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Page 1: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

Abrimos la matriz en formato TNT

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Si el archivo se encuentra en el formato correcto, nos dará un mensaje como este.

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Podemos ver la matriz con este comando

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También podemos usar el Block de notas o Notepad.

Aquí se notan los comandos para ver los nombres de caracteres y sus estados.

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Ahora vamos a realizar una búsqueda para < 15 taxa (Enumeración implícita). En este caso se evalúan TODOS los posibles arboles dicotómicos.

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Una vez realizada la búsqueda, se aprecia la longitud y número de árboles más parsimoniosos.

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Ahora podemos ver el o los árboles más parsimoniosos.

Y podemos apreciar los caracteres sobre el mapa y las reconstrucciones de cada estado:

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Este comando nos muestra las sinapomorfías en el árbol.

Recuerden que los caracteres se cuentan a partir de el 0 (y no 1).

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S y na p o mo r p h i e s f o r t r e e 0

Al l i g a t o r

T u r t l e

S n a k e

L i z a r d

B i r d

Ma mma l

Amp h i b i a n

7 , 8

0 , 4

9

1 , 2 , 3

1

5

5 , 9

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Este comando nos muestra las reconstrucciones de cada estado por carácter.

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T r e e 0 , c h a r . 0 ( 1 s t e p s ) - S k u l l _ j o i n t

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nT woO neAmb i g u o u s

Page 12: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 1 ( 2 s t e p s ) - Hi n d _ d i g i t s

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a n> = _ 4< = _ 4Au s e n tAmb i g u o u s

Page 13: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 2 ( 1 s t e p s ) - Gi z z a r d

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nAu s e n tP r e s e n tAmb i g u o u s

Page 14: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 3 ( 1 s t e p s ) - B l a d d e r

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nP r e s e n tAu s e n tAmb i g u o u s

Page 15: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 4 ( 1 s t e p s ) - Wa s t e _ t y p e

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nUr e aUr i cAmb i g u o u s

Page 16: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 5 ( 2 s t e p s ) - Me t a b o l i s m

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nEc t oEnd oAmb i g u o u s

Page 17: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 6 ( 1 s t e p s ) - Eg g

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nAu s e n tP r e s e n tAmb i g u o u s

Page 18: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 7 ( 1 s t e p s ) - He mi p e n i s

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nAu s e n tP r e s e n tAmb i g u o u s

Page 19: Tutorial para correr matriz de Brooks etal1994 en TnT

T r e e 0 , c h a r . 8 ( 1 s t e p s ) - Q u a d r a t e _ f u s i o n

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a nP r e s e n tAu s e n tAmb i g u o u s

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T r e e 0 , c h a r . 9 ( 2 s t e p s ) - T e mp o r a l _ h o l e s

Al l i g a t o r

T u r t l e

S na k e

L i z a r d

Bi r d

Ma mma l

Amp h i b i a n012Amb i g u o u s


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