localización de información científica en internet xi simposio internacional de la asociación de...

Localización de informacióncientífica en Internet

XI Simposio Internacional de laAsociación de Cardiología de Rosario

Rosario, 8 y 9 de noviembre de 2002

Prof. Dr. Armando PacherBioingeniería - Universidad Nacional de Entre Ríos

CETIFAC – Centro de Teleinformática de FACFECC - Foro de Educación Continua en Cardiología

•Localización de la información científica

•Estrategias y tácticas de búsqueda: (AND OR NOT, etc.)

•Búsqueda de imágenes en la Web

•Utilización de PubMed – Medline y sus herramientas

Se asume que los asistentes saben cómo conectarse a Internet y utilizar un Browser o Navegador

Consultas: cursofac@fac.org.arObtención de este material: www.fac.org.ar/fec/cursofac/ros02

Localización de la información

Tipos de información

Documentos, imágenes, trabajos científicos indexados o no en Medline

¿Dónde se encuentra la información?

En sitios de instituciones académicas y científicas y bibliotecas

Se localiza información: accediendo a sitios institucionales y biliotecas con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline *

A una “distancia de tres clicks”

Organizaciones internacionales “a tres clicks”

Etica y calidad en la información científica

Universidades

Sitios institucionales

Sitios institucionales

Sitios institucionales

Acceso y búsqueda de información en la Web

Se localiza información: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline participando en mailing lists *

Buscadores o Searchers

Google Copernic Yahoo! Webcrawler Metacrawler Lycos Excite Infoseek HotBot otros (Magellan, EuroSeek, Altavista, Fast Search, Direct

Hit, YellowPages, Albert, etc., etc. etc.) Información no “filtrada” salvo la de instituciones

científicas y académicas.

Utilizar uno o a lo sumo dos y aprender a fondo sus funcionamientos

(cada uno tiene sus propias reglas)

?210.000 citas

Limitar las búsquedas en la Web

Utilización de operadores lógicos

AND

OR

NOT

Recordar la Teoría de ConjuntosConjunto A y Conjunto B

Intersección - Unión - Diferencia

Operador AND (= Y)

A Y Barrhythmia AND ventricular

trabajos que incluyan arritmia y ventricular

Limitar las búsquedas en la Web

Intersección

Operador OR (= O)

A OR Barrhythmia OR ventricular

trabajos que incluyan o arritmia o ventricular

Limitar las búsquedas en la Web

Unión

Operador NOT ( = NO)

A NOT Barrhythmia NOT ventricular

trabajos que incluyan arritmia pero no ventricular

Limitar las búsquedas en la Web

Diferencia

Operadores AND OR NOT

arrhythmia AND ventricular:

encuentra trabajos de arritmia ventricular

arrhythmia OR ventricular:

encuentra tanto trabajos de arritmia como trabajos que tengan la palabra ventricular

arrhythmia NOT ventricular:

encuentra trabajos de arritmia no ventricular *

Operadores AND OR NOT

arrhythmia AND ventricular NOT ischemia:

encuentra trabajos de arritmia ventricular sin isquemia

arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT ischemia:

encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular sin isquemia

arrhythmia AND ventricular NOT sustained AND treatment NOT ischemia :

encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular no sostenida sin isquemia *

167 citas

Limitar las búsquedas en la Web

Equivalencias:

AND = +

OR = ^

NOT = -

Inclusión de frases:

"radiation induced apoptosis”

"human lymphocytes”

Estudiar los comandos de cada Searcher:

? * “” , <frase> () <NEAR> <NEAR/N> etc., etc.

64 citas

Acceso a traducción on line (limitada en su calidad)

Copiado (download) de la información

Mediante el browser, desde el sitio donde se localizó el o los archivos: definir bien la ubicación, para su localizacion posterior

Disminución del tiempo de copiado mediante programas específicos:

www.gozilla.com - www.getright.com - www.speedbit.com

Acceso y búsqueda de información en la Web

Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers

Se localiza información: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline participando en mailing lists *

Medline

Base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine - NLM

abarca los campos de medicina, enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas o básicas.

contiene citas bibliográficas y resúmenes de aproximadamente 4300 publicaciones biomédicas sumando más de 10 millones de citas desde 1966.

se actualiza mensualmente

es gratuita

PubMed ofrece acceso a dos bases de datos: MEDLINE y PREMEDLINE (datos aún no indexados en MEDLINE)

PubMed se actualiza semanalmente. *

PubMed (Medline)

Búsquedas simples con o sin operadores AND OR NOT

Utilización de “Limits” acotación de los resultados

Journal Browser para hojear revistas

Citation Matcher ubica trabajos conocidos

MeSH Browser búsquedas avanzadas

Clinical Queries mediante categorías (therapy, diagnosis, etiology,

prognosis) y elección de sensibilidad y especificidad.

Cubby almacenamiento y actualización de búsquedas *

arrhythmia

Búsqueda simple: arrhythmia

Arrhythmia: 101.249 citas

Utilización de operadores

AND OR NOT

Arrhythmia AND ventricular: 36.674 citas

Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained: 15.608

Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained AND 2001: 1074

Utilización de “Limits”

campo de búsqueda (título, autor, etc.) grupo etario sexo humano o animal idioma disponibilidad de abstracts fechas de publicación o de indexación tipo de publicación (ensayo clínico [clinical trial],

editorial, etc.) Nota: la mayoría descartan PREMEDLINE

Agregando “Limits”

Resultado con “Limits”: 31 citas

Id. anterior, trabajos sólo de 2001: 7 citas

Journal Browser

Herramienta para hojear publicaciones

Se ingresa el nombre de la publicación, o la abreviatura correspondiente de MEDLINE o el identificador ISSN.

Mediante “Limits” se elige el ejemplar buscado

Ingreso del nombre de la publicación

Codificación de la publicación

Acceso a la totalidad de lo publicado: 17.965 citas

Utilización de Limits: fecha de publicación

Utilización de Limits: fecha de publicación: 55 citas

Citation Matcher

Herramienta para buscar artículos cuando se dispone la cita

Se ingresan los datos conocidos en los diferentes campos

Cuando se conoce la cita bibliográfica

Cuando se conoce la cita bibliográfica

Obtención directa cuando se conoce la cita bibliográfica

Abstract del artículo

MeSH Browser - Encabezados de Temas Médicos

Herramienta de mayor complejidad pero sensible y específica

Cada cita en la sección de MEDLINE en la base de datos de PubMed es indexada con los Medical Subject Headings (o MeSH) que describen el tema contenido en el artículo.

El MeSH Browser permite la búsqueda de citas por términos MeSH.

Los términos MeSH se dividen en encabezados y subencabezados *

MeSH Browser

Buscar el término MeSH

Elegir el encabezado o término MeSH adecuado

Verificar el árbol y agregarlo (“Add”) a la búsqueda

Buscar subencabezados o subtérminos MeSH

Incluir subtérminos MeSH, de a uno por vez

Realizar la búsqueda en PubMed

Incluir límites si son necesarios

Verificar el esquema MeSH utilizado (Details)

Opción de guardar la búsqueda MeSH

Guardado de la búsqueda como “Favoritos” o “Bookmarks”

Ej.: Inmunología en la Enfermedad de Chagas congénita

Optar por "MeSH Browser"

Escribir en "Search for:" el término a buscar (Chagas) y hacer clic en "Go"

Elegir en el listado el término MeSH más adecuado (Chagas Disease) y hacer clic en "Browse this term"

Aparece un árbol de categorías MeSH relacionadas con el término a buscar.

Hacer clic en "Add this term to the Search using operator: AND"

Aparece en la nueva ventana "Chagas Disease"[MESH]

Hacer clic en "Detailed display" y agregar, de a uno por vez, los términos/subtítulos MeSH necesarios para acotar la búsqueda

Hacer clic en "PubMed Search"

Si es necesario, incluir "Limits”y/o “Add Terms”

Búsqueda compleja

Búsqueda compleja

Traducción de una búsqueda compleja

((((((Hypertension/drug therapy[MESH] AND Clinical Trial[ptyp]) AND English[Lang]) AND "adult"[MeSH Terms]) AND "human"[MeSH Terms]) AND ("2001/02/16 01.46"[EDat] : "2001/03/18 01.46"[EDat])) AND ("2001/02/16"[EDat] : "2001/03/17"[EDat]))

Esta sería la traducción aproximada:

"Buscar trabajos de marzo de 2001, sólo escritos en idioma inglés, que sean ensayos clínicos en humanos, mayores de 19 años, sobre el tema Terapia con drogas de la hipertensión arterial” *

Clinical Queries Filtros de categorías, sensibilidad y especificidad

Cubby Almacenamiento y actualización de búsquedas

Filtros de categorías, de sensibilidad y de especificidad

Almacenamiento y actualización de búsquedas

PubMed (Medline)

Técnicas: Búsquedas simples Utilización de “Limits” Journal Browser Citation Matcher MeSH Browser Clinical Queries Cubby

El material de texto completo (full text) puede ser obtenido en forma gratuita o bajo un arancel.

Esto es sólo la técnica para la búsqueda de información en Pubmed: hay que profundizar en la estrategia.

Guardar direcciones Web

Favoritos - Bookmarks

Se pueden copiar en diskettes,

enviar por email, etc.

Acceso y búsqueda de información en la Web

Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers

Se localiza información: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline participando en mailing lists *

Listas de Correo o Mailing lists

Grupos de interés común, cuyos integrantes intercambian información mediante E-mail

La correspondencia es recibida por todos los integrantes

Moderadas: un coordinador filtra los mensajes

• Temas de Informática Médica: cursofac@fac.org.ar

• La charla de esta mañana puede continuar en forma virtual

y permanente.

Suscripción a la mailing lists CursoFAC

Acceder a ayuda (Help) en temas informáticos (virus, etc.)

Obtener orientación para una búsqueda

Y obtener orientación desde otras mailing lists del Foro

Conceptos básicos finales (“para no marearse”)Dr. Alberto Vázquez, XX Congreso Nacional de Cardiología, Córdoba, 2001

Planificar una estrategia No sentarse a la PC sin un plan; escribir antes la búsqueda, que no deberá ser ni muy amplia ni muy acotada; abrir un solo frente por vez y agotarlo; si se encuentra un buen trabajo, detenerse y leerlo ...

al otro día se hará una mejor búsqueda; escribir todo en inglés (ayudarse con un buen diccionario).

No es difícil, pero hay que sumar “horas de silla”. *

Direcciones de Internet citadas en la exposición

http://www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/fig910.htm http://www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/atennecr.htm http://www.annals.org/issues/v134n12/toc.html http://www.fac.org.ar http://www.fac.org.ar/cvirtual/cvirteng/cienteng/mneng/mnm3004i/dicarli/dicarli.htm http://www.acc.org http://www.asecho.org http://www.americanheart.org http://www.worldheart.org http://www.who.int http://www.who.int/regions/amro http://www.paho.org http://www.cochrane.org http://www.hon.ch http://www.hon.ch/MedHunt http://www.bireme.br/bvs/E/home.html http://www.uba.ar http://www.un.edu.ar http://www.copernic.com http://www.sghms.ac.uk/depts/immunology/~dash/apoptosis http://www.google.com http://www.yahoo.com http://world.altavista.com http://www.gozilla.com http://www.getright.com http://www.speedbit.com http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi cursofac@fac.org.ar http://www.fac.org.ar/fec/cursofac http://www.fac.org.ar/search/mensaje.php3?cursofac+736 http://www.fac.org.ar/search/mensaje.php3?chagas-pcvc+679

Obtención de las diapositivas:www.fac.org.ar/fec/cursofac/ros02

Consultas:cursofac@fac.org.ar