aplicación de lims en biobancos

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DANIEL MURILLO CASTILLO CONTROL DE PROCESOS MÁSTER DE QUÍMICA SOSTENIBLE UNIVERSIDAD DE ZARAGOZA APLICACIÓN DE LIMS A BIOBANCOS DE SANGRE

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D A N I E L M U R I L L O C A S T I L L O

C O N T R O L D E P R O C E S O S

M Á S T E R D E Q U Í M I C A S O S T E N I B L E

U N I V E R S I D A D D E Z A R A G O Z A

APLICACIÓN DE LIMS A BIOBANCOS DE SANGRE

INTRODUCCIÓN

Las ciencias relacionadas de alguna forma con la vida estan teniendo cada vez más protagonismo, e incluyen aplicaciones biotecnológicas, diagnóstico, análisis y optimizaciones químicas, etc…

La investigación en este campo necesita de un apoyo en sistemas automáticos que realicen una gran cantidad de experimentos y sistemas que gestionen las enormes matrices de datos

INTRODUCCIÓN

El mercado de LIMS generó 216,2 M€ en Europa en 2006, y creció desde 125 M$ en 2001 hasta 305 M$ en 2007 en USA. Se prevé que para 2017 se alcancen globalmente 12,8 billones de $

Los mayores crecimientos vienen del área de la farmacéutica, proteómica y genómica.

BIOBANCOS

Las colecciones de muestras de ensayos clínicos se almacenan a -80ºC en biobancos para ser usados en proyectos de investigación

BIOBANCOS

Para obtener avances en ciencias de la vida, a menudo son necesarios largos estudios con multitud de muestras distintas

Se prevé que los biobancos ayuden en esta tarea. Para ello sería necesario una estandarización, control robotizado, sistemas automáticos, garantizar la trazabilidad, miniaturización y procesamiento de muestras individuales para evitar ciclos innecesarios de congelación/descongelación

PROYECTO PARA UN GRAN BIOBANCO DE SANGRE

384 tubos por bandeja con 100 μl de sangre

5.000.000 de muestras almacenadas a -80ºC

Sistema automático capaz de gestionar y procesar muestras líquidas

ESQUEMA GENERAL

MUESTREO

Las muestras son recogidas en el hospital en un tubo de 6 ml con un código de barras

La muestras son sometidas a un tratamiento en el que se le añade heparina, citrato y EDTA. Posteriormente se centrifugan 10 minutos a 10.000 rpm

MUESTREO

De cada tubo un sistema automático toma alícuotas de cada una de las fracciones, que se sellan herméticamente con un film de PP. El sistema de LIMS se asegura de la trazabilidad y del almacenamiento.

PRUEBA

Para probar la viabilidad de un almacén a gran escala se obtuvieron 48 muestras, que se analizaron durante 2 meses

Se analizaron un grupo de biomarcadoresHomocisteina, hierro, potasio, glucosa, IgG, IgA, IgM, colesterol, magnesio, ASAT, ApoA1, TSH, haptoglobina, trigliceridos, CRP, cortisol, albumina, TIBC, leucocitos, eritrocitos, plaquetas, WBC TEC y PLC.

INSTRUMENTACIÓN

CONCLUSIONES

Pudo crearse un sistema que gestione una gran multitud de muestras de una forma automática y con trazabilidad asegurada

Se pudieron manejar las muestras para tomar alícuotas y almacenarlas durante 2 meses de una forma automática

Se pudieron hacer análisis con la suficiente precisión

Sin el sistema de LIMS no podría ser posible la gestión de todos los datos

ESQUEMA GENERAL

SEGURIDAD

Vacunación de la hepatitis B Cubrir cortes y heridas con apósitos impermeables Lavar las manos antes y después de trabajar con la muestra La manipulación de cualquier muestra se realizará siempre

con guantes de nitrilo, bata y pantalla facial Todas las muestras deben ser transportadas en recipientes

con tapa segura que impida la salida de líquidos Manejo de objetos cortantes o punzantes con extremo cuidado Eliminar los residuos en contenedores rígidos Señalizar correctamente todas las muestras Eliminación adecuada de residuos Uso de material de un solo uso. Si no es posible deberá

esterilizarse Evitar la formación de gotas y aerosoles

REFERENCIASS

http://www.bbc.co.uk/blogs/thereporters/ferguswalsh/2010/07/biobank_tracking_the_health_of_a_generation.html

Large scale biobanking of blood — The importance of high density sample processing procedures. Johan Malma, ÁkosVégvárib, Melinda Rezelib, Paul Uptonc, Pia Danmyrd, RolfNilssona, Erik Steinfeldere, György Marko-Varga. Journal ofproteomics 76 (2012) 116 – 124

Laboratory Information Management Systems for Life Science Applications. Kerstin Thurow, Bernd Göde, UweDingerdissen, and Norbert Stoll. Organic Process Research & Development 2004, 8, 970-982

http://www.pcb.ub.edu/homePCB/docs/qsma/SEG-IMP-012_Trabajoconsangreymuestrasdeprocedenciahumana.pdf