efecto de cambios de temperatura sobre la estructura secundaria del arn de arenavirus: implicancias...
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EFECTO DE CAMBIOS DE TEMPERATURA SOBRE LA ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL ARN DE ARENAVIRUS:
IMPLICANCIAS EN LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION
GUTSON, DANIEL¹; MARCH, AGUSTIN¹; COMBINA, MAXIMILIANO¹; BENAVIDEZ, DANIELA¹; RABINOVICH, ROBERTO²
FUDEPANFUDEPAN CNRS
=
Imaginemos un caballo redondo y de masa despreciable
¿Los virus replican a 37ºC?
• Cambio de huésped
• Distintos órganos
• Ciclos circadianos u hormonales
• Febrícula o fiebre inducida por la infección
Cómo afecta a la infección el cambio de temperatura
• Metabolismo de las células de la respuesta inmune
• Actividad enzimática
• Fluidez de membranas
• Interacción entre proteínas
• ¿¿Estructura secundaria del RNA??
• ¿¿Regulación de la trascripción??
Estructura de arenavirus
• Virus envueltos
• RNA bisegmentado (S-L), ambisense.
• S: 2 genes => 3 productos génicos: NP, G1 y G2
• L: 2 genes => L (pol), Z (reguladora)
ARENAVRUS
Característica de los arenavirus
• Causan infección persistente en el roedor e infección aguda en humanos.
• Comienzo: fiebre, mialgia, anormalidades en células hematopoyéticas, anorexia, dolor epigástrico. El virus replica en bazo, médula ósea y otros órganos linfohematopoyéticos, hígado y pulmón.
FHA: síntomas clínicos
•3-4 días: postración, vómitos. Indicadores de daño vascular: enrojecimiento de la conjuntiva, petequias e hipotensión. Temblor en manos, hemorragia en mucosas. Síntomas neurológicos.
•10-13 días: mejoramiento
•30% de muertes en pacientes sin tratamiento
•Laboratorio: leucopenia, trombocitopenia, proteinuria.
• MFold, más un conjunto de scripts desarrollados ad-hoc para el análisis de los resultados e invocación masiva en modo ‘batch’, se determinó a distintas temperaturas (33º ó 42ºC) la estructura secundaria de los segmentos L y S del virus Junín determinando los nucleótidos apareados, el ss score, ∆G asociado al plegamiento y estructuras secundarias características.
Materiales y Métodos
Segmento S ∆G asociado al plegamiento
-1050
-1000
-950
-900
-850
-800
-750
-700
33º 34º 35º 36º 37º 38º 39º 40º 41º 42º
Temp
dG
Energía total de Junín S
Antigenómico
Segmento S nt apareados en la zona intergénica
40
45
50
55
60
65
70
75
80
85
33º 34º 35º 36º 37º 38º 39º 40º 41º 42º
Temp
Nuc
leót
idos
A
pare
ados Región
Intergénica S
Antigenómico
Segmento S tendencia a estar no apareado
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
33º 34º 35º 36º 37º 38º 39º 40º 41º 42º
Temp
SS-s
core
Extr Complem
Intergenic
Intergenic -Complem
Total
Total Complem
Segmento L
-2100
-1900
-1700
-1500
-1300
-1100
-900
-70033º 34º 35º 36º 37º 38º 39º 40º 41º 42º
Temp
dG
Energía total de Junín S
Antigenómico
Segmento L zona intergénica
40
45
50
55
60
65
70
Temp
paired n
uc
Región Intergénica
Antigenómico
Segmento L ss score
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0,45
33º 34º 35º 36º 37º 38º 39º 40º 41º 42º
Temp
SS-s
core
ExtrComplem
Intergenic
Intergenic -Complem
Total
TotalComplem
>glicoproteínas
> Lectura completa
>Lectura completa
> antigenómico
Los resultados predicen que
con el aumento de temperatura aumentaría la síntesis de
genomas completos y la síntesis de glicoproteinas
a temperaturas menores predominaria la sintesis de
nucleoproteina, caracterìstica de algunos modelos de infecciòn persistente del virus Junín
Otros Arenavirus
• Comportamiento semejante respecto de los extremos
• Estos resultados ponen de manifiesto la necesidad de considerar las variaciones de temperatura, incluyendo el estado febril, en la regulación de la trascripción viral.
• La realización de determinaciones in vitro a distintas temperaturas sería conveniente para evaluar la importancia de los cambios en la estructura del RNA, sus posibles consecuencias en la enfermedad y en el establecimiento de la infección persistente en los huéspedes naturales.
Conclusión
• Comportamiento semejante respecto de los extremos y zona intergénica
• Cepa vacunal Candid 1: difiere en su comportamiento en la zona intergénica
Otros Arenavirus
¿Se extienden estas conclusiones a otros virus?
Píenselo Rabinovich, Píenselo
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