DOCTORADO EN BIOINFORMÁTICA Y BIOLOGÍA DE SISTEMAS

FACULTAD DE CIENCIAS DE LA VIDA

Director: Dr. Fernando Danilo González NiloSec. Académico: Dr. Daniel Aguayo V.

Informaciones: daniel.aguayo@unab.clCentro de Bioinformática y Biología Integrativa

Av. República 3301er Piso.

http://investigacion.unab.cl/doctorados/doctorado-bioinformatica-biologia-sistemas/

Proceso de Selección al Programa 2021

• Recepción de antecentes: • hasta el 21 de Octubre 2020

• Revisión de antecedentes , Preselección, Pruebas y entrevistas : 24 – 28 Octubre 2020

• Informe de Selección: 4 de Noviembre 2020• Inicio acDvidades: Marzo 2021

DOCTORADO EN BIOINFORMÁTICA Y BIOLOGÍA DE SISTEMAS

• Carácter del programa: Académico• Líneas de formación:

– Boinformática– Biología de Sistemas

• Duración: 8 semestres • Modalidad: Presencial, Exclusiva • Horario: Diurno

• 926 hrs pedagógicas directas• 529 créditos UNAB• 240 SCT-Chile

El Doctorado en Bioinformática y Biología de Sistemas, esta dirigido a candidatosque cuenten al menos con un grado de Licenciado o Magister en ciencias condisciplinas relacionadas con la biología, ingeniería, y ciencias de la computación.

Aranceles, Becas y Beneficios 2020

• Arancel Anual 2021 $ -– no definido

• Matrícula $ no definida

Postulación Becas y Beneficios DBBS: Enero 2021• Beca de Arancel

– El Programa contempla otorgar a los alumnos aceptados en un programa de doctorado, becas parciales o totales de arancel, quienes deberán solicitarla personalmente a la dirección del programa. El porcentaje de beca será evaluad por el programa, y deberá ser renovada anualmente.

• Beneficio de Asistencia Académica ($500.000)– La Asistencia Académica, es una asignación mensual que comprende los meses de marzo de 2021 hasta febrero de

2022 o por los meses correspondientes a completar la permanencia máxima permitida. Esta asignación deberá ser renovada anualmente y podrá extenderse hasta por un máximo de 9 semestres de permanencia en el programa. Para recibir este beneficio el alumno deberá encontrarse con su matrícula vigente para el año académico 2021.

Requisitos, formularios e información Adecional:http://investigacion.unab.cl/becas-fondos-concursables/

Documentos deben ser enviados al Secretario Académico del Programa junto con documentos de postulación

Requisitos de Postulación• TODOS LOS DOCUMENTOS DEBEN SER ENTREGADOS EN FORMATO DIGITAL y FÍSICO al

Secretario Académico del Programa.• Estar en posesión del Grado académico de Licenciado o Título Profesional o cuenten con un

grado académico de Licenciado o Magister en ciencias con disciplinas relacionadas con la biología, ingeniería, y ciencias de la computación, otorgado por una Universidad reconocida por el Estado de Chile, o en el caso de instituciones extranjeras, por el Estado del país correspondiente.

• Completar formulario de postulación a Doctorados: FORMULARIO ÚNICO DE POSTULACIÓN*• Carta describiendo sus intereses y las razones por las cuales desea postular a este programa y

Universidad.• Fotocopia notariada del grado de Licenciado o Título Profesional. En el caso de alumnos

extranjeros, la fotocopia deberá ser visados por el Cónsul chileno en el país de origen y por el Ministerio de Relaciones Exteriores en Chile.

• Certificado de concentración de notas y grado de todos los grados obtenidos.• Ranking de egreso de pregrado.• Certificado de Nacimiento.• Curriculum Vitae.• Dos cartas de recomendación: FORMATO SUGERIDO*• Dos fotos con RUT incluido.• Fotocopia del carné de identidad por ambos lados notariado.*En caso de haber realizado postgrados, adjunte fotocopia legalizada del grado y de la concentración de notas, respectivas.• Cierre de Postulaciones:• La recepción de antecedentes para el proceso de admisión a este programa de doctorado se

mantendrá abierto hasta el 21 de Octubre del 2020.

* http://investigacion.unab.cl/doctorados/doctorado-bioinformatica-biologia-sistemas/

Entrega de Documentos de Postulación

Dr. Daniel Aguayo V.——————————————Secretario AcadémicoPrograma de Doctorado en Bioinformática y Biología de SistemasCentro de Bioinformática y Biología IntegrativaFacultad de Ciencias de la VidaUniversidad Andrés BelloChile----------------------------Av, República 330, Santiago, ChileCódigo Postal: 8370146

daniel.aguayo@unab.cl

• Todos los documentos deben ser entregados en formato digital al secretario académico del Programa y al ser aceptado en formato físico a:

Nombre del Programa: Doctorado en Bioinformá/ca y Biología de SistemasFacultad: Ciencias de la Vida

Antecedentes:El acelerado desarrollo de la biotecnología impulsado por las plataformas de secuenciación de alto rendimientohan generado un aumento masivo de información en grandes bases de datos durante los úl/mos 20 años, lo queha contribuido al rápido desarrollo de la bioinformá/ca. La bioinformá/ca es una disciplina en la que convergenconceptos avanzados de biología con la implementación y uso de herramientas computacionales tan diversas comoalgoritmos de tratamiento, almacenamiento y análisis de genomas hasta el uso de inteligencia ar/ficial paradesentrañar las reglas que guían los procesos biológicos. Con todo lo anterior, se crea un Programa de Doctoradoen Bioinformá/ca y Biología de Sistemas, cuyo propósito es formar cienJficos con un alto entrenamiento ycapacidad de inves/gación en diversos aspectos de la Bioinformá/ca, desde la genómica computacional a laingeniería de proteínas, con aplicaciones al diseño de biomoléculas ac/vas y a la generación de hipótesis sobrefunciones y procesos celulares.

Obje6vo General:Proporcionar al estudiante de postgrado una formación cienJfica avanzada con las competencias necesarias para desenvolverse en dis/ntos niveles de organización biológica, profundizando en la comprensión de los mecanismos moleculares en sistemas biológicos, y contribuyendo al desarrollo e implementación de métodos cuan/ta/vos para el análisis masivo de datos, y a la generación de nuevo conocimiento.

Antecedentes Generales

Perfil de Egreso

El graduado del Doctorado en Bioinformática y Biología de Sistemas de la Universidad AndrésBello posee una sólida formación en los fundamentos de la biología cuantitativa a través de unacomprensión mecanística de los sistemas biológicos. El graduado posee capacidades paraenfrentar desafíos emergentes de la biología mediante el uso de métodos en programacióncientífica, tratamiento de datos masivos, y generación de modelos predictivos, para proponer yvalidar los mecanismos que rigen los sistemas biológicos. El graduado tiene una formación anivel teórico y experimental en bioinformática genómica, bioinformática estructural, biofísica,modelado de sistemas biológicos basados en datos bioquímicos, fisiológicos y ómicos,enmarcados en las áreas de la biología. El graduado puede desarrollar investigación original yautónoma, enfocándose en su objeto de estudio relacionado con las líneas de investigación deBiología de Sistemas y de Bioinformática. Además, posee formación en bioética que le permitedesempeñarse de acuerdo con los principios éticos propios de las áreas de estudio. A partir de suinvestigación y formación, el graduado tendrá una proyección nacional e internacional con unasólida formación en bioinformática y biología de sistemas, y se desempeñará tanto en el sectoracadémico como productivo con énfasis en la administración, análisis, e interpretación deinformación biológica, contribuyendo de este modo al desarrollo del país.

Al finalizar el Programa el graduado será capaz de:

• Demostrar conocimientos teóricos y prácticos en el desarrollo y/o la aplicación de métodos computacionales y análisis de datos masivos, que le permitan desempeñarse de forma original, autónoma y colaborativa en investigación.

• Formular proyectos de investigación en las líneas de bioinformática estructural, y modelado de sistemas biológicos, considerando aspectos éticos y bioéticos que respondan a las necesidades de las ciencias biológicas en distintos niveles de organización.

• Ejecutar proyectos de investigación de vanguardia en áreas de bioinformática y biología de sistemas para la generación de conocimiento básico o aplicado, que contribuya al avance de las líneas de investigación del programa.

• Comunicar efectivamente los resultados derivados de la investigación a la comunidad especializada y no especializada, de acuerdo con normas reconocidas por la disciplina o campo de estudio.

• Participar activamente en equipos de trabajo interdisciplinarios orientados a la bioinformática y a la biología de sistemas.

Perfil de Egreso

Taxonomia cognitiva de Bloom

Líneas de investigación del Programa.

El programa de Doctorado en Bioinformática y Biología de Sistemas tiene un plan de estudios innovador y único, que busca la formación de estudiantes con un alto entrenamiento y capacidades de investigación en diversos aspectos de la Bioinformática, los cuales se extienden desde la genómica computacional a la ingeniería de proteínas, con aplicaciones al diseño de medicamentos y/o a la generación de hipótesis de las funciones y características celulares. Para esto, el programa plantea la formación del graduado en relación con las siguientes líneas de investigación:

Línea Bioinformática: Esta línea de investigación considera la caracterización de relaciones estructura-función de biomoléculas utilizando métodos teóricos y experimentales que requieren del uso de algoritmos y herramientas computacionales de alto rendimiento y de instrumentación experimental. Esta línea posee como objetivo el desarrollo de estrategias de investigación que integren la ciencia de datos y métodos computacionales con su posterior validación experimental. A través de este enfoque, se genera un ciclo iterativo de investigación, basado en la observación de eventos experimentales, modelado y simulación computacional y la validación empírica.

Línea de Genómica y Sistemas biológicos: Esta línea congrega la aplicación de métodos de genómica comparativa y genómica funcional para dilucidar mecanismos moleculares en microorganismos y organismos multicelulares, y sus posibles interacciones. Además de la cuantificación e integración de datos masivos de perfiles de expresión de RNAs y proteínas, y abundancia de metabolitos en la célula bajo diferentes condiciones ambientales. Estos datos a escala genómica también podrán servir como base para el desarrollo de modelos matemáticos, los cuales se usarán para formular hipótesis de las funciones y características celulares (fenotipos).

Programación para Bioinformá0ca(13 SCT)

Biología de Sistemas(12 SCT)

Bioinformática Estructural(9 SCT)

Electivo I(5 SCT )

Electivo II(5 SCT)

Genómica Computacional(9 SCT)

Semestre I

Asig

natu

ras

oblig

ator

ias

Asig

natu

ras

opta

0vas

Semestre II Semestre III Semestre IV Semestre V Semestre VI Semestre VII Semestre VIII

Inves0gación para la Tesis

Doctoral I(30 SCT)

Defensa de Tesis Privada(0 SCT)

Defensa de Tesis Pública (0 SCT)

Año 1 Año 2 Año 3 Año 4

30 SCT 30 SCT 30 SCT 30 SCT 30 SCT 30 SCT 30 SCT 30 SCT

Proy

ecto

yTe

sis D

octo

ral

Proyecto de Tesis (30 SCT)

Plan de Estudios Doctorado en Bioinformática y Biología de Sistemas

Bioética y ética en la Investigación(7 SCT)

Examen de Candidatura(0 SCT)

Investigación para la Tesis Doctoral II

(30 SCT)

Inves0gación para la Tesis Doctoral III

(30 SCT)

Investigación para la Tesis Doctoral IV

(30 SCT)

Investigación para la Tesis Doctoral V

(30 SCT)

Línea de investigación AsignaturasBioinformática Programación para Bioinformática

Genómica ComputacionalBioinformática EstructuralBioética y ética en la investigaciónProyecto de TesisExamen de candidaturaInvestigación para tesis doctoral I-VElectivos

Genómica y Sistemas Biológicos Biología de SistemasGenómica ComputacionalBioética y ética en la investigaciónProyecto de TesisExamen de candidaturaInvestigación para tesis doctoral I-VElectivos

Electivos Ingeniería de ProteínasIngeniería Metabólica de Sistemas BiológicosDiseño racional de moléculas BioactivasDiseño experimental y análisis de datosComputación de Alto RendimientoInnovación basada en ciencia