UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS

FACULTAD DE CIENCIAS BIOLGICAS

ESCUELA ACADMICO-PROFESIONAL DE MICROBIOLOGA Y PARASITOLOGA

SYLLABUS

SEMESTRE ACADMICO: 2013 I I. DATOS GENERALES

1.1. NOMBRE DEL CURSO : FUNDAMENTOS DE MICROBIOLOGA 1.2. CDIGO DEL CURSO : B03113 1.3. CRDITOS : 04

1.4. AO DE ESTUDIOS : III Ciclo (2 Ao) 1.5. NMERO DE HORAS : 6 horas (2 hrs. de teora y 4 hrs. de prctica) 1.6. DURACIN DEL CURSO : 17 semanas

1.7. HORARIO Y AMBIENTES 1.7.1.TEORA : Martes 10-12 horas (Pab. Docencia, aula 308)

1.7.2.PRCTICA : Grupo 1: Martes y Jueves de 2-4 p.m. (Pab. Investigacin, Lab.S1) Grupo 2: Martes y Jueves de 4-6 p.m. (Pab. Investigacin, Lab.S1)

1.8. PRE-REQUISITOS : Biologa Celular

1.9. PROFESORA RESPONSABLE : M.Sc. Ruth Garca de la Guarda Profesora Principal D.E.

1.10. PROFESORES COLABORADORES: M.Sc. Dbora Alvarado Iparraguirre Profesora Principal D.E. Dr. Pablo Ramrez Roca Profesor Principal D.E.

Dra. Egma Mayta Huatuco Profesora Principal D. E. M.Sc. Enrique Mamani Zapana Profesor Auxiliar T. C. M. Sc. Tito Snchez Rojas Profesor Auxiliar T. C.

Blgo. Fernando De la Cruz Calvo Profesor Auxiliar T. C.

1.11. PROFESORES INVITADOS :

M.Sc. Jorge Soto Villanueva Maestra en Microbiologa Avanzada Facultad de Biologa Universidad Autnoma de Madrid - Espaa

1.12. ASISTENTES DE PRCTICA : Myriam del Carmen Garca Rivera Jane Torres Chati

Nataly Roco Len Rojas Jos Vctor Licla Pariona Carlos Leonardo Quispe Sosa Ela Wendy Contreras Panta Ivette Alejandra Fuentes Quispe Joe Hermosilla Jara

Joseph Vctor Orellana Carmen Cecilia Matallana Katherine Margarita Larran Loayza Oscar Enrique Panana Rodrguez Karen Lisett Orozco Romero Jaime Augusto Guzmn Crdova

II. SUMILLA

El curso enfoca el estudio de las estructuras y la organizacin subcelular de los microorganismos y el conocimiento de las asociaciones supramoleculares (virus, priones, etc.). Se tocarn aspectos bsicos de la diversidad microbiana y su importancia en los ecosistemas. El alumno adquirir destrezas para el manejo y reconocimiento primario de

microorganismos dentro de las normas internacionales de bioseguridad y tcnicas generales del laboratorio microbiolgico.

III. OBJETIVOS DEL CURSO Al finalizar el curso el estudiante ser capaz de:

Comprender y explicar la morfologa, estructura y funcin celular y subcelular de los procariontes y microorganismos eucariticos.

Comprender y explicar aspectos bsicos de la estructura y diversidad viral, as como de las partculas sub-virales denominadas viroides y priones.

Comprender y explicar los fundamentos cientficos de la evolucin y diversidad microbiana, incluyendo la sistemtica y taxonoma.

Comprender y explicar los aspectos bsicos de fisiologa, gentica, genmica y ecologa de los microorganismos.

Conocer la biodiversidad de los principales grupos de microorganismos patgenos y de aquellos usados en la industria, agricultura y biorremediacin.

Conocer y aplicar los principios de la seguridad biolgica y no biolgica en el laboratorio de microbiologa.

Manipular correctamente los microorganismos en el laboratorio. Preparar adecuadamente los materiales usados en el laboratorio de microbiologa. Conocer los principios y aplicar los mtodos de esterilizacin y desinfeccin en el laboratorio de

microbiologa. Conocer los fundamentos de los procedimientos y protocolos para el estudio de los microorganismos. Aplicar e interpretar los resultados de los procedimientos y protocolos para el estudio de los

microorganismos.

IV. EVALUACIN Se tomarn dos exmenes tericos y prcticos parciales cancelatorios para evaluar la capacidad de

comprensin y de anlisis del alumno. La calificacin tendr una escala vigesimal (0-20).

Los informes de prctica son grupales, se califican de 0 a 20 y debern ser entregados en formato electrnico (CD) una semana despus de terminada dicha prctica. Los informes consistirn de una breve introduccin (fundamento de la prctica), procedimiento empleado, resultados obtenidos, discusin

(anlisis de sus resultados comparando con bibliografa), conclusiones y referencias bibliogrficas. Se tomarn pasos de prctica de 15 minutos con calificacin de 0-20. Primer examen terico y prctico : martes 14 de mayo (10-12 horas, aula 308) Segundo examen terico y prctico: martes 9 de julio (10-12 horas, aula 308) Examen sustitutorio : martes 16 de julio (10-12 horas, aula 308) Slo se podr sustituir un examen terico. No habr examen de prctica sustitutorio. El promedio final se obtendr aplicando la siguiente ponderacin:

-Promedio de los exmenes tericos: 50%

-Promedio de los exmenes prcticos: 40% -Promedio de los informes de prctica: 5% -Promedio de los pasos de prctica: 5%

La asistencia es OBLIGATORIA. El alumno con 30% de inasistencias no tendr derecho a evaluacin final de acuerdo con las disposiciones vigentes de la UNMSM.

V. METODOLOGA Para el desarrollo del curso se emplearn exposiciones tericas y clases prcticas de laboratorio.

Las exposiciones tericas se harn con la finalidad de proporcionar al alumno los conceptos y fundamentos cientficos del tema a desarrollar segn lo programado en el syllabus.

Las clases prcticas de laboratorio se harn para reforzar la informacin terica dada y para generar en el

alumno destrezas manuales y habilidades requeridas para el trabajo cotidiano en el laboratorio de microbiologa. Los estudiantes sern distribuidos en grupos de trabajo cada uno de los cuales estarn bajo permanente supervisin de un profesor de prctica. Para ingresar al laboratorio es obligatorio que los estudiantes porten su

mandil, guantes y mascarilla, como medida de bioseguridad. Cada uno de los estudiantes debe traer sus asas de siembra, encendedor, plumn marcador indeleble y pinza de madera o plstico para el trabajo de laboratorio. Asimismo, al finalizar la prctica los estudiantes deben usar jabn y alcohol para la higiene de sus manos.

VI. PROGRAMACIN

CALENDARIZACIN POR SEMANAS DE LAS CLASES TERICAS

SEMANA TEORA DESCRIPCIN PROFESOR(A)

1

T1

Introduccin

La Microbiologa como ciencia. Comparacin entre clula procaritica y

eucaritica. Virus, viroides, priones.

Ruth Garca

2 T2

Historia de la Microbiologa: desde van Leeuwenhoek hasta la

Microbiologa molecular.

Dbora Alvarado

3

T3-T4

Estructura y funcin celular de procariontes: Bacteria

Morfologa celular: Forma, tamao y agrupamiento celular. Estructura celular: paredes celulares, membrana externa de los

gramnegativos.

Filamentos de MreB (citoesqueleto). Biosntesis de peptidoglucano, formas

defectuosas (formas L: protoplastos y esferoplastos). Membranas:

funciones, sistemas de transporte y de exportacin.

Ruth Garca

Ruth Garca

4 T5-T6

Estructuras de superficie: Fimbrias, pili, adhesinas. Glicoclix: cpsula y

slim layer. Flagelos, estructura y sntesis. Motilidad: flagelar, deslizante y

otras. Quimiotaxis, fototaxis y otras taxias.

Estructuras internas: Endosporas, estructura, esporulacin y germinacin.

Organelos, grnulos de almacenamiento, vesculas de gas.

Ruth Garca

5

T7-T8

Estructura y funcin celular de procariontes: Archaea

Morfologa celular. Estructura celular: paredes celulares,

pseudopeptidoglucano, capas S o paracristalinas. Membranas: estructura y

funcin. Diferencias y semejanzas con las Bacteria. Estructuras de

superficie y estructuras internas. Genoma. Hbitat. Importancia de su

estudio.

Jorge Soto

6

T9-T10

Estructura y funcin celular de los microorganismos eucariticos.

Morfologa celular y estructuras caractersticas de los microorganismos

eucariticos. Estructuras de superficie, esporas, motilidad. Hongos y

protozoarios.

Dbora Alvarado

7

T11-T12

Los virus, viroides y priones.

Morfologa y estructura viral. Elementos de replicacin viral. Diversidad

viral. Partculas sub-virales: viroides y priones. Importancia.

Egma Mayta

8 14 / 05 PRIMER EXAMEN Ruth Garca

SEMANA TEORA DESCRIPCIN PROFESOR(A)

9

T13

T14

Biologa molecular, gentica y genmica microbiana

El cromosoma y los plsmidos. Conceptos de secuencias IS, transposones,

integrones e islas genmicas.

Recombinacin gentica: conceptos de transformacin, transduccin y

conjugacin. Ingeniera Gentica: conceptos de clonamiento molecular,

vectores, PCR, enzimas de restriccin. Conceptos de genmica, metagenmica

y protemica.

Ruth Garca

Pablo Ramrez

10

T15

T16

Nutricin, metabolismo y crecimiento microbiano

Requerimientos nutricionales. Fuentes de carbono y energa. Tipos

nutricionales. Diversidad metablica de los microorganismos.

Divisin celular y crecimiento exponencial bacteriano. Ciclo del crecimiento.

Efecto del O2, pH, temperatura y disponibilidad de agua sobre el crecimiento.

Ruth Garca

Ruth Garca

11

T17

T18

Antibiticos y quimioterpicos

Definicin de antibiticos y quimioterpicos. Clasificacin. Mecanismos de accin.

Fundamentos de la resistencia de los microorganismos a los antibiticos y

quimioterpicos.

Ruth Garca

Ruth Garca

12

T19

T20

Evolucin microbiana y diversidad

Origen de la vida. Teora endosimbitica. Mtodos para determinar las

relaciones evolutivas. Evolucin microbiana.

Sistemtica y taxonoma. Concepto de especie. El rbol de la vida. Filogenia

de Bacteria, Archaea y Eukarya.

Dbora Alvarado

Dbora Alvarado

13 T21-T22

Diversidad de Bacteria. Diversidad de Archaea y de microorganismos

eucariticos (Eukarya).

Dbora Alvarado

14

T23-T24

Ecologa microbiana

Ecosistemas microbianos. Microbiologa de suelos. Microbiologa de aguas

continentales y marinas. Importancia de los microorganismos en su ambiente

natural.

Dbora Alvarado

15

T25-26

Microbiologa aplicada

Principales microorganismos patgenos de humanos, animales y plantas.

Principales microorganismos usados en la industria, agricultura, biorremediacin y como herramientas para la ciencia.

Ruth Garca

Ruth Garca

16 09 / 07 SEGUNDO EXAMEN Ruth Garca

17 16 / 07 EXAMEN SUSTITUTORIO Ruth Garca

CALENDARIZACIN POR SEMANAS DE LAS CLASES PRCTICAS SEMANA PRCTICA DESCRIPCIN PROFESOR(A)* / ASISTENTES

1 Organizacin de las prcticas. R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz

2 P1 Bioseguridad en el laboratorio de microbiologa. D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz

3 P2 Lavado y preparacin de material microbiolgico. T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / J. Orellana, C. Matallana.

P3 Control del Crecimiento Microbiano. Parte I. Mtodos de esterilizacin y desinfeccin en laboratorio.

F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani

4 P4 Preparacin de medios de cultivo. T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / O. Panana, K. Orozco, K. Larran

P5 Distribucin de los medios de cultivo preparados y su control de calidad.

E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / O. Panana, K. Orozco, K. Larran

5 P6 Mtodos de siembra para el aislamiento de microorganismos, obtencin de cultivos puros y mantenimiento de cepas. Tcnicas aspticas.

T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / N. Len, O. Panana, K. Larran

P7 Caractersticas culturales: Morfologa de colonias. Actividad hemoltica. Crecimiento en caldo y en plano inclinado.

R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, A. Fuentes, O. Panana

6 P8 Coloraciones microbianas: Gram y Ziehl Neelsen. Coloraciones especiales: endosporas.

T. Snchez, R. Garca, D. Alvarado, E. Mamani, F. De la Cruz / E. Contreras, K. Larran, K. Orozco

P9 Estudio microscpico de hongos. Mtodos de cultivo: siembra en placas.

D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / J. Hermosilla, A. Fuentes, J. Licla

7 P10 Coloraciones especiales: flagelos, cpsula, pared celular, corpsculos metacromticos.

R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, N. Len, E. Contreras

P11

Estudio microscpico de hongos. Lectura: caractersticas culturales.

Microcultivos de hongos: Siembra.

D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F.

De la Cruz / J. Hermosilla, A. Fuentes, J. Licla, J. Torres

8 14 / 05 PRIMER EXAMEN R. Garca

9 P12 Microcultivos de hongos: lectura. D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / J. Hermosilla, A. Fuentes, J. Licla, J. Torres

P13 Sistemas de propagacin viral. E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / E. Contreras, C. Matallana, J. Guzmn

10 P14 Cultivo de microorganismos anaerobios. Siembra. R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, N. Len, C. Quispe, O. Panana

P15 Cultivo de microorganismos anaerobios. Lectura. R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, N. Len, C. Quispe, O. Panana

11 P16 Medicin del crecimiento microbiano: Enumeracin directa, enumeracin de microorganismos viables. Siembra.

D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / N. Len, J. Licla, J. Torres, J. Orellana

P17 Medicin del crecimiento microbiano: Enumeracin directa, enumeracin de microorganismos viables. Lectura.

D. Alvarado, R. Garca, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / N. Len, J. Licla, J. Torres, J. Orellana

12 P18 Metabolismo microbiano: Hidrlisis de protenas y aminocidos. Siembra.

E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / N. Len, C. Quispe, K. Larran, J. Guzmn

P19 Metabolismo microbiano: Hidrlisis de protenas y aminocidos. Lectura.

E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F.

De la Cruz / N. Len, C. Quispe, K. Larran, J. Guzmn

13 P20 Metabolismo microbiano: Hidrlisis de carbohidratos. Siembra. R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, J. Torres, J. Hermosilla, K. Orozco

P21 Metabolismo microbiano: Hidrlisis de carbohidratos. Lectura. R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani, F. De la Cruz / M. Garca, J. Torres, J. Hermosilla, K. Orozco

14 P22 Metabolismo microbiano: Hidrlisis de compuestos nitrogenados y enzimas de xido reduccin. Siembra.

F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani / A. Fuentes, E. Contreras, J. Orellana, C. Matallana

P23 Metabolismo microbiano: Hidrlisis de compuestos nitrogenados y enzimas de xido reduccin. Lectura.

F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani / A. Fuentes, E. Contreras, J. Orellana, C. Matallana

15 P24 Control del crecimiento microbiano. Parte II. Efecto de los agentes fsicos, qumicos, antibiticos y quimioterpicos. Siembra.

F. De la Cruz, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, E. Mamani / J. Torres, J. Licla, C. Quispe, J. Guzmn

P25 Control del crecimiento microbiano. Parte II. Efecto de los agentes fsicos, qumicos y antibiticos. Lectura.

E. Mamani, R. Garca, D. Alvarado, T. Snchez, F. De la Cruz / J. Torres, J. Licla, C. Quispe, J. Guzmn

16 09 / 07 SEGUNDO EXAMEN R. Garca

17 16 / 07 EXAMEN SUSTITUTORIO R. Garca

*Se ha subrayado el nombre del profesor (a) responsable de organizar la prctica.

VII. BIBLIOGRAFA RECOMENDADA

TEXTOS:

BAUMAN R. 2007. Microbiology. 2nd Edition. Pearson Education, Inc. USA. 778pp.

BROOKS G.F., BUTEL J.S., MORSE S.A. Jawetz, Melnick, & Adelberg's Medical Microbiology, 23 edicin. The McGraw-Hill Companies. USA.

DWORKIN M., FALKOW S., ROSENBERG E., SCHLEIFER K. H., STACKEBRANDT E. 2006. The Prokaryotes. A handbook on the biology of bacteria. 3 edicin. Vol.1-6. Springer Science+Business Media,

Inc. New York, USA.

MADIGAN, M.T., MARTINKO, J.M. 2006. Brock Biology of Microorganisms. 11 edicin. Pearson Education, Inc. USA. 992pp.

MAC FADDIN, J. 2003. Pruebas bioqumicas para la identificacin de bacterias de importancia clnica. 3 Edicin, Editorial Mdica Panamericana, S.A. Madrid, Espaa, 850pp.

NESTER, E., ANDERSON, E., ROBERTS, C., PEARSALL, N., NESTER, M., HURLEY, D. 2004. Microbiology. A Human Perspective. 4 edicin. McGraw-Hill, New York. 890pp.

OGUNSEITAN O. A. 2005. Microbial Diversity: Form and Function in Prokaryotes. Blackwell Publishing. USA. 300pp.

WIN W.C., ALLEN S.D., JANDA W.M., KONEMAN E.W., PROCOP G.W., SCHRECKENBERGER P.C., WOODS G.L. 2008. Koneman Diagnstico Microbiolgico: Texto y atlas en color. 6 edicin. Editorial

Mdica Panamericana. Buenos Aires, Argentina. 1475pp.

ALGUNOS SITIOS WEB DE INTERS

www.biomedcentral.com

www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/

www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/ www.cdc.gov/

www.nih.gov/ www.who.int/

www.microbelibrary.org

www.asm.org/