biología 3-teoría wohler

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Page 1: Biología 3-teoría Wohler

Las proteínas (proteuro: el primero)Llamadas también prótidos son principios inmediatos de tipo orgánico, compuestos básicamente por C, H, O y N; suelen contener además S y, con frecuencia menor P, Fe, Cu, Mg, I, etc. Tienen un alto peso molecular (macromoléculas).

Importancia• Son componentes estructurales de las membranas y organelas celulares. Colágeno (huesos, cartílagos, tendones),

alfa queratina (pelos, plumas, uñas).

• Catalizan las reacciones celulares. Todas las enzimas son proteínas. Ejemplo: Ribonucleasa (degrada al ARN), citocromo oxidasa (transporta electrones), tripsina (hidroliza proteínas).

• Transportan moléculas, como la hemoglobina (transporta gases respiratorios), la transferrina (transporta hierro), la hemocianina (transporta O2 en los invertebrados).

• Regula los procesos biológicos. Muchas hormonas son proteínas. Ejemplo: insulina (regula la glucosa en la sangre), la prolactina (produce leche), la hormona del crecimiento (actúa en el cartílago del crecimiento).

• Forman las fibras contráctiles de las células musculares. Ejemplo: la actina y la miosina.

• Las proteínas de reserva almacenan nutrientes, como la ovoalbúmina (huevo), caseína (leche).

• Tienen acción defensora. Los anticuerpos y las proteínas del complemento.

• Suministran energía.

Las proteínas son moléculas muy específicas, de manera que cada ser vivo posee algunas proteínas características de la especie biológica a la que pertenecen y otras que son propias de ese individuo en particular.Las proteínas están constituidas por polímeros de aminoácidos. Los aminoácidos son compuestos orgánicos que se caracterizan por poseer un grupo carboxilo (–COOH) y un grupo amino (–NH2).

EnzimasSon biocatalizadores. Transforman las sustancias químicas. La sustancia sobre la que actúa se denomina sustrato, la misma que es transformada en producto. Todas la enzimas son altamente específicas y son muy sensibles a los cambios de temperatura y pH. Existen dos modelos de acción enzimático:

Llave cerradura: Según este modelo, la enzima y el sustrato presentan una estructura que se complementan físicamente entre sí, tal como sucede con la llave y la chapa (cerradura). Es un modelo obsoleto

Encaje inducido: según este modelo, la enzima y el sustrato no presentan una estructura que se complementan físicamente. Sin embargo es el sustrato quien induce a la enzima para que esta se acomode a la forma del sustrato. Este modelo es el que se acepta actualmente.

La especificidad es una característica esencial de las enzimas, es decir una enzima no puede actuar sobre cualquier sustrato: Existe una enzima para cada sustrato.• Nomenclatura: Para denominar una enzima existen diferentes criterios (sustrato por el cual actúa, tipo de

reacción, etc)En términos generales el nombramiento de una enzima va con la terminación Asa. Así.

Sustrato Enzima

LípidosProteínasAlmidónSacarosa

LipasaProteasaAmilasaSacarasa

Reacción Enzima

OxidaciónCarboxilación

OxidorreducciónTransaminación

OxidasaCarboxilasa

OxidorreductasaTransaminasa

3 Bioquímica II

Biología

San Marcos23Colegio FRIEDRICH WÖHLER

Page 2: Biología 3-teoría Wohler

Existen unos 300 aminoácidos diferentes, pero solo 20 están en las proteínas, se les llama aminoácidos naturales. (Son 20a–aminoácidos). Desde el punto de vista nutricional, los aminoácidos son clasificados en: esenciales (no pueden ser sintetizados por nuestro organismo) y no esenciales.

Esencialesarginina, histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilalanina, triptofano, valina, treonina.

No esencialesasparagina, alanina, ácido aspártico, glutamina, ácido glutámico, cisteína. glicina, prolina, serina, tirosina.

De estos 20 aminoácidos, para formar una proteína de 100 aminoácidos existen hasta 20100 posibilidades diferentes. El aminoácido más simple es la glicina.

ClasificaciónSe han propuesto varias clasificaciones de los aminoácidos, de acuerdo con la naturaleza del grupo R, siendo la más importante la que se basa en su polaridad. Con este criterio habría 4 clases de aminoácidos.

a. Aminoácidos con grupo R no polares (hidrófobos)Este grupo comprende cinco aminoácidos con grupo R hidrocarburo alifático (alanina, leucina, isoleucina, valina y prolina), dos aminoácidos de anillo aromático (fenilanina y triptofano) y uno que contiene azufre (metionina). Todos estos aminoácidos son menos solubles en el agua que los que ostentan grupos R polares. La alanina es el menos hidrófobo.

b. Aminoácidos con grupos polares R neutrosEstos aminoácidos son más solubles en agua que el grupo anterior. Tienen grupos funcionales polares neutros que pueden dar lugar a puentes de hidrógeno con el agua. La polaridad de la serina, treonina y tirosina se debe al grupo OH; la de la asparragina y glutamina, al grupo amino y de la cisteína, al grupo SH.

c. Aminoácidos con grupos R positivamente cargados (básicos)Los aminoácidos básicos tienen una carga neta positiva a pH 7,0. Estos son la lisina, que tiene un grupo amino de carga positiva en la posición de la cadena alifática, la arginina que tiene un grupo guanidino positivo y la histidina que contiene un grupo imidazólico débilmente básico.

d. Aminoácidos con grupos R cargados negativamente (ácidos):Estos son los ácidos aspártico y glutámico, que tienen un segundo grupo carboxilo totalmente ionizado, es decir, con carga negativa a pH 6 a 7.

Enlace peptídicoEs un enlace covalente y se establece entre el grupo carboxilo de un aminoácido y el grupo amino del aminoácido contiguo inmediato con el consiguiente desprendimiento de una molécula de agua.Por naturaleza química, el enlace peptídico presenta cierta rigidez e inmoviliza en el plano a los átomos que lo forman; por lo tanto, existen otros enlaces que permiten formar otras estructuras de las proteínas.

Tipos• Fuertes: peptídicos, disulfuro.• Débiles: puente de hidrógeno, salinos, hidrófobos, electroestáticos, fuerzas de Van der Walls.

Estructura de las proteínasLas proteínas pueden manifestar distintos grados de complejidad o de estructuras, de los cuales depende su función biológica característica.

a. Estructura primariaEs el orden o secuencia de los aminoácidos en la cadena. Viene determinada por la información hereditaria (control genético). El cambio de un solo aminoácido puede hacer que la proteína pierda su función característica.

b. Estructura secundariaEs la forma que adopta la cadena de aminoácidos en el espacio, que se mantiene gracias a puentes de hidrógenos. Puede tener forma de a – hélice (a– queratina), b(lámina plegada; fibroina de la seda y b – queratina) o triple hélice (colágeno).

c. Estructura terciariaEs la conformación que adopta la molécula como consecuencia de las interacciones entre los aminoácidos. Existen dos tipos de estructuras.

Capítulo

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— Conformación globularEs la propia estructura secundaria, que se une entre sí mediante enlaces de disulfuros, puentes de H, salinos, fuerzas de Van der Walls. Por ejemplo, las enzimas, los anticuerpos, la actina, la miosina.

— FibrosaEs la estructura secundaria del tipo a – hélice. Por ejemplo: el colágeno, la queratina y la elastina.

d. Estructura cuaternariaConsiste en la asociación de dos o más cadenas iguales o distintas, mediante enlaces de tipo débil. La presentan solo las proteínas de gran tamaño. Ejemplo: la hemoglobina, el colágeno, los capsómeros (proteínas virales).

LípidosSon biomoléculas ternarias (poseen C – H – O, aunque algunos lípidos contienen también N y P. Son insolubles en agua y solubles es disolventes apolares, como el éter, el cloroformo o el benceno.

Importancia• Almacenamiento de energía.• Constituye las membranas celulares (función estructural).• Constituye hormonas.• Constituye las vitaminas liposolubles.• Protección e impermeabilidad de las superficies vegetales.• Protección alrededor de órganos delicados.• Termoaislante (mal conductor del calor), mantiene la temperatura corporal de los animales endotermos (mamíferos).

Componentesa. Ácidos grasos

Son poco abundantes en estado natural, están constituidos por una cadena de número par de átomos de carbono, que tiene un grupo ácido en uno de sus extremos. Se conocen unos 70 ácidos grasos. Dependiendo del tipo de enlace que exista entre los átomos de carbono, pueden ser:

— SaturadosLos átomos de carbono están unidos por enlaces sencillos (caprílico, palmítico, esteárico, araquídico).

— MonoinsaturadosExiste un enlace doble (oleico, palmitoleico, linolénico).

— PoliinsaturadosExisten dos o más enlaces dobles (ácidos linoleico, linolénico y araquidónico, llamados esenciales).

b. AlcoholSon cadenas hidrocarbonadas que presentan como grupo funcional a los oxidrilo. Los alcoholes que se hallan en los lípidos son: glicerol (o glicerina, es el más común), esfingosina (en sistema nervioso), dolicol (en levaduras) y el miricilo (cera de abejas).

Clasificación de lípidos

Lípidos

Ácidos grasosTriglicéridos: Son los más abundantes. Es la reserva de los animales en forma de sebo y manteca. En vegetales es líquido (aceite).Lípidos simples y

hololípidosacilglicérido y

céridos Ceras: Formado por un ácido graso y un alcohol lineal.

Lípidos complejos (compuestos o heterolípidos)

• fosfolípidos

• fosfoaminolípidos

saponificables • esfingolípidos

• glucolípidos

• proteolípidos

Esteroides insaponificables• esteroides

• terpenos

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Page 4: Biología 3-teoría Wohler

Los principales grupos de lípidos son los siguientes:

c. Lípidos saponificables (Pueden formar jabones)Son los que al descomponerse liberan ácidos grasos y alcoholes. Tenemos a:

— Grasas o triglicéridosSon moléculas resultantes de la unión de tres ácidos grasos con una molécula de glicerina o glicerol, no tienen grupo polar, son hidrófobos. Constituyen depósitos de reserva energética. También desempeñan funciones de aislamiento térmico y de protección de ciertos órganos.

— CerasCrean cubiertas protectoras. En el reino animal se encuentran en la piel, el pelo, las plumas, el exoesqueleto de muchos insectos y en la cera de abejas. En los vegetales se hallan recubriendo hojas y frutos.

— FosfolípidosSon moléculas formadas por la unión de ácidos grasos con fosfato y ciertos compuestos, que caracterizan a cada fosfolípido. Poseen un extremo polar (hidrófilo), mientras que el resto de la molécula es apolar (hidrófobo). Esta estructura permite que formen películas delgadas en una superficie acuosa, base de la formación de las membranas celulares.

— GlucolípidoFormados por un ácido graso, el alcohol esfingosina y un carbohidrato (monosácarido o disacárido). Se halla en el sistema nervioso y en la membrana celular de animales y protozoarios (forman el glucocálix).

d. Lípidos no saponificables (No pueden formar jabones).Cuando son descompuestos, no liberan ácidos grasos o alcohol. Se les llama también Lípidos Derivados. Tenemos a:

— TerpenosForman pigmentos (carotenoides, que participan en la fotosíntesis) y sustancias olorosas (mentilo, limoneno, geraniol), también constituyen el caucho, así como vitaminas A (antixeroftálmica), E (tocoferol) y K (naftoquinona).

— EsteroidesA este grupo pertenecen las hormonas sexuales (testosterona, progesterona) y las de la corteza suprarrenal (cortisol, aldosterona), la vitamina D (calciferol), los ácidos biliares y el colesterol, un componente de las membranas celulares. El colesterol es sintetizado en el hígado a partir de ácidos grados naturales. El colesterol se encuentra solo en pequeñas cantidades en las plantas, las que tienen otro tipo de esteroles, llamados fitosferoles, entre los cuales tenemos al estigmasterol y el fitosferol. Los hongos y levaduras tienen otro tipo de esteroles, los micosteroles, entre los cuales cabe mencionar el ergosterol que se transforma en vitamina D por la radiación ultravioleta.

Ácidos nucleicosLos ácidos nucleicos son biomoléculas pentaméricas (poseen C – H – O – N – P), y están formados por cadenas de nucleótidos, unidos entre sí mediante enlaces fosfodiester. Se encuentran en todos los seres vivos y controlan todos sus procesos vitales.Nucleótido: unidad básica (monómero) de los ácidos nucleicos. Está compuesto por:• Un monosacárido de tipo pentosa, que puede ser ribosa o desoxirribosa.• Un ácido fosfórico (H3PO4) que le da la característica ácida a la molécula.• Una base nitrogenada compuesta por C, H, O y N. Existen dos tipos de bases:

Bases nitrogenadas púricasPertenecen a este grupo la adenina (A) y guanina (G). Poseen doble anillo.

Bases nitrogenadas pirimidínicas.Pertenecen a este grupo la Citosina (C), Timina (T) y Uracilo (U). Poseen un solo anillo.

Bases nitrogenadas (complementarias)Son aquellas bases que pueden formar puentes de hidrógeno entre sí. Así tenemos que A y T (U) son complementarias, lo mismo que G y C, unidas con dos y tres puentes de Hidrógeno respectivamente (Ley de Chargaff).Los estudios de Chargaff del ADN revelaron:• Que el número de bases púricas (A+G) estaba en equilibrio con el número de bases pirimídinicas (T+C) o sea

Púricas / Pirimidínicas= 1.0• Que el número de residuos de guanina estaba equilibrado con el número de residuos de timina o sea A/T= 1,0• Que el número de residuos de guanina estaba equilibrado con el número de residuos de citocina, o sea G/C= 1,0.

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• Que la suma de los residuos de adenina y citocina estaba equilibrada con la suma de los residuos de guanina y timina, o sea (A+C)= (G+T).

Para la constitución del nucleótido los tres elementos mencionados se unen. La unión entre pentosa y la base nitrogenada, es mediante un enlace b – N glucosídico; mientras que la unión entre el ácido fosfórico y la pentosa, se realiza mediante un enlace fosfoéster.A los nucleótidos se les clasifica en desoxirribonucleótidos y ribonucleótidos, según la pentosa que posean: desoxirribosa o ribosa, respectivamente. También se les clasifica según la base nitrogenada que posean: nucleótido de adenina, nucleótido de citosina, nucleótido de uracilo, etc.Un concepto complementario al de nucleótido es el de nucleósido, que es la unión de una pentosa y una base nitrogenada.

Clasificacióna. ADN (ácido desoxirribonucleico)

Es un ácido nucleico constituido por dos cadenas de desoxirribonucleótidos, colocadas antiparalelamente (una cadena está “de cabeza” con respecto a la otra, pero son paralelas), que se mantienen unidas mediante los puentes de hidrógeno que se forman entre sus bases nitrogenadas. Por esto último se dice que son cadenas complementarias, ya que cada base nitrogenada de una de las cadenas tiene “al frente” (en la otra cadena) a su base complementaria. Esta estructura bicateriana se tuerce sobre si misma formando una hélice o espiral, por lo que se dice que es helicoidal, con giro a la derecha.

— Estructura del ADNLos desoxirribonucleótidos presentan las siguientes características:• Pentosa: desoxirribosa• Ácido fosfórico (H3PO4)• Bases nitrogenadas: adenina, guanina, citosina y timina.

FuncionesEs la molécula que contiene la información genética o hereditaria de un organismo. Se encuentra presente en todas sus células. En ella encontramos todas las instrucciones para construir y poner en funcionamiento cada una de las estructuras de un ser vivo. Tiene la capacidad de hacer copias de sí misma (replicación o autoduplicación del ADN)

b. ARN (ácido ribonucleico)Es un ácido nucleico compuesto por una sola cadena de ribonucleótidos, la cual puede adoptar diferentes formas según su función.

— Estructura del ARNLos ribonucleótidos presentan las siguientes características:

— Pentosa: ribosa — Ácido Fosfórico (H3PO4) — Bases Nitrogenadas: adenina, guanina, citosina y uracilo.

TiposSe conocen tres tipos de ARN y los tres trabajan para sintetizar las proteínas; sin embargo cada tipo cumple una función particular.

a. RNAm (mensajero)Se forma a modo de copia de algún segmento del ADN, de forma que transporta en él información genética, desde su núcleo hacia el citoplasma. Representa el 5 a 10% del ARN total. Su estructura es lineal. Presenta los codones, que son tripletes de nucleótidos, que lo constituyen. El proceso de copiado de la información del ADN en el ARNm se llama transcripción.

b. RNAt (transferencia)Es el que transporta los aminoácidos hacia el ribosoma para la síntesis de proteínas. Existe por lo menos un ARNt para cada uno de los aminoácidos de nuestras proteínas. Representa un 10 a 15% del ARN total. Su estructura es en “hoja de trébol” (trifoliado). Presenta los anticodones, que son tripletes de nucleótidos complementarios a los codones.

c. RNAr (ribosómico)Se asocia con proteínas para la constitución de los ribosomas. Su estructura es globular. A estos llega el ARNm para ser “leído” y ejecutado.

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