estudio del metagenoma de un consorcio degradador de hidrocarburos

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Facultad de ingeniería Química Ingeniería en Biotecnología Bioinformática Dr. Rafael Rojas Herrera Dr. Michel Canul Chan Proyecto final Presentado por: Carlos Cauich Córdova Thomas Ramos Sosa Diciembre de 2014

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Estudio metagenomico de un consorcio degradador de hidrocarburos desde los puntos de vista metabolicos

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Facultad de ingeniera QumicaIngeniera en BiotecnologaBioinformticaDr. Rafael Rojas HerreraDr. Michel Canul Chan

Proyecto finalPresentado por:Carlos Cauich CrdovaThomas Ramos Sosa

Diciembre de 2014

ContenidoMetagenoma 12Distribucin de las 10 familias ms abundantes2Distribucin de los 10 gneros ms abundantes3Distribucin de las 10 clases ms abundantes3Metagenoma 23Distribucin de las 10 familias ms abundantes4Distribucin de los 10 gneros ms abundantes4Distribucin de las 10 clases ms abundantes5Metagenoma 36Distribucin de las 10 familias ms abundantes6Distribucin de los 10 gneros ms abundantes6Distribucin de las 10 clases ms abundantes7

Reporte de los metagenomasPara cada uno de los 3 metagenomas en el MG-RAST se obtuvo lo siguienteMetagenoma 1Distribucin de las 10 familias ms abundantes

Distribucin de los 10 gneros ms abundantes

Distribucin de las 10 clases ms abundantes

Metagenoma 2

Distribucin de las 10 familias ms abundantes

Distribucin de los 10 gneros ms abundantes

Distribucin de las 10 clases ms abundantes

Metagenoma 3Distribucin de las 10 familias ms abundantes

Distribucin de los 10 gneros ms abundantes

Distribucin de las 10 clases ms abundantes

Curva de rarefaccin de los 3 metagenomas

Figura 1. Curva de rarefaccin de los 3 consorcios, la lnea azul representa el tercer consorcio, la lnea roja representa al segundo consorcio, la lnea naranja representa al primer consorcio

ndice de diversidad para cada consorcio

Figura 2. ndice de diversidad para el primer consorcio

Figura 3. ndice de diversidad para el segundo consorcio

Figura 4. ndice de diversidad para el tercer consorcio.Se realiz una comparacin de igual manera de los 3 metagenomas, para este caso se hizo con el metabolismo de los aminocidos, ya que en los 3 se encuentra un alto porcentaje, en comparacin con los otros metabolismos.

Figura 5. Metagenoma 1, mostrado en Krona View

Figura 6. Metagenoma 2, mostrado en Krona View

Figura 7. Metagenoma 3, mostrado en Krona ViewLos 3 presentaron un alto valor en el metabolismo de la serina, treonina y glicina, ms altos que en los otros que se presentaron por lo cual se eligi este como subsistema de inters.De la cual el dihydrolipoamide dehydrogenase, presenta la mayor abundancia para los 3 metagenomas y por ende el mayor porcentaje en los mismos.9