o la distancia evolutiva entre dos organismos se puede medir por las diferencias en la secuencia de...
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o La distancia evolutiva entre dos organismos se puede medir por las diferencias en la secuencia de aminoácidos o nucleótidos de macromoléculas homólogas aisladas de cada uno de ellos.
o El número de diferencias en la secuencia de una macromolécula es proporcional al número de cambios mutacionales estables fijados en el DNA que codifica esa molécula en ambos organismos.
o La evolución se produce cuando las mutaciones quedan fijadas en las diferentes poblaciones, el resultado es la biodiversidad.
o Estar distribuida universalmente en el grupo elegido para ser estudiado
o Deben ser funcionalmente homólogos en cada organismo (función idéntica)
o Poderse alinear apropiadamente las dos moléculas para identificar regiones homologas y variaciones en la secuencia
o Cambiar a una velocidad proporcional a la distancia filogenética. (cuanto mayor sea ésta menor será la velocidad de cambio).
o Varios citocromos, o Proteínas de hierro y azufre como las
ferredoxinaso Otras proteínaso RNAs ribosómicos*o ATPasa*o Rec A*
o *Los mejores
o Por la antigüedad de la maquinaria ribosomal
o Funcionalmente constanteso Universalmente distribuidoso Secuencia moderadamente conservada
o 3 moléculas de RNA ribosómicoo Procariontes 5S, 16S, 23S
o Tanto el 16S como el 23S tienes secuencias que pueden ser utilizadas como cronómetros moleculares.
o El 16S es más manejable experimentalmente, se ha usado máso (16S procariontes, 18S eucariontes; provienen de la subunidad
pequeña ribosomal).
o Tiene 24000 secuencias alineadas o 16000 16So 8000 18S
o http://rdp.cme.msu.edu/
o Las comparaciones de secuencias de RNA ribosómico son útiles para determinar las relaciones evolutivas entre organismos.
o Los árboles filogenéticos basados en el RNA ribosómico incluyen actualmente los principales grupos procarióticos y eucarióticos.
o Alinear la secuencia recién secuenciada con secuencias alineadas previamente. (alineamiento pareado vs múltiple)
o Análisis mediante algoritmos matemáticos: Parcimonia y distancia
o La distancia evolutiva (ED) se calcula mediante el recuento de todas las posiciones en las que exista una diferencia.
o Se hace una corrección de la ED que calcula la posibilidad de que en un sitio se hayan producido varios cambios.
0.29
0.15
0.080.08
0.23
0.31
Frecuencia en:
Secuencia
rúbrica
posición
aproxArchaea Bacteria Eukaria
CACYYG 315 0 >95 0
AAACUCAAA 910 3 100 0
AAACUUAAAG 910 100 0 100
YUYAAUUG 960 100 <1 100
CAACCYYCR 1110 0 >95 0
UCCCUG 1380 >95 0 100
UACACACCG 1400 0 >99 100
CACACACCG 1400 100 0 0
o Ninguno de los organismos vivos actualmente es primitivo (no evolucionado).
o Toda forma de vida existente corresponde a organismos modernos, bien adaptados a –y con éxito en— sus nichos ecológicos.
o Algunos pueden ser fenotípicamente parecidos o similares a organismos primitivos hipotéticos.
o Ej. hipertermófilos procarióticos Aquifex y Methanopyrus
Monday, October 13, 2003Diversity and Ecology MW Lecture 12
Bacteria Eukarya Archaea
Anim
alia
Fungi
Pla
nta
e
Figure 25.4
o La presión dentro de una célula bacteriana es de 2 atmósferas.
o Presión similar a la de una llanta de coche
o Las bacteria se dividen en dos gruposo Gram positivaso Gram negativas
o La tinción las distingue pero se basa en diferencias en la pared celular.
o Polímero base de las paredes celulares del Género Bacteria
o Formada por láminas finas compuesta por residuos de dos azúcares:o N-acetilglucosamida y ácido N-
acetilmurámico.o Un grupo pequeño de aminoácidos:
o L-alanina, D-alanina, D-glutámico, lisisna o diaminipomélico
GG M
GG M
GG M
GG M
L-Ala
D-Glu
DAP
D-Ala
L-Ala
D-Glu
DAP
D-Ala
L-Ala
D-Glu-NH2
L-Lis
D-Ala
L-Ala
D-Glu-NH2
L-Lis
D-Ala
Gli
Gli
Gli
Gli
Gli
Gram negativa
Gram positiva
o Unidades de glicerolfosfato o ribitolfosfato
o Polialcoles unidos por esteres fosfato
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