seminario 3 infraestructura technologies
Post on 22-Jan-2018
154 Views
Preview:
TRANSCRIPT
Introducción
Medicina traslacional
Descubrimientos biológicos integrativos
Información genómica Nuevas tecnologías moleculares Información fenotípica de
pacientes
Aportar al entendimiento de las enfermedades humanas
Desarrollo de nuevas técnicas diagnósticas y
tratamientos
Biobancos
Introducción
Biobancos en la investigación
Colecciones de tejido en centros del cáncer en hospitales
Grandes biobancos en redes de investigación multicéntricos
Pequeños biobancos basados en ensayos clínicos
Gran cantidad de información
Introducción
Biobanco 1996: colección de varios tipos de
muestras biológicas
Biobanco en 2006: colección de material biológico e información
asociada, con información de almacenamiento organizada y
sistematizada de una población o un gran subconjunto de la
población
Varios artículos han sido publicados en los últimos 5 años sobre tecnologías de información, ninguno provee un catálogo de requerimientos que debe tener una IT para satisfacer todos los escenarios a los que se puede enfrentar un Biobanco
Métodos
Revisión bibliográfica
NumerosasLos aspectos relevantes sobre IT han sido combinados con aspectos de organizacionales, éticos y seguridad
Enfoque en los requerimientos básicos para manejo de muestras, localizaciones de almacenaje e información clínica como también procesos relacionados con la adquisición de la muestra, transporte, almacenaje, aseguramiento de la calidad y documentación fenotípica.
Las IT varían de acuerdo a tipo de Biobanco
Métodos
Seguridad en la IT
Separación de los poderes de información
Seudonimización
Manejo de identidad basada en los servicios de terceros de confianza, que mantienen los datos de identidad y seudónimos separados de la base de datos médicos y genéticos
Separación física de la información de identidad de la información médica
Separación física de la información de la muestra almacenada, los análisis genéticos y la información médica
MétodosCon el fin de generar un catálogo de requerimientos, se formó un panel de especialistas:
Dos especialistas clínicos con gran experiencia en Biobancos, patología y laboratorios
Dos especialistas informáticos con gran experiencia en infraestructuras IT para redes de investigación médica
Moderador: autor principal de este artículo, especialista en informática médica
TAREAS
Recoger un gran número de requerimientos en la primera ronda de muestreo
Crear un conjunto de categorías para tales requerimientos
Categorizar y estructurar la lista de requerimientos dentro de la segunda ronda de muestreo
Resultados
150 funcionalidades
3 categorías principales y 20 subcategorías
Asignación de cada requisito a una de
las 20 subcategorías
Revisión de catálogo: eliminación de redundacias e inconsistencias
Los biobancos establecidos se encuentran insertos en hospitales
universitarios y en grandes instituciones de investigación no
universitarias Biobancos de hospitales universitarios están insertos en un entornos de TI
muy heterogéneo
Catálogo es aplicable para guiar los procesos logísticos y
médicos de los biobancos
Para la gran heterogeneidad de proyectos de investigación de hospitales
universitarios se debe crear una estructura genérica
Un biobanco se puede enfrentar a diversos escenarios
Almacén de datos
clínicosEncriptación
Módulo de gestión (LIMS)
Definición específica por proyecto de investigación y contexto de almacenamiento
Antes de la incorporación de un nuevo proyecto, el administrador de la IT debe configurarlo de acuerdo a las necesidades de éste.
Creación de roles y funcionalidades
Definir los tipos de datos que serán ingresados
Definición los flujos de trabajo para seguir el procesamiento, transporte y
almacenaje de muestras
Dentro de un hospital, la adquisición de la muestra puede realizarse a través de: consultas médicas, salas de hospitalización, dentro de departamentos de diagnósticos (ejemplo: endoscopías) y pabellones.
Almacenamiento en tiempo corto
Adquisiciones de muestras por estudios multicéntricos, ambientes más complejos y menos estandarizados
Muchas variables a considerar: contenedores, tiempos en diferentes espacios físicos, mantención de temperatura, mucho mayor flujo de datos hasta el almacenamiento final
Cuanto más preciso el registro de las variables del proceso a los largo de la vida útil de la muestra, más precisa será la extracción de información,
la que es necesaria para fines clínicos y de investigación
Abrir interfaces para enlazar con la manipulación pre analítica de muestras de alto estándar y robots de
almacenamiento
Biobancos pequeños
Biobancos grandes
Manejo manual del almacenamiento de muestras
Incorporación de robots
Seminario 3
Progresos importantes en el campo de la investigación en salud
Realizar medicina personalizada guiada por biomarcadoresy la habilidad para establecer nuevas medidas preventivas o
tratamientos para aplicarlas al paciente correcto en el momento correcto
Metodologías bioinformáticas avanzadas
Desarrollo de modelos animales para estudiar enfermedades humanas
Establecimiento de plataformas “ómicas”
Biobancos
Progreso de la biomedicina
Clasificación de Biobancos:
Colecciones de biomaterial dentro de la atención clínica directa
Creados por proyectos de investigación dedicados a una enfermedad particular
Meta-biobancos
• En años anteriores, muchas investigaciones se han enfocado en establecer IT para biobancos dedicados a proyectos o redes
• Ninguna de ellas se ha enfocado en describir una arquitectura IT aplicable a los distintos escenarios a los que se enfrenta un biobancoestablecido en un hospital universitario
Objetivo
Ilustrar los requerimientos basándose en las soluciones IT de biobancosde múltiples proyectos del Hospital Universitario de Erlangen y proponer una red IT genérica de biobanco, que puede ser adaptada por otras instituciones de investigación de acuerdo a sus necesidades con el fin de realizar un uso más eficiente de fuentes de tecnología de información
En el Hospital de Erlangen se estableció durante la última década un sistema de registro médico
electrónico (EMR)
DEPARTAMENTOS
NecesidadesPlataforma estratégica para
todo el Hospital Universitario y la Facultad de Medicina
Creación del software
CCC GCKD
DPKKColoNet
Consortium
Plataforma
Resultado
Sistema de gestión de Biobanco (BMS)
Sistema de gestión de ensayos clínicos certificado por GCP
EMR del Hospital Universitario
i2b2
PID generator
CCC
GCKD
DPKK
ColoNet
top related