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CODIFICACIÓN
Binarios
• Esmalte de los dientes
Estriado: 1Liso: 0
1 cm
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CODIFICACIÓN
Multiestado
• Proceso descendente del nasal: no desarrollado, corto,largo dividiendo casi completamente la narina, largo y dividiendo completamente la narina
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0 1 2
0
1
2• Desordenado / no aditivo
• Ordenado / Aditivo
Multiestado
0
1 2
3
0 1 2 3
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Codificación binaria aditiva(cada transformación en una columna separada)
Codificación linear
Multiestado
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Matriz binaria
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Datos faltantes
Datos no aplicables:
Estructura de los dientes
Cantidad de dedos
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Datos faltantesAlineación de secuencias
Gaps : datos faltantes
M Q P I L L LM L R – L L –M K – I L L L M P P V L I L
M Q P I L L LM L R L L M K I L L L M P P V L I L
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Análisis de caracteres
• Homología• Enunciación de los caracteres• Codificación
Maddison, 1993; Hawkins et al. 1997
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Maddison, 1993; Hawkins et al. 1997
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Parsimonia
Máxima verosimilitud
Métodos Bayesianos
Métodosalternativos
CLADÍSTICA
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• Principio general para la elección de hipótesis que compiten entre sí para explicar los datos de la forma más simple.
• No es un enunciado sobre evolución
• Se aplica tanto para caracteres morfológicos como moleculares:dadas las secuencias, encontrar el árbol que las explique con el menor número
de cambios
• sinapomorfía: cuanto más caracteres Puedan ser interpretados como sinapomorfías, mayor. Será el soporte a justificación de la monofilia de un grupo
Simplicidad ( parsimonia)
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Simplicidad ( parsimonia)
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H1 H2 H37 pasos 9 pasos 8 pasos
Simplicidad ( parsimonia)
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H17 pasos
Hipótesis más simple
Simplicidad ( parsimonia)
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D
C
E G
F
B
A
J
I
KH D
C
E
B
G H
F
J
I
K
A
D
C
B
E G
F
H
A
J
I
K
Grupo monofilético(se reconocen porsinapomorfías)
Grupo parafilético(compartensimplesiomorfías)
Grupo polifilético(similitud debida a homoplasia)
Dentro del paradigma de la taxonomía evolutiva eran muy populares
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GRUPO MONOFILÉTICO
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GRUPO PARAFILETICO
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GRUPO POLIFILÉTICO
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H1 H2 H37 pasos 9 pasos 8 pasos
Simplicidad ( parsimonia)
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D
C
E G
F
B
A
J
I
KH D
C
E
B
G H
F
J
I
K
A
D
C
B
E G
F
H
A
J
I
K
Grupo monofilético(se reconocen porsinapomorfías)
Grupo parafilético(compartensimplesiomorfías)
Grupo polifilético(similitud debida a homoplasia)
Dentro del paradigma de la taxonomía evolutiva eran muy populares
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21
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22
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• Delimitación del grupo (in-group).
• Caracteres, delimitación.
• Codificación y determinación de polaridad a priori (comparación con el grupo externo o criterio ontogenético)
• Construcción de la matriz. Se agrupa por sinapormorfías (cada apomorfíadefine una relación) Búsqueda de la solución más simple
¿Cómo se construye un cladograma?
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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Delimitación del grupo (in-group).
• Pueden ser de distinto rango. • Se asume a priori son monofiléticos• No necesariamente deben ser monofiléticos• Conviene seleccionar como in-group un grupo que comparta• Al menos una sinapomorfía
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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Determinación a priori de la polaridad
Método ontogenético
Comparación con el grupo externo (out-group)
• El estado de carácter plesiomórfico es aquel que sucede antes en la ontogénia
• El estado de carácter plesiomórfico es aquel presente en el grupo externo al estudiado (out-group)
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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Heterocronía (cambios en los tiempos del desarrollo)
Desarrollo Ocurre tempranamente
Ocurretardiamente
Caracteressomáticos
ACELERACION NEOTENIA
Reproducción PROGENESIS HIPERMORFOSIS
Desarrollo Ocurre tempranamente
Ocurretardiamente
Caracteressomáticos
ACELERACION NEOTENIA
Reproducción PROGENESIS HIPERMORFOSIS
RecapitulaciónPaedomorfosis
NEOTENIA
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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Fenestra antorbitaria (FAO)
FAOFAOFAOFAOFAOFAO
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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LB LB LB LB LC LC
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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0110101111111loro
0000101110011caiman
0000011110011serpiente
0000011110011gecko
0000000111111hombre
0000000110011tortuga
0001000110110sapo
0001000110110salamandra
0000000110000celacanto
0000000000000perca
13121110987654321
0110101111111loro
0000101110011caiman
0000011110011serpiente
0000011110011gecko
0000000111111hombre
0000000110011tortuga
0001000110110sapo
0001000110110salamandra
0000000110000celacanto
0000000000000perca
13121110987654321
65
1
7
8 910
2
11,1233
3
4
4
sinapomorfíashomoplasias
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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1º Los estados de carácter se organizan en una serie de transformación que sepolariza
2º Se reconocen las sinapormorfías que se utilizan para construir el cladograma
Análisis en dos pasos o restringido
DESARROLLO HISTÓRICO: ARGUMENTACIÓN HENNIGIANA
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DicotomíaPolitomía (relación no resuelta)
=/
A EDCB A EDCB
Raiz
Rama interna
CladoNodo A
X
D
C
B
Como se lee un árbol
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= =
E CD B AE DC B AA EDCB
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Los árboles escalados o no (con o sin longitud de ramas)
A
E
D
C
B
A
E
D
C
B
unidad
Longitud de rama
Filogramas
Los árboles pueden o no tener raíz
A
E
D
C
B
A
E
D
C
Bunidad
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A EDCB
Completamente resuelto
A EDCB
No completamente resuelto
A DCB
Balanceado
A DCB
Pectinado
vs
vs