modelo de watson y crick - ugr...modelo de watson y crick (semiconservativo) 2 replicación del...
Post on 08-Jul-2020
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4
La polimerización ocurre en sentido 5’3’
La ADN polimerasa sólo puede añadir nucleótidos al extremo 3’ de la cadena en crecimiento
8
>gi|16127994|ref|NC_000913.1| Escherichia coli K12, complete genome
AGCTTTTCATTCTGACTGCAACGGGCAATATGTCTCTGTGTGGATTAAAAAAAGAGTGTCTGATAGCAGC
TTCTGAACTGGTTACCTGCCGTGAGTAAATTAAAATTTTATTGACTTAGGTCACTAAATACTTTAACCAA
TATAGGCATAGCGCACAGACAGATAAAAATTACAGAGTACACAACATCCATGAAACGCATTAGCACCACC
ATTACCACCACCATCACCATTACCACAGGTAACGGTGCGGGCTGACGCGTACAGGAAACACAGAAAAAAG
CCCGCACCTGACAGTGCGGGCTTTTTTTTTCGACCAAAGGTAACGAGGTAACAACCATGCGAGTGTTGAA
GTTCGGCGGTACATCAGTGGCAAATGCAGAACGTTTTCTGCGTGTTGCCGATATTCTGGAAAGCAATGCC
AGGCAGGGGCAGGTGGCCACCGTCCTCTCTGCCCCCGCCAAAATCACCAACCACCTGGTGGCGATGATTG
AAAAAACCATTAGCGGCCAGGATGCTTTACCCAATATCAGCGATGCCGAACGTATTTTTGCCGAACTTTT
C
A
G
T
foreach $base (@bases) { if ( $base eq 'A' ) { $x = $x - 1 } ; if ( $base eq 'C' ) { $y = $y + 1 } ; if ( $base eq 'G' ) { $y = $y - 1 } ; if ( $base eq 'T' ) { $x = $x + 1 } ; print “$x $y” }
11
open IN, "Ecoli.fasta" or die "No hay genoma\n";
open OUT, ">coordenadas.txt";
while (<IN>) {
@linea = split //;
foreach (@linea) {
$x ++;
$y ++ if /G/;
$y -- if /C/;
print OUT "$x $y\n" if $x % 1000 == 0;
}
}
12
-20000
-15000
-10000
-5000
0
5000
10000
15000
20000
25000
30000
0 1000000 2000000 3000000 4000000 5000000
G (+1), C (-1)
G > C C > G G > C
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