evoluciÓn de patrones epigenÉticos · 2013-06-26 · arginina citrulina (neutralización de...

EVOLUCIÓN DE PATRONES EPIGENÉTICOS

HISTONAS

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EVOLUCIÓN DE PATRONES EPIGENÉTICOS MODIFICACIONES DE LAS HISTONAS

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NUCLEOSOMAS Y EMPAQUETAMIENTO DEL ADN

Eirín-López, J.M. et al. (2011)

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CARACTERÍSTICAS COMUNES GENES HISTONAS

• Ausencia de intrones • Expresión coordinada con la división celular • Múltiples copias relativamente homogéneas

• Agrupadas en determinadas regiones del genoma

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DISTRIBUCIÓN DE LOS GENES

Eirín-López, J.M. et al. (2009)

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DISTRIBUCIÓN DE LOS GENES

Eirín-López, J.M. et al. (2009)

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MODELOS EVOLUTIVOS FAMILIAS MULTIGÉNICAS

Eirín-López, J.M. et al. (2011)

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EVOLUCIÓN DE LAS HISTONAS

Eirín-López, J.M. et al. (2011)

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EVOLUCIÓN DE LAS HISTONAS

Eirín-López, J.M. et al. (2011)

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POSICIÓN Y DISTRIBUCIÓN DE NUCLEOSOMAS

Chodavarapu et al. (2010)

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NUCLEOSOMA, METILACIÓN DEL ADN & RNA Pol II

Chodavarapu et al. (2010)

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PROPIEDADES DINÁMICAS DE LOS NUCLEOSOMAS

Philips, T et al. (2008)

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MODIFICACIONES DE HISTONAS

Philips, T et al. (2008)

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ACETILACIÓN DE HISTONAS • Allfrey et al. (1964) Acetilación en Lisinas (Cofactor AcetilCoA) • Acetiltransferasas de Histonas (HATs) • Deacetilasas de Histonas (HDACs)

FUNCIONES • Transcripción Activa • Replicación • Ensamblado nucleosoma • Interacción con otras proteínas

Bannister et al. (2011)

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FOSFORILACIÓN DE HISTONAS • Fosforilación en las colas: Serinas, Treoninas y Tirosinas • Fosforilación en el Core de Histonas • Fosfatasas y Kinasas (Cofactor ATP)

FUNCIONES • Transcripción Activa • Reparación ADN • Apoptosis • Condensación del ADN

Bannister et al. (2011)

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METILACIÓN DE HISTONAS • Lisinas: mono, di o tri-metiladas (HKMT) • Argininas: mono o di-metiladas -simétricamente o asimétricamente- (PRMT)

FUNCIONES • Transcripción Activa o Inactiva • Regulación Estructural

Sims et al. (2003)

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OTRAS MODIFICACIONES

• Deiminación Arginina Citrulina (Neutralización de Carga) • Β-N-Acetilglucosamina Serinas y treoninas (inclusión del azúcar) • ADP ribosilación Glutamato y arginina (reparación ADN?) • Ubiquitinación Gran modificación (Iniciación de la transcripción y elongación) • Eliminación de la cola N-terminal Eliminar cualquier modificación

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EL CÓDIGO DE HISTONAS

COMPLEJO & DINÁMICO

Sims et al. (2003)

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EVOLUCIÓN DE LAS MODIFICACIONES

Woo et al. (2012) ALTA CONSERVACION DE H3K4me3 & H3K27ac en Promotores

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CORRELACIÓN CONSERVACIÓN & ESTABILIDAD

Woo et al. (2012) CORRELACIÓN ENTRE CONSERVACIÓN Y ESTABILIDAD

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EXPRESIÓN Y CONSERVACIÓN

Woo et al. (2012) BAJA CORRELACIÓN CON LA EXPRESIÓN

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COMPOSICIÓN Y CONSERVACIÓN

Woo et al. (2012) ALTA CORRELACIÓN CON LA COMPOSICIÓN

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TFBSs Y CONSERVACIÓN

Woo et al. (2012) CORRELACIÓN CON LA LOCALIZACIÓN DE TFBSs in-vivo