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Programa CNG2004

II Curso Nacional de Genética (2004) 1

II CURSO NACIONAL DE GENÉTICA

Centro Cultural de la Universidad Pablo de OlavideHotel Alcázar de la Reina

Carmona, Sevilla16 al 20 de junio de 2004

Directores del Curso:

Lluís MontoliuCentro Nacional de Biotecnología

CSIC, Madrid

Alberto FerrúsInstituto CajalCSIC, Madrid

Organizado por:

Sociedad Española de Genética

Programa CNG2004


ORGANIZACIÓN Y PATROCINIODEL II CURSO NACIONAL DE GENÉTICA

16-20 de Junio 2004Carmona (Sevilla)

Organizado por:Sociedad Española de Genética (http://seg.umh.es)

Entidades colaboradoras:Genoma España (http://www.gen-es.org)

Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) (http://www.csic.es)Centro Nacional de Biotecnología (CNB) (http://www.cnb.uam.es)

Universidad Pablo de Olavide (http://www.upo.es)Ayuntamiento de Carmona (http://www.carmona.org)

Empresas copatrocinadoras:Applied Biosystems (http://www.appliedbiosystems.com)

Roche Applied Science (http://www.roche-applied-science.com)Leica Microsistemas, S.A. (http://www.leica-microsystems.com)

Pacisa y Giralt (http://www.grupotaper.com)

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Centro Cultural de la Universidad Pablo de OlavideCarmona, Sevilla

16 al 20 de junio de 2004

OrganizadoresLluís Montoliu, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Madrid

Alberto Ferrús, Instituto Cajal, CSIC, Madrid

PROFESORES PARTICIPANTES:

Acaimo González-Reyes CABD, JA-CSIC-UPO, SevillaAlberto Ferrús Instituto Cajal, CSIC, MadridAlfredo Ruiz Universitat Autònoma de BarcelonaAntonio García-Bellido CBMSO-CSIC/UAM, MadridClara Goday CIB, CSIC, MadridJaume Bertranpetit Universitat Pompeu Fabra, BarcelonaFernando de la Cruz Universidad de Cantabria, SantanderFrancisco J. Murillo Universidad de MurciaJoaquín Dopazo CNIO, MadridJosé Angel Suja Universidad Autónoma de MadridJosé Carlos Reyes IBVF, CSIC, SevillaJuan Jiménez CABD, JA-CSIC-UPO, SevillaLluís Montoliu CNB, CSIC, MadridLucas Sánchez CIB, CSIC, MadridMontserrat Aguadé Universitat de BarcelonaRoderic Guigó CRG, BarcelonaSergio Moreno CIC, CSIC, Salamanca

Organizado por: Sociedad Española de Genética

Entidades colaboradoras: Genoma España, Consejo Superior de InvestigacionesCientíficas, Centro Nacional de Biotecnología, Universidad Pablo de Olavide, Ayuntamientode Carmona

Empresas copatrocinadoras: Applied Biosystems, Roche Applied Science, LeicaMicrosistemas, S.A., Pacisa y Giralt

http://www.cnb.csic.es/~cng2004/[email protected]

Lluís Montoliu, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Campus de Cantoblanco, 28049 Madrid([email protected])


PROGRAMA (16-20 de junio de 2004)

Martes 15 de junio de 2004

A partir de las 12:00, a lo largo del día, registro en recepción y entrada en el HotelHotel Alcázar de la Reina

18:00-21:30 Entrega de documentaciónCentro Cultural de la Universidad Pablo de Olavide en CarmonaCasa “Puerta de Córdoba”

22:00 CenaHotel Alcázar de la Reina

Miércoles 16 de junio de 2004Centro Cultural de la Universidad Pablo de Olavide en Carmona

7:30-9:00 DesayunoHotel Alcázar de la Reina

9:00-9:15 Entrega de documentación

9:15-9:30 Sesión de apertura del cursoExcmo Sr. D. Eduardo Santero (Vicerrector de Investigación de la UPO)Lluís Montoliu y Alberto Ferrús (Directores del Curso)

9:30-11:15 Antonio García-BellidoCentro de Biología Molecular “Severo Ochoa”, CSIC/UAM, Madrid

Cómo los genes controlan el número de células y su distribuciónespacial en el organismo adulto

11:15-11:45 Pausa (café)

11:45-13:30 Acaimo González-ReyesCentro Andaluz de Biología del Desarrollo, JA/UPO/CSIC, Sevilla

¿Cómo evitar que una célula madre de la línea germinal entre endiferenciación? ¿Que información deposita la madre en el huevopara dirigir el desarrollo correcto del embrión?

13:30 AlmuerzoCentro Cultural UPO-Restaurante Puerta de Córdoba

15:30-17:15 Alberto FerrúsInstituto Cajal, CSIC, Madrid

¿Cuál es la fuente de variabilidad sobre la que actúa la selecciónnatural?

17:15-17:30 Pausa (café)

17:30-19:15 José Carlos ReyesInstituto de Bioquímica Vegetal y Fotosíntesis, CSIC, Sevilla

¿Como se hereda el estado transcripcional de un gen?

19:15-20:00 Xavier Cristina Applied Biosystems"Soluciones Integrales de Applied Biosystems para la InvestigaciónGenética"

20:15 Actividad socio-cultural en CarmonaVisita guiada al casco histórico y al Museo de la Ciudad(Ayuntamiento de Carmona)


Jueves 17 de junio de 2004Centro Cultural de la Universidad Pablo de Olavide en Carmona


9:30-11:15 Clara GodayCentro de Investigaciones Biológicas, CSIC, Madrid

Eliminación de cromosomas: ¿dónde, cuándo y cómo?

11:15-11:45 Pausa (café)

11:45-13:30 José Angel SujaUniversidad Autónoma de Madrid

¿Por qué y cómo se mantienen asociadas las cromátidas hermanashasta su segregación?


16:00-17:45 Sergio MorenoCentro de Investigación del Cáncer, CSIC/USAL, Salamanca

¿Cuáles son las diferencias fundamentales entre la meiosis y lamitosis?

17:45-18:00 Pausa (café)

18:00-19:45 Juan JiménezCentro Andaluz de Biología del Desarrollo, JA/UPO/CSIC, Sevilla

¿Cómo se coordinan la mitosis y la citocinesis?

20:00 Actividad socio-cultural en CarmonaVisita guiada al Conjunto Arqueológico “Puerta de Sevilla”(Ayuntamiento de Carmona)


Viernes 18 de junio de 2004Centro Cultural de la Universidad Pablo de Olavide en Carmona


9:30-11:15 Fernando de la CruzUniversidad de Cantabria, Santander

¿Cómo se procesa y transporta el DNA durante la conjugaciónbacteriana?

11:15-11:45 Pausa (café)

11:45-13:30 Francisco J. MurilloUniversidad de Murcia

¿Qué hay de nuevo, viejo?


16:00-17:45 Presentación temas investigación de los alumnos

17:45-18:00 Pausa (café)

18:00-20:30 Presentación temas investigación de los alumnos


Sábado 19 de junio de 2004Hotel Alcázar de la Reina


9:30-11:15 Joaquín DopazoCentro Nacional de Investigaciones Oncológicas, Madrid

¿Podemos distinguir entre fenotipos o respuestas al medio usandosolamente datos de expresión génica?

11:15-11:45 Pausa (café)

11:45-13:30 Lluís MontoliuCentro Nacional de Biotecnología, CSIC, Madrid

¿Dónde empieza y termina un gen?

13:30 AlmuerzoHotel Alcázar de la Reina

16:00-17:45 Jaume BertranpetitUniversitat Pompeu Fabra, Barcelona

¿Podemos leer en el genoma qué hace humano a un humano?

17:45-18:00 Pausa (café)

18:00-19:45 Montserrat AguadéUniversitat de Barcelona

¿Puede la variabilidad en las secuencias de DNA aportar informaciónacerca de cambios adaptativos en las proteínas?

22:00 Cena oficial del curso en un restaurante típico de Carmona

Domingo 20 de junio de 2004Hotel Alcázar de la Reina


9:30-11:15 Alfredo RuizUniversitat Autónoma de Barcelona

¿Cuán maleable es el genoma eucariótico?

11:15-11:45 Pausa (café)

11:45-13:30 Lucas SánchezCentro de Investigaciones Biológicas, CSIC, Madrid

¿Por qué hay un alto grado de variación en los mecanismos dedeterminación sexual?

13:30 AlmuerzoHotel Alcázar de la Reina

16:00-17:45 Roderic GuigóCentre de Regulació Genòmica, Barcelona

Busqueda de genes en genomas eucariotas. Aplicaciones de lagenomica comparativa.

17:45-18:15 Conclusiones, evaluación y clausura del Curso

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TEMAS PROPUESTOS PARA LOS PROFESORES PARTICIPANTES

Antonio García-Bellido Morfogénesis

Acaimo González-Reyes Oogénesis

Alberto Ferrús Motores de especiación

Clara Goday Eliminación de cromosomas

José Angel Suja Cohesión cromosómica

Sergio Moreno Meiosis

Juan Jiménez Mitosis

Fernando de la Cruz Conjugación bacteriana

Francisco J. Murillo Reg. de la Expresión génica en procariotas

José Carlos Reyes Transcripción en plantas

Joaquín Dopazo Expresión génica

Lluís Montoliu Transferencia génica en animales

Jaume Bertranpetit Evolución humana

Montserrat Aguadé Evolución molecular

Alfredo Ruiz Evolución cromosómica

Lucas Sánchez Evolución de la determinación sexual

Roderic Guigó Genómica comparativa

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Profesor: Antonio García-Bellido

Tema: Morfogénesis

Pregunta: Cómo los genes controlan el número de células y su distribuciónespacial en el organismo adulto

Referencias bibliográficas:

“Los genes del Cámbrico”Antonio García-Bellido

Resino J, Salama-Cohen P, Garcia-Bellido A.Determining the role of patterned cell proliferation in the shape and size of the Drosophilawing.Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 May 28;99(11):7502-7

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Profesor: Acaimo González-Reyes

Tema: Oogénesis

Problema: La hembra de Drosophila produce gametos de forma continuadadurante toda su vida. Para ello necesita de la existencia de células madre en lalínea germinal. Asimismo, la maduración de estos gametos (oocitos) en huevoscapaces de ser fecundados y de dar lugar a embriones normales requiere de laacción coordinada de células somáticas y de células de la línea germinal.

Preguntas: ¿Cómo evitar que una célula madre de la línea germinal entre endiferenciación? ¿Que información deposita la madre en el huevo para dirigir eldesarrollo correcto del embrión?


González-Reyes, A. (2003).Stem cells, niches and cadherins: a view from Drosophila.J. Cell Sci. 116, 949-954.

Spradling, A., Drummond-Barbosa, D. and Kai, T. (2001).Stem cells find their niche.Nature 414, 98-104.

Torres, I., López-Schier, H. and St Johnston, D. (2003).A Notch/Delta-dependent relay mechanism establishes anterior-posterior polarity inDrosophila.Dev Cell 5, 547-558.

van Eeden, F. and St Johnston, D. (1999).The polarisation of the anterior-posterior and dorsal-ventral axes during Drosophilaoogenesis.Curr. Op. Gen. Dev. 9, 396-404.

Xie, T. and Spradling, A. (1998).decapentaplegic is essential for the maintenance and division of germline stem cells in theDrosophila ovary.Cell 94, 251-260.

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Profesor: Alberto Ferrús

Tema: Motores de especiación

Pregunta: ¿Cuál es la fuente de variabilidad sobre la que actúa la selecciónnatural?


Davidson EH, McClay DR, Hood L. (2003)Regulatory gene networks and the properties of the developmental process.Proc Natl Acad Sci U S A. 100(4): 1475-1480.

HÄMMERLE,B. and FERRÚS,A. (2003)Expression of enhancers is altered in Drosophila melanogaster hybrids.Evol. & Devel. 5, 221-230.

Meiklejohn CD, Parsch J, Ranz JM, Hartl DL.Rapid evolution of male-biased gene expression in Drosophila.Proc Natl Acad Sci U S A. 2003 Aug 19;100(17):9894-9.

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Profesor: Clara Goday

Tema: Eliminación de cromosomas

Pregunta: Eliminación de cromosomas: ¿dónde, cuándo y cómo?


de Saint-Phalle B, Sullivan W.Incomplete sister chromatid separation is the mechanism of programmed chromosomeelimination during early Sciara coprophila embryogenesis.Development 1996;122;3775-3784.

M. R. Esteban., M. C. C. Campos, A. L. P. Perondini and C. Goday.Role of microtubules and microtubule organizing centers on meiotic chromosomeelimination in Sciara ocellarisJ. Cell Sci. 110:721-730 (1997).

C. Goday and M.R. EstebanChromosome elimination in sciarid flies.BioEssays. 23:242-250 (2001).

C. Goday and M. F. Ruiz.Differential acetylation of histones H3 and H4 in paternal and maternal germlinechromosomes during development of sciarid flies.J. Cell Sci. 115: 4765-4775 (2002).

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Profesor: José Ángel Suja

Tema: Cohesión cromosómica

Pregunta: ¿Por qué y cómo se mantienen asociadas las cromátidas hermanashasta su segregación?

Referencias bibliograficas:

Klein F, Mahr P, Gálová M, Buonomo SBC, Michaelis C, Nairz K, Nasmyth K. 1999.A central role for cohesins in sister chromatid cohesion, formation of axial elements, andrecombination during yeast meiosis.Cell 98: 91-103.

Prieto I, Suja JA, Pezzi N, Kremer L, Martínez-A C, Rufas JS, Barbero JL. 2001.Mammalian STAG3 is a cohesin specific to sister chromatid arms during meiosis I.Nature Cell Biol. 3: 761-766.

Haering CH, Nasmyth K. 2003.Building and breaking bridges between sister chromatids.BioEssays 25: 1178-1191.

Kitajima TS, Yokobayashi S, Yamamoto M, Watanabe Y. 2003.Distinct cohesin complexes organize meiotic chromosome domains.Science 300: 1152-1155.

Parra MT, Viera A, Gómez R, Page J, Benavente R, Santos JL, Suja JA. 2004.Involvement of the cohesin Rad21 and SCP3 in monopolar attachment of sister kinetochoresduring mouse meiosis I.J. Cell Sci. 117:1221-34.

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Profesor: Sergio Moreno

Tema: Meiosis

Pregunta: ¿Cuáles son las diferencias fundamentales entre la meiosis y la mitosis?


Petronczki M, Siomos MF, Nasmyth K (2003).Un menage a quatre: the molecular biology of chromosome segregation in meiosis.Cell 112: 423-440.

Hassold T, Hunt P. (2001).To err (meiotically) is human: the genesis of human aneuploidy.Nat Rev Genet. 2: 280-291.

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Profesor: Juan Jiménez

Tema: Mitosis

Pregunta: ¿Cómo se coordinan la mitosis y la citocinesis?


Gruneberg U, Nigg EA (2003)Regulation of cell division: stop the SIN!.Trends in Cell Biology 13: 159-162 Guertin DA, Venkatram S, Gould KL, McCollum D. (2002)Dma1 prevents mitotic exit and cytokinesis by inhibiting the septation initiation network(SIN).Dev Cell. 3:779-90.

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Profesor: Fernando de la Cruz

Tema: La conjugación bacteriana

Pregunta: ¿Cómo se procesa y transporta el DNA durante la conjugaciónbacteriana?

Referencias bibliográficas

Cascales, E., Christie, P.J. (2003)The versatile bacterial type IV secretion systems.Nat Rev Microbiol 1:137-149.

Errington, J., Bath, J., Wu, L.J. (2001)DNA transport in bacteria.Nat Rev Mol Cell Biol 2: 538-545.

Guasch, A., Lucas, M., Moncalian, G., Cabezas, M., Perez-Luque, R., Gomis-Ruth, F.X., de laCruz, F., and Coll, M. (2003)Recognition and processing of the origin of transfer DNA by conjugative relaxase TrwC.Nat Struct Biol 10: 1002-1010.

Llosa, M., Gomis-Ruth, F.X., Coll, M., de la Cruz, F. (2002)Bacterial conjugation: a two-step mechanism for DNA transport.Mol Microbiol 45: 1-8.

Llosa, M., Zunzunegui, S., and de la Cruz, F. (2003)Conjugative coupling proteins interact with cognate and heterologous VirB10-like proteinswhile exhibiting specificity for cognate relaxosomes.Proc Natl Acad Sci U S A 100: 10465-10470.

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Profesor: Francisco J. Murillo

Tema: Regulación de la expresión génica en procariotas

Pregunta: ¿Qué hay de nuevo, viejo?

Referencias bibliográficas

Laub MT, Chen SL, Shapiro L, McAdams HH (2002).Genes directly controlled by CrtA, a master regulator of the Caulobacter cell cycle.Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99: 4632-4637.

Padmanabhan S, Elías-Arnanz M, Carpio E, Aparicio P, Murillo FJ (2001)Domain architecture of a high mobility group A-type bacterial transcriptional factor.J. Biol. Chem. 276: 41566-41575.

Rhodius V, Van Dyk TK, Gross C, LaRossa RA (2002).Impact of genomic technologies on studies of bacterial gene expression.Annu. Rev. Microbiol. 56: 599-624.

Shen-Orr SS, Milo R, Mangan S, Alon U (2002)Network motifs in the transcriptional regulation network of Escherichia coliNature Genet. 31: 64-68.

Vitreschak AG, Rodionov DA, Mironov AA, Gelfand MS (2004)Riboswitches: the oldest mechanism for the regulation of gene expression?Trends Genet. 20: 44-50.

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Profesor: José Carlos Reyes

Tema: Transcripción y epigenética

Pregunta: ¿Cómo se hereda el estado transcripcional de un gen?


Li E.Chromatin modification and epigenetic reprogramming in mammalian development.Nat. Rev. Genet. 2002, 3:662-673.

Tamaru H, Zhang X, McMillen D, Singh PB, Nakayama J, Grewal SI, Allis CD, Cheng X,Selker EU.Trimethylated lysine 9 of histone H3 is a mark for DNA methylation in Neurospora crassa.Nat. Genet. 2003, 34: 75-79.

Bastow R, Mylne JS, Lister C, Lippman Z, Martienssen RA, Dean C.Vernalization requires epigenetic silencing of FLC by histone methylation.Nature. 2004 Jan 8; 427(6970): 164-7.

Turner, B. M.Cellular memory and the histone code.Cell 2002, 111:285-291

Reyes JC, Hennig L, Gruissem W.Chromatin-remodeling and memory factors. New regulators of plant development.Plant Physiol. 2002, 130: 1090-1101.

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Profesor: Jaume Bertranpetit

Tema: Evolución humana

Problema: En el estudio de la diversidad genética (polimorfismos dentro denuestra especie, divergencia respecto a especies próximas) podemos interpretarlos resultados del análisis de diferentes regiones del genoma de dos formas:para entender la dinámica del genoma o para entender la dinámica de laspoblaciones o especies estudiadas. Hay un valor añadido en esta aproximación,ya que el proceso que ha llevado a seleccionar los cambios evolutivos exclusivosde una (nuestra) especie nos permite abordar el estudio del genoma no sólopara reconstruir el proceso seguido en la evolución (tempo) sino para reconocerlos cambios esenciales en la determinación de las bases biológicas de loscaracteres exclusivos de nuestra especie (mode).

Pregunta: ¿Podemos leer en el genoma qué hace humano a un humano?


Bertranpetit & Calafell (2004) Genome views on Human Evolution. Evolution: fromMolecules to Ecosystems. (Moya & Font eds.) Oxford University Press.

Bamshad M & Wooding SP (2003)Signatures of selection in the human genome.Nat Rev Genet 4: 99-111

Clark et al (2003)Inferring Nonneutral Evolution from Human-Chimp-Mouse Orthologous Gene Trios.Science: 302: 1960-1963,

Tishkoff SA, Verrelli BC.Patterns of human genetic diversity: implications for human evolutionary history anddisease.Annu Rev Genomics Hum Genet. 2003;4:293-340

Y sin duda hasta junio aparecerán muchos otros que podremos comentar. Muchostrascenderán las publicaciones científicas y aparecerán el la prensa (lenguaje, cerebro,olfato....)

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Profesor: Montserrat Aguadé

Tema: Evolución Molecular

Pregunta: ¿Puede la variabilidad en las secuencias de DNA aportar informaciónacerca de cambios adaptativos en las proteínas?


N. G. C. Smith & A. Eyre-Walker, 2002Adaptive protein evolution in DrosophilaNature 415, 1022-1024

J. Fay , G. Wyckoff & C-I. Wu, 2002Testing the neutral theory of molecular evolution with genomic data from Drosophila.Nature 415,1024–1026

H. Quesada, H., U. E. M Ramírez, J. Rozas & M. Aguadé 2003 Large-scale adaptivehitchhiking upon high recombinationGenetics 165, 895-900

A. G. Clark, S. Glanowski, R. Nielsen, P. D. Thomas, A. Kejariwal, et al., 2003Inferring Nonneutral Evolution from Human-Chimp-Mouse Orthologous Gene TriosScience 302, 1960-1963

E. Ruiz-Pesini, D. Mishmar & D. C. Wallace1, 2004Effects of purifying and adaptive selection on regional variationin human mtDNAScience 303, 223-226

T. A. Schlenke & D. J. Begun, 2004Strong selective sweep associated with a transposon insertion in Drosophila simulansProc. Natl. Acad. Sci. 101, 1626–1631

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Profesor: Joaquín Dopazo

Tema: expresión génica

Las diferencias fenotípicas o en las respuestas al medio entre individuos son laconsecuencia visible de diferencias a nivel molecular en la expresión de losgenes. Las metodologías de microarrays nos permiten, actualmente, medir losniveles de expresión de decenas de miles de genes simultáneamente.

Preguntas:¿Podemos distinguir entre fenotipos o respuestas al medio usando solamentedatos de expresión génica?, ¿podemos detectar todos los genes, sinequivocarnos, responsables de estas diferencias? ¿podemos saber que papelesestán jugando estos genes a nivel molecular?


Alizadeh et al., (2000)Distinct types of diffuse large B-cell lymphoma identified by gene expression profiling.Nature 403:503-511

Dopazo, J., Zanders, E., Dragoni, I., Amphlett, G. and Falciani, F. (2001)Methods and approaches in the analysis of gene expression data.J. Immunol. Meth. 250, 93-112.

Herrero et al., (2003a)GEPAS, a web-based resource for microarray gene expression data analysis.Nucleic Acids Research 31(13), 3461-3467.

Holloway et al., (2002)Options available—from start to finish—for obtaining data from DNA microarrays IINat Genet 32:481–489

Mateos A., Dopazo, J., Jansen, R., Tu, Y., Gerstein, M. & Stolovitzky, G (2002a)Systematic Learning of Gene Functional Classes From DNA Array Expression Data by UsingMultilayer Perceptrons.Genome Research 12, 1703-1715

Simon R, Radmacher MD, Dobbin K, McShane LM. (2003)Pitfalls in the use of DNA microarray data for diagnostic and prognostic classification.J Natl Cancer Inst. 95:14-18

van't Veer et al., (2002).Gene expression profiling predicts clinical outcome of breast cancer.Nature, 415: 530-536

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Profesor: Lluís Montoliu

Tema: Transferencia genica en mamiferos

Pregunta: ¿Dónde empieza y termina un gen?


Giraldo P, Martinez A, Regales L, Lavado A, Garcia-Diaz A, Alonso A, Busturia A, Montoliu L.Functional dissection of the mouse tyrosinase locus control region identifies a new putativeboundary activity.Nucleic Acids Res. 2003 Nov 1;31(21):6290-305.

Byrd K, Corces VG.Visualization of chromatin domains created by the gypsy insulator of Drosophila.J Cell Biol. 2003 Aug 18;162(4):565-74.

West AG, Gaszner M, Felsenfeld G.Insulators: many functions, many mechanisms.Genes Dev. 2002 Feb 1;16(3):271-88.

Labrador M, Corces VG.Setting the boundaries of chromatin domains and nuclear organization.Cell. 2002 Oct 18;111(2):151-4.

Bonifer C.Developmental regulation of eukaryotic gene loci: which cis-regulatory information isrequired?Trends Genet. 2000 Jul;16(7):310-5.

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Profesor: Alfredo Ruiz

Pregunta:

• ¿Cuán maleable es el genoma eucariótico?• ¿Existen límites a su reorganización?• ¿Es la organización de los cromosoma el resultado de contreñimientosfuncionales o simplemente el subproducto de la fijación de numerosasreordenaciones con puntos de rotura aleatorios?Referencias bibliográficas:

Nadeau, J.H. and B. A. Taylor 1984.Lengths of chromosomal segments conserved since divergence of man and mouse.Proc. Nat. Acad. Sci. USA 81: 814-818.

Ranz, J.M., F. Casals and A. Ruiz 2001.How malleable is the eukaryotic genome? Extreme rate of chromosomal rearrangement inthe genus Drosophila.Genome Research 11: 230-239.

Gónzalez J., J.M. Ranz and A. Ruiz 2002.Chromosomal elements evolve at different rates in the Drosophila genome.Genetics 161: 1137-1154.

Hurst, L.D., E.J.B. Williams and Csaba Pál 2002.Natural selection promotes the conservation of linkage of co-expressed genes.Trends in Genetics 18: 604-606.

Pevzner and Tesler 2003.Human and mouse genomic sequences reveal extensive breakpoint reuse in mammalianevolution.Proc. Nat. Acad. Sci. USA 100: 7672-7677.

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Profesor: Lucas Sánchez

Tema: Evolución de la determinación sexual

Problema: La determinación sexual es un proceso de desarrollo que da lugar ahembras y machos, que son distintos desde el punto de vista morfológico,fisiológico y de conducta. Hay una plétora de mecanismos de determinaciónsexual, los cuales se dan en el conjunto de los insectos.

Pregunta: ¿Por qué hay un alto grado de variación en los mecanismos dedeterminación sexual?


R. Nöthiger and M. Steinmann-Zwicky. 1985.A single principle for sex determination in insects.Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 50: 615-621.

S. A. Wilkins. 1995.Moving up the hierarchy: a hypothesis on the evolution of a genetic sex determinationpathway.BioEssays 17: 71-77.

I. Marín and B. S. Baker. 1998.The evolutionary dynamics of sex determination.Science 281: 1990-1994.

L. Sánchez and A. L. P.Perondini. 1999.Sex determination in sciarid flies: a model for the control of differential X-chromosomeelimination.J. theor. Biol. 197: 247-259.

G. Saccone, A. Pane and L. C. Polito. 2002.Sex determination in flies, fruitflies and butterflies.Genetica 116: 15-23.

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Profesor: Roderic Guigó

Tema: Busqueda de genes en genomas eucariotas. Aplicaciones de la genomicacomparativa.

Pregunta: Ante la secuencia recién obtenida del genoma de una especie protista,de la cual no se conoce prácticamente ningún gen, ¿qué estrategias cabríaseguir para identificar los genes codificados en ese genoma?


M.Brent and R. Guigo, "Recent Advances in Gene Strucutre Prediction",Current Opinion in Structural Biology (in press, June 2004)

G.V. Kryukov, S. Castellano, S.V. Novoselov, A.V. Lobanov, O. Zehtab, R. Guigó and V.N.Gladyshev"Characterization of mammalian selenoproteomes." Science 300(5624):1439-1443 (2003)

R. Guigó, E.T. Dermitzakis, P. Agarwal, C.P. Ponting, G. Parra, A. Reymond, J.F. Abril, E.Keibler, R. Lyle, C. Ucla, S.E. Antonarakis and M.R. Brent."Comparison of mouse and human genomes followed by experimental verification yields anestimated 1,019 additional genes."Proc. Nat. Acad. Sci. 100(3):1140-1145 (2003)

M. Zhang"Computational prediction of eukaryotic protein-coding genes"Nature Reviews Genetics 3, 698 - 709 (2002)

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