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CLUSTERING Eduardo Morales y Jesús González

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CLUSTERING

Eduardo Morales y Jesús González

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Clustering (Agrupamiento)

07/03/2010 08:34:21 p.m.

Proceso de agrupar datos en clases o clusters de tal

forma que los objetos de un cluster:

Tengan alta similaridad entre ellos

Baja similaridad con objetos de otros clusters

Medida de similaridad basada en los atributos que describen

los objetos

Los grupos pueden ser

Exclusivos

Con traslapes

Probabilísticos

Jerárquicos

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Clustering (Agrupamiento)

07/03/2010 08:34:21 p.m.

Puede ser aplicado a:

Caracterizar clientes

Formar taxonomías

Clasificar documentos

Etc.

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Retos

07/03/2010 08:34:47 p.m.

Escalabilidad

Normalmente corren con pocos datos

Capacidad de manejar diferentes tipos de atributos

Numéricos (lo más común)

Binarios

Nominales

Ordinales

Etc.

Clusters de formas arbitrarias

Los basados en distancias numéricas tienden a encontrar clusters

esféricos

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Retos

07/03/2010 08:34:55 p.m.

Requerimientos mínimos para especificar parámetros

Como el número de clusters

Manejo de ruido

Muchos son sensibles a datos erróneos

Independientes del orden de los datos

Poder funcionar eficientemente con alta

dimensionalidad

Capacidad de añadir restricciones

Que los clusters sean interpretables y utilizables

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Medida de Similaridad

07/03/2010 08:35:14 p.m.

Se define usualmente por proximidad en un espacio

multidimensional

Para datos numéricos, usualmente se pasa primero

por un proceso de estandarización

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:37:14 p.m.

La medida z (z-score) elimina las unidades de los

datos

donde, f es la desviación media absoluta de la

variable f, f es su media y xif es el i-ésimo valor

de f.

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:42:26 p.m.

Para variables numéricas (lineales):

Distancia Euclidiana

Distancia Manhattan:

Distancia Minkowski:

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:42:26 p.m.

Para variables numéricas (lineales):

Distancia Pesada (e.g., Euclidiana):

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:42:27 p.m.

Variables Binarias (0,1):

Simétricas (ambos valores tienen el mismo peso):

No-simétricas (el más importante y más raro vale 1),

conocido como el coeficiente Jaccard:

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:45:18 p.m.

Variable nominales (e.g., color):

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:45:19 p.m.

Variables ordinales: nominales con un orden

relevante. El orden es importante, pero no la

magnitud. Pasos:

Cambia el valor de cada variable por un ranqueo rif

{1, …, Mf}, donde Mf es el índice del valor más alto de la

variable

Mapeo el ranqueo entre 0 y 1 para darle igual peso

Usa cualquiera de las medidas numéricas anteriores.

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:53:14 p.m.

Variables escalares no lineales, por ejemplo,

variables que siguen una escala exponencial.

Posibilidades:

Tratarlas como numérica normal

Obtener su logaritmo (o alguna otra transformación)

antes para convertirlas en lineales

Considerarlas como variables ordinales

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Medidas de Similaridad

07/03/2010 08:54:20 p.m.

Variables Mixtas

Una posibilidad es escalar todas las variables a un intervalo común

(entre 0 y 1):

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Métodos de Clustering

07/03/2010 08:57:24 p.m.

Existen muchos métodos de clustering

Solo veremos algunos

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Métodos basados en Particiones

07/03/2010 08:59:34 p.m.

Construyen k particiones de los datos

Cada partición representa un grupo o cluster

Cada grupo tiene al menos un elemento y cada elemento pertenece a un solo grupo

Estos métodos crean una partición inicial e iteran hasta un criterio de paro

Los más populares son k-medias y k-medianas

Otros

CLARA y CLARANS

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Métodos Jerárquicos

07/03/2010 08:59:38 p.m.

Crean descomposiciones jerárquicas

Método aglomerativo o bottom-up

Inicia con un grupo por cada objeto y une los grupos más parecidos hasta llegar a un solo grupo u otro criterio de paro

AGNES, BIRCH, CURE, ROCK

Método divisorio o top-down

Inicia con un solo grupo y lo divide en grupos más pequeños hasta llegar a grupos de un solo elemento u otro criterio de paro

DIANA, MONA

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Métodos basados en Densidades

07/03/2010 09:00:11 p.m.

Se agrupan objetos mientras su densidad (número

de objetos) en la “vecindad” este dentro de un

cierto umbral

DBSCAN, DENCLUE

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Métodos basados en Rejillas

07/03/2010 09:00:46 p.m.

Divide el espacio en rejillas a diferentes

niveles

STING, CLIQUE

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Métodos basados en Modelos

07/03/2010 09:01:04 p.m.

Se encuentra un modelo para cada cluster que

mejor ajuste los datos de ese grupo

COWEB, AutoClass

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Métodos basados en Teoría de

Grafos

07/03/2010 09:01:11 p.m.

Utilizan representaciones basadas en grafos

Chameleon, Delaunay triangulation graph (DTG), highly

connected subgraphs (HCS), clustering identification via

connectivity kernels (CLICK), cluster affinity search

technique (CAST).

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Técnicas basadas en Búsqueda

Combinatoria

07/03/2010 09:01:23 p.m.

Genetically guided algorithm (GGA)

TS clustering

SA clustering

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Técnicas Fuzzy

07/03/2010 09:01:43 p.m.

Fuzzy c-means (FCM)

Mountain method (MM)

Possibilistic c-means clustering algorithm (PCM)

Fuzzy c-shells (FCS)

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Técnicas basadas en Redes

Neuronales

07/03/2010 09:01:51 p.m.

Learning vector quantization (LVQ)

Self-organizing feature map (SOFM)

ART

Simplified ART (SART)

Hyperellipsoidal clustering network (HEC)

Self-splitting competitive learning network (SPLL)

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Técnicas basadas en Kernels

07/03/2010 09:02:05 p.m.

Kernel K-means

Support vector clustering (SVC)

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Técnicas para Datos Secuenciales

07/03/2010 09:02:19 p.m.

Similaidad secuencial

Clustering secuencial indirecto

Clustering secuencial estadístico

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Técnicas para Grandes Conjuntos

de Datos

07/03/2010 09:02:22 p.m.

CLARA

CURE

CLARANS

BIRCH

DBSCAN

DENCLUE

WaveCluster

FC

ART

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k-Means

07/03/2010 09:03:26 p.m.

Toma como parámetro k elementos aleatoriamente

Representan el centro o media de cada cluster

A cada objeto restante se le asigna el cluster con el

cual más se parece

Basándose en una distancia entre el objeto y la media

del cluster

Después se calcula la nueva media del cluster

Itera hasta no cambiar de medias

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k-Means

07/03/2010 09:03:26 p.m.

Normalmente se utiliza una medida de similaridad

basada en el error cuadrático:

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Algoritmo k-Means

07/03/2010 09:03:27 p.m.

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k-Means

07/03/2010 09:03:46 p.m.

k-means es susceptible a valores extremos porque

distorsionan la distribución de los datos

También se pueden utilizar las modas (k-modes)

para agrupar objetos categóricos.

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k-Medoids

07/03/2010 09:03:54 p.m.

Otra posibilidad es usar medianas (k-medoids)

Para agrupar en base al objeto más representativo del

cluster

Idea básica

Encontrar objeto representativo

La estrategia es reemplazar una de las medianas por otro

objeto en forma aleatoria y medir si la calidad de los

clusters resultantes mejoran

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k-Medoids

07/03/2010 09:06:06 p.m.

La calidad se evalúa con base a una función de costo que mide la

disimilaridad promedio entre un objeto y la mediana en su cluster.

Para ver si un objeto aleatorio (Oalea) es un buen reemplazo de la mediana

(Oactu)

Se consideran todos los objetos que no sean medianas

Se analiza la re-distribución de los objetos a partir de la cual se calcula un

costo basado, p.e., en el error cuadrático

Esto se repite hasta que no exista mejora

Como en muchos de los métodos vistos, esto no garantiza encontrar el

mínimo global

Se recomienda correr el alg. varias veces con diferentes valores iniciales

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k-Means Jerárquico

07/03/2010 09:06:07 p.m.

Otra variante es hacer un k-means jerárquico

Se inicia con k = 2

Continúa formando clusters sucesivos en cada rama

Si queremos escalarlo a grandes bases de datos

Podemos tomar sólo muestras de los datos

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COBWEB

07/03/2010 09:06:09 p.m.

Crea un cluster jerárquico con un árbol de

clasificación

En un árbol de clasificación cada nodo es un

concepto

Tiene una descripción probabilística del concepto que

resume los objetos clasificados bajo ese nodo

La descripción probabilística incluye

La probabilidad del concepto (P(Ci))

Las probabilidades condicionales de pares atributos-valor

dado el concepto (P(Ai = Vij | Ck ))

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COBWEB

07/03/2010 09:20:29 p.m.

Utiliza una medida llamada utilidad de la categoría

para construir el árbol:

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COBWEB

07/03/2010 09:20:35 p.m.

Mide el valor esperado de valores de atributos que

pueden ser adivinados a partir de la partición

sobre los valores que se pueden adivinar sin esa

partición

Si la partición no ayuda en esto, entonces no es

buena

Entre más grande es la proporción de elementos de

la clase que tienen ese atributo-valor, ese atributo

valor es más predictivo sobre la clase.

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COBWEB

07/03/2010 09:20:40 p.m.

Desciende el árbol buscando el mejor lugar o nodo

para cada objeto

Se basa en poner el objeto en cada nodo y en un nodo

nuevo y mide en cual se tiene la mayor ganancia de

utilidad de categoría

También considera en cada iteración unir los dos

mejores nodos evaluados y dividir el mejor nodo

evaluado

Es decir, cada vez que se considera un lugar en un nivel

para un nuevo objeto, se consideran los dos mejores objetos

(de mayor utilidad) y se considera juntarlos

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COBWEB

07/03/2010 09:20:51 p.m.

El caso contrario, sucede una vez que se encuentra el mejor

lugar para un nuevo objeto

Pero el unir nodos no resulta en beneficio

Entonces se considera dividir ese nodo

COBWEB depende del orden de los objetos

Es conveniente probarlo con objetos en diferente orden

La división entre el número de cluster sirve para incentivar

tener clusters con más de un elemento

COBWEB asume que la distribución de probabilidad de los

atributos es independiente de las demás

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COBWEB

07/03/2010 09:17:28 p.m.

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COWEB

07/03/2010 09:11:37 p.m.

El alg. se puede extender a valores numéricos

usando distribuciones gaussianas (CLASSIT)

41

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COWEB

07/03/2010 09:12:43 p.m.

Ahora se estima la desviación estandar del atributo

numérico con los datos en el cluster y en los datos

para todos los clusters:

Si la desviación estándar es cero el valor de utilidad se

vuelve infinito, por lo que se impone un valor de varianza

mínimo en cada atributo (acuity)

Otro parámetro es el de corte (cutoff), que básicamente se

usa para parar la generación de nuevos nodos

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Clustering basado en Probabilidades

07/03/2010 09:12:43 p.m.

Desde el punto de vista bayesiano

Buscamos el grupo de grupos más probable dados los

datos

Ahora los objetos tienen cierta probabilidad de

pertenecer a un grupo o cluster

La base de un clustering probabilístico es un modelo

estadístico llamado finite mixtures (mezcla de

distribuciones).

Una mezcla es un conjunto de k distribuciones,

representando k clusters

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Clustering basado en

Probabilidades

Cada distribución da la probabilidad de que un

objeto tenga un conjunto particular de pares

atributo-valor

Si se supiera que fuera miembro de ese cluster

La mezcla más sencilla es cuando tenemos puros

atributos numéricos con distribuciones gaussianas

con diferentes medias y varianzas

07/03/2010 09:12:57 p.m.

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Clustering basado en

Probabilidades

La idea es, dado un conjunto de datos

Determinar las k distribuciones normales (medias y

varianzas) y las probabilidades particulares de cada

distribución (pueden ser diferentes)

Si tuviéramos dos distribuciones A y B con A, A, B,

B, y PA (PA + PB = 1) , podemos generar un conjunto

de datos.

Si supiéramos de qué distribución salió cada dato, es

fácil calcular su media y varianza, y la PA y PB.

07/03/2010 08:34:00 p.m.

45

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Clustering basado en

Probabilidades

07/03/2010 08:34:00 p.m.

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Clustering basado en

Probabilidades

Calcular la probabilidad de que un objeto (x)

pertenezca a un cluster (e.g., A), es:

07/03/2010 08:34:00 p.m.

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Algoritmo Expectation

Maximization

El problema es que no sabemos de qué distribución viene

cada dato y no conocemos los parámetros de las

distribuciones

EM (Expectation Maximization) empieza adivinando los

parámetros de las distribuciones

Los usa para calcular las probabilidades de que cada objeto

pertenezca a un cluster

Usa esas probabilidades para re-estimar los parámetros de las

probabilidades

Hasta converger (se puede empezar adivinando las probabilidades de

que un objeto pertenezca a una clase).

07/03/2010 08:34:00 p.m.

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Algoritmo Expectation

Maximization

El cálculo de las probabilidades de las clases o los

valores esperados de las clases es la parte de

expectation.

El paso de calcular los valores de los parámetros

de las distribuciones, es maximization, maximizar la

verosimilitud de las distribuciones dados los datos.

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Algoritmo Expectation

Maximization

Para estimar los parámetros

Consideramos que tenemos únicamente las probabilidades

de pertenecer a cada cluster y no los clusters en sí

Estas probabilidades actúan como pesos:

wi es la probabilidad de que el objeto i pertenezca al

cluster A y se suma sobre todos los objetos (no solo los de A)

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Algoritmo Expectation

Maximization

El algoritmo tiende a converger pero nunca llega a

un punto fijo

Podemos ver qué tanto se acerca calculando la

verosimilitud general de los datos con esos

parámetros, multiplicando las probabilidades de

los objetos individuales (i):

Esta medida crece en cada iteración, se itera hasta

que el crecimiento es despreciable

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Algoritmo Expectation

Maximization

Aunque EM garantiza convergencia, esta puede ser

un máximo local, por lo que se recomienda repetir

el proceso varias veces.

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Extensiones

Extender a más de dos distribuciones es prácticamente directo

Extenderlo a instancia con atributos múltiples, si se asume

independencia de los atributos, se puede hacer multiplicando

las probabilidades para obtener una distribución de

probabilidad conjunta

Si existen dos atributos correlacionados, se pueden analizar

con una distribución normal bi-variable en donde se utiliza una

matriz de covarianza

El número de parámetros crece al cuadrado del número de

atributos que se consideren correlacionados entre sí

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Extensiones

Se pueden especificar diferentes distribuciones

Cada una con sus propios parámetros

Para diferentes tipos de datos

Se puede penalizar el modelo que introduzca

parámetros y el que defina un número mayor de

clusters.

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AutoClass

Realiza un descubrimiento automático de clases en

datos (P. Cheeseman, J. Stutz)

Una vez que identificadas las clases, éstas pueden

servir para clasificar nuevos datos

Encuentra la hipótesis más probable dados los datos

e información a priori

Se busca un balance entre qué tan bien se ajustan los

datos a las clases y la complejidad de las clases

Casos extremos, una clase por dato o una sola clase para

todos los datos.

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AutoClass

En AutoClass los datos se pueden representar por

valores discretos, enteros y reales

El modelo es una mezcla finita de distribuciones de

probabilidad, cada una con su conjunto de

parámetros

Para cada dato se asigna una probabilidad de

pertenencia a una clase (o un peso)

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AutoClass

Dado un conjunto de datos se busca:

Los valores más probables (MAP) de los parámetros (para

las distribuciones y clases dadas), dada una distribución de

probabilidad

La distribución de probabilidad más probable (número de

clases y modelos alternativos), independientemente de los

parámetros

Asume datos condicionalmente independientes dada

la clase

La distribución conjunta de los datos es el producto de las

probabilidades individuales

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AutoClass

Cada dato pertenece a una y solo una clase (de un conjunto

disjunto de clases)

Con probabilidad donde es el vector de

parámetros de la distribución y Tc es la distribución particular

Las clases representan una partición discreta de los datos y

por lo tanto la distribución más apropiada es una distribución

Bernoulli o binomial

Asume que los atributos son independientes dada la clase

Los modelos individuales de los atributos tienen sus propios

parámetros de distribución

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AutoClass

Trata de encontrar los parámetros de las distribuciones de

probabilidad dependiendo del tipo de valores de las

variables

Discretos: Bernoulli

Reales: Gaussianas

Reales – Escalares (e.g., edad, peso): log-Gaussianas

Enteros: Poisson

En general se establecen cuántas clases y se corre el proceso

Existen muchos máximos locales

Correr el proceso con diferentes valores iniciales para los parámetros

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¿Cuántos Clusters?

En algunas aplicaciones es fácil determinar el

número de clusters “K”

De acuerdo al conocimiento del dominio

Para la mayoría de los casos “K” se desconoce

Se estima a partir de los datos

Muchos algoritmos de clustering preguntan “K”

como parámetro de entrada

La calidad de resultados está fuertemente ligada a

este valor

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¿Cuántos Clusters?

Una división con muchos clusters complica los

resultados porque los hace difíciles de interpretar y

analizar

Una división con muy pocos clusters lleva a una

pérdida de información y puede llevar a tomar

malas decisiones

Al problema de determinar el número de clusters se

le conoce como:

El problema fundamental de la validez del cluster

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¿Cuántos Clusters?

Algunos métodos para encontrar “K”

Visualización del conjunto de datos

Funciona bien para 2 dimensiones

Generalmente nuestros conjuntos de datos son más complicados

Construcción de índices ( o reglas de paro)

Utiliza índices para enfatizar

Compactes intra-cluster

Isolación inter-cluster

Considera efectos tales como:

Error cuadrático

Propiedades geométricas o estadísticas de los datos

Número de patrones

Disimilaridad o similaridad

Número de clusters

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¿Cuántos Clusters?

Algunos métodos para encontrar “K”

Optimización de alguna función de criterio bajo el

marco del modelo de mezcla de probabilidades

Como el algoritmo EM, para encontrar valor de “K” que

maximice ó minimice el criterio definido como óptimo

Criterio de Información de Akaike (AIC)

Criterio de Inferencia Bayesiana

Otros métodos heurísticos basados en una variedad de

técnicas y teorías.

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