RESUMEN EJECUTIVO
M e m o r i a A n u a l
© CRG 2018
RealizaDO pOR: Departamento de Comunicación y Relaciones públicas
Centro de Regulación Genómica (CRG)
Dr. aiguader, 88
08003 Barcelona, españa
www.crg.eu
TexTO Y GRÁfiCOs: CientíficosdelCRG,MiembrosdelequipodeAdministracióndelCRG,
Kat arney, Departamento de Comunicación y Relaciones públicas
DiseÑO GRÁfiCO: Ondeuev Comunicació s.l.
fOTOGRafÍa: IvanMarti,científicosdelCRG
vÍDeO: adrià sunyol
DepÓsiTO leGal: B 17125-2018
pRÓlOGO 4
DesTaCaDOs iNsTiTUCiONales 6
DesTaCaDOs CieNTÍfiCOs 16
Hogar dulce hogar 17
Nadar en un mar de virus 19
Ultracongelación 21
pásalo 23
Clasificar 25
De acuerdo, ordenador 27
Desempaquetandoelgenoma 29
InvestigaciónyServiciosCientíficos 32
investigadores eRC en el CRG 37
DaTOs Y CifRas 38
InfoRMefInAnCIeRo 44
AGRADeCIMIentoS 46
Contenidos
4 - Resumen ejecutivo 2017
prólogo
e steaño,el10deabril,tuvolugarfinalmentelafirmaoficialdelacuerdoparaelestablecimiento
deunanuevasubsededeleMBLenBarcelona.Despuésdemásde20años,eleMBLhaabierto
una nueva subsede en el pRBB en Barcelona, adyacente al CRG. esto mejorará la visibilidad
internacionaldelPRBBycreará, juntoconlaUnidaddeMicroscopiaÓpticaAvanzadadelCRG,una
instalación líder en imagen en europa.
Unodeloshechosmásimportantesquesucedieronen2017fuelacreacióndeunaredentretodos
los institutos y unidades universitarias españolas distinguidas con los premios de excelencia severo
ochoayMaríadeMaeztu.estaalianza(SoMMa,http://somma.es/)sehacreadoconelfindepromo-
ver la excelencia española en investigación y para mejorar su impacto a escala nacional e internacio-
nal.Dehecho,elCRGeselórganoquepresidedichaalianza.
Porloquerespectaalaciencia,duranteelañosellevóacabolaevaluacióndelprogramadeBioinfor-
máticayGenómica.Lavaloraciónfueexcelenteypropiciólacontinuidadyelrefuerzodelabioinfor-
mática en el CRG.
en 2017, tres de nuestros jóvenes investigadores principales pasaron a ocupar cargos en senior otros
institutos.MatthieuLouisestáahoraenelDepartamentodeBiologíaMolecular,CelularydelDesarro-
llodelaUniversidaddeCalifornia,enSantaBárbara,enestadosUnidos;fyodorKondrashovestáen
el Departamento de Genómica evolutiva del instituto de Ciencia y Tecnología (isT austria), en Klos-
terneuburg,Austria,yManuelMendozaesjefedegrupodelInstitutodeGenética,BiologíaMolecular
yCelular(IGBMC)enestrasburgo,francia.finalmente,JamesSharpesetrasladódelCRGparacon-
vertirseeneldirectordelanuevasededeleMBLenBarcelona.estamosenormementesatisfechosde
quetodosocupencargosexcelentes,unhechoquedemuestraeléxitodelCRGenlaformaciónyla
promocióndejóvenescientíficos.Aprincipiosde2017,elvanBokeynicholasStroustrup,queante-
riormentetrabajabanenlaHarvardMedicalSchooldeestadosUnidos,seunieronalCRG.
tambiénalolargodeeseaño,ydeacuerdoconnuestroplanestratégico,hicimoscambiosenlaforma
decontratarnuevosinvestigadoresprincipales.Porprimeravez,anunciamosplazasnoadscritasa
ninguno de los programas relativos a los principales temas de investigación de nuestro plan. Tuvimos
más de 150 solicitudes y, tras la selección y las entrevistas, contratamos a dos nuevos investigadores
Resumen ejecutivo 2017 - 5
principales:evanovoa,del InstitutoGarvandeInvestigaciónMédicadeAustralia,yArnauSebe-Pe-
dros,delWeizmannInstituteenIsrael,quellegaríanalCRGen2018y2019,respectivamente.
encuantoalafinanciación,elCRGsigueatrayendofondoscompetitivos.Cabemencionarquefuimos
galardonadosporsegundavezcomoCentrodeexcelenciaSeveroochoa,distinciónconunavalidez
decuatroañosqueotorgaelMinisteriodeeconomía,IndustriayCompetitividad.Asimismo,cuatro
gruposentraronaformarpartededosplataformastecnológicasnacionalesclavedebioinformática
(Guigó, Gabaldón, Gut) y proteómica (sabidó), con el apoyo del instituto de salud Carlos iii (isCiii). a
escala europea, además de numerosos proyectos colaborativos, es importante destacar dos ayudas:
unaStartingGrantdeleRC(Boke)yunapruebadeconceptodeleRC(Valcárcel),estaúltimaorienta-
daaprobarelpotencialterapéuticodenuevosreactivosparalaterapiadelcáncerdepulmón.enel
ámbito internacional, Roderic Guigó obtuvo dos nuevas ayudas a la investigación, procedentes de los
institutos Nacionales de salud (NiH) de eeUU.
el CRG apoya a la ciencia abierta y, en este sentido, es importante mencionar el proyecto de la Ue
liderado por el CRG: ORiON. se trata de una nueva iniciativa para promover cambios institucionales en
lafinanciacióndelainvestigaciónyenlasorganizacionesparahacerlasmásreceptivasalasnecesi-
dadesdelasociedadyabrazarlosprincipiosdelacienciaabierta.
CabesubrayarqueelCRGnoseríaunlugartanatractivosinelapoyoprofesionalyexcelentedesus
diferentesdepartamentosdeadministraciónque,apesardelaenormecarga,hanconseguidocrear
unfantásticoambienteparatrabajar.Másenconcreto,unadelasrecomendacionesclavedelgrupode
expertos externo en 2016, el proyecto de “gestión de procesos empresariales”, se implementó durante
elañopasadoconelobjetivodeevaluarymejorarelrendimientoylaeficaciadelaadministracióny,
por lo tanto, permitir la mejora continua de los departamentos.
enunañollenoderetos,porprimeravezhemoshechofrentealasalidademuchosgruposalmismo
tiempo, hemos tratado con una crisis política a escala nacional y autonómica y la condición de dedu-
cibilidaddenuestroIVAhaentradoencontroversia,conunimportanteimpactofinancieroyunagran
incertidumbre.Graciasalapoyode todonuestropersonal,hemosminimizadoel impactodeestos
retosyhemosaseguradoelapoyoyel éxitode todosnuestros investigadoresprincipales.elCRG
sigue siendo un lugar ideal para hacer ciencia y tenemos antes nosotros oportunidades y proyectos
emocionantes con vistas al año 2018.
Luis Serrano Director
6 - Resumen ejecutivo 2017
Destacados institucionales
Resumen ejecutivo 2017 - 7
administraciónelequipoadministrativo(incluyendoelCnAG-CRG)incluyemiembrosde10paísesdiferentesy,en2017,
haprestadoapoyoesencialyespecíficoalacomunidaddelCRGdeacuerdoconlasprioridadesdefini-
dasenelplanestratégico2017-2021yelplandeacciónanualdelinstituto.
Una de las recomendaciones clave del panel externo, el proyecto de “gestión de procesos de negocio”, se
implementóduranteelañopasadoconelobjetivodeevaluarymejorarelrendimientoylaefectividadde
la administración y, por lo tanto, permitir una mejora continua entre los departamentos. Continuaron o se
iniciaronalgunasactividadesparafomentarelespírituyeldesarrollodelequipo,einiciativasdeconciliación
entre la vida laboral y personal del grupo, incluyendo la jornada de administración con trabajo de grupo
sobre el tema de la innovación (dibujos, presentaciones breves, lluvia de ideas conjunta y actividades cien-
tíficas),elprogramadeteletrabajo,evaluacionesanualesderendimientoyactividadesde“cienciafácil”.
elequipoadministrativocontribuyóaalgunasiniciativasparatodoelCRG:laimplementacióndelplande
accióndeigualdaddegénerodeLIBRA,laexcelenciadeRRHHenproyectosdeinvestigación,laprimerareu-
nión de la junta de antiguos alumnos en Barcelona, la contratación de nuevos investigadores principales (pi)
ylapartidafluidadevariosgruposdeinvestigación.estaúltimacoincidióconunaumentosignificativodePI
júniorsqueabandonabanelinstituto,talcomoestáprevistoenlapolíticaderotacióncientífica.enelcontexto
delestablecimientodelaasociaciónlocalentreelCRGyeleMBLyconelapoyofinancierodelMinisteriode
economía,IndustriayCompetitividadespañol,elequipoadministrativoasesoróyprestóapoyoenlarecien-
tementecreadasededeleMBLdeBarcelonaenasuntosrelativosalastIC,prevenciónderiesgoslaborales,
gestión de instalaciones y compras. entre las nuevas iniciativas de prevención de riesgos laborales llevadas a
caboen2017,seencuentraladigitalizacióndeunregistrocentralizadodebioseguridadparaelusodeagen-
tes biológicos, así como la designación de coordinadores de seguridad en los laboratorios como contactos
localescadaunodeellos,loqueaseguraelusoadecuadodenormasdesaludyseguridadenellaboratorio.
Con el objetivo de actuar más allá del CRG, los miembros de la administración siguen compartiendo pun-
tos de vista y se relacionan con otros institutos nacionales y del extranjero, especialmente con institutos
deeU-LIfe.SecelebraronlocalmentemesasredondasenlasquelosinstitutosCeRCApermitieronel
intercambiodeconocimientosybuenasprácticas.Másconcretamente,lagerentefueponenteinvitada
en dos ocasiones y presentó la evaluación de la administración llevada a cabo en 2016 por un panel de
expertosexternosinternacionales,porloquesirviócomomodeloparaotrosinstitutosnacionales.
8 - Resumen ejecutivo 2017
formaciónAvanzadaLaformaciónavanzadaendiferentesetapasprofesionaleseselnúcleodelasactividadesdelCRG.
Tanto para estudiantes de máster y doctorado como para becarios y grupos de investigación júnior,
elCRGofreceunentornoestimulanteyenriquecedor,unprogramadeformaciónintegralycursos
amedidasobrehabilidadescientíficasytransferibles.
PROgRaMaS aCadéMICOS
el programa internacional de Doctorado del CRG es un emblema del compromiso del CRG con
la formación,ysecaracterizaporunacombinaciónde tutoríay formacióncientíficadedicadaa
apoyarlaindependenciaylacreatividad.Consusmásdediezañosdehistoria,elprogramasigue
siendomuyatractivoycompetitivo;pruebadeesteéxitoesquerecibecadaaño400 solicitudes de
más de 50 países diferentes yqueadmite20-30 estudiantes cada curso.
en el año 2017, el programa internacional de Doctorado siguió atrayendo a jóvenes talentos de
todoelmundofinanciadosporfondoscompetitivosinternosyexternos.Ademásdela convoca-
toria del Doctorado del CRG, junto con el iRB Barcelona, el vHiR y el iDiBaps, llevamos a cabo un
programade formación en investigaciónparamédicosdurante cuatro años, llamadoprograma
PhD4MD.elobjetivodelprogramaa largoplazoesformara lapróximageneracióndemédicos
científicosqueimpulsarálainvestigaciónygeneraráunmayorimpactoenlospacientes.Untotal
de cuatro doctores en medicina se han unido al CRG entre los años 2014 y 2017.
el programa posdoctoral del CRG permite a los jóvenes investigadores trabajar en proyectos muy
colaborativoseinterdisciplinariosendiferentesgruposyunidadesdelCRG.trasconseguirdosron-
dasdefinanciación,unaen2009(INTERPOD) y otra en 2014 (Impulse), el programa de postdocs,
hasidogalardonadoconunaterceraayudadelaCeatravésdeMarieSkłodowska-CurieH2020
COfUND actions para el período 2017-2022 (INTREPiD). el tercer programa COfUND permite co-
laboracionesconotras institucionesacadémicasyde la industria,por loque los investigadores
posdoctoralespuedenestablecerymantenerconexionesqueresultenútilesenlaconstrucciónde
suscarrerasprofesionalesmásalládelCRG.Variosinstitutosdeinvestigación,comoelInstituto
Curie y el instituto de investigación de la vall d’Hebron (vHiR), así como empresas como Novartis
y esteve, se unieron al programa iNTRepiD como socios externos.
el programa INTREPiDincluyeuncurrículumdeformacióndirigidoapotenciarhabilidadesnocien-
tíficasdelosinvestigadores(porejemplo,laéticadelainvestigación,ladivulgaciónyelgéneroen
laciencia)yofreceunapoyoexclusivoparaeldesarrolloprofesional.Laprimeraconvocatoriase
abrió en septiembre de 2017 y se seleccionaron seis nuevos miembros.
por último, la 5ª edición del Programa Internacional de Prácticas de Verano del CRG para estu-
diantesuniversitariossepusoenmarchaenfebrerode2017:seconcedieroncincoprogramasde
prácticas para proporcionar a los estudiantes universitarios la oportunidad de investigar en el CRG
durante el verano (países de origen: Rusia, Dinamarca, Ucrania, italia y la República Checa).
el CRG tiene asimismo varias asociaciones activas con programas de máster para acoger estu-
diantesparaprácticasde investigación:UPf,UB,UPC, facultaddeCienciasde laSaint-Joseph
University(Beirut),MIt(eeUU),etc.esteañohemosaceptadoiniciarunanuevaalianzaconlaUni-
versidad de Richmond (eeUU) para acoger a sus estudiantes universitarios en prácticas intensivas
de investigaciónduranteelveranodelpróximoaño.Seguiremosexplorandootrasalianzaspara
atraer a los mejores investigadores júnior.
elCRG tambiéncontribuyóal desarrollodel nuevoMáster en Investigación Multidisciplinar en
Ciencias Experimentales del BIST, iniciadoenoctubrede2017.fuerondos losestudiantesque
obtuvieronunabecapararealizardichomásterenelCRG.Actualmentetienelugarunanuevaedi-
ción de este máster.
Resumen ejecutivo 2017 - 9
PROgRaMa dE fORMaCIóN
en 2017 se mejoró el Programa de formación avanzada del CRG con varios cursos internacionales
dealtonivelenelmarcodelosCourses@CRG,asícomounaofertamásampliadecursosytalleres
científicosinternos.Comoenañosanteriores,loscursosorganizadosporelCRGestuvieronabier-
tosalascomunidadescientíficaslocaleseinternacionalesyenellosseimpartióformacióndealta
calidadsobrelosúltimosavancescientíficosylastecnologíasmásrecientes.
en2017,laUnidaddeformacióndelCRGorganizóeimpartiósieteCourses@CRG de calidad, un
cursoeMBoyuncursoconjuntoconelfIMM,alosqueasistieron170participantesdeinstitutos
deinvestigaciónde34paísesdiferentes,comoArgentina,Australia,Israel,lasIslasMauricio,Sin-
gapur,SudáfricayestadosUnidos.
- Conformacióncromosómica(f.LeDily)
- Proteómicaavanzada(e.Sabidó)
- Ingenieríadetejidos:Decélulasmadreaorganoides(L.Batlle)
- Modelizacióndecélulascompletas(L.Serrano,M.Lluch)
- nextflow:Genómicain-silicoreproducible(P.Ditommaso,C.notredame)
- C.elegans:CRISPR,RnAiygenética(B.Lehner)
- CRISPR/Cas9:HerramientadeedicióngenéticaCarolis,L.DiCroce)
- eMBo-Proteómicadirigida:Diseñoexperimentalyanálisisdedatos(e.Sabidó)
- epigenéticaen investigaciónclínicay traslacional (L.DiCroceencolaboraciónconelfIMMy
celebradoenHelsinki)
Los Courses@CRG atrajeron el patrocinio/colaboración de Amazon, Bio-Cat, Biogen, IDt, Izasa
Scientific,Leica,nemaMetrix,nikon,SigmaAldrich,Sonidel,StemCelltechnologiesytermofisher.
Unodelospuntosclaveparael2017fueeldesarrollodeunaampliacarteradecursos internos
centrados en habilidades científicas y tecnológicas, así como habilidades transferibles, integri-
dad de la investigación y coachingprofesional.Laformacióninternahaabiertonuevasoportunida-
destantoparalosformadorescomoparalosestudiantes.Lostécnicos,losestudiantesdedocto-
radoylosinvestigadoresposdoctoralesadquirieronexperienciaenlaenseñanzayelintercambio
deconocimientos,asícomoexperienciaconelrestodelacomunidaddelCRG,altiempoquelos
participantessebeneficiabandelamplioabanicodeactividadesdeformaciónqueseofrecieron
durante todoelaño (véasemásadelante).Los23 talleres llegarona todos losnivelesdeprofe-
sionalidadcientíficos,desdelosestudiantesuniversitarioshastalosjefesdegrupo,yasistierona
ellos casi 450 participantes procedentes de todos los programas y ámbitos del CRG y CNaG-CRG.
11tallerescientíficosytécnicos:AlostalleresdeLinux,Clúster,Bioinformática,programaciónen
PythonyR,ysoftwaredelclústerasistieroncasi150participantesdelCRGyCnAG-CRG.
en2017se implementóuna formaciónde libretasde laboratorio electrónicas (eLn)para todos
los estudiantes de doctorado de primer curso del instituto, así como un curso de iniciación sobre
Ciencia abierta e integridad de la investigación.
Desdemayode2017,esobligatorioquetodos losnuevoscientíficosque lleganalCRGrealicen
un curso en línea sobre integridad de la investigación. este curso consta de módulos interactivos,
cuestionarios,vídeosbrevesytutorialessobreéticaeintegridaddelainvestigación.
Casi 300 estudiantes del CRG y CNAG-CRG, posdoctorados, técnicos y jefes de grupo asistieron
a12cursosdefortalecimientodelashabilidadesencomunicacióncientífica,gestión,liderazgoy
emprendimiento.
Aprender haciendo esunainiciativaquepermitealosinvestigadoresdelCRGhacerprácticasen
diferentesdepartamentosdegestióndelCRGparaobtenerexperienciaenlagestióndeproyectos
científicos, lacomunicacióncientíficay laorganizacióndeeventosy formaciónparacientíficos,
profesoresdesecundariaypúblicoengeneral.Seleccionamosadiez investigadorespara lossi-
guientes departamentos: isa, Comunicación y ayudas a la investigación.
10 - Resumen ejecutivo 2017
Comunicación, divulgación y educación científicasla misión de Comunicación del CRG es promover y proteger la reputación de excelencia del CRG. lo con-
seguimos mediante el desarrollo y la implementación de estrategias claras, coherentes e interesantes
diseñadas para potenciar la comprensión pública de nuestra ciencia y nuestro instituto, sus investigado-
resyelvalorquetienenparalasociedad.
la segunda edición del proyecto de ciencia ciudadana “Saca la lengua” comenzóafinalesde2016.este
proyecto, incluido dentro del ámbito de la ciencia abierta, es el primer estudio sobre el microbioma bucal,
que tienecomoobjetivoestudiar lahuellagenéticadediferentescomunidadesmicrobianasyexplorar
una posible relación con las características ambientales o el estilo de vida. financiado principalmente por
lafundaciónBancaria“laCaixa”yelCRG,lasegundaedicióndelproyectoteníatambiéncomoobjetivo
incorporarnuevasvariablescientíficasypuntosfocales,asícomoabordarnuevosretos,llegaranuevos
públicoseinvolucraryrecogermuestrasdediversaspoblacionesypacientesquesufrendiferentesenfer-
medades.estosobjetivossealcanzaronorganizandounanuevarutaporespaña,ofreciendonuevasactivi-
dadesbasadasenformatosinnovadoresyparticipativosquenospermitierancomprometernosconestos
nuevos grupos diana, comunicar nuestra investigación y sus objetivos, y compartir una respuesta sobre el
proyectoconlosciudadanosqueparticipanenélyconelpúblicogeneral.Graciasaestaestrategiamejora-
da, llegamos a 3.700 personas, 34 centros escolares, 13 asociaciones de pacientes y 21 centros culturales.
Durantetodoelaño,elCRGsiguióofreciendoactividadesparticipativasparaelpúblicogeneralyactividades
deeducacióncientífica.encualquiercaso,algunasdelasiniciativasmerecenunamenciónespecial.enel
marcodeunacolaboraciónconlaempresaminiPCRyelproyecto“Sacalalengua”,fuimosinvitadosaparti-
cipar en el Festival de Ciencias de Cambridge deBostonenabril.fueunaexperienciamuyenriquecedoray
exitosa, y nos dio muchos inputspositivos.tambiéniniciamosconéxitounnuevotallerdirigidoalospadres,
titulado “Vuestros hijos pueden convertirse en científicos”,conelobjetivodeofrecerpistasyconsejosa
lospadresconhijosquetienenquedecidircuálserásutrayectoriaprofesional.tambiénparticipamosen
un nuevo proyecto piloto para la educación junto con mSchools, titulado “La complejidad de la vida”,que
consiste en un conjunto de materiales y recursos diseñados para introducir a los estudiantes en el campo de
lascienciasdelavidamediantetecnologíasmóviles.mSchoolsesunprogramamultimediamultifacéticode
meducationdelMobileWorldCapitalBarcelona,encolaboraciónconlaGeneralitatdeCataluña,elAyunta-
mientodeBarcelonaylaGSMA,quepermitealosestudiantesyprofesoresintegrartecnologíasmóvilesenel
aulayofrecenuevasformasdeenseñanzaydeaprendizajequemejorenloslogrosylassalidaslaborales.el
CRGtambiénfueunodelosinstitutosqueacogióaestudiantesdelaBarcelona International Youth Science
Challenge (BIYSC),organizadoporlafundaciónCatalunya-LaPedrera.elBIYSCesunprogramadeexcelen-
ciainternacionaldedossemanasquetieneporobjetivoestimulareltalentocientíficoentrejóvenesdetodoel
mundoymotivarlosparaquesiganconlainvestigacióncientíficayescojanunacarreraenciencias.
encuantoalastareasdeformación,eldepartamentoacogiócincoinvestigadoresenprácticasenel
marco del programa interno de aprendizaje basado en la práctica “Learning by Doing”,quedesarrolló
pequeñosproyectosrelacionadosconelcompromisopúblico, laeducacióncientíficay lasrelaciones
con los medios de comunicación. Durante el año, hemos contribuido asimismo a dos nuevas iniciativas
institucionales importantes: ORION y SOMMa. ORIONesunproyectoH2020coordinadoporelCRGque
seinicióen2017.eltemaprincipaldelproyectoeslacienciaabierta,yexploralasformasenquelasor-
Resumen ejecutivo 2017 - 11
ganizacionesdeinvestigaciónyfinanciacióndelascienciasdelavidaylabiomedicinapuedenfacilitarel
mododefinanciar,organizaryhacerinvestigación.elequipodeComunicacionesyRelacionesPúblicas
contribuye a llevar a cabo varias tareas de ORiON, en particular el diálogo público y los experimentos
científicosconlaciudadanía.enrelaciónconSOMMa,eslaalianzadelosCentrosSeveroochoayMaría
deMaeztuparapromoverlaexcelenciaespañolaeninvestigaciónypotenciarsuimpactosocialenel
ámbitonacionaleinternacional.LaparticipacióndeComunicacionesyRelacionesPúblicasenSoMMa
secentraenlapromoción,lavisibilidadyladivulgacióndeestaalianza.
Durantetodoelaño, loscientíficosdelCRGse involucraronprofundamenteen lasactividadesde los
medios de comunicación, en relación con los nuevos avances publicados en revistas de alto nivel, así
comoenactividadesinstitucionalesydedivulgaciónquepermitieronpublicarnuevosartículosenme-
diosescritosyenlínea,ytambiénparticiparonenprogramasderadioodetelevisión.elvaloreconómico
deestasaparicionesenlosmediosfuedemásde13millonesdeeuros.
2017fueigualmenteunañomuydensoencuantoalaorganizacióndeseminarios,sesionesysimposios
científicosinternacionales,incluidoslossiguientes:Barcelona NGS’17: Structural Variation & Popula-
tion Genomics,coorganizadaporlaInternationalSocietyforComputationalBiology(ISCB);Enhancing
the Usage of Human Genomics data for the benefit of all. Genotype Tissue Expression, GTEx Project
Meeting; Young Scientist Networking 2017,organizadojuntoconeMBoeIndiaBioScience;el“V Core
Management Workshop: Training the Trainers”;el“16th CRG Symposium: Seventh International Wor-
kshop on Genomic Epidemiology”;el“15th RECOMB Comparative Genomics Satellite Workshop” y el
“CRG Annual Proteomics Symposium 2017: Unveiling the complexity of the cell proteome”.
financiación externasegún los resultados del año anterior, los grupos de investigación del instituto consiguieron el nivel ade-
cuadodefinanciaciónnecesariaparareforzarsuposiciónnacionaleinternacional.
Unavezmás,en2017,lafinanciaciónconseguidoanivelnacionalaumentóconsiderablemente(>10millones
deeuros).elMinisteriodeeconomía,IndustriayCompetitividadespañolgalardonóelliderazgocientíficodelins-
tituto con la nueva distinción de cuatro años como Centro de excelencia severo Ochoa. además, cuatro grupos
entraronaformarpartededosplataformastecnológicasnacionalesmuyimportantesrelacionadasconlabioin-
formática(Guigó,Gabaldón,Gut)ylaproteómica(Sabidó),apoyadasporelInstitutodeSaludCarlosIII-ISCIII.
enelmarcodelnuevoPlanregionalestratégicodeinvestigacióneinnovaciónensalud(PeRIS2016a
2020),seiniciarondosproyectosdecolaboraciónqueinvolucrabanalosgruposdelCnAG-CRGsobre
lamedicinapersonalizada,basadosenelanálisisgenómicoparalatomadedecisionesclínicasenel
ámbitodelaoncología(Gut)ydelasenfermedadesneurológicasrarasnodiagnosticadas(Beltrán).
Lamedicinapersonalizadaes tambiénelobjetivode lasnuevasayudasdecolaboraciónconcedidas
porelH2020,centradasenlaintegracióndedatosmasivosheterogéneos(IASIS/tartaglia,eGA)yen
enfermedadesraras(SoLVe-RD/Beltrán),asícomoenunprogramapilotosobrelamejoradelareprodu-
cibilidad,lareutilizaciónylainteroperatividaddedatos(nubeeuropeadelaCienciaAbierta-eoSCpara
el proyecto piloto sobre investigación).
Aescalaeuropea,entrelosmásdestacadoscabeincluirunaayudaStartingGrantdeleRC(Boke)yuna
ProofofConcepttambiéndeleRC(Valcárcel);elobjetivodeestaúltimaconsisteenprobarelpotencial
terapéuticodelosnuevosreactivosparaeltratamientodelcáncerdepulmón.Además,cincoinvestiga-
doresposdoctoralesobtuvieronunabecaMarieS.Curie(fernández,Audergon,Stik,Rogalska,Schmie-
del),querepresentóuníndicedeéxitodemásdel50%paraelinstituto.
en2017,variosgruposdeinvestigaciónpudieronampliarsusfuentesdeapoyoexternoanivelinterna-
cionalyconsiguieronfinanciaciónprivada.entreotros,contamoscondosnuevasdistincionesenelám-
bitodelainvestigacióndelosInstitutosnacionalesdeSalud-nIH(Guigó)ydelDepartamentodeDefen-
sa-DoD(Serrano/Gill)respectivamente,eneeUU;unaayudaalainvestigaciónconcedidaporfUnDeLA,
dirigidaalaidentificacióndenuevostratamientosparalaesclerosislateralamiotrófica-eLA(DiCroce).
12 - Resumen ejecutivo 2017
InnovaciónytransferenciadetecnologíaLaoficinadetecnologíayDesarrollodenegocio(tBDo)delCRGtienelamisióndepropiciarlaexplo-
tación de la investigación de la institución para el bien público y ayudar al crecimiento económico del
sectordelascienciasdelavidaennuestraregión.nuestroobjetivoesquelosresultadoscientíficos
generadosenelCRGseconviertanennuevosproductosterapéuticos,diagnósticosydeotrotipoque
contribuyan al bienestar de nuestra sociedad.
Independientementedelafasededesarrollo,ytantosillevamosacabocienciabásicacomociencia
aplicadaenelCRG,desdetBDocreemosfirmementequelosproductosyserviciosmásbeneficiosos
sonelresultadodeavancescientíficosrompedores.esperamosqueestosresultadosgenerenunim-
pactomuchomayorennuestrasociedadsirecibenelapoyoadecuadoysecanalizanatravésdela
estrategiaadecuadadecomercialización.
Porlotanto,durante2017,tBDoreforzósuactividadmedianteencuentrosperiódicosconinvestiga-
dores, con más de 450 reuniones, además de asesorar a los innovadores del CRG en el proceso de
transferenciadetecnologíaconvarioscursosdeformación,comola4aediciónde laBio-Business
School o la 2a edición del curso “From Science to Business”,organizadoporelinstitutoBIStencola-
boraciónconeSADeBusinessSchool,yatravésdediferentesmesasredondasyseminariosconla
industria.
Conelcompromisodepromoverelespírituemprendedor,elequipodetBDodioapoyoactivoalgalar-
donado de la 2a edición de la iniciativa S2B Concept Challenge.Comoresultadodeltrabajoenequipo,
MicroomicsSLseconstituyóconéxitoenseptiembrede2017yactualmentedesarrollayproporciona
soluciones de metagenómica de alta calidad en empresas e institutos de investigación.
asimismo, en 2017 TBDO gestionó siete proyectos bajo su programa Commercialization Gap Fund.
Cabedestacarqueenunodeestosproyectos,eldeJordiHernández,investigadorenellaboratoriode
JuanValcárcelyjovenemprendedorqueparticipaenelprogramadelCRGEntrepreneur-in-Residen-
ce,liderasuproyectoinnovadortambiéngraciasalapoyodelprogramaCaixaImpulse.
tambiéncabemencionarlacantidadderegistrosdeinventosrecibidosyevaluados(30),lasnuevas
patentesprioritariaspresentadas(2,queelevana9elnúmerodefamiliasdepatentesactivasdurante
el2017)yelnúmerodeacuerdosnegociadoconéxitoconlasempresas,queaumentaronenun89%
respecto al año anterior. en cuanto al impacto económico del CRG, TBDO negoció y obtuvo unos
279.000euros(un39%másrespectoalañoanterior).
Duranteelaño2017,elequipodetBDoconsolidósucompromisoenvarioseventosnacionalese
internacionalesrelacionadosconlabiotecnologíaylafarmacia,comolaBio International Convention,
Bio Europe, la 2nd Annual Translational Microbiome Conference, etc., y participó en 153 encuentros
con empresas e inversores para debatir sobre la cartera de tecnologías del CRG y las posibles colabo-
racionesfuturas.
Además,PabloCironifueinvitadoaimpartirconferenciasenlaIeSeBusinessSchoolyaparticiparen
diferentesmesasredondasparadebatirsobrelasestrategiasparacomercializarlasinnovacionesen
unafaseinicial.
en general, 2017 ha sido un año muy positivo, y prevemos un espíritu emprendedor positivo en los
próximos años en el CRG.
Resumen ejecutivo 2017 - 13
Dimensión nacional e internacionalESPaña
SOMMa
Lanuevaalianzade loscentrosSeveroochoay lasunidadesMaríadeMaeztu(SoMMa;www.somma.
es)sepresentóoficialmenteenoctubrede2017.SoMMareúne25centrosy16unidadesacreditadoscon
estospremiosalaexcelenciaypretende:incrementarlavisibilidaddelacienciaenespaña;promoverel
intercambiodeconocimientos,tecnologíaybuenasprácticasentresusmiembros,lacomunidadcientífica
internacionalylosprincipalesgruposdeinterés;colaborarconotroscentrosdeinvestigaciónenespaña
parafortalecerelsistemadeI+D+i,ytenervozenlapolíticacientíficaespañolayeuropea.Lainiciativaha
sidolideradaporeldirectordelCRG,queseconvirtióenelprimerpresidentedeSoMMa,ylapusoenmarcha
elequipoISA.Lasactividadesdeiniciodelaalianzacomprendíanelestablecimientodesupropiagobernan-
za,lapresentacióndelsitiowebylaorganizacióndegruposdetrabajoparaalcanzarlosdiversosobjetivos.
EUROPa
Liderando redes de formación y de investigación colaborativa
elCRGlideravariasredesdeformacióneinvestigacióncolaborativafinanciadasporlosprogramasmar-
codelaComisióneuropeagraciasasuexcelenteesfuerzodeinvestigaciónyalapoyoentregadodel
equipodeAsuntosCientíficoseInternacionales.esteliderazgocontinuadoconllevaunaaltavisibilidad,
unasólidareputaciónyunrendimientocientíficoeinnovadordestacable.
LosproyectosfP7/H2020coordinadosiniciadosoenmarchaen2017incluyen:
- MycoSynVac: Coordinado por luis serrano.
- OPATHY:CoordinadoportoniGabaldón.esunareddeformaciónenlaqueparticipan13investigado-
resjóvenesqueseránacogidosen11institucionesde7paíseseuropeos.
- LIBRA: Coordinado por isabelle vernos. es el proyecto clave para implementar acciones de igualdad
degéneroenlosinstitutosdeinvestigacióneU-LIfe.
- MiniCell: Coordinado por luis serrano.
- CellViewer: Coordinado por pia Cosma.
- DivIDE:Coordinadopor IsabelleVernos.Se tratadeotra redde formaciónen laqueparticipan11
investigadoresjóvenesqueseránacogidosen9institucionesde7paíseseuropeos.
- ORION:CoordinadoporMichelaBertero.Setratadeunanuevainiciativaparapromovercambiosen
las institucionesquefinanciany llevanacabo la investigaciónparahacerlasmásreceptivasa las
necesidadessocialesyparaqueadoptenlosprincipiosdelacienciaabierta.
MásinformaciónsobrelosproyectoscolaborativosencabezadosporelCRGenactivoen:
http://www.crg.eu/content/research/projects/ec-coordinated.
Además,elCRGsigueteniendounapresenciaimportanteenvariasredesrelevantesdeinfraestructuras
paneuropeas,comoeLIXIR(comopartedelnúcleoespañoldelainfraestructura),euroBiolmaging(diri-
giendounmódulodetrabajoenlasegundafasepreparatoriaycomomiembrodelconsejointerino)ylos
proyectosCorbel,eXCeLeRAteyMuGH2020.
Integración europea
EU-LIFE, European Life Sciences Institutes for Excellence, es una iniciativa clave presidida por el CRG
para promover la excelencia en la investigación, consolidar la integración entre los institutos europeos de
investigación en ciencias de la vida y desarrollar y compartir buenas prácticas en investigación, gestión
14 - Resumen ejecutivo 2017
delainvestigaciónyformación.VariosmiembrosdelCRGparticipanactivamenteengruposdetrabajo
deeU-LIfe,yestaparticipaciónhadadolossiguientesfrutosrelevantes(entreotros):
• eU-LIfeactivaenlasdosplataformasdegruposdeinterésdelaCequeexisten(eRAyopenScience)
• 3informesdeposicionamientoeU-LIfe:(declaraciónfP9,informesH2020yfP9)
• CampañaeU-LIfeenocasióndel10ºaniversariodeleRC
• Contribución/feedbackpara8informesdelaCe
• 3consultasCe:evaluaciónintermediaH2020;PrevisiónparafP9(porinvitación);fetfLAGSHIP
• oRIon:PresentacióndelproyectodecienciaabiertaH2020
• ImplementacióndelLIBRACareerDevelopmentCompassdeorientaciónprofesionalparaposdocs
(2 talleres)
• ManualytallerdecontrataciónLIBRA,tallerdeconciliaciónlaboral
• Iniciativatedextechtransfer(6charlasaprofesionalesdeVCy4formaciones)
• 3eventosparacrearcapacidadinstitucional(talleresde“formarelformador”parasolicitudesMSCA;
hacervídeosenelámbitointernoparaladivulgacióncientífica;tallerdecomunicacióndecrisis)
• PresentacióndelprogramadevisitaseU-LIfe
• tallercientíficoeU-LIfe“Principiosdelahomeostasis”
• PósterdecursoseU-LIfeyunsimposioeU-LIfe(fIMM+CRG)
• Sitioweb y boletín: herramientasmejoradaspara investigadores (trabajos, financiación, noticias
científicas)
Los Servicios Científico-técnicos sonmiembros de Core facilities excellence Alliance “Core for Li-
fe”(www.coreforlife.eu),queincluyetambiéneleMBL(Heidelberg,Alemania),elVIB(Gent/Leuven,Bélgi-
ca),MPI-CBG(Dresden,Alemania),VBCf(Viena,Austria),yfGCZ(Zurich,Suiza).CoreforLifepretende
compartiryconsolidarprocedimientos,asícomouniresfuerzosenlaformacióndepersonalylavalida-
ción tecnológica, y compartir el acceso a instalaciones entre institutos..
EN TOdO El MUNdO
AtravésdesuequipodeAsuntosCientíficoseInternacionales,elCRGexploranuevasoportunidades
globalesparaatraeralosinvestigadoresconmástalento,establecercolaboracionescientíficasydar
másvisibilidadasubúsqueda.Lasaccionesinternacionalesmásrelevantesllevadasacaboen2017se
detallan a continuación:.
- Coordinación del proyecto de movilidad CRG-Novartis-África: acogimos tres nuevos estudiantes de
SudáfricaparaquedesarrollaransusproyectosenlasinstalacionesylaboratoriosdelCRG.Actual-
mentecolaboramosconnovartisparagarantizarlacontinuidaddelprogramademovilidad.
- Colaboración con la Fundación Mujeres por África:Acogimoslaprimeracientíficaséniorconelapoyo
delprograma“ellasinvestigan”.LizKizito,directoradelDepartamentodeAgriculturadelaUniversidad
CristianadeUganda,fueacogidaenlaUnidaddeBioinformáticaparaestudiarlavariabilidadgenética
de Solanum aethiopicumenÁfrica.JuntoconlafundaciónMujeresporÁfrica,tambiénorganizamosel
taller“RetosyoportunidadesparalainvestigaciónenÁfrica”,quefomentóundebateinteresanteentre
los ponentes y un gran número de asistentes.
MujeresenlaCienciaenelComitédeIgualdaddeGénero(eninglés,Gender Balance Committee, GBC), presidido por isabelle
Vernos,estánrepresentadastodaslascomunidadescientíficas,asícomoeldepartamentodeRecur-
sosHumanos(véansesuscomponentesenhttp://www.crg.eu/en/content/about-us-women-science/
gender-balance-committee). Losobjetivosdedichocomitésoneliminar el sesgodegénerode los
procesosdeseleccióndepersonal,atraerycaptaramujerescientíficas,mejorarlaconciliacióndela
vidalaboralyfamiliar,fomentareldesarrollodelacarreraprofesional,yestablecerydifundirprácti-
caslaboralessensiblesalascuestionesdegénero.estosobjetivossecorrespondenconelproyecto
Resumen ejecutivo 2017 - 15
LIBRA(LeadingInnovativeMeasurestoReachGenderBalanceinResearch),financiadoporlaUey
coordinado por el CRG.
en2017,lasaccionesimplementadasporelCRGincluíanelPlandeIgualdaddeGénero(GeP),presen-
tado en agosto de 2016 en el marco del proyecto liBRa. las acciones del Gep se centran en cuatro
aspectosprincipales:elprocesodeseleccióndepersonal,eldesarrollode lacarreraprofesional, la
conciliacióndelavidalaboralyfamiliar,ylasdimensionesdesexo/géneroenlainvestigación.
Duranteel2017, losprincipalesobjetivosdelComitédeIgualdaddeGénerofueroneldesarrollode
lacarreraprofesionalyelprocesodeseleccióndepersonal.Acontinuación,sepresentanalgunos
aspectos destacables:
dESaRROllO dE la CaRRERa PROfESIONal
• Se seleccionaron dos investigadoras posdoctorales del CRG para participar en el programa de
orientación profesional LIBRA Career Development Compass, cuyo objetivo es apoyar a las in-
vestigadoras en su camino para convertirse en investigadoras independientes y hacer carrera en
el ámbito académico (http://www.eu-libra.eu/news/20-eu-life-post-docs-their-way-become-pi-first-
milestone-knowing-how-they-want-their-career-be). el programa tuvo una muy buena acogida y
actualmenteLIBRAestudialaposibilidaddemantenerloenfuturasedicionesypermitirlaparticipa-
ción de más investigadoras postdoctorales.
• Después del éxito del programa de becas para mujeres científicas (WOSS, Women Scientists
Support Grant), implementadoporelComitédeIgualdaddeGéneroen2016,sevolvieronaabrir
dosconvocatoriasen2017.elsistemadeayudasWoSSpretendeapoyaramujerescientíficasque
tienenambiciónypotencialparaocuparunaposicióndeliderazgoenelámbitodelainvestigación,
peroqueseenfrentanalosretosasociadosalamaternidad.en2017,cuatromujerescientíficas
obtuvieron apoyo de WOss.
• Comoenelañoanterior,elCRGcelebróelDía Internacional de la Mujerel8demarzo.Sedistri-
buyeronfolletosentreelpersonaldelPRBBdondesedestacabanlastrayectoriasprofesionalesde
cuatroexalumnasdelCRG.el8demarzoseorganizóasimismounactodemediajornadaenelque
seproyectóunapelícula,seguidadeundebate,yquecontóconlaasistenciadeungrannúmerode
personas.
• Paracelebrareldía de Ada Lovelace, a los estudiantes adolescentes del área de Barcelona se les
ofrecióunmódulodidácticodeundíasobreconocimientosdeprogramación,quesellevóacaboen
el CRG (se trató de una iniciativa conjunta del departamento de Comunicación y RRpp e investiga-
doras del instituto).
PROCESO dE SElECCIóN dE PERSONal
Se implementaronvariasaccionesymedidasparagarantizarqueen losprocesosdeselecciónde
personalnoseprodujeransesgosporcuestionesdegénero.estasson:
• Unnuevomodelodeofertadetrabajoqueincluyainformaciónsobrelaigualdaddegéneroylacon-
ciliacióndelavidalaboralyfamiliarenelCRG,yquereflejeunentornodetrabajodiverso.
• Actualmenteseproyectaunvídeosobreelsesgodegénero,porencargodelainstituciónCeRCA,a
todoslosmiembrosdelcomitédeseleccióndejefesdegrupoconelfindeaumentarlasensibilización
conrespectoalosprocedimientosincorrectos.(https://www.youtube.com/watch?v=g978t58geLo)
• tambiénsehadiseñadounfolletoenelqueseenumeranlasventajasqueofreceelCRGasusemplea-
dosconrespectoaunaconciliaciónpositivadelavidalaboralyfamiliar.estasventajassonelacceso
aserviciosdeguardería,abeneficiossociales,aoportunidadesdedoblecarrera,teletrabajo,etc.el
folletosecompartedigitalmenteconcadaunadelascandidatasqueseentrevistanconelCRG.
16 - Resumen ejecutivo 2017
DestacadosCientíficos
Resumen ejecutivo 2017 - 17
Hogar dulce hogarelegirellugarperfectoparaviviresimportante,especialmentesieres un retrovirus.
a diferenciadelosviruscomoeldelresfriadocomún,queinfectanlascélulasy,alhacerlo,lasdes-
truyencompletamente,elVIHyotrosretrovirusconviertensuinformacióngenéticaenADnyla
insertanenelgenomadesuhuésped,unacélulacélulainmunehumanaconocidacomo“célulat”.
AlgunascélulasinfectadasutilizanesteADnviralparahacermuchascopiasdelvirus,queluegoinfectana
nuevoshuéspedes.Perootrosentranenunestadodereposo:elADnviralaúnseescondedentrodelgenoma
delacélula,peronoproducevirusnuevos.esloqueseconocecomounainfecciónlatente.estosvirusocultos
latentessereactivaránmásadelanteycomenzaránunainfecciónactivaquepuedeconvertirseenunsidaple-
namente desarrollado.
Hasta10decadamillóndecélulasinmunesdeunpacienteconVIHpuedenalbergarunainfecciónlaten-
te.LostratamientosactualesdelVIHsolofuncionanconvirusactivos,porloquelosinvestigadoreshan
diseñadomedicamentosquepueden“desalojar”losvirusescondidosenelADnyhacerlosvulnerables
alaterapia.enteoría,elVIHpuedeestablecerseencualquierubicacióndelgenoma,ydeberíaserigual
defácileliminarlodecualquierlugar.Peroningunodeestostratamientospuedemovertodoslosvirus
latentes,porloquelainfecciónporVIHtodavíaesimposibledecurarporcompleto.
Ahora,GuillaumefilionysuequipohandesarrolladoenelCRGunaformadelocalizarlaubicaciónexac-
tadelVIHlatenteenelgenoma,yhanreveladopistasimportantessobreporquéenalgunoscasosle
cuestamásreactivarsequeenotros.
“Sabemosdesdelosaños30quealgunosgenessonmásactivosqueotros,segúnsuubicaciónenel
genoma”,explicafilion.“Porlotanto,tienesentidoqueestomismoocurraconelVIH:queleresultemás
fácilintegrarseoreactivarsedesdeciertasubicacionesquedesdeotras”.
Cuando se trata de decidir dónde vivir, la ubicación lo es todo. si uno se traslada a una ciudad viva y
trepidante,probablementeelijaunazonaconcafés,baresytiendas,enlugardeunazonamuertadonde
todoestásiemprecerrado.Segúnhanobservadofilionysuequipo,elVIHtendríalamismaintención
cuandosetrasladaacélulashumanas.
18 - Resumen ejecutivo 2017
ROMPIENdO El CódIgO dE baRRaS
UnodelosproblemasprincipalesdelestudiodelainfecciónlatenteporVIHesqueunasolacélulapuedetener
variosvirusincrustadosenmuchoslugaresdelgenoma.estohacequeseadifícilidentificarlaubicaciónde
cada virus concreto y averiguar cuáles se reactivan y cuáles permanecen ocultos tras el tratamiento.
eltrucodelnuevométododefilionradicaenun“códigodebarras”genético:unasecuenciaúnicade
ADnquelosinvestigadoresincorporanenelcódigogenéticodelaspartículasdevirusindividuales.Una
vezlosvirussehaninsertadoenelgenomadelacélulahuésped(enestecaso,célulasinmuneshuma-
nascultivadasenellaboratorio),losinvestigadoresextraenelADncelularylosecuencianparalocalizar
dóndeseubicanlosviruslatentes.Ycomocadavirustienesupropiocódigodebarrasúnico,esfácil
verdóndesehaincrustadocadauno.elcódigodebarrastambiénsepuedeutilizarparaversiunvirus
concretosehaactivadoyseestá“leyendo”,deformasimilaralosgenesnormalesdelacélulahuésped.
“Hemospodidoutilizarnuestratécnica,quellamamosB-HIVe,parahacerunmapadeloslugaresadon-
delegustairalVIH”,dicefilion.“tienemuchosprejuiciosyprefierelaszonasactivasdelgenoma:quiere
ir donde está la acción”.
eincluso,entrelaszonasactivasdelgenoma,losinvestigadoreshanobservadoquealgunasáreascon-
cretasdelgenomaleresultanmuchomásatractivasqueotras.Porejemplo,algunas“direcciones”son
100vecesmáspropensasaserunvirusqueotras,aunquelarazónporlaquesontanpopularessigue
siendo un misterio.
Comoeradeesperar,laubicaciónexactadelVIHenelgenomaafectaalaprobabilidaddequeelvirusse
vuelvaaactivar.Losvirusquesehabíanestablecidocercadelos“conmutadoresdecontrol”encargados
deactivarlosgeneseranmuchomásactivosquelosdeotroslugares.Sinembargo,talcomoseñala
filion, todavía hay mucha variabilidad inexplicada.
“PensamosqueellugardeinserciónenelgenomaseríaelprincipaldeterminantedelaactividaddelVIH,
perohemosvistoqueelvirusentraenelmismolugarendiferentescélulasyluegosecomportadeforma
diferente.Asíquehayalgunaotracosaqueaúnnoentendemos”.
aVaNzaNdO
además de detectar patrones en los lugares donde al viH le gusta vivir dentro del genoma, filion y sus
colegastambiénobservarondiferenciasclaveen laformaenque losvirusdeubicacionesconcretas
respondíanadosmedicamentosdereactivación,elvorinostat(VoR)ylafitohemaglutinina(PHA),que
tienendiferentesmecanismosdeacción.Curiosamente,encontraronquelosvirusdeunconjuntode
“direcciones”genómicastendíanareaccionaralVoR,mientrasquelosquesehabíaninsertadoenotras
ubicacionessereactivabanpreferentementeconlaPHA.
estosugierequeuntratamientodirigidoatratarlasinfeccioneslatentesdeberíacombinarnecesariamenteun
cócteldevariosmedicamentosconaccionesdiferentesparaeliminartodoslosvirusinactivos.Conlamejora
delastécnicasgenéticas,esposiblequeenelfuturosepuedadesarrollarlamejorcombinacióndefármacos
dereactivaciónbasándoseenlosdiferentestiposdeubicacionesviralesdentrodelascélulasinmunesdel
paciente,paragarantizarquetodoslosviruslatentesseandesalojadosdetodosloslugaresdelgenoma.
Parafilionysuequipo,elsiguientepasoesversipuedenaplicarsutécnicadelcódigodebarrasparaetiquetar
elADndelVIHlatenteenlascélulasinmunesdeanimales-o,incluso,tomadasdirectamentedepacientes
infectados-,envezdecélulascultivadasenellaboratorio.Cabelaesperanzadequelanuevatecnologíade
edicióndegenes,conocidacomoCRISPR,lohagaposible,aunquetodavíahaymuchotrabajoporhacer.
“elfinaldeljuegoenestecasonoesquehayaunfármacoquepuedacurarelVIH,yquizásnuncaserá
posiblereactivaryeliminartodoslosvirusdelcuerpo”,dicefilion.“Y,loqueesmásimportante,nuestro
trabajonosayudaacomprenderlacomplejarelaciónentreelvirusyelgenomahuésped.Cadaunode
ellosesunaagujamuypequeñaenunpajarmuygrande,peroahorapodemossaberexactamentedónde
se esconden”.
OBRA DE REFERENCIA:
ChenHC,MartinezJP,Zoritae,
MeyerhansA,filionGJ.
“Position effects influence HIV latency
reversal.”
natStructMolBiol,24(1):47-54.doi:
10.1038/nsmb.3328.epub2016nov21.
Resumen ejecutivo 2017 - 19
Nadar en un mar de virusUnanuevatécnicadecribadodeviruspequeñosdelaguademarpuedeayudarenlabúsquedadepatógenoshumanos.
Desde la ventana de su laboratorio en el CRG, Oscar fornas puede ver el mar. lejos, sobre las olas,
los marineros tiran su captura sobre las cubiertas de sus barcos, ya llenas de peces demasiado
grandesparacolarsepor losagujerosde lasredes.Cuantomáspequeñosson losagujeros,
máspequeñossonlosbichosquequedanatrapados.Pero¿cuánpequeñadebeserunaredparaatrapar
cosastanpequeñascomounvirusmicroscópico?
Paraentenderelmundoquenosrodea,losbiólogosquierenaveriguarcómointeractúanlosanimales,
lasplantasylosmicrobios(incluidoslasbacteriasyvirus)paracrearunecosistema.Ylosocéanosson
losecosistemasmásfascinanteseimportantesdelplaneta,conmásvalorparaelclimadelatierraque
las selvas.
“Lamayorpartedeladiversidadbiológicadelplanetaviveenelmar”,dicefornas,jefedelaUnidaddeCito-
metríadeflujoquecompartenelCRGylaUniversidadPompeufabra.“Losorganismosmarinoscomoel
planctonylasbacteriasfijanaproximadamentelamitaddeldióxidodecarbonoenlaatmósferaygeneran
grandescantidadesdeoxígeno.Peromuchosviruslosinfectanypodríandestruirlospotencialmente”.
Dehecho,elocéanoestállenodevirus(tansolounmililitrodeaguamarinapuedecontenerunosdiez
millonesdevirus),perosecalculaquesoloconocemoslaidentidaddeununoporcientodeellos.
CazaR El VIRUS
AmedidaquelasecuenciacióndelADnsehavueltomásrápidaymásbarata,losinvestigadorescap-
turancadavezmásdatosgenéticosparacomprendermejorladiversidaddeespeciesquehabitanen
unecosistema.Pero,mientrasqueobtenerADndeunanimaloplantaconcretoesrelativamentefácil,
cuestamuchomáscaptarbacteriasmicroscópicasindividualesovirusinclusomáspequeños.
Latécnicamáspopularparaanalizargenomasmicrobianossalvajesrecibeelnombrede“meta-genómi-
ca”.Implicaobtenerunamuestradelentorno,comounapaladadetierraounvasodeagua,ypurificar
ysecuenciarunamezcladeADndetodos losmicrobiosquevivenenella.Seutilizanunastécnicas
20 - Resumen ejecutivo 2017
computacionales muy ingeniosas para separar los genomas de especies individuales, pero los genomas
víricossonmuypequeñosytiendenaperderseentreelrestodedatosdeorganismosmásgrandes.
encolaboraciónconcolegasdeBarcelona,AlicanteyestadosUnidos,fornasqueríaencontrarlama-
neradesepararvirusindividualesdeestamezclademicrobiosparapoderlossecuenciarporseparado.
esteenfoquehatenidoéxitoconcélulasindividualesdetejidosanimalesotumoresyconbacteriasde
muchosentornosdiferentes.Peronuncasehabíahechoconalgotanpequeñocomounvirus,unasmil
vecesmáspequeñoqueunacélulahumanaestándar.
REdUCIéNdOlO
Paracribarlosvirusdelaguasalada,fornasusóunatécnicadelaboratoriomuypopularconocidacomo
separacióndecélulasactivadaporfluorescencia(SCAf),queseutilizaamenudoparasepararcélulas
individualesdeunapoblaciónmezclada.Semarcanlascélulasconuncolorantefluorescenteyseintro-
ducenenunamáquinadondecorrientesdeunlíquidodiseñadocuidadosamentelasenvíanunaaunaa
travésdeunrayoláserparaanalizarlas.entoncesseseparandeformaautomáticaenplacasmicrotitu-
ladoras para el ensayo.
AjustarlamáquinadeSCAfparatratarconalgotanpequeñocomounvirusfuetodounreto.Aunque
fornasysuequipoconsiguieronmarcar losvirususandouncolorantequemanchaelADnvírico, la
fluorescenciaesmuyleveporqueelgenomaesmuypequeño.tambiénhaymuchasotraspartículas
pequeñasenelaguamarina,comoporejemplopartículasdebasuraenbolsasmicroscópicasextruidas
decélulasmásgrandesquepuedencrearconfusiónparalamáquinaseparadora.Ytodoelprocesodebe
quedarlibredecontaminantesquepuedandañarelADnyhacerloimposibledesecuenciar.
encontrar los parámetros correctos supuso muchos meses de hacer pruebas y solucionar problemas.
Ytambiénhuboelpesadoprocesodetodoundíadelimpiezaquehabíaquehacerantesdecadaexperi-
mento,paragarantizarladesaparicióndetodorestodeADnpotencialmentecontaminante.Afortunada-
mente,fornasysuequipoteníanaccesoaunafuentedevirusoceánicosmuycercana,yaqueutilizaban
muestrasdelMediterráneo,queteníanalaspuertasdellaboratorio,paraoptimizarlatécnica.
“el agua de mar es como una sopa”, dice fornas. “Trabajábamos muy cerca de los límites de nuestra
tecnología.Peroajustamoslosláseres,hicimosralentizarelflujodelamáquinayseguimoshaciendo
pruebashastaqueconseguimossepararvirusindividualesconéxito”.
dEl MaR a la SalIVa
Ademásdesusmuestraslocales,fornastambiénaislóvirusdeaguamarinaobtenidosdelasuperficie
ydehasta4kmdeprofundidaddelMediterráneoydelAtlántico.entotal,elequipocribómásde2.000
partículasdelamedidadeunvirus,delasqueobtuvoaproximadamente392secuenciasdegenoma
vírico.44deellasseremitieronparaunasecuenciaciónmásdetallada,ytodasresultaronservirusque
hasta entonces eran totalmente desconocidos para la ciencia.
Además,losvirusqueaparecenmásvecesenelprocesodeobtenciónesmásprobablequeseancomu-
nes,loquenosproporcionaunalecturaaproximadadelaabundanciarelativadediferentesespeciesen
esapartedelocéano.Aunqueencontrartantosvirusnuevosesimpresionante,fornasveesteproyecto
como una prueba de concepto.
“esteproyectodemuestraquepodemosjuntarlaSCAfylagenómicaparavirus”,explica.“Ahoratene-
mosunaherramientaqueutilizamospara identificarnuevosvirusenotrosecosistemas, talescomo
piscinas,lagos,aguapotableoinclusofluidoscorporales;yahemosdemostradoquepodemosutilizar
nuestrométodoparaencontrarvirusenlasaliva.nosabemosquévirushayfueraquepuedanserperju-
diciales para los seres humanos, pero ahora tenemos una herramienta para encontrarlos”.
OBRA DE REFERENCIA:
franciscoMartinez-Hernandez,oscar
fornas,MonicaLluesmaGomez,Benja-
minBolduc,MariaJosedelaCruzPeña,
JoaquínMartínezMartínez,JosefaAn-
ton,JosepM.Gasol,RiccardoRosselli,
franciscoRodriguez-Valera,Matthew
B.Sullivan,SilviaG.Acinas&Manuel
Martinez-Garcia
“Single-virus genomics reveals hidden
cosmopolitan and abundant viruses”
Nature Communications, 8:15892
(2017),doi:10.1038/ncomms15892
Resumen ejecutivo 2017 - 21
UltracongelaciónUnnuevométododecongelación,quesepuedeusarencualquierlugardelmundoyqueconservalascélulassimplesparaelanálisiscientífico.
a quíseplanteaunreto:tomadunpuñadodegominolasdediferentessabores,ponéoslasen
labocaymasticad.Intentadindividualizarcadasabor.Quizáspodréisdistinguirlacereza
oellimónácido,peroprobablementeoscostaráidentificarcadaunodelosotrossabores.
Peroponéoslasenlabocadeunaenunayserásencillodistinguircadasabor.
esteescenarioesmuyparecidoal problemaconqueseencuentran loscientíficosque investigan
loscambiosenlaactividadgenéticaqueseproduceenlascélulassimplesduranteeldesarrollode
enfermedadescomoelAlzheimeroelcáncer.Antes,loscientíficosteníanquetrabajarconmuestras
detejidoqueconteníanmuchosmilesomillonesdecélulasyfijarseenelresultadogeneral:igualque
ponerseenlabocatodounpuñadodegominolasdediferentessabores.
Graciasa lasmejorasen la tecnología,ahora los investigadorespuedenfijarseen lospatronesde
actividadgenéticaenlascélulasindividualesextraídasdetejidosanooanormalyobtenerunalectura
fiabledesu“sabor”individualizado.Peronoesfácilobtenereltipodemuestrascorrectasparaelaná-
lisisdelascélulassimples.
“tenemosqueempezarconcélulasvivasextraídasdematerialfresco”,explicaHolgerHeyn,jefedel
equipodeGenómicaMonocelulardelCnAG-CRG.“AquíenBarcelonaestamosjustoalladodelhos-
pitalytenemostodoelequipamientonecesarioparaseparar lascélulas.Perohaymuchoscentros
médicosodeinvestigaciónquenotienenestaposibilidad”.
enlugardeello,lasmuestrasdetejidodelospacientesnormalmenteseconservanenformaldehídoy
seenvíanaanalizaraotrolugar.Peroesteconservantehacequelascélulassepeguenynosepuedan
separar.Alternativamente,lasmuestrastambiénsepuedencongelarconhielosecoonitrógenolíqui-
do,aunqueesolasdañahastaelpuntodequesedesintegrancuandosedescongelan.Ysincélulas
simples,losinvestigadoresnopuedenanalizarlas.
Porello,Heyndecidiódesarrollarunmétodoalternativoquesepudierautilizarparaconservarlascélu-
lasrecogidasencualquierpartedelmundoyquepermitierasepararlasmásadelante.
22 - Resumen ejecutivo 2017
MUESTRa y ENfRIaMIENTO
Paradesarrollarelnuevométodo,Heynysuequiposeinspiraronenlacriopreservación.estatécnica
normalmenteseutilizaparaconservarcélulasbiológicasytejidoscomoóvulosoembrionesencen-
trosdefIV,perotambiénalgunosatrevidosdecidencriopreservarsucuerpoosucerebrodespuésde
lamuerte(aunquelatasadeéxitoenladescongelacióndeembrionesfIVesbuena,¡nohayejemplos
dehumanoscriopreservadosquehayanvueltoalavida!).
Durantelacriopreservación,lamuestradetejidosemezclaconunasoluciónespecialquecontieneun
conservantequímicosuavellamadoDMSo,juntoconunsueroricoenproteínasderivadodelasangre,
yseenfríalentamentehasta-80°Cenuncongeladordelaboratorioo-200°Cennitrógenolíquido.Los
primerospasosdelacongelaciónsepuedenllevaracaboenunrefrigeradorportátil,yasísepueden
recogermuestrasenlugaresremotosfueradeunhospital.
Unavezcongeladascorrectamente,lasmuestrascriopreservadassepuedenguardardurantealme-
nosseismeses,paraluegopoderlasdescongelar,trocearydescomponerconenzimasparaobtener
lascélulassimplesquehayqueanalizar.Despuésdeevaluarlatécnicaconcélulasobtenidasenel
laboratorio,muestrasdesangre,deintestinoydecáncer,losinvestigadoresconcluyeronque,aunque
algunascélulasquedandañadasysepierden,hayunaproporciónsignificativaquequedaintacta.
trasperfeccionarlatécnica,ahoraHeynysuequipopuedenrecuperaralrededordel90%delascélu-
lassanguíneascriopreservadas,aunqueestacifraesmásbajaparatejidossólidoscomolostumo-
res.Cabedestacarquehandemostradoqueelprocesodecongelaciónnoafectaalospatronesde
actividadgénicaencélulascriopreservadasencomparacióncon los tejidos frescos, loqueabre la
posibilidaddeanálisisdecélulassimplesaequiposdeinvestigaciónquenotienenunaccesodirecto
a instalaciones tan complejas.
“nuestrométodoesmuyeconómicoyfácil.nonecesitasnadaespecial”,explicaHeyn.“noesperába-
mosquefuncionaratanbien.nohayningunaseñalde“choque”debidoalacongelaciónyestamos
bastantesegurosdequeobtenemosunamuestrarepresentativadeltejidotalcomoeraenvida”.
Como la técnicadecriopreservaciónes tansencilla,ahoramuchoshospitalesoptanpor recoger
lasmuestrasdeestamaneraconlaesperanzadepodercolaborarconHeynoalgúnotrolaborato-
riodegenómicamonocelularenelfuturo.Porejemplo,losmédicospuedenrecogercélulasdeun
tumorenelpuntodediagnóstico,ytomarmásmuestrasamedidaquelaenfermedadrespondeal
tratamientoosedesarrollaunaresistenciayelpacienterecae,utilizandoanálisisdecélulassimples
para identificar todos loscambiosdetalladosen losgruposdecélulasgenéticamentediferentes,
queconformanuntumor.
Además,losinvestigadoresquetrabajanenpaísesenvíasdedesarrollotienenahoralaposibilidadde
recogermuestrasparaproyectosdeinvestigaciónqueimpliquenelanálisisdecélulassimples,loque
era imposible en el pasado.
“todaslasmuestrassoncomplejasyestánformadaspordiferentestiposdecélulas”,diceHeyn.“Pero
esteanálisisdetalladoconrespectoalascélulassimplesnospermitegenerarnuevosconocimientos
sobre loquerealmenteseestáproduciendoen los tejidos internos,cómoestán formadosycómo
funcionan.nuestrométododecriopreservaciónabrirátodounmundodemuestrasdecélulassimples.
Realmente cambiará las reglas del juego”.
OBRA DE REFERENCIA:
AmyGuillaumet-Adkins†,Gustavo
Rodríguez-esteban†,elisabettaMereu†,
MariaMendez-Lago,DiegoA.Jaitin,
alberto villanueva, august vidal, alex
Martinez-Marti,enriquetafelip,Ana
vivancos, Hadas Keren-shaul, simon
Heath,MartaGut,IdoAmit,IvoGutand
Holger Heyn
“Single-cell transcriptome conservation in
cryopreserved cells and tissues”
GenomeBiology,18:45,(2017),https://
doi.org/10.1186/s13059-017-1171-9
Resumen ejecutivo 2017 - 23
pásaloUnequipodeinvestigadoreshadescubiertounaherenciaepigenéticapococomúnquesepuedetransmitirmásde14generaciones.
Muchasfamiliastienenherencias,objetosespecialesquepasandegeneraciónengeneración,
recuerdosvaliososquelesllegandetiempospasados.Paralosdiminutosgusanosnema-
todos,estetesorotomalaformademarcasquímicasenelgenoma,quetransmiteninfor-
mación sobre cómo era la vida en el pasado. sorprendentemente, estos recuerdos celulares se pueden
transmitirhasta14generacionescomomínimo,aunquecomolosgusanosnacen,sereproducenymue-
ren en un espacio de pocos días, esto solo represente algunos meses..
eldescubrimiento,publicadoporeljefedegrupodelCRGBenLehnerencolaboraciónconinvestigadoresdel
InstitutodeInvestigacióncontralaLeucemiaJosepCarreras(IJC)ydelInstitutodeInvestigaciónenCiencias
delaSaludGermanstriasiPujol(IGtP),enuniniciofuecasual.AdamKlosin,estudiantededoctorado,estaba
estudiandounosgusanosC.elegansalosquesehabíaintroducidounchipgenético-unalargacadenadeco-
piasrepetidasdeungenquecodificaunaproteínafluorescenteroja-cuandosediocuentadeunhechoextraño.
Silosgusanossemanteníana20°C,elchiptransgénicoeramenosactivoycreabasolounapequeña
cantidaddeproteínafluorescente;perosilosanimalescambiabanaunclimamáscálidode25°C,la
actividaddelchiptransgénicoaumentabasignificativamenteyhacíaquelosanimalesbrillaranconun
rojointensobajolaluzultravioleta.
y SE PROdUJO UN hEChO INClUSO MáS ExTRañO
Cuando losgusanosvolvíana temperaturasmásbajas,sus transgenesseguíanmuyactivos, loque
sugeríaquedealgunaformatodavíareteníanla“memoria”desupasadomáscálido.Misteriosamente,
lafluorescenciabrillantesetransmitióasussucesivosdescendientesdurantesietegeneracionesque
vivieronatemperaturasmásbajas,apesardequelosanimalesdeorigensolohabíansidoexpuestosa
temperaturas más altas durante un periodo corto de tiempo. sorprendentemente, mantener a los gusa-
nosa25ºCdurantecincogeneracionesconllevóqueelaumentodelaactividadtransgénicasemantu-
vieradurantealmenos14generacionesunavezlosanimalesvolvieronaunavidamásfría.
“esgenial”,diceenLehner.“Setratadeunsistemaartificial,peroelefectoesmuymarcado.teníamosquedescu-
brirquéloprovocaba,asíqueAdamabandonósuproyectodedoctoradoanteriorycomenzóatrabajarenesto.”
24 - Resumen ejecutivo 2017
haCIENdO UNa MaRCa
Paradescubrirquéprovocabaestepatróndeherenciaextraño,Lehnerysuequipohicieronunanálisis
másdetalladodelchiptransgénico,concentradoenproteínasenformadebola(histonas)quecontienen
ADndentrodelacélula.
Lashistonassepuedenmodificarcon“marcadores”químicos(marcasepigenéticas)devariasformas.
Algunasmarcasepigenéticasseasocianalaactivacióndelosgenes,mientrasqueotrasseasocian
asusilenciamiento.enconcreto,Lehnersecentróenlamodificacióndeunahistonaconocidacomo
trimetilaciónH3K9,queayudaadetenerlaactividadgenética.
Comoeradeesperar,losinvestigadoresdescubrieronquelostransgenesenanimalesquesiempreha-
bíanestadoa20ºCteníanaltosnivelesdetrimetilaciónH3K9.enconsecuencia,sustransgeneseran
menosactivosynoemitíanmuchafluorescencia.Losgusanosqueentoncessepusierona25ºCperdie-
ronlosmarcadores,activaronsuchiptransgénicoycomenzaronabrillar.
Sorprendentemente,esosanimalesconfluorescenciabrillantequehabíancrecidoenelclimamáscálido
mantenían la metilación de la histona reducida cuando se les devolvía a una temperatura más baja, lo
quesugierequeestemecanismotieneunpapelimportanteenelbloqueodelamemoriasobrelatempe-
ratura ambiental en el genoma.
enunanálisisaúnmásdetallado,LehnerysuequipodescubrieronqueunaproteínallamadaSet-25es
laresponsabledemantenerlospatronesdemetilacióndelahistonaenelchiptransgénico.Peroaúnno
sabenexactamentecómoelaumentodetemperaturaconducealapérdidademarcasdemetilaciónen
histonas. Y tampoco saben si los patrones de metilación de la histona son los responsables de transmitir
lamemoriadetemperaturadeunageneraciónaotra,aunqueyasedistinganenloshuevosyelesperma,
yesténpresentesenlosprimerosestadiosdeldesarrollodelosgusanos.
dE gENERaCIóN EN gENERaCIóN
elchiptransgénicofluorescenteseintrodujoenlosgusanosmediantetécnicasdeingenieríagenética,
asíquepodríadarseelcasodequeactuarademaneraextraña.PeroLehnerysuequipotambiéndes-
cubrieronque repetidos fragmentosdelgenomanormalde losgusanosqueseparecíana loschips
transgénicossecomportabantambiéndeunaformasimilar,loquesugeríaqueestefenómenoesgene-
ralizadoynoestárestringidosoloagenesdiseñadosartificialmente.
“estefenómenonoesdeltodosorprendente”,afirmaLehner.“Hayotroselementosrepetitivosenlalínea
germinaldelosgusanosquecambiansuactividadenfuncióndelatemperatura,yparecequeseman-
tieneunremanentedeherenciaalgunasgeneracionesdespués.Perohastaahoranohemosencontrado
ningúngen‘regular’quesecomporteasí”.
Aunqueestefenómenodeherenciaepigenéticasehaobservadoenvariosanimales,incluidosmamífe-
ros,todavíanohaypruebasdelosefectosquepuedeteneralargoplazo.Inclusolosmejoresejemplos,
comoelimpactodelhambreduranteelembarazo,sedisipanalcabodeunpardegeneraciones.eso
hacequelosgusanosdeLehnerseanlamuestramásduraderade“memoria”ambientaltransgeneracio-
nalquesehaobservadoenanimaleshastaeldíadehoy.Pero,peseaserunresultadointrigante,todavía
nosesabeexactamentequéutilidadpuedetenerparalosgusanos.
“nosabemosmuybienporquéseproduceestefenómeno,peropodríaserunaformadeplanificación
anticipadabiológica”,explica.“Losgusanosvivenpocosdías,asíquetalveztransmitenrecuerdosdelas
condicionesvividasparaayudarasusdescendientesapredecirquéambienteencontraránenelfuturo”.
Paraungusano,diezgeneracionesrepresentanmenosdeunpardemeses.Podemospredecirconbas-
tanteexactitud la temperaturaquehabrá lossiguientesquincedías, así quepara losgusanos tiene
sentidointentarcodificarlainformaciónparaayudarasustrastatara-trastataranietos(o,másexacta-
mente,trastatara-trastataragusanos)aprepararseparaelambienteenquedeberáncrecer.Peroescasi
imposiblepredecircómoseráelclimadespuésdemuchasgeneracionesdevidahumana,asíqueeste
tipo de mecanismo probablemente no es útil para especies de vida más larga.
“Porahora,todoestosonespeculaciones”,afirmaLehner.“Perolabiologíaestanextrañaque,siseproduce
algoasí,esprobablequetambiénsehayaproducidoparaotroobjetivoenalgúnotrolugardelanaturaleza”.
OBRA DE REFERENCIA:
adam Klosin, eduard Casas, Cristina
Hidalgo-Carcedo, Tanya vavouri, Ben
lehner
“Transgenerational transmission of
environmental information in C. elegans”
science, 356(6335):320-323 (2017), doi:
10.1126/science.aah6412
Resumen ejecutivo 2017 - 25
Clasificareselcumpleañosdetuamigoyquieresenviarleunregalo.Loenvuelves con cuidado, escribes el nombre en el exterior, pegas un sello y lo mandas por correo. entonces, como por arte de magia, un pardedíasdespuésllegaasucasa.
l amagiatiene lugarcuandolostrabajadoresdeldepartamentodeclasificaciónde laoficinade
correosreconocenelselloyladirección,yluegoenvíanelpaqueteconlasfurgonetasdereparto
alaubicacióncorrecta.Casipasaexactamentelomismodentrodenuestrascélulas,aunaescala
muchomásreducida,yaqueellastambiénempaquetanyenvíanalorganismopaquetesdeproteínas,
comolasenzimasolashormonas.
esta vía de secreción, tal como se denomina, se ha estudiado minuciosamente durante años. ahora
sabemosquelasproteínassecretadasseprocesanenunaespeciede“fábrica”celular,llamada“retículo
endoplasmático”(Re),queluegoseenvíanaunaestructuradenominada“aparatodeGolgi”,dondese
modificanyseempaquetan.Lasproteínasseenvíanallugaradecuadograciasalos“sellos”yalas“di-
recciones”moleculares:pequeñasregionesdelaproteínasecretadaquelamarcanparasuexportación.
“LamayoríadelasproteínassesecretanatravésdelretículoendoplasmáticoydelaparatodeGolgi;esunavía
queconocemosmuybien”,explicaVivekMalhotra,jefedegrupoenelCRG,“perosesecretanotrasproteínas
quenohacenesterecorridoynosabemosqué‘sellos’niqué‘oficinasdeclasificación’losenvíanasusitio”.
UN RECORRIdO NO CONVENCIONal
estahistoriacomenzóen2007,cuandoMalhotraysuequiposedieroncuentadequelascélulasdeleva-
dura y las de hongos mucilaginosos secretan una proteína llamada acb1 bajo la inanición de nutrientes.
PeroresultacuriosoquelaAcb1nopresentaningunadelasseñalescaracterísticasquelaenviaríana
travésdelavíadesecreciónhabitual.
enlugardeesto,unasproteínastransportadorasespecialesseunenylatransportanauna“oficinadeclasifica-
ción” temporal. este es el compartimento para la secreción no convencional de proteínas (CUps, por sus siglas
eninglésdeCompartmentforUnconventionalProteinSecretion),queestáformadoporcomponentesdelRe,
delaparatodeGolgiydepequeñospaquetesllamados“endosomas”,ysoloapareceencondicionesdeestrés.
26 - Resumen ejecutivo 2017
Malhotraysuequipoteníancuriosidadporsabersihabíaotrasproteínasqueemprendieranestavía
pocoortodoxaparasalirdelacélula,ydecidieronexaminarconmayordetallelasuperóxidodismutasa
1 (SoD1),unaproteínaquenormalmentenosprotegeneutralizandosustanciasquímicas tóxicasdel
organismo.ComolaAcb1,laSoD1notieneel“sello”habitualdeexportaciónquelaconduceatravésdel
ReydelaparatodeGolgi,aunquetambiénlasecretanlascélulas.
LaSoD1estáinvolucradaenlaesclerosislateralamiotrófica(eLA,tambiénconocidacomoenfermedad
deLouGehrigoenfermedaddelasneuronasmotoras),queesunaafecciónneurodegenerativa.esuna
enfermedadqueavanzarápidamenteynotienecura,matalascélulasnerviosasqueseencargandel
movimiento(neuronasmotoras)y,finalmente,provocalaparálisisylamuerte.Cercadeunaquintaparte
delaspersonasquepadeceneLApresentaundefectogenéticoenelgenquecodificalaproteínaSoD1.
LosinvestigadorespiensanquelascélulasadyacentessecretanlaSoD1defectuosayquelasneuronas
motoraslaasimilan,loquedestruyelasvaliosascélulasnerviosasenlugardeprotegerlas.
DebidoalaimportanciadelaSoD1enlaeLA,Malhotraysuequipoquisierondescubrirsitambiénutiliza
lavíadelCUPSparasalirdelascélulas,ydescubrirlaidentidaddel“sello”biológicoqueselaenvía.
INaNICIóN y ClaSIfICaCIóN
Deformasimplificada,loscientíficosempezaronsuinvestigaciónconcélulasdelevadura,quepresentan
víasdesecreciónmuysimilaresalasdelascélulashumanas,perosonmásfácilesdecultivaryanalizar
enellaboratorio.Sedieroncuentadequecuandocultivabanlevaduraconabundanciadenutrientes,las
célulassecretabanalgodeSoD1.Perocuando lascélulastenían inanicióndenutrientes,exportaban
nueve veces más sOD1.
Después,Malhotraysuequipoutilizaron la ingenieríagenéticaparamodificaralgunoscomponentes
molecularesbásicos(aminoácidos)delaSoD1,centrándoseenunazonadelaproteínaqueesigual
tantoenlalevaduracomoenelserhumano.Descubrieronquesolounasecuenciadedosaminoácidos
erasuficienteparaactuarcomo“sello”paraenviarlaproteínaporlavíadelCUPS.Y,principalmente,que
losmismosdosaminoácidosseencuentrantambiénenlaAcb1,laotraproteínasecretadadeformano
convencional,loqueindicaquepodríaserunaseñaluniversaldelCUPS.
finalmente,afindeobservarsiestamismavíafuncionabaduranteeldesarrollodelaeLA,losinvestiga-
doresanalizaronversionessanasyversionesconeLAdelaSoD1encélulashumanasydescubrieron
quetambiénseexportamediantelavíadelCUPScuandolascélulasestánbajolainanicióndenutrientes.
teniendoencuentatodoello,Malhotraconsideraqueesteproyectopruebaquelascélulasensituación
deinaniciónsecretantantolasversionessanascomolasdefectuosasdeSoD1atravésdelavíadel
CUPSyqueelpequeño“sello”dedosaminoácidosessuficienteparaenviárselas.Perotodavíaquedaun
misterio por resolver.
“Muchasproteínaspresentanelmismopatróndedosaminoácidos;dehecho, esmuycomún”,dice
Malhotra. “todavíatenemosquedescubrircómosedetectanconcretamente laSoD1y lasproteínas
equivalentesycómoseenvíanalCUPS,mientrasquenoocurrelomismoconotrasproteínas”.
Malhotrapiensaque,generalmente,encondicionesnormales,el “sello”dedospiezasseescondeen
las proteínas como la sOD1 y la acb1. pero cuando hay algún cambio -por ejemplo, cuando la proteína
esdefectuosaolacélulapresentainanición,loqueafectaalaformadelasproteínas-,entoncesqueda
expuesta. a continuación, aparecen las chaperonas moleculares para evitar más desarrollo, y en lugar de
esoenvíanlaproteínaalCUPSparaquesalgadelacélula.
la identidad de estas chaperonas y la manera exacta de trasladar proteínas a los CUps actualmente
sedesconocen,peroMalhotraysuequiposeestánocupandodelasunto.enconcreto,lesinteresaen-
contrarloqueprovocalasecreciónperjudicialdeSoD1enlospacientesquepadeceneLAy,sobretodo,
descubrir si pueden pararlo.
Diceque“eldescubrimientodeeste‘sello’noconvencionalqueconducelasecrecióndeSoD1esmuyemo-
cionante”.“Actualmente,noexistentratamientoseficacesparalaeLA,asíqueesperoquenuestrosdescu-
brimientospuedanproporcionarlabaseparaeldesarrollo,enelfuturo,detratamientosmuynecesarios”.
OBRA DE REFERENCIA:
Cruz-GarciaD,Brouwersn,DuranJM,
MoraG,CurwinAJ,MalhotraV.
“A diacidic motif determines unconvention-
al secretion of wild-type and ALS-linked
mutant SOD1.”
JCellBiol,pii:jcb.201704056.doi:
10.1083/jcb.201704056.[epubaheadof
print] (2017).
Resumen ejecutivo 2017 - 27
De acuerdo, ordenadorUnnuevo“ordenadorvirtual”hacequeelanálisisdedatos biológicosseamásfiable.
imaginaqueestásanteunacajaenormequecontienecientosdecalculadorasdiferentes.tomala
primera,teclea“2+2=”yobténlarespuestacorrecta.4.Hazlomismoconotracalculadorayobtén
lamismarespuesta,yasísucesivamente.Sigueprobándolastodasycadavezobtieneselmismo
resultado.Pero,derepente,obtienesunarespuestaquenoesperabas:5.Conuncálculotansencillo
esfácilverquealgonohasalidobien.Sihemosintroducidobienlosdatos,estosignificaqueelproce-
sadorquehaydentrodelamáquinahacometidounerror.
Ahoraimaginaqueestáshaciendoelmismocálculocondiferentesgruposenormesdedatosgenó-
micos,analizandomillonesdebitsde informaciónenunordenador.obtienesunarespuestadeun
superordenadorLinuxenelsótanodeuninstitutodeinvestigación,perounpocodiferentedelaque
haobtenidounservidorbasadoenlanubeyobtienesunatercerasoluciónconunMac.entonces,¿por
quésondiferentesycómosabescuáleslacorrecta?
a daTOS MaSIVOS, PROblEMaS MaSIVOS
Loscientíficosquetrabajanconestetipodedatosmasivosyquebuscanpistasparaprevenirotratar
enfermedadeshumanasoaclararprocesosbiológicosfundamentalesnecesitanrespuestasquesean
fiablesyquesepuedanreproducir.estoesespecialmenteimportanteenlanuevaeradelamedicina
deprecisión,enlaquelosmédicostomandecisionessobreeltratamientoquedeberíarecibirunpa-
cienteenfuncióndelainformacióngenética.
“Labiologíaescadavezmáscomputacional”,diceCedricnotredame,jefedegrupoenelCRG.“Hace
veinteañoseramuycarohacerlasecuenciacióndelADn,asíquehabíamuypocainformación.Mi-
rabaslasecuenciaenuntrozodepapelyloanalizabasamano.Ahoraesmuchomáseconómicoy
rápido.Haymuchosmásdatosyporellotenemosqueutilizarordenadoresparaanalizarlos”.
Perohaydiferentesprogramasqueseejecutanendiferentesordenadoresconsistemasoperativos
diferentes,ynosiempredanlasmismasrespuestasapartirdelosmismosdatos.Ycomohaytantas
28 - Resumen ejecutivo 2017
operaciones y puntos de datos involucrados en estos cálculos a gran escala, es imposible averiguar
quéhasalidomalycómosolucionarlo.Además,dicenotredame,muchagentenisiquierasehadado
cuentadequelallamada“inestabilidadcomputacional”esunproblemaensímisma.
“fuecomounaepifaníacuandonosdimoscuentadequehabíatantainestabilidadcomputacional.
Antes,estonosesabía”,dicenotredame.“esunproblemaporquenosestamosdirigiendohaciauna
épocaenlaquelosmedicamentosylosdiagnósticossebasanendatosgenéticos:elordenadornos
daráunnúmeroynosdiránuestroriesgoconrespectoaunaenfermedadoquémedicamentotomar.
Perotodosebasaenclasificacionesyprobabilidades,porloqueinclusounapequeñavariaciónenel
resultado de los datos podría tener un impacto tremendo en los pacientes”.
algunas empresas de tecnología han intentado resolver este problema de reproducibilidad mediante
lacreacióndecostososcanalesdedatoshechosamedida,quebloqueanalosusuariosenesapla-
taformadesoftwareenconcreto.Peronotredameysuequipooptaronporunenfoquemássencillo.
“Construimosunaplataformadeanálisisconunatécnicallamada‘virtualización’,quecreadeforma
efectivaunordenadorvirtualsimuladoeidénticodentrodecualquiermáquina”,explica.“esexacta-
mentelamismaideaquelosantiguossimuladoresdejuegosdelossalonesrecreativosdelosaños
80quepodemosejecutarenunPC,peroaunaescalamuchomayor”.
este“ordenadordentrodeunordenador”implicaquelosinvestigadorespuedanejecutarcualquiersof-
twaredentrodelentornovirtualyobtenerelmismoresultado,yaquesusdatossiempreseprocesan
delamismaforma,independientementedelamáquinafísicaqueutilicen.
“Somosungrupode investigaciónpequeño,por loquenecesitábamosunasoluciónsencillaque
todospudieranutilizar fácilmente.Ynopodíamos rediseñar todas lasherramientas informáticas
quetenemos.Queríamosseguirutilizandolosprogramasalosqueestamosacostumbrados”,dice
notredame. “nuestra solución es sencilla y rentable porque lo hicimos para solucionar nuestras
propias necesidades”.
NExTflOw al RESCaTE
traslapublicaciónquedescribelanuevaplataformavirtual,conocidacomonextflow,notredamey
suequipodecidieronponerlaalibredisposiciónparaotraspersonas.Milesdeinvestigadoresdescar-
ganelsistemacadamesymuchasorganizacionesdeinvestigaciónlahanadoptado,incluidoselInsti-
tutoPasteurdefrancia,elSangerInstituteenelReinoUnido,laInfraestructuranacionaldeGenómica
de suecia, el Genome institute de singapur y los institutos Nacionales de salud de estados Unidos.
tambiénhasurgidounagrancomunidadenlíneainternacionalparaagruparideasycompartirherra-
mientas,conelapoyodetalleresdecapacitaciónyhackatonescelebradosenelCRG,paraampliarlos
límitesdeloquepuedehacernextflow.
“Meencantaestatecnologíaporqueesútil,perolomásimportanteesquesolucioneproblemas”,dice
notredame,quereflejaeléxitodenextflow.“Lainestabilidadcomputacionalesunproblemagenerali-
zado,peronoteníasoluciónynosepuedecorregir.esmuyemocionantesaberquehemossoluciona-
dounproblemaquelagentetodavíanosabíaniqueexistía,peroquepodríallegaraserenormeahora
queentramosenlaerade‘bigdata’”.
OBRA DE REFERENCIA:
DitommasoP,ChatzouM,flodeneW,
Barja pp, palumbo e, Notredame C.
“Nextflow enables reproducible computa-
tional workflows.”
Nat Biotechnol, 35(4):316-319 (2017).
doi:10.1038/nbt.3820.noabstract
available.
Resumen ejecutivo 2017 - 29
DesempaquetandoelgenomaCadaunadelascélulashumanascontienemásdedosmetrosdeADnenrolladoydensamenteempaquetado;porello,activarlosgenes correctos en el momento correcto es un gran reto.
p rácticamentetodaslascélulasdelcuerpocompartenlasmismasinstruccionesgenéticas,con
alrededorde20.000genescodificadosenlargosfilamentosdeADnllamadoscromosomas.
Peronotodaslascélulassoniguales.Losdistintostiposdecélulasutilizanconjuntosespe-
cíficosdegenesparapoderllevaracabofuncionesconcretasenelcuerpo.Porejemplo,unacélula
hepáticadebeactivargenesquecodifiquenenzimasdigestivasydesactivarlasinstruccionesparala
fabricacióndeneurotransmisores,mientrasqueunacéluladelcerebrotienequehacerlocontrario.
Y,esmás,elADndecadacélulahumanamidemásdedosmetrosdelargo.estáplegado,enrolladoy
metidodentrodelnúcleo,unaestructuramáspequeñaquelacabezadeunalfiler,juntoconunagran
cantidaddeproteínas.Dealgunaforma,enmediodetodoesterevoltijomolecular,lacélulatieneque
encontrar los genes correctos y activarlos en el momento adecuado.
estaorganizacióndelADnenelnúcleosepareceaunovillodelanaenredado.Algunaspartesestán
muycompactadas,mientrasqueenotraselenredoesmáslaxo.encontrarungenespecíficoyacti-
varloescomobuscaruntrozocortoyespecíficodelanaenmediodelcomplicadolío,liberándolode
cualquiercompactaciónyaflojandoelhiloparapoderutilizarlo.
Yasehavistoquelosgenesactivostiendenaestarempaquetadosdeunaformamáslaxaencompartimen-
tos“abiertos”delnúcleoencomparaciónconlosgenesinactivos,perosesabepocosobrecómoseorganizan
estosgenesenesasregionesdiferentesosobrecómocambiasuubicacióncuandoseactivanodesactivan.
entendercómofuncionatodoelloanivelmolecularesunodelosretosmásimportantesdelabiología
yesloquequiereresolverthomasGraf,jefedegruposéniorenelCRG.
haCIa la CUaRTa dIMENSIóN
todocomenzóen2014,cuandoGrafysuscolegasdelCRG,MiguelBeato,GuillaumefilionyMarcA.
Marti-Renom,emprendieronunprocesodecolaboraciónconocidocomo4DGenome(proyectoSyner-
30 - Resumen ejecutivo 2017
gydeleRC),queinvestigadequéformalaorganizacióndelADncambiaamedidaquelosgenesse
activan y se desactivan.
elequiponosolohaesquematizadolaorganizacióndelADnenelnúcleodelascélulas“enreposo”,
sinoquelosinvestigadorestambiénhandesarrolladonuevastécnicasinnovadorasparahacerelcon-
troldeloscambiosqueseproducenenlaestructuratridimensionaldeloscromosomasdelnúcleoa
lolargodeltiempo(lacuartadimensión)mientraslascélulascambiandeuntipoaotro,seatemporal-
menteodeformapermanente.
estetipodetransiciónseobservaeneldesarrollo,mientraslascélulasmadreembrionariasseespe-
cializangradualmenteentejidosespecíficosenelembriónoelfetoendesarrollo.PeroestavezGraf
estabaespecialmenteinteresadoenverquéocurrecuandolascélulasespecializadas“revierten”en
célulasmadreenunprocesoconocidocomo“reprogramación”.
“Yahabíaquienhabíacomparadolaorganizaciónnucleardelascélulasespecializadasylascélulasmadre,
peronosabíandequéformaseproducíanesoscambioseneltiempo”,diceGraf.“nosotrosqueríamos
observaresoscambiosenelmomentoenelqueteníanlugar,ynospreguntábamossilaorganizacióndel
genomacambiaantesodespuésdequelosgenessehayanactivadodurantelareprogramación”.
Pararetrocedereneltiempo,losinvestigadoresdelCRGrecurrieronaunavariacióndeunatécnica
desarrolladaporelcientíficojaponésypremionobelShinyaYamanaka,quiendescubrióqueuncóctel
formadoporcuatroproteínas(oCt4,SoX2,KLf4yMYC)podíarevertirlascélulasespecializadasen
célulasmadre.estasmoléculasextraordinariasson factoresde transcripciónqueseunenasitios
específicosdelADncercadeliniciodegenesespecíficosdecélulasmadreylosactivan,loquerepro-
gramalacélulaylareviertealestadodecélulamadre.
Desafortunadamente,paramuchostiposdecélulaselmétodonoesmuyeficiente.Porejemplo,solo
unapequeñafraccióndeloslinfocitosBsepuedenreprogramarconestosfactoresllamadosYama-
naka.Sinembargo,Grafysuequipodescubrieronquelaadicióndeotraproteínaantesdelosfactores
Yamanaka,conocidacomoC/eBPalpha,hacíaquealmenosun95%deloslinfocitosBvolvierana
convertirseencélulasmadreenelcursodeochodías.
Cogiendomuestrasdeesascélulascadadosdías,losinvestigadorespodíanrecurriralastécnicas4D
parahacerelseguimientodelaorganizacióncambiantedelADnenlosnúcleosdelascélulasmien-
traspasabandelinfocitosBacélulasmadre.
ExPlICaCIóN dE lOS daTOS
Paradescubrirdequéformavuelvenaorganizarselosgenesdentrodelnúcleodelascélulasdurante
lareprogramación,GrafysuequipousaronunmétodollamadoHi-C.estorevelasihayregionesespe-
cíficasdelADnquesetoquenentresíyreflejasielempaquetamientoeslaxoocompacto.
elequipotambiénrecogiódatossobreelestadodealgunosgenes,siestabanactivadosodesacti-
vados,ycategorizólasmarcasmoleculares(conocidascomomodificacionesepigenéticas)quehay
asociadasalosgenesactivosoinactivos.Lamayorpartedeltrabajoprácticofuellevadoacabopor
RalphStadhouders,investigadorposdoctoral,juntoconelbiólogocomputacionalenriqueVidal.
Laclavedeléxitodelproyectofueelnuevosoftware,conocidocomotADbit,creadoporMarti-Renom
ysuequipo.Paraelnúcleo,esalgoparecidoaunGoogleearthqueagrupatodoslosdatosparaesta-
blecerunmapadetalladodecómoseorganizaelADnencualquierpartedelgenoma.
“Lageneracióndedatosesenciertomodotrivial;suanálisiseslapartedifícilyrequieremuchotiempo
ypotenciainformática”,diceMartí-Renom.“estosexperimentosgeneranmillonesdedatosyrequieren
cientosdemilesdehorasdetiempodecomputación,porloqueelnuevosoftwareeraabsolutamente
claveparaautomatizarelanálisisyhacerloaccesible.”
Comoseríadeesperar,losinvestigadoresdescubrieronquelamayorpartedelosgenesquesehabían
activadoamedidaque los linfocitosBseconvertíanencélulasmadrepasaríanacompartimentos
Resumen ejecutivo 2017 - 31
másactivosdelnúcleo.Sorprendentemente,descubrieronqueestoocurrevariosdíasantesdeque
realmente se activen los genes.
“Laideapredominanteeraquelosgenesseactivancuandoseunenafactoresdetranscripción,como
losfactoresdeYamanaka,yluegopasanaunaregiónactivadelnúcleo”,explicaGraf.“Perodescubri-
mosquemuchosgenessedesplazabanprimeroyseactivabandespués,mástarde.esonoeraloque
seesperaba,perofueundescubrimientointeresante”.
VUElTa al INICIO
Grafcreequeestosdescubrimientosrevelanlaexistenciadeunpapelmásimportantedeloquese
creíapreviamentedelaorganizacióncambiantequetienelugarenelnúcleo,asícomounaposiblenue-
vafuncióndelosfactoresdetranscripción.nosoloseunenalADnyenciendenlosgenes,explica,sino
quecreetambiénquetienenunafunciónindependienteypreviaeneldesempaquetadodelgenomay
eldesplazamientodelosgenesalasregionesactivasdelnúcleo.
“encuanto losfactoresdetranscripcióndesenredanelADnyexponen losgenes,entoncesresulta
fácilencenderlos”,diceGraf. “Ahora,sinembargo, lasgrandespreguntasson:¿cómolohacen,con
quiéntrabajanycuáleselmotorqueimpulsalareorganización?”
Grafyloscompañerosdelequipo4DGenomequierensaberahoracuálessonlasmoléculasquetra-
bajanjuntoconlosfactoresdetranscripciónparadescifrarelADnyreconfigurarlo.Ytambiénquieren
probar y manipular estas interacciones, sea alterando el aDN o bien cambiando las proteínas, para
analizarlasrelacionesexactasentreloscambios4Dquevenenelnúcleoylospatronesresultantes
delaactividadgenética.
“Aprendemoslosprincipiosquerigenlasdecisionesdelascélulassobresudestinoyloquevemosen
nuestrosistemadereprogramaciónesunmodelodelosprocesosquetienenlugarenunembrión”,
diceGraf.“notengoesperaparasaberquépasadurantelosprimerosdíasdevida,cuandonacenlas
primerascélulasmadrepluripotentes”.
OBRA DE REFERENCIA:
RalphStadhouders,enriqueVidal,
françoisSerra,BrunoDiStefano,
françoisLeDily,JavierQuilez,Antonio
Gomez,SamuelCollombet,ClaraBeren-
guer,YasminaCuartero,JochenHecht,
GuillaumeJ.filion,MiguelBeato,Marc
A.Marti-Renom&thomasGraf
“Transcription factors orchestrate dynamic
interplay between genome topology and
gene regulation during cell reprogramming”
Nature Genetics, 50:238–249 (2018),
doi:10.1038/s41588-017-0030-7
32 - Resumen ejecutivo 2017
bIOINfORMáTICa y gENóMICaLoshitoscientíficosdelprogramadurante2017incluyeneldesarrollodelametodologíaCaptureLong
Seq(CLS)paracaracterizardeformaexhaustivaladiversidaddetranscripcionesdelARnlargonocodi-
ficante;eldesarrollodenextflow,unlenguajededominioespecíficoquepermiteflujosdetrabajocientí-
ficosreproduciblesyescalablesusandocontenedoresdesoftware;eldescubrimientodeunciclosexual
yunaasociaciónrecienteconelhuéspedhumanoenelpatógenofúngicoemergenteCandida glabrata
y el algoritmo Global score para predecir las interacciones de proteínas con grandes transcripciones.
varios grupos del programa participan en diversos proyectos genómicos de gran escala, tales como
enCoDe,Gtex,PanCancer, I5K,f1K,WebofLifee IASIS(primeraayudaenCataluñapara lamedicina
personalizada).
el programa ha seguido usando el european Genome-phenome archive (eGa) y prestándole apoyo en
colaboraciónconeleuropeanBioinformaticsInstitute(eBI).eleGAhasidoseleccionadocomoeLIXIR
CoreDataResourceycomoeLIXIRRecommendedDepositionDatabase.Asimismo, tambiénhasido
seleccionadocomounodelosproyectosdeimpulsodelaGlobalAllianceforGenomicsandHealth(GA-
4GH).LaeGAestambiénunodelosorganismospilotodedemostracióndelaeuropeanopenScience
Cloud (eOsC).
InvestigacionyServiciosCientíficoselamplioabanicodetemáticas,enfoquesytecnologíasenelCRGpermiteabordarunamplioespectrodeaspectosfundamentalesen ciencias de la vida y biomedicina. la investigación en el CRG se organizaencuatroáreasprincipales:regulacióngénica,célulasmadreycáncer;biologíacelularydeldesarrollo;bioinformáticaygenómica;y biología de sistemas. Desde el 1 de julio de 2015, el Centro Nacional deAnálisisGenómico(CnAG-CRG)formapartedeestaestructuradeinvestigación.
Roderic GuigóCoordinador
Resumen ejecutivo 2017 - 33
VivekMalhotraCoordinador
JuanValcárcelCoordinador
bIOlOgía CElUlaR y dEl dESaRROllO en2017,ellaboratoriodeMalhotradescubrióelmotivodiacídiconecesarioparalasecrecióndesuperóxidodismu-tasa(SoD)1,quesesegregasinlavíaendoplasmáticaconvencionalretículo-Golgideexportacióndeproteínas.Lamodulación de esta secuencia podría ayudar a comprender la neurotoxicidad asociada a la sOD1 mutante en la esclerosislateralamiotrófica.estelaboratoriotambiéndescubrióqueunaproteínallamadatAnGo1,requeridaparala exportación de colágenos voluminosos, encaja en un anillo en los lugares de salida del Re, compartimentando asíelReenregionesespecíficasparaeldesarrolloylaexportacióndecolágenosvoluminososdelrestodelRe.otrodescubrimientodeinterésconsiderableeslademostracióndelafuncióndelaesfingomielinaalahoradeorganizarlaformaylafuncióndelasmembranasdeGolgi.ellaboratoriodeIsabelleVernossiguióinspeccionandoelmecanis-modeladinámicadelhusomitóticoydescubrióunnuevosociomitóticodeunmotorespecíficodelakinesinaysufunciónenlaalineacióndemicrotúbulosycromosomas.SebastianMaurerlogróreconstituirlamigracióndeARnenlos microtúbulos in vitro. este descubrimiento tan crucial es el primero de este tipo y supone un avance esencial para entenderelmecanismodeltransportedecargadependientedekinesinaenlosmicrotúbulos.ManuelMendozades-cubrióunnuevomecanismodeprogresióndelciclocelularatravésdeladivisiónasimétrica.ellaboratoriodeJeromesolon proporcionó una primera descripción de las modulaciones evolutivas en el proceso de sellado epitelial entre diferentesespeciesdemoscas.Suequipoencontróunatransiciónevolutivaquecondujoaunasimplificacióndelprocesodeselladoenelcierredorsaleidentificóunafunciónesencialconservadadelcitoesqueletodemicrotúbulosenelselladoepitelial.estosresultadosevidencianelinterésgeneraldeestedepartamentocuandosetratadeabor-darlosmecanismossubyacentesalacompartimentacióncelular,ladivisióncelularylaorganizacióndelostejidos.
elaño2017fuetestigodelasalidadeunjefedelgrupojúnior,ManuelMendoza,quesetrasladócomojefedegrupoalInstitutodeGenéticayBiologíaMolecularyCelular-IGBMC(estrasburgo,francia).DurantesutiempoenelCRG,ellaboratoriodeManuelMendozarevelóunfascinantemecanismodemodulacióndeloscomplejosdelosporosnuclearesduranteladivisióncelularylafuncióndeesteprocesoenelcontroldelaprogresióndelciclocelulardiferencialencélulasmadreehija.Sushallazgostambiénrevelaronunaconexióndesafiantedeexocitosisyabscisión,yelmecanismoporelquelascélulascontrolanlaabscisiónparaasegurarlasegregacióncromosómi-canormal.estamosorgullososdeloslogrosdeManuelyledeseamosunéxitocontinuadoensunuevotrabajoenfrancia.echaremosdemenosdeverdadsucompañerismo,sugenerosidadysusdebatesacadémicos.
finalmente,damoslabienvenidaadosnuevasjefasdelgrupo.elvanBokeseunióaldepartamentocomojefade grupo junior. está liderando el laboratorio de Biología de los Ovocitos y latencia Celular. Durante su posdoc enHarvard,elvandescubrióquelosovocitosagrupabanysegregabanmRnA,mitocondrias,Re,Golgi,endo-somas y los lisosomas, por una gran proteína desordenada, denominada xvelo. la creación mediada por la xvelo de este megasubcompartimento llamado “cuerpo de Balbiani” es un avance importante y puede ser una gran promesa para comprender los principios básicos del desarrollo de los ovocitos y el proceso general de fertilización.LosdescubrimientosyobjetivosprincipalesdeBokeestánreconocidosporlaconcesióndeunaayudaStartingGrantdeleRC.VerenaRuprechtfuecontratadatrassubrillanteinvestigaciónenIStdeAustria.Como posdoc en el isT, verena descubrió cómo la actividad contráctil cortical lleva a una rápida motilidad celu-lar ameboide. este proceso de migración ameboide se ve en numerosas metástasis del desarrollo y de cáncer, pero el mecanismo no está claro. los descubrimientos de verena abrieron un capítulo nuevo en la migración celularyhanpermitidoquepuedahacerseunanálisismoleculardeesteprocesodeimportanciafundamental.LaexperienciadeVerenaenfísicaeimagineríaaportanuevosenfoquesparaabordarlamigracióncelularyesperamosquetambiénparamuchosnuevosdescubrimientos.
REgUlaCIóN géNICa, CélUlaS MadRE y CáNCER entre los hitos más destacados de la investigación en este programa durante 2017, se han producido im-portantes avances en el rol de la disposición tridimensional de la cromatina en la regulación de la expresión genética.Losmiembrosdelproyecto4DGenomeSynergydeleRCinformarondelosrolesfundamentalesdelcontextogenómicolocalenlalatenciadelvirusVIH,delaexpresióndelosgenesencélulasdeDrosophilaydequéinfluenciatienelatopologíagenómicaenlaactividaddelosfactoresdetranscripcióndurantelarepro-gramación celular y viceversa. el trabajo adicional de otros grupos del programa ha desvelado redes transcrip-cionalesconpapelesclaveenlaregulacióndelaidentidaddecélulasmadreembrionarias,reprogramacióncelularyregeneraciónorgánicaporfusióncelular.estosprocesostambiénseestáncaracterizandoconelusodemicroscopíadesuperresolución,conelapoyodelasayudasfet.tambiénseavanzóenlacomprensióndelosmecanismosmolecularesdefármacosantitumoralesdirigidosalmecanismodeempalmeyenlosesfuer-zosparadesarrollarnuevosmoduladoresendichosprocesos,conelapoyodelasayudasdeCaixaImpulseyeRC-PoC.Porúltimo,elgrupodeBernhardPayerhainiciadounacolaboraciónconlaclínicadefertilidadeugin,junto con el CNaG-CRG, para explorar la base molecular del envejecimiento de ovocitos humanos.
34 - Resumen ejecutivo 2017
bIOlOgía dE SISTEMaS en2017sefuerondosdenuestrosjefesdegrupo.MatthieuLouis,jefedegrupojúnior,setrasladóa
laUniversidaddeCalifornia,enSantaBárbara,yJamesSharpe,jefedegruposénior,seconvirtióenel
primerdirectordeleMBLBarcelona.DuranteeltiempoquepasaronenelCRG,ellaboratoriodeMatthieu
Louis llevóacabounauténtico tour de force en el desarrollo de tecnología para implantar las larvas
de Drosophilacomosistemaprincipalenelqueestudiarcualitativamente lapercepciónsensorialyel
comportamientoanimal.el laboratoriodescubriónuevoscomportamientos,desarrollómétodospara
estudiarlos,elucidóeldiagramadeinstalacióneléctricadelsistemaolfativodelaslarvas,estudiósuevo-
lucióny,medianteelusodeunrastreadoroptogenéticodebuclecerrado,desarrollóyprobóunmodelo
multinivelparasabercómointegraelanimallasseñalesolfativasdinámicas.
ellaboratoriodeJamesSharpehaformadopartedelprogramadesdeelcomienzo,en2006,yJames,
quefuesucoordinadordesde2011hasta2017,contribuyóenormementealprogresodelprogramayal
estilodelacienciaquedesempeñamos.ellogromásimportantedellaboratoriomientrasestabaenel
CRGfuelademostracióndequeelmecanismoqueespecificalosdedosdelosmamíferosesunsistema
de Turing molecular. Tras este gran logro hay un desarrollo tecnológico enorme, y el laboratorio continuó
desarrollandomicroscopiosyestrategiasdemodeladodurantetodoeltiempoqueformópartedelCRG.
tambiénpublicaronuncorpusdetrabajofascinantequeexplorabaelespaciodediseñoderedesgené-
ticasdinámicasy,encolaboraciónconMarkIsalan,exmiembrodelprograma,crearonvariosdeestos
modelosderedesenbacterias.esciertoquetenemoscincodedos,pero¡resultaquehayseismecanis-
mosparaquetresgenesinterpretenungradientemorfogenéticoparacrearunafranja!noshacemucha
ilusiónqueSharpedirijaeleMBLBarcelona.elinstitutosecentraráenlabiologíadelostejidosydelos
órganos,eincorporará6o7laboratoriosdebiologíadesistemasenelPRBB,quedaránlugaralacrea-
ción de una incomparable concentración de laboratorios de biología cuantitativa e integrativa en europa.
estamos muy orgullosos de los logros de los laboratorios de louis y sharpe: la suya es exactamente la cla-
sedecienciacuantitativaoriginal,ambiciosa,difícilyalargoplazoquepretendemosdesarrollarennuestro
programa.Lesdeseamossuerteensusnuevosdestinosyesperamosquesuslaboratorioshagangrandes
cosasdurantemuchosaños.echaremosdemenossuvisióncientífica,suamistadysuapoyo.
2017 ha sido un año muy productivo para el programa. el laboratorio de Ben lehner publicó el descu-
brimientodeunamemoriaepigenéticadelmedioambienteduraderaytransgeneracionalasociadaala
cromatina en C. elegans,asícomoeldescubrimientodequelaedadmaternaesunfactormuyimpor-
tantedevariaciónfenotípicaenestasespecies.estosdosestudiosprolonganelinterésquesiempreha
tenidoellaboratorioparaentenderlascausasdelavariaciónfenotípicaentreindividuosgenéticamente
idénticos.ellaboratoriotambiénmostróquelasfirmasmutacionalesenclústerenmásde1.000tumo-
reshumanossepuedenutilizarparaidentificarlosmecanismosmolecularesquecausanmutaciones,
entrelosqueestáeldescubrimientodeunnuevoprocesomutacionalquedirigelasmutacionespara
activar genes en tumores asociados con la exposición a carcinógenos, entre ellos el consumo de alcohol.
el laboratorio de luis serrano siguió desarrollando el Mycoplasma pneumonia como“chasisterapéutico”.
tambiénpublicaronlaestructuradelcromosomaMycoplasmaaunaresoluciónde10kByusaronmuta-
génesisaleatoriasysecuenciaciónprofundaparadeterminarsecuenciasclavederegionespromotoras
ynotranscritasqueinfluyenenlaeficaciadetranscripciónytraducciónenestabacteria.ellaboratorio
deMaraDierssenprosiguiólostrabajosparacomprenderloscambiosenlaarquitecturaneuronalyen
laconectividadqueinterrumpenlafuncióncorticalehipocámpicaenlostrastornosgenéticos.también
señalaronquelainfusióndeneurotrofina-3rescataeldéficitdeextincióndelmiedoenunmodelodera-
tóndemiedopatológico.ellaboratoriodeManuelIrimiahapublicadolabasededatosmásexhaustiva
deactosdeempalmealternativosaparecidahastaahora.elmismolaboratorioaclaró,también,elpapel
ylaevolucióndelosprogramasdeempalmedependientesdeesrpenlamorfogénesis.Además,carac-
terizandomolecularmenteeldesarrollodeltuboneuraldelosanfioxos,presentaronunnuevomodelo
importanteparalaorganizaciónylaevolucióndelcerebrodelosvertebrados.
Comoreconocimientodesuslogros,ManuelIrimiafueelegidojoveninvestigadordeeMBo,BenLehner
fueelegidomiembrodeeMBoyMaraDierssen recibió lamedallaBigVangyelpremiotrifermedal
impacto social en salud.
Ben lehnerCoordinadorenfunciones
Resumen ejecutivo 2017 - 35
finalmente,nickStroustrupseincorporóalprogramacomojefedegrupojúnior.ellaboratoriodediná-
micadelossistemasvivosdeStroustrupdesarrollarámétodosexperimentalesycomputacionalespara
caracterizardónde,cuándoyporquétienelugarelenvejecimientoydequémanerapodríamosintervenir
eficazmenteensuprogresión.MientrasestuvoenHarvard,Stroustrupdesarrollabala‘MáquinaLifes-
pan’,quepermitequelosinvestigadoresrastreendecenasdemilesdenematodosalolargodetodala
vida,ylautilizóparadescubrirunaleypotencialuniversalsobrelamaneraenlaquelasintervenciones
alteranlaesperanzadevida.nickStroustrupmantienelastradicionesdelprogramadeacogergrupos
conunaperspectivadeingenieríaygruposqueencaranunapreguntabienformuladadesdeunapers-
pectivamuyoriginal(ortogonal).¡Bienvenido,nick!
SERVICIOS CIENTIfICO-TéCNICOSLosServiciosCientífico-técnicosestánformadoactualmenteporsieteunidades:Genómica,Proteómica,Mi-
croscopia Óptica Avanzada, Cribado Biomolecular y tecnología de Proteínas, Citometría de flujo (fACS),
BioinformáticaeIngenieríadetejidos.elprogramaincluyeasimismoelServiciodeHistologíaylaUnidadde
AlmacenamientoyComputación,alosquesolopuedenaccederlosusuariosdelPRBBylosusuariosinternos,
respectivamente.
Todas estas unidades trabajan para implementar nuevas tecnologías y aplicaciones como respuesta tanto
alasnecesidadesdelosusuarioscomoalasfuturasorientacionesensusrespectivoscampos.Lasnuevas
tecnologías más destacables creadas en 2017 incluyen:
• Aislamientodevirusúnicoporcitometríadeflujo(paralagenómicadeunvirusúnicoyelestudiodela
virosferamarina)
• Identificaciónyaislamientodevesículasextracelularesporcitometríadeflujoparaelestudiodelacargade
las vesículas
• Generacióndeepiteliomucociliarpseudoestratificadoapartirdeepiteliobronquialhumanonormalyepite-
liopigmentadoderetinaapartirdecélulasembrionariashumanas
• origenycultivodelosorganoidesintestinales
• nuevoflujodetrabajoparaelesclarecimientodeloscomplejosproteicosylascaracterísticasestructurales
queutilizanretículosquímicos
• Protocoloparalacorreccióndeerroresdelecturadesecuenciacionesparapermitirunaaltasensibilidadde
la detección de mutaciones.
• ProtocolodedisminucióndeglobinaapartirdemuestrasdeARnensangreduranteunapreparaciónnor-
mal de la biblioteca de aRNm
• Implementacióndelamayoríadeloscircuitosdebioinformáticaestándaresanextflow
Parapreverlasnecesidadesfuturasdelainvestigaciónencienciasdelavida,tambiénestamostrabajando
para una mayor integración de las instalaciones mediante la implementación de nuevas metodologías de
servicioscruzadosquerequierenlacolaboracióndevariasunidades.enparticular,estamostrabajandoen
ingenieríagenómicaconCRISPR/Cas9directamenteenembriones,descifrandoelproteomadelasvesículas
extracelularesogenerandounconjuntocompletodeenzimasproducidasinternamenteparalapreparación
de la biblioteca del NGs.
Además,centramosnuestrosesfuerzosenlacolaboraciónconlaindustriaparalaexploracióntecnológica.
en2017realizamoslapruebadeaplicacióndelúltimoobjetivoSteDdeLeicayorganizamosvarioseventos
de exploración para evaluar las últimas tecnologías del mercado.
las instalaciones básicas del CRG no solo están bien establecidas a nivel local, con usuarios procedentes de
diferentesinstitucionesespañolas,sinoquecuentatambiénconsocios reconocidos en iniciativas europeas.
LaunidaddeMicroscopiaópticaavanzadaformapartedelainiciativaeuroBioimaging(euBI)deleSfRIysu
jefe,timoZimmerman,escoordinadornacionaldetécnicasdeimagenbiológica.LasunidadesdeGenómica
yProteómicasonmiembrosdelMeRIL,elconsorciodeinfraestructurasdeinvestigacióneuropeas,quein-
cluye instalaciones relevantes a nivel internacional (el CRG es la única instalación de proteómica en españa).
Los Servicios Científico-técnicos son miembros de la Core facilities excellence Alliance “CoreForLife”
(www.coreforlife.eu),talcomosedescribeenlasección“Dimensiónnacionaleinternacional”.
MònicaMoralesJefa
36 - Resumen ejecutivo 2017
CNag-CRgen 2017, el CNaG-CRG ha consolidado aún más su posición. la integración de la Unidad de Genómica
delCRGnoshapermitidoreorganizarlasactividadesyelinstrumental.Así,elCnAG-CRGsecentrará
enlasaplicacionesdegrancalidadyaltoredimiento,mientrasquelaUnidaddeGenómicadelCRGse
centramásenaplicacionestalescomolasecuenciacióndemicroARnyChIP.Juntoshemosseguido
nuestrahojaderutaestratégicaparaprestarelmejorapoyoposibleanuestroscolaboradorespara
sus proyectos de investigación. Continúan siendo de especial atención las áreas de investigación en
tornoalpaciente,comoen loscasosdeenfermedades rarasycáncer.Desdeelpuntodevistade
las aplicaciones, hemos ampliado nuestra experiencia en el análisis unicelular, la epigenómica, las
técnicastraslacionalesylaintegracióndelainformacióndemográfica.Hemosdesarrolladoaúnmás
nuestrascapacidadesanalíticasavanzadas.
esteañohasidotestigodegrandes logros.nuestrosistemadecalidad,quefuncionaconformea la
normaISo17024:2005enelámbitodelanálisisdeADn/ARnmediantelasecuenciaciónmasiva(nGS)
ylacertificaciónISo9001:2015emitidaporlaentidadnacionaldeAcreditaciónespañola(enAC),ha
superadolaspruebasdereacreditaciónyrecertificacióndeformabrillante.Además,despuésdeunpro-
gramadeformaciónriguroso,elCnAG-CRGsehaconvertidoenelprimercentroeuropeoqueobtieneel
programadePrestadordeServicioscertificadodeRocheparaSeqCapeZtargetenrichmentSystems.
estamosañadiendonuevasacreditacionesquefacilitaránlacolaboraciónconlosserviciosclínicos,con-
cretamentepensandoenlamedicinapersonalizada.
en2017incorporamosunsegundoHiSeq4000deIlluminayretiramosalgunosdelosinstrumentosde
secuenciaciónmásviejosquehabíanllegadoalfindesuvidaútil.Sehaninvertidomuchosesfuerzos
enlaresolucióndeproblemastécnicosinherentesalosinstrumentosdesecuenciaciónmásnuevosde
Illumina,quefuncionanconceldasdeflujomoldeadas.Sehaincluidounamodificacióninnovadoraen
losprotocolosdesecuenciaciónquepermitegestionaresteproblema.en lossecuenciadoresoxford
nanoporehemosaplicadounasecuenciacióndirectadelARnqueabrealgunasvíasinteresantespara
proyectosdeinvestigación.Lossecuenciadoresoxfordnanoporesehanconvertidoenuninstrumento
muyfiableeimportanteenlosproyectosdemontajedenovo.
LaplataformaRD-ConnectGenome-PhenomeAnalysisPlatform(GPAP),creadaenCnAG-CRG,seha
puesto a disposición de los investigadores del european international Rare Disease Research Consor-
tium.Yadisponedemásde400usuariosysehautilizadoenmuchosproyectosdeinvestigaciónsobre
enfermedadesraras.ResultóesencialparalaconvocatoriadelosBBMRI-LPC,enlaquesesecuencia-
ron900exomas.enlaRD-ConnectGPAPseanalizarondatosysetransfirieronmuestrasbiológicasal
eurobiobank.AunqueRD-Connectestállegandoasufin,elCnAG-CRGestáreforzandosufunciónenel
ámbitodelasenfermedadesrarasconproyectosinminentestalescomoSolve-RD.en2017,másdela
mitaddelasmuestrasdepacientesanalizadaspropiciaronidentificacionesdegenesdeenfermedades.
elequipodeGenómicaUnicelularhadescubiertounamaneradecriopreservarmuestrasbiológicassin
comprometerlosperfilesdeexpresióngenéticacomparándolosconlasmuestrasacabadasdeprocesar
anivelunicelular.Unresultadoquehasupuestounpuntodeinflexiónporqueelusodelacriopreserva-
cióninfluyeradicalmenteenlaaccesibilidadalasmuestras.Además,elequipoparticipaactivamenteen
elproyectoHumanCellAtlas,quepretendeconstruirunacoleccióndemapasquedescribiránydefinirán
labasecelulardelasaludylaenfermedad.
Lamedicinapersonalizadayacasiestáaquíyelanálisisdelgenomaeslaherramientaprincipalporque
proporciona una resolución sin precedentes para el diagnóstico de los pacientes. en 2017 se iniciaron
nAGen1000,unproyectopilotorealizadoconnavarrabiomedyfinanciadoporelServicionavarrode
Salud-osasunbidea,ydosproyectospilotos(MedPerCanyURDCat)llevadosacabojuntocondiferentes
hospitalesdeBarcelonayfinanciadosporelPeRISdelDepartamentodeSaluddelaGeneralitatdeCata-
luña.estosproyectospretendenintroducirelanálisisgenómicoenlaprácticaclínicaparaelbeneficioin-
mediatodelospacientes.Pensandoenelfuturo,resultaclaroqueelCnAG-CRGdesarrollaráunafunción
claveenlaimplementacióndelamedicinapersonalizadaenlaatenciónsanitaria.nuestraplataforma
desecuenciación,lasofisticaciónenelanálisisdedatosybasesdedatosparaquelosdatosgenómicos
seanmásfácilesdeutilizarnossitúanenunaposiciónprivilegiadaparaapoyarestatareamonumental.
ivo GutDirector
Resumen ejecutivo 2017 - 37
aRChIVO EUROPEO dE gENOMaS y fENOMaS (Ega)eGAesunservicioparaelarchivopermanenteyparacompartirtodotipodedatosgenéticosyfenotípicos
personalmente identificablesresultadodeproyectosde investigaciónbiomédica.Losdatosrecogidosen
eGAprocedendepersonaselacuerdodeconsentimientodelascualesautorizasupublicaciónsóloparaun
usoespecíficoeninvestigaciónoparaelusodeinvestigadores‘bonafide’.estrictosprotocolosdeterminan
cómolainformaciónsegestiona,sealmacenaysedistribuyeporpartedeeGA.
Desdesulanzamiento,investigadoresdetodoelmundohandepositadoyaccedidoalosdatosdemásde
1.000estudiosdediferentetipoeneGA.estosestudiosvandesdeexperimentosdegenotipaciónagranescala
basados en “arrays” sobre miles de muestras en estudios de diseño de casos y controles o estudios de pobla-
ción, a estudios basados en la secuenciación diseñados para comprender cambios en el genoma, el transcrip-
tomaoelepigenoma,tantoentejidosnormalescomoendiversasenfermedades,porejemplo,elcáncer.Como
resultado, eGa ha pasado de tener un volumen de datos de unos 50 TB a 3.500 TB durante los últimos 5 años.
elequipodeeGAestáimplicadoendiversasiniciativasyproyectos,comosongarantizarelalmacenamiento
yladistribucióndedatoshumanospersonales;analizarlasrelacionesentregenomasyfenomas;ymedicina
evolutiva.Alavez,eGAeselproyectodirectordelaGlobalAllianceforGenomicsandHealth(GA4GH);esel
RecursoCentraldeDatosenelmarcodelproyectoeLIXIR,deimportanciafundamentalparalacomunidadde
lascienciasdelasaludylapreservaciónalargoplazodedatosbiológicos;ademásdejugarunpapelrelevante
en los proyectos exCeleRaTe (H2020).
JordiRamblaJefeenfunciones
investigadores eRC en el CRG
Roderic Guigó
MiguelBeato
Ben lehner
fyodor Kondrashov
Juanvalcárcel
Toni Gabaldón
Toni Gabaldón
luis serrano
Guillaume filion
Gian Gaetano Tartaglia elvanBoke
thomasGraf
ManuelMendozaManuelIrimia
JamesSharpe
Marc Marti-Renom (CNaG-CRG)
STaRTINg gRaNTS
adVaNCEd gRaNTS
SyNERgy gRaNT
CONSOlIdaTOR gRaNTS
38 - Resumen ejecutivo 2017
(*) Nota: los datos globales incluyen los datos del CNag-CRg. El CNag-CRg forma parte del CRg desde el 1 de julio de 2015.
Datosycifras*
Resumen ejecutivo 2017 - 39
publicaciones
financiación(M€)
proyectos
publicaciones Totales
proyectos y Redes activos Totales
ayudas postdoctorales activas Totales
proyectos europeos Coordinados activos
Totales
presupuesto Total
financiación externa concedida en 2017
CRG
son proyectos eRC activos (16beneficiarioseRC)
son otros proyectos de investigación y redes H2020 activos
son proyectos europeos coordinados activos
son proyectos de investigación internacionales activos (no Ce)
CNaG
publicaciones en acceso abierto
publicaciones 1er Cuartil MediafactordeImpacto
225
124 19
7
42,6
34,4
12
18
7
11
8,2
70% 89% 8,8
Nota: Este gráfico incluye los fondos competitivos conseguidos durante 2017 y pendientes de resolución final o del convenio de la ayuda a 31/12/2017.
Pública-Nacional: 40% - 9,3
Pública-Europa: 27% - 6,3
Ventas Externas: 23% - 5,3
Privada-Filantrópica y Patrocinios: 3% - 0,6
Pública-Regional: 5% - 1,1
Pública-Internacional: 2% - 0,4
Privada Transferencia de Tecnología: 1% - 0,3
Total23,3
40 - Resumen ejecutivo 2017
personal
Total
PERSONal TOTal
INTERNaCIONalIdad
498* * EJC, equivalente jornada
completa: 482
a 31 de diciembre de 2017
Total
nacionalidades representadas
Jefes/asdeGrupo+ Jefes/asdeUnidad
estudiantes de Doctorado
Investigadores/asPostdoctorales Total personal de investigación
Total Total Total
PROgRaMaS dE INVESTIgaCIóN
SERVICIOS CIENTífICO-TéCNICOS
adMINISTRaCIóN y SOPORTE CIENTífICO
gRUPOS dE INVESTIgaCIóN
CRG
CRG CNaG-CRG
CRG CRG CRG
CNaG-CRG CNaG-CRG CNaG-CRG CNaG-CRG
324
41
60% 50%
70% 60%
98 76 28296
419 79
51 72 26
28 47 4 2
Categorías de investigación edad
Staff Scientists 3%
Investigadores/as Postdoc. 41%
Jefes/as de Grupo 11%
Jefes/as de Unidad 5%
Estudiantes de doctorado 40%
>50 años 20 (4%)
40-50 años 111 (22%)
30-40 años 263 (53%)
<30 años 104 (21%)
Resumen ejecutivo 2017 - 41
Género
Jefas de grupo Jefas de Unidad Staff Scientists Investigadoras Postdoctorales
Estudiantes de doctorado
36%
SOlICITaNTES EN PROCESOS dE SElECCIóN
MUJERES PONENTES INVITadaS
CaNdIdaToS/aS SElECCIoNadoS/daS EN PROCESOS dE SElECCIóN
MUJERES POR CaTEgORíaS PROfESIONalES
Mujeres MujeresHombres Hombres
947 34965 2949,5% 54%50,5% 46% Una mejora de casi el 4%
comparado con 2016
eventos
Simposios/CongresosInternacionales seminarios de alto Nivel
10 151
29% 29% 57% 46% 52%
42 - Resumen ejecutivo 2017
Desarrollo de tecnología y negocio
nuevastecnologíasidentificadasenproceso de evaluación
acuerdos firmados con empresas e inversores en 2017
proyectos Gestionados enProcesodeValorización
Spin-offs (Microomics)
priority pCT National phases
30
34 7 1
2 1 3PaTENTES
formaciónAvanzada
Tesis CURsOs CieNTÍfiCOs
COURses@CRG CURsOs De iNNOvaCiÓNCoMPetenCIAS TRaNsfeRiBles Y DesaRROllO
pROfesiONal
Tesis Doctorales leídas Cursos internos Cursos externos participantes
Cursos internacionales
Cursos
Cursos internos
Participantes* participantes
participantes
23 11 5 300
7 2 11
147 22276
*32 paises diferentes
Resumen ejecutivo 2017 - 43
Relaciones con los medios
Redes sociales
divulgación y educación científicas
Comunicación,divulgaciónyeducacióncientíficas
AparicionesenMedios
Actividadesorganizadas (en 39 categorías de actividadesdiferentes)
PúblicoBeneficiariototal
escuelas y estudiantes
público General
@CRGenomica CRG‘Megusta’enlapágina Visualizaciones Canal
@cnag_eu CNaG-CRG
escritos Online Blogs
Radio Tv
2.567
237 13.807
9.176
4.631
8.761 3.0253.299 142.535
1.653 1.393
272 1.985 276
19 15
SEgUIdORES TwITTER SEgUIdORES lINkEdIN faCEbOOk yOUTUbE
44 - Resumen ejecutivo 2017
Informefinanciero
Resumen ejecutivo 2017 - 45
Origen y Destinación de los Recursos Operativos Gestionados
ORIgEN RECURSOS OPERaTIVOS EN MIllONES dE EUROS
dESTINaCIóN RECURSOS OPERaTIVOS EN MIllONES dE EUROS
0,12Ingresos financieros
0,3%
17,4financiación Externa
44%17,1
financiación basal
43%
5,3Servicios
13%
ORIgEN RECURSOS OPERaTIVOS
39,9
1,3Otros
3%
30,6Investigación y Servicios Científico-técnicos
77%
3,4administración
9%4,6
alquiler y Mantenimiento Infraestructura
11% dESTINaCIóN RECURSOS OPERaTVOS
39,9
46 - Resumen ejecutivo 2017
agradecimientos
Resumen ejecutivo 2017 - 47
patrones
financiadores públicos
financiadores privados
ObRa SOCIal “la CaIxa”la fundación Bancaria “la Caixa” da apoyo a varias iniciativas clave en el CRG, tales como el programa inter-
nacionaldeDoctoradodesde2008yotrasactividadescientíficasydedivulgacióndesde2014:laasociación
entreelCRGyeleuropeanBioinformaticsInstitute(eMBL-eBI)paragestionarconjuntamenteeleuropean
Genome-phenome archive (eGa), y la primera iniciativa de ciencia ciudadana del CRG ‘saca la lengua’. en la
primeramitadde2016,lafundacióndecidiófinanciargenerosamentelasegundaediciónde‘SacalaLengua’,
queempezóenoctubrede2016.Duranteel2017,elproyectoorganizóelsegundo‘tour’anivelespañol,abor-
dandonuevosretos,alcanzandonuevospúblicosobjetivoyrecogiendomuestrasdecolectivosdiferentesy
pacientesdediversasenfermedades.
elapoyodenuestrospatrones,yfinanciadorespúblicosyprivadosesclaveparalograrlamisióndelCRG,decaraadescubriryhaceravanzarelconocimientoenbeneficiodelasociedad,lasaludpúblicaylaprosperidad económica.
Nota: los fondos FEdER y FSE han sido instrumentales en los últimos años a través de diferentes esquemas de financiación y en una variedad de actividades en apoyo a nuestra investigación y para mantener nuestras infraestructuras en la vanguardia de la técnica. Para más detalles sobre los proyectos co-financiados con estos fondos, ver la sección ERdF aNd ESF FUNdS aT THE CRG (http://www.crg.eu/en/content/erdf-and-esf-funds-crg) en la web del CRG.
48 - Resumen ejecutivo 2017
fUNdaCIóN bOTíNLafundaciónBotín,atravésdesuáreadeciencia,yencolaboraciónconlaoficinadeDesarrollodenegocio
ytecnologíadelCRG,promuevelatransferenciaalmercadodelosresultadosdelainvestigaciónproducida
enloslaboratoriosdelDr.JuanValcárcel(hasta2016)yelDr.LuisSerrano(2007-2013)almercado.Loconsi-
guenproporcionandorecursoseconómicosydegestiónparaidentificarprometedorasideasyresultadosen
unaetapainicial,evaluandoelpotencialylamejorformadeprotegerlosatravésdelosderechosdepropiedad
intelectual e industrial, y buscando al mismo tiempo los socios tecnológicos e industriales, o los inversores,
parafacilitarlaentradadelastecnologíasolosproductosalmercadoparaelbeneficiofinaldelasociedad.
fUNdaCIóN RaMóN aRECESLafundaciónRamónArecesofreciófinanciacióndetresañosparaun/ajoveninvestigador/apostdoctoralde
gran talento para hacer ciencia en el CRG. la investigadora postdoctoral seleccionada en una convocatoria
competitivafueXianghuaLi,quetrabajóenellaboratoriodelDr.BenLehnerhastaelprimertrimestrede2017.
fUNdaCIó CaTalUNya-la PEdRERaLafundaciónCataluña-LaPedreraapoyalasactividadesdeformaciónprofesionalparalosestudiantes
jóvenesycontalentoconelfindefomentarsuinterésporlacienciayemprenderunacarreracientífica.
LasactividadesprincipalesincluyenestanciasdeveranocientíficasenMónnaturaPirineusyenelCRG,
dondelosestudiantesparticipanenlassesionesyeventoscentradosentemascientíficosconelobjeti-
vode,finalmente,proponerydesarrollarsupropiaideadeproyecto.Desde2016,elCRGtambiénesuno
delosinstitutosqueacogeestudiantesdelaBarcelonaInternationalYouthScienceChallenge(BYISC),
unprogramainternacionaldeexcelenciadedossemanasenveranoquebuscaestimulareltalentocien-
tíficoentrelosjóvenesdetodoelmundoyfomentarsuentusiasmoparadesarrollarunainvestigación
científicayunacarreraenelámbitodelasciencias.
FUNdaCIÓ MaRaTo TV3LafundaciónMaratótV3financiadiversosproyectosdeinvestigacióndirigidosporinvestigadoresdel
CRGrelacionadosconlasdiferentesedicionesdelmaratóntelevisivo:tresproyectosde laediciónde
2012sobre“Cáncer”(thomasGraf,PiaCosmaySusanadelaLuna),dosproyectosdelaediciónde2013
de“enfermedadesneurodegenerativas”(fátimaGebaueryLucianoDiCroce),unproyectodelaedición
de2014sobre“Lasenfermedadesdelcorazón”(GianG.tartaglia)ydosproyectosdelaediciónde2016
sobre“Lesionesmedularesycerebralesadquiridas”(MarcMartí-RenomyMaraDierssen).
NOVaRTISNovartis mantiene una extensa tradición de colaboración con el CRG. De 2003 a 2016, la empresa dio su
apoyoalaorganizacióndelossimposiosanualesdelCRG,ytambiénfinancióunabecaanualparainves-
tigadores/aspostdoctoralesenelcampodelagenómicaentre2004y2012.en2012,secreóelnuevo
programademovilidadCRG-novartis-Áfricaparaavanzarenlainvestigaciónbioinformática,genéticay
genómicaenÁfrica,yacompañarcientíficos/casafricano/asjóvenesyprometedores/as.elprograma
permite,anualmente,acogerhastacuatroinvestigadores/asenestadiostempranosdesucarrerapro-
cedentesdeuniversidadesafricanas,pararealizarunaestanciade6mesesenelCRG,yllevaracabosu
proyectodeinvestigaciónbajolasupervisióndeun/ainvestigador/aprincipaldelCRG.
axa RESEaRCh fUNdLa“CátedraAXAdePrediccióndelRiesgoenenfermedadesrelacionadasconlaedad”fuecreadaen2014por
unperiododequinceañosconunadotacióndeunmillóndeeuros.elDr.BenLehnerfuenombradoprimer
titulardeestacátedraparacontinuarsulaboreneldesarrollodeunamedicinapersonalizadaqueofrezcaa
laspersonasunamayorprotecciónfrentealosriesgosúnicosqueencaranenenfermedadescomoelcáncer.
en2017,elDr.BernhardPayerfuenombradoelsegundotitulardeestacátedraparaunperíodode3años.
Resumen ejecutivo 2017 - 49
fONdaTION JEROME lEJEUNELarelaciónentreelCRGylafundaciónJeromeLejeunecomenzóhacemuchotiempo.Hanapoyado
variasdelasiniciativasdeinvestigacióndeMaraDierssenvinculadasconlaidentificacióndelasbases
molecularesygenéticasendiversaspatologíasacompañadasderetrasomental:elsíndromedeRett,
elsíndromeXfrágil,elsíndromedeWilliam-BeurenyelsíndromedeDown.Dierssenrecibiótambiénel
primerPremioInternacionalSisley-JeromeLejeuneen2010.en2016,otorgaronunabecaalproyecto
deeduardSabidóen laelucidacióndelmecanismodeacciónde laepigalocatequina-3-galatocomo
agenteterapéuticoenelfenotipocognitivoenmodelosderatonesconsíndromedeDown(2015-2017).
Másrecientemente,en2017,aMaraDierssenleconcedieronunnuevoproyecto,titulado‘Generadordel
CambioepigenéticoenSíndromedeDown’(2017-2019).
aECCen los últimos años, la asociación española Contra el Cáncer (aeCC) ha apoyado una serie de proyectos
einiciativasdeinvestigaciónporcientíficosdelCRG.en2015,PedroVizán(enellaboratoriodeLuciano
DiCroce)recibiólaBecadeInvestigaciónoncológicadelaAeCCparaunproyectoquepretendeidentifi-
cary“atacar”lascélulasmadreimplicadasenelcáncer,quefinalizaráen2019.
zIMIN fOUNdaTION Gracias a la zimin foundation, se celebró en Barcelona, durante dos años consecutivos (2016 y 2017),
la School ofMolecular and theoretical Biology (SMtB), organizada por nuestro investigador fyodor
Kondrashov.LaSMtBreunió,durantetressemanasenagosto,ochentaestudiantesdeenseñanzase-
cundariacontalentoeintelectualmenteinquietos,condestacadoscientíficosdetodoelmundo,todos
ellostrabajandojuntosenexperimentoscientíficosrealesquepodríanaportarresultadosinnovadores.
Losestudiantesdedicaronlostresprimerosdíassimplementeadescubrirlosdiversoslaboratoriosque
participanenelcursodeveranoparaqueposteriormentepudieranelegirelproyectocientíficoqueles
interesara. Como acto de clausura, los estudiantes prepararon una sesión de pósters para presentar los
resultados de los proyectos desarrollados durante las semanas anteriores.
fUNdaCIó bbVa en la convocatoria 2016 de las Becas de la fundación BBva para investigadores y creadores culturales,
nievesMartínez,delgrupodeJamesSharpe,fuegalardonadaconunaayudaparasuproyectodeinves-
tigacióntitulado“non-InvasivefacialBiomarkersofMentalDiseases”.elobjetivodelproyectoeracrear
unaaplicacióndeanálisisymodeladofacialconvalordediagnósticoypronósticodeenfermedades
mentalesrelacionadasconalteracionesgenéticasdelDYRK1Aytambiéntraduciblesaotrostrastornos.
ThE VElUx fOUNdaTIONSLasfundacionesVeluxestánfinanciandoelproyectodeinvestigacióntitulado“RegeneratingPhotore-
ceptorsinRetinitispigmentosa”,denuestraPIPiaCosma.Laretinitispigmentosa(RP)esunaenferme-
dadgravequeafectaaunadecada3.500personas,quesufrenunapérdidaprogresivadelavisiónypara
laquenohaycuraactualmente.elobjetivodelproyectoesponerapruebalareprogramaciónmediada
porfusióncelularcomoterapiaenratonesrd10,unmodeloderatónconRP,conelobjetivofinalderege-
nerarlosfotorreceptoresyalcanzarelrescatefuncionaldelavisión.
SwISS NaTIONal SCIENCE fOUNdaTIONLaSnSfestáfinanciandoactualmenteunproyectodenuestroPIJamesSharpetitulado“Reaction-diffu-
sionnetworksUnderlyingpatternformationoflymphoidtissue”.elproyectoexploralosdiversosescena-
riosposiblesdeformacióndepatroneseneltejidolinfoide.
50 - Resumen ejecutivo 2017
patrocinadores
fUNdaCIóN ESPañOla PaRa El fOMENTO dE la INVESTIgaCIóN dE la ESClEROSIS laTERal aMIOTRófICa (fUNdEla) Nuestro investigador principal luciano Di Croce recibió una ayuda de fUNDela en noviembre de 2017
paraabordarlaidentificacióndenuevasdianasterapéuticasparaeltratamientodelaeLA,medianteel
empleodecribadodefactoresepigenéticos.
glENN fOUNdaTION fOR MEdICal RESEaRCh LaGlennfoundationfinanciaactualmenteelproyecto‘temporalscalingin C. elegans aging’, de nuestro
investigador principal Nicholas stroustrup hasta octubre de 2018.
ThE baRCElONa INSTITUTE Of SCIENCE aNd TEChNOlOgy (bIST)elBIStcontribuyeadiversasiniciativasactivasenelCRG.enprimerlugar,co-financia2becasfIdel
AGAURen los laboratoriosde los Investigadores/asPrincipalesPiaCosmayRodericGuigódurante
cuatroaños.Porotraparte,dosproyectosdelaprimeraConvocatoriaIgnitedelBIStfueronconcedidos
ainvestigadoresdelCRG.elprimerofueparaVictoireneguembor(laboratorioPiaCosma)ysetitula
‘‘GenStormanintegratedapproachtovisualizeandmodelthespatialconformationofgenesatthena-
noscalelevel’(marzo-noviembre2017).elsegundofueparaIshierRaote(laboratorioVivekMalhtora),
parasuproyecto‘‘enlighteningtAnGo”(marzo-noviembre2017).
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Miembro de:
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