bioenergetica
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BIOENERGETICA. ATP E ADP I LEGAMI “ALTAMENTE ENERGETICI”. O O O Adenina - Ribosio – O – P – O – P – O – P – O - O - O - O -. ATP Mg 2+. ˜. ˜. Mg 2+. O O Adenina - Ribosio – O – P – O – P – O - O - O -. ADP Mg 2+. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
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pag. 1
BIOENERGETICA
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ATP E ADPI LEGAMI “ALTAMENTE ENERGETICI”
O O O
Adenina - Ribosio – O – P – O – P – O – P – O-
O- O- O-
Mg 2+
ATP Mg 2+
O O
Adenina - Ribosio – O – P – O – P – O-
O- O-
Mg 2+
ADP Mg 2+
Nei composti “altamente energetici” l’idrolisi causa nei prodotti:
• aumento di forme di risonanza• diminuzione di tensione elettrostatica
˜ ˜
˜
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Un composto è definito “altamente energetico” quando contiene legami con
energia libera di idrolisi superiore a 5000 cal /mole (G’° < - 5000 cal/mole)
idrolisi ortofosforica
Mg 2+ ATP 4- Mg 2+ ADP 3- + Pi + H+ G’° = - 7300 cal/mole
idrolisi pirofosforica
Mg 2+ ATP 4- Mg 2+ AMP 2- + PPi G’° = - 7300 cal/mole
PPi 2Pi (enzima pirofosfatasi) G’° = - 8000 cal/mole
ADP AMP + Pi G’° = - 7300 cal/mole
AMP adenosina + Pi G’° = - 3400 cal/mole
Il G’° di idrolisi di ATP pari a –7300 cal/mole è calcolato a pH 7, 25°C, forza ionica 0.2, Mg 2+ 1mM
I COMPOSTI “ALTAMENTE ENERGETICI”
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G , G°
Autore: Professoressa Carla Bovina pag. 4
ΔG = ΔG˚ + RT ln Q
Q: quoziente di reazioneA + B C + D
[C] [D][A] [B]
All’equilibrio: ΔG = 0 Q = Keq
ΔG˚ = - RT ln Keq
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pag. 5
Le reazioni enzimatiche in cui interviene ATP non sono usualmente idrolisi in cui H2O distacca Pi oppure PPi ma sono trasferimenti di gruppi quali
ortofosfato (Pi) e adenilato (AMP)
su di un residuo aminoacidico di un enzima oppure su di un substrato, facendone così aumentare il contenuto in energia libera.
Eccezionalmente alcuni processi utilizzano invece l’idrolisi di ATP.
Esempi:
• rifornimento di energia necessaria per il cambio conformazionale di una proteina
• rifornimento di energia necessaria nel processo di contrazione muscolare
• dispersione di calore per la termoregolazione
IL TRASFERIMENTO DI GRUPPO
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pag. 6
prodotti di idrolisi G’° cal/mole potenziale
PEP piruvato + Pi -14.800 14,8
1,3 BPG 3-P glicerato + Pi -13.000 13,0
Succinil-CoA succinato + CoA -10.400 10,4
Creatina-P creatina + Pi -10.300 10,3
ATP4- AMP 2- + PPi 3- -8.900 8,9
Acetil-CoA acetato + CoA -8.400 8,4
ATP 4- ADP3- + Pi -8.200 8,2
PPi 2 Pi -8.000 8,0
Mg ATP 2- Mg ADP- + Pi -5.700 5,7
Glucoso-1-P glucoso + Pi -5.000 5,0
Glucoso-6-P glucoso + Pi -3.300 3,0
AMP 2- adenosina + Pi -2.300 2,0
ENERGIE LIBERE DI IDROLISIE POTENZIALI
DI TRASFERIMENTO DI GRUPPO
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GLUCOSO + Pi GLUCOSO 6-P + H2O reazione parziale endoergonica
G’° = + 3300 cal/mole
ATP + H2O ADP + Pi reazione parziale esoergonica
G’° = - 7300 cal/mole
GLUCOSO + ATP GLUCOSO 6-P + ADP reazione globale esoergonica
G’° = - 4000 cal/mole
L’intermedio comune è Pi
I G’° sono di segno opposto ma non di valore assoluto identico in modo che la reazione globale accoppiata risulti esoergonica.
LE REAZIONI ACCOPPIATELe reazioni di sintesi di molecole nelle cellule sono endoergoniche e richiedono energia per avvenire. Il G’° di queste reazioni è positivo e tali reazioni, quindi non possono avvenire se non sono “accoppiate” a reazioni esoergoniche che liberano energia.“L’accoppiamento” avviene grazie alla presenza di un composto intermedio comune.
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In un sistema chiuso l’equilibrio è statico
In un sistema aperto l’equilibrio è dinamico = stato stazionario
Per lo “stato di benessere” nella cellula [ATP]/[ADP][Pi] sono in stato stazionario
Esempi:
[ATP] [ADP] [Pi]
Eritrociti 1,35 0,20 0.47
Muscoli 3,00 0,50 1.00
LO STATO STAZIONARIO
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ATP
1. Biosintesi, attivazione2. Contrazione e motilità3. Trasporto attivo: H+, Na+, K+, Ca2+
4. Trasferimento di informazione genetica
ADP + Pi
CATABOLISMO
ENERGIA LIBERA
CO2
NH3
H2O
O2
SOSTANZE COMBUSTIBILI
ATP MEDIATORE ENERGETICO CELLULARE: IMPORTANZA DELLE REAZIONI ACCOPPIATE
La sintesi di ATP da ADP + Pi è una reazione endoergonica: G’° = + 12.000 cal/mole
La concentrazione di ATP nelle cellule viene mantenuta relativamente costante attraverso lo stato stazionario dei sistemi che lo producono e di quelli che lo utilizzano.
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LA PRODUZIONE DELL’ENERGIA CELLULARE
Per attuare la reazione di sintesi di ATP (endoergonica)
ADP + Pi ATP
Si può ottenere energia da:
- la luce solare
- reazioni di ossidazione delle sostanze organiche nutrienti
In ogni processo sono sempre coinvolte reazioni di ossido-riduzione (esoergoniche).
Il meccanismo dell’accoppiamento (intermedi in comune) delle reazioni endo- ed esoergoniche conduce alla sintesi dell’ATP.
I processi biochimici relativi sono:
- la fotosintesi clorofilliana (cloroplasti)
- la catena respiratoria (mitocondri)
- la fosforilazione ossidativa (mitocondri)- la fosforilazione “a livello del substrato” (ad esempio PEP nella glicolisi)
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Reazioni chimiche Termodinamica chimica
Reazioni biochimiche Termodinamica biochimica
CHIMICA E BIOCHIMICA
Perché c’è la necessità di distinguerle?
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Le molecole coinvolte nelle reazioni dei sistemi biologici (reazioni biochimiche) sono poli-anioni
Ciò implica che i reagenti delle reazioni biochimiche consistano di vari addotti in equilibrio con acidi di Lewis quali H+, Mg2+, ecc.
Di conseguenza ogni reazione biochimica definisce un sistema complesso (multi-equilibrio) di reazioni
chimiche
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Leganti
ATP4-
ADP3-
PO43-
Cationi
Na+
K+
H+
Mg2+
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Ad ogni reazione biochimica sono associate una serie di reazioni chimiche
Reazioni chimiche e biochimicheReazioni chimiche e biochimiche
Le specie che prendono parte alle reazioni chimiche associate alla reazione biochimica vengono chiamati:
PSEUDOISOMERI
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PSEUDOISOMERI
ATP
PSEUDOISOMERI Pi
PSEUDOISOMERI
ADP
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REAZIONI CHIMICHE
ATP4− + H2O ADP3− + PO43− + 2H+
MgATP2− + H2O MgADP− + H2PO4−
REAZIONE BIOCHIMICA
ATP + H2O ADP + Pi
Reazioni chimiche e biochimicheReazioni chimiche e biochimiche
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K ATPhyd =
[ATP4-]
[ADP3-] [HPO42-] [H+]
K’ATPhyd =[ATP]
[ADP] [Pi]
ATP = ATP4- + HATP3- + H2ATP2- +…….MgATP2- +… MgHATP- +……NaATP3- + ……..KATP3- + …….
ADP = ADP3- + HADP2- + H2ADP- +…….MgADP- + MgHADP +……NaADP2- + ……..KADP2- + ………
Pi = PO43- + HPO3- + ……….MgPO4
- + ……..MgHPO4 + …….NaPO42- + ……….KPO4
2- + ……………
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VARIAZIONE DELL’ ENERGIA LIBERA IN UNA REAZIONE CHIMICA
ΔG = ΔG 0 + RT ln Q
MgATP2− + H2O MgADP− + H2PO4−
[MgATP2− ]
VARIAZIONE DELL’ ENERGIA LIBERA IN UNA REAZIONE BIOCHIMICA
ATP + H2O ADP + Pi
ΔG′ = ΔG′ 0 + RT ln Q′
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ATP + H2O → ADP + Pi
ΔG’˚ = −30.5 kJ/mol (−7.3 kcal/mol)
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Variazione di energia libera standard G’0
In condizioni considerate standard da un punto di vista biochimico (temperatura di 25°C (298K), pH=7, concentrazione dei reagenti e dei prodotti 1M concentrazione dell’acqua 55.5M) si definisce la variazione di energia libera standard G’0
ΔG’˚ = −30.5 kJ/mol (−7.3 kcal/mol)
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+=ATP
Pi ADP ln RT 'G hyd ATPG'
G°’ = F { pH, pMg }
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REAZIONI CHIMICHE
ATP4− + H2O ADP3− + PO43− + 2H+
MgATP2− + H2O MgADP− + H2PO4−
REAZIONE BIOCHIMICA
ATP + H2O ADP + Pi
Reazioni Reazioni chimiche e chimiche e biochimichebiochimiche
G1
G2
G’
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Nei sistemi biologici per calcolare la variazione di energia libera dei vari processi
cellulari (sintesi, lavoro meccanico e trasporto attivo) si utilizza solitamente il ΔG′
della reazione di idrolisi di ATP secondo la seguente equazione:
' 'ATP-hyd ATP-hyd
ADP Piln
ATPG G RT
solo l’energia libera di idriolisi di questo pseudoisomero è rilevante nel descrivere
lo stato energetico intracellulare secondo la reazione chimica:
Tuttavia, è il complesso MgATP2- la specie enzimaticamente attiva, e quindi,
La cui corrispondente energia libera di idrolisi è data dalla seguente equazione:
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![Page 31: BIOENERGETICA](https://reader036.vdocuments.co/reader036/viewer/2022062518/56814b63550346895db852e0/html5/thumbnails/31.jpg)
'K K
'Q Q
ΔGMgATP2- ΔG’ATP-hydr
![Page 32: BIOENERGETICA](https://reader036.vdocuments.co/reader036/viewer/2022062518/56814b63550346895db852e0/html5/thumbnails/32.jpg)
ΔGMgATP2- ΔG’ATP-hydr
ΔG ΔG’
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Implicazioni Implicazioni applicativeapplicative
Implicazioni Implicazioni concettualiconcettuali
Implicazioni Implicazioni “filosofiche”“filosofiche”
![Page 34: BIOENERGETICA](https://reader036.vdocuments.co/reader036/viewer/2022062518/56814b63550346895db852e0/html5/thumbnails/34.jpg)
Implicazioni applicative
Una conseguenza significativa di tale proprietà è che si può quantificare la variazione di energia libera di ogni reazione enzimatica anche se non si
conosce quale specie chimica è substrato dell’enzima
![Page 35: BIOENERGETICA](https://reader036.vdocuments.co/reader036/viewer/2022062518/56814b63550346895db852e0/html5/thumbnails/35.jpg)
Implicazioni concettuali
Una sostanziale parte della termodinamica chimica e biochimica, prima trattate separatamente, può essere ora unificata in un singolo sistema concettuale
![Page 36: BIOENERGETICA](https://reader036.vdocuments.co/reader036/viewer/2022062518/56814b63550346895db852e0/html5/thumbnails/36.jpg)
Implicazioni “filosofiche”
Alcune delle proprietà termodinamiche locali di un sistema biologico coincidono con quelle globali
Per l’energia libera: locale e globale non sono antonimi
ovvero
la parte è uguale al tutto