comisiÓn de Área ciencias agrarias - eez · 2014. 12. 18. · carlos garcía izquierdo, cebas....

ESTADO DE CENTRO 2014

COMISIÓN DE ÁREA CIENCIAS AGRARIAS


ENRIQUE PLAYÁN JUBILLAR (desde octubre de 2014)

Ingeniero agrónomo, doctor en 1992, CSIC en 1993

● CT 1995, IC 2005, PI 2010

● Especializado en gestión del agua en la agricultura

● Dos años como Experto Nacional Destacado en la Comisión Europea (2003‐2005)

● Desde 2006 hasta el 2014, colaborando con el Ministerio responsable de la investigación:

• Colaborador y Gestor del subprograma Agrícola y Forestal • Coordinador de la Iniciativa de Programación Conjunta sobre agua (Water JPI)

COORDINADOR Y COMISIÓN DE ÁREA

COMISIÓN DE ÁREAIñaki Hormaza, IHSM

José Miguel Martínez Zapater, ICVV Jaume Pérez Sánchez, IATS

Salomé Prat, CNB Carlos García Izquierdo, CEBAS


● Optimizar uso de equipos instrumentales, fincas experimentales, despachos,laboratorios, infraestructuras, en estos tiempos de limitaciones

● Los espacios y equipamientos que buscamos pueden estar ya dentro del CSIC ode instituciones asociadas

● Pueden estar infrautilizados por:

• Fragmentación de esfuerzos

• Situaciones anteriores que:

Generan ineficiencia en la organización

No se corresponden con la situación actual

● La compra de nuevos equipos debe de ser analizada a la luz de los existentes

● Los grandes equipamientos deben de ser puestos en valor para mantener supotencial científico y su valor patrimonial

● Debemos buscar fondos externos para su rentabilización y mantenimiento

● Situación muy heterogénea entre centros e institutos

Optimizar los espacios, equipamientos e infraestructuras


● Los grupos punteros (el 10% superior de cada área) corren un riesgo real en lasituación actual

● La excelencia se apoya en: ciencia/tecnología, transferencia, fondos

● Los investigadores de más impacto y más dinámicos deben sentir que sonobjetivo prioritario de su institución

● No se puede permitir que con la excelencia lleguen problemas para mantenerequipos humanos o técnicos, o que los problemas administrativos seacumulen

● Los primeros recursos nuevos que haya en estos años deben de ser para losgrupos excelentes

● Las clases medias científicas tendrán (tendremos) que esperar más parareponerse. La reactivación de la excelencia dará un aire renovado al CSIC

Proteger la Excelencia


● Poner en valor las capacidades del área:

• De la ciencia básica a la tecnología

• Las ciencias agrarias sirven a un sector económico

• Áreas de interfaz con todas las áreas CSIC, fundamentalmente: Biología y biomedicina

Recursos naturales

Ciencia y tecnología de los alimentos

• Perfil de grupos / Centros / Institutos receptores:Excelencia (tres patas)Eficiencia en recursos humanos, espacios, infraestructurasVisibilidad

IDEAS PARA UNA ESTRATEGIA


● Una parte de los recursos humanos que buscamos para hacer frente anuevos desafíos como la innovación o los retos sociales ya estén dentro delCSIC

● Buscar en los institutos bolsas de ineficiencia en los grupos einvestigadores… ponerlos en valor

• Mal encaje funcional• Problemas personales• Falta de dedicación

● A medio plazo estos esfuerzos podrían complementarse con la creación denuevos modelos de carrera profesional dentro del CSIC, como por ejemplola innovación:

• Hay recursos humanos en el CSIC que resultarían mucho másproductivos en estas nuevas carreras que en la carrera científica

• Especialistas en innovación podrían captar recursos de Horizonte2020, del RIS3, LIFE, Programa de Desarrollo Rural, EIPs…

● Situación muy heterogénea entre centros e institutos

Optimizar los recursos humanos


● Seguimiento del perfil del área en Plan Estatal y Comunidades Autónomas

● Buscar vías para el acceso de los grupos a las fuentes de financiacióneuropea regionalizada:• Programa de Desarrollo Rural,• EIP agricultura; EIP agua• RIS3 para los ESIF

● Aumentar la presencia del Área en Horizonte 2020• Continuar mejorando en el ERC (enhorabuena, IHSM)• Sobrevivir a la orientación hacia la innovación en los retos

● Aumentar la presencia del Área en las JPIs y ERA‐NETs

• Zonas refugio para los proyectos colaborativos europeos con alto pesocientífico: FACCE, Water JPI, Oceans, JPI Climate, HDHL, AMR…

● Aumentar la presencia del Área en otros programas Europeoscentralizados (LIFE, MED…)• Cooperando con CDTI en H2020• Incentivando a grupos ante convocatorias específicas

Mejorar la captación de recursos


● Redes de investigación intercentros e interáreas, frente a la fragmentación y laatomización• Seminarios cruzados pueden derivar en nuevas líneas• Orientar subáreas hacia nuevas técnicas de grupos CSIC o no CSIC• Buscar soluciones en red para centros / grupos con poca masa crítica

● Revisión de la estructura de grupos… superando los personalismos para lograreficiencia• Ligado a la identificación de grupos de baja eficiencia… análisis en positivo• Fomentar la figura de coaching para rentabilizar lo que hay

● Orientar el Área a retos sociales

● Desarrollar la figura del “fund raiser” a nivel de área / centro

Ideas adicionales generadas por otros Coordinadores de Área


● Reunión futura de la Comisión de Área con grupos de interés:• Posibles invitados:

MAGRAMA, ministerio del gremio, en sus diferentes áreasOPIs con áreas de solapamiento: IEO, INIAPlataformas tecnológicas con intereses en el temaOrganizaciones de la sociedad civil

• ObjetivosPresentar ideas sobre estrategia, maduradas tras esta reuniónGenerar una discusión sectorial… un procedimiento para orientar el ÁreaDiscutir la necesidad y la forma de mejorar nuestra visibilidadEstablecer un marco para colaboraciones posteriores

• Tentativamente planificada para febrero● Analizar la conveniencia de replicar a nivel autonómico

• Reuniones planteadas por Directores y Comunidades Autónomas• Posibles objetivos adicionales:

Abordaje del Programa de Desarrollo RuralAnalizar el RIS3 en relación con ESIF

Consultando la estrategia con grupos de interés


● Convocados 3 CT para el área

• EspecialidadesInteracción planta‐organismoEstrés, fisiología y nutrición vegetalAcuicultura

• Lista provisional de admitidos, abstenciones de miembros de tribunales

● ID

• Está previsto que se convoquen 17 en el CSIC

• Reparto por áreas inspirado en estimaciones de Contratados RyC con I3

• La Comisión precisa mejor información sobre este tema

● Promoción interna en el Área:

• IC: 3 plazas

• PI: 2 plazas

Plazas y tribunales 2014 del Área


● El Presidente anuncia en el 75 Aniversario un escenario de nuevas plazas conremplazo del 50‐100% de las perdidas anualmente.

• 2011 (29 CT), 2012 (22 CT), 2013 (5 CT)

• 2014: 21 CT + [17 ID] = 38 plazas nuevas

• Crecimiento vegetativo anual (jubilaciones…): ‐ 200 personas

● Esto supone un crecimiento muy importante de las plazas para 2015

● Adjudicación:

• Candidatos

Excelencia y competencia

• Perfil de grupos / Centros / Institutos receptores:Excelencia (tres patas)Eficiencia en recursos humanos, espacios, infraestructurasVisibilidad

Plazas y tribunales del Área: futuro


● Solicitud de informes a la Comisión de Área:

• Iniciales, progreso, final

● Elemento importante para la implicación territorial de los Centros e Institutos

• Universidades, Centros de Comunidades Autónomas, otros OPIs…

● Oportunidad para explotar sinergias y oportunidades, particularmente en lasComunidades Autónomas (la propia u otras)

● Formaliza relaciones existentes casi sin carga administrativa adicional

● En 2006‐13 hubo 23 activas en el Área (en algún momento)

• Un 8 % de las del CSIC

• Cuando el Área tiene un 13% del personal científico

● Algunas han sido germen de Institutos Mixtos

Unidades Asociadas


ORGANIGRAMA CSIC

Juan Manuel Ruiz Lozano

Diciembre 2014

Tareas de apoyo• Control de plagas y aplicación de fitosanitarios (Juan M. García, Sept. 13)• Ayuda en las tareas de preparación, esterilización y eliminación de

sustratos y material vegetal. Riego de plantas

PERSONAL IMPLICADO:Responsable Científico:

Juan Manuel Ruiz LozanoResponsable Técnico:

Fernando Caro FernándezFernando Flores García

Técnico de apoyoJesús Chacón Carrasco

COMPOSICIÓN y USO

Composición • 10 Invernaderos (1 sin climatización)• 9 cámaras de cultivo (+1 cultivo in vitro) (Pedro P.,Fernando F.,Fernando C.)

Uso en 2013• Invernaderos: 68% de ocupación• Cámaras: 60% de ocupación• Picos de uso de cámaras > 85% en primavera y otoño• No limitación de espacio en invernaderos

Uso en 2014 (3 trimestres)• Invernaderos: 66% de ocupación• Cámaras: 65% de ocupación• Picos de uso de cámaras > 85% en primavera y otoño• No limitación de espacio en invernaderos

INGRESOS Y GASTOS 2013

FACTURACIÓN INVERNADEROS: 18.196€• GASTOS 2013: 11.318€ (reparaciones, equipos nuevos (1), plaguicidas...)

• ESTIMACIÓN DE GASTOS ELECTRICIDAD: 12.100€

FACTURACIÓN CÁMARAS: 19.822€• GASTOS 2013: 9.641€ (equipos nuevos (2), reparaciones, gastos varios…)

• ESTIMACIÓN GASTO ELÉCTRICO: 14.400€

INGRESOS Y GASTOS 2014

FACTURACIÓN CÁMARAS (3 trim): 14.510€• GASTOS 2014 (3 trim): 17.640€ (equipos nuevos (3), cámara in vitro,

reparaciones, varios….)

• ESTIMACIÓN GASTO ELÉCTRICO: 10.100€

FACTURACIÓN INVERNADEROS (3 trim): 12.174€• GASTOS 2014 (3 trim): 5.120€ (equipo agua, reparaciones, varios…)

• ESTIMACIÓN DE GASTOS ELECTRICIDAD: 8.500€

USUARIOS INVERNADEROS

GRUPO DE INVESTIGACIÓN (10) % DE USOMICORRIZAS 66HOMEOSTASIS IONICA Y TRANSPORTADORES DE MEMBRANA 8.2REGULACION REDOX, SEÑALIZACION POR AZUCARES Y RESPUESTA AL ESTRÉS BIOTICO Y ABIOTICO DEL PROCESO FOTOSINTETICO 5.5PASTOS Y SISTEMAS SILVOPASTORALES MEDITERRANEOS 4.3BIOFERTILIZACION Y BIOREMEDIACION POR HONGOS RIZOSFERICOS 3.2METABOLISMO DEL NITROGENO 2.5RELACIONES PLANTA‐SUELO 2.1BIOLGIA REPRODUCTIVA DE PLANTAS 1.7SEÑALIZACION POR ESPECIES DE OXIGENO Y NITROGENO REACTIVOEN SITUACIONES DE ESTRÉS EN PLANTAS 1.7INTERACCIONES PLANTA BACTERIA 0.5

2013GRUPO DE INVESTIGACIÓN (9) % DE USOMICORRIZAS 41PASTOS Y SISTEMAS SILVOPASTORALES MEDITERRANEOS 18HOMEOSTASIS IONICA Y TRANSPORTADORES DE MEMBRANA 11.4METABOLISMO DEL NITROGENO 8.5RELACIONES PLANTA‐SUELO 7.1BIOFERTILIZACION Y BIOREMEDIACION POR HONGOS RIZOSFERICOS 4.7REGULACION REDOX, SEÑALIZACION POR AZUCARES Y RESPUESTA AL ESTRÉS BIOTICO Y ABIOTICO DEL PROCESO FOTOSINTETICO 3.9BIOLGIA REPRODUCTIVA DE PLANTAS 2.6SEÑALIZACION POR ESPECIES DE OXIGENO Y NITROGENO REACTIVOEN SITUACIONES DE ESTRÉS EN PLANTAS 1.4

2014

USUARIOS CÁMARAS

GRUPO DE INVESTIGACIÓN (11) % DE USOBIOFERTILIZACION Y BIOREMEDIACION POR HONGOS RIZOSFERICOS 15HOMEOSTASIS IONICA Y TRANSPORTADORES DE MEMBRANA 13.9MICORRIZAS 13.7BIOLGIA REPRODUCTIVA DE PLANTAS 11.1REGULACION REDOX, SEÑALIZACION POR AZUCARES Y RESPUESTA AL ESTRÉS BIOTICO Y ABIOTICO DEL PROCESO FOTOSINTETICO 10.8SEÑALIZACION POR ESPECIES DE OXIGENO Y NITROGENO REACTIVOEN SITUACIONES DE ESTRÉS EN PLANTAS 8.4ANTIOXIDANTES, RADICALES LIBRES Y OXIDO NITRICO EN BIOTECNOLOGIA Y AGROALIMENTACION 6.7GENETICA DE INFECCIONES FITOBACTERIANAS 6.5INTERACCIONES PLANTA BACTERIA 5.8ESTRUCTURA, DINAMICA Y FUNCION DE GENOMAS DE RHIZOBACTERI 4.4METABOLISMO DEL NITROGENO 3.8

2013GRUPO DE INVESTIGACIÓN (11) % DE USOBIOFERTILIZACION Y BIOREMEDIACION POR HONGOS RIZOSFERICOS 22.6HOMEOSTASIS IONICA Y TRANSPORTADORES DE MEMBRANA 18.7MICORRIZAS 15BIOLGIA REPRODUCTIVA DE PLANTAS 9.3INTERACCIONES PLANTA BACTERIA 7.9ANTIOXIDANTES, RADICALES LIBRES Y OXIDO NITRICO EN BIOTECNOLOGIA Y AGROALIMENTACION 7.7SEÑALIZACION POR ESPECIES DE OXIGENO Y NITROGENO REACTIVOEN SITUACIONES DE ESTRÉS EN PLANTAS 6.4METABOLISMO DEL NITROGENO 5.6REGULACION REDOX, SEÑALIZACION POR AZUCARES Y RESPUESTA AL ESTRÉS BIOTICO Y ABIOTICO DEL PROCESO FOTOSINTETICO 3.3ESTRUCTURA, DINAMICA Y FUNCION DE GENOMAS DE RHIZOBACTERI 2.4GENETICA DE INFECCIONES FITOBACTERIANAS 2.2

2014

ACTUACIONES REALIZADAS Y PREVISTAS

Puesta en marcha equipo purificación de agua (Millipore, RIOS 16)

Habilitación de cámara de cultivo in vitro (3ª p. casa roja)

Actualización y mejora de equipos de climatización (sistema inverter)2013 (Inv. 6, Cámara 6, Cámara 8) 2014 (Cámaras 1, 5 y 9)

Sustitución de equipos de climatización en resto de cámaras e invernaderosEn orden de antigüedad o problemática técnicaPlan EQUIPA 2013 aprobado!!! (50.751€; 3 equipos + 5 equipos adicionales)

Instalación de área de fotografía de plantas en laboratorio de Inv. 4Uso con plantas no OMGs. Inv. 1, uso con plantas OMGs

Sustitución vidrios de techo de invernaderos por vidrio carglass armado(11.400€; ya en marcha!!)Iluminación suplementaria Invernadero 4

SICServicio de Instrumentación Científica

Miembros Instrumentos

Dra. Lourdes Sánchez Moreno High Performance Liquid Chromatography (HPLC), HPLC acoplado a un detector de masas ms/ms del tipo electrospray

Dra. Mónica Pineda Dorado Espectrómetro de emisión óptica de plasma acoplado inductivamente (ICP-óptico)

Dr. Rafael Nuñez Gómez Equipo de cromatografía de gases con detector de masas (GC/MS)

Nueva página web

La heterogeneidad de demandas:Desafío y utilidad

GC-MS2014

Muestras grupo facturación P/N días % en tiempo

Residuos de plaguicidas y sus metabolitos

Relaciones Planta-Suelo 490 € P 35 30

Residuos de plaguicidas y sus metabolitos

191 € P 10

Compuestos volátiles en plantas de tomate

82 € P 10

Plaguicidas en muestras de piensos

Producción de Pequeños Rumiantes

592 € P 50 28

Polifenoles en muestras “ADOR” y “Vinaza”

Biofertilización y Biorremediación por Hongos Rizosféricos

386 € P 30 15

Compuestos aromáticos en sedimentos

Microbiología Ambiental y Biodegradación

806 € P 28 15

Polifenoles y ácidos triterpenoides en aceite de oliva y de harina de hueso de aceituna

Biología Reproductiva de Plantas

186 € P 20 10

Deltametrina en extractos de hoja de olivo

Protección Vegetal 149 € P 2 1

Desconocidos en extractos de arcillas

IACT-CSIC 84 € P 2 1

GC-MS 2013

Muestras grupo Facturación P/N días % en tiempo

Derivados de la degradación del naftaleno en cultivos bacterianos


219 € P 38 40

Acido 3,5-dihidroxibenzoico y de 1,2,4-bencenotriol en cultivos bacterianos.

516 € P 30

Acido 3,5-dihidroxibenzoico y de 1,2,4-bencenotriol en cultivos bacterianos y muestras patrón.

305 € P 10

Nitroderivados y otros compuestos activos en frutos de tomate y pimiento.

Antioxidantes, Radicales Libres y Oxido Nítrico en Biotecnología y Agroalimentación

1000 € P 40 22

Alifáticos y aromáticos en extractos de suelos Biofertilización y Biorremediación por Hongos Rizosféricos

134 € P 10 15

PHAs y Alifáticos en muestras de agua por SPME. Análisis semicuantitativo de dibenzofurano en muestras de cultivos fúngicos.

339 € P 15

Dicloroquinolina en cultivos de hongos Relaciones Planta-Suelo 202 € P 32 15

metilcetonas en cultivos bacterianos Genética de Infecciones Fitobacterianas

103 € P 12 5

Volátiles en planta y hojas de tomate y arabidopsis.

Homeostasis Iónica y Transportadores de Membrana

301 € P 8 3

HPLC-MS/Ms2014

Muestras Investigador facturación P/N días% en tiempo

Cofactores en plantas de arabidopsis


30 € P 12

37

Fitoquelatinas en guisante 1,020 € P 27

Cofactores y fitoquelatinas en guisante

515 € P 15

VitC, GSH y GSSG en muestras de brasica

137 € P 11

Cofactores en hojas de pimiento 130 € P 12

Plaguicidas en muestras de piensosProducción de Pequeños Rumiantes

644 € P 32 15

Análisis de plaguicidas en hojas de olivo

Protección Vegetal 336 € P 23 11

Ácido vainíllico en raíces y medio de cultivo

Biofertilización y Biorremediaciónpor Hongos Rizosféricos

344 € P 19 9

Glutation y ascórbato en larvas de pulpo

I. de Acuicultura, CSIC 191 € P 15 7

Cofactores en cotiledones de olivoBiología Reproductiva de Plantas

184 € P 97

Cofactores en polen de olivo 250 € P 7

Hormonas (Ja y Me-Ja) en raíces de tomate

Micorrizas 60 € N 11 5

Paraquat y diquat en suelo Relaciones Planta-Suelo 60 € P 7 3

Anfotericina B en extractos de Leismania

IPBLN, CSIC 100 € N 9 4

HPLC-MS/Ms2013

Descripción de trabajo Investigador responsable Facturación P/N días% en tiempo

Análisis de VitC


120 € P 12

63

Análisis de cofactores en muestras de arabidopsis, Lotus y Ajo

495 € P 18

Análisis de GSH, GSSG y VitC muestras de pimiento

815 € P 17

Análisis de cofactores 300 € P 13

Análisis de cofactores de mostaza y de trigo

440 € P 12

Análisis de cofactores en e guisante y de calabacin

300 € P 16

Análisis de GSNO en presencia de nitrolípidos

30 € P 6

Análisis de GSNO generado a partir de nitrato y uso de sulfanilamida

30 € P 7

Análisis de GSH, GSSG y Ac. ascórbico en aceituna

900 € P 28

Análisis de AHB en raíces y medio de cultivo

Biofertilización y Biorremediación por Hongos Rizosféricos

550 € P 16

14Polímeros de diferentes tamaños 100 € P 13

Fenarimol y Tiacloprid en muestras de Césped y Tomate

IACT 403 € P 22 12

Péptidos en TodS modificada por menadiona


94 € P 13 7

Análisis de cofactores en polen Biología Reproductiva de Plantas

366 € P 9 4

ICP-óptico2014

Muestras Investigador Facturación %

Análisis mineral de Ca, K y Na en 10 muestras vegetales sólidas


30

53


120


120

Análisis mineral de todos los elementos en 36 muestras vegetales sólidas Antioxidantes, Radicales Libres y Oxido

Nítrico en Biotecnología y Agroalimentación

180

45Análisis mineral de todos los elementos en 10 muestras vegetales sólidas

50

Análisis mineral de P en 3 extractos líquidos de suelos

Micorrizas 12 2

ICP-óptico2013

Muestra Investigador Fact. %Todos los elementos de 4 muestras sólidas de suelos Biofertilización y Biorremediación por

Hongos Rizosféricos20 6

Todos los elementos en 11 muestras vegetales sólidas 55Todos los elementos en 8 muestras sólidas de suelos 40Todos los elementos en 45 muestras vegetales sólidas 225K en 28 extractos líquidos de suelos Metabolismo del Nitrógeno 112 20P en 24 extractos líquidos de suelos 96K y P en 24 muestras vegetales sólidas 120K y P en 30 muestras vegetales sólidas y 60 extractos 390Al, B, Ca, Cu, Fe, K, Li, Mg, Mn, Mo, Na, P, S y Zn en 16 muestras 64Ca, cu, Fe, K, Mg, Mn, Mo, Na, P, S y Zn en 47 extractos 235K y P en 38 muestras de extractos acuosos vegetales 161Na en 20 muestras de exudados vegetales Micorrizas 80 46Todos los elementos en 56 muestras vegetales sólidas 280Todos los elementos de 144 muestras vegetales sólidas 720Todos los elementos en 14 muestras vegetales sólidas 70300 muestras sólidas 1500Al, Ca, Fe, K, Li, Mg, Mn, Na, P y Zn en 66 muestras sólidas Homeostasis Iónica y Transportadores de

Membrana330 15

Al, ca, Fe, K, Li, Mg, Mn, Na, P y Zn en 24 muestras sólidas 120Al, Ca, fe, K, Li, Mg, Mn, Na, P y Zn en 36 muestras sólidas 180Todos los elementos en 44 muestras vegetales sólidas 220Todos los elementos en 71 muestras vegetales sólidas Antioxidantes, Radicales Libres y Oxido

Nítrico en Biotecnología y Agroalimentación

355 6

Todos los elementos en 12 muestras sólidas de suelos IACT 60 3Todos los elementos en 12 muestras sólidas de suelos 60Ce, Eu e Yb en 3 muestras sólidas 18Fe en 1 muestra de proteína liofilizada 6Ca y Si en 9 muestras líquidas 45 Todos los elementos en 15 muestras de leche caprina Producción de Pequeños Rumiantes 150 4Todos los elementos en 5 muestras vegetales sólidas 25Todos los elementos en 12 muestras de leche caprina 60

Objetivos

- Reducir el tiempo de espera

- Fomentar el desarrollo de protocolos de análisis nuevos para analitos con alta demanda (formulario para autorización de protocolo nuevo)

- media-jornada de formación para personal de la EEZ sobre técnicas del SIC(febrero 2015)

- Aumento en la reactividad del servicio: introducción de la microdemanda

Curso de formación hidrolisis de muestraspara ICP-óptico

Personal formado grupo

Virginia Cuéllar Maldonado Genética de Infecciones Fitobacterianas

Julia Martín Trujillo Biofertilización y Biorremediación por Hongos Rizosféricos

Nieves Aranda Sicilia, Francisco Javier Gálvez Segovia, Jacob Pérez Tienda


María Sanz Señalización por Especies de Oxígeno y Nitrógeno Reactivo en Situaciones de Estrés en Plantas

Sonia Molina Micorrizas

Resolución convocatoria EQUIPA

1. Cromatógrafo de gases Bruker 450-GC Greenhouse Gas Analyzer: diseñado específicamente para la detección de gases permanentes o con efecto invernadero (oxígeno, óxidos de nitrógeno, CO2, metano, etc) e hidrocarburos de bajo peso molecular. 48.400 euros

2. Sistema ACQUITY UPLC H-Class Bio y accesorios varios: cromatógrafo líquido, rapidez de análisis y mejor sensibilidad. 40.881 euros

3. Concentrador de muestras ITEX: accesorio para el GC-MS, permite muestrear con mayor sensibilidad compuestos orgánicos volátiles. 8 338 euros

Trabajos pendientes

GC-MSJuan de Dios Alché: Polifenoles y ácidos triterpenoides en aceite y harina*Pilar Rodriguez: Sacarosa en extractos de fruto de tomate*Eduardo López Huertas: aminoácidos*Emilio Benitez: metabolitos de pesticidas en suelo*Emilio Benitez: volátiles en plantasJuan José Lázaro: PHAs en aguas* En ejecución. Actualmente afectados por la avería del equipo.

HPLC-Ms/MsM.Martín-Vivaldi, UGR: Ácidocompuestos en secreciones de aveE.Romero: Residuos de plaguicidas (diuron, tebuconazol, imidacloprid y oxigluorfeno) en suelos F.J.Corpas: Determinación de cofactores y fitoquelatinas en plantas de arroz, guisante y lechugaM.I. Ramos: Determinación de c-di-GMP en bacterias

ICP-óptico

Datos económicos

Instrumento Facturación 2013

Gastos 2013

Facturación 2014

Gastos 2014

HPLC, HPLC-MS 4943 6493 4001 5782

GC-MS 3119 2967

ICP-óptico 5809 2433 512 2965

Total 13 871 8936 7480 8747

SERVICIO DE SECUENCIACIÓN DE ADN(2013‐2014)

Responsable hasta Febrero 2013: Francisco Martínez‐AbarcaDesde Marzo 2014: Ricardo Aroca

Personal: Amparo Salido

EQUIPAMIENTO:

‐Secuenciador ABI PRISM 3130xl Genetic Analyzer

(Secuenciación Sanger)

‐454 FLX Junior (Roche). (16S rRNA sequencing Amplitags)

‐Cuantificación de DNA con QuantiFluor (Picogreen).

PEQUEÑO EQUIPAMIENTO ADQUIRIDO EN 2014:

(Cubeta de Electroforésis, Fuente de Alimentación, Pipeta

Multicanal, Pipeta repetidora Multipette)

SECUENCIACIÓN SANGER(2013‐2014)

1219

316

227117

11394

93 76 52

40

38

2119

16

6

Sanger 2013

Genomas Rizobacterias

Planta‐Suelo

Metabolismo Nitrógeno

Micorrizas

Planta‐Bacteria

MicrobiologíaAmbiental

Salud Gastrointestinal

Hongos Rizósféricos

Homeostasis iónica

InfeccionesFitobacterianas

Bilogía Reproductiva

Proceso Fotosintético

Pequeños Rumiantes

Antioxidantes

Total = 2447Externo (UGR) = 321 (2768, 12%)

1294

291

159141

120105

65 54

43

42

26

3

Sanger 2014(Noviembre)


Micorrizas


Plant‐Bacteria

Homeostasis iónica

Microbiología Ambiental



Antioxidantes



Pequeños Rumiantes

Total = 2343Externo (UGR) = 102 (2445, 4%)


49,8%

12,9%

9,3%4,8%4,6%3,8%

3,8%

3,1%

2,1%

1,6%

1,6%0,9%

0,8%

0,7%

0,2%

Sanger 2013


Planta‐Suelo


Micorrizas

Planta‐Bacteria




Homeostasis iónica



Proceso Fotosintético

Pequeños Rumiantes

Antioxidantes

55%

12%

7%6%

5%4%

3% 2%

2%

2%

1%

0%

Sanger 2014(Noviembre)


Micorrizas


Plant‐Bacteria

Homeostasis iónica




Antioxidantes



Pequeños Rumiantes


050

100150200250300350400450

Núm

ero de

Secue

ncias

Sanger 2013promedio = 204 sec / mes(231 externos)

050

100150200250300350400450500

Núm

ero de

secuen

cias

Sanger 2014promedio = 213 secuencias/mesExterno (222)

Demanda media 26

Demanda media 31

1

10

5

2 2 2

1

0

2

4

6

8

10

12

2013 2014

Runs Junior 454

Externos



Pequeños Rumiantes


Secuenciador 454 GS Junior

3

20

Taq Polimerasa

7

20

10

5

0

5

10

15

20

25

2013 2014

(500 U)

Homeostasis iónica


Gastos e Ingresos

Gastos 2013: Fungible 17.032,28 €Ingresos 2013: 20.568,91 €Saldo: 3.563,63 €

Gastos 2014: Fungible: 38.017,41 €Inventariable: 1.469,32 €Total: 39.486,73 €

Ingresos: 44.995,66 €Saldo: 5.508,93 €

0

5000

10000

15000

20000

25000

30000

35000

40000

45000

50000

2013 2014

Ingresos

Gastos

Futuro

2200 TapeStation Instrument

Shotgun (Secuenciación genomas, RNA seq)

Amplitag Universales (16S)

‐ 450 nt a 800 nt‐Hasta 60 muestras

Personal del Servicio:

Dª Alicia Rodríguez Sánchez Dª Mª Carmen Perálvarez Gutiérrez

Responsable Científico (2014):

Enero‐marzo: Dr. Juan de Dios AlchéMarzo‐diciembre: Dra. Adela Olmedilla

http://www.eez.csic.es/?q=es/node/4103 [email protected]

Equipamiento

CONFOCALNikon C‐1

ESTEREOLeica

INVERTIDOLeica

TEMZeiss/JEOL

Laboratorio de Preparación de Muestras

Comparativa número horas de uso demicroscopios 2013/2014

• MICROSCOPIO INVERTIDO: 205 h (27 usuarios)/101 h (11 usuarios)

• ESTEREOMICROSCOPIO: 113,5 h (13 usuarios)/86 h (13 usuarios)

• MICROSCOPIO CONFOCAL NIKON: 95 h (20 usuarios)/40,5 h (6 usuarios)

• MET JEOL: 91 h (17 usuarios)/74,5 h (11 usuarios)

• MET ZEISS: 20 h (13 visitas)/10,5 h (7 visitas)

Comparativa preparación muestras 2013/2014

• CONTRASTADO REJILLAS: 27 REJILLAS (3 usuarios)/27 REJILLAS (1 usuario)

• CORTES SEMIFINOS: 96 BLOQUES (4 usuarios)/174 BLOQUES (1 usuario)

• CORTES ULTRAFINOS: 65 BLOQUES (6 usuarios)/20 BLOQUES (2 usuarios)

• INCLUSIONES MATERIAL: 585 MUESTRAS (13 us.)/91 MUESTRAS (6 us.)

• PREPARACION MUESTRAS SEM: 10 MUESTRAS (1 us.)/4 MUESTRAS (1 us.)

• MATERIAL MICROSCOPÍA: 9 REJILLAS (2 us.)/15 REJILLAS (2 us.)

MICROSCOPIO INVERTIDOENE FEB MAR ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPT OCT NOV DIC

4 8,5 20,5 11 39 37 27 4 3 17,5 25 8,52013

(205 h)

ENE FEB MAR ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPT OCT NOV DIC

2,5 29 26,5 19 9,5 0 9,5 0 0 0 5 0

2014(101 h)

Biología reproductiva deplantas

Señalización porespecies de O y N

Regulación redox

Ecología genética de larizosfera

Bioquímica y biologíamolecular

Usuarios externos

Microorganismosrizosféricos

Biología reproductivade plantas



Interacciones planta‐bacteria

Ecología genética de larizosfera

Regulación redox

Degradación tóxicosorg.

Metabolismo del N

2013 2014

Detalle de uso de microscopios por mes. Uso por grupos. (2013/2014)

Homeostasisiónica

Homeostasisiónica

Detalle de uso de microscopios por mes durante 2013/2014

2013 (113,5 h)

2014(86 h)

ESTEREOMICROSCOPIO


16,5 11,5 22 11,5 24,5 6 1 0 0 8 10,5 2


2 11 12 4,5 23,5 0 5,5 0 20,5 1 6 0

Usuarios externos



Regulación redox



Micorrizas


Microorganismosrizosféricos

Micorrizas

Pastos

Microbiologíaambiental


Protección vegetal

2013 2014

MICROSCOPIO CONFOCAL

2013 (95 h)

2014(40.5 h)

2013 2014


12 1,5 0 17,5 28,5 11,5 2 4 1,5 1 13 2,5


0 6 7,5 6,5 7 5,5 0 0 2,5 5,5 0 0

Regulación redox


Usuarios externos

Micorrizas






Regulación redox




Homeostasisiónica

Homeostasisiónica

MICROSCOPIO ELECTRÓNICO (JEOL)

2013 (91 h)

2014(74,5 h)

2013 2014


ENE FEB MARZO ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPT OCT NOV DIC

4 5 0,5 2 8 19 34 0 6,5 7 5 0


17 5 22 9,5 3,5 6 0 0 9 1 1,5 0



Usuarios externos



Sistemas antioxidantes




Antioxidantes, radicaleslibres

Micorrizas

Metabolismo del N

Homeostasisiónica

Homeostasisiónica

2013 (27)

2014(27)

2013 2014

Detalle de preparación muestras por mes y por grupos. (2013/2014)

CONTRASTADO DE REJILLAS


0 0 0 0 0 2 22 0 0 0 3 0

ENE FEBR MAR ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPT OCT NOV DIC

0 0 6 7 2 12 0 0 0 0 0 0

Usuarios externos




2013 (0)

2014(4,5)


USO DE MICROTOMOS


0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

ENE FEBR MAR ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPT OCT NOV DIC

0 0 0 0 0 0 4,5 0 0 0 0 0

2013

2014

• No se usa

• Señalización por especies de oxígeno y nitrógeno en sist. de estrés en plantas: 100 %

2013 (96blq)

2014(174blq)

2013 2014


SECCIONES SEMIFINASENE FEB MAR ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPT OCT NOV DIC

0 60 0 0 0 18 18 0 0 0 0 0

Micorrizas


Usuarios externos




66 0 0 42 35 0 31 0 0 0 0 0

Homeostásisiónica

2013 (58 blq)

2014(20blq)

2013 2014


SECCIONES ULTRAFINAS


Usuarios externos

Sistemas antioxidantes




Micorrizas



30 0 0 9 1 0 18 0 0 0 0 0


0 0 12 0 0 0 6 0 0 2 0 0

Homeostasisiónica

Homeostasisiónica

2013 (585 mst)

2014(91mst)

2013 2014


INCLUSIONES DE MATERIAL


16 56 0 4 1 0 295 0 0 3 196 14


19 37 0 2 21 1 9 0 2 0 0 0

Usuarios externos


Micorrizas

Regulación redox





Regulación redox

Metabolismo del N

Micorrizas


Homeostasisiónica

Homeostasisiónica

2013 (10 mst)

2014(4mst)

2013

2014


PREPARACIÓN DE MUESTRAS PARA MEB

ENE FEB MAR ABRIL MAYO JUNIO JULIO AGOSTO SEPT. OCT. NOV. DIC.

0 0 0 0 10 0 0 0 0 0 0 0


0 0 4 0 0 0 0 0 0 0 0 0

• Regulación redox y respuesta al estrés biótico y abiótico: 100 %

• Regulación redox y respuesta al estrés biótico y abiótico: 100 %

2013 (9rej)

2014(15rej)

2013

2014

Detalle de compra de material por mes y por grupos. (2013/2014)

• Interacciones planta-bacteria: 100 %

• Interacciones planta-bacteria: 100 %

MATERIAL DE MICROSCOPÍA


0 0 0 0 0 2 4 0 0 0 3 0


0 0 6 7 2 0 0 0 0 0 0 0

• Incorporación progresiva de nuevos equipos:

‐ Agitador‐Mezclador ELMI Modelo RM‐2L‐Microscopio binocular modelo LBX100‐ Centrífuga Spectrafuge‐Mini‐ Congelador horizontal marca Ignis modelo ICF110 y caja de polimerización adaptada por el personal de mantenimiento de la EEZ‐ pHmetro Basic‐20 y electrodo 5012‐Máscaras 3M 6800 y filtros‐Microondas marca Scheneider

Otras acciones realizadas (2014)

•Traslado de los micrótomos, que anteriormente eran de uso compartido con el grupo de Biología reproductiva de plantas y que han pasado a ser del Servicio, a una habitación mejor acondicionada.

• Colaboración en actividades de divulgación:

• Visitas de 7 centros de educación primaria, secundaria y otros.•Participación en el evento: “La noche de los investigadores”.

enero a diciembre 2013

∗ Adquisición de material fungible:2 699,44 €

∗ Adquisición de material inventariable:• Bomba recirculación TEM: 673,97 €• Diodo TEM: 153,74 €• Pipeta automática P1000: 277,09 €∗ Reparación y mantenimiento de equipos:• Revisión TEM: 2 492,88 €• Reparación TEM: 6 266,85 €

∗ TOTAL: 12 563,97 €

enero a diciembre 2014

Gastos servicio de microscopía

∗ Adquisición de material fungible:1 595,37 €

∗ Adquisición de material inventariable:• Agitador‐mezclador: 450 €• Rax para 42 tubos: 55 €• Microscopio binocular: 415 €• pHmetro: 498 €• Minicentrífuga: 150 €• Congelador: 1 88,23 €• Microondas: 62,58 €• Fuente alimentación ordenador

Microscopio Invertido Leica: 61,98 €

∗ TOTAL: 3 476,16 €

enero a diciembre 2013 enero a diciembre 2014

Ingresos servicio de microscopía

Uso microscopio invertido: 235,25 €

Uso estereomicroscopio: 198,5 €

Uso microscopio confocal Nikon: 729 €

Uso microscopio TEM JEOL: 1 639 €

Contrastado de rejillas: 40,5 €

Secciones semifinas: 696 €

Secciones ultrafinas: 162 €

Inclusiones de material: 543 €

Preparación de muestras MEB: 30 €

Material de microscopía: 45 €

Uso microtomo RM2165 LEICA: 9 €

Uso microscopio invertido: 506,5 €

Uso estereomicroscopio: 386 €

Uso microscopio confocal Nikon: 1 694 €

Uso microscopio TEM JEOL: 1 958 €

Contrastado de rejillas: 40,5 €

Secciones semifinas: 384 €

Secciones ultrafinas: 451 €

Inclusiones de material: 1 700 €

Preparación de muestras MEB: 30 €

Material de microscopía: 27 €

Uso microtomo RM2165 LEICA: 0 €

TOTAL: 7 177 € TOTAL: 4 327,25 €

Gastos/Ingresos2013/2014

Comparativa gastos/ingresos 2013/2014

∗ Procesador automático de tejidos ∗ Sistema modular de inclusión de tejidos en parafina∗ Vibratomo

Programa Equipa

¡Felices fiestas!¡Feliz y próspero

año 2015!

SERVICIO DE ANÁLISIS DE NITRÓGENO Y CARBONO

1

Servicio de Análisis de N/C

‐Equipo utilizado: Leco TruSpec CN (finales de 2007).

‐Surge como alternativa limpia y eficaz al método Kjeldhal, “cuello de botella”

del Departamento.

‐Servicio de Instrumentación (2009)‐ fase de transición‐ Servicio

independiente (2013).

‐Utilizado sobre todo por grupos del Departamento de Fisiología y Bioquímica

de la Nutrición Animal, extendiéndose en la sede principal.

‐Tiempo de respuesta: inferior a una semana.


2


‐Se basa en el método Dumas de combustión de la muestra para un posterior

análisis de los gases generados.

‐Es útil para una gran variedad de matrices: tejidos vegetales y animales,

alimentos, suelos.

‐Requerimientos de la muestra: homogénea y cantidad suficiente (100 mg).

Análisis adicionales:

‐Análisis de muestra líquidas.

‐Análisis de C orgánico por combustión a baja temperatura.

Análisis de Nitrógeno y Carbono

3

4

Servicio de Análisis de N/CMuestras analizadas

2013‐2014 Muestras Ordenes de Trabajo (OT) % Muestras % OT

Producción de Pequeños Rumiantes 933 36 34,0 42,4Nutrición Animal 736 18 26,8 21,2Metabolismo del Nitrógeno 414 12 14,4 14,1Relaciones Planta‐Suelo 231 3 8,4 3,5Salud Gastrointestinal 140 6 4,9 7,1

Interacciones Planta‐Bacteria 153 2 5,6 2,4

Biofertilización y Biorremediación por Hongos Rizosféricos 40 1 1,4 1,2Microbiología del Suelo y Sistemas Simbióticos 36 1 1,3 1,2Genética de Infecciones Fitobacterianas 25 1 0,9 1,2Micorrizas 14 2 0,5 2,4Otros 25 1 0,9 1,2

Total 2746 85 100 100

2012 Muestras OT % Muestras % OT

Producción de Pequeños Rumiantes 755 31 62,0 52,5Nutrición Animal 223 16 18,3 27,1Salud Gastrointestinal 112 6 9,2 10,2Metabolismo del Nitrógeno 99 3 8,1 5,1

Otros 19 2 1,6 3,4

Estructura, Dinámica y Función de Genomas de Rizobacterias 9 1 0,7 1,7Total 1217 59 100 100

5


Datos económicos (Enero 2013‐Septiembre 2014)

2013 2014 Total

Ingresos 2466,40 1045,70 3512,10

Gastos 2671,42 522,05 3193,47

Diferencia ‐205,02 523,65 318,63

Gastos: Fungibles + Mantenimiento

( Balance estimado Octubre‐Diciembre 2014: +288 euros )

Comisión Científica

Silvia Marqués Protección AmbientalJuan de Dios Alché BioquímicaEdu Molina Nutrición AnimalJuan Sanjuan Microbiología

Eduardo López‐Huertas OTT

Carmen LorenteElisabet Correa

•“Brainstorming”: ideas para potenciar la actividad científica del centro

•Fuentes de financiación‐ Análisis de convocatorias H2020, etc. para detectar oportunidades‐ Búsqueda de posibilidades fuera de lo “clásico” (fundaciones, empresas, extranjero)

•Apoyo a investigadores (ej. ERC o similares)

•Hacia la acreditación “Severo Ochoa” ‐ 1 M€ / año durante 4 años‐ Posibilidad de usar ese dinero para cofinanciaciones‐ Programa específico de contratos predoctorales

Severo Ochoa: ¿podemos?

• Mínimo 10 investigadores > 1.5 veces media mundial impacto normalizado en el área

• Plan de investigación

• Indicadores de excelencia

• Seleccionar un director científico para ese plan (tiene que cumplir lo primero)

• Recopilar datos publicaciones de TODOS los investigadores de plantilla

• Otros: plan de formación, comité externo, etc.

2008‐2012 Ejemplo para Severo Ochoa

M. Espinosa‐Urgel h‐index = 18

D) = Area Microbiology & Immunology > Microbiology

AÑO A: PAPERS B: CITAS C = B/A D: MEDIA MUNDIAL

E = C/D F = A/T Mp = E×F

2008 2 49 24.5 16.56 1.48 0.125 0.185

2009 1 0 0 13.61 0 0.0625 0

2010 4 54 13.5 10.03 1.35 0.25 0.3375

2011 4 39 9.75 6.26 1.56 0.25 0.39

2012 5 15 3 3.35 0.9 0.31 0.28

Total (T) 16 157 1.2

2008‐2012 Ejemplo para Severo Ochoa

M. Espinosa‐Urgel

D) = Area Microbiology & Immunology > Applied Microbiology & Biotechnology

AÑO A: PAPERS B: CITAS C = B/A D: MEDIA MUNDIAL

E = C/D F = A/T Mp = E×F

2008 2 49 24.5 12.46 1.97 0.125 0.246

2009 1 0 0 9.47 0 0.0625 0

2010 4 54 13.5 7.07 1.91 0.25 0.4775

2011 4 39 9.75 4.41 2.21 0.25 0.5525

2012 5 15 3 2.29 1.31 0.31 0.406

Total (T) 16 157 1.68

Amenazas: recambio generacional

Número total publicaciones 2008‐2013

comisiÓn de Área ciencias agrarias - eez · 2014. 12. 18. · carlos garcía izquierdo, cebas....

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