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DISEÑO DE UNA GUÍA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS
ASOCIADOS A LA MENINGITIS BACTERIANA AGUDA A TRAVÉS DE UN
ESQUEMA DE DESCRIPCIÓN DOCUMENTAL
ADELA MARLEN BARRERA GUERRERO
PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA
FACULTAD DE COMUNICACIÓN Y LENGUAJE
DEPARTAMENTO DE CIENCIA DE LA INFORMACIÓN
CARRERA DE CIENCIA DE LA INFORMACIÓN- BIBLIOTECOLOGÍA
BOGOTÁ
2017
2
DISEÑO DE UNA GUÍA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE MICROORGANISMOS
ASOCIADOS A LA MENINGITIS BACTERIANA AGUDA A TRAVÉS DE UN
ESQUEMA DE DESCRIPCIÓN DOCUMENTAL
ADELA MARLEN BARRERA GUERRERO
Trabajo presentado como requisito para
Optar al título de Profesional en
Ciencia de la Información – Bibliotecólogo
Director: Yeny Magali Pérez Puerto
PONTIFICIA UNIVERSIDAD JAVERIANA
FACULTAD DE COMUNICACIÓN Y LENGUAJE
DEPARTAMENTO DE CIENCIA DE LA INFORMACIÓN
CARRERA DE CIENCIA DE LA INFORMACIÓN- BIBLIOTECOLOGÍA
BOGOTÁ
2017
3
ARTICULO 23 DE LA RESOLUCIÓN NO.13 DE JUNIO DE 1946
“La universidad no se hace responsable de los conceptos emitidos por sus
alumnos en sus proyectos de grado.
Solo se velará porque no se publique nada contrario al dogma y la moral
católica y porque los trabajos no contengan ataques o polémicas puramente
personales. Antes bien, que se vea en ellos el anhelo de buscar la verdad y
la justicia”
Reglamento de la Pontificia Universidad Javeriana
4
Agradecimientos
Agradezco a Dios por permitirme lograr cada una de las metas propuestas.
A mis padres por apoyarme y darme la fortaleza necesaria en los
momentos difíciles.
Agradezco a mis hijas y a mi esposo por la paciencia y el apoyo que me
brindaron en los momentos en que más los necesite.
A mi tutora y guía Yeny Magali Pérez Puerto, por su paciencia y apoyo
incondicional para hacer realidad este proyecto.
A todos los Maestros que hicieron parte de mi formación profesional y
guiaron mis pasos en este camino.
Al Dr. Hugo Diez por sus aportes, apoyo y orientaciones para la realización
de este trabajo.
A mis amigos y compañeros por el apoyo incondicional durante esta etapa
de formación.
A la Pontificia Universidad Javeriana por brindarme la oportunidad de crecer
como persona y como profesional.
5
Dedicatoria
Dedico este trabajo a Daniela y Mariana quienes a través de su amor y paciencia
han logrado motivarme día a día y recordarme que en la vida todo es posible y que
con esfuerzo se hacen realidad todos los sueños.
A Álvaro Andrés por apoyarme incondicionalmente en seguir adelante con mis
sueños y proyectos que son la base del futuro para nuestra familia.
A mis padres y hermanos, siempre presentes en cada ciclo de mi vida.
Al padre Antonio José Sarmiento Nova S.J., por su apoyo incondicional y su
acompañamiento en este proceso de aprendizaje y crecimiento profesional.
6
TABLA DE CONTENIDO
INDICE DE TABLAS ................................................................................................ 8
INDICE DE ILUSTRACIONES ............................................................................... 10
INDICE DE GRAFICOS ......................................................................................... 11
INDICE DE FICHAS TÉCNICAS ............................................................................ 14
INDICE DE ANEXOS ............................................................................................. 15
GLOSARIO ............................................................................................................ 16
RESUMEN ............................................................................................................. 18
INTRODUCCIÓN ................................................................................................... 19
1 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA ............................................................. 21
2 JUSTIFICACIÓN ............................................................................................. 27
3 ESTADO DEL ARTE ....................................................................................... 30
4. OBJETIVOS ...................................................................................................... 34
4.1 OBJETIVO GENERAL .................................................................................. 34
4.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS ........................................................................ 34
5. MARCO TEÓRICO .......................................................................................... 35
5.1 GESTIÓN DE LA INFORMACIÓN ............................................................ 35
5.2 LA INFORMACIÓN COMO HERRAMIENTA ............................................ 37
5.3 METADATOS: .......................................................................................... 41
5.3.1 METADATOS Y ORGANIZACIÒN DL CONOCIMIENTO: ....................... 44
5.1 CODIFICACIÓN ........................................................................................ 45
5.2 MENINGITIS AGUDA BACTERIANA ....................................................... 48
5.3 MICROORGANISMOS COMO DOCUMENTOS ...................................... 50
6. METODOLOGÍA .............................................................................................. 55
6.1 EVALUACIÓN DE LAS NECESIDADES DE LOS USUARIOS ................. 55
6.2 DESCRIPCIÓN DE LOS MECANISMOS DE RECOLECCIÓN ................ 57
6.2.1 La encuesta ............................................................................................ 57
6.2.2 La entrevista ........................................................................................... 57
6.3 PRESENTACIÓN DE LA RECOLECCIÓN DE DATOS (TABULACIÓN Y
ANÁLISIS) .......................................................................................................... 58
6.3.1 Encuesta Para Profesionales en el Área de la Salud ......................... 59
6.3.2 Conclusión Encuesta Para Profesionales en el Área de La Salud ..... 72
7
6.3.3 Encuesta para estudiantes ................................................................. 72
6.3.4 Conclusión Encuesta Para Estudiantes ............................................. 80
6.3.5 Entrevista - Coordinador Especialización Microbiología Médica. ....... 81
6.3.6 Conclusión Entrevista - Coordinador Especialización Microbiología
Médica ................................................................................................ 82
7. DISEÑO DE UNA GUÍA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE
MICROORGANISMOS ASOCIADOS A LA MENINGITIS BACTERIANA AGUDA A
TRAVÉS DE UN ESQUEMA DE DESCRIPCIÓN DOCUMENTAL ........................ 84
7.1 METADATOS DE IDENTIFICACIÓN ........................................................ 84
7.1.1 Taxonomía En Microorganismos ........................................................ 85
7.1.2 Morfología Microscópica .................................................................... 87
7.1.3 Morfología Macroscópica ................................................................... 92
7.1.4 Pruebas Bioquímicas ......................................................................... 99
7.2 FICHAS DE IDENTIFICACIÓN ............................................................... 105
7.3 EQUIVALENCIAS DE VALIDACIÓN ...................................................... 116
8. CONCLUSIONES .......................................................................................... 124
9. RECOMENDACIONES ................................................................................. 125
REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS ..................................................................... 126
8
INDICE DE TABLAS
Pág.
Tabla 1 Ejemplo de metadato ................................................................................ 42
Tabla 2 Codificación Microorganismos .................................................................. 48
Tabla 3 Agentes etiológicos de la MBA ................................................................. 51
Tabla 4. Evaluación de necesidades de los usuarios ............................................ 56
Tabla 5. Comparativa Microorganismos ................................................................ 86
Tabla 6. Morfología microscópica Nem .................................................................. 87
Tabla 7. Morfología microscópica Spn ................................................................... 88
Tabla 8. Morfología microscópica Sau ................................................................... 89
Tabla 9. Morfología microscópica Lmn .................................................................. 90
Tabla 10. Morfología microscópica Cyn ................................................................. 91
Tabla 11. Morfología macroscópica Spn ................................................................ 92
Tabla 12. Morfología macroscópica Sau ................................................................ 93
Tabla 13. Morfología macroscópica Hae ............................................................... 94
Tabla 14. Morfología macroscópica Kpn ................................................................ 95
Tabla 15. Morfología macroscópica Nem .............................................................. 96
Tabla 16. Morfología macroscópica Lmn ............................................................... 97
Tabla 17. Morfología macroscópica Nem .............................................................. 98
Tabla 18. Pruebas Bioquímicas Catalasa - Oxidasa ............................................ 100
Tabla 19. Pruebas Bioquímicas Ureasa – Citrato - Fermentación ....................... 101
9
Tabla 20. Pruebas Bioquímicas Hidrólisis - Coagulasa - Solubilidad ................... 102
Tabla 21. Pruebas Bioquímicas CAMP - Optoquina – Indol – Manitol ................. 103
Tabla 22. Pruebas Bioquímicas Mc Conkey – Agar Sangre – Voges – Lisina ..... 104
10
INDICE DE ILUSTRACIONES
Pág.
Ilustración 1. Condiciones para la gestión de la información ................................. 38
Ilustración 2. Criterios de la información ................................................................ 39
Ilustración 3. Parámetros básicos para el análisis del LCR ................................... 52
Ilustración 4. Diagrama de flujo Tinción de Gram ................................................ 116
Ilustración 5. Diagrama de flujo Catalasa ............................................................ 117
Ilustración 6 Diagrama de flujo Oxidasa .............................................................. 117
Ilustración 7 Diagrama de flujo CAM .................................................................... 118
Ilustración 8. Algoritmo de diagnóstico de la MBA ............................................... 123
11
INDICE DE GRAFICOS
Pág.
Gráfica 1. Tendencia de los países latinoamericanos RGTI 2016 ....................... 23
Gráfica 2. Resultados pregunta 1 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 59
Gráfica 3. Resultados pregunta 2 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 60
Gráfica 4. Resultados pregunta 3 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 61
Gráfica 5. Resultados pregunta 4 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 61
Gráfica 6. Resultados pregunta 5 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 62
Gráfica 7. Resultados pregunta 5 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 63
Gráfica 8. Resultados pregunta 5 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 63
Gráfica 9. Resultados pregunta 6 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 64
12
Gráfica 10. Resultados pregunta 7 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 66
Gráfica 11. Resultados pregunta 7 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 66
Gráfica 12. Resultados pregunta 8 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 67
Gráfica 13. Resultados pregunta 9 de la encuesta para profesionales en el área de
la salud ............................................................................................... 68
Gráfica 14. Resultados pregunta 10 de la encuesta para profesionales en el área
de la salud .......................................................................................... 69
Gráfica 15. Resultados pregunta 11 de la encuesta para profesionales en el área
de la salud .......................................................................................... 70
Gráfica 16. Resultados pregunta 12 de la encuesta para profesionales en el área
de la salud .......................................................................................... 70
Gráfica 17. Resultados pregunta 13 de la encuesta para profesionales en el área
de la salud .......................................................................................... 71
Gráfica 18. Resultados pregunta 1 de la encuesta para estudiantes .................... 73
Gráfica 19. Resultados pregunta 2 de la encuesta para estudiantes .................... 73
Gráfica 20. Resultados pregunta 3 de la encuesta para estudiantes .................... 74
Gráfica 21. Resultados pregunta 4 de la encuesta para estudiantes .................... 75
Gráfica 22. Resultados pregunta 5 de la encuesta para estudiantes .................... 76
Gráfica 23. Resultados pregunta 6 de la encuesta para estudiantes .................... 77
Gráfica 24. Resultados pregunta 7 de la encuesta para estudiantes .................... 78
13
Gráfica 25. Resultados pregunta 8 de la encuesta para estudiantes .................... 79
Gráfica 26. Resultados pregunta 9 de la encuesta para estudiantes .................... 79
14
INDICE DE FICHAS TÉCNICAS
Pág.
FICHA TÉCNICA 1. Streptococcus pneumoniae ................................................ 106
FICHA TÉCNICA 2. Staphylococcus aureus ....................................................... 107
FICHA TÉCNICA 3. Neisseria meningitidis .......................................................... 109
FICHA TÉCNICA 4. Listeria monocytogenes ....................................................... 110
FICHA TÉCNICA 5. Klebsiella pneumoniae........................................................ 112
FICHA TÉCNICA 6. Haemophilus influenzae ..................................................... 113
FICHA TÉCNICA 7. Cryptococcus neoformans ................................................... 114
15
INDICE DE ANEXOS
Pág.
ANEXO 1. ENCUESTA PARA PROFESIONALES DEL AREA DE LA SALUD ... 130
ANEXO 2. ENCUESTA PARA ESTUDIANTES ................................................... 135
ANEXO 3. ENTREVISTA ..................................................................................... 137
16
GLOSARIO
Cepa Bacteriana: Colonia microbiana procedente de un solo germen obtenido de
un enfermo, y multiplicado por pases sucesivos en diferentes medios de cultivo.
(García García, Manuel, 2011)
CMPUJ: Colección de Microorganismos de la Pontificia Universidad Javeriana.
(Pontificia Universidad Javeriana, 2017)
Descriptor: Palabra clave que define el contenido de un documento y que permite
localizarlo en el seno de un archivo, manual o automatizado. (Thefree dictionary)
Fichas Técnicas: Tablas taxonómicas, PDF, esquemas RDF, cuyo contenido
principal es la descripción del material que para este proyecto serán los
microorganismos etiológicos de la MBA. En este sentido se tendrá en cuenta:
Taxonomía, morfología macroscópica, morfología microscópica, patologías y
resultados de pruebas.
MENINGITIS: Es el proceso inflamatorio de las leptomeninges, puede ser causada
por bacterias, virus, hongos o parásitos. (Robledo María del Rosario, 2015)
17
Metadatos: son datos secundarios que se emplean para suministrar información
sobre datos producidos, ellos describen el contenido y otras características de los
datos primarios para posibilitar a una persona o máquina ubicar y entender los
datos. (Daudinot., 2006).
Microorganismos: La palabra microorganismo proviene del griego, formada por
“mikro” que significa pequeño, más la raíz “organon” que quiere decir órgano,
herramienta o instrumento, y el sufijo “ismo” que significa actividad o sistema.
(conceptodefinicion.de)
Normalización: hacer que algo se desarrolle conforme a un modelo en común
(Thefree dictionary)
Pruebas Bioquímicas: son usadas para determinar el género de la mayoría de las
bacterias. (Microbitos, 2015)
Vocabulario controlado: es un instrumento que propone organización del
conocimiento, taxonomía, metadatos y la normalización de la terminología de las
palabras clave que serán utilizadas en los artículos elaborados en el ámbito de las
publicaciones (Universidad de Palermo, 2017)
18
RESUMEN
El siguiente proyecto se desarrolla con el fin de poder aportar a estudiantes,
bacteriólogos, microbiólogos e investigadores especializados en el área de
enfermedades infecciosas de la Facultad de Ciencias de la Pontificia Universidad
Javeriana, una guía que les brinde la posibilidad de identificar microorganismos
etiológicos de la meningitis bacteriana aguda.
Los contenidos de la guía están basados en metadatos que proporcionan
información especializada de los microorganismos, permitiendo de esta manera que
se convierta en herramienta clave para los estudiantes de manera didáctica y como
orientación para investigadores y profesionales dedicados al estudio e identificación
de los agentes microbianos de la MBA.
Se realizó el levantamiento de fichas técnicas que permiten a los usuarios encontrar
información relevante para sus investigaciones relacionadas con la identificación y
diagnóstico de la MBA.
19
INTRODUCCIÓN
Una guía es un documento cuyos contenidos incluyen procedimientos para orientar
el desarrollo de un trabajo a través de datos que se refieren a una temática, se
puede considerar también un catálogo para seguir. La guía debe ser práctica y
contener documentos, descriptores y todo lo necesario para orientar a información
relevante que conduzca a un objetivo final.
En el siguiente trabajo, se presenta una propuesta que apoye las necesidades de
los investigadores, estudiantes y profesores de la línea de investigación de
enfermedades infecciosas de la Facultad de Ciencias de la Pontificia Universidad
Javeriana. Su estructura se divide en tres partes:
La primera parte que contiene los capítulos 1 a 3 en donde se establece el
planteamiento del problema evidenciado en la Facultad de Ciencias de la
Pontificia Universidad Javeriana, se presenta la justificación de la
implementación de una guía a estudiantes y profesores de Bacteriología,
Microbiología y Medicina que trabajan en el área de investigación de
enfermedades infecciosas, que los oriente al diagnóstico e identificación
etiológica de la MBA con un resultado más preciso.
20
La segunda parte, constituida por los capítulos 4 y 5 se enfoca en los objetivos
que se desean cubrir a partir de este proyecto y se hace la presentación del
marco teórico en el que se fundamenta conceptual y teóricamente la propuesta.
En la tercera parte, se tienen los capítulos 6 y 7 desde donde se desarrolla el
análisis de los resultados de la información recopilada a través de los
mecanismos utilizados, y de acuerdo con esto, se establece la propuesta que
permitirá dar solución al planteamiento del problema del grupo de investigación
de enfermedades infecciosas.
Se propone una guía que oriente a la identificación de microorganismos
etiológicos de la meningitis a partir de un esquema documental, basado en un
sistema de organización, clasificación, metadatos y fichas que faciliten la
descripción y comparación entre los agentes causantes de la enfermedad.
21
1 PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA
La humanidad camina hacia otra etapa de su desarrollo que muchos expertos
denominan la Sociedad de la Información (Roca Chillida, 2017), en la que la
generación, distribución y uso de la información se convierte en el eje fundamental
para toda actividad económica, académica y científica.
En esta nueva era, las capacidades desarrolladas por las personas para inventar
nuevas técnicas en busca de su mejor desempeño y productividad son evidenciadas
en la Revolución Industrial que como afirma, Voth (2006) se trataba de una ruptura
radical con un pasado de pobreza y bajo crecimiento y el comienzo de una brillante
generación en la cual la productividad, la población, el producto y el cambio
tecnológico crecieron.
A través de la historia se refleja el deseo del hombre por superarse y por encontrar
nuevas formas de compartir y gestionar tanto la información como el conocimiento,
logrando que la educación, la ciencia y la tecnología estén en continua
transformación. Como afirma Gadino (2001) es necesario que la escuela forme
pensadores competentes que actúen con responsabilidad, frente al desarrollo
informacional como actual recurso económico por lo que es necesario contar con
habilidades en el área de la tecnología, la información y comunicación.
22
El desarrollo científico-tecnológico vigente es indudablemente el más importante de
los que ha experimentado la sociedad, ya que ha permitido al ser humano
comprenderse a sí mismo a su entorno y a emprender el camino hacia la resolución
de distintos problemas, aunque al aplicar la ciencia y la tecnología se han cometido
errores, que se observan en el perjuicio natural, social e individual.
En cuanto a los beneficios en salud son varios los avances que se han desarrollado
a nivel mundial, de acuerdo con (Rangel Barón, 2017) dos hospitales belgas
introdujeron a Pepper un robot que recopila información, tiene incrustada una
cámara 3D y dos HD para procesar imágenes con un software de reconocimiento
de formas que identifica objetos, caras y estados emocionales.
En Norteamérica una compañía diseñó el robot da Vinci Xi® que integrado a una
mesa de operaciones puede ser utilizado para cirugías complejas. Con este avance
en cirugía robótica es posible mover a los pacientes sin necesidad de extraer los
brazos del robot mientras permanecen en el interior del cuerpo del paciente, siendo
beneficioso para cirugías como la colorrectal.
Sumado a lo descrito, existen otro tipo de avances como los realizados por
investigadores de la Universidad Autónoma de Puebla (BUAP) que diseñaron un
nano sensor de fibra óptica que detecta gases tóxicos en lugares de difícil acceso y
que son un peligro para la integridad física, también sería de gran ayuda en la
identificación de sustancias en el cuerpo humano, como la glucosa, de modo que
se tendría conocimiento de la cantidad en la sangre, de una forma rápida y menos
invasiva, gracias a su diminuto tamaño.
23
Paralelo a estos avances, el Informe Global de Tecnologías de la información, refleja
indicadores concretos sobre los países que han desarrollado un alto porcentaje de
inversión en TIC´s. Lo anterior, permite ver cómo Colombia se encuentra
posicionada en el quinto lugar dándole un lugar sobresaliente en relación con países
de mayor desarrollo en la región Latinoamericana.
Gráfica 1. Tendencia de los países latinoamericanos RGTI 2016 Fuente: Centro de Desarrollo Industrial. (2016). Informe global de tecnología de la información
Con las tendencias observadas en la gráfica1, es importante destacar la
participación de la Academia en la generación, adquisición y transmisión de
conocimiento tanto explícito como tácito que resulta fundamental para el buen uso
y aplicación de las TIC. Por lo anterior, una de las grandes responsabilidades de las
instituciones académicas reposa en la adopción de posiciones estratégicas que
incentiven y promuevan la generación de respuestas innovadoras apalancadas en
tecnologías nacientes y que respondan a las demandas del entorno.
Para lograr esta transformación desde lo académico y como se registra en
(Innovation and Technology for Development Centre, 2017) hay instituciones que
24
incentivan y apoyan iniciativas como en la Universidad Politécnica de Madrid, en
donde un grupo de estudiantes desarrollaron un proyecto cuyo objetivo principal
fue optimizar el aporte de luz natural a fin de minimizar el consumo energético.
Dentro del contexto nacional, la Pontificia Universidad Javeriana seccional Bogotá
a través de la Facultad de Ciencias cuenta con un grupo de trabajo que está
enfocado en el estudio de enfermedades infecciosas y en el cual desarrollan
actividades de investigación, docencia y servicio que contribuyan al desarrollo
científico y tecnológico tanto de la universidad como del país.
El grupo de enfermedades infecciosas se focaliza en generar conocimiento
científico - técnico y contribuir en el proceso de formación de profesionales
integrales en el área de la salud, que den soluciones a los problemas de salud de
mayor impacto en el país. Una de las líneas de investigación de dicho grupo, se
basa en el estudio de la Meningitis Bacteriana Aguda en adelante denominada MBA.
La MBA ha captado gran atención por parte del grupo anteriormente citado, ya que
según la OMS es una de las enfermedades que en los últimos tiempos ha tomado
gran fuerza convirtiéndose en un problema de salud pública, ya que en el mundo se
reportan aproximadamente 350 mil casos y 35 mil muertes por año. Dicho
padecimiento ataca el sistema nervioso central y en muchos casos, los síntomas
son confundidos con los de una gripe por lo que los pacientes no reciben el
tratamiento adecuado desde un principio y esto les puede ocasionar la muerte.
Uno de los problemas más importantes y comunes en la atención médica de una
meningitis, es brindar un diagnóstico, pronóstico y tratamiento de certeza, por esta
25
razón resulta fundamental el reconocimiento preciso y rápido del agente etiológico.
De acuerdo con Robledo (2013) la relevancia en la identificación del
microorganismo radica en que esta influye en la elección precoz de la
antibioticoterapia, y como resultado limita las complicaciones y secuelas.
En la actualidad los médicos que sospechan de la presencia de la meningitis dan
inicio a un tratamiento con antibióticos sin el conocimiento del agente etiológico
mientras dan espera a los resultados de laboratorio, lo cual puede traer
consecuencias como: daños neurológicos ocasionados por la ausencia de un
tratamiento específico del agente infeccioso en un menor tiempo.
Adicional a lo anterior los hospitales no cuentan con los recursos materiales ni el
suficiente conocimiento para poder hacer la identificación de los microorganismos,
como es el caso del Hospital San Ignacio que remite las muestras a los laboratorios
del grupo de enfermedades infecciosas de la Pontificia Universidad Javeriana para
poder dar un diagnóstico en menor tiempo a partir de la identificación de la bacteria,
hongo o virus que se encuentre presente en la muestra.
Con el apoyo de una buena gestión en la información que encierra recolección,
clasificación, análisis, codificación, el levantamiento de fichas técnicas y el uso de
códigos y descriptores necesarios para la comparación e identificación de
microorganismos se lograría generar un lenguaje controlado que a su vez permita
un mejor acceso a la información referente a cada cepa.
26
Desde esta perspectiva y con el crecimiento actual en datos y tecnología sería de
gran importancia para esta especialidad contar con datos organizados que permitan
la búsqueda, recuperación y comparación de los microorganismos en bases de
datos o imágenes que faciliten llegar al reconocimiento e identificación necesarios
para un mejor diagnóstico de la MBA.
Es por esta razón que se hace relevante resaltar la importancia desde Ciencia de la
Información, del buen uso y la gestión de los datos existentes de las cepas a partir
de la indexación, los descriptores, bases de datos e imágenes fundamentales para
investigaciones que redundará en pro de la salud en las diferentes comunidades
desde la perspectiva de los microorganismos como documento.
Por lo anterior y basados en la problemática planteada se propone la siguiente
pregunta para el desarrollo de este proyecto:
¿Cuáles serían los aspectos o elementos constitutivos para la descripción de los
microorganismos asociados a la Meningitis Bacteriana Aguda?
27
2 JUSTIFICACIÓN
En cuanto a salud pública el apoyo en investigación y mejoras en tiempo de
valoración de la MBA es un desafío para esta nueva era, pero con el avance en
métodos de recuperación y gestión de la información en el área científica, para
estudiantes y docentes de la Facultad de Ciencias sería uno de los recursos
fundamentales para adelantar estudios especializados y lograr bajar los índices de
tasas por mal diagnóstico.
De acuerdo con informe Portafolio, en 2016 se registraron ingresos por 366.000
millones de dólares en el mundo por tecnologías aplicadas a la salud y se estima
que la inversión en investigación y desarrollo para el 2020 superará los 29 mil
millones de dólares. Con estas cifras se confirma el desarrollo que se está
generando cada día en el sector de la salud y por lo cual se hace necesario
implementar políticas para la organización de la información teniendo en cuenta el
uso de las nuevas tecnologías con el fin de optimizar y brindar nuevos y más
eficientes servicios.
Como expresa Milliner (2016) A pesar de que hay serios desafíos, los beneficios de
implementar avances tecnológicos en el sector médico son enormes, como mejora
en la calidad de la atención, mayor comodidad para los pacientes y mejores
resultados en general. Lo expresado anteriormente invita a que el sector salud
28
cuente con toda una infraestructura en el campo de la investigación que permita
brindar más beneficios a la población.
En este sentido, si desde Ciencia de la información se apoya con la recolección,
organización, descripción, recuperación y metadatos de microorganismos
etiológicos de la MBA, los usuarios lograrían un acceso más ágil a los datos que
necesitan. Es por esta razón que el objetivo principal desde lo académico debe ser
el uso responsable de la información a través de las nuevas tecnologías.
Entre las posibilidades que pueden brindar las TIC a nivel Nacional se encuentra el
fortalecimiento de la gestión de las políticas públicas, administrativas, académicas
y científicas a su cargo. De acuerdo con Frías (2013) el surgimiento de nuevos
proyectos que apoyan el desarrollo científico, económico y social en un país se
apoya desde el uso responsable de las Tecnologías y la información, la ciencia en
el caso de este proyecto es la que debe recibir todo el apoyo de los profesionales
en el campo de la información y la tecnología.
En este contexto, la necesidad de lograr una mayor optimización en el manejo de
documentos con contenidos que permitan la búsqueda y recuperación de
información relevante se convierte en una realidad que se debe asumir. En cuanto
a los proyectos de investigación enfocados en la MBA, el reconocimiento de
microorganismos al momento de realizar pruebas en laboratorio para diagnóstico,
estarían muy bien apoyadas con contenidos previamente organizados.
29
Cabe resaltar que uno de los problemas más importantes y comunes según Cedeño,
2008 en la atención médica de una meningitis es brindar un tratamiento a partir de
la identificación de su agente etiológico y por esto resulta fundamental su precisión.
De acuerdo con lo anteriormente expuesto este proyecto se desarrolla con el fin de
aportar una guía a estudiantes y profesores de Bacteriología, Microbiología y
Medicina que trabajan en el área de investigación de enfermedades infecciosas de
la Facultad de Ciencias de la Pontificia Universidad Javeriana, que los oriente al
diagnóstico e identificación etiológica de la MBA en menor tiempo y con un resultado
más preciso.
Como algunos microorganismos requieren pruebas diferentes al microscopio, se
debe tener establecido un listado de metadatos, fotos e hipertextos de pruebas
microbiológicas como hemocultivos y pruebas bioquímicas, con el fin de obtener un
resultado más exacto, además se pretende que los usuarios tengan acceso rápido
a información relevante y actualizada para sus investigaciones.
Teniendo en cuenta lo anterior, es necesario apoyarse con actividades de
almacenamiento y recuperación de información que se adelantaran en cooperación
con un profesional en el área de Ciencias de la información Bibliotecología, que
oriente en la estructuración de un esquema documental que permita una mejor
identificación y un acceso eficaz a los microorganismos.
30
3 ESTADO DEL ARTE
La información en el siglo XXI es un insumo básico para el desarrollo cultural,
económico, científico, técnico y académico en cualquier sociedad, por esta razón la
disponibilidad de datos y registros debe garantizar la confiabilidad y validez que se
busca desde el laboratorio para la identificación de microorganismos de una manera
más eficiente.
Con base en esto se ha observado que en los laboratorios de la Facultad de
Ciencias de la Pontificia Universidad Javeriana no cuentan con los recursos y el
conocimiento necesario sobre un esquema de descripción documental que sirva
como orientación a estudiantes, investigadores y profesionales de la salud que
trabajen o investiguen acerca del diagnóstico de enfermedades infecciosas.
De acuerdo con lo anteriormente descrito, se realiza una búsqueda de información
basada en las diferentes colecciones de cepas que se encuentran disponibles a
nivel nacional e internacional y que contribuyen a la investigación e identificación de
las diferentes variedades, la relevancia de este tema está enfocado en orientar el
diseño de una guía para la identificación de microorganismos asociados a la
meningitis bacteriana aguda a través de un esquema de descripción documental.
Las siguientes, son algunas de las colecciones relacionadas con esta temática:
Colección Nacional de Cepas Microbianas y Cultivos Celulares CDBB-500, del
Centro de Investigación y de Estudios Avanzados (Cinvestav) [2017] en México
tiene más de 3500 especies, a las que se puede acceder a través del catálogo en
31
línea, las búsquedas en este sitio arrojan resultados por género, especie o CDBB
(Colección del Departamento de Biotecnología y Bioingeniería) dicha información
corresponde a gran variedad de cepas, en donde la identificación del
microorganismo juega un papel muy importante para las diferentes ramas de la
Bacteriología y Microbiología.
De igual manera la Comisión Nacional para el Conocimiento y uso de la
Biodiversidad (CONABIO) en México, cuenta con gran variedad de metadatos a
cerca de las colecciones, su objetivo es promover, coordinar, apoyar y realizar
actividades dirigidas al conocimiento de la diversidad biológica, así como a su
conservación y uso sustentable para beneficio de la sociedad.
CONABIO como organización de investigación aplicada, desarrolla capacidades
humanas en el área de informática de la biodiversidad y es fuente pública de
información y conocimiento accesible para toda la sociedad, en su base de datos
se encuentra la descripción de los contenidos que tiene.
Asimismo, el Centro Mundial de Datos para Microorganismos (World Federation
Collection Cultur) [2017] se encarga de la recolección, autenticación, mantenimiento
y distribución de cultivos de microorganismos y células. Su objetivo es promover y
apoyar el establecimiento de colecciones, enlaces y una red de información entre
las colecciones y sus usuarios, en su página web tiene un directorio en el que se
encuentran diferentes colecciones registradas a nivel mundial y permite el acceso a
listas de colecciones, catálogos de variedades, bases de datos, estadísticas,
documentos publicados, recomendaciones.
32
Lo más importante de esta colección es la autenticación de las cepas pues los
científicos esperan que sean identificadas correctamente, el nombre aplicado a una
cepa conduce a otra información relevante para esa especie, incluido el grupo de
riesgo y posible toxina, permitiendo de esta manera que los usuarios no emplean el
organismo equivocado en sus investigaciones.
Con respecto a la línea de diagnóstico de enfermedades a nivel de microorganismos
se cuenta con diferentes formas, aunque algunas son poco eficaces por la falta de
una buena administración y gestión de la información, además se ha visto dificultad
en incorporar nuevas tecnologías en el área de la microbiología, y por esto los
métodos de identificación de microorganismos que se utilizan son manuales como
la microscopía, las siembras en cultivo y las pruebas bioquímicas.
A pesar de que la microbiología se ha considerado una disciplina tradicionalmente
manual y según Hervé (2015) todavía no se ha conseguido la aplicación de
procesos automáticos, existen métodos para la identificación que han sido capaces
de mejorar la reproducibilidad de los resultados por su estandarización.
Por otra parte, afirma Marcia (2011) que existen sistemas que han sido utilizados
por un grupo interdisciplinario en Argentina para la identificación de hongos en
alimentos, para lograr desarrollar este proyecto necesitaron toda la información,
referente a características y datos descriptores de cada especie, utilizaron
herramientas de gestión de conocimientos, en uno de los campos de la Inteligencia
Artificial, más precisamente el de la Ingeniería del Conocimiento.
33
Debido a la gran variedad de muestras, a veces no son tan eficientes las técnicas;
sin embargo, existen herramientas tecnológicas que se pueden acondicionar a las
necesidades de los investigadores, de tal manera que les puedan brindar
información más relevante para sus investigaciones y a su vez eficiencia en la
identificación de microorganismos.
En el contexto Nacional y retomando la línea de colecciones, cabe resaltar que la
Facultad de Ciencias de la Pontificia Universidad Javeriana cuenta con una única
Colección de Microorganismos que se encuentra registrada en el Centro Mundial de
Datos para Microorganismos, esta serie de muestras facilita la recolección de
descriptores básicos para el levantamiento de fichas técnicas que orienten al acceso
y a la identificación de microorganismos.
Con la información anteriormente expuesta se reafirma que el camino por el cual se
está orientando este trabajo es el apropiado, ya que sólo a través de la utilización
de descriptores acertados de los microorganismos se puede garantizar el acceso y
control de la información a través de un lenguaje controlado que lleve a la
identificación de las cepas, para el uso de la comunidad universitaria de la Pontificia
Universidad Javeriana enfocada a la investigación d enfermedades infecciosas
como la MBA.
34
4. OBJETIVOS
4.1 OBJETIVO GENERAL
Diseñar una guía para la identificación de microorganismos asociados a la
meningitis bacteriana aguda a través de un esquema de descripción documental
que sirva como orientación a estudiantes, investigadores y profesionales de la salud
que trabajen o investiguen acerca del diagnóstico de enfermedades infecciosas en
la Pontificia Universidad Javeriana.
4.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS
Definir los metadatos necesarios para poder realizar la identificación de
microorganismos causantes de la MBA
Levantar fichas técnicas que permitan la identificación de las familias de los
microorganismos etiológicos de la MBA a través de descriptores, metadatos e
imágenes.
Estructurar las equivalencias de validación de acuerdo con los resultados en
laboratorio para hacer el comparativo de los agentes etiológicos de la MBA.
35
5. MARCO TEÓRICO
5.1 GESTIÓN DE LA INFORMACIÓN
El hombre siempre ha tenido la necesidad de intercambiar, comunicar y transmitir
sus experiencias y conocimientos a través de diferentes métodos como las pinturas
en roca, papiros, utensilios etc., según Vidal (2012) esto le permitió de alguna
manera gestionar información y por ende generar el conocimiento en sus
coterráneos y su descendencia.
A medida que transcurre el tiempo surgen nuevas configuraciones tecnológicas
como apoyo al desarrollo humano y a nuevas formas de comunicación donde la
Gestión de la información y la Gestión del conocimiento adquieren mayor relevancia
social, como afirma Aja(2002) los servicios de información, son parte esencial de la
infraestructura para la gestión del conocimiento, suministran información, impulsan
la generación del conocimiento para la búsqueda de soluciones a los problemas que
enfrentan las organizaciones.
La gestión de la información es el proceso de organizar, evaluar, presentar,
comparar los datos en un determinado contexto, controlando su calidad, de manera
que esta sea veraz, oportuna, significativa, exacta y útil, como afirma Fernández
(2006) adopta una forma física por ello es tangible, se refleja en documentos, se
percibe como una acumulación de datos, lógica y adecuadamente estructurados,
adicional a esto se registra en diversos formatos y por tanto, se puede almacenar.
36
En la actualidad la Gestión de la información de acuerdo con Arévalo (2007) tiene
como soporte de cobertura la incorporación de tecnologías de la información de
última generación que simplifican su gestión y que como resultado en muchas
empresas se han diseñado políticas para gestionar este recurso en beneficio de sus
necesidades e intereses.
Es primordial para esta época innovadora que desde todo ámbito; bien sea
académico, científico, social o tecnológico se tenga claridad en conceptos básicos
que son apoyo en la identificación de procesos y actividades que conducen a la
generación y gestión de nuevos conocimientos y que aportan para la elaboración
de este proyecto como, por ejemplo, los sistemas de información.
Los Sistemas de Información (SI) puede ser definidos según Barrera Ortiz (2017)
como la herramienta que contribuye a la generación de Información y Conocimiento
en diferentes sectores y se puede representar como una colección, procedimientos
y equipos diseñados, construidos, operados y mantenidos para recoger, registrar,
procesar, almacenar, recuperar y visualizar datos y tiene objetivos específicos como
el proporcionar información para la toma de decisiones, a partir del uso de métodos
y conocimiento interdisciplinar disponible.
Basados en las anteriores definiciones se puede resaltar la importancia que tiene el
hecho de disponer de un sistema que por su utilidad al recoger, registrar, procesar,
almacenar, recuperar y visualizar información apoyara en el proceso de elaboración
de fichas técnicas que describen los microorganismos de tal manera que para los
usuarios sea más fácil llegar a una identificación.
37
5.2 LA INFORMACIÓN COMO HERRAMIENTA
Para que la información pueda utilizarse y genere ventajas competitivas según
Capote (2003) debe tener tres características básicas: completa, confiable y
oportuna, para obtener información estructurada que permita describir de manera
detallada, organizada y correcta un objeto, un microorganismo o cualquier unidad
de información dándole un valor agregado.
Cuando se habla de información es necesario mencionar Gestión de la información
ya que es el proceso que permite llegar a la toma de decisión por parte de
investigadores. De acuerdo con el plan estratégico de TI del gobierno colombiano
(2015) para gestionar información se deben tener herramientas orientadas al
seguimiento, análisis y a la presentación y publicación de información según sus
ciclos de vida y de acuerdo con los diversos públicos o audiencias, es importante
contar con las condiciones planteadas en la ilustración.1:
Las condiciones planteadas en esta figura evidencian la importancia que tiene el
manejo y la gestión de la información desde su origen, esto con el fin de brindar a
los usuarios calidad en los servicios.
38
Ilustración 1. Condiciones para la gestión de la información
Fuente: elaboración propia
En cuanto a la apropiación de la información para su gestión debe existir claridad
en los criterios presentes a la hora de tomar decisiones frente a la resolución de un
problema, es de gran importancia concientizarse de que a partir de la obtención de
datos precisos se puede lograr implementar en cada organización o unidad
herramientas que sirvan para el aseguramiento de mejoras en tiempos y servicios,
posicionando de esta manera la organización, por esta razón se deben tener en
cuenta los criterios que a continuación se describen en la ilustración.2:
39
Ilustración. 2. Criterios de la información
Fuente: elaboración propia
Cabe anotar que en la actualidad la información es un gran recurso ya que se ha
hecho digital y permite acceder al conocimiento de una forma más efectiva,
haciendo que los datos y registros se conviertan en herramienta para el uso y
estructuración de nuevas estrategias a nivel de comparación e identificación de
documentos, imágenes y cepas entre otros, de tal manera que desde el quehacer
del profesional en Ciencia de la Información los usuarios tengan un mayor
entendimiento desde un enfoque técnico de documentación, es decir desde la
recolección, codificación, clasificación, selección, utilización y difusión.
Para dar el enfoque de documentación se debe realizar el levantamiento de toda la
información referente a los microorganismos etiológicos de la meningitis para la
elaboración de fichas técnicas, dicha información debe ser previamente clasificada,
organizada y codificada para luego ser indexada y quedar disponible para su
adecuado uso.
Oportunidad
Confiabilidad
Completitud Pertinencia
Utilidad
40
La información de los microorganismos aportan un valor muy importante para los
laboratorios y hospitales pues es base fundamental en la identificación y diagnóstico
de enfermedades pasando a formar parte de los activos del laboratorio, de acuerdo
con la norma ISO 55001 (2014) se refiere a activos como centro de negocio,
independientemente de si éstos son financieros, físicos u organizativos estos
contribuyen a mejorar los resultados operativos, el rendimiento y, en última instancia
mejorar sus resultados.
En el marco de la seguridad de la información según ISO 27001, consiste en la
preservación de su confidencialidad, integridad y disponibilidad, así como de los
sistemas implicados en su tratamiento, dentro de una organización y sus bases
están constituidas por la confidencialidad, la integridad y la disponibilidad “acceso y
utilización de la información y los sistemas de tratamiento de la misma por parte de
los individuos, entidades o procesos autorizados cuando lo requieran”.
Es importante para la gestión y la seguridad de la información tener un responsable
directo, de igual manera se debe reflexionar respecto a la importancia que tiene
entender, identificar, aplicar e implementar técnicas que lleven a la valoración,
inventario, identificación y protección de los diversos activos existentes con miras a
la creación de nuevos servicios de información, apoyando así la generación de
nuevo conocimiento.
41
5.3 METADATOS:
Con el fin de encontrar información valiosa en cualquier área del conocimiento se
hace necesaria la organización y estructuración de la información de tal manera que
se pueda preservar y asegurar el acceso a ella a largo plazo, esto se logra a través
de los metadatos con los que se obtiene la descripción de una colección o un
recurso.
La importancia que tiene el uso de metadatos en la actualidad surge por la
necesidad de contar con métodos que permitan el fácil acceso y recuperación de
información desde cualquier ámbito bien sea académico, científico, laboral o social,
por lo tanto, es también preciso tener claridad en su definición y usos o aplicaciones:
Una de las definiciones según Howe (1993), el término metadato fue acuñado por
Jack Myers en la década de los 60 para describir conjuntos de datos. La primera
acepción que se le dio (y actualmente la más extendida) fue la de dato sobre el dato,
ya que proporcionaban la información mínima necesaria para identificar un recurso.
Con estos descriptores altamente estructurados, se listan diferentes atributos que
ayudan a un acceso más amigable desde las diferentes áreas del conocimiento
aumentando la posibilidad de recuperación de datos y registros, a través de campos
de fácil comprensión para las personas que realicen consultas.
42
Otro concepto según Lacombe (2007) es que los metadatos son datos estructurados
que describen y permiten encontrar, comprender o preservar documentos
archivísticos a lo largo del tiempo. En otras palabras, son elementos que siempre
están disponibles y apoyan la accesibilidad a los documentos y su preservación.
Basados en lo expuesto anteriormente con la implementación de metadatos como
herramienta de búsqueda, se busca proporcionar a los usuarios una manera más
práctica para la recuperación de información digital, dando diferentes opciones de
acceso, siendo clave para el diseño de la guía que se pretende construir para lo que
se necesita que cada microorganismo sea descrito con: Nombre de la bacteria, virus
u hongo, grupo taxonómico al que pertenece, codificación, especificaciones
morfológicas y el registro del autor de la ficha en la que reposa la información junto
con la fecha de actualización.
Tipo de microorganismo Género y especie
Bacterias Hemophilus influenzae
Neisseria meningitidis
Streptococcus pneumoniae
Hongo levaduriforme Cryptococcus neoformans
Hongo filamentoso Aspergillus fumigatus
Tabla .1 Ejemplo de metadato Fuente: Elaboración propia
En la Tabla 1. Se puede observar un ejemplo en donde se encuentra como metadato
intrínseco el tipo de microorganismo su género y especie, esta información es
relevante a la hora de identificar una cepa ya que permite realizar la descripción que
favorecerá al usuario al que se le debe orientar en los métodos de búsqueda y
43
recuperación de la información de tal manera que tenga un amplio acceso a los
registros relacionados con los microorganismos, dando visualización a todos los
campos indexados en la ficha técnica.
Los metadatos pueden servir como herramienta descriptiva y de búsqueda con la
que se pretende facilitar de manera práctica la recuperación de la información a
nivel digital, convirtiéndose en un elemento clave para compartir datos, dando
características propias de los recursos recuperados,
Respecto a los tipos, según tutorial de la biblioteca de Cornell hay tres tipos de
metadatos; Metadatos descriptivos cuyo objetivo es la descripción e identificación
de recursos de información tanto a nivel del sistema como a nivel web permitiendo
la búsqueda y recuperación de información; Metadatos estructurales, que
proporcionan la navegación y presentación de los recursos electrónicos y
proporcionan información como página, capítulo, sección, relacionan materiales,
unen archivos y textos relacionados; Metadatos administrativos, facilitan la gestión
y procesamiento de las colecciones digitales.
Para este proyecto, únicamente se tendrán en cuenta los tres tipos descriptivos,
estructurales y administrativos esto en razón a que es necesario realizar una
descripción física de los microorganismos, se deben relacionar y unir archivos como
por ejemplo imágenes y textos relacionados a la identificación de microorganismos
etiológicos de la meningitis al igual que se deben tener datos técnicos como
actividades de preservación de la información.
44
5.3.1 METADATOS Y ORGANIZACIÒN DEL CONOCIMIENTO
El ser humano siempre ha estado en busca de nuevo conocimiento de acuerdo con
sus necesidades, es por esta razón que es de gran importancia generar sistemas
que contribuyan a la adecuada organización, recuperación y preservación d
apoyados en la identificación de los metadatos y de esta manera lograr llegar a un
Sistema de Organización del Conocimiento SOC.
La organización del conocimiento según Torres (2008) pasa a ser una variedad de
esquemas que organizan, manejan y recuperan información, contribuyendo de esta
manera a la promoción de nuevos saberes acordes a las necesidades de los
usuarios desde cualquier área de la investigación.
Con la implementación del diseño de una guía para la identificación de
microorganismos es de vital importancia tener estructurada toda la información
referente a cada uno de los agentes desde su estructura, morfología, dimensiones,
y familia entre otros, que se convierten en herramienta descriptiva y de gran uso al
buscar la identificación de estos.
Para construir un SOC se debe seleccionar la información que se va a utilizar, esta
debe recopilarse en tablas como conjunto de datos específicos, para el uso y
comprensión del investigador, estudiante y profesores para identificar y diferenciar
los distintos temas a consultar, para este trabajo agentes microbianos que producen
la MBA.
45
En toda construcción de conocimiento es importante la elaboración de un esquema
de descripción documental como base a través de metadatos que apoyen un mejor
acceso a la información.
Los esquemas para organización del conocimiento según Hodge (2000) se pueden
clasificar en: Encabezamientos de materia, esquemas de clasificación, taxonomías,
esquemas de categorización y listas de relaciones –Thesauri, de esta manera el
SOC puede emplearse para obtener registros más descriptivos para las unidades a
nivel digital.
Para este proyecto, se tendrán en cuenta la descripción física de los
microorganismos que deben relacionarse entre sí tanto con imágenes como textos,
tablas, y toda información relevante para la identificación de microorganismos
etiológicos de la meningitis, estos registros son la base para el desarrollo de esta
guía y poder lograr hacer el comparativo de agentes etiológicos de la MBA.
5.4 CODIFICACIÓN
Para la identificación de microorganismos etiológicos de la meningitis es necesario
contar con un mecanismo de codificación que apoye la recuperación de la
información de estos, y de esta manera poder tener un mejor acceso a la
información desde un lenguaje normalizado siendo este, otro de los usos que se
obtendrá con el diseño de la guía para la identificación de microorganismos
asociados a la meningitis bacteriana aguda a través de un esquema de descripción
documental.
46
Al implementar el diseño de una guía para la identificación de microorganismos se
debe hacer énfasis en la importancia que tiene saber el significado de un sistema
de codificación ya que va a ser el insumo de mayor relevancia a la hora de hacer la
recuperación de información de los microorganismos, por esta razón a continuación
se expresaran algunas definiciones:
Un sistema de codificación es según González es un conjunto de normas que
permite identificar productos y el sistema por excelencia para identificación de
bienes o productos es el código de barras, por otra parte, en la Guía de Identificación
GS1 Colombia existen otro tipo de codificaciones como La Matriz de Datos que es
muy utilizado en la industria médica, El Código QR para acceder a información a
través de dispositivos móviles o a través de enlaces en página WEB.
Este método no es muy funcional para la identificación de microorganismos pues no
ofrece la posibilidad de modificarse para actualizar información, es necesario
establecer un sistema que sea flexible y se puedan modificar los contenidos de ser
necesario.
A nivel internacional se tiene el sistema de Clasificación Internacional de
Enfermedades, en el que según Gómez Rivadeneira (2015) en este sistema se hace
énfasis en la codificación de enfermedades. Ahora bien, para una buena
clasificación internacional (ONU/OMS) dentro de las características técnicas
descritas en el CIE se deben tener en cuenta la utilización de un vocabulario
controlado de manera tal que facilite la comunicación entre profesionales, deben
47
responder a las necesidades de los usuarios a través de manuales de instrucciones,
índices de codificación, listas tabulares, manuales y capacitación disponibles en
diferentes formatos.
A nivel local la Colección de Microorganismos de la PUJ cuenta con una
clasificación taxonómica con pruebas bioquímicas, de igual manera están
catalogados por código, nombre, familia, género y especie con sus respectivos
porcentajes de identificación y cantidad de cepas. Esta clasificación permite el
levantamiento de fichas técnicas basadas en la clasificación ya existente de tal
manera que no se genere duplicidad en la información.
Para el diseño de la guía es necesario desarrollar un sistema de clasificación que
permita seguir un lenguaje controlado para usuarios de cualquiera de las
especialidades en el área de la salud, en el Cepario de Microorganismos de la PUJ
no tienen una codificación estándar, solamente se utiliza el dato del día en que se
recoge la muestra, por esta razón no se puede recurrir a esta codificación.
Para este proyecto se ha previsto para la parte de codificación, identificar cada
microorganismo con su abreviatura de manera tal que, en adelante, tanto para el
laboratorio como para el Hospital se genere la cultura de identificación de los
microorganismos con este símbolo. De igual manera se genera el lenguaje
controlado que es muy importante para esta área de la salud.
48
Tabla 2 Codificación Microorganismos Fuente: Elaboración propia
Con este tipo de codificación que se muestra en la Tabla.2 se espera tener una
buena acogida por parte de los profesionales en el área de la salud ya que ofrece
un lenguaje técnico de fácil manejo para ellos convirtiéndose en universal esta
codificación. Es preciso tener cuidado en la escritura del nombre de los
microorganismos ya que por norma general se debe tener ese formato.
5.5 MENINGITIS AGUDA BACTERIANA
Para el desarrollo de este proyecto es de gran importancia conocer que es la
Meningitis Aguda Bacteriana, por esta razón a continuación se dará una definición
y se describirá su importancia en el área de la salud:
La meningitis según Lovo (2015) es una enfermedad infecciosa causada por un
pequeño grupo de bacterias, virus y hongos que se caracteriza por un proceso
inflamatorio de las capas meníngeas que recubren el cerebro y la médula ósea. Los
síntomas característicos de este padecimiento de acuerdo con Herrera (2010) son:
fiebre alta, dolor de cabeza intenso, vómito brusco y rigidez de nuca.
ABREVIATURA MICROORGANISMO
Sau Staphylococcus aureus
Hae Haemophilus influenza
Kpn Klebsiella pneumoniae
Spn Streptococcus neumoniae
Lmn Listeria monocytogenes
Nem Neisseria Meningitdis
Cyn Cryptococcus neoformans
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La meningitis es el síndrome infeccioso más importante del sistema nervioso central
para su diagnóstico, pronóstico y tratamiento es de gran importancia tener claridad
en los agentes etiológicos de la infección, ya que muchas veces tienen
presentaciones clínicas similares.
El diagnóstico según la OMS puede establecerse a partir de la exploración física,
seguida de una punción lumbar que muestra un líquido cefalorraquídeo (LCR)
purulento, a veces se puede observar la bacteria en el examen microscópico del
LCR. Esta enfermedad puede ser mortal y debe considerarse siempre como una
urgencia médica, hay que ingresar al paciente en un hospital o centro de salud,
aunque no es necesario aislarlo.
El inicio del tratamiento antes de la punción puede dificultar el crecimiento de la
bacteria en el cultivo de LCR y la confirmación del diagnóstico. Es por esto por lo
que en la actualidad los médicos que sospechan de la presencia de la meningitis
dan inicio a un tratamiento con antibióticos sin el conocimiento del agente etiológico
mientras dan espera a los resultados de laboratorio, lo cual puede traer
consecuencias como: daños neurológicos ocasionados por la ausencia de un
tratamiento específico del agente infeccioso en un menor tiempo.
Otra consecuencia puede ser la resistencia al antimicrobiano, que pone en riesgo la
prevención y el tratamiento de la infección. Por esta razón es importante reducir el
problema valiéndonos de una herramienta que oriente al diagnóstico que nos brinde
resultados específicos y eficientes en un menor tiempo.
50
6 MICROORGANISMOS COMO DOCUMENTOS
Hasta este punto se ha dado a entender la importancia de ver a los microorganismos
como un documento para que de esta forma las personas que requieran hacer
consultas obtengan una lectura de carácter descriptivo logrando así una apropiada
identificación de las cepas.
Para este proceso debe ser de gran importancia tener en cuenta los
microorganismos más comunes que originan la MBA como lo son: Neisseria
meningitidis, Listeria monocytogenes, Haemophilus Influenza, Klebsiella
pneumoniae.
Este filtro sirve para hacer una colección especializada en el área de la MBA
diferenciando como primera medida los microorganismos etiológicos. Pues la
importancia se debe a que como afirma Arthur (2011) pueden ingresar por vía
respiratoria, a través de la sangre o emigrar a partir de procesos infecciosos en piel,
oídos, nariz y órganos cercanos al Sistema Nervioso central, haciendo que
contactos simples como un beso o la tos sean las principales fuentes de contagio
letal en muchos casos.
En la Tabla 3. Se puede observar la descripción de los agentes etiológicos de la
MBA por grupos de edad.
51
Tabla 3 Agentes etiológicos de la MBA Fuente: Guía para la vigilancia por laboratorio de meningitis bacteriana aguda
(2014)
Para identificar el microorganismo etiológico de la MBA debe analizarse el LCR
(Líquido cefalorraquídeo) el cual se encuentra en una cavidad rodeado de las capas
meníngeas. El examen de rutina se denomina análisis Microbiológico y citoquímico
del LCR, este análisis consta de cuatro parámetros básicos, que se pueden ver en
la ilustración 3.
En la gráfica se muestra en primer lugar, LA COLORACIÓN DE GRAM que es
una de las mejores herramientas diagnósticas porque orienta sobre el posible tipo
de microorganismo, siendo este un insumo importante para la identificación del
agente causante de la enfermedad y es relevante a la hora de identificar y
comparar agentes microbianos.
52
Ilustración 3. Parámetros básicos para el análisis del LCR
Fuente: elaboración propia
Es así como a nivel de bacterias los clasifica en 4 grupos dependiendo del Color y
la forma que toman ante el colorante: Como se puede observar en la ilustración 3.
Hay diferencias en los microorganismos dependiendo su tipología, Cocos Gram
positivos, Cocos Gram negativos, Bacilos Gram positivos, Bacilos Gram negativos.
53
Imagen 1 Bacterias con tinción de Gram Fuente: ASM Microbelibrary.org
Todos estos microorganismos se caracterizan porque disminuyen la glucosa,
aumentan las proteínas y aumentan una célula que se llama neutrófilos.
Es preciso tener claridad en que los virus tienen por característica que no se
colorean con el Gram (no se ven), solamente aumentan las proteínas, y a diferencia
de las bacterias no afectan la glucosa y aumentan la población de células
denominada linfocitos. Por su parte los hongos ante el Gram se visualizan como
estructuras circulares.
Basados en lo anterior se puede ver cómo los microorganismos con toda la
información que arrojan desde los resultados de las pruebas que se les realizan
pueden ser catalogados, clasificados, gestionados y administrados como parte de
54
una colección a través de una herramienta que a partir de metadatos permite el
acceso y recuperación de una manera confiable.
La información derivada de imágenes también es insumo de gran importancia para
la identificación de microorganismos dándoles un valor de activo para el laboratorio,
la colección o la entidad que lo genera, de igual forma la codificación que se le
asigne ayudará en el manejo de un lenguaje estructurado y de mayor usabilidad.
En conclusión, los microorganismos se pueden ver como documentos ya que sin
importar en qué formato se encuentren pasan a ser elementos que proveen
información que se puede gestionar y administrar dándole un valor único en la
generación de nuevo conocimiento. Al tomar un microorganismo y extraer toda la
información taxonómica, morfológica macro y microscópica, con todas sus
características se logrará obtener una visualización del agente microbiano y será
mucho más fácil llegar a identificarlo por sus características gracias a los metadatos
descriptores que se pueden generar.
55
6. METODOLOGÍA
El tipo de enfoque que se desarrollará en este proyecto será mixto que según,
Johnson y Onwuegbuzie (2004) definieron los diseños mixtos como “(…) el tipo de
estudio donde el investigador mezcla o combina técnica de investigación, métodos,
enfoques, conceptos o lenguaje cuantitativo o cualitativo en un solo estudio” (p. 17).
Con estas técnicas se pretende diseñar una guía para la identificación de
microorganismos asociados a la meningitis bacteriana aguda a través de un
esquema de descripción documental.
La construcción de esta guía será a partir de imágenes que se encuentran
vinculadas a unos descriptores tales como: taxonomía, fundamentos y resultados
de pruebas microbiológicas utilizadas en el diagnóstico, que conllevan a una
estructura de validación. Este proyecto se desarrollará teniendo en cuenta las
siguientes etapas:
6.1 EVALUACIÓN DE LAS NECESIDADES DE LOS USUARIOS
El producto se quiere entregar a estudiantes, investigadores y profesionales de la
salud que trabajen o investiguen acerca del diagnóstico de enfermedades
infecciosas en la Pontificia Universidad Javeriana. Una de las bases para de la
elaboración de este proyecto son las necesidades y preferencias de información por
lo que se tendrán en cuenta los siguientes factores:
56
Tabla de evaluación de necesidades de los usuarios
Tabla 4. Evaluación de necesidades de los usuarios
Fuente: Elaboración propia
En esta fase se aplicará la técnica de encuesta a docentes, estudiantes e
investigadores de la Facultad de Ciencias de la Pontificia Universidad Javeriana,
con el fin de recolectar datos sobre los requerimientos de los usuarios, evaluar y
comprender los inconvenientes presentados en lo relativo a necesidades de
búsqueda y recuperación de la información.
Para la implementación de las encuestas y entrevista a cada uno de los grupos que
se trabajaron, se obtuvo la opinión de 24 estudiantes, 9 profesionales en el área de
la salud y una entrevista, consolidando una muestra poblacional de 34 usuarios.
Factor Descripción
Herramientas y servicios
● La herramienta debe permitir agilizar la investigación
● Poder visualizar los microorganismos de una manera muy
cercana a la realidad.
Material gráfico
● Información completa sobre los microorganismos
etiológicos de la especialidad (Meningitis) ● Clasificación del material, tipologías de Microorganismos
Aporte en innovación
● Hipertextualidad: característica que hace referencia a la
información vinculada para generar un contexto. Por
ejemplo, que cuando se señale un microorganismo se vea
vinculación a una ficha con descriptores como taxonomía y
pruebas utilizadas en el diagnóstico microbiológico.
57
6.2 DESCRIPCIÓN DE LOS MECANISMOS DE RECOLECCIÓN
6.2.1 La encuesta
Para el desarrollo del presente proyecto se tendrán en cuenta las percepciones de
los usuarios de los laboratorios de investigación de enfermedades infecciosas de la
Facultad de Ciencias de la Pontificia Universidad Javeriana de quienes se tomará
directamente la información para ser analizada.
Esta técnica según Anguita (2003) es ampliamente utilizada como procedimiento de
investigación, ya que permite obtener y elaborar datos de modo rápido y eficaz. De
acuerdo con lo anterior la herramienta de recolección para este trabajo será aplicada
como encuesta electrónica y para facilitar su análisis se realizarán en su gran
mayoría preguntas cerradas.
Con esta técnica se puede lograr la obtención de datos sobre una gran variedad de
temas a través de la información que se recoge de modo estandarizado mediante
un cuestionario en donde tanto las instrucciones como la formulación de las
preguntas son iguales, esto permite ver los puntos de vista de los usuarios cuando
se enfrentan a la identificación y diagnóstico de una enfermedad infecciosa por lo
tanto se realizarán encuestas en línea.
6.2.2 La entrevista
Se aplicará una entrevista de tipo cualitativo a uno de los profesionales del grupo
de enfermedades infecciosas de la facultad de ciencias de la PUJ, como la definen
(Hernández Sampieri, Fernández Collado y Baptista Lucio 2010, p.423) “puede
58
hacerse preguntas sobre experiencias, opiniones, valores y creencias, emociones,
sentimientos, hechos, historias de vida, percepciones, atribuciones, etcétera.” Esta
técnica permitirá conocer y valorar el trabajo del grupo de enfermedades infecciosas
de la PUJ y su percepción.
6.3 PRESENTACIÓN DE LA RECOLECCIÓN DE DATOS (TABULACIÓN Y ANÁLISIS)
Los mecanismos de recolección de datos en la Facultad de Ciencias de la Pontificia
Universidad Javeriana fueron dos la encuesta en línea dirigida a profesionales en el
área de la salud del grupo de enfermedades infecciosas y a estudiantes y la
entrevista al coordinador de la Especialización en Microbiología Médica de la PUJ,
el siguiente paso es la tabulación y análisis de los resultados en los que se
evidenciaron las necesidades de información de los usuarios al momento de realizar
sus pruebas y consultas en el laboratorio.
El objetivo de esta investigación es poder diseñar una guía para la identificación de
microorganismos asociados a la meningitis bacteriana aguda a través de un
esquema de descripción documental que sirva como orientación a estudiantes,
investigadores y profesionales de la salud, teniendo como estrategia la definición
detallada de metadatos que apoyen esta actividad en torno a los microorganismos
causantes de la MBA.
Otro de los objetivos es el levantamiento de fichas técnicas de los microorganismos
y la estructuración de equivalencias de validación de acuerdo con los resultados en
laboratorio para hacer el comparativo de los agentes etiológicos de la MBA.
59
6.3.1 Encuesta Para Profesionales en el Área de la Salud
La aplicación de esta encuesta se hizo online dejándola disponible durante el tiempo
necesario de tal manera que los docentes participaran y proporcionaron la
información en el momento que ellos pudieran realizarla de manera tranquila. Por
tal motivo, se obtuvo un total de 9 respuestas obedeciendo esta cantidad, al 100%
del grupo seleccionado.
Pregunta 1. ¿A qué carrera pertenece?
Gráfica 2. Resultados pregunta 1 de la encuesta para profesionales en el área de la salud
Fuente: elaboración propia
En esta gráfica se muestra que el 70% de profesionales, corresponden a la
carrera de Bacteriología seguido con un 20% pertenecientes a la carrera de
Medicina y finalmente con un 10% de Microbiología. Los resultados evidencian
la participación más alta en los profesionales de Bacteriología.
Pregunta 2. Seleccione su rango de edad
60
Gráfica 3. Resultados pregunta 2 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
El 78% de los profesionales en el área de la salud pertenecen al rango establecido
en más de 32 años, seguido del 11% comprendido entre los 30 y los 32 años, de
igual manera el siguiente grupo con el 11% el cual corresponde entre los 21 y 23
años. Respecto al primer resultado en el que están la mayoría de los profesionales,
obedece a que son los que tienen mayor experiencia y por lo tanto cuentan con más
destrezas y capacidades en el análisis microbiológico y bioquímico de muestras
biológicas, lo cual les permite entender la importancia clínica de los resultados en el
momento de hacer el diagnóstico, seguimiento, manejo y tratamiento del paciente.
Esto es un gran aporte ya que sus conocimientos sirven como base sólida para la
guía a desarrollar.
Pregunta 3 Seleccione su género
61
Gráfica 4. Resultados pregunta 3 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
El 78 %, de los encuestados pertenecen al género femenino seguido del 22%
correspondiente al género masculino. Como lo demuestra el resultado de la primera
pregunta cuando se refiere ¿a qué carrera pertenece? El porcentaje más alto lo
obtuvo la carrera de Bacteriología esto obedece a que históricamente el género
femenino es el que ha liderado el ingreso a este programa.
Pregunta 4 ¿Cuál de los siguientes métodos de identificación de
microorganismos utiliza usted?
Gráfica 5. Resultados pregunta 4 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
62
En la guía para la identificación de microorganismos asociados a la meningitis
bacteriana aguda se tendrán en cuenta los métodos de medio de cultivo,
microscopia y pruebas bioquímicas para la elaboración del esquema de descripción
documental, ya que son los más utilizados por los profesionales en el área de la
salud que están especializados en el diagnóstico de enfermedades como la MBA,
esto se puede observar en la gráfica 5 en donde el 33% de la población utiliza como
método de identificación de microorganismos los medios de cultivo y las pruebas
bioquímicas y el 17 % usa microscopia. En otros resultados obtenidos las pruebas
moleculares y de aglutinación también son utilizadas, pero en menor porcentaje, sin
embargo, se deben tener en cuenta en la elaboración de la guía con el fin de obtener
un resultado más preciso.
Pregunta 5 ¿Al momento de identificar microorganismos cuál de los
siguientes niveles de complejidad ha tenido para identificarlo?
Gráfica 6. Resultados pregunta 5 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
63
Gráfica 7. Resultados pregunta 5 de la encuesta para profesionales en el área de la salud
Fuente: elaboración propia
Gráfica 8. Resultados pregunta 5 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
En las gráficas 6,7 y 8 uno de los problemas más importantes y comunes en la
atención médica de una meningitis, es brindar un diagnóstico, pronóstico y
tratamiento de certeza, por esta razón resulta fundamental el reconocimiento
preciso y rápido del agente etiológico, en la gráfica 6 el 56% de la población indica
que se le ha dificultado la identificación debido a los cuidados que hay que tener
64
durante el proceso de la técnica utilizada, la lectura de paneles, trabajar con
muestras estériles, la estructura, el número posible y la similitud entre ellos.
Teniendo en cuenta esto una posible solución a este problema es la implementación
de la guía propuesta, la cual permitirá diferenciar gran cantidad de microorganismos
ya que se basará en el uso de descriptores, metadatos específicos y codificación
para cada uno de los probables causantes de la MBA, para obtener resultados más
eficaces y reducir el nivel de complejidad.
Pregunta 6 ¿Cuáles son las fuentes que utiliza usted para la identificación de
microorganismos de una manera eficiente?
Gráfica 9. Resultados pregunta 6 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
En el proceso de identificación el profesional debe hacer un buen análisis crítico en
el momento de escoger el tipo de prueba que realizará, además de esto para
65
comprobar que los resultados de los métodos que usa correspondan con los de
otras pruebas y con su sospecha diagnóstica debe comparar con controles de
calidad estrictos. En la gráfica 9 están señaladas las opciones que fueron dadas en
la encuesta realizada, las que no están marcadas corresponden a las respuestas
alternativas dadas por los profesionales. En cuanto a las opciones propuestas se
puede observar que el 31% de la población prefiere las bases de datos, lo que
demuestra su preferencia por lo digital y que también se evidencia en las otras
respuestas como los videos de YouTube, algoritmos clínicos y aparatos.
Basados en estos resultados se hace necesario implementar estas herramientas en
la guía, como videos que de manera didáctica apoyen en la identificación de los
microorganismos y que de igual forma contextualicen a los usuarios en temas
referentes a la MBA.
Pregunta 7 Usted considera que una guía basada en un esquema de
descripción documental (entendiendo como descripción documental, toda la
información adicional que se pueda tener de los microorganismos como:
nombre, familia, género, tamaño etc.), ¿serviría como orientación en la
identificación de microorganismos etiológicos de la Meningitis?
66
Gráfica 10. Resultados pregunta 7 de la encuesta para profesionales en el área de la salud
Fuente: elaboración propia
Gráfica 11. Resultados pregunta 7 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
De acuerdo con los resultados obtenidos en esta pregunta la implementación de la
guía para la identificación de microorganismos asociados a la meningitis bacteriana
aguda a través de un esquema de descripción documental tendría un gran impacto
para los usuarios ya que daría apoyo en el proceso de identificación de
enfermedades infecciosas como la MBA.
Dentro de la justificación a las respuestas dadas por parte de los encuestados, se
encuentran ventajas en la implementación de la guía tales como: con un 67% la
guía serviría como herramienta eficaz en la orientación durante el proceso de
identificación de microorganismos, y el resto considera que es buena por la clase
67
de contenidos que ofrece y la unificación de conceptos a través de un lenguaje
controlado.
Pregunta 8 ¿De los siguientes grupos de información cuál cree que sería más
funcional si contara con una herramienta de orientación que apoye la
identificación y diagnóstico de una enfermedad infecciosa?
Gráfica 12. Resultados pregunta 8 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
El profesional le da un nivel de importancia a las diferentes opciones según lo que
le sirve en el área donde se desempeña normalmente, como la mayoría de los
encuestados pertenecen a programas de Bacteriología y Microbiología las opciones
de tratamiento y pasos técnicos no les dan prioridad, sin embargo, para medicina
estos dos aspectos son muy importantes debido a su ejercicio profesional y a las
pocas destrezas que tienen en el laboratorio. Por estas razones se tendrán en
cuenta la epidemiologia, el algoritmo de los pasos técnicos, la morfología macro y
microscópica, los pasos y prueba de diagnóstico, la taxonomía de los
microorganismos y el tratamiento, para el desarrollo de la guía.
68
Pregunta 9 ¿A la hora de dar un tratamiento a una enfermedad infecciosa
considera importante la identificación del género y especie del
microorganismo etiológico de la Meningitis?
Gráfica 13. Resultados pregunta 9 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
En la gráfica se evidencia la importancia del diagnóstico diferencial a la hora de dar
un tratamiento, como una de las razones por las cuales se quiere realizar la guía se
basa en reducir la tasa de pacientes con MBA que han muerto por qué no se les da
el tratamiento adecuado a tiempo, la información acerca de los distintos tratamientos
que se pueden brindar según la especie del microorganismo, se tendrá en cuenta
en el momento de realizar el levantamiento de fichas técnicas ya que existen
microorganismos que pertenecen al mismo género, pero que varían de especie,
esto ayudaría a estructurar la guía.
Pregunta 10 ¿A usted le gustaría contar en su laboratorio con una guía en la
que a través de descriptores pueda acceder a registros de material
microbiológico?
69
Gráfica 14. Resultados pregunta 10 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
La gráfica 13 muestra que los profesionales en el área de la salud se podrían ver
beneficiados si contaran con una guía en sus laboratorios, lo que significa que se
podría implementar no solo en las clases de microbiología, sino que también en los
laboratorios de investigación o en el hospital, con el fin de apoyar el diagnóstico
clínico y el desarrollo intelectual y académico tanto en la universidad como en la
HUSI.
Pregunta 11 ¿Usted considera que una guía que le permita diferenciar un
Microorganismo a través de imágenes e información documental le ayudara a
mejorar tiempos de identificación y de diagnóstico?
70
Gráfica 15. Resultados pregunta 11 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
En torno al porcentaje obtenido según la gráfica 11 reafirma la utilidad de la
implementación de una guía de orientación para la identificación de
microorganismos etiológicos de la MBA.
Pregunta 12. Si utilizara una guía de orientación en la identificación de
microorganismos ¿cuáles de los siguientes registros descriptores le gustaría
que tuvieran los microorganismos?
Gráfica 16. Resultados pregunta 12 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
71
Con los resultados de esta pregunta se puede definir la información que los
profesionales consideran relevante y necesaria a la hora de realizar la identificación
de microorganismos causantes de la MBA. Los metadatos utilizados para
estructurar la guía son: información acerca del control de calidad, datos
epidemiológicos, descripción e imágenes de la morfología macro y microscópica,
explicación detallada de los procedimientos microbiológicos que se utilizan para la
identificación del microorganismo con sus fundamentos, falsos positivos o negativos
para las pruebas, medicamentos con su respectivo mecanismo de acción,
taxonomía y tratamiento.
Pregunta 13 ¿Cómo le gustaría que estuviera presentada la información de la
Guía?
Gráfica 17. Resultados pregunta 13 de la encuesta para profesionales en el área de la salud Fuente: elaboración propia
En la gráfica se puede observar que los profesionales prefieren las ayudas visuales
por lo que en la guía se utilizaran imágenes, gráficas, algoritmos, tablas y videos
para organizar la información y hacer la guía más didáctica.
72
6.3.2 Conclusión Encuesta Para Profesionales en el Área de La Salud
De acuerdo con los resultados obtenidos en las encuestas aplicadas a los
profesionales en el área de la salud, se evidencia que en su mayoría tienen un
recorrido profesional que le permite tener más destrezas en la realización de
pruebas para identificar microorganismos; sin embargo ven la necesidad de la
implementación de una guía para la identificación de microorganismos asociados a
la meningitis bacteriana aguda en la que se tengan en cuenta los métodos de medio
de cultivo, microscopia y pruebas bioquímicas.
Estos resultados conllevan a la exhaustividad en la búsqueda de metadatos
descriptores, para que, a través de la elaboración del esquema de descripción
documental, se elabore la guía que les permita obtener mejores resultados en
menor tiempo frente al diagnóstico de enfermedades como la MBA.
6.3.3 Encuesta para estudiantes
Se realizó La aplicación de encuesta online a estudiantes de los programas de
Bacteriología y Microbiología obteniendo como resultado un total de 24 respuestas.
Pregunta 1. ¿A qué carrera pertenece?
73
Gráfica 18. Resultados pregunta 1 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
En esta gráfica se muestra que el 54% de estudiantes, corresponden a la carrera
de Bacteriología seguido con un 46% perteneciente a la carrera de Microbiología.
Los resultados evidencian la participación más alta en los estudiantes de
Bacteriología.
Pregunta 2 Seleccione su rango de edad
Gráfica 19. Resultados pregunta 2 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
74
En la gráfica 18 se observa que el mayor porcentaje de los estudiantes se encuentra
en el rango de edad entre los 18 – 20 años, son estudiantes con poca experiencia
y que se encuentran en la etapa de aprendizaje, el porcentaje que esta entre el 33%
y el 8% por su rango de edad puede contar con más experiencia, destrezas y
capacidades en el análisis microbiológico y bioquímico de muestras biológicas. Esto
es importante ya que con base en sus necesidades de conocimientos se puede
analizar cuáles son sus falencias y poderlas estructurar en la guía a desarrollar.
Pregunta 3 Seleccione su genero
Gráfica 20. Resultados pregunta 3 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
En la gráfica 16 se puede observar que el 75 %, de los encuestados pertenecen al
género femenino seguido del 22% correspondiente al género masculino. Como lo
demuestra el resultado de la primera pregunta cuando se refiere ¿a qué carrera
pertenece?
75
Pregunta 4 ¿Cuál de los siguientes métodos de identificación de
microorganismos utiliza usted?
Gráfica 21. Resultados pregunta 4 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
Si se comparan las respuestas de los estudiantes con las de los profesionales se
puede ver que los estudiantes desconocen las pruebas moleculares y de
aglutinación para realizar la identificación, por esta razón la guía servirá de gran
apoyo en las clases de microbiología.
Pregunta 5 ¿Al momento de identificar microorganismos cuál de los
siguientes niveles de complejidad ha tenido para identificarlo?
76
Gráfica 22. Resultados pregunta 5 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
En esta pregunta se ve que a los estudiantes se les dificulta la identificación de los
microorganismos debido a que hay gran variedad de estos y son muy similares en
cuanto morfología y metabolismo, por esta razón la implementación de la guía en
las clases de microbiología sería de gran ayuda.
Pregunta 6 ¿Cuáles son las fuentes que utiliza usted para la identificación de
microorganismos de una manera eficiente?
77
Gráfica 23. Resultados pregunta 6 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
Al comparar las fuentes utilizadas por los estudiantes para la identificación de
microorganismos con las utilizadas por los profesionales en el área de la salud se
evidencia que los estudiantes utilizan más los libros y los artículos científicos que
bases de datos y asesorías, probablemente porque desconocen la gran variedad de
herramientas digitales existentes. Con base en esto se puede decir que la guía
generaría un impacto innovador en los estudiantes y les puede ser de gran ayuda,
ya que, a diferencia de los libros, esta se podría modificar y actualizar
constantemente según el avance, desarrollo científico y condiciones
epidemiológicas.
Pregunta 7 ¿De los siguientes grupos de información cuál cree que sería más
funcional si contara con una herramienta de orientación que apoye la
identificación y diagnóstico de una enfermedad infecciosa?
78
Gráfica 24. Resultados pregunta 7 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
Debido a que los estudiantes se encuentran en proceso de aprendizaje para ellos
resulta fundamental contar con toda la información necesaria para realizar la
identificación de microorganismos, en la gráfica 20 se puede ver que el 31% le dio
prioridad a los pasos y pruebas de diagnóstico, ya que desconocen de distintos
métodos que les facilitan este proceso, el 24% escogió la morfología macro y
microscópica de los microorganismos debido a la gran variedad y la similitud que
hay entre ellos, la epidemiología, taxonomía y tratamiento también los consideran
importantes, por lo que se tendrán en cuenta todos estos factores en la elaboración
de la guía.
Pregunta 8 ¿A usted le gustaría que en su asignatura de microbiología se
implementara una guía que le permita identificar Microorganismos?
79
Gráfica 25. Resultados pregunta 8 de la encuesta para estudiantes
Fuente: elaboración propia
Como muestra la gráfica 21 la guía sería de gran apoyo en las clases de
microbiología, porque no solo sería una herramienta didáctica e innovadora, sino
que también serviría para retroalimentar y orientar a los estudiantes durante el
proceso de la identificación que resulta vital para desempeñarse en sus carreras.
Pregunta 9 ¿Usted considera que una guía que le permita diferenciar un
Microorganismo a través de información documental, le ayudará a mejorar
tiempos de diagnóstico?
Gráfica 26. Resultados pregunta 9 de la encuesta para estudiantes Fuente: elaboración propia
80
El 92% de la población estudiantil considera que la guía podría ayudar a reducir el
tiempo implementado en el diagnóstico diferencial de la MBA, probablemente
porque les ahorraría el tiempo de ir a buscar en libros que es lo que más utilizan y
comparar sus resultados, además de esto la orientación durante el proceso de
identificación los retroalimenta con distintos temas y les recuerda la importancia de
los controles que se deben tener para una identificación más segura y efectiva.
6.3.4 Conclusión Encuesta Para Estudiantes
De acuerdo con las respuestas manifestadas por los estudiantes, se puede
evidenciar la necesidad que ellos tienen de una guía que les permita seguir en clase
un paso a paso ya que esto les permitirá adquirir más conocimiento con un fácil
acceso a la información y también estarían gastando menos tiempo en laboratorio
para realizar la identificación de agentes microbianos.
A raíz de estos resultados se necesita hacer el levantamiento de metadatos
descriptores muy exactos en cuanto a los microorganismos, las fichas técnicas con
imágenes resultan un insumo para la elaboración de la guía de orientación para la
identificación de microorganismos etiológicos de la MBA, cabe resaltar que hoy en
día los jóvenes son más virtuales y prefieren la información a la mano, llegar a los
datos con un clic.
81
6.3.5 Entrevista - Coordinador Especialización Microbiología Médica.
En este apartado se plasma la información recopilada en la entrevista realizada al
Dr. Hugo Diez quien es Bacteriólogo con Especialización en microbiología médica
y Doctorado en Biología Molecular.
De acuerdo con la información proporcionada por el Dr. las dificultades que se
presentan en el diagnóstico de la MBA están muy relacionadas con lo que él llama
los resultados falsos positivos, es decir que un paciente puede tener meningitis,
pero a la hora de realizar las pruebas como existen muchas variables que afectan
los exámenes de laboratorio los resultados salen negativos, uno de los posibles
factores que contribuyen a esta problemática son los protocolos que utilizan en el
laboratorio.
En los hospitales es obligatoria la implementación de guías que orienten el
diagnóstico, por razones como la certificación y acreditación, la mayoría son
protocolos escritos que tienen como desventaja que son muy densos y largos, por
lo que resulta ser muy demorado llegar a unos buenos resultados. Por esta razón la
elaboración de una guía de orientación para la identificación de microorganismos
asociados a la MBA a través de un esquema de descripción documental sería de
gran apoyo para estudiantes y profesionales en el área de la salud.
En cuanto a los aspectos para tener en cuenta en el desarrollo del proyecto, Hugo
Diez afirma que los metadatos necesarios para poder realizar la identificación de
microorganismos causantes de la MBA deben consistir en imágenes microscópicas
82
de alta definición donde se puedan apreciar las diferentes características
morfológicas como forma, color según la tinción, tamaño y agrupación, imágenes
macroscópicas donde se detallen las características de las colonias como la
superficie, color, textura, borde ,entre otras, también el paso a paso de las pruebas
utilizadas acompañadas del fundamento de cada una, taxonomía de los distintos
agentes, para la parte clínica es importante tener información acerca de la
epidemiología, factores de riesgo, tratamiento, prevención, mecanismos de acción
de medicamentos e información básica de la enfermedad como síntomas, signos y
el proceso de infección.
6.3.6 Conclusión Entrevista - Coordinador Especialización
Microbiología Médica.
Analizando los resultados obtenidos en la entrevista se evidencia la necesidad de
profundizar en la información que se recopile, en el levantamiento de los datos para
la construcción de metadatos descriptores que se utilizaran en la estructuración de
la guía que permitirá la identificación de microorganismos causantes de la MBA.
De acuerdo con la información suministrada por el Dr. Diez se debe estar acorde a
la generación digital, pues hoy en día toda la información debe encontrarse de
manera tal que los usuarios puedan acceder y confiar en lo que se ofrece desde las
herramientas de apoyo en la academia y en la investigación, por lo que se hace
necesario trabajar de la mano con las nuevas tecnologías y metodologías que
apoyen el crecimiento a nivel del conocimiento.
83
La información es una de las herramientas más necesarias para que surjan y
avancen nuevas investigaciones a nivel de salud, es por esta razón que se hace
necesaria la implementación de la guía ya que favorece según el Dr. Diez muchos
aspectos en el área clínica tales como mejoras en tiempos de identificación de los
agentes microbianos e inclusive como se habla de un lenguaje controlado apoyaría
mucho en la certificación tanto de la Facultad de Ciencias a nivel académico, como
del Hospital San Ignacio ante el Ministerio de salud ya que hasta el momento no
existe una codificación universal como la que se está proponiendo en este proyecto.
84
7. DISEÑO DE UNA GUÍA PARA LA IDENTIFICACIÓN DE
MICROORGANISMOS ASOCIADOS A LA MENINGITIS BACTERIANA
AGUDA A TRAVÉS DE UN ESQUEMA DE DESCRIPCIÓN
DOCUMENTAL
De acuerdo con los resultados obtenidos tanto en las encuestas como en la
entrevista realizadas, se desarrollará esta propuesta en tres secciones: Fichas
Técnicas, Metadatos y Equivalencias, insumos necesarios para la elaboración de la
guía.
A partir de la implementación de este instrumento se espera lograr la identificación
de agentes etiológicos de las MBA consiguiendo de esta manera la posibilidad de
procesar un volumen más alto de muestras en laboratorio. En la parte académica
los estudiantes tendrán la oportunidad de ir paso a paso en el aprendizaje de esta
enfermedad gracias a que la guía será de fácil acceso y usabilidad.
7.1 METADATOS DE IDENTIFICACIÓN
Los metadatos que se van a utilizar para la guía propuesta sirven para determinar
la clase de microorganismos que causan la enfermedad y por esta razón es preciso
tener claros los datos de taxonomía, morfología macro y microscópica y pruebas
específicas para la identificación, estos campos fueron seleccionados ya que
contienen información esencial y precisa para obtener resultados más eficientes en
menor tiempo.
85
Para seleccionar la información que se utilizara en la guía se recopiló en tablas un
conjunto de datos específicos que normalmente utilizan estudiantes, investigadores
y profesores para identificar y diferenciar los distintos agentes microbianos que
producen la MBA.
En la elaboración de la guía se tendrá como base un esquema de descripción
documental que se realizará a través de una serie de metadatos intrínsecos que a
continuación se describirán.
7.1.1 Taxonomía En Microorganismos
Para la elaboración de la guía es importante tener claridad en la Taxonomía de los
microorganismos de tal manera que se logren desarrollar los objetivos propuestos
en esta investigación para poder presentar información relevante a los usuarios. En
la imagen 3. Se puede observar la Taxonomía de los microorganismos.
Imagen 3. Taxonomía de los microorganismos Fuente: elaboración propia
TAXONOMIAESPECIE
• ESPECIE
• GENERO
• FAMILIA
• ORDEN
• CLASE
• FILO
• REINO
• DOMINIO
86
Tabla comparativa de microorganismos
Bacteria: Bacteria Las bacterias son microorganismos unicelulares de tipo procariótico, es decir, son organismos que solo se pueden observar al microscopio, constituidos por una sola célula autónoma que además no tiene membrana nuclear.
Eucaria Es el dominio que agrupa a los organismos que tienen organelos y núcleo
Características
Estructura celular Tienen organelos
Procariota mayor tamaño Cromosomas múltiples lineales con cromatina
No posee organelos Composición de pared celular glúcidos (celulosa, quitina)
Cromosomas Enlace lipídico de la membrana Uno circular y desnudo Éster
Composición de pared celular Ácidos grasos de la membrana - lineales
Peptidoglicano Flagelo eucariota
Enlace lipídico de la membrana Ribosoma 80S, pero 70S (o 55S) en
Éster Mitocondrias y cloroplastos Ácidos grasos de la membrana – lineales Intrones en la mayoría de los genes Flagelo bacteriano Operones No Ribosoma 70S Plásmidos raros
Intrones No Cromatina con nucleosomas e histonas Sí
Operones Sí Iniciador de ARNt metionina Plásmidos Sí ARN polimerasas varias Cromatina con nucleosomas e histonas No Subunidades del ARNP 12-14
Iniciador de ARNt formil-metionina Estreptomicina y cloranfenicol resistente
ARN polimerasas una Toxina diftérica sensible Subunidades del ARNP 4-5
Estreptomicina y cloranfenicol sensible
Toxina diftérica resistente
Tabla 5. Comparativa Microorganismos Fuente elaboración propia
87
7.1.2 Morfología Microscópica
Morfología microscópica de Neisseria meningitidis
MORFOLOGÍA MICROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA- AGRUPACIÓN
Nem
Nombre del microorganismo: Neisseria meningitidis
AGRUPACIÓN Las bacterias pueden formar distintas formas de agrupaciones en el momento
de su replicación.
Diplococo
Grupos de dos cocos
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 6. Morfología microscópica Nem Fuente elaboración propia
88
Morfología microscópica de Streptococcus pneumoniae
MORFOLOGÍA MICROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA- AGRUPACIÓN
Spn
Nombre del microorganismo: Streptococcus pneumoniae
AGRUPACIÓN Las bacterias pueden formar distintas formas de agrupaciones en el momento
de su replicación.
Diplococo
Grupos de dos cocos
Estreptococo
Grupos de cocos en cadena, hilera o
fila
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 7. Morfología microscópica Spn Fuente elaboración propia
89
Morfología microscópica de Staphylococcus aureus
MORFOLOGÍA
MICROSCÓPICA
MICROORGANISMOS
ETIOLÓGICOS DE LA
MBA- AGRUPACIÓN
Sau
Nombre del microorganismo: Staphylococcus aureus
AGRUPACIÓN
Las bacterias pueden formar distintas formas de agrupaciones en el momento
de su replicación.
Estafilococos
Grupos de cocos en forma de racimo
de uvas
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 8. Morfología microscópica Sau Fuente elaboración propia
90
Morfología microscópica de Staphylococcus aureus
MORFOLOGÍA
MICROSCÓPICA
MICROORGANISMOS
ETIOLÓGICOS DE LA
MBA- AGRUPACIÓN
Lmn
Nombre del microorganismo: Listeria monocytogenes
AGRUPACIÓN
Las bacterias pueden formar distintas formas de agrupaciones en el
momento de su replicación.
Empalizada
Agrupación de bacilos en paralelo
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 9. Morfología microscópica Lmn Fuente elaboración propia
91
Morfología microscópica de Cryptococcus neoformans
MORFOLOGÍA
MICROSCÓPICA
MICROORGANISMOS
ETIOLÓGICOS DE LA
MBA- AGRUPACIÓN
Cyn
Nombre del microorganismo: Cryptococcus neoformans
Tinción de Gram:
Blastoconidias: Las levaduras son
organismos unicelulares, redondos u
ovales. Se multiplican mediante
gemación formando blastoconidias, las
cuales son en forma de ocho y están
ubicadas una tras otra.
Tinta China:
Encapsuladas
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 10. Morfología microscópica Cyn Fuente elaboración propia
92
7.1.3 Morfología Macroscópica
Morfología macroscópica de Streptococcus pneumoniae
MORFOLOGÍA MACROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA- AGRUPACIÓN
Spn
Nombre del microorganismo: Streptococcus pneumoniae
Morfología colonial
Medio de cultivo: Agar chocolate
http://www.microregistrar.com/author/suryaban/page/7/
Forma
Puntiforme
Superficie Translúcida
Hemolisis Alfa hemolítica
Es una hemólisis (lisis de glóbulos rojos) parcial y la zona de crecimiento aparece rodeada de un halo de color verdoso.
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 11. Morfología macroscópica Spn Fuente elaboración propia
93
Morfología macroscópica de Staphylococcus aureus
MORFOLOGÍA MACROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA- AGRUPACIÓN
Sau
Nombre del microorganismo: Staphylococcus aureus
Morfología colonial
https://www.microbiologyinpictures.com/staphylococcus%20aureus.html
Forma
Circular
Superficie
Cremosa, lisa brillante
Tamaño Grandes
Borde
Entero
Pigmentos Produce pigmentos gris-amarillo-
naranja
Hemolisis
Beta hemolítica Es una hemólisis (lisis de glóbulos rojos)
completa y la zona de crecimiento aparece rodeada de un halo transparente.
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 12. Morfología macroscópica Sau Fuente elaboración propia
94
Morfología macroscópica de Haemophillus influenzae
MORFOLOGÍA MACROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA-
AGRUPACIÓN
Hae
Nombre del microorganismo: Haemophillus influenzae
Morfología colonial
Medio de cultivo: Agar chocolate suplementado con x-v
https://www.cdc.gov/hi-disease/about/photos.html
Forma
Puntiforme
Elevación Convexa
Superficie
Lisa brillante
Satelitismo En cultivos mixtos, las especies de Haemophillus que requieren factor V pueden crecer como colonias puntiformes alrededor de las colonias de estos otros microorganismos, este fenómeno se denomina satelitismo. ( libro diagnostico microbiológico, 12ava edición, 2009,Betty Forbes,Daniel F.Sahm, Alice S.Weissfeld,pag 405)
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 13. Morfología macroscópica Hae Fuente elaboración propia
95
Morfología macroscópica de Klebsiella pneumoniae
MORFOLOGÍA MACROSCÓPICA MICROORGANISMOS
ETIOLÓGICOS DE LA MBA- AGRUPACIÓN
Kpn
Nombre del microorganismo: Klebsiella pneumoniae
Morfología colonial
Medio de cultivo: Agar sangre y Agar McConkey
http://www.bacteriainphotos.com/Klebsiella%20pneumoniae%20on%20MacConkey.html https://co.pinterest.com/explore/klebsiella-pneumoniae/
Forma
Irregular
Superficie
Lisa, brillante y mucoide
Elevación
Elevada
Borde Ondulado
Tamaño Grandes
Hemolisis
Alfa hemolítica Es una hemólisis (lisis de glóbulos rojos) parcial y la zona de crecimiento aparece
rodeada de un halo de color verdoso.
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 14. Morfología macroscópica Kpn Fuente elaboración propia
96
Morfología macroscópica de Neisseria meningitidis
MORFOLOGÍA MACROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA-
AGRUPACIÓN
Nem
Nombre del microorganismo: Neisseria meningitidis
Morfología colonial
Medio de cultivo: Agar chocolate
https://www.flickr.com/photos/nathanreading/6826337394
Forma
Circular
Superficie Lisa y brillante
Elevación Convexa
Borde
Entero
Hemolisis Gamma hemolítica
No hay hemólisis (lisis de glóbulos rojos) por lo tanto, no hay un halo alrededor
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 15. Morfología macroscópica Nem Fuente elaboración propia
97
Morfología macroscópica de Listeria monocytogenes
MORFOLOGÍA MACROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA-
AGRUPACIÓN
Lmn
Nombre del microorganismo: Listeria monocytogenes
Morfología colonial
Medio de cultivo: Agar sangre
https://www.flickr.com/photos/nathanreading/6268795918/
Forma
Circular
Superficie Lisas
Tamaño Pequeñas
Hemolisis
Beta hemolítica Es una hemólisis (lisis de glóbulos rojos)
completa y la zona de crecimiento aparece rodeada de un halo transparente.
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 16. Morfología macroscópica Lmn Fuente elaboración propia
98
Morfología macroscópica de Neisseria meningitidis
MORFOLOGÍA MACROSCÓPICA
MICROORGANISMOS ETIOLÓGICOS DE LA MBA-
AGRUPACIÓN
Nem
Nombre del microorganismo: Neisseria meningitidis
Morfología colonial
Agar sabourad sin cicloheximida
http://cursoenarm.net/UPTODATE/contents/mobipreview.htm?25/60/26569
Forma
Circular
Superficie Mucoide y brillante
Tamaño Grandes
Color Blanco, beige o marrón
RELACIONADO CON LA MBA SI X NO
Tabla 17. Morfología macroscópica Nem Fuente elaboración propia
99
7.1.4 Pruebas Bioquímicas
Las pruebas bioquímicas (Determinan la actividad metabólica de una cepa pura.
Son empleadas principalmente para la identificación y clasificación de bacterias y
hongos) que se tendrán en cuenta son: catalasa, coagulasa, manitol, oxidasa, agar
sangre con factores v y x, glucosa, ribosa, galactosa, galactosamina, indol, ureasa,
urea, citrato, lisina, VP, maltosa, lactosa, CAMP, hemólisis e hidrólisis esculina.
Para concluir, tanto estudiantes como profesionales en el área de la salud se verán
beneficiados ya que esta guía les brindara metadatos que han sido seleccionados
detalladamente y les permitirá mayor rapidez en la identificación de
microorganismos asociados a la MBA.
Con la estructuración de los metadatos y por su especificidad, se logra brindar
mayor claridad a los usuarios frente a los microorganismos, convirtiendo la guía en
una fuente importante para visualizar bajo un esquema documental la identificación
de los agentes etiológicos por parte de los investigadores, estudiantes y profesores
de la PUJ.
100
Tabla 18. Pruebas Bioquímicas Catalasa – Oxidasa
Metadato Descripción Imagen
Catalasa La catalasa es un enzima presente en la mayoría de los microorganismos que poseen citocromos. Las bacterias que sintetizan catalasa hidrolizan el peróxido de hidrogeno en agua y oxigeno gaseoso que se libera en forma de burbujas. El principal objetivo de esta prueba es separar Micrococacceae (positiva) de Streptococcus spp. y Enterococcus spp. (Negativa).
Imagen disponible en: http://microbitosblog.com/2011/09/27/pruebas-bioquimicas-primarias/
Oxidasa Esta prueba sirve para determinar la presencia de enzimas oxidasas. La reacción de la oxidasa se debe a la presencia de un sistema citocromo oxidasa que se encuentra en bacterias aerobias, algunas anaerobias facultativas y, excepcionalmente, en algún microaerófilo (Vibrio fetus), pero las bacterias anaerobias estrictas carecen de actividad oxidasa.
Imagen disponible en: http://aprendeenlinea.udea.edu.co/lms/moodle/pluginfile.php/186037/mod_page/content/1/Bacteriologia/Pruebas_de_laboratorio/Prueba_de_oxidasa.html
Tabla 18. Pruebas Bioquímicas Catalasa - Oxidasa
Fuente elaboración propia apoyada en información de britanialab
101
Tabla 19. Pruebas Bioquímicas Ureasa – Citrato – Fermentación
Ureasa Algunas bacterias son capaces de emplear la urea como única fuente de nitrógeno. En tal caso la bacteria ha de poseer un enzima, la ureasa, capaz de atacar la urea. Al descomponerse se libera amoniaco que alcaliniza el medio. Esta prueba puede ayudar en la identificación de Cryptococcus spp que produce un resultado positivo después de una incubación prolongada.
Imagen disponible en: http://www.telmeds.org/atlas/bacteriologia/bacilos-gram-negativos-fermentadores-y-no-fermentadores/prueba-de-urea/
Citrato Esta prueba permite diferenciar un grupo de bacterias que son capaces de crecer con citrato como única fuente de carbono y sales amónicas inorgánicas como única fuente de nitrógeno, provocando la alcalinización del medio.
Imagen disponible en: ttp://cibergega.galeon.com/Citrato.htm
Fermentación de azúcares
(lactosa, sacarosa, dextrosa, manitol glucosa)
Las bacterias anaerobias o anaerobias facultativas a menudo fermentan carbohidratos ácidos orgánicos y gas (H2 o CO2). Estos pueden detectarse incluyendo en el medio un indicador de pH.
Imagen disponible en: http://www.telmeds.org/atlas/bacteriologia/bacilos-gram-negativos-fermentadores-y-no-fermentadores/prueba-de-fermentacion-de-azucares/
Tabla 19. Pruebas Bioquímicas Ureasa – Citrato - Fermentación Fuente elaboración propia apoyada en información de britanialab
102
Tabla 20. Pruebas Bioquímicas Hidrólisis - Coagulasa – Solubilidad
Hidrólisis de esculina
Esta prueba es usada en bacteriología principalmente en la identificación de Streptococcus grupo D. Hay microorganismos con capacidad de hidrolizar la esculina en esculetina y glucosa.
Imagen disponible en:http://www.telmeds.org/atlas/bacteriologia/cocos-gram-positivos-piogenos-de-importancia-medica/prueba-de-bilis-esculina-para-streptococcus-gamma-hemoliticos/
Coagulasa Permite determinar la capacidad de coagular el plasma por la acción de la enzima coagulasa. Se utiliza para diferenciar S. aureus (coagulasa positiva) de otras especies de Staphylococcus
Imagen disponible en: http://www.telmeds.org/atlas/bacteriologia/cocos-gram-positivos-piogenos-de-importancia-medica/prueba-de-coagulasa-para-staphylococcus/
Solubilidad en bilis
Se basa en la capacidad de determinadas especies bacterianas de lisarse en presencia de sales biliares, las más utilizadas de las cuales son el taurocolato y el desoxicolato de sodio. El efecto de esta enzima auto lítica se pone de manifiesto sobre colonias de S. neumonía crecidas en medios sólidos, en las que se aprecia una umbilicación central, y también en colonias mucoides
Imagen disponible en: http://identificacionbacterias.web16.top/pruebas-cocos-g/prueba-de-solubilidad-en-bilis
Tabla 20. Pruebas Bioquímicas Hidrólisis - Coagulasa - Solubilidad Fuente elaboración propia apoyada en información de britanialab
103
Tabla 21. Pruebas Bioquímicas CAMP - Optoquina – Indol - Manitol
Prueba de CAMP
Sirve principalmente para determinar la capacidad de un microorganismo para producir una proteína conocida como factor CAMP. En esta prueba la hemolisis producida por algunos microorganismos se inhibe por la β-hemolisina de S. aureus
Imagen disponible en:
https://www.flickr.com/photos/dydm_sem/15404923178
Optoquina El clorhidrato de etilhidroxicupreÌna (optoquina) inhibe a muy baja concentración (5 µg/ml o menos) el crecimiento de S. pneumoniae, mientras que no afecta al crecimiento de otros Streptococcus alfa-hemolíticos.
Imagen disponible en: http://slideplayer.es/slide/1086796/
Indol Mediante esta prueba se detecta la liberación de indol en un cultivo bacteriano. Dicha liberación se debe a la degradación del aminoácido triptófano mediante el enzima triptofanasa.
Imagen disponible en: http://slideplayer.es/slide/1086796/
Agar de Manitol salado
Determinar si la bacteria puede crecer en altas concentraciones de sal y si puede fermentar manitol
Imagen disponible en https://www.pinterest.es/pin/458663543275262658/
Tabla 21. Pruebas Bioquímicas CAMP - Optoquina – Indol – Manitol Fuente elaboración propia apoyada en información de britanialab
104
Tabla 22. Pruebas Bioquímicas Mc Conkey – Agar Sangre – Voges - Lisina
Mc Conkey Determinar si la bacteria Gram negativa es fermentadora de lactosa
Agar sangre Medio para propósitos generales, para el aislamiento y cultivo de numerosos microorganismos. Con la adición de sangre, el medio es útil tanto para el aislamiento y cultivo de microorganismos aerobios y anaerobios nutricionalmente exigentes a partir de una gran variedad de muestras, como para la observación de reacciones de hemólisis.
Imagen disponible en: https://www.news-medical.net/whitepaper/20170522/High-Quality-Blood-Agar-Production-using-the-Combination-of-DOSE-IT-and-MEDIA-JET.aspx
Voges-Proskauer
Permite observar si el microorganismo fermenta la glucosa por la vía butanodiolica.
Lisina Medio de cultivo utilizado para diferenciar microorganismos, basado en la descarboxilación / desaminación de la lisina y en la producción de ácido sulfhídrico.
Imagen disponible en: https://es.slideshare.net/StephaneLovon/pruebasbioquimicasdeidentificacion243338506-16283374
Tabla 22. Pruebas Bioquímicas Mc Conkey – Agar Sangre – Voges – Lisina Fuente elaboración propia apoyada en información de britanialab
105
7.2 FICHAS DE IDENTIFICACIÓN
Para el levantamiento de esta información se contó con el apoyo de un experto en
el área de enfermedades infecciosas, quien con sus conocimientos apoyó la
clasificación de los descriptores más relevantes que debe contener la ficha técnica,
de tal manera que cuando el usuario acceda a la guía encuentre toda la información
necesaria para la identificación de los microorganismos etiológicos de la MBA.
Dentro de la información que se presenta en las fichas de identificación se encuentra
el código del microorganismo que será utilizado a partir de esta guía como única,
de tal manera que se logre convertir en un término controlado para el uso clínico.
También se encuentra el nombre del microorganismo, su taxonomía, características
de su estructura macro y microscópica y los resultados de las pruebas que se
realizan normalmente para la identificación del agente microbiano.
A continuación, se anexan las fichas técnicas de cada uno de los microorganismos
etiológicos de la MBA:
106
Ficha Técnica 1. Streptococcus pneumoniae
FICHA TECNICA DE MICROORGANISMO ETIOLOGICO DE LA
MENINGITIS BACTERIANA AGUDA (MBA)
Spn Preparado por: Adela Marlen Barrera Guerrero Código Microorganismo
Nombre del microorganismo Streptococcus pneumoniae
Taxonomía del microorganismo
Dominio Bacteria
Phylum Formicutes
Clase Bacilli
Orden Lactobacillales
Familia Streptococaceae
Genero Streptococcus
Especie Pneumoniae
Características microscópicas
Tamaño 0,2-1,8 µm longitud
Forma Ovoide lanceolada
Agrupación Diploide o en cadenas
Otros Halo transparente
(Cápsula)
Características macroscópicas
Colonias
Medida 0,5 a 1,25 µm
Puntiformes, translucidas, alfa
hemolítica
PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS
Gram Coco Gram positivo
Pruebas bioquímicas
Catalasa Negativa
Oxidasa Negativa
Optoquina Sensible
Sales Biliares Soluble
Cápsula Positiva
Resultados LCR
Presión de apertura Elevada
Glucosa Disminuida
Proteínas Elevadas
Leucocitos Elevados a expensas de
PMN
FICHA TÉCNICA 1. Streptococcus pneumoniae Fuente: elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
107
Ficha Técnica 2. Streptococcus aureus
FICHA TECNICA DE MICROORGANISMO ETIOLOGICO DE LA
MENINGITIS BACTERIANA AGUDA
(MBA)
Sau Preparado por: Adela Marlen Barrera Guerrero Código Microorganismo
Nombre microorganismo Staphylococcus aureus
IMAGEN Taxonomía del microorganismo
Dominio Bacteria
Phylum Firmicutes
Clase Bacilli
Orden bacillales
Familia Stafilococcaceae
Genero Staphylococcus
Especie aureus
Características microscópicas
Tamaño 0,5-1,0 m longitud
Forma Cocoide redonda
Agrupación Racimos
Características macroscópicas
Colonias
Medida 0,5 a 1,25 µm
Grandes, lisas, enteras, beta hemolítica, cremosas, pigmentos gris-amarillo-naranja
PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS
Gram Coco Gram positivo
Pruebas bioquímicas
Catalasa Positivo
Oxidasa Negativa
Manitol Positivo
Coagulasa Positivo
Resultados LCR
Presión de apertura Elevada
Glucosa Disminuida
Proteínas Elevadas
Leucocitos Elevados a expensas de PMN
Gram Con presencia de CGP en racimo
VDRL No reactiva
BK Negativa
FICHA TÉCNICA 2. Staphylococcus aureus Fuente: elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
108
Ficha Técnica 3. Neisseria meningitidis
FICHA TECNICA DE MICROORGANISMO ETIOLOGICO DE
LA MENINGITIS BACTERIANA AGUDA (MBA)
Nem
Preparado por: Adela Marlen Barrera Guerrero Código
Microorganismo
Nombre microorganismo Neisseria meningitidis
IMAGEN Taxonomía del microorganismo
Dominio Bacteria
Phylum Proteobacteria
Clase Betaproteobacteria
Orden Neisseriales
Familia Neisseriaceae
Genero Neisseria
Especie Meningitidis
Características microscópicas
Tamaño 0,5 por 0,8 µm
longitud
Forma Diplococos en forma
gránulos de café
Agrupación Puede ser intracelular
Características macroscópicas
Colonias
Medida 2m por 5 m
Colonia gris, no hemolítica, redondas,
convexas, lisas, húmedas y relucientes
con un borde claramente definido
PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS
Gram Cocos Gram negativos
Pruebas bioquímicas
Cultivo
Sembrar en Agar Chocolate con
Vancomicina y Agar Thayer Martin
Catalasa Negativo
Oxidasa Positivo
109
FICHA TÉCNICA 3. Neisseria meningitidis Fuente: elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
Oxidación azúcares: Glucosa
Positivo
Maltosa Positivo
Resultados LCR
Presión de apertura Elevada
Glucosa Disminuida
Proteínas Elevadas
Leucocitos Elevados a expensas
de PMN
Gram Con presencia de
CGN tipo intracelular
VDRL No reactiva
BK Negativa
110
Ficha Técnica 4. Listeria monocytogenes
FICHA TECNICA DE MICROORGANISMO ETIOLOGICO DE LA
MENINGITIS BACTERIANA AGUDA (MBA)
Lmn Preparado por: Adela Marlen Barrera Guerrero Código Microorganismo
Nombre del microorganismo Listeria monocytogenes
IMAGEN Taxonomía del microorganismo
Dominio Bacteria
Phylum Firmicutes
Clase Bacilli
Orden Bacillales
Familia Lactobacilaceae
Genero Listeria
Especie monocytogenes
Características microscópicas
0,5 por 1,2 µm longitud
Bastones delgados cortos
Agrupación Pleomorficos y en
empalizadas
Características macroscópicas
Colonias Medida 1µm por 2µm
Colonia gris, beta hemolíticas, pequeñas, lisas
PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS
Gram Bacilos Gram positivos
Pruebas bioquímicas
Cultivo Agar sangre y Agar PALCAM
Catalasa Positivo
Móvil a 30ºC
Inmóvil 37ºC
Crecimiento En sombrilla a 25ºC
VP Positivo
CAMP Positivo
Hidrólisis esculina Positivo
Resultados LCR
Presión de apertura Elevada
Glucosa Disminuida
Proteínas Elevadas
Leucocitos Elevados a expensas de PMN
Gram Con presencia de CGN tipo
intracelular
VDRL No reactiva
BK Negativa
FICHA TÉCNICA 4. Listeria monocytogenes Fuente: elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
111
Ficha Técnica 5. Klebsiella pneumoniae
FICHA TECNICA DE MICROORGANISMO ETIOLOGICO DE LA
MENINGITIS BACTERIANA AGUDA
(MBA)
Kpn
Preparado por: Adela Marlen Barrera Guerrero Código
Microorganismo
Nombre del microorganismo Klebsiella pneumoniae
IMAGEN Taxonomía del microorganismo
Dominio Bacteria
Phylum Proteobacteria
Clase Gammaproteobacteria
Orden Enterobacteriales
Familia Enterobacteriaceae
Genero Klebsiella
Especie Pneumoniae
Características microscópicas
Tamaño 0,5 por 3,0 µm longitud
Forma Alargados gruesos
Agrupación
Otros Con y sin halo
transparente (Cápsula)
Características macroscópicas
Colonias
Medida 2-3 µm por 4-7 µm
Grandes, mucoides, difícil de aislar,
elevadas, redonda borde ondulado, lisas, brillantes, rosadas en
MacConkey
PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS
Gram Bacilos Gram negativo
Pruebas bioquímicas
Cultivo Sembrar en Agar
Sangre y Agar MacConkey
Lactosa Positivo
Oxidasa Negativo
Urea Positiva
112
VP Positivo
Citrato Positivo
Lisina Positivo
Resultados LCR
Presión de apertura Elevada
Glucosa Disminuida
Proteínas Elevadas
Leucocitos Elevados a expensas
de PMN
Gram Con presencia de BGN
tipo bacilar
FICHA TÉCNICA 5. Klebsiella pneumoniae Fuente: elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
113
Ficha Técnica 6. Haemophilus influenza
FICHA TECNICA DE MICROORGANISMO ETIOLOGICO DE LA
MENINGITIS BACTERIANA AGUDA (MBA)
Hae Preparado por: Adela Marlen Barrera Guerrero
Código Microorganismo
Nombre del microorganismo Haemophilus influenza IMAGEN Taxonomía del microorganismo
Dominio Bacteria
Phylum Proteobacteria
Clase Gammaproteobacteria
Orden Pasteurellales
Familia Pasteurellaceae
Genero Haemophilus
Especie Influenza
Características microscópicas
Tamaño 0,2-0,3 por 0,5-0,8 µm
longitud
Forma Pleomórficos
Agrupación
Otros Halo transparente (Cápsula)
Características macroscópicas
Colonias
Medida 0,5-0,8 a 1,0-1,5 µm
Convexas, lisas, pálidas, grises o transparentes
Colonias en satelitismo
PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS
Gram Cocobacilo Gram negativo
Pruebas bioquímicas
Crecimiento En Agar Sangre con
factores V y X
Incubación 5% CO2.
Glucosa, Ribosa, Positivas
Galactosa Positiva
Galactosamina Positiva
Indol e Ureasa Positiva
Resultados LCR
Presión de apertura Elevada
Glucosa Disminuida
Proteínas Elevadas
Leucocitos Elevados a expensas de
PMN
Gram Con presencia de BGN tipo
cocobacilar
VDRL No reactiva
BK Negativa
FICHA TÉCNICA 6. Haemophilus influenzae Fuente: elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
114
Ficha Técnica 7. Cryptococcus neoformans
FICHA TECNICA DE MICROORGANISMO ETIOLOGICO DE LA
MENINGITIS BACTERIANA AGUDA (MBA)
Cyn Preparado por: Adela Marlen Barrera Guerrero
Código Microorganismo
Nombre del microorganismo Cryptococcus neoformans
IMAGEN Taxonomía del microorganismo
Dominio Fungi
Phylum Basidiomycota
Clase Tremellomycetes
Orden Tremellales
Familia Tremellaceae
Genero Cryptococcus
Especie neoformans
Características microscópicas
Tamaño 4,0 por 25 mm longitud
Forma Redondas y en forma
de ocho
Otros Encapsuladas
Características macroscópicas
Colonias
Medida 2-5µm por 5-8µm
Grandes, mucoides, brillantes, blancas-
beige-marrón
PRUEBAS MICROBIOLÓGICAS Gram Conidias y blastoconidias
Pruebas bioquímicas
Cultivo Agar Sabouraud sin
cicloheximida Ureasa Positivo Nitratos Negativo
Azucares No fermentadora de
azucares Tinta China Positiva
Resultados LCR
Presión de apertura Elevada Glucosa Disminuida
Proteínas Elevadas
Leucocitos Elevados a expensas
de PMN
Gram Con presencia de CGN
tipo intracelular VDRL No reactiva
BK Negativa
FICHA TÉCNICA 7. Cryptococcus neoformans Fuente: elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
115
En conclusión, las fichas solamente tendrán información de los microorganismos
que causan la MBA, como los virus solo se pueden manejar a través de la
microscopía electrónica estos no se tuvieron en cuenta. Al momento de realizar la
comparación se hará solo con las 6 bacterias y la levadura, ya que no vale la pena
hacerla con ningún otro pues el resto no llega nunca al LCR y además de esto si se
realizara las bacterias serían aproximadamente 1000 especies.
El levantamiento de la información para la elaboración de las fichas permite
evidenciar los metadatos que describen este tipo de recursos en su aspecto físico,
beneficiando la identificación de los microorganismos etiológicos de la meningitis
aguda bacteriana, adicional a esto facilita a los usuarios tener información de fácil
acceso y con un lenguaje controlado para su especialidad.
116
7.3 EQUIVALENCIAS DE VALIDACIÓN
Para la elaboración y desarrollo de las validaciones se debe tener en cuenta que
para la identificación de microorganismos se realizan diferentes pruebas debido
a las similitudes que hay entre ellos, teniendo en cuenta esto lo primero que se
hace cuando hay sospecha de una MBA es una tinción de Gram y dependiendo
del resultado se realizan una serie de pruebas específicas, hasta llegar a la
identificación del microorganismo en cuanto a género y especie, a continuación,
se presenta en un diagrama de flujo las equivalencias según los resultados.
Ilustración 4. Diagrama de flujo Tinción de Gram
Fuente elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
117
Ilustración 5. Diagrama de flujo Catalasa
Fuente elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
Ilustración 6 Diagrama de flujo Oxidasa
Fuente elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
118
Ilustración 7 Diagrama de flujo CAM
Fuente elaboración propia con apoyo del Dr. Hugo Diez
En los diagramas de flujo se observan los pasos a seguir para llegar a la
identificación de la bacteria Staphylococcus aureus, primero se realiza una tinción
de Gram y si en el microscopio se ven bacterias redondas de color morado se trata
de cocos Gram positivos, sin embargo, existen muchos microorganismos con esta
morfología, pero cuando se asocia el resultado con una sospecha de MBA se
minimizan las probabilidades a dos bacterias: Staphylococcus aureus y
Streptococcus pneumoniae, ambas con un 33%, por lo que se tienen que seguir
reduciendo las opciones y aumentando el porcentaje de validez.
A continuación, se hace una prueba bioquímica de catalasa (enzima que poseen
algunas bacterias aerobias) ya que sí es positiva hay un 66% de probabilidad de
que sea Staphylococcus aureus, se sabe si es positiva por la formación de burbujas
119
en la reacción. Para confirmar que sea el microorganismo se espera que al hacer
las pruebas bioquímicas de manitol y coagulasa den positivo para asegurarse un
99% de que es Staphylococcus aureus.
Si después de aplicar la tinción de Gram y obtener como resultado Cocos Gram
positivos, se realiza la prueba de catalasa y está da negativo, el porcentaje que
indica que el agente que está produciendo la MBA es Streptococcus pneumoniae
aumenta al 66%, de acuerdo con la información en los diagramas de flujo para estar
99% seguro de que es Streptococcus pneumoniae la prueba de oxidasa debe dar
negativo, la de susceptibilidad a optoquina positiva y se debe observar que es
soluble en sales biliares.
Cuando en la tinción de Gram se obtienen cocos Gram negativos, es decir bacterias
redondas (cocos) de color rosado, inmediatamente el profesional en salud piensa
en Neisseria meningitidis y lo que hace es utilizar la prueba de la Oxidasa, la
reacción positiva la indica un color azul-violeta intenso y pasa de ser un 33% a un
66% de confiabilidad, para poder llegar a un 99% certeza de que es Neisseria
meningitidis las pruebas de glucosa y maltosa deben dar positivo.
En el diagrama se puede observar que aunque los resultados de la tinción de Gram
coincidan con la morfologia de Neisseria meningitidis, no necesariamente se trata
de esta bacteria, ya que al realizar la prueba de oxidasa y esta dar negativa se
120
reduce el porcentaje de 33% a un 0%, por lo que no se le da paso a otro proceso,
ya que no se trata de un microorganismo que causa MBA.
Al observar al microscopio bacterias en forma de barras y de color rosado, es decir
bacilos Gram negativos y teniendo en cuenta que se sospecha de una MBA, se
contemplan dos opciones Kliebsiella pneumoniae y Haemophillus influenzae, pero
cada una es segura en un 24,7%, por lo que se procede a sembrar el
microorganismo en un medio de cultivo llamado MacConkey, si se observa
crecimiento el resultado es positivo e indica la posibilidad con un 49,4% de que si
sea Kliebsiella pneumoniae, luego se realiza una prueba de lactosa que de dar
positivo se obtiene un 74,1% de probabilidad de que sea Kliebsiella pneumoniae ,
finalmente la pruebas de urea, citrato, VP y lisina dan positivo se ha logrado
identificar en un 98,8% a Kliebsiella pneumoniae.
Siguiendo el procedimiento que se le da a un microorganismo que coincide en
cuanto a morfología y crecimiento agar McConkey que tiene Kliebsiella
pneumoniae, se realiza la prueba bioquímica de la lactosa y si el resultado da
negativo significa que no se trata de Kliebsiella pneuomiae, sino de otro agente
microbiano que requiere otro enfoque en su diagnóstico.
Si después de obtener como resultado bacilos Gram negativos se realiza la siembra
en el Agar McConkey y no se observa crecimiento entonces es posible que se trate
de Haemophillus influenzae, por esta razón en vez de realizar la prueba de lactosa
121
que normalmente se hace cuando se trata de bacilos Gram negativo, se cultiva el
microorganismo en Agar sangre implementado con factores x y v si se observa
crecimiento es positivo y se tiene un 74.1% de seguridad de que es Haemophillus
influenzae, para llegar al 98,8% las pruebas de ureasa, glucosa, ribitol y satelitismo
deben dar positivo, tal como se visualiza en el diagrama de flujo.
Si se obtienen bacilos Gram negativos y no se ve crecimiento en agar McConkey
normalmente se pensaría que se trata de Haemophillus influenzae, sin embargo es
importante tener en cuenta que esto solo tiene un porcentaje de probabilidad del
49,4%, por lo cual se ve la necesidad de sembrar en agar sangre suplementado con
los factores x y v, si finalmente no se observa crecimiento, no se procesa la muestra
y se descarta la opción de que sea Haemophillus influenzae y una MBA.
Si se tienen bacilos Gram positivos y se asocia a la sospecha de una MBA se habla
de Listeria monocytogenes, sin embargo, como la tinción de Gram solo arroja datos
sobre la morfología bacteriana solo le da un 33% de certeza al decir que se trata de
esta bacteria, por lo que es necesario realizar otra serie de pruebas como CAMP, si
resulta positiva, se procede a realizar las pruebas de VP y esculina que deben dar
positivas, al igual que la movilidad de la bacteria a una temperatura de 30°C para
finalmente decir que con un porcentaje del 99 de validez, se trata de Listeria
monocytogenes.
122
En caso de que se sospeche de listeria monocytogenes debido a los resultados
obtenidos en la tinción de Gram y la prueba de CAMP salga negativa el 33% de
probabilidad de que se trate de esta bacteria reduce a un 0%.
Por otro lado cuando en la tinción de Gram se observan conidias y blastoconidas,
que son estructuras fúngicas, se tiene en cuenta el cuadro clínico del paciente y la
sospecha de que tiene una meningitis y se piensa en la levadura patógena causante
de meningitis fúngica: Cryptococcus neoformans, razón por la cual el resultado de
la prueba de tinta china debe dar positiva, al igual que la de ureasa, la de
fermentación de azucares debe dar negativo, para finalmente concluir que se trata
de un 99% de seguridad de un Cryptococcus neoformans, por lo que es una
meningitis fúngica y no una MBA. Es importante tener en cuenta estos datos ya que
la mayoría de las muertes de pacientes con meningitis ha sido ocasionada por no
diferenciar una meningitis bacteriana de una fúngica.
En conclusión, para poder llegar a las equivalencias de validación, es preciso tener
el análisis detallado de las características morfológicas, fisiológicas y metabólicas
de los agentes microbianos para poder establecer agrupaciones por similitudes,
vale la pena resaltar que estos porcentajes fueron generados de acuerdo a la
cantidad de microorganismos de la MBA y a las pruebas que se le deben realizar a
cada uno de ellos para su identificación.
123
El algoritmo es la metodología o la ruta que debe seguir el laboratorio para identificar
microorganismos, no es una validación, es una orientación pues las fichas técnicas
no incluyen ningún proceso sino solo muestran datos.
Ilustración 8. Algoritmo de diagnóstico de la MBA
Fuente: elaboración propia con información brindada por Hugo Diez
124
8. CONCLUSIONES
Después del desarrollo de este trabajo, se observa la importancia que tiene la
generación de metadatos para la identificación de la MBA ya que de la correcta
descripción de cada dato que se logra extraer de los microorganismos depende que
se logre construir un comparativo respecto a otros agentes microbianos
En segundo lugar, se evidencia y se resalta la importancia de representar el
contenido de los documentos a través de un lenguaje controlado con el fin de
recuperar fácilmente la información a partir del tema, es decir esto será clave para
la consulta por parte de los especialistas en el área de enfermedades infecciosas.
Por otra parte, el manejar la Meningitis Bacteriana como un documento aportara en
el mejor desempeño de los investigadores a la hora de enfrentarse a una
identificación ya que gracias a la información generada por los metadatos permitirá
una mejor identificación de los agentes etiológicos de la MBA.
125
9. RECOMENDACIONES
Este trabajo sirve de punto de partida para abordar la estructuración de la
información de todos los microorganismos no solamente los etiológicos de la
meningitis si no todos los que se tengan recolectados de tal manera que puedan
servir para nuevas investigaciones que aporten a nivel de salud.
Es primordial el uso de un vocabulario controlado que se convierte en universal en
el área de la ciencia de la salud, permitiendo de esta manera evitar la duplicidad de
información en otros formatos y códigos, este uso del lenguaje permitirá la
Certificación tanto de la Facultad como del Hospital san Ignacio por la unificación
de información.
Se recomienda el apoyo por parte de la facultad y de la Universidad para promover
el desarrollo de la guía para identificación de microorganismos a través de un
esquema de descripción documental ya que servirá de herramienta tanto para
estudiantes como para investigadores por su trazabilidad, funcionalidad y
arquitectura que permitirá tener acceso de una manera más inmediata a la
información requerida para lograr la identificación de los agentes microbianos.
126
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662.
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octubre de 2017, de http://www.wfcc.info/about/
ANEXO 1. ENCUESTA PARA PROFESIONALES DEL AREA DE LA SALUD
OBJETIVO:
El objetivo de la siguiente encuesta es recopilar información para lograr definir los
metadatos que describen y representan cepas, para posteriormente hacer el
levantamiento de fichas técnicas que permitan la identificación de las familias de los
microorganismos etiológicos de la Meningitis Bacteriana Aguda (MBA).
Política de protección de datos:
Estos datos serán cuantificados analizando las situaciones que se presentan al
momento de identificar microorganismos y diagnosticar meningitis aguda bacteriana
(MAB) los cuales permanecerán en anonimato; y que serán incorporados
anteriormente tal y como lo dispone el Art. 15 de la Constitución Política Nacional
131
de Colombia, las Leyes estatutarias 1266 de 2008, la Ley estatutaria 1581 de 2012,
y sus Decretos Reglamentarios, Decreto 1727 de 2009, Decreto 2952 de 2010,
Decreto 1377 de 2013 y Decreto 886 de 2014. Los datos personales y/o sensibles
suministrados, que sean sujetos a tratamiento, serán utilizados con fines netamente
académicos y en el marco de esta investigación. Manifiesto que la información
suministrada es veraz, cierta, real, comprobable, y actualizada; y que el autor de
esta encuesta me garantiza que podré ejercer mi derecho de acceso, rectificación y
actualización relativo a este tratamiento, a través de los mecanismos previamente
dispuestos por mandato legal.
DATOS DE IDENTIFICACIÓN
Pregunta 1. ¿Cuál es su profesión?
Bacteriología Medicina
Microbiología Otra
Si su respuesta fue “otra” indique ¿Cuál? ______________________
Pregunta 2. ¿Seleccione su rango de edad?
18-20 21-23 30-32
24-26 27-29 más de 32
Pregunta 3. ¿Seleccione su género?
Masculino Femenino
132
DATOS DE RECOLECCIÓN
Pregunta 4. ¿Cuál de los siguientes métodos de identificación de microorganismos
utiliza usted?
Microscopia
Medio de Cultivo
Pruebas bioquímicas
Pregunta 5. ¿Al momento de identificar microorganismos usted ha tenido algún nivel
de complejidad para identificarlo?
Complejo
Muy complejo
Nada Complejo
¿Por qué? ________________________
Pregunta 6. ¿Cuáles son las fuentes que utiliza usted y que le permiten hacer la identificación de microorganismos de una manera eficiente?
( Libros Asesorías
Artículos Científicos Bases de datos
Otra ¿Cuál? _______________________________________
Pregunta 7. ¿Usted considera que una guía basada en un esquema de descripción
documental (entendiendo como descripción documental, toda la información
adicional que se pueda tener de los microorganismos: ¿nombre, familia, genero,
tamaño etc.), serviría como orientación en la identificación de microorganismos
etiológicos de la Meningitis?
133
Sí No
Por favor justifique su respuesta
__________________________________________________________________
__________________________________________________________________
______________
Pregunta 8. ¿De los siguientes grupos de información cuales cree usted que van
hacer más funcionales, si contara con una herramienta de orientación que apoye la
identificación y diagnóstico de una enfermedad infecciosa?
Taxonomía Epidemiología
Morfología macro y microscópica Tratamiento
Pasos y prueba de diagnóstico Otra
Si su respuesta fue “otra” indique ¿Cuál? _______________________
Pregunta 9. ¿A la hora de dar un tratamiento a una enfermedad infecciosa considera
importante la identificación del género y especie del microorganismo etiológico de
la Meningitis?
Sí No No aplica
Pregunta 10. ¿A usted le gustaría contar en su laboratorio con una guía en la que a
través de descriptores pueda acceder a registros de material microbiológico?
Sí No
Pregunta 11. ¿Usted considera que una guía que le permita diferenciar un
Microorganismo a través de imágenes e información documental le ayudara a
mejorar tiempos de identificación y de diagnóstico?
Sí No
Pregunta 12. Si utilizara una guía de orientación en la identificación de
microorganismos ¿cuáles de los siguientes registros descriptores le gustaría que
tuvieran los microorganismos?
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
134
Taxonomía
Descripción e imágenes de la morfología macro y microscópica
Explicación detallada de los procedimientos microbiológicos que se utilizan
para la identificación del microorganismo con sus fundamentos.
Datos epidemiológicos
Tratamiento
Medicamentos con su respectivo mecanismo de acción
Proceso de la infección
Anatomía del SNC,
Otra
Si su respuesta fue “otra” indique ¿cuál? y ¿por qué?
__________________________________________________________________
__________________________________________________________________
_____________
Pregunta 13 ¿Cómo le gustaría que estuviera presentada la información de la guía?
Por medio de tablas, graficas, imágenes, videos, audios, otro
Si su respuesta fue “otra” indique ¿cuál?
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
s
i
S
i
135
ANEXO 2. ENCUESTA PARA ESTUDIANTES
ENCUESTA PARA ESTUDIANTES
OBJETIVO:
El objetivo de la siguiente encuesta es recopilar información para lograr definir los
metadatos que describen y representan cepas, para posteriormente hacer el
levantamiento de fichas técnicas que permitan la identificación de las familias de los
microorganismos etiológicos de la Meningitis Bacteriana Aguda (MBA).
DATOS DE IDENTIFICACIÓN
Pregunta 1. ¿A qué carrera pertenece?
Bacteriología Medicina
Microbiología Otra ¿Cuál? ____________________
Pregunta 2. ¿Seleccione su rango de edad?
18-20 21-23 30-32
24-26 27-29 más de 32
Pregunta 3. ¿Seleccione su género?
Masculino Femenino
DATOS DE RECOLECCIÓN
Pregunta 4. ¿Cuál de los siguientes métodos de identificación de microorganismos
utiliza usted?
Microscopia
136
Medio de Cultivo
Pruebas bioquímicas
Pregunta 5. ¿Al momento de identificar microorganismos usted ha tenido algún nivel
de complejidad para identificarlo?
Complejo
Muy complejo
Nada Complejo
¿Por qué?
Pregunta 6. ¿Cuáles son las fuentes que utiliza usted y que le permiten hacer la
identificación de microorganismos de una manera eficiente?
( Libros Asesorías
Artículos Científicos Bases de datos
Otra ¿Cuál? ____________________________________
Pregunta 7. ¿De los siguientes grupos de información cuál cree que va hacer más
funcional si contara una herramienta de orientación que apoye la identificación y
diagnóstico de una enfermedad infecciosa?
Taxonomía Epidemiología
Morfología macro y microscópica Tratamiento
Pasos y prueba de diagnóstico Otra ¿Cuál?
Pregunta 8. ¿A usted le gustaría que en su asignatura de microbiología se
implementara una guía que le permita identificar Microorganismos?
Sí No
Pregunta 9. ¿Usted considera que una guía que le permita diferenciar un
Microorganismo a través de información documental le ayudara a mejorar tiempos
de diagnóstico?
s
i
S
i
137
Sí No
ANEXO 3. ENTREVISTA
ENTREVISTA - COORDINADOR ESPECIALIZACIÓN MICROBIOLOGÍA
MÉDICA
Hugo Díez Ortega, M.Sc, PhD
Profesor Titular – Facultad de Ciencias
Coordinador Especialización Microbiología Médica – Facultad de Ciencias
El objetivo principal de este proyecto consiste en diseñar una guía para la
identificación de microorganismos asociados a la meningitis bacteriana aguda que
sirva como orientación a estudiantes, investigadores y profesionales de la salud que
trabajen o investiguen acerca del diagnóstico de enfermedades infecciosas en la
PUJ, a través de un esquema de descripción documental, que ayude al usuario en
el momento de hacer una consulta, ya que busca transmitir la información y los
rasgos más sobresalientes presentes en el documento después de analizarlo y
normalizar sus términos.
1. ¿Cuál es su profesión y actualmente a que se dedica?
2. ¿Respecto al diagnóstico de enfermedades infecciosas como la MBA, usted
qué tipo de problemas ha tenido para identificar los microorganismos?
3. ¿Usted considera que una guía basada en un esquema de descripción
documental (entendiendo como descripción documental, toda la información
adicional que se pueda tener de los microorganismos: ¿nombre, familia,
genero, taxonomía etc.), serviría como orientación en la identificación de
microorganismos etiológicos de la Meningitis? ¿Por qué?
4. ¿De las siguientes técnicas o métodos cuál prefiere utilizar para identificar un
microorganismo causante de la MBA?
s
i
S
i
138
Microscopia, pruebas bioquímicas, medios de cultivo, maldi-tof, PCR u otra
técnica ¿Cuál?
5. Si utilizara la guía de identificación ¿cuáles de los siguientes registros
descriptores le gustaría que tuvieran los microorganismos?
Taxonomía
Descripción e imágenes de la morfología macro y microscópica
Explicación detallada de los procedimientos microbiológicos que se utilizan
para la identificación del microorganismo con sus fundamentos.
Datos epidemiológicos
Tratamiento
Medicamentos con su respectivo mecanismo de acción
Proceso de la infección
Anatomía del SNC,
Otra ¿cuál? y ¿por qué?
6. ¿Cómo le gustaría que estuviera presentada la información de la guía?
Por medio de tablas, graficas, imágenes, videos, audios, otro ¿Cuál?