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El citoesqueleto es un sistema subcelular formado por filamentos y proteínas accesorias

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El citoesqueleto es un sistema subcelular formado

por filamentos y proteínas accesorias

Materila de Estudio

Libros

Alberts, Molecular Biology of the Cell

Lodish, Molecular Cell Biology

Artículos

Thomas D. Pollard, et al. Actin, a Central Player in Cell Shape and Movement. Science 326, 1208

(2009)

Thomas D. Pollard, et al. Cellular Motility Driven by Assembly and Disassembly of Actin Filaments.

Cell 112, 453–465 (2003)

Ronald D. Vale, et al. The Way Things Move: Looking Under the Hood of Molecular Motor Proteins.

Science 288, 88 (2000)

Andre P. Carter. Crystal clear insights into how the dynein motor moves. Journal of Cell Science 126,

705–713 (2013)

Hancock. Bidirectional cargo transport: moving beyond tug of war Bidirectional cargo transport: moving

beyond tug of war. Nature Reviews Molecular Cell Biology (2014)

iBioseminars

JULIE THERIOT: CELL MOTILITY AND THE CYTOSKELETON

Protein Polymers, Crawling Cells and Comet Tails: http://www.ibiology.org/ibioseminars/cell-biology/julie-

theriot-part-1.html

THOMAS POLLARD: CELL MOTILITY AND CYTOKINESIS

I. Mechanism of cell motility 1: http://www.ibiology.org/ibioseminars/thomas-pollard-part-1.html

II. Mechanism of cell motility 2: http://www.ibiology.org/ibioseminars/thomas-pollard-part-2.html

RON VALE: MOLECULAR MOTOR PROTEINS

Molecular Motor Proteins: http://www.ibiology.org/ibioseminars/cell-biology/ron-vale-part-1.html

Propiedades generales del citoesqueleto

Cumple una función

estructural en las células

Es esencial para el tráfico

intracelular y la motilidad

celular

Compuesto por filamentos

poliméricos proteicos

Los polímeros son de

naturaleza dinámica

Los polímeros ensamblan

estructuras de mayor orden y

complejidad

Es capaz de generar trabajo

mecánico

Diferentes estructuras formadas por el citoesqueleto. Microfilamentos

Alberts et al., MBC2002

microvellosidades

fibras de estrés

sarcómeros

Microfilamentos:• polímeros de actina de doble cadena• estructuras flexibles organizadas en arreglos lineales, redes bidimensionales y geles 3D• estructuras dinámicas (filopodios y lamelipodios) vs. estables (estereocilios)• estructuras transientes (anillo contráctil)

Diferentes estructuras formadas por el citoesqueleto. Microtúbulos

Hirokawa´s lab

vesícula

Moléculas Motoras convierten la

energía de la hidrólisis de ATP en

fuerza mecánica que puede

mover organelas a lo largo de los

filamenteos

Alberts et al., MBC2002MTs de interfase MTs del huso

axonemas

huso mitótico

célula en interfase

Microtúbulos:

• cilindros huecos formados por

tubulina

• rígidos y largos

• MTOC

Diferentes estructuras formadas por el citoesqueleto. Filamentos intermedios

Alberts et al., MBC2002

IFs de procesos gliales

IFs de células epiteliales

malla de laminas

Filamentos intermedios:

• fibras formadas por proteínas de filamentos intermedios

• resistencia mecánica

• pueden mantener juntas a las células epiteliales, ayudan en la extensión de axones

neuronales, o permiten formar uñas o pelo

Células motiles o migratorias requieren un citoesqueleto dinámico

VIDEO 10

La fagocitosis de bacterias depende del rearreglo del citoesqueleto de las células

fagocíticas especializadas (macrófagos y neutrófilos)

Los procesos de motilidad celular están conservados a través de protozoarios y eucariotas

Acanthamoeba y macrófagos capturan microorganismos mediante un proceso de

fagocitosis dependiente de la polimerización de actina que involucra la formación

de seudópodos y la motilidad celular

https://www.youtube.com/watch?v=qBIdfJEJMK0

Los filamentos del citoesqueleto son polímeros dinámicos

Alberts et al., MBC2002

El ensamblado repetitivo de subunidades

pequeñas resulta en la formación de

polímeros:

• actina microfilamentos

• tubulina microtúbulos

• varias subunidades filamentos

intermedios

Las subunidades se meantienen unidas

en el polímero mediante interacciones no

covalentes débiles

Proteínas accesorias asociadas al

citoesqueleto regulan la distribución

espacial y el comportamiento dinámico de

los filamentos

La polimerización/depolimerización de los

filamentos permite rápidos ajustes de la

estructura del citoesqueleto y de la forma

celular

La actina es una proteína globular de 375 aminoácidos (43 kDa). Sitios de unión en los

monómeros de actina (G-actina) median la interacción cabeza-cola con otros dos monómeros

para polimerizar filamentos de actina (F-actina). Los filamentos están formados por dos

protofilamentos que se mantienen unidos a travás de contactos laterales. La orientación

constante de los monómeros en los polímeros determina su polaridad estructural [extremos

(+) y (-)].

Estructura cristalina del

monómero de actina

(difracción de rayos X)

Filamento de actina

(microscopía electrónica)

Estructura de la actina globular y filamentosa

Estudios in vitro revelan las propiedades dinámicas de los polímeros

Preparaciones de actina soluble purificadas de

músculo esquelético polimerizan espontáneamente

a concentraciones fisiológicas de iones.

La cinética de polimerización de actina puede ser

monitoreada in vitro por viscosimetría,

sedimentación, espectroscopía de fluorescencia o

microscopía.

vis

cosid

ad

tiempo

sin Mg2+

sin Ca2+

La fluorescencia del polímero de actina

marcada con pireno es 7-10 veces más

grande que la del monómero y la señal es

proporcional a la concentración en masa del

polímero.

tiempo

fluore

scencia

Espectroscopía de fluorescencia

Viscosimetría

Cinética de polimerización de actina

Durante una fase inicial se forman pequeños núcleos (fase de nucleación) y luego la polimerización

incrementa linealmente en función del tiempo (fase de elongación) hasta alcanzar un estado estacionario

donde la masa del polímero permanece constante. La concentración de monómeros en el estado estacionario

es la concentración crítica o Cc; concentraciones mayores o menores a la Cc inducen el aumento o

disminución de la masa del polímero, respectivamente.

VIDEO 1

Lodish et al MCB2004

nucleación elongación estado estacionario

La tasa de adición de monómeros está dada

por la constante de velocidad kon (M-1 sec-1) y la

tasa de pérdida por koff (sec-1). El número de

monómeros que se adicionan al polímero por

segundo es proporcional a la concentración de

subunidades libres (konC), pero las

subunidades dejan el extremo del polímero a

una velocidad constante (koff) que no depende

de la concentración.

Concentración crítica

A medida que el polímero crece, C cae

hasta alcanzar un valor constante,

concentración crítica (Cc). En este

equilibrio,

konC = koff

por lo tanto

En un extremo del polímero, a la Cc la

velocidad de adición es igual a la

velocidad de depolimerización y no hay

elongación neta.

Cc =koff

kon

=1

K

+

polímero (con n subunidades) subunidad polímero (con n + 1 subunidades)

kon

koff

Constantes de velocidad de adición y pérdida de monómeros

La reacción acrosomal del esperma de cangrejo extiende fascícuos de actina que sirven de núcleos para la reacción de polimerización in vitro

pro

ce

so

acro

so

mal

(fascíc

ulo

sd

e F

-actin

a)

Microscopía de campo claro de

esperma del cangrejo Limulus no

reactivo (1a) y luego de la

reacción acrosomal (1b)

Los filamentos de actina son polímeros polares

La polaridad de los microfilamentos de actina puede determinarse mediante

microscopía electrónica después de incubar los polímeros con fragmentos S1 de

miosina.

(+)(-)

Microscopía electrónica de la polimerización

de filamentos de actina en los extremos (+) y

(-) de un proceso acrosomal de Limulus. Las

constantes de velocidad se calculan a partir

de la medida de la longitud de los fascículos

de filamentos de actina.lo

ngitud

(μm

)

tiempo

(+)

(-)

Las constantes de velocidad de adición y pérdida de monómerosson diferentes en los extemos (+) y (-) del polímero

Pollard (1986) JCB 103: 2747-2754

La tasa de adición (kon) de subunidades en forma T es mucho más ràpida en el extremo (+) (12

M-1 s-1) que en el extremo (-) (1.3 M-1 s-1), mientras que la tasa de disociación es similar en los

dos extremos. Luego de la adición de subunidades ocurre la hidrólisis rápida del nucleótido

trifosfato y la disociación lenta de Pi. El cambio conformacional asociado a la hidrólisis es

responsable de la diferencia en las tasas de asociación y disociación de los dos extremos.

Las constantes de velocidad de adición y pérdida de monómerosson diferentes en los extemos (+) y (-) del polímero

Pollard (2009) Science

La actina es una enzima con actividad ATPasa

Cuando el filamento crece, en el extremo (+) la elongación es más rápida que la hidrólisis. Las

subunidades del extremo (+) se encuentran en forma T. La hidrólisis es más rápida que la

elongación en el extremo (-) y las subunidades terminales están en forma D.

Si se considera uno solo de los extemos, el balance entre la tasa de adición y disociación se

alcanza a la Cc=koff /kon. Cc+ es menor que Cc

-. En el estado estacionario la concentración de

subunidades libres será intermedia entre Cc+ y Cc

-.

Cc(T) es menor que Cc(D)Para C > Cc(T) pero < Cc(D)

se observa treadmilling

Alberts et al., MBC2002

En el estado de treadmilling hay movimiento hacia el extremo (+) debido al flujo de subunidades a través del polímero

El treadmilling es un estado estacionario de los polímeros con adición neta de

subunidades en la forma T en el extremo (+) y pérdida neta de subunidades en la

forma D en el extremo (-). La longitud del polímero permanece invariable.

Lodish et al MCB2004

La polimerización de actina es capaz de generar fuerza mecánica

tiempo

dis

tancia

fuerz

a

La fuerza que genera la elongación de un fascículo de

filamentos de actina puede medirse directamente usando

una trampa óptica. La trampa óptica sostiene una

microesfera donde se encuentran inmobilizados acrosomas

de Limulus próxima a una barrera rígida. Cuando ocurre la

elongación de los filamentos de actina, la distancia que se

desplaza la microesfera es proporcinal a la fuerza. La

elongación puede impedirse cuando se aplica una furza del

orden del pN.

Trampas ópticas

Footer (2007) PNAS

Los objetos dieléctricos son atraídos al centro

del rayo. La fuerza aplicada sobre el objeto es

directamente proporcional a su desplazamiento

desde el centro de la trampa

Proteínas accesorias de unión a actina

La nucleación espontánea de filamentos es desfavorable debido a la inestabilidad de los

oligómeros de actina. La elongación de filamentos es favorable, especialmente en el extremo

(+). La célula emplea proteínas accesorias para (i) mantener un pool de actina no polimerizada

mediante proteínas de unión a los monómeros de actina, (ii) promover la nucleación (forminas

y Arp2/3), (iii) restringir el largo de los filamentos, (iv) regular el ensamblado y el recilado de los

filamentos, y (v) entrecruzar filamentos en fascículos o redes.

Pollard (2009) Science

El complejo Arp2/3 comprende siete subunidades de Actin RelatedProteins (ARPs)

Arp2/3 se aisló de la ameba Acanthamoeba castellanii como un ligando de profilina, una

proteína de unión a actina. Luego se identificó asociado a estructuras ricas en actina de

levaduras. Arp2/3 purifica como un complejo de siete polipéptidos en proporciones

estequiométricas en una columna de cromatografía de afinidad. Las subunidades de mayor

peso molecular son actin related proteins.

La estructura cristalina de Arp2 y Arp3 revela que la cara superior de ambas es muy similar el extremo (+)

de la molécula de actina. Sin embargo las diferencias en los lados y en la cara opuesta impiden que

estas proteínas formen filamentos por sí mismas o se ensamblen en filamentos junto con actina.

SD

S-P

AG

E

Arp3

Arp2

Machesky (1994) JCB

Actin Related Proteins (ARPs) se comportan como agentes nucleantes de la polimerización de filamentos de actina

ARP2/3 nuclea el crecimiento de los filamentos de actina a partir del extremo menos,

permitiendo la elongación rápida de los filamentos por el extremo más.

Reconstrucción 3D de imágenes de

microscopía electrónica de la ramificación de

filamentos de actina mediada por el complejo

Arp2/3 de Acanthamoeba. Las reconstrucción

de las ramificaciones de preparaciones de

bovino (F) y levadura (G) son muy similares y

presentan densidades electrónicas conectando

los dos filamentos.

Alberts et al., MCB2002

Rouiller (2008) JCB 180(5):887-895

Rouiller (2008) JCB 180(5):887-895

Arp2 y Arp3 son las primeras dos subunidades en el nuevo filamento

La reconstrucción de la ramificación muestra que el complejo Arp2/3

interacciona con el filamento madre. La formación de la ramificación resulta en

cambios conformacionales en el filamento madre y en el complejo Arp2/3. Arp2

(rojo) y Arp3 (naranja) se reorganizan como un dímero que sirve de molde

para la elongación de un nuevo filamento.

(-)

(+)

vista en estéreo

La unión de un factor activador al

complejo ARP provoca un cambio

conformacional de Arp2 y Arp3. El

complejo ARP activado se asemeja al

extremo (+) de un filamento de actina

y las subunidades se ensamblan en

esta estrucutra.

Factores promotores de la nucleación de la familia WASp de proteínas activan al complejo ARP2/3

tiempo

fluore

scencia

actina

actina + Wasp

actina

Arp2/3

Wasp

actina + Arp2/3

La combinación de Wasp y el complejo

Arp2/3 promueve la polimerización

espontánea de monómeros de actina

(Machesky, 1999).

Lodish et al MCB2004

La microscopía de reflexión total

interna de fluorescencia permite

observar la polimerización de actina

marcada con rodamina en tiempo real.

El complejo Arp2/3 activado se une a

un filamento de actina preformado

para nuclear filamentos ramificados a

los lados del filamento madre.

VIDEOS 2 y 3

El complejo Arp2/3 media la formación de filamentos ramificados

Las ramificaciones del

filamento madre que nuclea el

complejo Arp2/3 emanan a un

ángulo de 70º. Sucesivas

rondas de nucleación resultan

en una red ramificada de

filamentos de actina.

Amann (2001) PNAS

Las forminas son factores de nucleación de actina que aceleran la elongación de filamentos de actina in vitro

Las forminas forman un complejo

dimérico que puede nuclear la formación

de un nuevo filamento de actina y quedar

asociado con el extremo más mientras

ocurre la elongación. El dímero se

mantine unido a una de las dos

subunidades de actina expuestas en el

extremo más permitiendo el ensamblado

nuevas subunidades.

Lodish et al MCB2004

VIDEO 4

FH2

FH1

Las forminas posibilitan la elongación de filamentos no ramificados.

actinaprofilina

Higgs (2005) TiBS

Okada (2010) JCB

Las forminas + profilina aumentan

la tasa de elongación en el

extremo (+). Los dominios FH2

forman un dímero que rodean el

extremo (+) de un filamento. Los

dominios FH1 contienen sitios de

unión a profilina. Profilina-actina se

ensambla en el dominio FH1,

luego el monómero de actina se

transfiere al extremo (+)

liberándose de profilina

Microscopía TIRF de la polimerización de

actina en presencia de mDia y profilina.

Organización de la formina mDia

thimosyn profilin

Timosina y profilina se unen a los monómeros de actina libres paracontrolar la elongación de filamentos in vivo

Timosina bloquea todas las reacciones de polimerización (nucleación y elongación de los

extremos (+) y (-)). Profilina inhibe la nucleación y la elongaión del extremo (-), pero no la

elongación del extremo (+).

Proteínas de capping se unen al extemo más de filamentos y bloquean la adición y la pérdida de subunidades en ese extremo

En una reacción de polimerización de actina in vitro, el agregado de proteínas

de capping sólo permite la adición y la pérdida de subunidades por el extremo

menos disminuyendo la velocidad de elongación por encima de la Cc y la

velocidad a la que el filamento se acorta por debajo de la Cc.

La unión de cofilina a los filamentos de actina provoca

una alteración en el giro normal del filamento, los

contactos entre subunidades de actina se debilitan y

en algunos casos se rompen.

ADF (actin depolymerizing factor)/cofilina induce la fragmentación de filamentos de actina

microscopía electrónica

+ c

ofilin

a

Andrianantoandro (2006) Mol Cell

McGough (1997) JCB

VIDEO mmc3

mic

roscopía

TIR

F

Cofilina aumenta la tasa de elongación en el

extremo (+), no en el extremo (-) de los

filamentos de actina. Cofilina aumenta la tasa

de depolimerización desde el extremo (-), no

desde el extremo (+). El resultado neto es un

aumento en la tasa de treadmilling.

Cofilina promueve el reciclado de monómeros de actina

tiempo

Abs 3

10nm

Polimerización in vitro

Turbidimetría

actina

actina

+ cofilina

El agregado de cofilina

aumenta la Ccrit

Ccrit

Carlier (1997) JCB

Cofilina se une a la forma D de actina en los filamentos

La afinidad de cofilina por la forma

D es dos veces más grande que

por la forma T de actina en los

filamentos. Como la tasa de

elongación en el extremo (+) es

más grande que la tasa de

hidrólisis de ATP, cofilina induce la

fragmentación de filamentos a a

medida que “envejecen”. Los

extremos menos que se generan

por acción de cofilina se acortan

rápidamente para promover el

reciclado de monómeros de actina.

Profilina sirve de buffer de los

monómeros de ADP-actina e

intercambia ADP por ATP. Los

monómeros de ATP-actina unidos

a profilina se adicionan al extremo

más o son secuestrados por

timosinaLodish et al MCB2004

Modelo de nucleación dendrítica en el frente de avance de células migratorias

Factores promotores de la

nucleación asocian al

complejo Arp2/3 con un

monómero de actina en el

lado de un filamento para

nuclear un filamento

ramificado. El extremo (+)

del filamento crece hasta la

asociación de una proteína

de cap que termina la

elongación. La hidrólisis del

nucleótido unido a las

subunidades provoca el

envejecimiento del

filamento. Cofilina fragmenta

los filamentos promoviendo

la disociación de la forma D

de actina desde el extremo

(-). Profilina recicla las

subunidades de actina a la

forma T que quedan

disponibles para elongar

extremos (+).

Pollard (2009) Science

Las proteínas involucradas en la migración celular son las mismasque las involucradas en la endocitosis en levaduras

La endocitosis en levaduras constituye un

sistema que permite estudiar con

resolución espacial y temporal la hipótesis

de nucleación dendrítica de actina. Los

parches de actina son muy pequeños

comparados con el frente de avance de

una célula migratoria. En estos parches de

actina los filamentos se ensamblan de

novo, proveen la fuerza para formar e

internalizar una vesícula endocítica desde

la membrnana plasmática y se

desensamblan en un proceso autolimitado.

Wsp1 ARPC5

Sirotkin (2005) JCB

VIDEO V2

Pollard (2009) Science

En las imágenes de

microscopía de fluorescencia,

la intensidad es directamente

proporcional al número de

moléculas en un área definida,

lo que permite seguir la

acumulación y desaparición de

proteínas en los sitios de

endocitosis (“parches de

actina”). La primer proteína que

se detecta es clatrina, luego

aparecen las proteínas

adaptadoras para asociarse

1:1 con clatrina. El factor

promotor de la nucleación

Wsp1 (~200) precede a al

complejo ARP2/3 (~300) justo

antes del ensamblado de

actina en una red de filamentos

entecruzados (~7000 actinas,

~200 proteínas de capping, y

900 proteínas de

entrecruzamiento).

Sirotkin (2010) MBoC

El modelo de nucleación dendrítica explica el ensamblado de redesdendríticas en los sitios de endocitosis

El estado de polimerización puede afectarse con drogasque unen monómeros y filamentos de actina

Algunas drogas se unen y secuestran a los monómeros no ensamblados,

provocando la depolimerización de los filamentos. Otras drogas se unen a los

filamentos y los estabilizan. El efecto de las drogas revela el rápido y continuo

intercambio de subunidades en los polímeros.

La faloidina es una toxina del

hongo Amanita phalloides.

Debido a su unión selectiva a

microfilamentos, derivados de

faloidina conjugados a

fluoróforos se usan en

microscopía para visualizar F-

actina en células fijadas.

ACTIN-SPECIFIC DRUGS

Phalloidin binds and stabilizes filaments

Cytochalasin caps filament plus ends

Swinholide severs filaments

Latrunculin binds subunits and prevents their polymerization

fibroblasto

DAPI

faloidina

La citocalasina D se une a los extemos más de los filamentos de actina impidiendo la polimerización

-90 0 60

citocalasina D lavado

recuperación

tiempo (min)

Schulze 2014 JCS

Baum 2014 Nature Commun