desarrollo del sistema nervioso en el embrión y en la generación de diferentes patologías como la enfermedad de Alzheimer y diabetes tipo II, en el adulto. La visión clásica de que un proceso inflamatorio se iniciaba solo por la activación de células del sistema inmune en respuesta a patógenos o al daño tisular, ha cambiado en los últimos años; ahora sabemos que este proceso inflamatorio lo puede activar prácticamente cualquier célula del organismo. Estudios recientes indican que tanto señales de daño derivadas de alteraciones en el metabolismo (colesterol, lípidos, ácido úrico, niveles elevados de glucosa) como la deposición de placas β-amiloide en el cerebro inducen, por diferentes mecanismos, el ensamblaje del inflamasoma, con la consecuente activación de caspasa-1 y la producción de citocinas pro-inflamatorias como IL-1β e IL-18; iniciando así, un proceso inflamatorio, que ante la continua presencia del insulto se perpetúa, eventualmente alterando la homeostasis del organismo. En este contexto, presentaré evidencias que indican que un proceso inflamatorio ya sea de origen periférico o central compromete la capacidad cognitiva en el adulto y el desarrollo del sistema nervioso central en etapas embrionarias; así como, las estrategias que estamos usando para contrarrestar esta inflamación. Específicamente, discutiré el papel de la proteína KChiP3 (o DREAM o Calsenilin) en el deterioro cognitivo inducido por un proceso inflamatorio periférico y en el deterioro cognitivo asociado a la enfermedad de Alzheimer instigado por el proceso neuroinflamatorio resultante de la acumulación de péptidos β-amiloides. Dado el impacto de la inflamación en el funcionamiento del sistema nervioso central, para nosotros es prioritario aplicar el conocimiento generado a través de nuestras investigaciones para desarrollar nuevas estrategias biotecnológicas encaminadas a contrarrestar la inflamación. En este sentido, presentaré la caracterización de los efectos de un extracto estandarizado de Malva parviflora con actividad anti-inflamatoria y neuroprotectora en la progresión de la enfermedad de Alzheimer. Referente al proceso inflamatorio y su efecto en el desarrollo del sistema nervioso central, presentaré los avances del proyecto encaminado a demostrar que la respuesta antiviral iniciada por la presencia del virus Zika, a través de modular el perfil de expresión de microRNAs específicos, altera el desarrollo del sistema nervioso central. Así también, las evidencias que sugieren que la respuesta inmune antiviral durante el desarrollo embrionario provoca cambios conductuales en la progenie relacionados con autismo y depresión.

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Integrantes del Grupo 2017-2018 Investigador Adscrito Dra. Martha Pedraza Escalona Estudiantes de doctorado - M.C. Angélica Garduño - M.C. Miriam Martínez Armenta - M.C. Ma. del Sol Díaz de León - Lic. Elisa Medrano - M.C. Rubiceli Manzo Durán - Biól. Bolívar Jesús Arcos Encarnación - M.C. Roberto Carlos Licea Cejudo - M.C. Cristina Elizabeth Ramírez Serrano Estudiantes de maestría - Biól. Jimena Alejandra López - Biól. Tonali Blanco Ayala - QFB Roberto Carlos Liceo Cejudo - Biól. Cristina E. Ramírez Serrano - Biól. Uriel Pineda Solís - Biól. María Elizabeth Santana Román - Lic. Humberto Martínez Álvarez - Lic. Rubén Asgard Castorena Anaya Estudiantes de licenciatura - Eladio Cortés Flores - Abigail García Radilla (dirigida por la Dra. Pedraza Escalona) - Alonso Ortega Gurrola - Uriel Pineda Solís - José Antonio Urbán Aragón Estudiantes estancia temporal - Larisa Morales. Licenciatura en Ciencias Genómicas. Agosto 2017-Agosto 2018 - Paola Arguello. Licenciatura en Ciencias Genómicas. Enero 2017-Diciembre 2017 - Mariana Rivero. Licenciatura en Ciencias Genómicas. Enero 2018-Junio 2018 - Ana María Soto Rincón. Licenciatura en Ingeniería de Biotecnología. Universidad Tecnológica de Corregidora, Qro. Enero-Abril 2018 Asistente Ejecutivo Leonel Linares Labastida/Clara Maritza Díaz Auxiliar de Laboratorio María del Carmen Gante Villa Publicaciones 2017-2018 1. Lourdes Álvarez-Arellano, Martha Pedraza-Escalona, Tonali Blanco-Ayala, Nohemí, Camacho-Concha, César Cortez-Mendoza, Leonor Pérez-Martínez and Gustavo Pedraza-Alva*. (2018). Autophagy impairment by caspase-1-dependent inflammation mediates memory loss in response to beta-Amyloid peptide accumulation. J. of Neuroscience Research 96, 234-246.

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2. Tomás Villaseñor-Toledo, Edgardo Madrid-Paulino, Rafael Maldonado-Bravo, Leonor Pérez-Martínez and Gustavo Pedraza-Alva. (2017). Activation of the Wnt pathway by Mycobacterium tuberculosis: a Wnt-Wnt situation. Frontiers in Immunology, 8, 50. 3. Elisa Medrano-Jiménez1#, Itzia Jiménez-Ferrer Carrillo1#, Martha Pedraza-Escalona1#, Lourdes Álvarez-Arellano1,†, Javier Cortés-Mendoza1, Maribel Herrera-Ruiz2, Enrique Jiménez-Ferrer2, Alejandro Zamilpa2, Jaime Tortoriello2, Gustavo Pedraza-Alva1 and Leonor Pérez-Martínez1*. Malva parviflora extract ameliorates the deleterious effects of high fat diet on the cognitive deficit in a mouse model of Alzheimer´s disease by restoring microglial function via a PPARgamma dependent mechanism. En revisión en Journal of Neuroinflammation, JNEU-D-18-00683. 4. Cristina E. Ramírez Serrano1, Enrique Jiménez-Ferrer2*, Maribel Herrera-Ruiz2, Alejandro Zamilpa2, Gabriela Vargas-Villa2, Jaime Tortoriello2, Gustavo Pedraza-Alva1 and Leonor Pérez-Martínez1*. A Malva parviflora´s fraction prevents the deleterious effects resulting from neuroinflammation. Sometido a Biomedicine and Phamacotherapy, BIOPHA_2018_6955. 5. Salazar-León Jonathan, Valdez-Hernandez Ana Laura, García-Jiménez Sara#, Pérez-Martínez Leonor and Pedraza-Alva Gustavo*. Nlrp1b1 negatively modulates obesity-induced inflammation by promoting IL-18 production. Sometido a Scientific Reports, SREP-18-377708. 6. Tomás Villaseñor, Edgardo Madrid-Paulino, Rafael Maldonado-Bravo, Leonor Pérez-Martínez and Gustavo Pedraza*. Mycobacterium bovis BCG promotes IL-10 expression by establishing a SYK/PKCα/β positive autoregulatory loop that sustains STAT3 activation. Sometido a Frontiers in Immunology. 7. Nilda C. Sánchez1, Elisa Medrano-Jiménez1, Diana Aguilar2, Leonor Pérez-Martínez1, Gustavo Pedraza-Alva1*. TNF-induced miR-146a upregulation promotes human lung adenocarcinoma metastasis by targeting Merlin. Sometido a American Journal of Cancer Research. 8. Santos Ramírez-Carreto1, Erick I. Pérez-García1, Sandra I. Salazar-García1, Johanna Bernaldez Sarabia2, Alexei Licea-Navarro2, Enrique Rudiño-Piñera1, Leonor Pérez-Martínez1, Gustavo Pedraza-Alva1, Claudia Rodríguez-Almazán1*. Identification of a pore forming protein from the sea anemone Anthopleura dowii Verril (1869) venom by mass spectrometry. En revisión en Journal of Venomous Animals & Toxins including Tropical Diseases, JVAT-D-18-00063R1. 9. Francisca Villanueva-Flores, Margarita Miranda-Hernández, José O. Flores-Flores, Alberto Porras-Sanjuanico, Hailin Hu, Leonor Pérez-Martínez, Octavio T. Ramírez, and Laura A. Palomares*. Poly(vinyl alcohol co-vinyl acetate) as a novel scaffold for mammalian cell culture and controlled drug release. Sometido a Journal of Materials Science (JMSC), JMSC-D.18-09448. Alumnos Graduados 2017-2018 Licenciatura 1. José Antonio Urbán Aragón. “Papel de los microRNAS miR-146a, miR-125a/b, miR-181b y miR 223 en el desarrollo de la resistencia a insulina/leptina en el hipotálamo” Licenciatura en Ciencias Genómicas-UNAM.Obtención de grado Febrero 10, 2017

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2. Alonso Ortega Gurrola. “Papel del cluster de miR-106b-25 en el desarrollo hipotalámico murino”. Facultad de Ciencias-UNAM. Obtención de grado: Junio 22, 2017 Maestría 1. Tonali Blanco Ayala. “Efecto del proceso inflamatorio inducido por la presencia de péptidos β-amiloides sobre la función mitocondrial en células de la microglía en un modelo murino de la enfermedad de Alzheimer”. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Obtención de grado: Agosto 10, 2017 2. Jimena Alejandra López Mejía. “Función de miR-7 en el control post-transcripcional de las proteínas del citoesqueleto Septina1, Septina8 y Profilina2 y su importancia en la diferenciación neuronal hipotalámica”. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Obtención de grado: Septiembre 6, 2017 3. Roberto Carlos Licea Cejudo. “Determinación de la relación entre la longitud de los telómeros y la obesidad en niños mexicanos”. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Obtención de grado: Agosto 22, 2017 4. Cristina Elizabeth Ramírez Serrano. “Efecto de una fracción estandarizada de Malva parviflora con propiedades anti-inflamatorias en un modelo murino de la enfermedad de Alzheimer”. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Obtención de grado: Agosto 18, 2017 Doctorado 1. Miriam Martínez Armenta. “El papel del KLF10 en la expresión del gen de TRH durante la etapa de diferenciación terminal hipotalámica”. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Obtención de grado Junio 14, 2017 Participación en docencia 2017-2018 1. Profesor en la Licenciatura en Ciencias Genómicas con sede en el Centro de Ciencias Genómicas-UNAM. Coordinación del Curso básico Biología Celular 2017-1, 2017-2, 2018-1, 2018-2. 2. Curso-Taller La biología a partir de las biomoléculas; nuevos paradigmas y aplicaciones. Tema: “Mecanismos moleculares que controlan la diferenciación neuronal”. Facultad de Ciencias-UNAM. 3. Curso optativo Biología Celular, Tema: Señalización. Segundo semestre 2017 y 2018. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología-UNAM. 4. Tópico selecto “En la salud y en la Enfermedad: Bases moleculares de la comunicación entre el sistema inmune y el sistema nervioso central”. Responsable semestre 2018-1. Instituto de Biotecnología-UNAM. Desarrollo tecnológico Se registró la patente “Extracto hidroalcohólico de Malva parviflora y su uso para

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prevenir y/o tratar síntomas asociados a trastornos neurológicos crónicos-degenerativos” con número de registro MX/a/2016/002089. Divulgación 2017-2018 1. Leonor Pérez Martínez. Conferencia: “microRNAs, los pequeños grandes actores del desarrollo y funcionamiento del hipotálamo”. Seminario de Investigación interdisciplinaria en Biomedicina RAU-UNAM. Septiembre 20, 2018. 2. Leonor Pérez Martínez. Conferencia: “El desarrollo del cerebro y la infección con el virus ZIKA”. Taller: Enfoque Multidisciplinario para enfrentar el desafío de las enfermedades arbovirales en América, Instituto Nacional de Salud Pública. Septiembre 22, 2018. 3. Leonor Pérez Martínez. Conferencia: “microRNAs, los pequeños grandes acores del desarrollo y funcionamiento del hipotálamo”. Instituto Nacional de Medicina Genómica (INMEGEN). Septiembre 14, 2018 4. Leonor Pérez Martínez. Conferencia: “El poder de la curiosidad”. Colegio de Bachilleres. Jayacatlán, Etla Oaxaca. Julio 6, 2018 5. Leonor Pérez Martínez. Conferencia: “Molecular aspects of the developing hypothalamus: the role of microRNAs”. Symposium: Neurodevelopment. II Neurobiology meeting of the Mexican Society for Biochemistry. Querétaro, Qro. Octubre 15-18, 2017. 6. Leonor Pérez Martínez. Conferencia: “Un paradigma de ambiente enriquecido mejora la homeostasis de la glucosa y modula las vías inflamatorias en el hipotálamo de ratones obesos: la función de los microRNAs”. III Jornadas de Inflamación, una visión translacional. Instituto Mexicano del Seguro Social, Sociedad Mexicana de Inmunología, Sociedad Mexicana de Neuroinmunoendocrinología. Ciudad de México, México. Noviembre 6-8, 2017. 7. Roberto Carlos Licea Cejudo, Gustavo Pedraza Alva y Leonor Pérez Martínez (2018). Obesidad infantil: crónica de una vejez anunciada. Revista: Biotecnología en movimiento Núm. 12, 6-9. https://biotecmov.files.wordpress.com/2018/08/bm12.pdf 8. Reconocimiento a la Dra. Leonor Pérez Martínez (2018). Revista: Biotecnología en movimiento Núm. 12, 6-9. https://biotecmov.files.wordpress.com/2018/08/bm12.pdf 9. Roberto Carlos Licea Cejudo, Gustavo Pedraza Alva y Leonor Pérez Martínez (abril 23, 2018). Obesidad infantil: crónica de una vejez anunciada. CONACYT ID. http://invdes.com.mx/los-investigadores/obesidad-infantil-cronica-una-vejez-anunciada/ 10. Participación en el 3er día de Puertas abiertas del Instituto de Biotecnología-UNAM. Abril 20, 2018. 11. Artículo: Del ADN a la neurona: un vistazo a la expresión génica del cerebro (mayo 7, 2017). http://invdes.com.mx/los-investigadores/del-adn-la-neurona-vistazo-la-expresion-genica-del-cerebro/ Donativos

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1. La respuesta antiviral es responsable de la microcefalia inducida por el virus del ZIKA: la función de los factores reguladores del interferón en la inhibición de la diferenciación neuronal. CONACYT 2016-01-2282. Fronteras de la Ciencia. 2. Impacto del ambiente enriquecido en la neurogénesis hipotalámica y la regulación del balance energético. PAPIIT I IN213316. 3. Efecto de la acumulación de los péptidos beta-amiloides sobre la dinámica celular de la microglía en un modelo murino de la enfermedad de Alzheimer. PAPIIT IA203318 (Responsable Dra. Marta Pedraza Escalona) 4. Estudio de los efectos del proceso inflamatorio resultante de la acumulación del pépido beta-amiloide sobre el proteoma mitocondrial de la microglia. PAPIIT IA203416 (Responsable Dra. Marta Pedraza Escalona) Título de los carteles 1. “Effect of viral maternal infection in structure, function and development of central nervous system”. Uriel Pineda Solís, Gustavo Pedraza-Alva, Leonor Pérez-Martínez 2. “Regulation of the expression of microRNAs by the Zika virus during central nervous system development”. María E. Santana Román1, Carlos Arias2, Susana López2, Victoria Pando Robles3 Gustavo Pedraza-Alva1 and Leonor Pérez-Martínez1

3. “Malva parviflora extract regulates the phagocytosis of microglia via PPAR in an Alzheimer´s disease model”. Elisa Medrano-Jiménez1, Martha Pedraza-Escalona1, Alejandro Zamilpa-Alvarez2, Maribel Herrera-Ruíz3, Enrique Jiménez-Ferrer2, Jaime Tortoriello-García2, Gustavo Pedraza-Alva1 and Leonor Pérez-Martínez1 4. “A Malva parviflora´s fraction ameliorates the spatial learning and memory impairments resulting from neuroinflammation”. Cristina E. Ramírez Serrano1, Maribel L. Herrera-Ruíz2, Jesús E. Jiménez Ferrer2, Alejandro Zamilpa Alvarez2, Gabriela Vargas-Villa2, Jaime Tortoriello García2, Gustavo Pedraza-Alva1 and Leonor Pérez-Martínez1 5. “Characterization of the Klf10 gene promoter in the developing hypothalamus”. Garduño-Tamayo Norma1, Pedraza-Alva Gustavo1, Pérez-Martínez Leonor1 6. “Determinación de la relación entre la longitud de los telómeros y la obesidad en niños mexicanos”. Roberto Carlos Licea Cejudo, Gustavo Pedraza Alva y Leonor Pérez Martínez.

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Dra. Marcela Ayala Aceves Deaprtamento de Ingeniería Celular y Biocatálisis, IBT-UNAM “Biocatálisis redox: ingeniería de enzimas redox combinando un enfoque teórico- experimental” Resumen Como resultado del trabajo de estos dos años completamos varios trabajos, como la síntesis de polímeros azufrados lineales en un proceso químico-enzimático muy eficiente, con altas conversiones y buenos rendimientos; la obtención de una variante de una lacasa fúngica, que tiene mayor estabilidad operacional que la enzima parental; obtención de variantes de una peroxigenasa fúngica con mayor capacidad de degradar hidrocarburos policíclicos aromáticos; oxidación de asfaltenos con una peroxigenasa fúngica inespecífica. Y tuvimos avances en nuevos proyectos de tesis, como la obtención de una lacasa halófila a partir de minería de metagenomas de sitios extremos. Varios de estos proyectos incluyen colaboraciones con investigadores de la UNAM (IBT, Facultad de Química) y fuera de la UNAM (UAEM, Colegio de Posgraduados, CSIC en España). Dentro de las contribuciones más importantes está el uso de herramientas computacionales (métodos híbridos QM-MM) para estudiar y mejorar la capacidad oxidativa y catalítica de peroxidasas y lacasas. Hemos desarrollado métodos para simular la transferencia de electrones en estas enzimas y así contar con información que nos permitan comprender su funcionamiento a nivel molecular, así como para el diseño racional de variantes con mayor estabilidad operacional y capacidades catalíticas. Durante este periodo se graduaron 6 estudiantes de posgrado y se titularon 3 estudiantes de licenciatura. Se obtuvo financiamiento para dos proyectos nuevos (PAPIIT IN209116 2016-2018 y PAPIIT). Hemos contado con tiempo de cálculo en la supercomputadora Miztli de la UNAM (Proyecto LANCAD-UNAM-DGTIC-293) para realizar simulaciones (QM-MM y dinámicas) de las enzimas que estudiamos. Además, la Dra. Olvera cuenta con un proyecto para una empresa que ha generado ingresos extraordinarios para el grupo. Integrantes del Grupo Académicos Dra. Marcela Ayala Aceves Dra. Clarita Olvera Carranza Biol. Rosa Román Miranda Dra. Dulce Catalina Díaz (estancia posdoctoral) DOCTORADO Estudiantes de la Dra. Ayala (*graduados en el periodo)

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MC Estefanía Sierra Ibarra* MC Mayra Guadalupe Avelar Frausto * MC Joaquín Ramírez Ramírez MC Ezequiel Tobón Pérez Estudiantes de la Dra. Olvera (*graduados en el periodo) MC Enrique Raga Carbajal MC Flor de María García Paz MAESTRIA Estudiantes de la Dra. Ayala (*graduados en el periodo) IQ Elizabeth Undiano Cicero* Q Noé Arroyo Mozo* IBQ Priscila Pérez Forcado* QFB Raúl Mireles Ing Alina Elizabeth Torres Estudiantes de la Dra. Olvera (*graduados en el periodo) Ing Maira Citlalli Jiménez* QFB Jorge Michel Hernández QFB Ingrid Mercado Del Rio Med. Pat. Raymundo David Valdez LICENCIATURA Estudiantes de la Dra. Ayala (*graduados en el periodo) Gustavo Alonso Alvarado Daniela Rubio Deisi Fuentes Estudiantes de la Dra. Olvera (*graduados en el periodo) Salvador Martínez Carlos Medrano* Jazmín Avilés* Guillermo Alonso Vicente Ramírez Grissel Vázquez Bustos* Héctor Alejandro Sierra Jeanette Liliana Pineda Publicaciones del grupo ARTICULOS (*autor de correspondencia) 1. Sarkar AA, Stubley V, Esa S, Goycoolea NH, Qin FM, Gonzalez XF, Olvera C*. Pickering emulsions co-stabilized by composite protein/

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polysaccharide particle-particle interfaces: Impact on in vitro gastric stability Food Hydrocolloids 84 (2018) 282-291 2. Avelar M, Pastor N, Ramírez J, Ayala M*. Replacement of oxidizable residues predicted by QM-MM simulation of a fungal laccase generates variants with higher operational stability. Journal of Inorganic Biochemistry 178 (2018) 125-122 3. Avelar M, Olvera C, Aceves-Zamudio D, Folch JL, Ayala M*. Recombinant expression of a laccase from Coriolopsis gallica in Pichia pastoris using a modified alpha-factor preproleader. Protein Expression and Purification 136 (2017) 14-19 4. Sierra E, Miranda A, Castillo E, Hu H, Ayala M*. Chemoenzymatic synthesis of poly(phenylene disulfides) with insulating properties and resistant to high temperatures. Journal of Chemical Technology and Biotechnology 92 (2017) 2691-2698. Una figura del artículo fue elegida para la portada del número. 5. Montor-Antonio JJ, Hernandez-Heredia S, Avila-Fernandez A, Olvera C, Sachman-Ruiz B, Del Moral S. Effect of differential processing of the native and recombinant alpha-amylase from Bacillus amyloliquefaciens JJC33M on specificity and enzyme properties 3Biotech 7 (2017) 336. ARTICULOS SOMETIDOS 1. Jiménez-Sánchez M, Pérez-Morales R, Goycoolea FM, Mueller M, Praznik W, Loepper R, Bermúdez-Morales V, Zavala- Padilla G, Ayala M, Olvera C*. Self-assembled high molecular weight inulin nanoparticles: Enzymatic synthesis, physicochemical and biological properties. Sometido a Carbohydrate Polymers. 2. Undiano E, Roman R, Miranda A, Ayala M*. Halogenation of estrogens catalyzed by a fungal chloroperoxidase. Somietido a Biocatalysis and Biotransformations. CAPITULOS DE LIBRO 1. Ayala M, Vazquez-Duhalt R, Morales M, Le Borgne S. “Application of microorganisms to the processing and upgrading of crude oil and fractions” en Consequences of microbial interactions with hydrocarbons, oils and lipids: production of fuels and chemicals. “Handbook of Hydrocarbon and Lipid Microbiology” (SY Lee, editor). Cham. Springer International Publishing. 2017. pp 1-36. Alumnos Graduados DOCTORADO 1. Estudio de la transferencia electrónica en una lacasa fúngica: implicaciones en la actividad y estabilidad. M.C. Mayra Guadalupe Avelar Frausto. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM.

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Enero 2013-Junio 2017. Fecha de obtención de grado: 7 de diciembre, 2017. (Ganó el premio a la mejor tesis de doctorado IBT 2018) 2. Síntesis enzimática de polímeros azufrados a partir de tioles aromáticos. M.C. Estefanía Sierra Ibarra. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Agosto 2012-Diciembre 2016. Fecha de obtención de grado: 23 de junio, 2017. MAESTRIA 1. Oxidación de asfaltenos por una peroxigenasa fúngica versátil. I. B. Q. Priscila Pérez Forcado. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Enero 2016-Diciembre 2017. Fecha de obtención de grado: 28 de septiembre, 2018.

2. Construcción de una fusión de proteínas fluorescentes con un fragmento del receptor de estrógenos de humano. Q. A. Noé Alejandro Arroyo Mozo. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Enero 2016-Diciembre 2017. Fecha de obtención de grado: 2 de agosto, 2018.

3. Halogenación enzimática de estradiol y otros compuestos estrogénicos. I. Q. Elizabeth Undiano Cicero. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Enero 2015-Diciembre 2016. Fecha de obtención de grado: 4 de agosto, 2017. 4. Estudio de la formación de nanopartículas de inulina y sus propiedades biológicas. Ing. Maira Citlalli Jiménez Sánchez. Posgrado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Enero 2015-Diciembre 2016. Fecha de obtención de grado: 6 de junio, 2017. Participación en docencia • Profesora en el curso de Bioquímica. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. • Responsable y profesora del curso “Del gen al producto: fundamentos de bioprocesos” (36 h teoría, 120 h prácticas). Febrero-Junio 2017 y 2018. Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas, Instituto de Biotecnología, UNAM. Divulgación Artículos y notas de divulgación (*con estudiantes) 1.-Ayala M. Enzimas como antibióticos: nuevas herramientas en la lucha contra las infecciones. La Unión de Morelos. 8 de mayo, 2017. 2.-Undiano E*, Arroyo N*, Ayala M. Contaminantes emergentes, ¿qué son y

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cómo nos afectan? La Unión de Morelos. 27 de febrero, 2017. Conferencias por invitación 1. Ayala M. Peroxidasas y peroxigenasas fúngicas: aplicaciones potenciales y retos. Universidad Politécnica del Estado de Morelos. 19 de enero, 2017. Cuernavaca, Morelos. Otros 1. XI Jornada Estatal de Ciencia, Tecnología e Innovación. Taller “Fábrica de Biotecnólogos”. 23-25 de octubre, 2017. Organizado por: Secretaría de Innovación, Ciencia y Tecnología, Gobierno del Estado de Morelos. 2. Participación en el 3er. Día de Puertas Abiertas, IBT UNAM 2018 con visitas guiadas al laboratorio, charlas y demostraciones. 3. Charlas y visitas guiadas al laboratorio a estudiantes visitantes en el IBT. Donativos 1.-PAPIIT IN201612 y IN209116 2.- Qualtia Alimentos SA de CV (ingresos extraordinarios) Títulos y autores de los cárteles que presentará el grupo 1.-Modulación de la actividad de una peroxigenasa fúngica: un estudio teórico- experimental. AUTORES: Ramírez Ramírez J, Pastor N, Ayala M. 2.-Una lacasa verdaderamente halófila: minando metagenomas extremos. Tobón E, Ayala M. 3.-Síntesis enzimática de oligosacáridos híbridos. AUTORES: Raga Carbajal E, Vázquez-Bustos G, Pineda L, Alonso G, Olvera C. 4.-Nanopartículas de fructanas. AUTORES: Jiménez-Sánchez M, Medrano C, Valdez R, Hernández J, Olvera C. 5.-Estudios de relación estructura/función de los dominios adicionales de las fructansacarasas. AUTORES: García-Paz F, Mercado I, Martínez S, Ramírez V, Olvera C.

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Dra. Gladys Iliana Cassab López Departamento de Biología Molecular de Plantas, IBT-UNAM. “Mejoramiento de la evasión a la sequía y al calor en maíz por genómica ecológica” Resumen: El análisis fenotípico y genotípico de dos rasgos adaptativos de resistencia a sequía como la respuesta hidrotrópica de la raíz, y la resistencia a la siembra profunda permitió reconocer su importancia en el rendimiento de grano en maíz en condiciones de sequía sin afectarlo en condiciones óptimas. Además, identificamos marcadores moleculares (SNPs, Single Nuecleotide Polimorphisms) asociados a la variación fenotípica de estos rasgos en una colección endogámica de maíces (DTMA, Drought Tolerant Maize for Africa). Logramos para algunos de estos SNPS s asociados confirmar mediante análisis de ligamiento en poblaciones biparentales su heredabilidad mediante mapeo de QTLs (Quantitavie Trait Loci). La identificación de alelos causantes de variaciones fenotípicas de la respuesta hidrotrópica de la raíz por análisis tipo GWAS (Genome Wide Association Studies) y por mapeo de QTLs arrojó varios genes que son componentes del sistema de ubiquitina/proteasoma cuya expresión en raíces tanto génica como a nivel de proteína fue diferencial entre maíces con respuesta hidrotrópica robusta y con respuesta hidrotrópica débil. Observamos, mediante análisis tipo Western utilizando anticuerpos anti-ubiquitina, un gradiente de menor a mayor cantidad de conjugados de ubiquitina de alto peso molecular cuando las raíces fueron expuestas al reto hidrotrópico, mientras que en condiciones control (agua) el patrón es inverso. El uso del anti-20S y el anti-S2/Rpn1 (26S), reveló un patrón semejante en ambos tratamientos, un aumento del proteasoma 20S y posiblemente del proteasoma 26S de manera escalonada hacia la zona de la cofia. Los gradientes de ubiquitinación, 20S y Rpn1 (26S) se establecen una vez que las raíces son sometidas al ensayo de hidrotropismo (tanto en agua como en carbonato de potasio), dado que muestras equivalentes de las raíces analizados después de los 3 días de germinación, no muestran diferencias entre si en el contenido de conjugados totales de Ub de alto y medio peso molecular ni en el proteasoma 20S. Así mismo, se identificaron varios genes, entre estos EGY2 (proteasa de la familia M50) y varias MAP cinasas con expresión génica diferencial en raíces de híbridos con respuesta hidrotrópica robusta y débil. La resecuenciación de los genes asociados permite identificar los alelos causantes de las variaciones fenotípicas de estos rasgos. Como ejemplo, en un estudio de tres genes analizados en elongación del mesocotilo encontramos en dos de ellos los alelos causantes en regiones regulatorias (3’UTR y un intrón), en el caso del tercer gene se encontró dentro del marco de lectura abierta. Los análisis comparados de los transcriptomas del mesocotilo de variedades de maíz que lo elongan mucho o muy poco identificó que la expresión de tres genes asociados con funciones de la promoción del crecimiento se sobreexpresan en la variedad de mesocotilo lago mientras que funciones asociadas a la inhibición del crecimiento

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están sobreexpresadas en la variedad de mesocotilo corto. Como producto aplica del proyecto se identificaron líneas de maíz para producción de maíz de alto rendimiento aptas para la siembra profunda en Valles Altos de México. Dos de los híbridos generados a partir de estas líneas mostraron muy buena resistencia a la siembra profunda lo cual permitirá utilizarlos en agricultura sostenible y también en la generación de nuevas variedades sintética. Artículos publicados -Eapen, D., Martínez-Guadarrama, J., Hernández-Bruno, O., Flores, L., Nieto-Sotelo, J. & Cassab, G.I. (2017) Synergy between root hydrotropic response and root biomass enchances drought avoidance in maize (Zea mays L.). Plant Science 265: 87–99. doi: http://dx.doi.org/10.1016/j.plantsci.2017.09.016. -Salazar-Blas, A., Noriega-Calixto, L., Campos M.E., Eapen, D., Cruz-Vázquez, T.S., Castillo Olamendi, L., Sepúlveda-Jiménez, G., Porta, H., Dubrovsky, J.D., & Cassab, G.I. (2016) Robust root growth in altered hydrotropic response1 (ahr1) mutant of Arabidopsis thaliana is maintained by high rate of cell production at low water potential gradients. Journal of Plant Physiology 208: 102–114. -Ponce G., Corkidi G., Eapen D., Lledías F., Cárdenas L., Cassab G.I. (2017). Root hydrotropism and thigmotropism in Arabidopsis thaliana are differentially controlled by redox status. Plant Signaling & Behavior 12(4): e1305536. doi: 10.1080/15592324.2017.1305536. -Lledías F., Hernández F., Rivas V., García-Mendoza A., Cassab G.I., Nieto-Sotelo J. (2017). A Rapid and Reliable Method for Total Protein Extraction from Succulent Plants for Proteomic Analysis. Protein Journal 36: 308–321. doi: 10.1007/s10930-017-9720-3. -Jiménez-Nopala, G., Salgado-Escobar, A.E., Cevallos-Porta, D., Cárdenas, L., Sepúlveda-Jiménez, G., Cassab, G.I., Porta, H. (2018). Autophagy mediates hydrotropic response in Arabidopsis thaliana roots. Plant Science 272:1-13. doi: https://doi.org/10.1016/j.plantsci.2018.03.026 Manuscritos en Revisión: -Noriega-Calixto L., Campos M. E., Cassab G. I. (2018). A method for rapid analysis of the root hydrotropic response in Arabidopsis thaliana. Manuscrito en revisión en: Biotechniques. Manuscritos en Preparación: -Noriega-Calixto L., Campos M. E., Cassab G.I. (2018). TIME FOR COFFEE (TIC) participates in the enhancement of the root hydrotropic response of Arabidopsis thaliana. Manuscrito en Preparación.

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- Martínez-Guadarrama, J., Sáenz-Rodríguez M.N., Lledías F., Rivas V., Puentes C., Eapen, D., Cassab, G.I. (2018). Quantitative Trait Locus mapping provides insights into the root hydrotropic response in maize (Zea mays L.). Manuscrito en Preparación. Alumnos: Servicios Sociales: -Eduardo Eattan Puente Pastrana Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Xochimilco. Alberto Román Villaseñor Escuela Técnicos Laboratoristas Especialidad: Técnico Laboratorista en Química de Alimentos Tesis: Licenciatura: -Brandon Bueno Hernández (2018) Localización de especies de oxígeno reactivas en la raíz primaria de Zea mays L. durante la respuesta hidrotropica. Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Seminario I,II y III. Asesor: Gladys Iliana Cassab López. Grado obtenido el 12 de junio de 2018. -Maximiliano Peñaloza Gómez (2018) Análisis morfológicos y anatómicos asociados con respuesta hidrotropica de la raíz de maíz Zea mays L. en condiciones de sequía. Facultad de Ciencias Biológicas, Universidad Autónoma del Estado de Morelos. Seminario I, y II. Asesor: Delfeena Eapen (Investigadora Adscrita a mi grupo). (Titulación por tres etapas finalizada. Certificado por obtener). Participación en Docencia: Cursos de Biología Celular y Biología Vegetal. Desarrollo tecnológico: Diseñamos y construimos una sembradora para la siembra profunda que se adapta a un tractor convencional. Este prototipo nos permitió entender las características ideales que debería de tener una máquina que siembre profundamente con mejor eficiencia. Las fallas y limitaciones de nuestro prototipo nos permitieron establecer una vinculación con un grupo de investigación en Ingeniería Mecánica del Instituto de Ingeniería de la UNAM, que está dispuesto a construir y mejorar otro prototipo bajo un diseño nuevo que responda a los requerimientos mecánicos que implica la siembra profunda. El interés de este grupo de Ingenieros para diseñar este prototipo aumentó una vez que identificamos a los híbridos de alto rendimiento resistente a

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siembra profunda, siendo estos un nuevo material genético que no se había generado en maíz anteriormente. Divulgacion: Participación en el Día de Puertas Abiertas del IBt-UNAM. Donativos: Problemas Nacionales PN 247732-CONACyT.

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M.C Ma. del Carmen M. Quinto Hernández Departamento de Biología Molecular de Plantas, IBT-UNAM “Las especies de oxígeno reactivas y su efecto antagónico en las simbiosis frijol-rizobia y frijol-hongo micorrízico” Resumen Las interacciones mutualistas entre plantas y microorganismos de la rizósfera son de gran importancia agroecológica. Tal es el caso de las simbiosis que se establecen entre las raíces de las leguminosas y bacterias gram-negativas del suelo, las rizobias o bien entre las raíces con hongos micorrízicos arbusculares, como Rhizophagus irregularis. Las NADPH oxidasas de plantas, llamadas RBOHs (por sus siglas en inglés de Respiratory Burst Oxidase Homologs), son enzimas de la membrana plasmática que generan especies de oxígeno reactivas (EOR). Estas oxidasas están implicadas en una amplia variedad de procesos en plantas que incluyen desarrollo, crecimiento y señalización tanto bajo estímulos bióticos como abióticos. En trabajos previos de nuestro consorcio, hemos reportado que estas oxidasas participan en las simbiosis Phaseolus vulgaris - Rhizobium tropici y P.vulgaris – R. irregularis (1-2). Los resultados obtenidos sugieren fuertemente que una RBOH de P. vulgaris, RBOHB, es un regulador positivo de la nodulación y un regulador negativo de la micorrización. Esto es, PvRBOHB, parece tener un papel antagónico en estas simbiosis. Con el objetivo de identificar y caracterizar funcionalmente genes que se expresan diferencialmente en condiciones de bajos niveles de EOR durante la nodulación y la micorrización, se llevó a cabo un análisis transcriptómico a los 7 días después de la inoculación con cada uno de los dos microsimbiontes en estudio. Los datos obtenidos muestran que 2,741 genes se expresan diferencialmente en las raíces transgénicas de P. vulgaris silenciadas en PvRbohB, inoculadas con rizobia; en contraste cuando las raíces de inoculan con hongos micorrizícos únicamente 540 genes se expresan diferencialmente; de éstos, 152 se comparten en ambas simbiosis. Esto indica que en simbiosis con rizobia hay más cambios en el transcriptoma, que cuando se inoculan con el hongo micorrízico arbuscular. La anotación funcional de estos genes muestra un catálogo de genes expresados diferencialmente que están relacionados con la degradación de las EOR, la homeostasis de auxinas, el crecimiento celular y la remodelación de la pared celular durante la nodulación y la micorrización (3). Bibliografía 1. Montiel., et al. 2012. Plant Cell Physiol. 53 (10): 1751-1767. 2. Arthikala., et al. 2014. New Phytol, 201 (3) 886-900 3. Fonseca et al., 2018. Sometido a publicación.

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Integrantes del Grupo CQ dentro del Consorcio Quinto-Cárdenas en el período 2018-2018 Dra. Rosana Sánchez López, Investigador titular B, adscrita al grupo Biól. Noreide Nava Nuñez, Técnico Académico Titular B Dra. Janet Carrasco, Posdoctoral durante 2017 Dra. Yolanda Ortega, Posdoctoral durante 2017 y parte del 2018 Dra. Citlali Fonseca García, Posdoctoral a partir de enero del 2018 MCB Jorge Solís Miranda, estudiante de doctorado en CB Biól. Ronal Pacheco Sánchez, estudiante de maestría en CB Roberto Carlos Sotelo, tesista de licenciatura en Ing. Bioquímica, UPEMor. José Luis Carranza Contreras, tesista de licenciatura en Ing. Bioquímica, UPEMor. Publicaciones Manoj-Kumar Arthikala, Jesús Montiel, Rosana Sánchez-López, Noreide Nava, Luis Cárdenas and Carmen Quinto RESPIRATORY BURST OXIDASE HOMOLOG GENE A IS CRUCIAL FOR Rhizobium INFECTION AND NODULE MATURATION AND FUNCTION IN COMMON BEAN Frontiers in Plant Science, 8, doi10.3389 (2017) Manoj-Kumar Arthikala and Carmen Quinto RbohA COORDINATES LATERAL ROOT EMERGENCE IN COMMON BEAN Communicative & Integrative Biology, 11:2, 1-5, DOI: 10.1080/19420889.2018.1467188 (2018) Janet Carrasco-Castilla, Yolanda Ortega-Ortega, David Jáuregui-Zúñiga, Marco A. Juárez Verdayes, Elizabeth Monroy-Morales, Noreide Nava, Olivia Santana, Rosana Sánchez-López and Carmen Quinto DOWN-REGULATION OF A COMMON BEAN ANNEXIN IMPAIRS RHIZOBIAL INFECTION AND NODULATION IN COMMON BEAN Journal of Environmental and Experimental Botany, 153, 108-119 (2018) Jesús Montiel, Citlali Fonseca-García and Carmen Quinto PHYLOGENY ND EXPRESSION OF NADPH OXIDASES DURING SYMBIOTIC NODULE FORMATION Agriculture 8, 1-9, 179; doi:10.3390/agriculture8110179 (2018) Alejandra Zayas del Moral, Felipe Damián, Carmen Quinto, Federico Sánchez and Claudia Díaz. IDENTIFICATION OF SMALL OPEN READING FRAMES ASSOCIATED TO HEAT TOLERANCE IN Phaseolus vulgaris ROOT NODULES Australian Journal of Crop Sciences, Aceptado (2018)

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Jesús Montiel and Carmen Quinto NADPH OXIDASES HAVE KEY ROLES IN MUTUALISTIC ASSOCIATIONS WITH RHIZOBIA OR WITH MYCORRHIZAL FUNGI IN ROOT LEGUMES Chapter 8, 1-12, Microbial probiotics for agricultural systems. Advances in agronomic use. Springer Ed. (2018) En prensa. Alumnos Graduados Licenciatura Nombre del estudiante: Alejandro Siu Rivas Título obtenido: Técnico Superior Universitario en Agrobiotecnología Institución: Universidad Tecnológica de la Selva Título de la tesis: Determinación de la actividad delpromotor de Feronia 2

en la simbiosis de frijol (Phaseolus vulgaris) con bacterias gram-negativas del suelo del género Rhizobium”

Fecha del examen: agosto 14, 2017 Nombre del estudiante: Miriam Rodríguez Fernández Título obtenido: Ingeniero en Biotecnología Institución: Universidad Politécnica de Tlaxcala Título de la tesina: Efecto de la sobre-expresión del gen PvCRT08 en la interacción simbiótica frijol-rizobia Fecha del examen: julio 11, 2017 Nombre del estudiante: Valeria Itzel Villanueva Espinosa Título obtenido: Ingeniero en Biotecnología Institución: Universidad Politécnica de Cuautitlán Izcalli Título del proyecto: Análisis de la localización subcelular de la proteína ADFE de Phaseolus vulgaris durante la interacción simbiótica con Rhizobium tropici Fecha de examen: mayo 31, 2017 Nombre del estudiante: Lizeth Paola López Ortíz Título obtenido: Ingeniero en Biotecnología Institución: Universidad Politécnica de Cuautitlán Izcalli Título del proyecto: Localización subcelular de las anexinas de Phaseolus vulgaris en la interacción simbiótica con rizobia Fecha del examen: mayo 26, 2017 Nombre del estudiante: Magalí Zamora Fosado Título obtenido: Ingeniero en Biotecnología Institución: Universidad Politécnica de Tlaxcala Título de la tesis: Identificación y caracterización del promotor del gen FERONIA1 en Phaseolus vulgaris Fecha del examen: marzo 28, 2017

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Participación en docencia Curso de Biología vegetal en la Mestría de Ciencias Bioquímicas: Semestre 2018-1, sección Simbiosis, 6 hrs. Semestre 2019-1, sección Simbiosis, 6 hrs. Divulgación Entrevista a Científicos en programa de la Araña Patona Tema: simbiosis entre microorganismos y el frijol Instituto Morelense de Radio y TV, Radio, Entrevistó Juan Manuel Valero Marzo 5 del 2018 Donativos Nombre del Proyecto: “ANÁLISIS DEL EFECTO ANTAGÓNICO DE LAS ESPECIES DE OXÍGENO REACTIVAS EN LA SIMBIOSIS DE FRIJOL CON RIZOBIA Y CON HONGOS MICORRÍZICOS” IN204115 Institución u organismo financiador: Direccion General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA) Período: 2015-2017. Nombre del Proyecto: “ANÁLISIS FUNCIONAL DE RALF-FERONIA-RIPK EN

RAÍCES DE FRIJOL EN SIMBIOSIS CON RIZOBIA Y SU IMPACTO EN LA EFICIENCIA DE NODULACIÓN” IN201118

Institución u organismo financiador: Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA)

Período: 2018-2020. Nombre del Proyecto: “ESPECIES DE OXÍGENO REACTIVAS EN

ASOCIACIONES MUTIALISTAS EN PLANTAS“ FC 1503

Institución u organismo financiador: CONACyT Período: 2019-2020 Títulos y autores de los carteles DECIPHERING THE ROLE OF BEAN RALF, FER AND RIPK GENES IN SYMBIOSIS WITH RHIZOBIA Jorge Solís Miranda, Marco Juárez, Noreide Nava and Carmen Quinto

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FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF A PATATIN-RELATED

PHOSPHOLIPASE A GENE OF Phaseolus vulgaris (PvpPLA-II) DURING NODULATION Ronal Pacheco, Marco Juárez, Jorge Solís, Noreide Nava, Yolanda Ortega, Citlali Fonseca, Alfonso Leija and Carmen Quinto. PvKNOLLE: A MOLECULAR MARKER FOR THE IN VIVO VISUALIZATION OF THE CYTOKINESIS IN Phaseolus vulgaris ROOTS Elizabeth Monroy Morales, Emmanuel Ayala Guzmán, Jonathan Gilberto Cuellar Vega, Raúl Dávila Delgado and Rosana Sánchez-López-

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Dra. Susana López Charretón Departamento de Genética del Desarrollo y Fisiología Molecular, IBT-UNAM. “Estrategias de los rotavirus para contrarrestar la respuesta antiviral de la célula huésped” Resumen Los rotavirus representan el principal agente etiológico de gastroenteritis severa en niños menores de dos años y en las crías de un gran numero de mamíferos y aves. Estos virus infectan los enterocitos que se encuentran en las puntas de las vellosidades del intestino delgado, destruyéndolos, lo que constituye una de las principales causas de la enfermedad causada por estos virus. Para lograr una infección productiva, los virus tienen que contender con las medidas antivirales de la célula huésped. Los gránulos de RNA son agregados dinámicos de RNA y proteínas que cumplen diversas funciones en la célula. En particular, los gránulos de estrés son estructuras que se forman ante diversas señales de alarma en la célula y su función principal es la de detener la síntesis de proteínas, hasta que se resuelva el estrés. En contraste, los gránulos de procesamiento, o cuerpos-P son estructuras que se encuentran de manera constitutiva en la célula y su función principal es la de degradar RNA; ambos tipos de gránulos participan, además, en el silenciamiento de genes dirigido por micro-RNAs. Dadas las funciones de éstas estructuras, es claro que representan una medida antiviral de la célula, y hemos encontrado que una de las estrategias que utilizan los rotavirus para sobrepasar estos controles consiste en prevenir la formación de los gránulos de RNA y disminuir el número de los cuerpos-P, presentes en el citoplasma celular, así como secuestrar a varias de las proteínas de unión a RNA que normalmente se encuentran en estos gránulos de RNA. En esta ocasión platicaremos de los mecanismos que utilizan los rotavirus para lograr este desbalance. INTEGRANTES DEL GRUPO Líderes Académicos Carlos F. Arias, Susana López Investigadores asociados Pavel Isa, Tomás López Díaz, Blanca Taboada Ramírez, Carlos Sandoval Jaime Posdoctorados Yasel Garcés

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Técnicos académicos Rafaela Espinosa Marco A. Espinoza Estudiantes: Licenciatura: Anaid Cándido, Connie López, Saúl Romero, Catalina Agulera Maestría: Ana Sánchez, Oscar Trejo, Nayeli Aguilar, Giovanni Elizarraras, Leticia Guzmán, Carlos E. Báez, Arianna Pérez, Marco Olguín, Yarenci Aguado, Jey Hernández Doctorado: Alfonso Oceguera, Liliana Sánchez, Luis Casorla, Joaquín Moreno, José Luis Martínez, Elizabeth Cadenas, Xaira Rivera. Administrativos: Lorena Salazar, Miguel Angel Olvera, Nalleli Uribe PUBLICACIONES Jauregui D, Pedraza M, Espino G, Quintero-Hernandez V, Olvera-Rodriguez A, Diaz- Salinas M, Lopez S, and Possani L. 2017 Targeting antigens to Dec-205 on dendritic cells induces a higher immune response in chickens: hemagglutinin of avian influenza virus example. Research in Veterinary Science. 111: 52-62 http://dx.doi.org/10.1016/j.rvsc.2016.12.002 Lopez-Guerrero DV, Arias N, Gutierrez- Xicotencatl L, Chihu-Amparan L, Gonzalez A, Pedroza-Saavedra A, Rosas-Salgado G, Villegas-Garcia JC, Badillo-Godinez O, Fernandez M, Lopez S, Esquivel FR. 2107 Enhancement of VP6 immunogenicity against rotavirus by VP2 in a genetic immunization. 2017 Vaccine doi: 10.1016/j.vaccine.2017.03.104. Casorla-Pérez L, López T, López S, and Arias CF. The ubiquitin-proteasome system necessary for the efficient replication of human astrovirus. J Virol 92:e01809-17. https:// doi.org/10.1128/JVI.01809-17. Díaz-Salinas MA, Casorla-Pérez L, López T, López S, and Arias CF. 2018 Most rotavirus strains require the cation-independent mannose-6-phosphate receptor, sortilin-1, and cathepsins to enter cells. Vir Res 245:44-51. doi:10.1016/j.virusres.2017.12.002. Trejo-Cerro O, Eichwald C, Schraner E, Silva-Ayala D, López S, and Arias CF. 2018 Actin-dependent non-lytic rotavirus exit and infectious virus morphogenetic pathway in non-polarized cells. J Virol 92:e02076-17. https://doi.org/10.1128/JVI.02076-17. Elizondo-Quiroga D, Medina-Sánchez A, Sánchez-González JM, Allison Eckert K, Villalobos-Sánchez E, Navarro- Zúñiga AR, Sánchez-Tejeda G, Correa-Morales F,

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González-Acosta C, Arias CF, Lopez S, del Angel RM, Pando-Robles V, Elizondo- Quiroga AE. 2018, Zika Virus in Salivary Glands of Five Different Species of Wild- Caught Mosquitoes from Mexico. Sci Rep. 16;8:809. doi: 10.1038/s41598-017-18682-3. Erratum in: Sci Rep. 2018 May 15;8(1):7887. Parrón JA, Ripollés D, Sánchez AC, Perez MD, Calvo M, López S, Arias CF, Sánchez L. Antirotaviral activity of bovine milk components: Extending the list of inhibitory proteins and seeking a better understanding of their neutralization mechanism 2018. Journal of Functional Foods. 44:103-111 https://doi.org/10.1016/j.jff.2018.03.002 Taboada B, Isa P, Gutiérrez-Escolano AL, Del Ángel RM, Ludert JE, Vázquez N, Tapia-Palacios MA, Chávez P, Garrido E, Espinosa AC, Eguiarte LE, López S, Souza V, Arias CF. 2018. The geographic structure of viruses in the Cuatro Cienegas Basin, a unique oasis in northern Mexico, reveals a a highly diverse population at a small geographic scale. Appl Environ Microbiol. 17;84. pii: e00465-18. doi: 10.1128/AEM.00465-18. Thézé J, Li T, du Plessis L, Bouquet J, Kraemer MUG, Somasekar S, Yu G, de Cesare M, Balmaseda A, Kuan G, Harris E, Wu CH, Ansari MA, Bowden R, Faria NR, Yagi S, Messenger S, Brooks T, Stone M, Bloch EM, Busch M, Muñoz-Medina JE, González-Bonilla CR, Wolinsky S, López S, Arias CF, Bonsall D, Chiu CY, Pybus OG. 2018, Genomic epidemiology reconstructs the introduction and spread of Zika virus in Central America and Mexico. Cell Host Microbe. 2018 May 15. pii: S1931-3128(18)30218-X. doi: 10.1016/j.chom.2018.04.017. Aguilar-Hernandez, N., Lopez S, y Arias CF. 2018. Minimal capsid composition of human astrovirus. 2018. Virology 521: 58-61 https://doi.org/10.1016/j.virol.2018.05.021 Oceguera A, Peralta AV, Martínez-Delgado G, Arias CF, and López S. 2018 Rotavirus RNAs sponge host cell RNA binding proteins and interfere with their subcellular localization. Virology 2018, 525:96-105 https://doi.org/10.1016/j.virol.2018.09.013 Espinosa R, López T, Bogdanoff W, Espinoza M, López S, DuBois R, and Arias CF. 2018 Isolation of neutralizing monoclonal antibodies to human astrovirus and characterization of virus variants that escape neutralization J Virol doi: 10.1128/JVI.01465-18. Capítulos en libros López S, Arias CF. Rotavirus Biology. In Human Virology in Latin America; From Biology to Control. JE Ludert, FH Pujol, J Arbiza (eds). Springer, Switzerland. Ch 2, pp 19-42, 2017.

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ALUMNOS GRADUADOS Giovani Elizararaz. “Obtención de una línea celular knockout para el gen RNAseL, utilizando el sistema CRISPR/Cas9 y su uso para la caracterización del ciclo replicativo de Rotavirus” Maestría en Ciencias Bioquímicas. Obtención Diciembre 5, 2017 Liliana Sánchez Tacuba “Estudio de los Mecanismos involucrados en la modulación la vía 2´5´-oligoadenilato sintetasa/RNasa L durante la infección por rotavirus” Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Obtención 2 de Febrero 2017 Anaid Alethia Candido. “Efecto de la metilación (N-6metiladenosina) del RNA en el ciclo Replicativo de Rotavirus” Lic. en Químico Farmaceútico Biologo, Fac. de Quimica, UNAM. Obtención 18 Junio 2018 PARTICIPACIÓN EN DOCENCIA Julio 2017 Participación en el curso de Virologia Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas Tema: Conceptos Básico de Virología Noviembre 7 y 10, 2017 Participacion en el curso de Virologia Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas Tema: Inmunidad Innata Mayo 19, 2018 Curso de Virología para maestros Red Mex Virología y UAEM Temas: El ciclo infeccioso Genomas virales y estrategias de replicación Agosto 2018 Participación en el curso de Virología Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas Tema: Conceptos Básicos de Virología, El ciclo infeccioso Noviembre 14 2018 Participación en el curso de Virologia Programa de Maestría y Doctorado en Ciencias Bioquímicas Tema: Respuesta Inmune Innata DIVULGACIÓN Enero 13, 2017 Entrevista para Capsula TV “Las buenas noticias también cuentan”

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Marzo, 30, 2017 Canal Once, entrevista con Javier Solórzano https://www.youtube.com/watch?v=6DNHc6hFSWk Sept 26, 2077 Entrevista Radio UNAM, con Deyanira Morán “Semblanza” Nov 7, 2017 Agencia Informativa Conacyt, con Carmen Baéz La Red Mexicana de Virología http://newsnet.conacytprensa.mx/index.php/videos/37974-red-mexicana-de-virologia-en-entrevista-conacyt Nov 7, 2017 Agencia Informativa Conacyt: Ciencia en 10 http://newsnet.conacytprensa.mx/index.php/videos/43959-rotavirus-conacyt-ciencia-en-diez Marzo 1, 2018 Conacyt, Pablo Miranda RadioConciencia http://conacytprensa.mx/index.php/sociedad/personajes/20650-susana-lopez-charreton-modelo-mujer-cientifica?utm_source=feedburner&utm_medium=feed&utm_campaign=Feed%3A+conacytprensa%2FLeUl+%28Sociedad%29 Marzo 2, 2018 Johnatan Bañuelos/ El mural de Guadalajara Marzo 2, 2018, Ilse Martinez/ El informador Guadalajara http://acmor.org.mx/?q=content/doctorado-honoris-causa-para-susana-lópez Marzo 30, 2018 Gaceta UNAM, Honoris Causa http://www.gaceta.unam.mx/20180402/wp-content/uploads/2018/04/020418.pdf Abril 20, 2018 Conferencia ¿Que son los virus? Tercer dia de Puertas Abiertas en el Instituto de Biotecnología, IBT/UNAM Abril 20, 2018 Junio 5, 2018 Entrevista Radio UNAM, Cristina Godínez Sobre los virus de RNA NOTA RNA 050618.mp3

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Octubre 10, 2018 ¿VACUNARSE O NO VACUNARSE? – ESTO NO ES UN DILEMA http://invdes.com.mx/los-investigadores/vacunarse-o-no-vacunarse-esto-no-es-un-dilema/ Reproduccion del mismo articulo escrito para la Union de Morelos http://www.acmor.org.mx/descargas/18_oct_08_vacunarse.pdf por Carlos Sandoval Jaime y Susana López Octubre 20, 2018 López S, Zárate S, Yocupicio M, Lobatón E. 2018. “¡Pablo Tiene Sarampión!” https://redvirologia.org/wp-content/uploads/2018/10/Pablo-tiene-Sarampio%CC%81n-FINAL2.pdf DONATIVOS VIGENTES Proyectos de Desarrollo para atender problemas Nacionales CONACyT Proyecto 5113 Titulo: Implementación de un ensayo serológico para diagnosticar infecciones por los flavivirus mas frecuentes: Zika, Dengue, Virus del Oeste del Nilo y Fiebre Amarilla Nov 2018- Nov 2020 Monto 1,700,000 Responsable Fundación Miguel Alemán Estimulos a la Investigación Médica Título: Desarrollo de un sistema diagnóstico serológico diferencial para Zika y dengue Octubre 2017-Sept 2018 Monto: 100,000.00 Responsable Fondo de Redes de Investigación- CONACYT Proyecto 293788 Titulo: Red Mexicana de Virología Abril 2018- Noviembre 2018 Monto: 1,000,000.00 Responsable PAPIIT DGAPA Proyecto IG200317, Modalidad de grupos Caracterización de la interacción rotavirus-célula huésped que favorece la replicación viral. Enero 2017-Enero 2019 Monto: 1,740,000.00

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Primer Responsable: Susana López Segundo Responsable: Carlos Arias PREMIOS Y DISTINCIONES: - Miembro de la Academia de Ciencias de Latinoamerica (ACAL) Oct. 2017 - Doctorado Honoris Causa otorgado por el Sistema Universitario Jesuíta, Marzo 2018 - PRIDE D 2018-2023 TÍTULOS Y AUTORES DE LOS CARTELES QUE PRESENTARÁ EL GRUPO. “Detection of Rotavirus NSP3 interactions during infection” Carlos Sandoval Jaime Caracterización de la estructura Cap de los mRNAs de rotavirus Joaquin Moreno Contreras

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Dra. YvonneJ. Rosenstein Azoulay Departamento de Medicina Molecular y Bioprocesos, IBT-UNAM. “Transitando de la inmunología a los péptidos de defensa pasando por la biología de tumores y enfermedades infecciosas” RESUMEN El trabajo de nuestro grupo se centra en i) estudiar la participación de la molécula CD43, una sialomucina transmembranal, en la percepción que tienen distintas células de su entorno, ii) identificar pequeños péptidos de defensa con funciones inmunoreguladoras y iii) caracterizar los mecanismos moleculares que se derivan de bloquear los canales Kv1.3 con la toxina Vm24. i) Nuestro interés general es entender los procesos a través de los cuales CD43, una mucina transmembranal, participa en la percepción que tienen distintas estirpes celulares de su medio ambiente y como traducen esta percepción en señales intracelulares que impactaran la respuesta celular. Durante el periodo 2017-2018 hemos continuado con este objetivo en el marco de la respuesta inmunitaria así como de la biología de tumores. Los experimentos que hemos realizado con diferentes modelos experimentales indican que, para desempeñar sus funciones, CD43 requiere de las señales bioquímicas que emanan desde su dominio intracelular. En linfocitos T, la falta de CD43 reduce considerablemente su capacidad de proliferación en tanto que la expresión de una mutante de CD43 que carece de la porción intracelular de CD43 (CD43Tg) en ratones que expresan un TCR específico para ovalbúmina abate la respuesta antígeno-especifica ex vivo e in vivo. Recientemente, con un análisis del proteoma de linfocitos T activados a través de CD43, identificamos que las señales de CD43 llevan a activación de la piruvato cinasa 2 (PKM2), la cual regula la función de moléculas que a su vez impactan activación, proliferación, metabolismo y capacidad de sobrevida de las células. En macrófagos mostramos que la interacción de CD43 con la chaperona Cpn60.2 de M. tuberculosis lleva a la producción de TNF, una citocina pro-inflamatoria esencial para la resolución de la enfermedad y caracterizamos la vía de señalización que regula estos eventos. Actualmente estamos evaluando la participación de CD43 tuberculosis, en un modelo de ratones. Otro de los ligandos de CD43 es la adhesina Hsa de S. gordonii, una bacteria Gram+ que forma parte de la microbiota de la cavidad bucal y que es el agente etiológico de la endocarditis bacteriana. Evaluamos la capacidad de región BR2 de Hsa de inducir la producción de TNF en macrófagos siendo que la interacción de CD43 con el dominio BR2 de Hsa, pero no con una mutante que no reconoce CD43, lleva a la producción de TNF en macrófagos humanos y murinos y que esto depende de la activación de los factores de transcripción AP-1 y NFkB, via PKC y MAPKs. Estos resultados son el primer reporte de que la interacción de CD43 con dos moléculas derivadas de bacterias patógenas inducen una respuesta intracelular que lleva a la producción de una

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citocina y nos lleva a proponer que CD43 es un receptor de patrones moleculares derivados de patógenos (PRR) bona fide. En células tumorales no linfoides, hemos encontrado que la expresión de CD43 favorece la sobrevida de las células la expresión de moléculas involucradas en remodelamiento de la matriz extracelular y angiogénesis. Estos resultados definen nuevas funciones para la mucina CD43 tanto en células linfoides como tumorales, e identifican posibles nuevos blancos terapéuticos para manipular la respuesta inmune y para combatir con mayor éxito tumores CD43+. ii) Los péptidos de defensa (Host defense peptides, HDPs) tienen la capacidad de regular la respuesta inmune a distintos niveles además de ser antimicrobianos. Hemos aislado una colección de HDPs de la piel de la rana Pachymedusa dacnicolor e identificado péptidos con distintas actividades. Recientemente demostramos que, además de su interacción con los lípidos de la membrana bacteriana, la dermaseptina DMS-DA6 reconoce al peptidoglicano, un componente principal de la membrana de las bacterias Gram+, perfilándose como un buen candidato para desarrollar nuevos péptidos terapéuticos contra bacterias multi-resistentes. Otros péptidos promueven la migración direccional de leucocitos, o inducen la muerte de poblaciones particulares de células linfoides o tumorales. Estas moléculas que pueden regular la amplitud de una reacción inflamatoria a la vez que controlar infecciones en los sitios de inflamación, son candidatos a ser herramientas terapéuticas. iii) en colaboración con el grupo del Dr. Possani, reportamos que el bloqueo de los canales de Kv1.3 por la toxina Vm24 en linfocitos T de memoria, inhibe la maquinaria de síntesis de ARNm, la respuesta UPR y el transporte de vesículas intracelulares, lo que impacta sobre la síntesis y secreción de citoquinas en respuesta a las señales del TCR. Estos resultados identifican nuevas funciones de los canales de Kv1.3 en la regulación de la función de linfocitos de memoria y fortalecen el interés terapéutico por bloquear los canales KV1.3 con pequeñas moléculas como el Vm24, para combatir enfermedades crónico-inflamatorias. INTEGRANTES DEL GRUPO Personal Adscrito: Investigadores asociados: Ismael Secundino (ISV), Constance Auvynet

(honorarios) Técnicos Académicos: Erika Melchy, Angel Flores Alcantar (AFA) Secretaria: Yvonne Rosenstein Laboratorista: Virginia Ramírez Granados

• Estudiantes: ➢ Licenciatura Victor Manuel Villalva (Biologia, UAEM) tutor: Ismael Secundino Lorena Elizabeth Fajardo Brigido (LCG, UNAM) tutor: Constance Auvynet ➢ Maestría Alicia Cañas Linares (PCBQ, UNAM) tutor: YR Den Alejandro Alvarado Velázquez (CIDC, UAEM) tutor: YR Ivan Carranza Morales (PCBQ, UNAM) tutor: YR

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Sara Gloria Sarmientos (PCBQ, UNAM) tutor: YR Veronica Martinez Osorio (PCBQ, UNAM) tutor: Constance Auvynet y

YR ➢ Doctorado Alvaro Torres Huerta (Posgrado en Ciencias, UAEM) 2017 tutor: YR Estefanía Alemán Navarro (PCBQ, UNAM) tutor: YR Monserrat Alba Sandoval (PCBQ, UNAM) tutor: YR Daniela Vega Mendoza (PCBQ, UNAM) tutor: YR José Ignacio Veytia (PCBQ, UNAM ) tutor: YR y L. Possani PUBLICACIONES

• Torres-Huerta A, Aleman-Navarro E, Bravo-Adame ME, Sandoval-Hernandez MA, Migueles- Lozano OA & Rosenstein Y. CD43, DOI 10.1007/978-1-4614-6438-9_523-1 in Encyclopedia of Signaling Molecules, (2nd edition) S. Choi (ed), Springer

Science+Business Media LLC, 2017

• Bravo-Adame ME, Vera-Estrella R, Barkla BJ, Martínez-Campos C, Flores-Alcantar A, Ocelotl-Oviedo JP, Pedraza-Alva G, Rosenstein Y. An alternative mode of CD43 signal transduction activates pro-survival pathways of T lymphocytes. Immunology 150(1): 87-99. doi: 10.1111/imm.12670, 2017

• Torres-Huerta A, Villaseñor T, Flores-Alcantar A, Parada C, Alemán-Navarro E, Espitia C, Pedraza- Alva G & Rosenstein Y. Interaction of the CD43 Sialomucin with the Mycobacterium tuberculosis Cpn60.2 Chaperonin Leads to Tumor Necrosis Factor Alpha Production. Infect. Immun. 85:314 e00915-16; DOI.org/10.1128/IAI.00915-16, 2017; 2017.

• Schwarz F, Landig C S, Siddiqui S, Secundino I, Olson J, Varki N, Nizet V, Varki A. Paired Siglec receptors generate opposite inflammatory responses to a human-specific pathogen. The EMBO journal, 36(6), 751-760, 2017.

• Lizcano A, Secundino I, Döhrmann S, Corriden R, Rohena C, Diaz S, Ghosh P, Deng L, Nizet V, Varki, A. Erythrocyte sialoglycoproteins engage Siglec-9 on neutrophils to suppress activation. Blood, 129(23), 3100-3110, 2017.

• Reyna-Figueroa J, Lagunas-Martínez A, Galindo-Delgado P, Fernández-Bautista MF, Castro-Oteo PG, Martínez-Matsumoto P, Melchy-Perez E, Rosenstein Y, Limón-Rojas AE, Ortiz-Ibarra FJ, Madrid-Marina V. Serum concentrations of apoptosis-associated molecules in septic children with leukemia, neutropenia and fever. Int J Hematol 105: 668. doi.org/10.1007/ s12185-016-2175-z, 2017

• Quester K, Juarez-Moreno K, Secundino I, Roseinstein Y, Alejo KP, Huerta-Saquero A, Vazquez-Duhalt R: Cytochrome P450 Bioconjugate as a Nanovehicle for Improved Chemotherapy Treatment. Macromol Biosci 17(5). DOI: 10.1002/mabi.201600374, 2017

• Alejo-González K, Quester K, Hanson E, Secundino I, Rosenstein Y, Huerta-Saquero A, Vazquez-Duhalt R.: PEGylation of cytochrome P450 enhances its biocatalytic performance for pesticide transformation. Int J Biol Macromol.105(Pt 1):163-170; DOI: 10.1016/j.ijbiomac.2017.07.014, 2017

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• Vitales-Noyola M, Layseca-Espinosa E, Baranda L, Abud-Mendoza C, Niño-Moreno P, Monsiváis-Urenda A, Rosenstein Y & González-Amaro R: Analysis of sodium chloride intake and Treg/th17 lymphocytes in healthy individuals and patients with rheumatoid arthritis or systemic lupus erythematosus. Journal of Immunology Research, vol. 2018, Article ID 9627806, 11 pages, 2018. doi.org/10.1155/2018/9627806.

• Veytia-Bucheli JI, Jiménez-Vargas JM, Melchy-Pérez E, Sandoval-Hernández MA, Possani LD & Rosenstein Y. Kv1.3 channel blockade with the Vm24 scorpion toxin attenuates the CD4+ effector memory T cell response to TCR stimulation. Cell Communication and Signaling 16: 45. doi: 10.1186/s12964-018-0257-7, 2018

• Cardon S, Sachon E, Carlier E, Drujon T, Walrant A, Aleman-Navarro E, Martinez-Osorio V, Guianvarc’h D, Sagan S, Fleury Y, Marquant R, Piesse C, Rosenstein Y, Auvynet C, Lacombe C: Peptidoglycan potentiates the membrane disrupting effect of the carboxyamidated form of DMS-DA6, a Gram-positive selective antimicrobial peptide isolated from Pachymedusa dacnicolor skin. PloS one, 13(10), e0205727. doi:10.1371/journal.pone.0205727, 2018 PREMIOS Y DISTINCIONES

• Erika Melchy, International Specialist in Ccytometry (SCYM), International Society for Advanced Cytometry ( ISAC), 2017

• Lorena Elizabeth Fajardo Brigido, Premio al mejor poster, nivel licenciatura, XII Congress of the Latin American Association of Immunology & XXII Congress of the Mexican Society of Immunology (2018)

• Estefania Alemán Navarro, Premio al mejor poster, nivel maestria, XII Congress of the Latin American Association of Immunology & XXII Congress of the Mexican Society of Immunology (2018)

• Yvonne Rosenstein, SNI III (2019-2028) ALUMNOS GRADUADOS

• Alvaro Torres Huerta, Doctorado, Facultad de Ciencias , UAEM, Agosto 2017 (YR)

• Alicia Caña Linares, Licenciatura, Facultad de Biologia, UAEM, Marzo 2017 (AFA)

• Estefania Alemán Navarro, Maestria, PCBQ, UNAM, 2017 (YR)

• Victor Manuel Villalva Montaño, Licenciatura, Facultad de Biologia, UAEM, Diciembre 2018 (ISV)

• Sharlotte Lazcano, Escuela de Tecnicos Laboratoristas, UAEM, 2018, (José Ignacio Veytia) DOCENCIA

• Participación en Curso Básico de Biología Celular (sección Señalización intracelular). PCBQ, UNAM, 2017, 2018, (Y. Rosenstein, 18 h)

• Participación puntual en varios tópicos selectos UNAM y UAEM 2017, 2018 (Y. Rosenstein e I. Secundino)

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• Frontiers in Genomics, Licenciatura en Ciencias Genómicas, (Y. Rosenstein, 2017, 2018, curso anual, 4h/semana)

• Tópico Selecto Aplicaciones en Citometria de flujo (curso teorico-práctico) (PCBQ, UNAM) [Paulina Torres (Lab. Claudia Treviño) y Erika Melchy (Lab YR), 2017 y 2018]

• Jornadas Nacionales de Citometría 2017, sede IBT, Taller teórico-practico, E. Melchy, Organizadora y docente, junto con Paulina Torres, 20 h

• Jornadas Nacionales de Citometría 2018, sede IBT. Taller teórico-practico, E. Melchy, Organizadora y docente, junto con Paulina Torres, 20 h DESARROLLO TECNOLÓGICO

• patente en tramite (Comunidad Europea) sobre usos terapéuticos de péptidos de defensa aislados de la piel de rana (2017) DIVULGACIÓN

• “Puertas abiertas 2018”: todos los estudiantes del laboratorio participaron entusiastamente. OTRAS ACTIVIDADES

• Y. Rosenstein Unidad de Citometria

• E. Melchy Responsable técnico, Unidad de Citometria,: apoyo técnico a los usuarios, mantenimiento de los aparatos, cursos “CRASH” de citometria para nuevos usuarios (en promedio 5 cursos/año, 6hrs/curso); tiempo dedicado: 15 hrs/semana en promedio.

• Y. Rosenstein: miembro del Comité de Evaluación de Proyectos Ciencia Básica (2017)

• Y.Rosenstein Comité Técnico y de Administración, fondo Sectorial de Investigación para la Educación SEP-CONACYT, Investigador Invitado (Dic. 2017-Dic.2019)

• Y. Rosenstein: Organización y difusión del ciclo de conferencias “ Frontiers in Genomics”, (25-30 seminarios/año), 2017-2018

• Y. Rosenstein Creación del Mexican Translational Immunology Research Group (MEXTIRG), un Focis Center for Excellence afiliado a FOCIS, (Federation of Clinical Immunology Societies), con sede en IBT DONATIVOS CONACYT

• Ciencia Basica: PARTICIPACIÓN DE LA SIALOMUCINA CD43 EN ACTIVACIÓN Y TRANSFORMACION CÉLULAR (proyecto # 220990), Enero 2015-Septiembre 2018, $1,998,000.00

• Fronteras de la Ciencia 2015-2: PEQUEÑOS PEPTIDOS DE DEFENSA: NUEVAS MOLÉCULAS CON CAPACIDADES INMUNOMODULADORAS Y ANTIMICROBIANAS (proyecto # 853), Noviembre 2016-Septiembre 2018 (prorroga a Noviembre 2019) $ 3,725,000.00

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PAPIIT

• PARTICIPACIÓN DE LA SIALOMUCINA CD43 EN LA ACTIVACIÓN Y MUERTE DE LINFOCITOS T, IN212716, Enero 2016-Diciembre 2018, $ 780,000.00 CÁRTELES QUE PRESENTARÁ EL GRUPO

• ROLE OF CD43 IN THE SECRETION OF FACTORS THAT MODULATE THE TUMORIGENIC PROCESS IN A549 CELLS. Daniela Vega-Mendoza, Alicia Canas Linares, Yvonne Rosenstein

• PROMISING ANTI-INFLAMMATORY AND ANTIMICROBIAL PEPTIDE ISOLATED FROM AN ENDEMIC MEXICAN FROG PACHYMEDUSA DACNICOLOR IN THE TREATMENT OF INFLAMMATORY SKIN DISEASE Elizabeth Fajardo Brigido, Verónica Martínez-Osorio, Estefanía Alemán Navarro Thierry Drujon, Christophe Piesse, Sandra Rodríguez-Martínez, Claire Lacombe, Yvonne Rosenstein & Constance Auvynet

• THE RECOGNITION OF STREPTOCOCCUS GORDONII HSA BY CD43 PROMOTES MACROPHAGE ACTIVATION Villalva-Montaño, V., Torres-Huerta, A., Rosenstein, Y. & Secundino, I

• THE CD43 INTRACELULAR DOMAIN REGULATES AG-SPECIFIC T CELL RESPONSE Erika I. Melchy-Perez, Ivan Carranza-Morales, Angel F. Flores-Alcantara, Gustavo Pedraza-Alva & Yvonne J. Rosenstein